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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 3521 - 3540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 3521 | 2025-10-06 |
Single-nucleus transcriptional and chromatin accessibility analyses of maturing mouse Achilles tendon uncover the molecular landscape of tendon stem/progenitor cells
2025-Jun-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.24.619991
PMID:39484401
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研究论文 | 本研究通过单细胞和单核测序技术分析小鼠跟腱成熟过程中的转录组和染色质可及性，揭示了肌腱干/祖细胞的分子特征 | 首次鉴定CD55和CD248作为肌腱干/祖细胞的新型表面抗原标记物，并发现该细胞群在发育过程中数量减少 | 研究仅使用小鼠模型，样本年龄范围有限(2周和6周)，未涉及人类样本或更广泛的年龄阶段 | 探索肌腱干/祖细胞的分子特征及其在肌腱发育和修复中的作用机制 | 小鼠跟腱细胞，特别是肌腱干/祖细胞群体 | 单细胞生物学 | 肌腱韧带损伤 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 单核ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | 2周和6周龄小鼠跟腱细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq, 单核ATAC-seq | NA | NA |
| 3522 | 2025-10-06 |
Single-Cell Analysis of Host Responses in Bovine Milk Somatic Cells (bMSCs) Following HPAIV Bovine H5N1 Influenza Exposure
2025-06-03, Viruses
DOI:10.3390/v17060811
PMID:40573402
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析牛乳体细胞在H5N1禽流感病毒暴露后的宿主免疫反应 | 首次对H5N1病毒暴露的牛乳体细胞进行单细胞分析，揭示了乳腺免疫反应向2型免疫转变的动态特征 | 单细胞测序数据中未检测到病毒读数，免疫反应可能仅源于病毒成分暴露而非生产性感染 | 理解牛乳腺对H5N1病毒暴露的宿主免疫反应机制 | 体外暴露于H5N1病毒的牛乳体细胞(bMSCs) | 单细胞组学 | 禽流感 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3523 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing-derived signatures define response patterns to atezolizumab + bevacizumab in advanced hepatocellular carcinoma
2025-Jun, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2024.12.016
PMID:39709141
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别了晚期肝细胞癌患者对阿特珠单抗+贝伐珠单抗联合治疗的两种不同应答模式及耐药特征 | 首次利用单细胞RNA测序技术系统揭示了晚期肝癌对atezo+bev联合治疗的分子应答机制，定义了免疫主导型和血管生成主导型两种获益亚组 | 研究为回顾性分析，需要前瞻性研究验证；样本量相对有限；未涉及其他潜在耐药机制 | 探索晚期肝细胞癌患者对阿特珠单抗+贝伐珠单抗联合治疗的应答和耐药机制 | 晚期肝细胞癌患者 | 单细胞转录组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，RNA测序 | 基因表达特征分析 | 单细胞RNA测序数据，RNA测序数据 | 422例RNA测序样本（317例接受atezo+bev治疗，47例接受atezolizumab单药，58例接受索拉非尼治疗） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3524 | 2025-10-06 |
Redefining macrophage phenotypes after spinal cord injury: An open data approach
2025-Jun, Experimental neurology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.expneurol.2025.115222
PMID:40113007
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研究论文 | 通过整合分析三个公开的单细胞RNA测序数据集，重新定义了脊髓损伤后巨噬细胞表型的异质性 | 采用无偏倚的数据整合方法，首次在三个独立数据集中一致识别出四种保守的巨噬细胞群体 | 研究仅聚焦于7天损伤时间点的年轻雌性小鼠模型，未涵盖其他时间点或不同性别/年龄的动物 | 重新定义脊髓损伤后巨噬细胞的表型异质性 | 脊髓损伤后小鼠脊髓组织中的巨噬细胞 | 生物信息学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | Seurat, SingleR | 单细胞基因表达数据 | 三个独立研究团队的公开数据集，样本来自接受中胸段脊髓挫伤的年轻雌性小鼠7天损伤时间点 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3525 | 2025-10-06 |
scRNA-seq reveals transcriptional plasticity of var gene expression in Plasmodium falciparum for host immune avoidance
2025-Jun, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-025-02008-5
PMID:40379932
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示恶性疟原虫var基因表达的可塑性及其在宿主免疫逃避中的作用 | 首次在单细胞水平证明恶性疟原虫除了单等位基因var基因表达外，还能同时表达多个var基因或进入低/无表达状态 | 研究仅使用了3D7和IT4两个克隆寄生虫系，可能需要更多寄生虫株验证 | 探究恶性疟原虫var基因表达机制及其在免疫逃避中的作用 | 恶性疟原虫克隆株3D7和IT4 | 单细胞生物学 | 疟疾 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 两个克隆寄生虫系(3D7和IT4) | NA | 单细胞RNA-seq | 便携式微孔系统 | 使用富集探针和便携式微孔系统的单细胞转录组学技术 |
| 3526 | 2025-10-06 |
Meningeal-derived retinoic acid regulates neurogenesis via suppression of Notch and Sox2
2025-May-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115637
PMID:40310723
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研究论文 | 本研究揭示脑膜来源的视黄酸通过抑制Notch和Sox2通路调控神经发生的新机制 | 首次发现脑膜来源的视黄酸通过结合Sox2ot启动子抑制Notch信号通路和Sox2表达，从而促进神经发生 | 研究主要基于Foxc1突变胚胎模型，机制验证仍需进一步扩展 | 探究脑膜来源视黄酸调控端脑神经前体细胞神经发生的分子机制 | 小鼠胚胎端脑神经前体细胞 | 发育神经生物学 | 神经发育障碍 | 空间转录组学，RARα DNA结合分析，子宫内电穿孔 | Foxc1突变胚胎模型 | 基因表达数据，DNA结合数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3527 | 2025-10-06 |
Exploring the immune environment of glioblastoma through single-cell RNA sequencing in humanized mouse models
2025-May-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.17.654526
PMID:40475625
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研究论文 | 通过人源化小鼠模型中的单细胞RNA测序探索胶质母细胞瘤的免疫环境 | 建立了利用患者来源异种移植的人源化小鼠胶质母细胞瘤模型，该模型能更好地模拟复发性胶质母细胞瘤的免疫特征 | 模型基于免疫缺陷小鼠，可能无法完全模拟人类完整的免疫系统功能 | 研究胶质母细胞瘤的肿瘤免疫微环境并评估新疗法 | 人源化小鼠模型中的胶质母细胞瘤患者来源异种移植 | 单细胞测序分析 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，免疫组织化学 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 两个免疫缺陷小鼠模型，使用人脐带血来源的CD34+造血干细胞祖细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3528 | 2025-10-06 |
Sex differences in adenosine deaminase activity associate with disparities in SARS-CoV-2 innate immunity
2025-May-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112418
PMID:40343269
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研究论文 | 本研究揭示腺苷脱氨酶活性性别差异与SARS-CoV-2先天免疫差异的关联机制 | 首次发现女性ADA活性较低与内源性逆转录病毒-干扰素刺激基因信号增强的关联，并阐明IL-18驱动性别特异性ADA2表达的机制 | 样本来源和数量未明确说明，机制研究仍需进一步验证 | 探究抗病毒免疫性别差异的分子机制 | 健康人群和COVID-19患者的血液、肺组织和呼吸道细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3529 | 2025-10-06 |
Enhanced interpretation of immune cell phenotype and function through a rhesus macaque single-cell atlas
2025-May-14, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100849
PMID:40233746
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研究论文 | 本研究构建了首个以免疫为重点的猕猴单细胞多组织图谱，通过对比转录谱与免疫谱系揭示了无监督聚类在免疫细胞分析中的局限性 | 创建了首个猕猴免疫参考图谱，识别了具有高判别价值的基因程序，包括模拟T/NK细胞成熟的多基因特征 | 无监督聚类在T细胞和自然杀伤细胞分析中会导致功能不同亚群的系统性混合 | 提高通过单细胞图谱解读免疫细胞表型和功能的准确性 | 猕猴免疫细胞 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类分析 | 转录组数据 | 多组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3530 | 2025-10-06 |
Reparative immunological consequences of stem cell transplantation as a cellular therapy for refractory Crohn's disease
2025-May-07, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-333558
PMID:39961646
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研究论文 | 本研究探讨自体造血干细胞移植治疗难治性克罗恩病的免疫修复机制 | 首次揭示干细胞移植通过影响肠道髓系细胞谱系发挥治疗作用，并发现克罗恩病患者造血干细胞功能异质性 | 样本量较小(n=19)，为单臂II期研究 | 理解干细胞移植后免疫系统重建机制及其作为细胞疗法的潜在作用 | 难治性克罗恩病成人患者 | 数字病理 | 克罗恩病 | scRNA-seq, CyTOF, 小鼠异种移植模型 | NA | 血液样本, 肠道组织样本 | 19例难治性克罗恩病患者 | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 3531 | 2025-10-06 |
Citrullination of NF-κB p65 by PAD2 as a Novel Therapeutic Target for Modulating Macrophage Polarization in Acute Lung Injury
2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202413253
PMID:40087815
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研究论文 | 本研究发现了PAD2对NF-κB p65的新型瓜氨酸化修饰机制，并开发了靶向M1巨噬细胞的纳米药物治疗急性肺损伤 | 首次发现NF-κB p65在精氨酸171位点的PAD2介导瓜氨酸化修饰，并开发了ICAM-1抗体靶向的金纳米颗粒递送系统 | 研究主要聚焦于铜绿假单胞菌诱导的急性肺损伤模型，其他病因的ALI是否适用仍需验证 | 探索PAD2调控巨噬细胞极化的分子机制并开发急性肺损伤的新型治疗策略 | 巨噬细胞极化过程及铜绿假单胞菌诱导的急性肺损伤小鼠模型 | 分子生物学与纳米医学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序, 质谱蛋白质组学, 纳米颗粒递送系统 | NA | 基因表达数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3532 | 2025-10-06 |
Histological signatures map anti-fibrotic factors in mouse and human lungs
2025-May, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-08727-3
PMID:40108456
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研究论文 | 本研究通过空间表型分析和小鼠肺纤维化模型，绘制了促纤维化和抗纤维化因子的图谱 | 首次将时空分辨的基质转化与多组学数据整合，识别了具有功能价值的促纤维化与抗纤维化特征 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据验证仍需进一步扩展 | 探索肺纤维化过程中基质结构与纤维细胞亚型的功能作用 | 小鼠和人类肺组织，特发性肺纤维化患者样本 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞测序，空间转录组学，蛋白质水平空间表型分析 | NA | 组织图像，单细胞测序数据，空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | NA |
| 3533 | 2025-10-06 |
Single cell RNA sequencing of haematopoietic cells in fresh and frozen human atheroma tissue
2025-Apr-29, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaf014
PMID:39907372
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序比较新鲜与冷冻保存的人类动脉粥样斑块中造血细胞的转录组特征 | 首次系统评估冷冻保存对脆弱坏死动脉粥样斑块中造血细胞单细胞转录组分析的影响 | 颈动脉样本中LYVE1+巨噬细胞缺失，样本量较小（5对样本） | 确定冷冻保存是否影响动脉粥样斑块中造血细胞的活性和转录组特征 | 人类动脉粥样斑块中的造血细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 5对新鲜与冷冻动脉粥样斑块样本（3个冠状动脉，2个颈动脉） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序工作流程 |
| 3534 | 2025-10-06 |
Investigative needle core biopsies support multimodal deep-data generation in glioblastoma
2025-Apr-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58452-8
PMID:40295505
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研究论文 | 本研究展示了通过常规立体定向穿刺活检获取的胶质母细胞瘤组织可进行多组学深度数据分析 | 首次系统验证立体定向穿刺活检在生成多组学数据和监测治疗反应方面的可行性 | 样本量有限，需要更大规模研究验证 | 探索立体定向穿刺活检在胶质母细胞瘤多组学分析和治疗监测中的应用价值 | 胶质母细胞瘤患者术中获取的穿刺活检组织 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,代谢组学,蛋白质组学,磷酸化蛋白质组学,T细胞克隆型分析,MHC I类免疫肽组学 | NA | 多组学数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,代谢组学,蛋白质组学,磷酸化蛋白质组学,免疫肽组学 | NA | NA |
| 3535 | 2025-10-06 |
Single-cell and spatial detection of senescent cells using DeepScence
2025-Apr-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.21.568150
PMID:38045252
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研究论文 | 开发了一种基于深度神经网络的DeepScence方法，用于在单细胞和空间转录组数据中准确识别衰老细胞 | 提出了CoreScence衰老相关基因集，并开发了DeepScence深度学习方法，能够同时在单细胞和空间转录组数据中识别衰老细胞，性能显著优于现有方法 | NA | 开发准确识别衰老细胞的方法，研究其空间和分子特征 | 衰老细胞 | 生物信息学 | 衰老相关疾病 | 单细胞转录组测序，空间转录组测序 | 深度神经网络 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 3536 | 2025-10-06 |
Single cell RNA sequencing after moderate traumatic brain injury: effects of therapeutic hypothermia
2025-Apr-18, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03430-6
PMID:40251570
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析中度创伤性脑损伤后治疗性低温对多种细胞类型特异性转录反应的影响 | 首次在单细胞水平上揭示治疗性低温对创伤性脑损伤后胶质细胞和血管细胞特异性转录调控的机制 | 研究仅观察损伤后24小时的时间点，样本量相对有限 | 探究治疗性低温对创伤性脑损伤后细胞类型特异性分子机制的影响 | C57BL/6小鼠的脑皮质组织 | 单细胞测序分析 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | C57BL/6小鼠创伤性脑损伤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3537 | 2025-10-06 |
An atlas of single-cell eQTLs dissects autoimmune disease genes and identifies novel drug classes for treatment
2025-Apr-09, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100820
PMID:40154479
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研究论文 | 通过单细胞eQTL图谱解析自身免疫疾病基因并识别新型治疗药物类别 | 提出JOBS联合模型将bulk eQTL建模为单细胞eQTL的加权和，显著提高eQTL检测能力 | 单细胞eQTL数据集规模相对较小 | 解析自身免疫疾病遗传机制并识别潜在治疗药物 | 14种免疫介导疾病 | 基因组学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序，全基因组关联分析 | JOBS联合模型 | 基因表达数据，基因组变异数据 | OneK1K和eQTLGen数据集 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3538 | 2025-10-06 |
EcDNA-borne PVT1 fusion stabilizes oncogenic mRNAs
2025-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.01.646515
PMID:40236070
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研究论文 | 本研究揭示染色体外DNA(ecDNA)通过结构变异产生基因融合，其中PVT1外显子1作为5'端伴侣可增强癌基因mRNA稳定性 | 首次发现ecDNA通过结构变异产生lncRNA与mRNA的嵌合融合，并阐明PVT1外显子1通过SRSF1蛋白相互作用增强癌基因mRNA稳定性的新机制 | 未明确说明研究样本的具体数量和类型 | 探究ecDNA结构变异产生的基因融合对癌基因表达的调控机制 | 染色体外DNA(ecDNA)、PVT1 lncRNA、癌基因融合转录本 | 癌症基因组学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3539 | 2025-10-06 |
Evidence of off-target probe binding in the 10x Genomics Xenium v1 Human Breast Gene Expression Panel compromises accuracy of spatial transcriptomic profiling
2025-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.31.646342
PMID:40236200
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研究论文 | 本研究通过开发OPT软件工具，揭示了10x Genomics Xenium v1人类乳腺癌基因表达面板中存在的脱靶探针结合问题 | 开发了首个专门检测空间转录组技术中脱靶探针结合的工具OPT，并系统评估了Xenium平台的探针特异性问题 | 研究仅针对特定版本的Xenium人类乳腺癌基因面板，结果可能不适用于其他基因面板或平台版本 | 评估10x Genomics Xenium平台探针结合的特异性，提高空间转录组数据的生物学可解释性 | 10x Genomics Xenium v1人类乳腺癌基因表达面板中的280个基因 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 探针序列比对，空间转录组分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，探针序列数据 | 来自同一肿瘤组织的多个数据集 | 10x Genomics | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | 10x Xenium, 10x Visium CytAssist, 10x Chromium | 10x Genomics Xenium v1 Human Breast Gene Expression Panel, Visium CytAssist, 3' single-cell RNA-seq |
| 3540 | 2025-10-06 |
Crosstalk Signaling Between the Epithelial and Non-Epithelial Compartments of the Mouse Inner Ear
2025-Apr, Journal of the Association for Research in Otolaryngology : JARO
DOI:10.1007/s10162-025-00980-7
PMID:40080263
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探索小鼠内耳前庭器官中上皮细胞与非上皮间充质细胞之间的信号串扰 | 首次在新生小鼠椭圆囊中系统揭示上皮与非上皮细胞区室间的动态信号交流，特别是间充质细胞在出生后发育中的主导信号发送作用 | 研究仅关注出生后第4天和第6天两个时间点，未能覆盖更完整的发育时间序列 | 探索内耳前庭器官发育过程中上皮与非上皮细胞区室间的相互作用机制 | 新生小鼠内耳椭圆囊细胞 | 单细胞生物学 | 前庭功能障碍 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学，定量多重原位杂交 | 多种计算方法 | 单细胞转录组数据，图像数据 | 955个细胞，来自12个注释细胞群体 | NA | 单细胞RNA-seq | Smart-seq2 | 全长Smart-seq2单细胞RNA测序 |