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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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26801 | 2024-08-09 |
An approach to suppress the evolution of resistance in BRAFV600E-mutant cancer
2017-Aug, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/nm.4369
PMID:28714990
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研究论文 | 本文通过建模研究了靶向治疗下BRAF基因扩增在肿瘤进化中的选择和传播机制 | 本文首次通过单细胞测序和多重荧光原位杂交分析,揭示了BRAF基因扩增在肿瘤治疗后的平行进化轨迹,并提出了通过同时靶向RAF、MEK和ERK激酶来提高适应性阈值,从而防止耐药性进化的治疗策略 | 本文主要基于小鼠模型进行研究,其结果在人体中的适用性尚需进一步验证 | 研究靶向治疗下肿瘤进化的机制,并探索有效的治疗策略以抑制耐药性的产生 | BRAFV600E突变肿瘤中的BRAF基因扩增 | 数字病理学 | 肺癌,黑色素瘤 | 单细胞测序,多重荧光原位杂交 | NA | 基因组数据 | 11个患者来源的肿瘤异种移植模型(PDXs) |
26802 | 2024-08-09 |
InDrops and Drop-seq technologies for single-cell sequencing
2017-07-25, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/c7lc90070h
PMID:28721415
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
26803 | 2024-08-09 |
Perspective on droplet-based single-cell sequencing
2017-07-25, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/c7lc90069d
PMID:28721425
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
26804 | 2024-08-09 |
Genome-wide identification of genes essential for podocyte cytoskeletons based on single-cell RNA sequencing
2017-11, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2017.04.022
PMID:28709640
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,对20个鼠足细胞进行分析,鉴定出对足细胞细胞骨架至关重要的基因 | 通过单细胞RNA测序技术,扩展了足细胞细胞骨架关键基因的列表 | NA | 鉴定对足细胞细胞骨架至关重要的基因 | 鼠足细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 20个鼠足细胞 |
26805 | 2024-08-09 |
Lack of human cytomegalovirus expression in single cells from glioblastoma tumors and cell lines
2017-10, Journal of neurovirology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s13365-017-0543-y
PMID:28695489
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术检测人类巨细胞病毒在胶质母细胞瘤肿瘤和细胞系中的表达情况 | 首次在单细胞水平上严格测试人类巨细胞病毒RNA在胶质母细胞瘤样本中的表达 | 仅分析了五个胶质母细胞瘤肿瘤和两个细胞系的样本 | 探讨人类巨细胞病毒与胶质母细胞瘤之间的关系,并评估单细胞数据在肿瘤病毒学中的潜在应用 | 人类巨细胞病毒在胶质母细胞瘤中的表达 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 五个胶质母细胞瘤肿瘤和两个细胞系 |
26806 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals an altered gene expression pattern as a result of CRISPR/cas9-mediated deletion of Gene 33/Mig6 and chronic exposure to hexavalent chromium in human lung epithelial cells
2017-09-01, Toxicology and applied pharmacology
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.taap.2017.07.003
PMID:28688920
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,分析了CRISPR/cas9介导的Gene 33/Mig6缺失及慢性暴露于六价铬的人肺上皮细胞中基因表达模式的变化 | 首次揭示了Gene 33缺失和六价铬暴露联合作用下肺上皮细胞的基因表达模式和表型变化,特别是UCHL1基因的上调 | 未详细描述细胞形态的明显变化 | 探究Gene 33缺失和六价铬暴露对肺上皮细胞基因表达和表型的影响 | BEAS-2B肺上皮细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | CRISPR/cas9 | 基因表达数据 | 83个差异表达基因 |
26807 | 2024-08-09 |
Massively parallel whole genome amplification for single-cell sequencing using droplet microfluidics
2017-07-12, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-017-05436-4
PMID:28701744
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研究论文 | 介绍了一种名为单液滴多重置换扩增(sd-MDA)的方法,用于大规模并行扩增单细胞基因组,同时保持序列准确性和特异性 | 该方法通过在微流控通道中使用被动液滴融合技术,实现了数万个单细胞在数百万皮升液滴中的分隔和全基因组扩增,提高了扩增的通量和质量 | NA | 进一步理解复杂生物系统中的遗传多样性 | 单细胞基因组 | 基因组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组序列 | 数万个单细胞 |
26808 | 2024-08-09 |
Gene expression profiles of brain endothelial cells during embryonic development at bulk and single-cell levels
2017-07-11, Science signaling
IF:6.7Q1
DOI:10.1126/scisignal.aag2476
PMID:28698213
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研究论文 | 本文通过翻译核糖体亲和纯化和单细胞RNA测序技术,生成了小鼠胚胎脑内皮细胞的高分辨率基因表达谱,以探索脑血管发育和分化的分子机制 | 本文首次在批量和单细胞水平上分析了脑内皮细胞在胚胎发育过程中的基因表达变化,并识别了与血脑屏障成熟相关的特定转录因子 | NA | 探索脑内皮细胞在胚胎发育过程中的分子机制 | 小鼠胚胎脑内皮细胞的基因表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠胚胎脑内皮细胞 |
26809 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics of East-Asian pancreatic islets cells
2017-07-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-017-05266-4
PMID:28694456
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了东亚人群胰腺胰岛细胞的基因表达特征 | 首次在东亚人群中进行胰腺胰岛细胞的单细胞RNA测序,并发现了与欧洲人群不同的基因表达特征 | 样本量较小,仅包括三名东亚非糖尿病患者 | 评估东亚人群胰腺胰岛细胞的基因表达特征 | 东亚人群的胰腺胰岛细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 448个胰岛细胞,来自三名东亚非糖尿病患者 |
26810 | 2024-08-09 |
Massively parallel nanowell-based single-cell gene expression profiling
2017-07-07, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-017-3893-1
PMID:28687070
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研究论文 | 本文介绍了一种新型纳米孔单细胞RNA测序系统ICELL8,该系统能够高效处理数千个细胞样本,提供单细胞水平的基因表达谱分析 | ICELL8系统采用含有5,184个纳米孔的微芯片,每个纳米孔包含预印的寡核苷酸编码多聚dT、独特的孔条形码和独特的分子标识符,实现了简单且高通量的单细胞表达谱分析 | NA | 开发一种简单且高通量的单细胞表达谱分析方法 | 人源和鼠源的培养细胞以及鼠源的实体组织样本 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 超过一千个人源和鼠源培养细胞以及468个鼠源胰腺胰岛细胞 |
26811 | 2024-08-09 |
Vibrissa sensory neurons: Linking distinct morphology to specific physiology and function
2018-Jan-01, Neuroscience
IF:2.9Q2
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研究论文 | 本文探讨了啮齿动物的触须感觉神经元,通过形态学和电生理特征的结合,研究其生理特性和功能 | 文章提出使用单细胞转录组测序和光遗传学辅助的在体电生理技术,填补了触须感觉系统中形态学定义的神经元类型与其生理特性和功能之间的知识空白 | NA | 旨在揭示触须感觉神经元的形态学特征与其生理功能之间的联系 | 啮齿动物的触须感觉神经元及其在物体定位和辨别中的作用 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组测序,光遗传学 | NA | 电生理记录 | 多个不同类型的三叉神经(TG)感觉神经元 |
26812 | 2024-08-09 |
Single cell transcriptomics of pluripotent stem cells: reprogramming and differentiation
2017-Oct, Current opinion in genetics & development
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.gde.2017.06.003
PMID:28675884
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学在多能干细胞重编程和分化中的应用及其最新进展和重要发现 | 单细胞转录组学技术提供了高分辨率的细胞状态识别和细胞群体内异质性解析的新视角 | NA | 探讨单细胞转录组学在多能干细胞研究中的应用 | 多能干细胞的重编程和分化过程 | 基因组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
26813 | 2024-08-09 |
Human induced pluripotent stem cell (hiPSC)-derived neurons respond to convulsant drugs when co-cultured with hiPSC-derived astrocytes
2017-08-15, Toxicology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.tox.2017.06.010
PMID:28666936
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研究论文 | 本文研究了人诱导多能干细胞(hiPSC)衍生的神经元在与hiPSC衍生的星形胶质细胞共培养时对致痉挛药物的反应 | 首次探讨了hiPSC衍生的神经元与hiPSC衍生的星形胶质细胞共培养系统在药物诱导癫痫风险评估中的应用 | 尚未完全解决hiPSC衍生的神经元在药物诱导癫痫风险评估中的应用,尤其是在与hiPSC衍生的星形胶质细胞共培养的情况下 | 探讨hiPSC衍生的神经元在与hiPSC衍生的星形胶质细胞共培养时如何用于评估药物诱导的癫痫风险 | hiPSC衍生的神经元和星形胶质细胞 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 共培养8周的hiPSC衍生的神经元与星形胶质细胞 |
26814 | 2024-08-09 |
Single-cell sequencing made simple
2017-07-03, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/547125a
PMID:28682345
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
26815 | 2024-08-09 |
Identifying Cell Subpopulations and Their Genetic Drivers from Single-Cell RNA-Seq Data Using a Biclustering Approach
2017-Jul, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2017.0049
PMID:28657835
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研究论文 | 本文介绍了一种基于SNN-Cliq算法的快速简单迭代双聚类方法BiSNN-Walk,用于从单细胞RNA测序数据中识别细胞亚群及其相关的遗传驱动因子 | BiSNN-Walk方法返回一个按可靠性排序的聚类列表,并根据基因与相关细胞聚类的关联程度对基因进行排序,使结果更具生物学解释性 | NA | 开发一种新的双聚类方法,用于分析单细胞RNA测序数据,以识别细胞亚群及其遗传驱动因子 | 单细胞RNA测序数据中的细胞亚群及其遗传驱动因子 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 双聚类方法 | 基因表达数据 | 三项大型单细胞RNA测序研究 |
26816 | 2024-08-09 |
IFNγ-Dependent Tissue-Immune Homeostasis Is Co-opted in the Tumor Microenvironment
2017-Jun-29, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2017.06.016
PMID:28666115
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研究论文 | 本文探讨了IFNγ依赖的组织免疫稳态在肿瘤微环境中的作用 | 发现IFNγ依赖的稳态程序在多种人类原发性肿瘤中富集,并影响患者的生存 | NA | 研究免疫稳态如何影响肿瘤监测及其在肿瘤微环境中的作用 | 免疫单核吞噬细胞在健康组织中的稳态程序及其在肿瘤中的作用 | NA | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及人类原发性肿瘤样本,包括黑色素瘤 |
26817 | 2024-08-09 |
BRIE: transcriptome-wide splicing quantification in single cells
2017-06-27, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-017-1248-5
PMID:28655331
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研究论文 | 本文介绍了BRIE模型,用于单细胞转录组中剪接事件的定量分析 | BRIE模型通过学习序列特征的先验分布,解决了单细胞RNA测序技术在RNA加工事件分析中的局限性 | NA | 探索单细胞RNA测序实验中RNA加工的随机性 | 单细胞转录组中的剪接事件 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 贝叶斯层次模型 | 转录组数据 | NA |
26818 | 2024-08-09 |
Independent regulation of gene expression level and noise by histone modifications
2017-Jun, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1005585
PMID:28665997
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研究论文 | 研究通过计算分析单细胞RNA测序数据和酵母流式细胞术实验,探讨了组蛋白修饰在人类胚胎细胞和酵母中独立调控基因表达水平和噪声的机制 | 揭示了组蛋白修饰通过影响基因表达的爆发大小和频率,实现对基因表达水平和噪声的独立调控,扩展了“组蛋白密码”假说 | NA | 探讨组蛋白修饰如何独立调控基因表达水平和噪声 | 人类胚胎细胞和酵母中的基因表达噪声 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | RNA测序数据 | NA |
26819 | 2024-08-09 |
Time-lapse observation and transcriptome analysis of a case with repeated multiple pronuclei after IVF/ICSI
2017-Sep, Journal of assisted reproduction and genetics
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10815-017-0972-9
PMID:28643089
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研究论文 | 本研究通过时间流逝观察和转录组分析,探讨了一位患者在接受体外受精(IVF)和胞浆内单精子注射(ICSI)后反复形成多原核合子的原因 | 本研究首次通过时间流逝观察和转录组分析,识别了影响原核形成的几个候选基因,为不孕症提供了新的病因 | 本研究为个案研究,样本量较小,需要进一步的大样本研究验证结果 | 探讨IVF/ICSI后反复形成多原核合子的原因 | 一位不明原因原发性不孕患者的多原核合子 | NA | 不孕症 | 荧光原位杂交(FISH),单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 患者1例,捐赠者4例 |
26820 | 2024-08-09 |
Inflammatory Ly6Chi monocytes and their conversion to M2 macrophages drive atherosclerosis regression
2017-Aug-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI75005
PMID:28650342
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研究论文 | 研究探讨了在正常血脂小鼠中,炎症性Ly6Chi单核细胞转化为M2巨噬细胞在动脉粥样硬化消退中的起源和功能需求 | 首次证实了Ly6Chi炎症性单核细胞的持续招募及其通过STAT6依赖性极化为M2状态在动脉粥样硬化炎症消退和斑块消退中的必要性 | 研究仅在实验小鼠模型中进行,其结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 开发促进动脉粥样硬化消退的治疗方法 | 动脉粥样硬化斑块中的M2巨噬细胞和Ly6Chi单核细胞 | 心血管疾病 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了WT、Ccr2-/-、Cx3cr1-/-和Ccr5-/-等多种基因型的小鼠进行移植实验 |