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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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281 | 2025-10-05 |
Single-cell sequencing insights into the transcriptional landscape of cerebral cavernous malformations
2025-Sep-30, Angiogenesis
IF:9.2Q1
DOI:10.1007/s10456-025-10011-x
PMID:41028361
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综述 | 本文综述单细胞RNA测序技术在脑 cavernous 血管畸形研究中的应用进展 | 首次系统总结单细胞测序在CCM疾病中揭示内皮细胞、壁细胞、成纤维细胞、星形胶质细胞和免疫细胞转录组特征的研究进展 | NA | 探索单细胞测序技术在脑 cavernous 血管畸形研究中的应用价值 | 脑 cavernous 血管畸形中的内皮细胞、壁细胞、成纤维细胞、星形胶质细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
282 | 2025-10-05 |
ERO1A-positive tumor epithelial cells in colorectal cancer progression: a multi-omics perspective
2025-Sep-30, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-025-02184-z
PMID:41028408
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研究论文 | 通过多组学方法鉴定ERO1A阳性肿瘤上皮细胞在结直肠癌进展中的关键作用 | 首次发现ERO1A阳性上皮细胞亚群在晚期结直肠癌中显著富集,并构建了基于ERO1A+TME评分的预后预测模型ETSRM | 研究基于多中心队列但需进一步验证,机制研究仍需深入 | 探究ERO1A阳性肿瘤上皮细胞在结直肠癌进展中的作用机制 | 结直肠癌患者样本和细胞模型 | 数字病理 | 结直肠癌 | 单细胞转录组学、空间转录组学、蛋白质组学、生物信息学分析 | 风险预测模型ETSRM | 转录组数据、蛋白质组数据、空间转录组数据 | 21个多中心队列共2,767例样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
283 | 2025-10-05 |
NQO1/p65/CXCL12 Axis-Recruited Tregs Mediate Resistance to Anti-PD-1 Plus Lenvatinib Therapy in PIVKA-II-Positive Hepatocellular Carcinoma
2025-Sep-30, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202511152
PMID:41028931
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研究论文 | 本研究揭示了PIVKA-II阳性肝细胞癌中通过NQO1/p65/CXCL12轴招募Treg细胞导致抗PD-1联合乐伐替尼治疗耐药的机制 | 首次发现PIVKA-II通过上调NQO1稳定p65蛋白,激活NF-κB/CXCL12轴招募Treg细胞介导治疗耐药的新机制 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证 | 探究PIVKA-II阳性肝细胞癌对免疫联合治疗耐药的机制 | 肝细胞癌患者肿瘤组织和细胞 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,体外实验,体内实验 | NA | 临床数据,单细胞RNA测序数据 | 156例手术切除患者和104例接受治疗患者,其中22例进行单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
284 | 2025-10-05 |
The loss of microRNA-26b promotes aortic calcification through the regulation of cell-specific target genes
2025-Sep-29, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaf117
PMID:40737220
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研究论文 | 本研究首次揭示microRNA-26b缺失通过调控细胞特异性靶基因促进主动脉钙化的机制 | 首次发现miR-26b在主动脉钙化中的关键作用,结合单细胞转录组学和网络分析揭示细胞特异性靶点 | NA | 探索miR-26b在血管钙化中的潜在作用机制 | miR-26b基因敲除小鼠和主动脉瘤或瓣膜相关主动脉病变患者的主动脉组织 | 分子生物学 | 心血管疾病 | micro-PET/CT成像, 18F-氟化钠标记, 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 网络分析 | NA | 基因表达数据, 影像数据 | miR-26bKO小鼠和人类主动脉组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
285 | 2025-10-05 |
Tumor microenvironment delineates differential responders to trastuzumab emtansine in HER2-positive metastatic breast cancer patients previously treated with pyrotinib: an exploratory biomarker analysis of a phase II study (NJMU-BC02)
2025-Sep-29, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02409-2
PMID:41016944
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研究论文 | 探索T-DM1在既往接受吡咯替尼治疗的HER2阳性转移性乳腺癌患者中的疗效及肿瘤微环境生物标志物 | 首次发现癌细胞低细胞周期活性、活化巨噬细胞和CD8+ T细胞与T-DM1良好疗效相关 | 样本量较小,需更大规模研究验证生物标志物 | 评估T-DM1在既往接受吡咯替尼治疗的HER2阳性转移性乳腺癌患者中的疗效和安全性 | HER2阳性转移性乳腺癌患者 | 单细胞测序分析 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 36名患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
286 | 2025-10-05 |
PD-L1(+) tumor-associated macrophages induce CD8(+) T Cell exhaustion in hepatocellular carcinoma
2025-Sep-29, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2025.101234
PMID:41027276
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学、空间分析和功能实验,揭示了PD-L1阳性肿瘤相关巨噬细胞在肝细胞癌中诱导CD8阳性T细胞耗竭的关键作用 | 首次系统阐明PD-L1阳性肿瘤相关巨噬细胞通过GM-CSF诱导途径促进CD8阳性T细胞耗竭的具体机制,并证明抗GM-CSF与抗PD-L1联合治疗的协同效应 | 研究样本量相对有限,主要基于手术标本,缺乏更大规模的前瞻性验证 | 阐明PD-L1阳性肿瘤相关巨噬细胞在肝细胞癌免疫抑制微环境中的具体功能和机制 | 肝细胞癌患者肿瘤样本、体外培养的巨噬细胞和CD8阳性T细胞、小鼠原位肝癌模型 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多重免疫荧光染色、体外功能实验、体内治疗模型 | 小鼠原位肝癌模型 | 单细胞转录组数据、空间分布数据、免疫荧光图像 | 113例肝细胞癌患者手术标本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
287 | 2025-10-05 |
Treg-microglia partnership in the injured spinal cord preserves Treg cell function and regulates microglial cholesterol metabolism
2025-Sep-29, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2025.09.001
PMID:41027425
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研究论文 | 本研究揭示了Treg细胞与小胶质细胞在脊髓损伤中的相互作用机制 | 首次发现胸腺来源的Treg细胞通过外周血浸润损伤脊髓,并阐明其通过MHC II和CTLA-4途径调节小胶质细胞胆固醇代谢的神经保护机制 | Treg细胞与微环境相互作用的详细分子机制仍需进一步探索 | 阐明Treg细胞在脊髓损伤中的时空动态和功能作用 | 脊髓损伤模型中的Treg细胞和小胶质细胞 | 免疫学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
288 | 2025-10-05 |
Dynamic modulation of claudin18.2 expression and remodeling of the tumor microenvironment in gastric cancer during chemo-immunotherapy
2025-Sep-29, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012683
PMID:41027671
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研究论文 | 本研究探讨了胃癌化疗免疫治疗期间Claudin18.2表达的动态变化及其对肿瘤微环境的影响 | 首次系统揭示了CLDN18.2在化疗免疫治疗过程中的动态表达变化及其与免疫抑制性、纤维化肿瘤微环境的关联 | 单臂II期临床试验设计,样本量相对有限,生存结果在CLDN18.2阳性和阴性组间无显著差异 | 阐明CLDN18.2在胃癌化疗免疫治疗过程中的动态表达规律及其与肿瘤微环境的关系 | 晚期胃癌患者 | 数字病理学 | 胃癌 | 免疫组织化学, 全转录组测序, 全外显子测序, 单细胞RNA测序 | NA | 组织切片图像, 基因组数据, 转录组数据 | 57名晚期胃癌患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
289 | 2025-10-05 |
Human single-cell atlas analysis reveals heterogeneous endothelial signaling
2025-Sep-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.15.670370
PMID:40894541
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研究论文 | 通过整合15个人体组织的300多万个单细胞数据,系统研究内皮细胞异质性及其在不同组织微环境中的调控机制 | 首次在血管类型和组织微环境的双重背景下系统研究内皮细胞异质性,并开发计算流程分析代谢物和蛋白质介导的细胞通讯 | 研究基于现有单细胞数据集,可能受数据质量和覆盖范围的限制 | 探索内皮细胞在不同组织和血管类型中的异质性及其调控机制 | 人体内皮细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 主题模型 | 单细胞转录组数据 | 超过300万个单细胞,涵盖15个人体组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
290 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals LGALS9+ epithelial and COMP+ stromal cell crosstalk driving keratoconus pathogenesis
2025-Sep-27, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.147969
PMID:41022233
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示圆锥角膜发病机制中LGALS9+上皮细胞与COMP+基质细胞的相互作用 | 首次识别出圆锥角膜中LGALS9阳性角膜上皮细胞和COMP阳性角膜基质细胞两个疾病特异性细胞亚群,并发现它们通过LGALS9-CD44/CD45和血小板反应蛋白信号通路形成促纤维化和促炎症网络 | 样本量相对较小(5例患者和5例对照),需要更大规模研究验证 | 研究圆锥角膜的细胞图谱,揭示导致疾病进展的关键病理细胞群和信号通路 | 圆锥角膜患者和健康对照者的角膜组织 | 单细胞组学 | 圆锥角膜 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, 免疫荧光, 蛋白质印迹 | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质表达数据 | 5例圆锥角膜患者和5例健康对照的角膜组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
291 | 2025-10-05 |
SPP1-mediated crosstalk between macrophage and fibroblasts promotes benign airway stenosis
2025-Sep-26, Archives of biochemistry and biophysics
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.abb.2025.110627
PMID:41015147
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研究论文 | 本研究通过大鼠模型和体外共培养系统揭示了M2巨噬细胞通过SPP1介导的信号通路促进良性气道狭窄的纤维化机制 | 首次系统阐明M2巨噬细胞通过SPP1-PI3K/AKT/mTOR信号轴驱动成纤维细胞活化在良性气道狭窄中的作用机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验,需要进一步临床验证 | 阐明M2巨噬细胞在良性气道狭窄发病机制中的作用 | SD大鼠模型、人肉芽组织来源的成纤维细胞、正常气道组织成纤维细胞 | 病理生物学 | 良性气道狭窄 | 单细胞RNA测序、生物信息学分析、体外共培养 | 动物疾病模型、细胞共培养系统 | 基因表达数据、组织病理数据 | SD大鼠分为5个实验组(正常对照和建模后第1、4、7、14天) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
292 | 2025-10-05 |
Comprehensive Immune Subtyping and Multi-Omics Profiling of the Tumor Microenvironment in Colorectal Cancer: Implications for Prognosis and Personalized Immunotherapy
2025-Sep-26, Current cancer drug targets
IF:2.3Q3
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研究论文 | 通过多组学分析对结直肠癌肿瘤微环境进行免疫分型,并开发预后模型和探索微生物多样性作用 | 首次整合TME免疫分型、风险建模、单细胞分析和微生物组分析,揭示微生物多样性对免疫治疗反应的影响 | 需要外部数据集验证,样本量有限 | 识别结直肠癌免疫亚型,开发预后模型,探索微生物多样性在肿瘤进展中的作用 | 结直肠癌患者样本 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,微生物组分析,免疫组织化学,qPCR | 非负矩阵分解,Cox回归,LASSO回归 | 多组学数据,单细胞RNA测序数据,微生物组数据 | 未明确指定样本数量 | NA | 单细胞RNA测序,微生物组分析 | NA | NA |
293 | 2025-10-05 |
Exploring therapeutic targets for hepatocellular carcinoma through druggable genes
2025-Sep-26, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000044627
PMID:41029168
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研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化方法探索肝细胞癌的潜在治疗靶点 | 整合多种分析方法(包括贝叶斯共定位、蛋白质相互作用网络和单细胞RNA测序)系统评估基因与肝细胞癌风险的因果关系 | 未在文中明确说明研究局限性 | 识别肝细胞癌的潜在治疗靶点 | 肝细胞癌相关基因 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序, 贝叶斯共定位, 蛋白质相互作用网络分析 | 两样本孟德尔随机化, 基于汇总数据的孟德尔随机化 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
294 | 2025-10-05 |
A specific gene expression program underlies antigen archiving by lymphatic endothelial cells in mammalian lymph nodes
2025-Sep-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-63543-7
PMID:40998762
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研究论文 | 本研究揭示了淋巴结中淋巴内皮细胞通过特定基因表达程序实现抗原长期存档的机制 | 首次定义了淋巴内皮细胞抗原存档的特异性转录程序,并证明该程序能跨物种预测抗原存档能力 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据验证仍需进一步扩展 | 探究淋巴内皮细胞实现持久抗原存档的分子机制及其调控特性 | 小鼠和人类淋巴结中的淋巴内皮细胞及树突状细胞 | 空间转录组学 | 病毒感染 | 单细胞测序, 空间转录组学, 机器学习 | 机器学习模型 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 多个时间点的免疫后淋巴结组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
295 | 2025-10-05 |
Macrophage-derived FN1 promotes peritoneal cavity metastasis of gastric cancer by inhibiting the Hippo signaling pathway via SDC4
2025-Sep-24, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research
DOI:10.1016/j.bbamcr.2025.120063
PMID:41005547
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研究论文 | 本研究揭示了巨噬细胞来源的FN1通过SDC4抑制Hippo信号通路促进胃癌腹膜腔转移的机制 | 首次发现巨噬细胞来源的FN1通过SDC4抑制Hippo信号通路促进胃癌腹膜转移的新机制 | NA | 探究FN1在胃癌腹膜腔转移中的功能及作用机制 | 胃癌细胞和巨噬细胞 | 单细胞测序分析 | 胃癌 | 单细胞测序, Western blot, MTT, 迁移侵袭实验, 克隆形成实验, 细胞黏附实验 | NA | 单细胞测序数据, 实验数据 | 使用单细胞测序数据集GSE140182 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
296 | 2025-10-05 |
Integrated spatial transcriptomic profiling to dissect the cellular characteristics of tumor-associated tertiary lymphoid structures
2025-Sep-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116250
PMID:40934085
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研究论文 | 通过整合23种癌症的空间转录组数据构建泛癌TA-TLS图谱,解析肿瘤相关三级淋巴结构的细胞特征 | 首次构建泛癌TA-TLS图谱,发现成熟TLS中IgG+浆细胞优先富集,鉴定CCL19+血管周细胞作为淋巴组织组织细胞,揭示动脉内皮细胞通过Notch信号抑制获得高内皮静脉样表型 | 研究主要基于空间转录组数据分析,需要进一步实验验证机制 | 解析肿瘤相关三级淋巴结构的细胞特征和形成机制 | 23种癌症的肿瘤相关三级淋巴结构 | 空间转录组学 | 癌症 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 23种癌症 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
297 | 2025-10-05 |
Lymphatic dysfunction is linked to disease pathogenesis in Duchenne muscular dystrophy animal models
2025-Sep-23, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2505656122
PMID:40966282
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研究论文 | 本研究通过动物模型揭示了淋巴功能障碍与杜氏肌营养不良症发病机制之间的关联 | 首次在DMD动物模型中系统性地证明淋巴系统功能失调与疾病发病机制的直接联系 | 研究主要基于动物模型,尚未在人类患者中验证 | 探究淋巴系统在杜氏肌营养不良症发病机制中的作用 | 小鼠、金毛犬肌营养不良模型及淋巴肌细胞 | 病理生理学 | 杜氏肌营养不良症 | 单细胞RNA测序, 显微淋巴管造影, 磁共振淋巴管成像, 免疫荧光分析 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 影像数据 | 多种DMD动物模型(小鼠和大模型) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
298 | 2025-10-05 |
SPACE: Spatially variable gene clustering adjusting for cell type effect for improved spatial domain detection
2025-Sep-23, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf936
PMID:40985765
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研究论文 | 提出SPACE框架,通过调整细胞类型混杂效应来基于空间模式对空间可变基因进行聚类,以改进空间域检测 | 无需基因簇数量、空间模式或细胞类型信息的先验知识,通过分组SVG并获取每组低维嵌入来保留特定模式、减少信号混合 | 未在摘要中明确说明 | 改进空间转录组分析中的空间域检测 | 空间可变基因(SVGs) | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
299 | 2025-10-05 |
Constructing Gene Regulatory Network using Chatterjee's Rank Correlation with Single-cell Transcriptomic Data
2025-Sep-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.17.676530
PMID:41000795
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研究论文 | 提出基于Chatterjee秩相关系数的单细胞转录组基因调控网络构建方法 | 使用非参数依赖度量Chatterjee秩相关系数,开发了数据驱动的检验阈值估计算法,并提出定向调控的新检验方法 | 未明确说明方法在特定生物场景下的适用性限制 | 从单细胞RNA测序数据中发现基因调控网络 | 基因调控网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 非参数统计模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
300 | 2025-10-05 |
Astragaloside VI attenuates mechanical stress-induced cardiac remodeling through piezo1-VDAC1 dependent endoplasmic reticulum unfolded protein response
2025-Sep-22, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157288
PMID:41027153
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研究论文 | 本研究探讨黄芪甲苷VI通过Piezo1-VDAC1依赖性内质网未折叠蛋白反应减轻机械应力诱导的心脏重塑的机制 | 首次揭示Piezo1-VDAC1相互作用通过调控内质网未折叠蛋白反应介导机械应力诱导心脏重塑的病理机制,并发现黄芪甲苷VI通过该通路发挥治疗作用 | 研究主要基于动物模型和体外实验,尚未进行临床验证;转基因模型可能无法完全模拟人类疾病复杂性 | 探究Piezo1-VDAC1依赖性内质网未折叠蛋白反应在机械应力诱导心脏重塑中的作用机制及黄芪甲苷VI的治疗潜力 | 心肌细胞、转基因小鼠(Piezo1TG/VDAC1TG)和野生型小鼠 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞测序,网络药理学,宏基因组学,激光共聚焦显微镜,免疫荧光 | 转基因动物模型 | 多组学数据,图像数据,分子生物学数据 | 转基因小鼠和野生型小鼠模型 | NA | 单细胞测序,宏基因组学 | NA | NA |