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当前共找到 38047 篇文献,本页显示第 2961 - 2980 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
2961 2026-02-24
CytoVerse: Single-Cell AI Foundation Models in the Browser
2026-Jan-30, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了CytoVerse框架,它能在浏览器中运行单细胞RNA测序基础模型,实现无需服务器计算的大规模单细胞数据映射 通过ONNX部署模型、使用压缩索引(IVFPQ)在客户端搜索超过2000万个细胞参考数据,以及轻量级协议共享嵌入而不暴露原始数据,实现了浏览器端的隐私保护单细胞分析 未提及具体性能瓶颈或兼容性限制 开发一个可扩展且隐私保护的分布式单细胞分析框架 单细胞RNA测序数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 基础模型(Foundation Models) 单细胞基因表达数据 超过2000万个细胞参考数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2962 2026-02-24
Altered immune and treatment response gene expression signatures among poverty-exposed children with B-ALL
2026-Jan-29, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析贫困暴露的B细胞急性淋巴细胞白血病(B-ALL)儿童患者的白血病母细胞及其微环境,揭示了其在诊断时表现出类固醇耐药和免疫细胞功能改变的转录特征 首次在单细胞水平上揭示了贫困暴露与B-ALL儿童患者白血病细胞类固醇耐药性及免疫微环境改变的关联 研究样本量有限,且机制性关联需要进一步实验验证 探究贫困暴露对B-ALL儿童患者治疗反应和免疫微环境的影响 标准风险B-ALL儿童患者(贫困暴露与非贫困暴露对比) 数字病理学 白血病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确样本数量,但涉及贫困暴露和非贫困暴露的B-ALL儿童患者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2963 2026-02-24
MicroRNAs as potential prognostic biomarkers in acute lymphoblastic leukemia: a systematic review, meta-analysis, and bioinformatics study
2026-Jan-29, Systematic reviews IF:6.3Q1
系统综述、荟萃分析与生物信息学研究 本文通过系统综述、荟萃分析和生物信息学方法,评估miRNA作为急性淋巴细胞白血病预后生物标志物的潜力,并利用ceRNA网络和单细胞RNA测序分析验证靶基因 结合系统综述、荟萃分析和生物信息学方法,首次构建ceRNA网络并应用单细胞RNA测序分析miRNA靶基因在ALL中的表达模式,揭示了白血病原始细胞中靶基因表达的最一致和显著改变 需要大型多中心试验进一步确认miRNA的预后价值,研究结果可能受纳入研究的异质性和样本量限制 评估miRNA作为急性淋巴细胞白血病预后生物标志物的潜力,并探索其调控机制 急性淋巴细胞白血病患者,特别是涉及1974名患者的22项研究中的miRNA表达数据 生物信息学 急性淋巴细胞白血病 单细胞RNA测序、ceRNA网络分析、荟萃分析 NA 文本数据、基因表达数据 1974名患者,来自22项研究 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2964 2026-02-24
Sod1 trisomy causes ENS developmental defects and susceptibility to Hirschsprung disease via neuronal Ret suppression and glial remodeling
2026-Jan-28, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究揭示了21号染色体基因SOD1剂量增加如何通过抑制神经元Ret表达和重塑胶质细胞状态,导致肠神经系统发育缺陷并增加先天性巨结肠症易感性 首次证明SOD1基因剂量单独增加足以扰乱肠神经系统发育,并阐明了其通过双重机制(抑制神经发生与促进胶质细胞反应性增殖)导致先天性巨结肠易感性的具体通路 研究基于人源化三体小鼠模型,与人类Down综合征的完整遗传背景存在差异;单细胞测序仅分析了出生后第0天的远端结肠组织 解析Down综合征患者先天性巨结肠症风险增高的特定染色体21基因机制 携带人源SOD1基因座的转基因小鼠肠神经系统细胞 单细胞组学 先天性巨结肠症 单细胞RNA测序,免疫荧光染色 转基因小鼠模型 单细胞转录组数据,荧光图像数据 未明确样本数量(出生后第0天小鼠远端结肠组织) NA 单细胞RNA-seq NA NA
2965 2026-02-24
Spatial transcriptomics reveals brain-wide circadian disruption in an Alzheimer's disease model
2026-Jan-28, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用空间转录组学技术,揭示了小鼠大脑中昼夜节律转录的空间组织架构,并发现阿尔茨海默病模型中存在早期、区域特异性的昼夜节律紊乱 首次在大规模空间转录组学层面,绘制了健康与阿尔茨海默病模型小鼠大脑中24小时节律转录的空间分布图,揭示了区域特异性节律紊乱作为疾病早期特征 研究基于小鼠模型(APP23),可能无法完全反映人类阿尔茨海默病的复杂性;且主要关注转录水平,未深入探讨功能机制 探究健康与阿尔茨海默病状态下大脑昼夜节律转录的空间组织特征及其在疾病发病机制中的作用 小鼠大脑(包括皮质和皮质下区域),特别是APP23阿尔茨海默病模型小鼠 空间转录组学 阿尔茨海默病 空间转录组学 NA 空间转录组数据 未明确指定样本数量,但涉及小鼠大脑多个区域的大规模空间转录组分析 NA 空间转录组学 NA NA
2966 2026-02-24
Substantial unannotated noncoding transcripts in tumors may transcriptionally regulate cancer-related genes
2026-Jan-28, BMC biology IF:4.4Q1
研究论文 本研究通过泛癌分析识别了未注释的非编码转录本(UNTs),并利用CRISPR/Cas9技术验证了它们在癌症中转录调控基因的潜力 首次系统性地研究了肿瘤中未注释非编码转录本(UNTs)的广泛存在及其转录调控机制,揭示了其癌症和物种特异性 研究仅针对四种肿瘤的细胞系和组织样本,可能无法代表所有癌症类型;UNTs的功能验证仅限于三个具体例子 探究肿瘤中未注释非编码转录本(UNTs)的转录调控功能及其在癌症中的作用 四种肿瘤的细胞系和组织样本,以及三个具体的UNTs(MSTRG.2513.6、MSTRG.4401.1、MSTRG.34636.7) 生物信息学 癌症 RNA-seq、scRNA-seq、CRISPR/Cas9基因编辑 NA RNA序列数据 四种肿瘤的细胞系和组织样本(具体数量未明确) NA 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq NA NA
2967 2026-02-22
stGCL: a versatile cross-modality fusion method based on multi-modal graph contrastive learning for spatial transcriptomics
2026-Jan-28, Genome biology IF:10.1Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
2968 2026-02-24
huSA: a comprehensive database for multi-dimensional resolution of bulk, single cell and spatial transcription profiles in skin diseases
2026-Jan-15, Database : the journal of biological databases and curation
研究论文 本研究构建了一个名为人类皮肤图谱(huSA)的综合性数据库,整合了多种皮肤疾病的批量、单细胞和空间转录组数据,并提供标准化分析和交互式可视化工具 首次构建了一个整合17种皮肤疾病、涵盖单细胞RNA测序、空间转录组学和批量RNA测序等多种数据类型的综合性数据库,并提供标准化的分析流程和交互式可视化平台 数据库目前主要整合已发表的公开数据集,可能未包含所有最新的研究数据;分析流程的标准化可能无法完全适应所有特定研究问题 解决皮肤疾病转录组数据缺乏有效整合和标准化分析的问题,构建一个系统性的资源平台 皮肤疾病相关的转录组数据 数字病理学 皮肤疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq),空间转录组学,批量RNA测序(bulk RNA-seq) NA 转录组数据 总计2999个样本,包括1434个scRNA-seq样本、63个空间转录组样本和1502个bulk RNA-seq样本,来自63个独立数据集 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学,bulk RNA-seq NA NA
2969 2026-02-24
Generation of human pineal gland organoids with melatonin production for disease modeling
2026-Jan-08, Cell stem cell IF:19.8Q1
研究论文 本研究开发了人松果体类器官,用于模拟松果体发育和功能,并应用于疾病建模 首次从多能干细胞生成人松果体类器官,成功模拟松果体发育和褪黑素生产,并应用于Angelman综合征疾病模型 研究基于体外模型,可能无法完全复制体内复杂环境,且样本来源有限 开发人松果体类器官平台,用于研究松果体发育、昼夜节律调节及相关疾病 人松果体类器官、Angelman综合征患者来源的iPSCs、松果体切除小鼠 数字病理学 神经发育障碍 单细胞RNA测序 NA RNA-seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2970 2026-02-24
SLC25A37 as a novel therapeutic target for benign prostatic hyperplasia: integrative analyses of single-cell RNA sequencing and genome-wide association studies
2026-Jan, Open medicine (Warsaw, Poland)
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和全基因组关联分析,鉴定出SLC25A37是良性前列腺增生(BPH)的一个新型致病基因,并探索了其作为治疗靶点的潜力 首次将单细胞RNA测序与全基因组关联研究相结合,在BPH的经典单核细胞中鉴定出SLC25A37这一新的致病基因,并探索了靶向该基因的潜在治疗药物 未明确说明样本的具体数量,且体外实验验证可能不足以完全代表体内复杂的病理生理环境 识别良性前列腺增生(BPH)的致病基因并探索潜在的治疗靶点 良性前列腺增生(BPH)患者与健康对照者的前列腺组织 数字病理学 前列腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq),全基因组关联研究(GWAS),孟德尔随机化(MR),贝叶斯共定位,分子对接,流式细胞术,qRT-PCR,蛋白质印迹,免疫组织化学,免疫荧光染色 NA 单细胞RNA测序数据,基因组关联数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2971 2026-02-24
Multi-scale systems toxicology defines a KLF5-centered adverse outcome pathway linking DEHP exposure to pancreatic cancer progression and signaling programs relevant to therapy tolerance
2026, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过多尺度系统毒理学框架,揭示了DEHP暴露通过KLF5中心的不良结局通路促进胰腺癌进展的机制 整合了异质集成机器学习、孟德尔随机化、分子对接与动力学、单细胞转录组学等多种方法,首次提出KLF5为中心的DEHP-PDAC关联通路 研究结果主要为假设生成性质,需要进一步实验验证 阐明DEHP暴露与胰腺癌进展之间的分子机制和不良结局通路 胰腺导管腺癌(PDAC)相关基因、KLF5蛋白、PANC-1细胞系 系统毒理学 胰腺癌 单细胞转录组学、分子对接、分子动力学模拟、孟德尔随机化 TabPFN增强集成模型、异质集成机器学习 基因表达数据、单细胞RNA-seq数据、分子结构数据 未明确说明具体样本数量 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2972 2026-02-24
Single-cell RNA sequencing suggests different progenitor lineages between IDH mutant and IDHwt glioma
2026 Jan-Dec, Neuro-oncology advances IF:3.7Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了IDH突变型和IDH野生型胶质瘤在祖细胞谱系标记表达上的差异 首次将胎儿脑神经祖细胞分类系统应用于IDH突变型和野生型胶质瘤的单细胞分析,揭示了THY1表达在两类胶质瘤中的显著差异 研究依赖于公开数据集,样本量有限,且未进行实验验证 比较IDH突变型和IDH野生型胶质瘤的祖细胞谱系差异 IDH突变型星形细胞瘤、少突胶质细胞瘤和IDH野生型胶质母细胞瘤样本 数字病理学 胶质瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 90个样本(74个IDHwt原发和复发样本,6个原发少突胶质细胞瘤样本,10个原发IDH突变型星形细胞瘤样本) NA 单细胞RNA-seq NA NA
2973 2026-02-24
Microglia heterogeneity and therapeutic strategies in Parkinson's disease
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 本文系统综述了帕金森病中小胶质细胞的异质性及其在疾病中的作用,并总结了针对小胶质细胞的新干预和治疗策略 利用单细胞转录组学等新技术揭示了帕金森病中小胶质细胞功能的多样性和表型谱系变化,为理解其机制提供了新见解,并系统阐述了其在功能、空间、遗传和性别方面的差异 NA 探讨帕金森病中小胶质细胞的异质性及其在神经退行性变中的作用,并总结针对小胶质细胞的干预和治疗策略 帕金森病、小胶质细胞 神经科学 帕金森病 单细胞转录组学 NA NA NA NA NA NA NA
2974 2026-02-24
Unique chicken B cell development: species-specific mechanisms and contradictory requirements of B cell receptor for post-hatched B cell development
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 本文综述了鸡B细胞发育的独特三阶段个体发生过程,并与哺乳动物(以人类为代表)的B细胞发育进行比较 揭示了鸡B细胞发育中BCR信号需求的矛盾性,以及通过基因转换而非V(D)J重组进行抗体多样化的替代进化策略 作为一篇综述文章,主要基于现有文献进行总结,未提出新的实验数据或模型 比较鸡与哺乳动物B细胞发育的物种特异性机制,探讨免疫系统进化 鸡的B细胞发育过程,特别是法氏囊作为禽类特异性初级B细胞淋巴器官的作用 NA NA 单细胞RNA测序,基因敲除研究 NA NA NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
2975 2026-02-24
Blinatumomab-driven T-cell activation in αβ and γδ T-cell subsets: insights from in vitro assays
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本文通过体外实验研究了Blinatumomab在αβ和γδ T细胞亚群中驱动的T细胞活化机制 首次系统比较了Blinatumomab在传统αβ T细胞和非常规γδ T细胞中的效应功能差异,并探索了γδ T细胞作为联合治疗策略的潜力 研究基于健康供者体外培养的T细胞,未在患者来源模型或临床研究中验证,且单细胞转录组学仅分析了一个供者样本 阐明Blinatumomab治疗B细胞前体急性淋巴细胞白血病时,不同T细胞亚群的免疫应答机制 健康成人供者的αβ和γδ T细胞,以及CD19+ BCP-ALL细胞系(NALM-6, HAL-01) 免疫学 B细胞前体急性淋巴细胞白血病 多参数流式细胞术,靶向单细胞转录组学 NA 细胞功能数据,流式细胞术数据,单细胞转录组数据 健康成人供者T细胞,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2976 2026-02-24
Diversity and function of tumor-associated macrophages in brain metastases: mechanisms and therapeutic prospects
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 本文综述了脑转移瘤中肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)的多样性、功能、调控机制及其作为治疗靶点的前景 超越了传统的M1/M2二分法,基于单细胞研究揭示了TAMs的功能亚群谱系(如脂质相关、干扰素响应、促血管生成型),并系统阐述了其在脑转移从预转移生态位形成到肿瘤定植全过程中的作用机制 TAMs的高度异质性、靶向治疗缺乏特异性以及血脑屏障递送障碍仍是当前面临的挑战 探讨脑转移瘤中肿瘤相关巨噬细胞的多样性、功能及其作为治疗靶点的机制与前景 脑转移瘤中的肿瘤相关巨噬细胞(TAMs) 肿瘤免疫学 脑转移瘤(以乳腺癌和肺癌脑转移为例) 单细胞测序、空间转录组学 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
2977 2026-02-24
ECM remodeling-associated immune signatures and hub proteins: predictive markers and therapeutic targets for metastatic gastric cancer
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过蛋白质组学和单细胞RNA测序技术,揭示了胃癌转移中细胞外基质重塑相关的免疫特征和核心蛋白,并验证了RPS29在胃癌细胞转移机制中的功能作用 结合蛋白质组学和单细胞RNA测序技术,系统识别了胃癌转移相关的核心蛋白和肿瘤细胞亚型,并首次验证了RPS29在胃癌转移中的调控机制 研究主要基于体外实验和生物信息学分析,缺乏体内动物模型的验证,且样本量可能有限 探索胃癌转移过程中细胞外基质重塑的分子机制,识别预测标志物和治疗靶点 胃癌细胞和细胞外基质蛋白 数字病理学 胃癌 蛋白质组学, 单细胞RNA测序 NA 蛋白质组数据, 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2978 2026-02-24
Multi-omics comprehensive analysis identified KIF22 and KRAS as highly synthetic lethal pairs for triple-negative breast cancer
2026, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过多组学分析识别出KIF22和KRAS作为三阴性乳腺癌的合成致死基因对 首次通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和批量RNA测序等多组学数据,结合机器学习方法,系统性地鉴定出三阴性乳腺癌中具有高合成致死活性的新型细胞亚型,并实验验证了KIF22和KRAS作为合成致死基因对的功能 研究主要基于生物信息学分析和体外体内实验验证,临床转化潜力尚需进一步临床试验评估 探索三阴性乳腺癌的异质性,识别与疾病进展相关的合成致死基因对,为靶向治疗提供新策略 三阴性乳腺癌细胞及其微环境细胞亚群 生物信息学 三阴性乳腺癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 随机森林, 机器学习 RNA测序数据 未明确指定具体样本数量 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq NA NA
2979 2026-02-24
ESRP1 drives epithelial-mesenchymal transition by activating EPAC-RAP1A signaling axis
2026, Frontiers in medicine IF:3.1Q1
研究论文 本研究揭示了ESRP1通过激活EPAC-RAP1A信号轴驱动上皮-间质转化,从而促进特发性肺纤维化进展 首次在单细胞水平上识别ESRP1作为EMT的关键上游调控因子,并阐明其通过EPAC-RAP1A轴的新机制 研究主要基于小鼠模型和细胞系,人类样本验证不足,且未探讨其他潜在信号通路 探究特发性肺纤维化中上皮-间质转化的分子机制 小鼠肺组织、原代肺泡上皮细胞、MLE-12肺泡上皮细胞系 单细胞转录组学 特发性肺纤维化 单细胞RNA测序、qPCR、Western blot、免疫荧光、Co-IP NA 单细胞转录组数据、基因表达数据、蛋白质互作数据 未明确样本数量,包括BLM处理的小鼠模型和细胞培养实验 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2980 2026-02-24
Decoding muscle-resident Schwann cell dynamics during neuromuscular junction remodeling
2025-May-20, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,揭示了肌肉驻留雪旺细胞在神经肌肉接头重塑中的作用,并发现了调控该过程的关键分子通路 发现了神经肌肉接头重塑过程中一种新型的终末雪旺细胞亚型,并确定了SPP1信号通路作为调控雪旺细胞增殖和肌肉再神经支配的关键调节因子 研究主要基于小鼠模型,其在人类疾病中的直接适用性尚需进一步验证 阐明肌肉驻留雪旺细胞在神经肌肉接头重塑中的细胞动力学和分子机制 肌肉驻留雪旺细胞及其在稳定神经支配、部分去神经支配和完全去神经支配再神经支配模型中的亚型 单细胞组学 神经肌肉疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
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