单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27818 篇文献，本页显示第 23041 - 23060 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 23041 | 2024-08-08 |
The network interplay of interferon and Toll-like receptor signaling pathways in the anti-Candida immune response
2021-10-13, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-99838-0
PMID:34645905
|
研究论文 | 本研究通过综合分析微阵列、批量和单细胞RNA测序数据，揭示了人类对念珠菌属的免疫反应中干扰素和Toll样受体信号通路的网络相互作用 | 研究首次通过整合多种转录组学数据，揭示了念珠菌感染中干扰素和Toll样受体信号通路的网络相互作用，并确认了这些基因在不同免疫细胞中的细胞类型特异性表达模式 | NA | 揭示人类对念珠菌属的免疫反应中干扰素和Toll样受体信号通路的网络相互作用 | 念珠菌属（包括C. albicans, C. auris, C. glabrata, C. parapsilosis, 和C. tropicalis） | NA | 真菌感染 | 微阵列、批量和单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 涉及多种念珠菌属的感染数据 |
| 23042 | 2024-08-08 |
Recovery of strain-resolved genomes from human microbiome through an integration framework of single-cell genomics and metagenomics
2021-10-12, Microbiome
IF:13.8Q1
DOI:10.1186/s40168-021-01152-4
PMID:34641955
|
研究论文 | 本文介绍了一种结合单细胞基因组学和宏基因组学的框架，称为单细胞宏基因组学（sc-metagenomics），用于从微生物群落中重建具有菌株水平分辨率的基因组 | 提出的SMAGLinker框架通过使用微流控技术生成的单细胞扩增基因组（SAGs）作为分箱指南，并与宏基因组装基因组（MAGs）整合，从而恢复改进的草图基因组 | NA | 开发一种新的方法从微生物群落中获取高质量的参考基因组，以更好地理解未培养微生物的系统发育和功能 | 人类微生物群落中的微生物基因组 | 宏基因组学 | NA | 单细胞基因组学，宏基因组学 | NA | 基因组数据 | 103个肠道微生物基因组和45个皮肤微生物基因组 |
| 23043 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing reveals antitumor characteristics of intratumoral immune cells in old mice
2021-10, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-002809
PMID:34642245
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA和耦合T细胞受体（TCR）测序分析，揭示了老年小鼠肿瘤内浸润免疫细胞的抗肿瘤特性 | 发现老年小鼠肿瘤中效应免疫细胞比例显著较高，这些细胞有助于抵抗肿瘤进展 | NA | 深入理解老年个体如何防御肿瘤侵袭 | 年轻和老年小鼠的肿瘤浸润免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，TCR测序 | NA | 转录组数据 | 年轻和老年小鼠的免疫细胞样本 |
| 23044 | 2024-08-08 |
MET overexpression contributes to STAT4-PD-L1 signaling activation associated with tumor-associated, macrophages-mediated immunosuppression in primary glioblastomas
2021-10, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-002451
PMID:34667077
|
研究论文 | 本文研究了MET过表达在原发性胶质母细胞瘤中通过STAT4-PD-L1信号通路激活与肿瘤相关巨噬细胞介导的免疫抑制的关系 | 首次详细探讨了MET基因在原发性胶质母细胞瘤中逃避免疫监视检查点的能力，并揭示了MET-STAT4-PD-L1轴与肿瘤相关巨噬细胞在胶质母细胞瘤中的作用 | NA | 探讨MET表达与胶质瘤微环境的关系，并通过生存分析理解MET在临床实践中的潜在意义 | 原发性胶质瘤样本中的MET表达及其与PD-L1和STAT通路的关系 | 数字病理学 | 脑瘤 | 多组学数据分析 | NA | RNA表达数据 | 1243个原发性胶质瘤样本 |
| 23045 | 2024-08-08 |
[An optimized protocol of meniscus cell extraction for single-cell RNA sequencing]
2021-Aug-31, Nan fang yi ke da xue xue bao = Journal of Southern Medical University
|
研究论文 | 本文优化了半月板细胞提取协议，以提高细胞悬液制备效率并保持高细胞活力，用于单细胞RNA测序。 | 提出了一个优化的半月板细胞提取协议，相比常规方法能获得更多细胞且细胞活力更高。 | NA | 优化半月板细胞提取协议，以提高单细胞RNA测序的效率和细胞活力。 | 半月板细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 超过1×10^5个细胞 |
| 23046 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Approaches for Tracing T Cell Development
2021-07-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2100408
PMID:34644259
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在追踪T细胞发育中的应用 | 单细胞RNA测序技术提供了前所未有的分辨率，以分析细胞身份及其基因表达程序 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术如何提供对T细胞发育的深入见解 | T细胞发育过程中的细胞身份和基因表达程序 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 23047 | 2024-08-08 |
[Research progress in the identification and lineage differentiation of skeletal stem cell]
2021-Jan-09, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
|
综述 | 本文综述了骨骼干细胞（SSC）的鉴定、时空分布和功能特性的研究进展 | 讨论了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在骨骼干细胞鉴定和功能研究中的应用 | NA | 阐明骨骼干细胞的特性，为干细胞治疗提供新的见解 | 骨骼干细胞的鉴定、时空分布和功能特性 | 干细胞研究 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 23048 | 2024-08-08 |
Full-Length Transcriptome: A Reliable Alternative for Single-Cell RNA-Seq Analysis in the Spleen of Teleost Without Reference Genome
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.737332
PMID:34646272
|
研究论文 | 本文提出了一种使用全长转录组作为参考的单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据分析方法，并在没有已知基因组的硬骨鱼样本中进行了评估 | 本文提出的方法不依赖于参考基因组，适用于没有参考基因组的鱼类研究，为scRNA-seq数据分析提供了一种可靠的替代方案 | NA | 旨在开发和评估一种新的scRNA-seq数据分析方法，以在没有参考基因组的硬骨鱼中识别和表征免疫细胞亚群 | 硬骨鱼的脾脏中的免疫细胞亚群 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 23049 | 2024-08-08 |
SCMAG: A Semisupervised Single-Cell Clustering Method Based on Matrix Aggregation Graph Convolutional Neural Network
2021, Computational and mathematical methods in medicine
DOI:10.1155/2021/6842752
PMID:34646337
|
研究论文 | 本文提出了一种基于矩阵聚合图卷积神经网络的半监督单细胞聚类方法SCMAG | SCMAG充分利用了单细胞数据的先验信息，提高了聚类算法的准确性 | NA | 旨在提高单细胞数据聚类分析的准确性 | 单细胞数据 | 机器学习 | NA | 图卷积神经网络 | 图卷积神经网络 | 单细胞RNA测序数据 | 不同单细胞数据集 |
| 23050 | 2024-08-08 |
Tryptophan metabolism is inversely regulated in the tumor and blood of patients with glioblastoma
2021, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.60679
PMID:34646367
|
研究论文 | 本文研究了胶质母细胞瘤患者肿瘤和血液中色氨酸代谢的反向调控，并开发了新的技术来支持针对色氨酸分解酶或芳香烃受体激活的治疗 | 开发了结合LC-MS/MS与化学同位素标记的方法，用于同时定量比较色氨酸及其代谢物，并应用MALDI MSI和scRNA-seq技术分析色氨酸代谢和芳香烃受体活性 | NA | 更好地理解色氨酸代谢，支持针对色氨酸分解酶或芳香烃受体的治疗 | 胶质母细胞瘤患者的色氨酸代谢 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | LC-MS/MS, MALDI MSI, scRNA-seq | 人工神经网络 | 血液样本, 肿瘤组织 | 43名复发性胶质母细胞瘤患者和43名年龄性别匹配的健康对照 |
| 23051 | 2024-08-08 |
Tumor microenvironment-based screening repurposes drugs targeting cancer stem cells and cancer-associated fibroblasts
2021, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.62676
PMID:34646392
|
研究论文 | 本研究旨在建立基于肿瘤微环境（TME）的筛选方法，以识别能够特异性靶向癌症干细胞（CSCs）和癌症相关成纤维细胞（CAFs）的药物 | 开发了一种基于肿瘤微环境的高通量药物筛选平台，并利用单细胞RNA测序技术评估药物在CSCs和CAFs中的作用机制 | NA | 建立基于肿瘤微环境的药物筛选平台，以加速药物开发和治疗应用 | 肺癌患者来源的癌细胞和CAFs，以及CSCs和CAFs | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 1,524种化合物 |
| 23052 | 2024-08-08 |
Single Cell RNA-Sequencing Reveals a Murine Gallbladder Cell Transcriptome Atlas During the Process of Cholesterol Gallstone Formation
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.714271
PMID:34650971
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了胆固醇结石形成过程中小鼠胆囊细胞的转录组图谱 | 首次展示了胆固醇结石形成过程中小鼠胆囊细胞的细胞异质性和转录组动态变化 | NA | 揭示胆固醇结石形成过程中胆囊细胞的变化，增进对疾病发病机制和治疗的理解 | 小鼠胆囊细胞在胆固醇结石形成过程中的转录组变化 | 数字病理学 | 胆石症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | NA |
| 23053 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis of Peripheral Blood Reveals a Novel B-Cell Subset in Renal Allograft Recipients With Accommodation
2021, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2021.706580
PMID:34658852
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析肾移植受者的外周血细胞，揭示了免疫抑制剂对免疫细胞亚群的新机制 | 发现了一个新的B细胞亚群（CD19IGLC3IGKCTCL1ACD127），该亚群在肾移植受者中显著减少，并显示出激活潜力 | 样本量较小，仅包括三名个体 | 描述肾移植受者免疫耐受的细节，并揭示免疫抑制剂对免疫细胞亚群的影响机制 | 肾移植受者的外周T细胞、B细胞、髓系细胞和NK细胞 | 数字病理学 | 肾病 | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 总共8,272个细胞，来自三名个体，包括2,758个健康对照细胞，2,550个ESRD患者细胞和2,964个肾移植患者细胞 |
| 23054 | 2024-08-08 |
Expansion of Human Papillomavirus-Specific T Cells in Periphery and Cervix in a Therapeutic Vaccine Recipient Whose Cervical High-Grade Squamous Intraepithelial Lesion Regressed
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.645299
PMID:34659195
|
研究论文 | 本文描述了一位接受HPV治疗性疫苗PepCan的女性，其宫颈高级别鳞状上皮内病变完全消退，并通过T细胞受体β深度测序分析了疫苗接种前后的T细胞反应。 | 结合传统和前沿的免疫监测技术，首次展示了HPV抗原特异性T细胞不仅在外周血中，而且在宫颈中的扩增。 | NA | 研究HPV治疗性疫苗对T细胞反应的影响，并验证疫苗特异性T细胞的存在。 | HPV治疗性疫苗PepCan接种者的T细胞反应及宫颈病变消退情况。 | 免疫学 | 宫颈疾病 | T细胞受体β深度测序 | NA | 单细胞RNA测序和TCR测序数据 | 70个可能的疫苗特异性克隆型 |
| 23055 | 2024-08-08 |
Phytohormone-Based Regulation of Trichome Development
2021, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2021.734776
PMID:34659303
|
综述 | 本文综述了植物激素对毛状体发育的调控作用 | 介绍了CRISPR-Cas9系统和单细胞转录组学等新技术在研究毛状体细胞系调控网络中的应用 | NA | 探讨植物激素对毛状体发育的调控机制 | 植物毛状体的发育 | NA | NA | CRISPR-Cas9系统, 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | NA |
| 23056 | 2024-08-08 |
From GWAS to Gene: Transcriptome-Wide Association Studies and Other Methods to Functionally Understand GWAS Discoveries
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.713230
PMID:34659337
|
综述 | 本文综述了结合功能基因组学知识与全基因组关联研究（GWAS）的数据整合生物信息学方法，以识别遗传调控基因 | 介绍了转录组广泛关联研究（TWAS）作为一种基因基础的关联方法，能够减少多重检验负担，并讨论了不同TWAS方法的设计和生物学假设 | 文章未明确提及具体限制 | 探讨如何通过数据整合方法更好地理解GWAS发现与复杂疾病机制之间的关系 | 全基因组关联研究（GWAS）发现的非编码区域及其在复杂人类疾病和性状中的功能 | 基因组学 | NA | 全基因组关联研究（GWAS），转录组广泛关联研究（TWAS） | NA | 基因组数据 | NA |
| 23057 | 2024-08-08 |
Identification of Specific Cell Subpopulations and Marker Genes in Ovarian Cancer Using Single-Cell RNA Sequencing
2021, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/2021/1005793
PMID:34660776
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析卵巢癌细胞中的特定细胞亚群和标记基因 | 揭示了卵巢癌中的特定细胞亚群和标记基因，为卵巢癌的异质性提供了新的见解 | NA | 分析卵巢癌细胞中的特定细胞亚群和标记基因 | 卵巢癌细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 66个高级别浆液性卵巢癌细胞样本和568个卵巢癌样本及8个正常卵巢样本 |
| 23058 | 2024-08-08 |
Biallelic variants in ZFP36L2 cause female infertility characterised by recurrent preimplantation embryo arrest
2022-Sep, Journal of medical genetics
IF:3.5Q2
DOI:10.1136/jmedgenet-2021-107933
PMID:34611029
|
研究论文 | 本文通过全外显子测序和功能验证，发现双等位变异在ZFP36L2基因中与反复的植入前胚胎发育停滞相关 | 首次发现ZFP36L2基因的双等位变异与反复的植入前胚胎发育停滞有关，为这类不孕症提供了新的遗传诊断靶点 | NA | 探究反复植入前胚胎发育停滞的遗传原因 | 100名经历反复植入前胚胎发育停滞的不孕女性 | NA | 不孕症 | 全外显子测序, Sanger测序, 生物信息学分析, 体外功能分析, 单细胞RNA测序 | NA | 基因序列 | 100名不孕女性 |
| 23059 | 2024-08-08 |
Satb1 expression in retinal ganglion cells of marmosets, macaques, and humans
2022-04, The Journal of comparative neurology
IF:2.3Q1
DOI:10.1002/cne.25258
PMID:34622958
|
研究论文 | 本研究利用针对转录因子Satb1的抗体，研究了狨猴、猕猴和人类视网膜中Satb1的表达情况 | 发现旧世界（人类和猕猴）和新世界（狨猴）灵长类动物视网膜神经节细胞中转录因子的表达并不保守，并将分子标记与特定细胞类型联系起来 | NA | 研究不同物种视网膜神经节细胞中Satb1的表达情况 | 狨猴、猕猴和人类的视网膜神经节细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 狨猴、猕猴和人类各一种 |
| 23060 | 2024-08-08 |
Integrating genetic and epigenetic factors in chronic myeloid leukemia risk assessment: toward gene expression-based biomarkers
2022-02-01, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2021.279317
PMID:34615339
|
综述 | 本文综述了基因表达（GE）分析在慢性髓性白血病（CML）中的应用，探讨其作为个性化治疗风险评估工具的潜力 | 提出了一个四阶段方法来开发基于GE的CML生物标志物，并探讨了遗传和表观遗传因素在耐药性和急性转化中的作用 | 不同细胞类型、技术使用和基因组数据解释的复杂性对将GE数据转化为具有临床实用性的生物标志物提出了挑战 | 评估GE分析在CML中的临床信息价值，并探索其作为个性化CML治疗风险评估工具的潜力 | 慢性髓性白血病（CML）患者 | 数字病理学 | 白血病 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自多种来源的患者材料 |