单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 3821 - 3840 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3821 | 2025-10-06 |
cDC1s Promote Atherosclerosis via Local Immunity and Are Targetable for Therapy
2025-Jul-18, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.325792
PMID:40444360
|
研究论文 | 本研究揭示传统1型树突状细胞通过促进T细胞免疫加剧动脉粥样硬化，并开发靶向cDC1的纳米颗粒疗法 | 首次证实cDC1通过STING通路促进动脉粥样硬化，并开发了靶向CLEC9A的免疫抑制纳米颗粒疗法 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体验证 | 阐明传统树突状细胞在动脉粥样硬化发病机制中的作用并开发靶向治疗策略 | Ldlr-/-基因敲除小鼠和不同cDC1缺陷小鼠模型 | 免疫学 | 心血管疾病 | 流式细胞术，单细胞RNA测序，纳米颗粒靶向治疗 | NA | 基因表达数据，细胞表型数据 | 多种基因修饰小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3822 | 2025-10-06 |
Integrating bulk and single cell sequencing data to identify prognostic biomarkers and drug candidates in HBV associated hepatocellular carcinoma
2025-Jul-18, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-10876-4
PMID:40676059
|
研究论文 | 整合bulk和单细胞测序数据识别HBV相关肝细胞癌的预后生物标志物和候选药物 | 结合101种机器学习模型开发最优免疫风险指数模型，首次发现SPP1在血管型TAMs中高表达并通过多途径促进肿瘤进展 | 样本量相对有限，机制研究需要进一步实验验证 | 识别HBV相关肝细胞癌的预后生物标志物和潜在治疗靶点 | HBV相关肝细胞癌患者 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，分子对接，PPI分析 | 逐步Cox回归，RSF（随机生存森林），机器学习集成模型 | 基因表达数据，单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3823 | 2025-10-06 |
Identification of a fibroblast-derived gene signature reveals prognostic and therapeutic insights in pancreatic cancer
2025-Jul-18, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01801-0
PMID:40676405
|
研究论文 | 本研究基于成纤维细胞特异性基因特征开发了胰腺癌预后模型并识别潜在治疗靶点 | 首次构建包含14个关键基因的成纤维细胞相关预后特征，能有效预测患者对免疫检查点阻断疗法和化疗药物的敏感性 | 需要进一步实验验证识别基因的生物学功能和治疗潜力 | 开发胰腺癌预后预测模型并识别治疗靶点 | 胰腺导管腺癌(PDAC)患者组织样本 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 高维加权基因共表达网络分析, LASSO Cox回归 | 预后特征模型 | 单细胞RNA测序数据 | 多个队列的PDAC和癌旁正常组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3824 | 2025-10-06 |
Reduced Availability of Essential Amino Acids Disrupts Differentiation of Anorexigenic POMC Neurons in the Fetal Rat Hypothalamus
2025-Jul-18, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-025-05201-z
PMID:40681826
|
研究论文 | 本研究探讨妊娠期蛋白质限制对胎儿下丘脑发育的影响，特别是对调节食欲和能量平衡的神经元群体分化的影响 | 首次揭示必需氨基酸减少通过mTOR信号通路和表观遗传机制选择性破坏ISL1前体细胞向POMC神经元分化 | 仅研究特定发育窗口期，需要进一步研究其他发育阶段 | 探究宫内生长受限与代谢疾病风险的机制联系 | 妊娠期蛋白质限制的大鼠模型及其胎儿下丘脑发育 | 发育生物学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序, EdU标记, 免疫组织化学, RNAscope, mTOR信号分析, DNA甲基化分析 | 大鼠等热量蛋白质限制模型 | 基因表达数据, 表观遗传数据, 组织图像数据 | 妊娠15天和17天的大鼠胎儿下丘脑组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3825 | 2025-10-06 |
Identification of CTSK as a TLR-related critical biomarker in liver cirrhosis via integrative bioinformatics and pathological characterization
2025-Jul-17, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-11606-6
PMID:40670571
|
研究论文 | 通过整合生物信息学和病理学方法鉴定CTSK作为肝硬化中TLR相关关键生物标志物 | 首次系统识别TLR相关基因在肝硬化中的作用，发现四个枢纽基因并验证其诊断和治疗价值，揭示CTSK可能通过TLR4-MyD88-NF-κB轴促进肝硬化进展 | 基于公共数据库数据的回顾性分析，需要进一步实验验证机制 | 探索肝硬化中Toll样受体相关基因的诊断和治疗价值 | 肝硬化相关基因和生物标志物 | 生物信息学 | 肝硬化 | 生物信息学分析，qRT-PCR，免疫组化，单细胞RNA测序，分子对接 | 机器学习，风险模型 | 基因表达数据，单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3826 | 2025-10-06 |
Modeling tumor relapse using proliferation tracing and ablation transgenic mouse
2025-Jul-17, NPJ breast cancer
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s41523-025-00792-1
PMID:40675988
|
研究论文 | 通过增殖追踪和消融转基因小鼠模型研究肿瘤复发机制 | 开发了双重组酶介导的遗传系统，能够在特定时间窗内追踪并消融增殖细胞 | 基于小鼠模型的研究，与人类肿瘤存在物种差异 | 建立模拟肿瘤复发的临床前动物模型并研究复发机制 | PyMT诱导的自发性小鼠乳腺癌模型 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据 | 未明确说明 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 3827 | 2025-10-06 |
The role of UBR2 in triple-negative breast cancer and its implications for immune checkpoint blockade therapy
2025-Jul-17, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03153-3
PMID:40676335
|
研究论文 | 本研究探讨UBR2在三阴性乳腺癌中的作用及其对免疫检查点阻断治疗的影响 | 首次揭示UBR2在TNBC免疫抑制微环境中的非泛素化功能，并发现其可作为PD-L1治疗的预测指标 | 研究主要基于数据库分析和体外实验，需要更多临床样本验证 | 阐明UBR2在三阴性乳腺癌免疫治疗中的作用机制 | 三阴性乳腺癌细胞系和患者样本 | 癌症免疫学 | 三阴性乳腺癌 | RNA测序, Western blotting, 流式细胞术, 免疫浸润分析 | NA | RNA测序数据, 蛋白质印迹数据, 流式细胞数据 | 来自GEO和TCGA数据库的三阴性乳腺癌患者队列 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 3828 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals the effects of mental stress on mouse mammary tumors and the tumor microenvironment
2025-Jul-16, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02619-1
PMID:40670350
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究精神压力对小鼠乳腺肿瘤及肿瘤微环境的影响 | 首次在体内系统阐明精神压力通过诱导肿瘤细胞去分化为癌症干细胞样细胞、改变免疫细胞组成（如增加TANs和TIDCs，抑制CTLs等）促进肿瘤生长的机制 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究精神压力对乳腺肿瘤及其微环境的影响机制 | MMTV-PyMT转基因小鼠的乳腺肿瘤组织 | 单细胞测序分析 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、免疫荧光染色、通路富集分析 | NA | 单细胞转录组数据、组织切片图像 | MMTV-PyMT转基因小鼠肿瘤组织（压力暴露与未暴露组） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3829 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing combined with spatial transcriptomics reveals the characteristics of follicle-targeted inflammation patterns in primary cicatricial alopecia
2025-Jul-16, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-025-01447-1
PMID:40671126
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序和空间转录组学揭示了原发性瘢痕性秃发中毛囊靶向炎症模式的特征 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术系统分析LPP毛囊靶向炎症的细胞组成、空间定位和细胞间相互作用 | 样本量相对有限，仅分析了LPP、LS和对照组的头皮样本 | 研究原发性瘢痕性秃发中毛囊靶向炎症的特征并识别治疗靶点 | 扁平苔藓样秃发、局限性硬皮病和对照组的头皮样本 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | LPP、LS和对照组头皮样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3830 | 2025-10-06 |
Utilizing genomics to identify novel immunotherapeutic targets in multiple myeloma high-risk subgroups
2025-Jul-15, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-025-01503-y
PMID:40665393
|
研究论文 | 本研究开发了一种利用多组学数据识别多发性骨髓瘤新型免疫治疗靶点的方法 | 建立了整合细胞表面潜力、健康器官表达和MM细胞表达水平的框架来定义新型免疫治疗靶点，并识别了亚型特异性靶点 | NA | 识别多发性骨髓瘤高危亚群的新型免疫治疗靶点 | 多发性骨髓瘤患者样本和细胞系 | 基因组学 | 多发性骨髓瘤 | 多组学分析,流式细胞术,免疫印迹,CRISPR-Cas9敲除模型,单细胞RNA-seq | NA | 基因组数据,转录组数据,蛋白质数据 | 两个大型数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3831 | 2025-10-06 |
Paneth cells inhibit intestinal stem cell proliferation through the bone morphogenic protein 7 pathway under rotavirus-mediated intestinal injury
2025-Jul-14, World journal of gastroenterology
IF:4.3Q1
DOI:10.3748/wjg.v31.i26.107044
PMID:40678707
|
研究论文 | 本研究揭示了潘氏细胞通过骨形态发生蛋白7通路抑制肠道干细胞增殖的机制，以应对轮状病毒介导的肠道损伤 | 首次发现轮状病毒直接感染潘氏细胞，并阐明潘氏细胞通过BMP7信号通路调控肠道干细胞增殖的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和类器官，在人体中的验证仍需进一步研究 | 探究轮状病毒感染对潘氏细胞的影响及潘氏细胞在肠道损伤修复中对肠道干细胞的调控作用 | 潘氏细胞、肠道干细胞、轮状病毒感染的肠道组织 | 单细胞生物学 | 肠道感染性疾病 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、流式细胞术、逆转录定量聚合酶链反应 | CellChat、伪时序分析 | 单细胞RNA测序数据、免疫组织化学数据 | Lgr5-EGFP-IRES-CreERT2小鼠和肠道类器官 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3832 | 2025-10-06 |
Mature megakaryocytes acquire immune characteristics in a mouse model of aplastic anemia
2025-Jul-08, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2024015621
PMID:40086077
|
研究论文 | 本研究通过小鼠模型揭示了成熟巨核细胞在再生障碍性贫血中获得免疫特征的新功能 | 首次发现成熟巨核细胞在骨髓衰竭状态下获得抗原呈递细胞功能并抑制造血干细胞 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 探究巨核细胞在免疫性骨髓衰竭中的非传统功能 | 小鼠巨核细胞和再生障碍性贫血患者样本 | 单细胞生物学 | 再生障碍性贫血 | 单细胞RNA测序，电子显微镜，共培养实验 | NA | 单细胞转录组数据，显微镜图像 | 小鼠模型和人类患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3833 | 2025-10-06 |
Lars2 Deficiency-Induced Mitochondrial Dysfunction Drives the Emergence of a Pro-Inflammatory Stroke-Specific Microglial Subpopulation
2025-Jul-04, Aging and disease
IF:7.0Q1
DOI:10.14336/AD.2025.0387
PMID:40681356
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现Lars2缺陷导致的线粒体功能障碍驱动了中风特异性促炎小胶质细胞亚群的出现 | 首次识别出具有低Lars2表达和促炎特征的中风特异性小胶质细胞亚群(Mc)，并揭示了Lars2作为连接中风诱导的小胶质细胞重编程与神经炎症的线粒体检查点 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性尚需验证 | 探究中风后小胶质细胞免疫状态改变的分子机制 | 出血性、缺血性中风和对照小鼠的纹状体小胶质细胞 | 单细胞转录组学 | 中风 | 单细胞RNA测序，基因本体功能富集分析，细胞间通讯分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 出血性、缺血性和对照小鼠纹状体组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3834 | 2025-10-06 |
scRDAN: a robust domain adaptation network for cell type annotation across single-cell RNA sequencing data
2025-Jul-02, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf344
PMID:40671175
|
研究论文 | 提出一种用于跨单细胞RNA测序数据的细胞类型注释的鲁棒域自适应网络scRDAN | 结合去噪域自适应模块、细粒度判别模块和鲁棒性增强模块，通过特征重构和对抗学习解决噪声和批次效应问题 | NA | 开发能够有效处理单细胞RNA测序数据中噪声和批次效应的细胞类型注释方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 域自适应网络 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3835 | 2025-10-06 |
scRECL: representative ensembles with contrastive learning for scRNA-seq data clustering analysis
2025-Jul-02, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf346
PMID:40671174
|
研究论文 | 提出一种名为scRECL的对比集成学习方法用于单细胞RNA测序数据聚类分析 | 结合对比学习和集成学习方法，通过Siamese神经网络和多重图代表性元素选择来提高聚类鲁棒性 | NA | 开发鲁棒的单细胞RNA测序数据聚类方法 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | Siamese神经网络, 对比学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3836 | 2025-10-06 |
Anomaly detection in spatial transcriptomics via spatially localized density comparison
2025-Jul-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf242
PMID:40662796
|
研究论文 | 提出了一种名为Sardine的空间转录组学异常检测方法，用于识别不同条件下组织切片中空间局部化的表达变化 | 通过空间局部化密度估计来比较不同条件下细胞状态在相同空间位置的概率，能够更准确地识别空间局部化改变 | 论文未明确说明方法的计算复杂度或在大规模数据集上的性能限制 | 开发空间转录组数据分析方法，检测不同条件下组织中的空间局部化表达变化 | 小鼠大脑皮层损伤响应前后的组织样本和接受电疗的小鼠脊髓组织样本 | 空间转录组学 | 神经系统损伤 | 空间转录组测序 | 密度估计算法 | 空间基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间基因表达平台 |
| 3837 | 2025-10-06 |
Inactivation of Histone Chaperone HIRA Unmasks a Link Between Normal Embryonic Development of Melanoblasts and Maintenance of Adult Melanocyte Stem Cells
2025-Jul, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70070
PMID:40669469
|
研究论文 | 本研究通过小鼠模型揭示组蛋白伴侣HIRA在胚胎期黑色素细胞发育与成年期黑色素干细胞维持之间的关键联系 | 首次证实HIRA在胚胎期的功能缺陷会通过表观遗传机制影响成年组织干细胞的长期维持 | 研究仅限于小鼠色素系统模型，尚未在人类或其他物种中验证 | 探索组蛋白伴侣HIRA在胚胎发育与成年组织干细胞维持之间的分子联系 | 小鼠黑色素细胞谱系（黑色素母细胞和黑色素干细胞） | 发育生物学 | 色素相关疾病 | 单细胞RNA测序, ATAC-seq, 条件性基因敲除 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 未明确样本数量的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, ATAC-seq | NA | NA |
| 3838 | 2025-10-06 |
Itaconate suppresses neonatal intestinal inflammation via metabolic reprogramming of M1 macrophage
2025-Jul, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70419
PMID:40673634
|
研究论文 | 本研究揭示了衣康酸通过代谢重编程调节巨噬细胞分化在新生儿坏死性小肠结肠炎中的保护作用 | 首次发现衣康酸通过挽救线粒体功能和上调氧化磷酸化来抑制M1巨噬细胞极化的机制 | 研究主要基于小鼠模型，临床样本验证有限 | 探究衣康酸在坏死性小肠结肠炎中对巨噬细胞代谢重编程的调节作用 | 坏死性小肠结肠炎新生儿临床样本和ACOD1基因敲除小鼠模型 | 免疫代谢 | 坏死性小肠结肠炎 | 免疫荧光染色,液相色谱-质谱联用,单细胞测序 | NA | 图像,代谢组数据,单细胞测序数据 | 临床NEC样本和ACOD1-/-、ACOD1fl/flLysMcre小鼠模型 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 3839 | 2025-10-06 |
PPARγ controls ESCRT-dependent fibroblast-like synoviocyte exosome biogenesis and alleviates chondrocyte osteoarthritis mediated by exosomal ANXA1
2025-Jul, Journal of orthopaedic translation
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.jot.2025.06.008
PMID:40678612
|
研究论文 | 本研究揭示运动通过上调PPARγ调控ESCRT依赖性成纤维样滑膜细胞外泌体生成，并通过外泌体ANXA1蛋白缓解骨关节炎 | 首次发现PPARγ通过ESCRT通路调控成纤维样滑膜细胞外泌体生成，并鉴定ANXA1为关键治疗性外泌体货物蛋白 | NA | 探索运动疗法缓解骨关节炎的分子机制及外泌体介导的细胞间通讯 | 成纤维样滑膜细胞和软骨细胞 | 细胞生物学 | 骨关节炎 | 单细胞转录组测序, 定量蛋白质组学, 数据非依赖性采集 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3840 | 2025-10-06 |
Mesenchymal stem/stromal cell therapy improves immune recovery in a feline model of severe coronavirus infection
2025-Jun-25, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1093/stcltm/szaf025
PMID:40659357
|
研究论文 | 评估同种异体间充质干细胞联合抗病毒治疗在猫传染性腹膜炎中的安全性和有效性 | 首次在自然发生的猫冠状病毒感染模型中证明MSC疗法能促进免疫恢复，揭示PDGF-bb在淋巴细胞恢复中的潜在作用 | 研究结束时仍存在残余细胞因子升高，样本量未明确说明 | 评估MSC疗法改善严重冠状病毒感染免疫恢复的效果 | 患有渗出性猫传染性腹膜炎的猫 | 免疫学 | 冠状病毒感染 | 单细胞RNA测序，血清细胞因子分析，主成分分析 | NA | 单细胞RNA测序数据，血液学数据，细胞因子数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |