单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 32005 篇文献，本页显示第 28641 - 28660 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 28641 | 2024-08-09 |
Single-cell atlas of hepatic T cells reveals expansion of liver-resident naive-like CD4+ T cells in primary sclerosing cholangitis
2021-08, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2021.03.016
PMID:33774059
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和计算分析，构建了原发性硬化性胆管炎（PSC）患者肝脏内T细胞的图谱，并发现了一种新的肝脏驻留型幼稚样CD4+ T细胞群。 | 首次构建了PSC患者肝脏内T细胞的图谱，并发现了一种新的肝脏驻留型幼稚样CD4+ T细胞群，这些细胞在PSC患者中显著扩增。 | NA | 旨在构建原发性硬化性胆管炎患者肝脏内T细胞的图谱，并深入研究这些细胞在疾病发病机制中的作用。 | 原发性硬化性胆管炎（PSC）患者和健康捐献者的肝脏内T细胞。 | 数字病理学 | 原发性硬化性胆管炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | PSC患者11例，健康捐献者4例，以及24例PSC患者和其他肝脏疾病对照组。 | NA | NA | NA | NA |
| 28642 | 2024-08-09 |
Wake-up alarm: virtual time-lapse gene expression landscape illuminates mechanisms underlying dormancy breaking of germinating spores
2021-Aug, Current genetics
IF:1.8Q3
DOI:10.1007/s00294-021-01177-0
PMID:33782714
|
综述 | 本文综述了真菌孢子萌发过程中休眠打破的机制，并通过单细胞基因表达分析方法，探讨了基因表达随时间的变化 | 引入了单细胞RNA测序技术来分析孢子在休眠和萌发过程中的基因表达变化 | NA | 探讨孢子萌发过程中休眠打破的机制，并扩展对S. pombe萌发的研究 | 真菌孢子的萌发过程及其基因表达 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个单孢子细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 28643 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics dissects hematopoietic cell destruction and T-cell engagement in aplastic anemia
2021-07-08, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2020008966
PMID:33763704
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析，揭示了再生障碍性贫血中造血干细胞和祖细胞（HSPCs）与T细胞之间的分子相互作用 | 首次在单细胞水平上解析了再生障碍性贫血中HSPCs和T细胞的转录组变化，并识别了细胞类型特异性的配体-受体相互作用 | 研究主要受限于技术手段和骨髓衰竭背景下HSPCs的稀少性 | 探究再生障碍性贫血中HSPCs与T细胞的复杂关系及其分子机制 | 再生障碍性贫血患者的残留HSPCs和T细胞 | 数字病理学 | 再生障碍性贫血 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 28644 | 2024-08-09 |
Single-cell sequencing technology in tumor research
2021-Jul, Clinica chimica acta; international journal of clinical chemistry
DOI:10.1016/j.cca.2021.03.013
PMID:33766554
|
综述 | 本文综述了单细胞测序技术在肿瘤研究中的应用及其在肿瘤诊断和临床治疗中的重要性 | 单细胞测序技术解决了传统批量组织测序无法揭示稀有细胞独特基因表达的问题 | NA | 探讨单细胞测序技术在肿瘤研究中的应用及其对肿瘤诊断和治疗的贡献 | 肿瘤细胞的异质性及其在分子层面的复杂变化 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞测序（SCS） | NA | 基因组、转录组和表观基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 28645 | 2024-08-09 |
Robust integration of multiple single-cell RNA sequencing datasets using a single reference space
2021-07, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-00859-x
PMID:33767393
|
research paper | 本文介绍了一种使用参考数据集的基因特征向量来建立全局框架的算法，用于整合多个单细胞RNA测序数据集 | 提出了Reference Principal Component Integration (RPCI)方法，该方法通过使用参考数据集的基因特征向量来建立全局框架，以实现多个单细胞RNA测序数据集的整合 | NA | 开发一种新的算法，用于更准确地整合多个单细胞RNA测序数据集 | 单细胞RNA测序数据集的整合方法 | digital pathology | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 使用了模拟数据集和真实数据集进行验证 | NA | NA | NA | NA |
| 28646 | 2024-08-09 |
Inhibition of macrophage histone demethylase JMJD3 protects against abdominal aortic aneurysms
2021-06-07, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20201839
PMID:33779682
|
研究论文 | 本研究探讨了抑制巨噬细胞组蛋白去甲基酶JMJD3对腹主动脉瘤的保护作用 | 首次揭示了JMJD3在腹主动脉瘤形成中的作用，并提出了针对JMJD3的细胞特异性药物治疗可能是一种有效的干预方法 | NA | 研究JMJD3在腹主动脉瘤形成中的作用及潜在的治疗策略 | 腹主动脉瘤中的巨噬细胞和JMJD3酶 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用人类腹主动脉瘤组织进行研究 | NA | NA | NA | NA |
| 28647 | 2024-08-09 |
Combining segmental bulk- and single-cell RNA-sequencing to define the chondrocyte gene expression signature in the murine knee joint
2021-06, Osteoarthritis and cartilage
IF:7.2Q1
DOI:10.1016/j.joca.2021.03.007
PMID:33762205
|
研究论文 | 本研究通过结合批量RNA测序和单细胞RNA测序技术，定义了小鼠膝关节软骨细胞的基因表达特征 | 提出了一种新的实用方法，通过结合批量RNA测序和单细胞RNA测序来解决从小鼠膝关节中提取软骨细胞转录组的技术难题 | NA | 精确描绘软骨细胞的转录组，并研究未来小鼠OA模型中软骨细胞的疾病表型 | 小鼠膝关节软骨细胞的基因表达特征 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 批量RNA测序分析了不同段，单细胞RNA测序分析了包含主要软骨细胞的131个细胞簇 | NA | NA | NA | NA |
| 28648 | 2024-08-09 |
Regenerative cross talk between cardiac cells and macrophages
2021-06-01, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
DOI:10.1152/ajpheart.00056.2021
PMID:33769920
|
研究论文 | 本文通过分析多个RNA测序数据集，研究了心肌细胞和巨噬细胞之间的再生交叉对话，以及这种对话如何随着年龄变化影响心脏的再生能力 | 首次详细探讨了巨噬细胞在心脏再生中的作用及其随年龄变化的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型，可能不完全适用于人类 | 揭示心脏再生过程中心肌细胞与巨噬细胞之间的交叉对话及其分子机制 | 心肌细胞和巨噬细胞 | NA | 心血管疾病 | RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 多个小鼠心脏样本 | NA | NA | NA | NA |
| 28649 | 2024-08-09 |
Comprehensive analysis of radiosensitivity in head and neck squamous cell carcinoma
2021-06, Radiotherapy and oncology : journal of the European Society for Therapeutic Radiology and Oncology
IF:4.9Q1
DOI:10.1016/j.radonc.2021.03.017
PMID:33775714
|
研究论文 | 本研究利用单细胞测序数据、大量组织测序数据和反卷积数据，全面分析了头颈鳞状细胞癌（HNSCC）的放射敏感性 | 发现了HNSCC细胞的放射敏感性聚类与分子分型高度一致，并开发了一种放射抗性评分，识别了可能从联合放疗和免疫检查点阻断中受益的HNSCC群体 | NA | 全面探讨HNSCC的放射抗性，并提出新的治疗靶点 | 头颈鳞状细胞癌（HNSCC）的放射敏感性 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞测序, RNA-seq, DNA甲基化测序 | NA | 单细胞转录组数据, 大量组织测序数据 | 1388个原发性癌细胞, 499个原发性HNSCC样本 | NA | NA | NA | NA |
| 28650 | 2024-08-09 |
Notch Signaling between Cerebellar Granule Cell Progenitors
2021 May-Jun, eNeuro
IF:2.7Q3
DOI:10.1523/ENEURO.0468-20.2021
PMID:33762301
|
研究论文 | 本文研究了小脑颗粒细胞前体细胞中的Notch信号传导机制 | 首次报道Notch信号在小脑颗粒细胞前体细胞中的比例分化作用 | NA | 探讨Notch信号在小脑颗粒细胞前体细胞分化中的作用 | 小脑颗粒细胞前体细胞及其分化过程 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠样本 | NA | NA | NA | NA |
| 28651 | 2024-08-09 |
Genetic control of retinal ganglion cell genesis
2021-May, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-021-03814-w
PMID:33782712
|
综述 | 本文综述了视网膜神经节细胞（RGCs）的生成及其调控网络的最新研究进展 | 利用单细胞转录组学技术，提供了对RGC类型和发展轨迹的前所未有的新见解 | 需要进一步研究以全面理解RGC生成的不同方面 | 总结当前对RGC生成调控因子和途径功能的理解，并讨论未来研究中可利用的新兴技术 | 视网膜神经节细胞的生成及其调控网络 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 约40种不同类型的RGCs | NA | NA | NA | NA |
| 28652 | 2024-08-09 |
A human ACTH-secreting corticotroph tumoroid model: Novel Human ACTH-Secreting Tumor Cell in vitro Model
2021-Apr, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2021.103294
PMID:33773184
|
研究论文 | 本文介绍了一种新型的人类ACTH分泌性皮质瘤细胞体外模型，用于研究库欣病。 | 开发了一种能够持续分泌ACTH的人类皮质瘤细胞体外模型，为库欣病的转化研究提供了新的工具。 | NA | 旨在开发一种有效的体外模型，用于研究库欣病及其治疗方法。 | 人类皮质瘤细胞及其在体外环境中的ACTH分泌特性。 | 数字病理学 | 库欣病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 4个手术切除的肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 28653 | 2024-08-09 |
User-friendly, scalable tools and workflows for single-cell RNA-seq analysis
2021-04, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-021-01102-w
PMID:33782609
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 28654 | 2024-08-09 |
Single-cell profiling of myeloid cells in glioblastoma across species and disease stage reveals macrophage competition and specialization
2021-04, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-020-00789-y
PMID:33782623
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序和CITE-seq技术，研究了胶质母细胞瘤中髓系细胞的多样性和动态变化，特别是在不同物种和疾病阶段中的巨噬细胞竞争和特化现象 | 首次揭示了胶质母细胞瘤中髓系细胞的复杂景观，包括树突状细胞和巨噬细胞的跨物种和疾病阶段的动态变化 | NA | 探究胶质母细胞瘤中髓系细胞的动态变化及其在疾病进展中的作用 | 胶质母细胞瘤中的髓系细胞 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序, CITE-seq | NA | RNA | 包括小鼠肿瘤和初诊或复发的患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 28655 | 2024-08-09 |
A RIPK1-regulated inflammatory microglial state in amyotrophic lateral sclerosis
2021-03-30, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2025102118
PMID:33766915
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，在肌萎缩侧索硬化症（ALS）的小鼠模型中鉴定了一种新型的小胶质细胞亚类，称为RIPK1调控的炎症性小胶质细胞（RRIMs），并探讨了其在ALS中的作用机制 | 首次鉴定并描述了RIPK1调控的炎症性小胶质细胞（RRIMs），并揭示了其在ALS中的具体作用和调控机制 | NA | 阐明RIPK1激酶抑制在ALS小鼠模型中提供治疗益处的机制，并可能为正在进行的使用RIPK1抑制剂的ALS临床试验提供额外的生物标志物 | RIPK1调控的炎症性小胶质细胞（RRIMs）及其在ALS中的作用 | 神经退行性疾病 | 肌萎缩侧索硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型中的小胶质细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 28656 | 2024-08-09 |
A zero-inflated non-negative matrix factorization for the deconvolution of mixed signals of biological data
2021-03-30, The international journal of biostatistics
DOI:10.1515/ijb-2020-0039
PMID:33783171
|
研究论文 | 本文提出了一种零膨胀非负矩阵分解方法，用于解卷积生物数据中的混合信号 | 本文引入了一种零膨胀非负矩阵分解方法，并推导出有效的乘法参数更新规则，以改善在存在过多零值情况下的估计准确性 | NA | 提高生物数据中混合信号解卷积的准确性 | 脑基因表达数据和粪便微生物组数据 | 生物信息学 | NA | 非负矩阵分解 | 零膨胀非负矩阵分解 | 序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 28657 | 2024-08-09 |
A cross-talk between CAR T cell subsets and the tumor microenvironment is essential for sustained cytotoxic activity
2021-03-26, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abd4344
PMID:33771887
|
研究论文 | 本文报道了在免疫活性小鼠B细胞淋巴瘤模型中，CAR T细胞亚群与肿瘤微环境之间的相互作用对肿瘤控制至关重要 | 揭示了CAR T细胞通过产生IFN-γ与肿瘤微环境相互作用，增强内源性T细胞和自然杀伤细胞活性，并维持CAR T细胞的细胞毒性 | 文章未明确提及局限性 | 研究CAR T细胞与肿瘤微环境之间的相互作用及其对肿瘤治疗的影响 | CAR T细胞亚群与肿瘤微环境 | 免疫学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 免疫活性小鼠B细胞淋巴瘤模型 | NA | NA | NA | NA |
| 28658 | 2024-08-09 |
Pten is a key intrinsic factor regulating raphe 5-HT neuronal plasticity and depressive behaviors in mice
2021-03-26, Translational psychiatry
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41398-021-01303-z
PMID:33771970
|
研究论文 | 本文探讨了PTEN作为调节脑内5-HT神经元活性和抑郁行为的关键内在因子，并展示了其在小鼠中的作用机制 | 提出了PTEN作为调节5-HT神经元活性和抑郁行为的新治疗策略 | NA | 研究PTEN在调节5-HT神经元活性和抑郁行为中的作用 | 小鼠的5-HT神经元和抑郁行为 | 神经科学 | 抑郁 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 28659 | 2024-08-09 |
The Burkholderia pseudomallei intracellular 'TRANSITome'
2021-03-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-22169-1
PMID:33772012
|
研究论文 | 本文开发了一种'TRANSITomic'方法，用于在特定阶段分析单个Burkholderia pseudomallei细胞在宿主细胞感染过程中的转录组，从而获得病理生理学见解 | 首次提出'TRANSITome'概念，用于研究单个细菌细胞在宿主细胞内的时空特异性过程 | NA | 深入理解宿主-病原体相互作用 | Burkholderia pseudomallei细菌在宿主细胞感染过程中的转录组 | NA | NA | 转录组分析 | NA | 转录组数据 | 单个Burkholderia pseudomallei细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 28660 | 2024-08-09 |
scGNN is a novel graph neural network framework for single-cell RNA-Seq analyses
2021-03-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-22197-x
PMID:33767197
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为scGNN的图神经网络框架，用于单细胞RNA测序（scRNA-Seq）分析 | scGNN框架通过图神经网络形式化和聚合细胞间关系，并使用左截断混合高斯模型模拟异质基因表达模式，集成了三种迭代多模态自编码器 | NA | 提供一个无假设的深度学习框架，用于scRNA-Seq分析 | 单细胞RNA测序数据，特别是基因表达的稀疏性和复杂差异模式 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | scRNA-Seq | 图神经网络 | 基因表达数据 | 13,214个来自尸检脑组织中的单核细胞 | NA | NA | NA | NA |