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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2025-10-05 |
Spatiomolecular mapping reveals anatomical organization of heterogeneous cell types in the human nucleus accumbens
2025-Sep-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.10.675374
PMID:40964296
|
研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学和单核RNA测序数据，构建了人类伏隔核细胞类型和空间域的空间分子图谱 | 首次在人类大脑中发现连续的基因表达空间梯度，揭示了DRD1和DRD2中型多棘神经元更复杂的空间组织模式 | 研究样本仅来自10名神经正常成年捐赠者的死后组织，样本量有限 | 解析人类伏隔核的细胞多样性和空间组织特征及其与神经精神疾病的关联 | 人类伏隔核组织 | 空间转录组学 | 神经精神疾病 | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 10名神经正常成年捐赠者的伏隔核组织 | NA | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 222 | 2025-10-05 |
High Treg and PMN-MDSC densities are a hallmark of tertiary lymphoid structures in fatal cases of cervical cancer
2025-Sep-25, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012613
PMID:40998518
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研究论文 | 本研究通过分析三级淋巴结构在宫颈癌和头颈鳞癌中的密度、组成及预后影响，揭示其在HPV相关癌症中的免疫调节作用差异 | 首次发现宫颈癌中三级淋巴结构的高Treg和PMN-MDSC浸润与患者不良预后相关，不同于头颈鳞癌中三级淋巴结构密度与良好预后的正相关 | 样本来源限于HPV相关癌症，未涵盖其他癌症类型；空间转录组学分析范围有限 | 探究三级淋巴结构在HPV诱导的宫颈癌和头颈鳞癌中对抗肿瘤免疫的塑造作用及预后影响 | 宫颈癌和头颈鳞癌患者组织样本 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 多重免疫荧光、免疫组织化学、空间转录组学、流式细胞术 | NA | 组织切片图像、空间转录组数据、流式细胞数据 | 宫颈癌和头颈鳞癌患者组织样本（具体数量未明确） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 223 | 2025-10-05 |
Myasthenia thymus reprograms class-switched B cells into BAFF-dependent survivors
2025-Sep-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.19.677075
PMID:41000735
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示重症肌无力胸腺中B细胞通过转向BAFF依赖的生存机制逃避正常免疫耐受检查点 | 首次发现重症肌无力胸腺中发生免疫耐受检查点转换，B细胞从T细胞依赖性激活转向BAFF驱动的生存机制 | 研究样本仅限于人类胸腺组织，未验证BAFF-BCMA轴在其他自身免疫疾病中的普适性 | 解析重症肌无力中自身反应性B细胞逃避免疫耐受的分子机制 | 人类胸腺组织中的B细胞和滤泡辅助T细胞 | 单细胞组学 | 重症肌无力 | 单细胞RNA测序,V(D)J repertoire分析,空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,B细胞受体序列数据 | 237,661个细胞，来自人类胸腺样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 224 | 2025-10-05 |
Recent insights in the development and functions of insect hemocytes
2025-Sep-15, Current opinion in insect science
IF:5.8Q1
DOI:10.1016/j.cois.2025.101434
PMID:40962030
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综述 | 本文综述了昆虫血细胞发育与功能研究的最新进展 | 整合了单细胞RNA测序技术对血细胞群体异质性的新发现，拓展了对固着血细胞功能的理解 | 主要基于果蝇、蚊子和鳞翅目昆虫的研究结果，可能不适用于所有昆虫类群 | 探讨昆虫血细胞的个体发育和免疫功能机制 | 昆虫血细胞，特别是果蝇、蚊子和鳞翅目昆虫的血细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 225 | 2025-10-05 |
Decoding the Tumor Microenvironment: Insights and New Targets from Single-Cell Sequencing and Spatial Transcriptomics
2025-Sep-09, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb47090730
PMID:41020852
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综述 | 本文探讨单细胞测序和空间转录组学技术在解析肿瘤微环境中的应用与进展 | 整合单细胞测序与空间转录组学技术，在单细胞分辨率下揭示肿瘤微环境的异质性和空间动态 | NA | 探索肿瘤微环境的分子机制并发现新的治疗靶点 | 肿瘤微环境中的细胞组成和空间结构 | 数字病理 | 癌症 | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 226 | 2025-10-05 |
Leveraging RNA-seq deconvolution to improve complex in vitro model characterization
2025-Sep, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110510
PMID:40701251
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研究论文 | 本研究评估RNA-seq反卷积方法在复杂体外模型表征中的应用 | 利用公开单细胞RNA-seq数据集通过反卷积方法从批量RNA-seq数据预测细胞比例，改进了复杂体外模型的表征能力 | 反卷积方法的准确性在不同分析中存在显著差异 | 开发复杂体外模型的表征方法以用于毒理学和药物开发 | 基于干细胞的人类肠道类器官CIVM和新生啮齿动物睾丸CIVM | 生物信息学 | NA | RNA-seq, scRNA-seq | 反卷积模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 227 | 2025-10-05 |
The urokinase receptor/uPAR is a major effector of p53 gain-of-function mutations in gemcitabine-treated pancreatic ductal adenocarcinoma
2025-Sep, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110561
PMID:40759369
|
研究论文 | 本研究揭示了p53功能获得性突变通过上调尿激酶受体(uPAR)表达促进胰腺导管腺癌化疗耐药和侵袭转移的机制 | 首次发现p53功能获得性突变通过上调PLAUR/uPAR表达介导吉西他滨治疗后胰腺癌细胞的侵袭转移能力增强 | 研究主要基于细胞系模型，需要更多体内实验验证；EGFR在uPAR信号通路中的具体作用机制尚未完全阐明 | 探究p53功能获得性突变在胰腺导管腺癌化疗耐药和侵袭转移中的作用机制 | 胰腺导管腺癌细胞系(PANC1、MIA PaCa-2)和人类PDAC组织样本 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、基因沉默、细胞迁移侵袭实验、信号通路分析 | 细胞系模型 | 基因表达数据、临床生存数据、单细胞测序数据 | 两个胰腺癌细胞系和TCGA数据库中的PDAC患者数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 228 | 2025-10-05 |
After the bite: cellular responses to mosquito blood feeding
2025-Sep, Trends in parasitology
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.pt.2025.07.018
PMID:40803965
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学和代谢组学分析埃及伊蚊吸血后中肠和脂肪体组织的细胞反应 | 首次在单细胞水平系统表征蚊子吸血后不同组织的转录组和代谢组响应，揭示了新型细胞类型和昆虫特异性病毒感染动态 | NA | 研究蚊子吸血后的细胞响应机制 | 埃及伊蚊的中肠和脂肪体组织 | 单细胞组学 | NA | 单细胞转录组学, 代谢组学 | NA | 单细胞转录组数据, 代谢组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 229 | 2025-10-05 |
SMAD1/5-mediated recruitment of the histone demethylase KDM1A controls cell fate programs in embryonic stem cells
2025-Sep, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110591
PMID:40812426
|
研究论文 | 本研究揭示了SMAD1/5通过招募组蛋白去甲基化酶KDM1A调控小鼠胚胎干细胞命运程序的分子机制 | 首次发现SMAD1/5通过招募KDM1A介导H3K4me1/2去甲基化，从而抑制特定基因表达的转录抑制新机制 | 研究主要集中于小鼠胚胎干细胞，在人类细胞或其他细胞类型中的普适性需要进一步验证 | 探究SMAD1/5在小鼠胚胎干细胞中调控细胞命运程序的分子机制 | 小鼠胚胎干细胞(mESCs) | 表观遗传学 | NA | 单细胞RNA测序,染色质免疫沉淀测序 | 基因敲除模型 | 基因组学数据,转录组数据 | Smad1/5双敲除和野生型小鼠胚胎干细胞 | NA | 单细胞RNA-seq,ChIP-seq | NA | NA |
| 230 | 2025-10-05 |
Plant metabolism: Zoom in to the single-cell level
2025-Sep-01, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiaf375
PMID:40889291
|
综述 | 本文综述了单细胞技术在植物代谢研究中的应用进展 | 整合单细胞转录组学与多组学技术揭示植物代谢产物的细胞类型特异性积累模式 | NA | 探索植物代谢产物在细胞水平上的积累规律及其调控机制 | 模式植物和药用植物 | 植物代谢组学 | NA | 质谱成像, 单细胞转录组学, 多组学 | NA | 代谢组数据, 转录组数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多组学分析 | NA | NA |
| 231 | 2025-10-05 |
TGF-β-Enriched Exosomes from Acute Myeloid Leukemia Activate Smad2/3-MMP2 and ERK1/2 Signaling to Promote Leukemic Cell Proliferation, Migration, and Immune Modulation
2025-Aug-27, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb47090690
PMID:41020812
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和外泌体转录组分析，揭示急性髓系白血病来源的TGF-β富集外泌体通过激活Smad2/3-MMP2和ERK1/2信号通路促进白血病进展 | 首次整合单细胞转录组与外泌体分析，发现AML外泌体通过TGF-β介导的信号通路同时增强白血病侵袭性和免疫微环境重塑的双重作用机制 | AML外泌体的精确功能特征仍未完全阐明，需要进一步研究验证 | 探究急性髓系白血病来源外泌体在肿瘤进展中的功能作用和分子机制 | 急性髓系白血病患者的骨髓穿刺样本和外泌体 | 单细胞组学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序, 转录组分析 | NA | 单细胞转录组数据, 外泌体转录组数据 | AML患者和健康捐赠者的骨髓穿刺样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 232 | 2025-10-05 |
Profibrotic monocyte-derived alveolar macrophages as a biomarker and therapeutic target in systemic sclerosis-associated interstitial lung disease
2025-Aug-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.07.669006
PMID:40832362
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研究论文 | 本研究探讨了促纤维化单核来源肺泡巨噬细胞在系统性硬化相关间质性肺病中的生物标志物和治疗靶点潜力 | 首次在SSc-ILD患者中发现MoAM与疾病严重程度相关，并证实其转录组变化与治疗反应相关 | 样本量较小（仅9例患者），需要更大规模研究验证 | 评估MoAM作为SSc-ILD生物标志物和治疗靶点的潜力 | 系统性硬化相关间质性肺病患者和健康对照 | 数字病理学 | 间质性肺病 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 流式细胞数据 | 9例SSc-ILD患者和13例健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 233 | 2025-10-05 |
Histology-Based Virtual RNA Inference Identifies Pathways Associated With Metastasis Risk in Colorectal Cancer
2025-Aug-11, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.modpat.2025.100866
PMID:40803647
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研究论文 | 本研究开发了一种基于组织学图像的虚拟RNA推断方法，用于识别结直肠癌转移风险相关的通路 | 首次利用深度学习模型从常规H&E染色组织图像中推断空间转录组水平的分子信息，无需进行昂贵的空间转录组测序 | 某些肿瘤相关通路仅靠组织学特征无法完全捕获 | 开发从H&E组织图像推断空间转录组信息的方法，识别结直肠癌转移风险相关通路 | 结直肠癌患者组织样本 | 数字病理 | 结直肠癌 | 虚拟RNA推断，深度学习 | UNI, ResNet-50, Vision Transformer, Vision Mamba | 组织图像，空间转录组数据 | 45名患者，超过300,000个Visium点 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
| 234 | 2025-10-05 |
High-resolution spatial mapping of cell state and lineage dynamics in vivo with PEtracer
2025-Jul-24, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adx3800
PMID:40705858
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研究论文 | 开发了一种基于基因编辑的谱系追踪技术PEtracer，能够在高空间分辨率下同时分析细胞状态和谱系关系 | 首次将prime editing技术与空间转录组分析相结合，开发出能够在完整组织中同时追踪细胞状态和谱系关系的创新技术 | NA | 绘制发育和疾病过程中细胞命运决定的时空动态图谱 | 小鼠肿瘤转移模型中的细胞 | 空间生物学 | 肿瘤转移 | prime editing, MERFISH空间转录组分析 | NA | 空间转录组数据, 单细胞测序数据, 多模态成像数据 | NA | NA | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 235 | 2025-10-05 |
Increased inflammation as well as decreased endoplasmic reticulum stress and translation differentiate pancreatic islets from donors with pre-symptomatic stage 1 type 1 diabetes and non-diabetic donors
2025-Jul, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-025-06417-3
PMID:40457096
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研究论文 | 本研究通过蛋白质组学分析比较了1型糖尿病前期患者与非糖尿病供体的胰岛蛋白表达差异 | 首次在人类胰岛中揭示1型糖尿病前期阶段的蛋白质组变化，发现免疫反应增强与内质网应激和蛋白质翻译减弱并存的新现象 | 样本量较小（n=3 vs n=3），供体间变异大，统计功效有限 | 识别1型糖尿病前期胰岛β细胞功能障碍的分子通路 | 来自器官捐献者的胰岛组织 | 蛋白质组学 | 1型糖尿病 | 激光显微切割，质谱蛋白质组学，无标记定量 | NA | 蛋白质组数据 | 3名多自身抗体阳性1型糖尿病前期患者与3名匹配的非糖尿病对照 | NA | 质谱蛋白质组学，单细胞RNA-seq | NA | 液相色谱-质谱联用技术 |
| 236 | 2025-10-05 |
Targeting the Epigenetic Regulator CBX5 Promotes Fibroblast Metabolic Reprogramming and Inhibits Lung Fibrosis
2025-Jun, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2024-0255OC
PMID:39642371
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研究论文 | 本研究揭示了表观遗传调控因子CBX5在肺纤维化中通过调控成纤维细胞代谢重编程促进疾病进展的机制 | 首次发现CBX5作为表观遗传调控因子连接代谢异常与肺成纤维细胞持续活化状态，并证明靶向CBX5可抑制纤维化发展 | 研究主要基于体外实验和动物模型，在人体内的直接证据仍需进一步验证 | 探究表观遗传调控在肺纤维化发病机制中的作用，特别是CBX5对成纤维细胞代谢重编程的调控机制 | 肺成纤维细胞、特发性肺纤维化(IPF)患者肺组织、博来霉素诱导的肺损伤模型 | 分子生物学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 批量RNA测序, 代谢评估 | NA | 基因表达数据, 代谢数据, 组织图像 | IPF患者肺组织和成纤维细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 237 | 2025-10-05 |
Histology-Based Virtual RNA Inference Identifies Pathways Associated with Metastasis Risk in Colorectal Cancer
2025-Apr-23, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.04.22.25326170
PMID:40313260
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于组织学图像的虚拟RNA推断方法，用于识别结直肠癌转移风险相关的通路 | 首次实现了直接从H&E染色组织图像推断空间转录组水平的分子信息，无需实际进行空间转录组测序 | 某些肿瘤相关通路仅靠组织学无法完全捕获 | 开发从组织学图像推断RNA表达的方法，识别结直肠癌转移风险相关通路 | 结直肠癌患者组织样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 虚拟RNA推断，空间转录组学 | UNI, ResNet-50, ViT, VMamba | 组织图像，基因表达数据 | 45名患者，超过300,000个Visium点 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
| 238 | 2025-10-05 |
Long-read single-cell RNA sequencing enables the study of cancer subclone-specific genotypes and phenotypes in chronic lymphocytic leukemia
2025-Apr-14, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279049.124
PMID:39965935
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研究论文 | 本研究利用长读长单细胞RNA测序技术研究慢性淋巴细胞白血病中癌症亚克隆的基因型和表型特征 | 结合scBayes分析方法和MAS-seq长读长单细胞RNA测序技术，显著提高转录本覆盖度并扩展可检测的突变信息 | 研究样本量较小，仅包含6名患者 | 研究携带BTK C481S突变的癌症亚克隆，识别共存的CLL驱动突变，并分析突变亚克隆的转录组特征 | 慢性淋巴细胞白血病患者的癌细胞亚克隆 | 单细胞测序分析 | 慢性淋巴细胞白血病 | 长读长单细胞RNA测序，bulk DNA测序 | scBayes | 单细胞RNA测序数据，DNA测序数据 | 6名慢性淋巴细胞白血病患者 | NA | 单细胞RNA测序 | MAS-seq | 长读长单细胞RNA测序技术 |
| 239 | 2025-10-05 |
Integrating short-read and long-read single-cell RNA sequencing for comprehensive transcriptome profiling in mouse retina
2025-Apr-14, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279167.124
PMID:40050124
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研究论文 | 本研究通过整合短读长和长读长单细胞RNA测序技术，对小鼠视网膜进行了全面的转录组分析 | 首次系统比较单细胞长读长与传统短读长RNA测序技术，发现了44,325个转录本异构体，其中38%为先前未表征，17%在特定细胞亚类中特异性表达 | 研究仅限于小鼠视网膜组织，未验证其他组织或物种的适用性 | 建立有效的转录本异构体表征方法，研究选择性剪接在视网膜生物学中的作用 | 约30,000个小鼠视网膜细胞 | 单细胞测序 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 约30,000个细胞 | Illumina, Oxford Nanopore Technologies | 单细胞RNA测序 | Illumina测序平台, Oxford Nanopore测序平台 | 短读长测序产生15.4亿条reads，长读长测序产生14.0亿条reads |
| 240 | 2025-10-05 |
Timing neural development and regeneration
2025-Apr, Current opinion in neurobiology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.conb.2025.102976
PMID:40010202
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综述 | 探讨哺乳动物神经祖细胞时间身份调控机制及其在胶质细胞重编程中的潜在应用 | 整合时间身份调控与神经发生因子过表达以增强重编程效率并扩展神经元亚型多样性 | NA | 解析神经祖细胞时间身份调控机制及其在神经再生治疗中的应用潜力 | 哺乳动物中枢神经系统神经祖细胞和胶质细胞 | 神经发育生物学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |