单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
321	2025-07-03	Molecular pathology, developmental changes and synaptic dysfunction in (pre-) symptomatic human C9ORF72-ALS/FTD cerebral organoids 2024-09-18, Acta neuropathologica communications IF:6.2Q1 DOI:10.1186/s40478-024-01857-1 PMID:39289761	研究论文	研究通过iPSC衍生的脑类器官模型，揭示了C9ORF72基因六核苷酸重复扩增（HRE）导致的肌萎缩侧索硬化症（ALS）和额颞叶痴呆（FTD）的早期分子病理和突触功能障碍	首次在3D人脑类器官模型中揭示了C9-ALS/FTD的早期分子病理和突触功能障碍，包括细胞类型丰度和分布的变化	研究样本量有限，且类器官模型可能无法完全模拟人脑的复杂性	理解C9ORF72-HRE导致的ALS和FTD的早期病理机制	C9-ALS/FTD患者、无症状C9ORF72-HRE携带者和对照组的iPSC衍生的脑类器官	分子病理学	肌萎缩侧索硬化症, 额颞叶痴呆	iPSC衍生技术, 单细胞RNA测序, 膜片钳电生理学	脑类器官模型	分子和细胞数据, 电生理数据	C9-ALS/FTD患者、无症状C9ORF72-HRE携带者和对照组的脑类器官
322	2025-07-03	Spatial transcriptomic analysis of adult hippocampal neurogenesis in the human brain 2024 Sep-Oct, Journal of psychiatry & neuroscience : JPN IF:4.1Q1 DOI:10.1503/jpn.240026 PMID:39414359	研究论文	通过空间转录组学和多重荧光原位杂交技术，评估了人类死后海马样本中的成人海马神经发生现象	结合空间转录组学和多重荧光原位杂交技术，首次在人类死后海马样本中评估成人海马神经发生的存在	样本量小且仅包括男性样本	评估人类成人海马神经发生的存在及其特征	人类死后齿状回（DG）样本	神经科学	NA	空间转录组学, 多重荧光原位杂交	NA	空间转录组数据, 荧光原位杂交图像	婴儿（n = 1, 2岁）, 青少年（n = 1, 16岁）, 年轻成人（n = 2, 平均23.5岁）, 中年（n = 2, 平均42.5岁）, 以及固定冷冻的中年男性DG组织（n = 6, 平均43.5岁）
323	2025-07-03	Microglia-specific IL-10 gene delivery inhibits neuroinflammation and neurodegeneration in a mouse model of Parkinson's disease 2024-08-21, Science translational medicine IF:15.8Q1 DOI:10.1126/scitranslmed.adm8563 PMID:39167665	研究论文	本研究探讨了在小鼠帕金森病模型中，通过小胶质细胞特异性递送IL-10基因抑制神经炎症和神经退行性变的治疗效果	揭示了IL-10通过诱导小胶质细胞新状态增强吞噬和清除活性，并调节T淋巴细胞分化，为帕金森病治疗提供了新策略	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证其安全性和有效性	探索通过调节神经炎症来保护多巴胺能神经元的新治疗方法	帕金森病小鼠模型中的小胶质细胞和多巴胺能神经元	神经科学	帕金森病	病毒基因递送技术、单细胞转录组学	小鼠帕金森病模型	基因表达数据、细胞表型数据	多个常用帕金森病小鼠模型
324	2025-07-03	Natural killer cells promote neutrophil extracellular traps and restrain macular degeneration in mice 2024-08-14, Science translational medicine IF:15.8Q1 DOI:10.1126/scitranslmed.adi6626 PMID:39141700	研究论文	研究发现自然杀伤细胞（NK细胞）通过促进中性粒细胞胞外诱捕网（NETs）的形成来抑制小鼠模型中的黄斑变性	首次揭示了NK细胞在nvAMD中的保护作用及其通过CCR5和NKG2D的机制	研究主要基于小鼠模型，人类样本数据有限	探究自然杀伤细胞在新生血管性年龄相关性黄斑变性（nvAMD）中的作用机制	自然杀伤细胞（NK细胞）、中性粒细胞胞外诱捕网（NETs）、小鼠模型和人类样本	免疫学	黄斑变性	Olink蛋白质组学分析、单细胞RNA测序、基因敲除研究	小鼠模型	蛋白质组数据、RNA测序数据	小鼠模型和有限的人类供体样本
325	2025-07-03	Comparative single-cell analysis reveals IFN-γ as a driver of respiratory sequelae after acute COVID-19 2024-07-17, Science translational medicine IF:15.8Q1 DOI:10.1126/scitranslmed.adn0136 PMID:39018367	研究论文	通过比较临床样本和动物模型的单细胞RNA测序数据，揭示了IFN-γ在急性COVID-19后呼吸道后遗症中的关键作用	首次在人类和小鼠模型中比较了呼吸道PASC的单细胞RNA测序数据，并确定了IFN-γ作为免疫异常的关键节点	研究主要基于呼吸道样本，可能无法完全代表其他器官系统的PASC症状	理解SARS-CoV-2感染后急性后遗症(PASC)的病因学	临床PASC样本和小鼠PASC模型	免疫学	COVID-19后遗症	单细胞RNA测序	小鼠模型	RNA测序数据	临床PASC样本和小鼠模型样本（具体数量未提及）
326	2025-07-03	Control of goal-directed and inflexible actions by dorsal striatal melanocortin systems, in coordination with the central nucleus of the amygdala 2024-Jul, Progress in neurobiology IF:6.7Q1 DOI:10.1016/j.pneurobio.2024.102629 PMID:38763506	研究论文	研究揭示了背侧纹状体中表达黑素皮质素-4受体（MC4R）的多巴胺D1受体神经元在控制小鼠基于奖励可能性的行为灵活性中的作用	发现MC4R+神经元通过抑制背侧纹状体中的即刻早期基因水平来调控行为灵活性，并揭示了其与杏仁核中央核的功能性连接	研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需进一步验证	探究背侧纹状体中MC4R在调控目标导向行为和刻板行为中的作用机制	小鼠的背侧纹状体和杏仁核中央核	神经科学	NA	空间转录组学分析、行为实验	NA	基因表达数据、行为数据	NA
327	2025-07-03	Wnt Signaling Inhibition Prevents Postnatal Inflammation and Disease Progression in Mouse Congenital Myxomatous Valve Disease 2024-07, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology DOI:10.1161/ATVBAHA.123.320388 PMID:38660802	研究论文	本研究探讨了Wnt信号通路在小鼠先天性黏液瘤性瓣膜病（MVD）中的作用及其作为早期治疗靶点的潜力	首次揭示了Wnt信号通路在MVD起始阶段的关键作用，并证明早期抑制Wnt信号可阻止疾病发展	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类患者中验证	阐明Wnt信号通路在MVD发病机制中的作用并探索潜在治疗策略	携带Fbn1C1039G/+基因变异的Marfan综合征小鼠模型	心血管疾病	先天性黏液瘤性瓣膜病	单细胞RNA测序，TCF/Lef-lacZ报告基因系统，免疫荧光	小鼠遗传模型	基因表达数据，组织学图像	野生型和Fbn1C1039G/+小鼠的瓣膜组织
328	2025-07-03	Salivary Gland Tissue Recombination Can Modify Cell Fate 2024-07, Journal of dental research IF:5.7Q1 DOI:10.1177/00220345241247484 PMID:38715201	研究论文	通过单细胞RNA测序和成像分析，研究胚胎小鼠唾液腺组织中间质和上皮重组对细胞命运的影响	首次全面无偏地分子表征了组织重组方法在探索细胞命运调控中的作用，并发现了双向诱导的证据	研究仅限于小鼠胚胎唾液腺组织，未涉及其他器官或发育阶段	阐明组织相互作用在细胞分化中的具体作用	胚胎小鼠的腮腺（浆液腺）和颌下腺（主要为粘液腺）	分子生物学	NA	单细胞RNA测序、成像分析	NA	基因表达数据、图像数据	胚胎小鼠唾液腺组织
329	2025-07-03	Similarity Network Analysis of the Adaptive Immune Response in the Proximal Airway 2024-Jul, The Laryngoscope DOI:10.1002/lary.31376 PMID:38450771	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和相似性网络分析，探讨了特发性声门下狭窄（iSGS）患者近端气道黏膜中适应性免疫反应的T细胞克隆分布及其抗原靶点	首次揭示了健康气道黏膜中T细胞克隆在多个解剖亚位点的高度保守性，以及iSGS患者疤痕组织中低频率克隆共享抗原靶点的现象	样本量相对较小（iSGS患者32例，健康对照10例），且仅针对特发性声门下狭窄这一特定疾病	探究近端气道黏膜中适应性免疫反应的T细胞克隆分布及其抗原靶点	特发性声门下狭窄患者（iSGS）和健康对照者的气道黏膜组织	免疫学	特发性声门下狭窄	单细胞RNA测序，T细胞受体（TCR）序列分析，GLIPH2算法	NA	RNA测序数据	iSGS患者32例，健康对照10例
330	2025-07-03	Non-canonical Wnt pathway expression in the developing mouse and human retina 2024-Jul, Experimental eye research IF:3.0Q1 DOI:10.1016/j.exer.2024.109947 PMID:38815793	研究论文	本研究通过分析小鼠和人类视网膜以及人类视网膜类器官的单细胞RNA测序数据，探讨了非经典Wnt通路在视网膜发育和突触形成中的作用	发现了小鼠和人类FZD3和WNT10A的差异表达模式，以及在小鼠Chat星爆无长突细胞中未描述的Wnt2b表达	研究主要依赖于公开可用的单细胞RNA测序数据，可能受限于数据的质量和覆盖范围	探讨非经典Wnt通路在小鼠和人类视网膜发育及突触形成中的作用	小鼠视网膜、人类视网膜和人类视网膜类器官	发育生物学	NA	单细胞RNA测序(scRNAseq)、荧光原位杂交(FISH)	NA	RNA测序数据、图像数据	多个发育时间点的小鼠视网膜、人类视网膜和人类视网膜类器官数据
331	2025-07-03	Molecular heterogeneity of quiescent melanocyte stem cells revealed by single-cell RNA-sequencing 2024-07, Pigment cell & melanoma research IF:3.9Q2 DOI:10.1111/pcmr.13169 PMID:38613320	研究论文	通过单细胞RNA测序揭示静止黑色素细胞干细胞的分子异质性	确认了静止黑色素细胞干细胞(qMcSCs)的现有分子特征，并发现了新的qMcSC亚群，其中两个亚群差异调节其免疫特权状态	研究仅基于成年雌性C57BL/6J小鼠的皮肤样本，可能不适用于其他物种或性别	探究静止黑色素细胞干细胞的分子异质性	成年雌性C57BL/6J小鼠的静止黑色素细胞干细胞	单细胞转录组学	NA	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	RNA测序数据	来自成年雌性C57BL/6J小鼠的KIT+/CD45-细胞
332	2025-07-03	Enhanced prostatic Esr1+ luminal epithelial cells in the absence of SRD5A2 2024-07, The Journal of pathology IF:5.6Q1 DOI:10.1002/path.6283 PMID:38606616	研究论文	研究探讨了SRD5A2缺失对前列腺细胞异质性的影响，特别是对雌激素受体1（ESR1）阳性管腔上皮细胞的影响	发现SRD5A2缺失导致ESR1阳性管腔上皮细胞比例增加和增殖表型增强，揭示了5α还原酶抑制剂（5ARI）耐药机制	研究主要基于小鼠模型，人类样本分析较少，可能限制结果的普适性	探索SRD5A2缺失对前列腺细胞异质性的影响及其在良性前列腺增生（BPH）治疗中的作用	小鼠模型和人类前列腺活检样本	病理学	前列腺增生	单细胞RNA测序	小鼠模型	RNA测序数据和临床活检数据	NA
333	2024-08-07	Comment on Hu et al. Single-Cell Transcriptomics Reveals Novel Role of Microglia in Fibrovascular Membrane of Proliferative Diabetic Retinopathy. Diabetes 2022;71:762-773 2024-Jul-01, Diabetes.. IF:6.2Q1 DOI:10.2337/db24-0041 PMID:38900953	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
334	2025-07-03	Positionally distinct interferon stimulated dermal immune acting fibroblasts promote neutrophil recruitment in Sweet's syndrome 2024-Jun-28, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.06.24.600500 PMID:38979312	研究论文	本文通过单核和批量转录组学分析Sweet综合征的皮肤样本，揭示了干扰素信号在Sweet综合征中的作用，并发现不同位置的免疫活性成纤维细胞在促进中性粒细胞招募中的功能	首次在Sweet综合征中识别出位置不同的免疫活性成纤维细胞亚群，并阐明了它们通过识别I型干扰素在疾病发病机制中的作用	研究基于临床存档样本和体外培养的成纤维细胞，可能无法完全反映体内复杂环境	阐明Sweet综合征中中性粒细胞浸润的分子机制	Sweet综合征患者的皮肤样本和体外培养的原代人皮肤成纤维细胞	皮肤病理学	Sweet综合征	单核转录组学、批量转录组学、单分子分辨率空间转录组学	NA	转录组数据	临床存档的Sweet综合征皮肤样本和体外培养的原代人皮肤成纤维细胞
335	2025-07-03	Sex differences and immune correlates of Long COVID development, persistence, and resolution 2024-Jun-19, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.06.18.599612 PMID:38948732	研究论文	本研究探讨了性别差异与长新冠（LC）发展、持续和消退的免疫相关性	揭示了性别特异性的免疫失调在长新冠发病机制中的作用，并识别了与长新冠相关的多种先天和适应性免疫特征	样本量较小（45名患者），且仅基于血液样本分析	研究长新冠的免疫学基础及其性别差异	45名发展为长新冠或康复的新冠患者	免疫学	COVID-19	单细胞转录组学、单细胞蛋白质组学、血浆蛋白质组学	NA	血液样本	45名患者
336	2025-07-03	Anti-PD-1 cancer immunotherapy induces central nervous system immune-related adverse events by microglia activation 2024-06-12, Science translational medicine IF:15.8Q1 DOI:10.1126/scitranslmed.adj9672 PMID:38865481	研究论文	本文研究了抗PD-1免疫疗法在癌症治疗中引起的中枢神经系统免疫相关不良事件（CNS-irAEs）及其与小胶质细胞激活的关系	揭示了小胶质细胞在抗PD-1免疫疗法诱导的CNS-irAEs中的关键作用，并提出了基于脾酪氨酸激酶（Syk）抑制的治疗方法	研究主要基于小鼠模型，人类患者数据有限，需要进一步验证	探究抗PD-1免疫疗法引起的中枢神经系统免疫相关不良事件的机制	小鼠模型和接受抗PD-1治疗的患者中枢神经系统组织	免疫疗法	癌症	单细胞RNA测序、成像质谱流式细胞术、蛋白质组学方法	NA	基因表达数据、蛋白质数据、影像数据	小鼠模型和一组接受抗PD-1治疗的患者组织样本
337	2025-07-03	Single cell spatial transcriptomic profiling of childhood-onset lupus nephritis reveals complex interactions between kidney stroma and infiltrating immune cells 2023-Nov-13, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2023.11.09.566503 PMID:38014158	research paper	利用单细胞空间转录组技术研究儿童发病型狼疮肾炎中肾脏基质与浸润免疫细胞间的复杂相互作用	首次在儿童发病型狼疮肾炎中应用高分辨率的单细胞空间转录组技术，揭示了免疫细胞在肾脏中的特定区域定位及与基质细胞的基因表达变化	组织学评分与肾小球细胞转录特征在单个肾小球水平上相关性较低，样本量相对较小（8例患者和2例对照）	探索儿童发病型狼疮肾炎的免疫发病机制	儿童发病型狼疮肾炎患者的肾脏组织和浸润免疫细胞	digital pathology	lupus nephritis	单细胞空间转录组技术	NA	单细胞转录组数据	8例儿童发病型狼疮肾炎患者和2例对照的肾脏组织，超过40万个细胞
338	2025-07-03	Development of a cell-free strategy to recover aged skeletal muscle after disuse 2023-11, The Journal of physiology DOI:10.1113/JP282867 PMID:35318675	研究论文	本研究开发了一种无细胞策略，用于恢复老年人在长期卧床或肢体固定后的骨骼肌萎缩	利用健康供体的周细胞经H2O2刺激产生的小细胞外囊泡（sEVs），有效恢复成年和老年小鼠在废用后的肌纤维大小	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体中验证	探索一种无细胞方法以改善老年人骨骼肌在废用后的恢复	小鼠骨骼肌中的周细胞及其分泌的小细胞外囊泡（sEVs）	肌肉生物学	肌肉萎缩	单细胞RNA测序、蛋白质组学分析	小鼠模型	RNA测序数据、蛋白质组数据	年轻成年和老年小鼠
339	2025-07-03	Single-cell RNA sequencing reveals gene expression signatures of breast cancer-associated endothelial cells 2018-Feb-16, Oncotarget DOI:10.18632/oncotarget.23760 PMID:29541388	研究论文	通过单细胞RNA测序揭示了乳腺癌相关内皮细胞的基因表达特征	首次通过scRNA-seq技术比较了乳腺癌肿瘤内皮细胞与正常内皮细胞的基因表达差异，并鉴定了与细胞外基质信号通路相关的关键基因	研究样本来源有限，仅针对乳腺癌组织，未涉及其他癌症类型的广泛验证	探究乳腺癌肿瘤内皮细胞的分子特征及其在肿瘤生物学中的作用	人类乳腺癌组织和减乳整形术组织中的内皮细胞	生物信息学	乳腺癌	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	PCA分析、层次聚类分析	基因表达数据	未明确说明样本数量（乳腺癌组织与减乳整形术组织的内皮细胞样本）
340	2025-07-02	Organelle symphony: Nuclear factor erythroid 2-related factor 2 and nuclear factor-kappa B in stroke pathobiology 2026-Apr-01, Neural regeneration research IF:5.9Q1 DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-01404 PMID:40146002	综述	本文综述了核因子红细胞2相关因子2（Nrf2）和核因子κB（NF-κB）在缺血性和出血性中风病理生物学中的作用，重点关注它们在氧化应激、炎症和神经保护中的机制	强调了Nrf2和NF-κB在中风病理生理学中的相互作用及其在细胞器间的串扰，提出了通过单细胞测序和空间转录组学开发靶向治疗的新视角	未具体讨论针对Nrf2和NF-κB的靶向治疗在临床实践中的应用挑战和效果	探讨Nrf2和NF-κB在中风病理生物学中的作用及其潜在的治疗靶点	核因子红细胞2相关因子2（Nrf2）和核因子κB（NF-κB）	神经科学	中风	单细胞测序、空间转录组学	NA	NA	NA