单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
301	2025-05-20	Visualization of the Spiral Ganglion Neuron in Vivo Using a Novel 177Lu Nuclear Molecule Label 2025-May-19, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202504464 PMID:40387257	研究论文	本研究开发了一种新型的177Lu核分子标记物，用于在体内可视化螺旋神经节神经元（SGNs），为评估耳蜗神经完整性提供了新方法	首次使用放射性核素标记的抗VGLUT1抗体药物在动物水平实现耳蜗SGNs的体内成像	研究仅在动物模型中进行，尚未应用于人体	开发一种能够直接评估耳蜗神经完整性的方法，以改善人工耳蜗植入术前的评估	螺旋神经节神经元（SGNs）	分子影像学	听力损失	核素成像	NA	影像数据	小鼠和猪模型
302	2025-05-20	Activation of HTR2B Suppresses Osteosarcoma Progression through the STAT1-NLRP3 Inflammasome Pathway and Promotes OASL1+ Macrophage Production to Enhance Antitumor Immunity 2025-May-19, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202415276 PMID:40387572	研究论文	本研究探讨了5-羟色胺受体2B（HTR2B）在骨肉瘤进展中的潜在作用及其通过STAT1-NLRP3炎症小体途径和OASL1+巨噬细胞产生增强抗肿瘤免疫的机制	首次揭示了HTR2B通过STAT1-NLRP3炎症小体途径抑制骨肉瘤进展，并通过促进OASL1+巨噬细胞产生增强抗肿瘤免疫的双重作用机制	研究主要基于体外实验和数据库分析，缺乏大规模临床验证	探索HTR2B在骨肉瘤进展中的作用及其治疗潜力	骨肉瘤组织和细胞系	肿瘤学	骨肉瘤	转录组测序分析、单细胞测序	NA	基因表达数据、单细胞数据	TARGET和GEO数据库中的骨肉瘤样本及医院收集的骨肉瘤组织样本
303	2025-05-20	Scar-associated macrophages and biliary epithelial cells interaction exacerbates hepatic fibrosis in biliary atresia 2025-May-18, Pediatric research IF:3.1Q1 DOI:10.1038/s41390-025-04100-2 PMID:40383871	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和空间定位数据，揭示了胆道闭锁(BA)肝脏中疤痕相关巨噬细胞(SAMs)和胆道上皮细胞(BECs)的相互作用如何加剧肝纤维化	首次发现SAMs通过调节BECs的上皮-间质转化(EMT)促进肝纤维化进展，并识别出BA诊断的生物标志物	样本量较小(仅8例组织样本)，且缺乏长期随访数据验证治疗效果	探究BA肝脏微环境变化及其在肝纤维化中的作用机制	胆道闭锁患者的肝脏组织	单细胞转录组学	胆道闭锁	scRNA-seq	NA	单细胞转录组数据	8例肝脏组织(2例正常组织，2例胆总管囊肿组织，4例BA组织)
304	2025-05-20	New insights into tumor microenvironment and HPV integrations in cervical cancer pathogenesis revealed by single-cell transcriptome data 2025-May-17, Human molecular genetics IF:3.1Q2 DOI:10.1093/hmg/ddaf027 PMID:40151001	研究论文	利用单细胞RNA测序技术研究宫颈癌发病机制中肿瘤微环境与HPV整合的关系	开发了一种从scRNA-seq数据中识别HPV整合事件的方法，并发现了新的HPV重复整合基因	NA	探讨宫颈癌发病机制中细胞异质性与HPV整合的关联	正常患者及三个疾病阶段（HSIL、MIC、CSCC）的宫颈组织	数字病理学	宫颈癌	scRNA-seq	NA	单细胞转录组数据	涉及正常患者及三个疾病阶段（HSIL、MIC、CSCC）的宫颈组织样本
305	2025-05-20	DNA hypermethylation of PLTP mediated by DNMT3B aggravates vascular dysfunction in diabetic retinopathy via the AKT/GSK3β signaling pathway 2025-May-17, Clinical epigenetics IF:4.8Q1 DOI:10.1186/s13148-025-01874-4 PMID:40380281	研究论文	本研究探讨了磷脂转移蛋白(PLTP)在糖尿病视网膜病变(DR)中血管功能障碍的作用及其DNA甲基化调控机制	首次揭示了DNMT3B介导的PLTP DNA高甲基化通过AKT/GSK3β信号通路加重DR血管功能障碍的分子机制	研究主要基于细胞和小鼠模型，尚未在临床样本中验证	阐明PLTP在DR血管功能障碍中的作用及DNA甲基化调控机制	人视网膜微血管内皮细胞(HRMECs)和链脲佐菌素处理的小鼠	分子生物学	糖尿病视网膜病变	单细胞测序、转录组测序、免疫共沉淀、荧光素酶报告基因检测	NA	基因表达数据、甲基化数据	细胞模型和小鼠模型
306	2025-05-20	Protocol for isolating and characterizing human vitreous immune cell infiltrates by flow cytometry and single-cell transcriptomic studies 2025-May-17, STAR protocols IF:1.3Q4 DOI:10.1016/j.xpro.2025.103830 PMID:40382772	研究论文	本文介绍了一种用于通过流式细胞术和单细胞转录组学研究分离和表征人类玻璃体免疫细胞浸润的定制方案	提出了针对人类玻璃体样本的免疫细胞分离和表征的定制方案，包括手术修改和其他措施以最大化免疫细胞产量	未提及具体样本量或实验结果的局限性	开发一种用于研究眼内免疫反应的玻璃体免疫细胞分离和表征方法	人类玻璃体中的免疫细胞浸润	生物医学研究	NA	流式细胞术, 单细胞转录组学	NA	细胞样本, 转录组数据	NA
307	2025-05-20	Integrating multi-omics data to identify the role of Aggrephagy-related genes in tumor microenvironment and key tumorigenesis factors of GB from the perspective of single-cell sequencing 2025-May-16, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-02431-4 PMID:40377747	research paper	本研究通过整合多组学数据，从单细胞测序的角度探讨了聚集自噬相关基因（ARGs）在胶质母细胞瘤（GB）肿瘤微环境（TME）和肿瘤发生中的关键作用	首次利用单细胞测序技术分析ARGs对GB的TME和肿瘤发生的影响，并通过分子对接分析确定了TUBA1C和UBB作为潜在的治疗靶点	未提及样本量大小，可能影响结果的普遍性	探索ARGs在GB的TME和肿瘤发生中的作用，并验证其预后意义及免疫治疗预测潜力	胶质母细胞瘤（GB）及其肿瘤微环境（TME）	digital pathology	glioblastoma	single-cell sequencing, non-negative matrix factorization, molecular docking	NA	single-cell sequencing data	NA
308	2025-05-20	Deciphering the interaction between the expression of LRP2 served as a mitochondrial metabolism-related gene and prognosis in colon cancer integrating multi-omics analysis 2025-May-16, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-02568-2 PMID:40377809	研究论文	本研究通过多组学分析探讨了LRP2基因在结肠癌中的表达及其预后价值	首次将LRP2基因作为线粒体代谢相关基因与结肠癌预后联系起来，并通过多组学数据验证其临床意义	研究样本量有限，且主要依赖公共数据库数据，需要更多独立队列验证	探索LRP2基因在结肠癌中的表达特征及其临床预后价值	结肠腺癌(COAD)患者和结肠癌细胞系	癌症基因组学	结肠癌	单细胞测序、转录组学分析、免疫组化(IHC)、CCK-8检测、流式细胞术	Cox回归分析、基因集富集分析(GSEA)	基因组数据、转录组数据、临床病理数据、细胞实验数据	TCGA数据库中的结肠癌样本、GEO数据库中的验证数据集、HCT116和SW480细胞系
309	2025-05-20	Sialyltransferase gene signature as a predictor of prognosis and therapeutic response in kidney renal clear cell carcinoma 2025-May-16, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-02566-4 PMID:40377806	研究论文	本研究基于唾液酸转移酶相关基因（SRGs）构建了一个预测模型，用于评估肾透明细胞癌（KIRC）患者的预后和治疗反应	首次基于SRGs构建KIRC预后模型，揭示了唾液酸化在KIRC中的关键作用，并识别了两种分子亚型及其对不同药物的敏感性差异	研究主要依赖公共数据库数据，缺乏独立的前瞻性临床队列验证	开发KIRC预后预测模型并探索唾液酸化在肿瘤生物学中的作用机制	肾透明细胞癌（KIRC）患者	肿瘤基因组学	肾癌	RNA-Seq, scRNA-seq, 生物信息学分析	Cox回归风险模型	基因表达数据	TCGA和ICGC数据库中的KIRC样本
310	2025-05-20	The critical role of BMP signaling in gastric epithelial cell differentiation revealed by organoids 2025-May-16, Cell regeneration (London, England) DOI:10.1186/s13619-025-00237-x PMID:40377813	研究论文	本研究通过结合单细胞RNA测序和信号通路操作，揭示了BMP信号在胃上皮细胞分化中的关键作用	揭示了BMP4信号在刺激胃小凹细胞和壁细胞分化中的作用，并发现BMP4与EGF信号协同增强小凹细胞分化，同时抑制TGF-β和BMP4信号促进主细胞分化	研究主要基于小鼠和人类胃类器官，可能不完全反映体内复杂环境	探究胃上皮细胞分化的分子机制及其在小鼠和人类中的异同	小鼠和人类胃类器官	细胞生物学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	小鼠和人类胃类器官
311	2025-05-20	SARS-CoV-2 induced immune perturbations in infants vary with disease severity and differ from adults' responses 2025-May-16, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-025-59411-z PMID:40379618	research paper	该研究通过多维方法解析了SARS-CoV-2感染婴儿的免疫反应，并与成人反应进行了比较	首次系统地研究了因严重COVID-19住院婴儿的免疫反应，并揭示了婴儿与成人在免疫反应上的显著差异	样本量相对较小（n=26），且仅针对住院婴儿进行研究	解析SARS-CoV-2感染婴儿的免疫反应特征及其与成人的差异	SARS-CoV-2感染的婴儿（n=26）和匹配的对照组（n=14）	免疫学	COVID-19	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	单细胞转录组数据	40名婴儿（26名感染，14名对照）
312	2025-05-20	Advances in spatial transcriptomics and its application in the musculoskeletal system 2025-May-16, Bone research IF:14.3Q1 DOI:10.1038/s41413-025-00429-w PMID:40379648	综述	本文总结了空间转录组学的最新进展及其在肌肉骨骼系统中的应用	空间转录组学通过同时捕获基因表达谱和组织原位空间信息，革新了生物学研究，并逐渐应用于肌肉骨骼研究	NA	探讨空间转录组学在肌肉骨骼系统研究中的应用及其潜力	肌肉骨骼系统的生理和病理状态	生物信息学	肌肉骨骼系统疾病	空间转录组学	NA	基因表达数据和空间信息	NA
313	2025-05-20	USP2 inhibition unleashes CD47-restrained phagocytosis and enhances anti-tumor immunity 2025-May-16, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-025-59621-5 PMID:40379682	研究论文	本文揭示了USP2通过去泛素化稳定CD47的机制，抑制USP2可促进CD47降解并重塑肿瘤微环境，从而增强抗PD-1免疫治疗的疗效	首次发现USP2通过去泛素化稳定CD47的调控机制，并证明抑制USP2可增强抗肿瘤免疫	研究主要基于小鼠模型，临床数据有限	探索CD47的调控机制以开发更有效的联合免疫疗法	CD47/SIRPα轴和肿瘤微环境	肿瘤免疫学	癌症	单细胞RNA测序	小鼠肿瘤模型	基因表达数据和临床数据	小鼠模型和临床样本（数量未明确说明）
314	2025-05-20	A novel LncRNA risk model for disulfidptosis-related prognosis prediction and response to chemotherapy in acute myeloid leukemia 2025-May-16, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-01730-8 PMID:40379722	研究论文	本研究开发了一种基于与双硫死亡相关的长链非编码RNA（DRLs）的风险模型，用于预测急性髓系白血病（AML）患者的预后和化疗反应	首次构建了基于6种特定DRLs的预测模型，并验证了其在AML预后预测中的效用，同时探索了双硫死亡与AML的潜在联系	研究依赖于公开数据库数据，需要进一步实验验证模型的临床适用性	探索双硫死亡与AML的关系，开发预后预测模型和寻找新的治疗靶点	急性髓系白血病（AML）患者	生物信息学	急性髓系白血病	scRNA-seq, RT-qPCR, Cox比例风险模型, LASSO回归分析	风险预测模型	基因表达数据	来自GEO数据库的AML患者scRNA-seq数据
315	2025-05-20	M2-ApoBDs as a therapeutic strategy for systemic lupus erythematosus: targeted macrophage reprogramming and treg differentiation 2025-May-16, Journal of nanobiotechnology IF:10.6Q1 DOI:10.1186/s12951-025-03437-4 PMID:40380199	research paper	该研究探讨了M2巨噬细胞衍生的凋亡小体（M2-ApoBDs）作为系统性红斑狼疮（SLE）治疗新策略的潜力，通过靶向重编程巨噬细胞和促进Treg细胞分化	首次提出M2-ApoBDs能够选择性靶向脾脏并重编程巨噬细胞，进而促进Treg细胞分化，为SLE提供了一种新的治疗策略	研究仅在SLE小鼠模型中进行，尚未在人类临床试验中验证	探索通过巨噬细胞重编程和Treg细胞分化治疗系统性红斑狼疮的有效靶向治疗方法	系统性红斑狼疮（SLE）小鼠模型	免疫学	系统性红斑狼疮	单细胞RNA测序	NA	NA	SLE小鼠模型
316	2025-05-20	Spatiotemporal dynamic changes of meningeal microenvironment influence meningeal lymphatic function following subarachnoid hemorrhage: from inflammatory response to tissue remodeling 2025-May-16, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1 DOI:10.1186/s12974-025-03460-0 PMID:40380229	研究论文	该研究探讨了蛛网膜下腔出血后脑膜微环境的时空动态变化如何影响脑膜淋巴功能，从炎症反应到组织重塑的过程	揭示了脑膜微环境从炎症反应到组织重塑的时空转变，并发现胎盘生长因子（PGF）可能是促进炎症反应后脑膜淋巴功能早期修复的关键因素	研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证	研究蛛网膜下腔出血后脑膜淋巴功能的动态变化及其调控机制	小鼠模型中的脑膜淋巴管和脑膜微环境	神经科学	蛛网膜下腔出血	单细胞RNA测序和空间转录组学	小鼠SAH模型	基因表达数据	NA
317	2025-05-20	Single-cell transcriptomic analysis deciphers the inflammatory microenvironment characterized by CXCL9+ fibroblasts and ACKR1+ endothelial cells in immune-related myocarditis 2025-May-16, Journal of translational medicine IF:6.1Q1 DOI:10.1186/s12967-025-06551-x PMID:40380233	研究论文	通过单细胞转录组分析揭示了免疫相关心肌炎中由CXCL9+成纤维细胞和ACKR1+内皮细胞主导的炎症微环境	首次在单细胞水平上解析了免疫相关心肌炎的炎症微环境，并识别了CXCL9+成纤维细胞和ACKR1+内皮细胞等关键细胞亚群	研究样本量较小，仅基于一例患者的活检样本和小鼠数据	阐明免疫相关心肌炎的病理机制并寻找潜在治疗靶点	免疫检查点抑制剂引发的免疫相关心肌炎患者心脏组织	单细胞转录组学	心肌炎	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	单细胞转录组数据	1例患者活检样本+小鼠模型数据
318	2025-05-20	Single-cell transcriptomics reveals metabolic remodeling and functional specialization in the immune microenvironment of bone tumors 2025-May-16, Journal of translational medicine IF:6.1Q1 DOI:10.1186/s12967-025-06346-0 PMID:40380260	研究论文	通过单细胞RNA测序分析，研究骨肿瘤免疫微环境中的代谢重塑和功能特化	揭示了骨肿瘤微环境中免疫细胞的代谢和功能可塑性，发现了FN1作为免疫协调的中心调节因子	样本量较小（13个骨肿瘤样本），可能影响结果的普遍性	研究骨肿瘤微环境中免疫细胞的代谢重塑和功能特化	骨肿瘤（包括尤文肉瘤、骨肉瘤和骨巨细胞瘤）的免疫微环境	数字病理学	骨肿瘤	scRNA-seq（单细胞RNA测序）	NA	RNA测序数据	13个骨肿瘤样本
319	2025-05-20	Novel exosome-associated LncRNA model predicts colorectal cancer prognosis and drug response 2025-May-16, Hereditas IF:2.1Q3 DOI:10.1186/s41065-025-00445-0 PMID:40380258	研究论文	本研究首次基于外泌体相关lncRNA构建了预测结直肠癌预后和药物反应的模型，并深入分析了MIR4713HG在结直肠癌中的生物学作用	首次构建了基于外泌体相关lncRNA的预后模型EALncRI，并发现MIR4713HG可能成为结直肠癌的重要治疗靶点	研究依赖于TCGA数据库的数据，未进行独立队列验证	预测结直肠癌预后和药物反应，探索外泌体相关lncRNA的生物学功能	结直肠癌患者和相关的lncRNA	生物信息学	结直肠癌	scRNA-seq, LASSO, 多变量Cox回归分析	SVM-REF, EALncRI风险评分模型	基因表达数据和临床数据	TCGA-CRC队列数据
320	2025-05-20	Kinesin family member 4 a drives Cancer stem cell characteristics in breast Cancer: Insights from scRNA-Seq and experimental validation 2025-May-16, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.144308 PMID:40383330	研究论文	本研究通过整合分析单细胞RNA测序和大块RNA测序数据，识别了乳腺癌中的癌症干细胞标记基因	发现了19个癌症干细胞标记基因，特别是驱动蛋白家族成员4A（KIF4A）被证实为乳腺癌癌症干细胞特性的关键调控因子	研究主要基于特定数据集（GSE180286和TCGA），可能无法完全代表所有乳腺癌亚型	识别乳腺癌中癌症干细胞的标记基因并验证其功能	乳腺癌细胞系和裸鼠模型	癌症生物学	乳腺癌	scRNA-Seq, bulk RNA-Seq, WGCNA	NA	RNA测序数据	单细胞RNA测序数据集GSE180286和TCGA乳腺癌数据集