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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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26781 | 2024-08-09 |
Single-Cell Sequencing Technologies for Cardiac Stem Cell Studies
2017-11-01, Stem cells and development
IF:2.5Q2
DOI:10.1089/scd.2017.0050
PMID:28859577
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在心脏干细胞研究中的最新进展及其应用 | 单细胞测序技术为干细胞和再生医学研究提供了新的视角 | NA | 探讨单细胞测序技术在心脏干细胞研究中的应用,以理解心脏发育和再生的机制 | 心脏干细胞(CSCs) | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 转录组和表观基因组数据 | NA |
26782 | 2024-08-09 |
The Drosophila embryo at single-cell transcriptome resolution
2017-10-13, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aan3235
PMID:28860209
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研究论文 | 本文利用单细胞测序技术对精确分期的果蝇胚胎进行研究,并开发了一种计算映射策略DistMap,以重建胚胎并预测接近单细胞分辨率的空间基因表达。 | 本文创新性地使用了单细胞测序技术,并开发了DistMap计算映射策略和DVEX数据库,能够生成三维虚拟原位杂交并计算基因表达梯度。 | NA | 旨在重建果蝇胚胎并预测接近单细胞分辨率的空间基因表达。 | 果蝇胚胎的单细胞转录组。 | 基因组学 | NA | 单细胞测序 | DistMap计算映射策略 | 转录组数据 | 约6000个细胞 |
26783 | 2024-08-09 |
Psychrophilic proteases dramatically reduce single-cell RNA-seq artifacts: a molecular atlas of kidney development
2017-10-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.151142
PMID:28851704
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研究论文 | 本文介绍了一种使用低温活性蛋白酶的单细胞RNA测序分离方法,该方法在6°C或更低温度下进行,有效减少了基因表达的伪影,并生成新生小鼠肾脏的单细胞分辨率基因表达图谱。 | 使用来自嗜冷微生物的低温活性蛋白酶,在6°C或更低温度下进行单细胞RNA测序,有效减少了基因表达的伪影。 | 传统的单细胞RNA测序方法在37°C下酶解组织,可能导致基因表达模式的伪影变化。 | 开发一种新的单细胞RNA测序方法,减少基因表达伪影,并生成新生小鼠肾脏的基因表达图谱。 | 新生小鼠肾脏的单细胞RNA测序。 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 20,424个单细胞 |
26784 | 2024-08-09 |
A Total-variation Constrained Permutation Model for Revealing Common Copy Number Patterns
2017-08-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-017-09139-8
PMID:28851906
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研究论文 | 本文提出了一种基于总变差约束的排列模型,用于揭示单细胞DNA测序数据中的共同拷贝数模式 | 通过连续样本排列和总变差范数最小化,有效恢复单细胞DNA测序数据中的隐藏块模式 | 单细胞DNA测序数据通常起始量低,需要额外扩增步骤,引入噪声,使得常规模式发现具有挑战性 | 解决单细胞DNA测序数据中恢复隐藏块模式的问题 | 单细胞DNA测序数据中的拷贝数模式 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序技术 | 交替方向乘子法 | DNA序列数据 | NA |
26785 | 2024-08-09 |
Unravelling biology and shifting paradigms in cancer with single-cell sequencing
2017-08-24, Nature reviews. Cancer
DOI:10.1038/nrc.2017.58
PMID:28835719
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观点文章 | 本文讨论了单细胞测序技术在癌症研究中的应用及其对理解癌症生物学的重要意义 | 单细胞测序技术解决了以往技术限制的问题,为癌症研究提供了更高分辨率的分析方法 | NA | 深入理解癌症的生物学特性,包括肿瘤内遗传异质性和癌症基因组进化 | 癌症的单细胞 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA |
26786 | 2024-08-09 |
A practical guide to single-cell RNA-sequencing for biomedical research and clinical applications
2017-08-18, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-017-0467-4
PMID:28821273
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综述 | 本文为单细胞RNA测序技术在生物医学研究和临床应用中的实用指南 | 随着scRNA-seq平台的商业可用性和生物信息学方法的成熟,非专业实验室的研究人员和临床医生也能利用该技术进行创新发现 | NA | 帮助研究人员设计他们的首个scRNA-seq研究 | 单细胞RNA测序技术 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA | 单个细胞 |
26787 | 2024-08-09 |
Human Astrocyte Maturation Captured in 3D Cerebral Cortical Spheroids Derived from Pluripotent Stem Cells
2017-Aug-16, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2017.07.035
PMID:28817799
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研究论文 | 本文介绍了一种利用人源多能干细胞衍生的三维大脑皮层球体生成星形胶质细胞系细胞的方法 | 首次展示了在三维细胞结构中,从多能干细胞衍生的脑皮层球体中提取的星形胶质细胞与人类胎儿原代星形胶质细胞的相似性,并观察到其随时间从胎儿状态向成熟状态的转变 | NA | 开发与生理相关的模型,用于研究健康和疾病中的人类星形胶质细胞 | 人源多能干细胞衍生的三维大脑皮层球体中的星形胶质细胞 | 数字病理学 | NA | 免疫磁珠分选和细胞分选,以及高深度批量和单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 长达20个月的体外培养的人脑皮层球体中的星形胶质细胞系细胞 |
26788 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing to explore immune cell heterogeneity
2018-01, Nature reviews. Immunology
DOI:10.1038/nri.2017.76
PMID:28787399
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术在探索免疫细胞异质性方面的应用 | 讨论了如何利用scRNA-seq技术解析免疫系统的异质性,包括识别健康和疾病中的新型免疫细胞亚群,描述细胞群体内的随机异质性,以及构建免疫细胞的发育‘轨迹’ | NA | 探讨scRNA-seq技术在解析免疫系统异质性方面的应用及未来发展方向 | 免疫细胞的异质性 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | NA |
26789 | 2024-08-09 |
Single-cell sequencing unveils the lifestyle and CRISPR-based population history of Hydrotalea sp. in acid mine drainage
2017-Oct, Molecular ecology
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/mec.14294
PMID:28802076
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了酸矿排水(AMD)中Hydrotalea属微生物的生活方式及其基于CRISPR的种群历史 | 首次通过单细胞测序技术分析了早期AMD样本中Hydrotalea属微生物的基因组,并发现了两种共存的CRISPR-Cas位点及其在种群中的异质性 | 研究仅限于早期AMD样本中的Hydrotalea属微生物,未涉及其他阶段或其他环境中的微生物群落动态 | 探究酸矿排水环境中微生物群落动态,特别是早期发展阶段的微生物种群历史和适应性 | Hydrotalea属微生物及其在酸矿排水环境中的适应性和种群历史 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组 | 来自早期AMD样本的单细胞 |
26790 | 2024-08-09 |
Current research development of single cell genome in urological tumor
2017-09, The international journal of biochemistry & cell biology
DOI:10.1016/j.biocel.2017.08.003
PMID:28802562
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综述 | 本文综述了单细胞基因组技术在泌尿系统肿瘤(包括肾癌、膀胱癌和前列腺癌)中的最新进展和应用 | 介绍了单细胞基因组技术在检测个体癌细胞基因组病变中的新进展,以及其在肿瘤异质性研究中的应用 | NA | 探讨单细胞基因组技术在泌尿系统肿瘤研究中的应用及其在早期诊断、靶向治疗和预后判断中的潜力 | 泌尿系统肿瘤,包括肾癌、膀胱癌和前列腺癌 | 数字病理学 | 泌尿系统肿瘤 | 全基因组扩增 | NA | 基因组数据 | NA |
26791 | 2024-08-09 |
Whole transcriptome profiling of taste bud cells
2017-08-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-017-07746-z
PMID:28790351
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了小鼠味觉细胞中两种不同亚群(Tas1r3表达的II型细胞和生理学上识别的III型细胞)的基因表达 | 研究揭示了II型细胞中调控刺激响应的基因上调,以及III型细胞中与神经功能相关的通路上调,并发现了与趋化性和轴突导向相关的高表达基因和通路 | NA | 探索味觉细胞中不同亚群的基因表达特征及其功能 | 小鼠味觉细胞中的II型和III型细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两种不同亚群的小鼠味觉细胞 |
26792 | 2024-08-09 |
Functional Virtual Flow Cytometry: A Visual Analytic Approach for Characterizing Single-Cell Gene Expression Patterns
2017, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/2017/3035481
PMID:28798928
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研究论文 | 本文介绍了一种基于单细胞转录组研究检测细胞群分布模式的新工作流程 | 该工作流程使用基因共表达模块作为特征,而不是单个基因,从而可以交互式地探索细胞分布并快速解释基因特征 | NA | 旨在有效地提取基因特征,以有意义地区分细胞群 | 单细胞转录组数据中的细胞群分布模式 | 计算机视觉 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 图像 | 两个大型单细胞研究数据集 |
26793 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics reveals gene signatures and alterations associated with aging in distinct neural stem/progenitor cell subpopulations
2018-04, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1007/s13238-017-0450-2
PMID:28748452
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研究论文 | 本研究利用群体和单细胞转录组分析,揭示了衰老大脑中神经干细胞/祖细胞(NSC/NPCs)亚群的基因特征和改变 | 首次使用群体和单细胞转录组分析方法,揭示了不同NSC/NPCs与其微环境在衰老大脑中的分子相互作用 | 研究仅限于小鼠前脑的室管膜和室下区域,可能不适用于其他物种或其他脑区 | 探索衰老过程中神经干细胞/祖细胞亚群的分子机制 | 神经干细胞/祖细胞(NSC/NPCs)及其在衰老大脑中的分子变化 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 年轻和老年小鼠的前脑室管膜和室下区域样本 |
26794 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing: Technical advancements and biological applications
2018-02, Molecular aspects of medicine
IF:8.7Q1
DOI:10.1016/j.mam.2017.07.003
PMID:28754496
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综述 | 本文综述了自2009年以来发展的单细胞RNA测序技术及其在不同生物学背景下的应用 | 单细胞RNA测序技术为从头发现细胞异质性和细胞类型/状态提供了巨大潜力 | NA | 总结和比较单细胞RNA测序技术,并讨论其在不同生物学背景下的应用 | 单细胞RNA测序技术及其应用 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
26795 | 2024-08-09 |
Proinflammatory Dual Receptor T Cells in Chronic Graft-versus-Host Disease
2017-Nov, Biology of blood and marrow transplantation : journal of the American Society for Blood and Marrow Transplantation
DOI:10.1016/j.bbmt.2017.07.016
PMID:28750779
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研究论文 | 本文研究了慢性移植物抗宿主病(cGVHD)中双T细胞受体(TCR)细胞的作用 | 首次揭示了双TCR细胞在cGVHD中的病理作用,并指出了Tbet驱动的T细胞功能作为潜在治疗靶点 | NA | 探讨双TCR细胞在慢性移植物抗宿主病中的潜在作用 | 慢性移植物抗宿主病患者中的双TCR细胞 | NA | 移植物抗宿主病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
26796 | 2024-08-09 |
Genetics: Taking single-cell transcriptomics to the bedside
2017-10, Nature reviews. Clinical oncology
DOI:10.1038/nrclinonc.2017.117
PMID:28762386
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
26797 | 2024-08-09 |
Fusion of Regionally Specified hPSC-Derived Organoids Models Human Brain Development and Interneuron Migration
2017-09-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2017.07.007
PMID:28757360
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研究论文 | 本文描述了从人多能干细胞生成特定于内侧神经节隆起(MGE)和皮质区域的类器官,这些类器官能够重现MGE和皮质区域的发育过程 | 首次开发了模拟人内侧神经节隆起(MGE)发育的系统,并展示了区域特异性类器官融合后的活体成像分析 | NA | 提供一个平台用于生成特定区域的脑类器官,并模拟人中间神经元迁移 | 人多能干细胞衍生的MGE和皮质特定类器官 | 数字病理学 | NA | RNA测序(RNA-seq),转座酶可及染色质的高通量测序(ATAC-seq) | NA | 单细胞数据 | 未具体说明样本数量 |
26798 | 2024-08-09 |
Adventitial SCA-1+ Progenitor Cell Gene Sequencing Reveals the Mechanisms of Cell Migration in Response to Hyperlipidemia
2017-08-08, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2017.06.011
PMID:28757161
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术分析了野生型和ApoE缺陷型小鼠的SCA-1+前体细胞基因,揭示了高脂血症诱导的细胞迁移机制 | 首次详细探讨了SCA-1前体细胞在高脂血症诱导的动脉粥样硬化中的作用及其分子机制 | NA | 研究高脂血症对血管前体细胞迁移功能的影响及其分子机制 | SCA-1+前体细胞和ApoE缺陷型小鼠 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 野生型和ApoE缺陷型小鼠的SCA-1+前体细胞 |
26799 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptome Analysis of Developing and Regenerating Spiral Ganglion Neurons
2016-Oct, Current pharmacology reports
DOI:10.1007/s40495-016-0064-z
PMID:28758056
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析,研究了耳蜗螺旋神经节神经元(SGNs)的发育和再生过程 | 利用Fludigm C1工作流程或Drop-seq技术进行单细胞转录组测序,揭示细胞间的变异性,并通过伪时间排序描述分化轨迹 | NA | 开发新的策略以指导高效的SGN再生 | 耳蜗螺旋神经节神经元(SGNs)的发育和再生 | 数字病理学 | 听力损失 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA |
26800 | 2024-08-09 |
Can single-cell RNA sequencing crack the mystery of cells?
2018-02, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-017-9404-y
PMID:28733864
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |