单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
261	2025-08-08	Selective Depletion of CCR8+Treg Cells Enhances the Antitumor Immunity of Cytotoxic T Cells in Lung Cancer by Dendritic Cells 2025-Aug, Journal of thoracic oncology : official publication of the International Association for the Study of Lung Cancer IF:21.0Q1 DOI:10.1016/j.jtho.2025.02.029 PMID:40056978	研究论文	该研究探讨了通过选择性清除CCR8+Treg细胞来增强细胞毒性T细胞在肺癌中的抗肿瘤免疫，并评估了抗CCR8单药及其与PD1抑制剂联合治疗的疗效和安全性	揭示了抗CCR8疗法通过重塑肿瘤微环境和破坏CCR8+Treg-C-CL5+树突状细胞相互作用，与PD1阻断协同作用的分子机制	研究主要基于小鼠模型，临床患者数据有限，需要进一步验证	探索增强肺癌抗肿瘤免疫的新策略	非小细胞肺癌（NSCLC）小鼠模型和临床患者	免疫治疗	肺癌	单细胞RNA测序、单细胞T细胞受体测序分析、流式细胞术、多色免疫荧光、Luminex检测	小鼠模型	基因表达数据、蛋白质数据	四个NSCLC小鼠模型和临床患者数据
262	2025-08-08	Presbycusis: Pathology, Signal Pathways, and Therapeutic Strategy 2025-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202410413 PMID:40349177	综述	本文综述了老年性耳聋的病理机制、信号通路及治疗策略，特别关注了血管纹在其中的关键作用	重点探讨了血管纹在老年性耳聋中的作用，并介绍了单细胞转录组学在该领域的应用	NA	增进对老年性耳聋中血管纹作用的理解，为个性化治疗和预防策略提供依据	老年性耳聋（特别是血管纹的作用）	NA	老年性疾病	单细胞转录组学	NA	NA	NA
263	2025-08-08	Visualization of the Spiral Ganglion Neuron in Vivo Using a Novel 177Lu Nuclear Molecule Label 2025-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202504464 PMID:40387257	研究论文	本研究开发了一种新型的177Lu核分子标记方法，用于在体内可视化螺旋神经节神经元（SGNs），以评估耳蜗神经的完整性	首次使用放射性核素标记的抗VGLUT1抗体药物实现耳蜗SGNs的动物水平体内成像	研究仅在动物模型中进行，尚未应用于人类临床	开发一种新型方法，用于评估耳蜗神经的完整性，以改善人工耳蜗植入术前的评估	螺旋神经节神经元（SGNs）	数字病理	听力损失	核成像	NA	图像	小鼠和猪模型
264	2025-08-08	Activation of HTR2B Suppresses Osteosarcoma Progression through the STAT1-NLRP3 Inflammasome Pathway and Promotes OASL1+ Macrophage Production to Enhance Antitumor Immunity 2025-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202415276 PMID:40387572	研究论文	本研究探讨了HTR2B在骨肉瘤进展中的潜在作用及其通过STAT1-NLRP3炎症小体途径和促进OASL1+巨噬细胞产生来增强抗肿瘤免疫的机制	首次提出HTR2B作为骨肉瘤治疗的新靶点，揭示了其通过双重机制（直接抑制肿瘤细胞增殖和增强宿主免疫反应）发挥作用	研究主要基于体外实验和数据库分析，缺乏体内实验的进一步验证	探索HTR2B在骨肉瘤进展中的作用及其潜在治疗价值	骨肉瘤组织和细胞系	肿瘤学	骨肉瘤	转录组测序分析、单细胞测序	NA	基因表达数据、单细胞数据	TARGET、GEO数据库中的骨肉瘤组织样本及医院收集的样本
265	2025-08-08	Remodelling hypoxic TNBC microenvironment restores antitumor efficacy of Vγ9Vδ2 T cell therapy 2025-Aug, British journal of cancer IF:6.4Q1 DOI:10.1038/s41416-025-03045-x PMID:40437021	研究论文	本研究探讨了通过重塑缺氧的三阴性乳腺癌（TNBC）微环境来恢复Vγ9Vδ2 T细胞疗法的抗肿瘤效果	揭示了γδ T细胞在TNBC微环境中的功能异质性，并提出了通过抑制HIF-1信号通路来增强Vγ9Vδ2 T细胞疗法的新策略	研究主要基于小鼠模型和体外实验，临床转化效果尚需进一步验证	提高Vγ9Vδ2 T细胞疗法在晚期乳腺癌治疗中的疗效	三阴性乳腺癌（TNBC）微环境中的γδ T细胞	肿瘤免疫治疗	乳腺癌	流式细胞术、原子力显微镜、共聚焦激光扫描显微镜、小鼠模型	小鼠模型	scRNA-seq数据、TCGA数据、实验数据	未明确提及具体样本数量，但涉及TNBC、非TNBC及健康个体的数据
266	2025-08-08	Patterns of intra- and intertumor phenotypic heterogeneity in lethal prostate cancer 2025-Aug-01, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1 DOI:10.1172/JCI186599 PMID:40493417	研究论文	本研究旨在定义致死性前列腺癌中肿瘤间和肿瘤内异质性的模式、程度和后果	结合原位组织学和测序方法，揭示了患者、转移灶和细胞水平的表型异质性，并发现分子亚型异质性与基因组和临床特征的关联	样本量相对较小（52名患者），且仅针对致死性前列腺癌，可能不适用于其他阶段或类型的前列腺癌	探究致死性前列腺癌的肿瘤异质性模式及其临床意义	52名转移性前列腺癌患者的630多个肿瘤样本	数字病理学	前列腺癌	原位组织学分析、测序方法、单细胞测序	NA	组织样本、测序数据	52名患者的630多个肿瘤样本
267	2025-08-08	Integrating single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq, and Mendelian randomization to elucidate the role of HLA-DPA1 expression levels and non-classical monocytes in the pathogenesis of idiopathic pulmonary arterial hypertension 2025-Aug, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.145284 PMID:40545078	研究论文	通过整合单细胞RNA测序、全基因组关联研究和表达数量性状位点数据，研究HLA-DPA1表达水平与非经典单核细胞在特发性肺动脉高压发病机制中的作用	首次发现HLA-DPA1在非经典单核细胞中的表达与特发性肺动脉高压的免疫失调和血管重塑密切相关	研究样本量有限，且未进行功能验证实验	阐明HLA-DPA1表达水平与非经典单核细胞在特发性肺动脉高压发病机制中的作用	特发性肺动脉高压患者的单核细胞和非经典单核细胞	生物信息学	特发性肺动脉高压	scRNA-seq, GWAS, eQTL, sc-eQTL, bulk RNA-seq	NA	RNA测序数据	特发性肺动脉高压患者和健康对照的外周血单核细胞和肺组织样本
268	2025-08-08	Targeting the HNRNPA2B1/HDGF/PTN Axis to Overcome Radioresistance in Non-Small Cell Lung Cancer 2025-Aug, Antioxidants & redox signaling IF:5.9Q1 DOI:10.1089/ars.2024.0808 PMID:40643435	研究论文	本研究探讨了非小细胞肺癌(NSCLC)中放射抗性的分子机制，聚焦于HNRNPA2B1/HDGF/PTN信号通路及其在自噬依赖性铁死亡调控中的作用	揭示了HNRNPA2B1/HDGF/PTN通路通过影响自噬依赖性铁死亡来促进放射抗性的新机制	研究主要基于细胞系和小鼠模型，尚未在临床患者中进行验证	探索克服非小细胞肺癌放射抗性的潜在治疗靶点	非小细胞肺癌细胞系和小鼠肿瘤模型	癌症生物学	肺癌	单细胞RNA测序、免疫荧光、流式细胞术、生化染色、RT-qPCR、Western blot、MeRIP-qPCR	小鼠肿瘤模型	基因表达数据、蛋白质相互作用数据	放射抗性和放射敏感性细胞系
269	2025-08-08	Gene regulatory networks and essential transcription factors for de novo-originated genes 2025-Aug, Nature ecology & evolution IF:13.9Q1 DOI:10.1038/s41559-025-02747-y PMID:40659874	研究论文	本研究通过计算方法和单细胞RNA测序数据，识别了调控新生基因表达的关键转录因子	首次揭示了新生基因表达的调控程序，并识别了关键转录因子achintya和vismay的作用	研究主要基于果蝇数据，可能在其他物种中的适用性有待验证	探索新生基因表达的调控机制	新生基因及其调控转录因子	基因组学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	NA
270	2025-08-08	Defining the Ovarian Cancer Precancerous Landscape through Modeling Fallopian Tube Epithelium Reprogramming Driven by Extracellular Vesicles 2025-Aug-01, Cancer research communications IF:2.0Q3 DOI:10.1158/2767-9764.CRC-25-0064 PMID:40689422	研究论文	本研究通过微流体组织培养平台结合空间转录组学和蛋白质组学，探索卵巢癌来源的小细胞外囊泡（sEV）对人类输卵管上皮（hFTE）重编程的影响	开发了一种新型微流体组织培养平台，结合空间转录组学和蛋白质组学技术，首次系统研究了sEV对hFTE的短期和长期影响	研究仅针对体外培养系统，未涉及体内环境的复杂性	探索卵巢癌前病变的分子机制，特别是sEV在其中的作用	人类输卵管上皮（hFTE）和卵巢癌来源的小细胞外囊泡（sEV）	癌症生物学	卵巢癌	空间转录组学、蛋白质组学、微流体组织培养	微流体组织培养模型	转录组数据、蛋白质组数据	NA
271	2025-08-08	Integrative Single-Cell Analysis Reveals Iron Overload-Induced Senescence and Metabolic Reprogramming in Ovarian Endometriosis-Associated Infertility 2025-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202417528 PMID:40693455	研究论文	该研究通过单细胞分析揭示了铁过载在卵巢子宫内膜异位症相关不孕症中诱导衰老和代谢重编程的作用	首次整合单细胞图谱和空间转录组学技术，揭示了铁过载在卵巢子宫内膜异位症相关不孕症中的具体作用机制	研究主要基于小鼠模型和有限的人类卵巢样本，可能需要更大规模的临床验证	探究铁过载对卵巢子宫内膜异位症相关不孕症患者卵泡功能的影响	卵巢子宫内膜异位症相关不孕症患者的排卵前卵泡液和铁过载小鼠卵巢	数字病理学	卵巢子宫内膜异位症	单细胞分析, Stereo-seq空间转录组学	NA	单细胞数据, 空间转录组数据	OEI患者的排卵前卵泡液样本和铁过载小鼠卵巢样本
272	2025-08-08	SCENE: Signature Collection for Endometrial Cancer Prognosis 2025-Aug, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2 DOI:10.1111/jcmm.70762 PMID:40754672	研究论文	创建了一个名为SCENE的数据库，用于收集子宫内膜癌(EC)转录组特征与患者预后的关联信息	首次整合了EC转录组特征与多种预后指标的关联，并提供了详细的注释	仅基于PubMed文献综述，可能遗漏未发表或非英文研究	提高子宫内膜癌预后预测的准确性	子宫内膜癌患者的转录组特征	数字病理学	子宫内膜癌	scRNA-seq	NA	转录组数据	约200项研究中的700个mRNA特征、60个miRNA和150个lncRNA
273	2025-08-08	Nanoparticle-Delivered siRNA Targeting NSUN4 Relieves Systemic Lupus Erythematosus through Declining Mitophagy-Mediated CD8+T Cell Exhaustion 2025-Aug, MedComm IF:10.7Q1 DOI:10.1002/mco2.70311 PMID:40761479	研究论文	本研究通过单细胞转录组测序和m5C表观转录组测序，发现NSUN4通过调控CD74表达和CD8+T细胞耗竭在系统性红斑狼疮（SLE）发病机制中的关键作用，并验证了纳米颗粒递送siRNA靶向NSUN4的治疗潜力	首次发现CD7CD74 CD8+T细胞亚群在SLE患者中显著扩增，并揭示NSUN4通过m5C修饰调控CD74表达和CD8+T细胞耗竭的新机制	研究主要基于小鼠模型，尚未在人体临床试验中验证NSUN4靶向治疗的安全性和有效性	探究m5C修饰在系统性红斑狼疮发病机制中的作用，并寻找潜在治疗靶点	系统性红斑狼疮患者和小鼠模型中的CD8+T细胞	表观遗传学	系统性红斑狼疮	scRNA-seq, m5C-seq, siRNA纳米颗粒递送	自发性和普里斯特烷诱导的SLE小鼠模型	单细胞转录组数据、表观转录组数据	SLE患者和小鼠模型的CD8+T细胞样本
274	2025-08-08	Anatomical Region-Specific Transcriptomic Signatures and the Role of Epithelial Cells in Pterygium Inflammation: A Multi-Omics Analysis 2025-Aug-01, Translational vision science & technology IF:2.6Q2 DOI:10.1167/tvst.14.8.13 PMID:40772680	研究论文	通过多组学分析研究翼状胬肉组织中主区和副区的细胞和分子模式差异，重点关注炎症和线粒体能量代谢	首次在翼状胬肉研究中区分解剖区域（主区和副区），并发现上皮细胞在炎症中的关键作用	样本量较小（6例批量RNA-seq和2例单细胞RNA-seq数据）	识别翼状胬肉的特定生物标志物以实现更高效的诊断和治疗	翼状胬肉患者组织样本	数字病理学	眼科疾病	RNA-seq（批量及单细胞）	NA	转录组数据	6例批量RNA-seq样本和2例单细胞RNA-seq样本
275	2025-08-08	CYCLONE: recycle contrastive learning for integrating single-cell gene expression data 2025-Jul-30, BMC bioinformatics IF:2.9Q1 DOI:10.1186/s12859-025-06214-0 PMID:40739171	research paper	本文介绍了一种名为CYCLONE的新方法，用于通过循环对比学习网络整合单细胞基因表达数据	CYCLONE通过循环更新MNN对和结合KNN对来识别批次特异性细胞类型，避免了批次效应过度校正的问题	NA	整合单细胞转录组测序数据以减少批次效应，提高对细胞身份和功能的理解	单细胞基因表达数据	生物信息学	NA	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	对比学习网络和VAE模型	基因表达数据	模拟和真实的scRNA-seq数据集
276	2025-08-08	Bacterial Infections Shape Cardiac Macrophages' Response to Ischemia 2025-Jul-30, Circulation research IF:16.5Q1 DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.325147 PMID:40735767	研究论文	探讨细菌感染对心脏髓系细胞的长期影响及其对后续心肌缺血的潜在影响	发现细菌感染后心脏巨噬细胞的两个新亚群，并揭示它们在后续缺血性损伤中的不同作用	研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证	研究细菌感染如何通过影响先天免疫细胞来增加心血管事件的风险	心脏髓系细胞、外周白细胞、造血干细胞和祖细胞	心血管疾病	心血管疾病	流式细胞术、单细胞RNA测序、纳米颗粒介导的RNA干扰	遗传命运映射模型	细胞数据、RNA测序数据	NA
277	2025-08-08	Columbianadin targets TRIM7 to maintain P2X7 palmitoylation, inhibiting cuproptosis in synovial M2 macrophages 2025-Jul-30, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1 DOI:10.1016/j.phymed.2025.157091 PMID:40768810	研究论文	本研究探讨了天然植物化学物质Columbianadin (CBN)通过靶向TRIM7维持P2X7棕榈酰化，抑制滑膜M2巨噬细胞铜死亡的分子机制	首次将TRIM7鉴定为铜死亡警报蛋白，并揭示了CBN通过TRIM7-ZDHHC5-P2X7轴调控铜流出的新机制	研究仅在小鼠模型中进行，尚未进行人体临床试验	阐明CBN治疗创伤性滑膜炎的分子机制，为其临床转化提供理论基础	创伤性滑膜炎小鼠模型和TRIM7条件性敲除小鼠	分子病理学	创伤性滑膜炎	单细胞测序、生物信息学分析、荧光共定位、电感耦合等离子体质谱、酰基生物素交换实验	小鼠前交叉韧带非破坏性撕裂模型	基因表达数据、蛋白质互作数据、金属离子浓度数据	未明确说明具体样本数量，使用基因工程小鼠模型
278	2025-08-08	Exploration and Application of Malignant Cell Heterogeneity Analysis with Single-Cell Transcriptome Sequencing Technology 2025-Jul-25, Aging and disease IF:7.0Q1 DOI:10.14336/AD.2025.0836 PMID:40768639	研究论文	本文探讨了利用单细胞转录组测序技术分析恶性肿瘤细胞异质性及其应用	强调了单细胞RNA测序技术在解析肿瘤细胞异质性方面的创新应用，尤其是在肿瘤细胞本身的研究上，而不仅限于免疫和基质细胞群	当前单细胞RNA测序技术的应用仍主要集中于免疫和基质细胞群体，对肿瘤细胞本身的研究相对较少	阐明肿瘤的生物学机制，以提高诊断精度和治疗效果	恶性肿瘤细胞及其异质性	数字病理学	癌症	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	转录组数据	NA
279	2025-08-08	Role of APE1 redox function in chronic rhinosinusitis pathogenesis: Implications for targeted therapy 2025-Jul-17, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jaci.2025.07.004 PMID:40683569	研究论文	本文探讨了APE1氧化还原功能在慢性鼻窦炎发病机制中的作用及其靶向治疗的潜力	揭示了APE1氧化还原功能在慢性鼻窦炎中驱动2型炎症、线粒体氧化应激、黏液产生和上皮屏障功能障碍的新机制，并评估了APE1氧化还原抑制剂C10的治疗潜力	研究主要基于动物模型和体外细胞实验，需要进一步临床验证	阐明APE1氧化还原功能在慢性鼻窦炎发病机制中的作用并评估其靶向治疗的潜力	人类鼻组织、CRS小鼠模型、气液界面培养的人鼻上皮细胞和BEAS-2B细胞	病理生理学	慢性鼻窦炎	单细胞RNA测序、免疫组化、Western blot、定量RT-PCR	CRS小鼠模型	RNA测序数据、蛋白质表达数据	未明确说明样本数量，涉及人类鼻组织、小鼠模型和细胞系
280	2025-08-08	Single-cell and spatial transcriptomics map senescent vascular cells in arterial remodeling during atherosclerosis in mice 2025-Jul-14, Nature aging IF:17.0Q1 DOI:10.1038/s43587-025-00889-z PMID:40660002	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术，系统性地研究了小鼠动脉粥样硬化中衰老血管细胞的异质性	发现了动脉粥样硬化中血管特异性衰老转录组特征，包括Spp1、Ctsb和Tnfrsf11b mRNAs的富集	研究主要基于小鼠模型，人类VSMC衰老的体外模型验证有限	探究动脉粥样硬化中衰老血管细胞的异质性及其转录组特征	小鼠主动脉中的血管平滑肌细胞(VSMCs)、成纤维细胞和T细胞	数字病理学	心血管疾病	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组学	p16-tdTomato和Ldlr; p16-3MR小鼠模型	RNA序列数据	使用两种小鼠动脉粥样硬化模型和人类VSMC体外模型