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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 3581 - 3600 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3581 | 2025-10-06 |
Oncogenic Calreticulin Induces Immune Escape by Stimulating TGFβ Expression and Regulatory T-cell Expansion in the Bone Marrow Microenvironment
2024-Sep-16, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-3553
PMID:38885318
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研究论文 | 本研究揭示了致癌性钙网蛋白通过刺激TGFβ表达和调节性T细胞扩增诱导骨髓微环境中免疫逃逸的机制 | 首次发现CALRdel52突变通过ERK/Sp1/TGFβ1轴促进免疫抑制，并证明靶向该轴可增强T细胞活性 | 研究主要基于小鼠模型，临床样本验证仍需扩大 | 探究致癌性CALR突变在骨髓增殖性肿瘤中诱导免疫逃逸的分子机制 | 骨髓微环境中的TGFβ1产生细胞和调节性T细胞 | 肿瘤免疫学 | 骨髓增殖性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | 小鼠MPN模型 | 基因表达数据 | 四个独立患者队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3582 | 2025-10-06 |
STAN, a computational framework for inferring spatially informed transcription factor activity
2024-Sep-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.26.600782
PMID:38979296
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研究论文 | 开发了一个名为STAN的计算框架，用于从空间转录组数据推断转录因子活性 | 提出首个整合TF-靶基因先验知识、mRNA表达、空间坐标和形态学特征的线性混合效应计算方法，实现点特异性TF活性预测 | 方法仅在线性框架下建模，可能无法捕捉复杂的非线性调控关系 | 开发空间信息化的转录因子活性推断方法 | 淋巴结、乳腺癌和胶质母细胞瘤组织样本 | 生物信息学 | 乳腺癌, 胶质母细胞瘤 | 空间转录组学 | 线性混合效应模型 | 空间转录组数据, 成像数据 | 多个组织样本（具体数量未明确说明） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3583 | 2025-10-06 |
A distribution-free and analytic method for power and sample size calculation in single-cell differential expression
2024-Sep-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae540
PMID:39231036
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研究论文 | 提出了一种基于广义估计方程的scPS方法，用于单细胞差异表达分析中的功效和样本量计算 | 无需假设数据分布，考虑样本内细胞间相关性，采用解析方法而非耗时模拟策略 | 未在摘要中明确说明 | 开发单细胞差异表达分析中功效和样本量计算的统计方法 | 单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 广义估计方程 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3584 | 2025-10-06 |
Age-related epithelial defects limit thymic function and regeneration
2024-Sep, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-024-01915-9
PMID:39112630
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学技术揭示了与年龄相关的非典型胸腺上皮细胞状态及其对胸腺功能和再生的限制机制 | 首次发现两种年龄相关的非典型胸腺上皮细胞状态，这些细胞形成无胸腺细胞的高密度上皮簇，作为TEC生长因子的吸收池并干扰再生通路 | 未明确说明样本数量和研究对象的详细信息 | 探究胸腺年龄相关功能衰退和再生能力下降的细胞机制 | 非造血基质细胞和胸腺上皮细胞 | 空间转录组学 | 衰老相关免疫缺陷 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 谱系追踪, 先进成像 | NA | 转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3585 | 2025-10-06 |
Fc-engineered antibodies promote neutrophil-dependent control of Mycobacterium tuberculosis
2024-Sep, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-024-01777-9
PMID:39174703
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研究论文 | 本研究通过工程化改造识别结核分枝杆菌荚膜的抗体Fc区域，探索了抗体介导的结核病控制机制 | 构建了52种Fc变体抗体，首次发现Fc工程化抗体可通过中性粒细胞依赖性方式促进结核分枝杆菌限制 | 研究主要基于人类全血感染模型，尚未进行体内验证 | 探索抗体Fc介导的结核分枝杆菌限制机制及治疗潜力 | 结核分枝杆菌和工程化抗体 | 免疫学 | 结核病 | 单细胞RNA测序，Fc工程化 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3586 | 2025-10-06 |
Plasma proteomics of acute tubular injury
2024-Aug-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51304-x
PMID:39191768
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研究论文 | 通过血浆蛋白质组学识别急性肾小管损伤的生物标志物 | 首次使用SomaScan蛋白质组学平台系统鉴定与ATI严重程度相关的血浆生物标志物，并整合多组学数据揭示免疫调节和细胞器应激反应在ATI发病机制中的作用 | 样本量相对有限（434例活检确诊患者），需要在更大队列中验证生物标志物的临床适用性 | 开发急性肾小管损伤的非侵入性生物标志物用于早期检测和药物开发 | 肾病患者（活检确诊）和多个队列研究的参与者 | 蛋白质组学 | 肾脏疾病 | SomaScan蛋白质组学、区域转录组学、单细胞RNA测序、通路分析 | NA | 血浆蛋白质组数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 主要队列434例活检确诊肾病患者，验证队列包括KPMP（44例）、ARIC（4610例）和CHROME（268例） | SomaLogic | 血浆蛋白质组学 | SomaScan | SomaScan蛋白质组学平台 |
| 3587 | 2025-10-06 |
Integration of Clinical Trial Spatial Multiomics Analysis and Virtual Clinical Trials Enables Immunotherapy Response Prediction and Biomarker Discovery
2024-Aug-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-0943
PMID:38861365
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研究论文 | 本研究开发了一种计算模型，整合空间多组学分析和虚拟临床试验，用于预测肝细胞癌免疫治疗反应和发现生物标志物 | 开发了能够同时追踪器官尺度肿瘤进展和捕获肿瘤空间异质性的新型计算模型，将数学建模与高通量空间多组学数据相结合 | 模型参数主要来源于文献，需要进一步临床验证 | 促进免疫治疗方案设计和生物标志物发现 | 肝细胞癌患者 | 计算生物学 | 肝细胞癌 | 空间定量系统药理学模型，成像质谱流式技术，空间转录组学 | 空间定量系统药理学模型 | 空间多组学数据，空间蛋白质组学数据，空间转录组学数据 | 来自新辅助HCC临床试验和独立抗PD1单药治疗研究的样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium | Visium空间转录组分析 |
| 3588 | 2025-10-06 |
aKNNO: single-cell and spatial transcriptomics clustering with an optimized adaptive k-nearest neighbor graph
2024-Aug-01, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03339-y
PMID:39090647
|
研究论文 | 开发了一种名为aKNNO的单细胞和空间转录组学聚类方法，通过优化自适应k近邻图同时识别丰富和稀有细胞类型 | 提出基于优化自适应k近邻图的聚类方法，能够同时准确识别丰富和稀有细胞类型，解决了现有方法在这两个目标间的权衡问题 | 仅使用基因表达数据，未整合其他多组学信息 | 开发更准确的单细胞和空间转录组学聚类算法 | 单细胞和空间转录组学数据中的细胞类型识别 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 自适应k近邻图优化 | 基因表达数据 | 38个模拟数据集和20个单细胞及空间转录组学数据集 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 3589 | 2025-10-06 |
A robust model for cell type-specific interindividual variation in single-cell RNA sequencing data
2024-Jun-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49242-9
PMID:38898015
|
研究论文 | 开发了一种名为CTMM的新模型，用于检测和量化单细胞RNA测序数据中细胞类型特异性个体间变异 | 首次提出专门针对细胞类型特异性个体间变异的线性混合模型，能够识别传统方法难以发现的阶段特异性变异基因 | 单细胞RNA测序样本量相对较小，模型校准具有挑战性 | 开发统计模型来解析单细胞RNA测序数据中的细胞类型特异性个体间变异 | 人类诱导多能干细胞分化过程中的转录组变异 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 线性混合模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3590 | 2025-10-06 |
Dysfunction of infiltrating cytotoxic CD8+ T cells within the graft promotes murine kidney allotransplant tolerance
2024-Jun-18, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI179709
PMID:38888968
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现，小鼠肾脏异体移植耐受性与浸润性CD8+ T细胞在移植物内重编程为耗竭/调节样表型相关 | 首次揭示细胞毒性CD8+ T细胞在移植肾脏内通过IFN-γ介导重编程为耗竭/调节样表型，并提出'防御性耐受'新概念 | 研究仅限于小鼠模型，CD8-KO实验表明调节样表型细胞对耐受诱导并非必需，机制尚未完全阐明 | 探究肾脏异体移植耐受的免疫学机制 | 小鼠肾脏异体移植模型和CD8+ T细胞 | 免疫学 | 移植免疫 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)，过继性T细胞转移 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3591 | 2025-10-06 |
A pathologically expanded, clonal lineage of IL-21-producing CD4+ T cells drives inflammatory neuropathy
2024-Jun-11, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI178602
PMID:39087473
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术鉴定出驱动炎症性神经病变的IL-21产生型CD4+ T细胞克隆谱系 | 首次发现IL-21表达CD4+ T细胞在炎症性神经病变中的克隆扩增和多功能特性，揭示Tfh/Tph细胞亚群共同谱系分化途径 | 研究基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 阐明炎症性神经病变中致病性CD4+ T细胞的关键特性 | 炎症性神经病变小鼠模型中外周神经组织 | 免疫学 | 炎症性神经病变 | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据, T细胞受体序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞TCR-seq | NA | NA |
| 3592 | 2025-10-06 |
Self-regulating CAR-T cells modulate cytokine release syndrome in adoptive T-cell therapy
2024-Jun-03, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20221988
PMID:38607370
|
研究论文 | 本研究开发了能够自我调节的自体CAR-T细胞，通过分泌细胞因子抑制剂减轻细胞因子释放综合征 | 首次设计能够分泌托珠单抗衍生单链可变片段的CAR-T细胞，实现自我调节炎症反应 | 研究基于人源化小鼠模型，尚未进行人体临床试验 | 改善CAR-T细胞治疗的安全性并同时增强疗效 | CD19 CAR-T细胞和细胞因子释放综合征 | 免疫治疗 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人源化NSG-SGM3小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3593 | 2025-10-06 |
Vascular restoration through local delivery of angiogenic factors stimulates bone regeneration in critical size defects
2024-Jun, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2024.07.003
PMID:39100886
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析骨缺损修复机制，并开发了搭载Spp1和Cxcl12的PCL/PLGA支架材料促进血管生成和骨再生 | 首次在单细胞水平揭示临界尺寸骨缺损中血管生成障碍的关键机制，并创新性地开发了可局部缓释Spp1和Cxcl12的双电纺支架材料 | 研究仅在小鼠模型中进行验证，尚未在大型动物或临床实验中测试 | 探索临界尺寸骨缺损的修复机制并开发促进骨再生的新型治疗方法 | 小鼠临界尺寸骨缺损模型及再生组织中的细胞群体 | 骨组织工程 | 骨缺损 | 单细胞RNA测序，电纺丝技术，电喷雾技术 | NA | 单细胞RNA测序数据，组织学数据，行为学数据 | 小鼠骨缺损模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3594 | 2025-10-06 |
Integrated Single-cell Multiomic Analysis of HIV Latency Reversal Reveals Novel Regulators of Viral Reactivation
2024-05-09, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzae003
PMID:38902848
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研究论文 | 通过整合单细胞多组学分析揭示HIV潜伏逆转的新调控因子 | 首次结合scRNA-seq和scATAC-seq技术同时分析潜伏感染细胞的转录组和表观基因组特征，并利用机器学习预测病毒再激活 | 研究仅针对CD4+ T细胞，未涉及其他潜在HIV潜伏库细胞类型 | 揭示HIV潜伏逆转的分子机制和新型调控因子 | 约125,000个潜伏感染的原代CD4+ T细胞 | 单细胞多组学 | HIV/AIDS | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 机器学习模型 | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | 约125,000个原代CD4+ T细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 3595 | 2025-10-06 |
Young glial progenitor cells competitively replace aged and diseased human glia in the adult chimeric mouse brain
2024-May, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01798-5
PMID:37460676
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研究论文 | 本研究通过移植年轻健康的人类胶质祖细胞成功替代成年嵌合小鼠大脑中的衰老和病变胶质细胞 | 首次发现年轻健康胶质祖细胞在成年大脑中具有竞争优势，能够通过YAP1/MYC/E2F信号通路取代衰老和病变胶质细胞 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类临床环境中验证 | 探究健康胶质细胞是否能在成年前脑中竞争取代病变人类胶质细胞 | 人类胶质祖细胞和亨廷顿病模型小鼠 | 神经科学 | 亨廷顿病 | 单细胞RNA测序 | 嵌合小鼠模型 | 基因表达数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3596 | 2025-10-06 |
Marmosets contain multitudes
2024-Apr-25, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.97866
PMID:38661001
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示狨猴携带来自其兄弟姐妹的遗传差异细胞的程度 | 利用单细胞RNA测序技术首次在狨猴中量化了来自兄弟姐妹的遗传嵌合细胞 | NA | 研究狨猴体内遗传嵌合现象 | 狨猴细胞 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3597 | 2025-10-06 |
Stimulator of Interferon Genes Pathway Activation through the Controlled Release of STINGel Mediates Analgesia and Anti-Cancer Effects in Oral Squamous Cell Carcinoma
2024-Apr-21, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines12040920
PMID:38672274
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研究论文 | 本研究开发了STINGel缓释制剂，通过激活干扰素基因刺激因子通路，在口腔鳞状细胞癌模型中同时实现镇痛和抗癌效果 | 开发了延长STING激动剂可用时间的缓释制剂STINGel，首次系统研究其在口腔鳞癌疼痛管理中的作用机制 | 研究局限于动物模型，尚未进行临床试验验证 | 研究STINGel缓释制剂对口腔鳞状细胞癌疼痛的镇痛作用及其机制 | 口腔鳞状细胞癌动物模型 | 癌症研究 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序，行为学检测 | NA | 基因表达数据，行为学数据 | 两种口腔鳞癌模型 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 3598 | 2025-10-06 |
BuDDI: BulkDeconvolution withDomainInvariance to predict cell-type-specific perturbations from bulk
2024-Apr-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.20.549951
PMID:37503097
|
研究论文 | 提出BuDDI方法，通过域适应技术整合单细胞和批量RNA-seq数据来预测细胞类型特异性扰动效应 | 使用变分自编码器学习四个独立潜在空间，能够模拟细胞类型特异性扰动响应，无需单细胞扰动数据训练 | NA | 开发从批量数据推断细胞类型特异性扰动效应的方法 | 单细胞RNA-seq数据和批量RNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | 变分自编码器(VAE) | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 3599 | 2025-10-06 |
Uncover spatially informed variations for single-cell spatial transcriptomics with STew
2024, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbae064
PMID:38827413
|
研究论文 | 提出一种名为STew的空间转录组多视图表示学习方法，用于联合分析空间信息和基因表达 | 开发了首个空间转录组多视图表示学习方法，能够有效利用空间信息揭示与基因表达共享的变异 | NA | 解决空间转录组数据分析中有效利用空间信息的挑战 | 人类背外侧前额叶皮层、小鼠主嗅球和银屑病皮肤组织 | 空间转录组学 | 银屑病 | 空间转录组学 | 多视图表示学习 | 空间转录组数据 | 多个数据集，包含数千个空间位置 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium, 10x Xenium, Slide-seqV2 | 10x Visium空间转录组技术、Slide-seqV2技术、10x Xenium单细胞空间转录组技术 |
| 3600 | 2025-10-06 |
Genetic and Functional Analyses of Cutibacterium Acnes Isolates Reveal the Association of a Linear Plasmid with Skin Inflammation
2024-01, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2023.05.029
PMID:37478901
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研究论文 | 本研究通过遗传和功能分析揭示痤疮丙酸杆菌携带线性质粒与皮肤炎症的关联 | 发现线性质粒的存在与痤疮丙酸杆菌的促炎能力相关，表明菌株类型不足以预测炎症反应 | 研究主要基于体外细胞实验和小鼠模型，需要进一步人体验证 | 探究不同痤疮丙酸杆菌菌株类型与皮肤炎症的关系 | 痤疮丙酸杆菌分离株 | 微生物学 | 痤疮 | 全基因组测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 从健康受试者和痤疮患者皮肤拭子分离的痤疮丙酸杆菌菌株 | NA | 全基因组测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |