单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 32827 篇文献，本页显示第 2041 - 2060 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2041 | 2025-10-05 |
Innate Immune-Cloaked Microgel-Coated Mesenchymal Stromal Cells Reverse Persistent Pulmonary Fibrosis via Reparative Macrophages
2025-Sep-23, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202504590
PMID:40984773
|
研究论文 | 本研究开发了一种先天免疫伪装微凝胶包被的间充质基质细胞，通过修复性巨噬细胞逆转持续性肺纤维化 | 首次将先天免疫检查点材料策略与微凝胶包被技术结合，使治疗细胞能逃逸组织驻留巨噬细胞的清除 | NA | 开发治疗复杂慢性疾病（如纤维化）的新型细胞治疗策略 | 间充质基质细胞、组织驻留巨噬细胞、肺纤维化模型 | 细胞治疗 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2042 | 2025-10-05 |
Tertiary lymphoid structures in Merkel cell carcinoma facilitate naïve and central memory T-cell infiltration linked to immunotherapy response
2025-Sep-23, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012224
PMID:40992783
|
研究论文 | 本研究探讨默克尔细胞癌中三级淋巴结构对T细胞浸润和免疫治疗反应的影响机制 | 首次系统揭示三级淋巴结构通过高内皮小静脉促进初始和中央记忆T细胞浸润的详细机制，并发现TCR克隆多样性与病毒抗原反应性的关联 | 样本量较小（27例患者），部分分析仅在选定病例中进行空间转录组学 | 阐明三级淋巴结构在默克尔细胞癌免疫微环境中的作用机制 | 27例默克尔细胞癌患者的肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 默克尔细胞癌 | 转录组分析、多重免疫可视化分析、T细胞受体克隆分型、空间转录组学 | 加权基因共表达网络分析 | RNA测序数据、免疫组织化学数据、空间转录组数据 | 27例默克尔细胞癌患者 | NA | 空间转录组学、RNA测序、V(D)J测序 | NA | NA |
| 2043 | 2025-10-05 |
Spatial regulation of CD8+ T cells at the HLA-E-NKG2A axis drives HIV persistence in lymph node B cell follicles
2025-Sep-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116181
PMID:40849901
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学和高维组织细胞计量技术揭示了HIV在淋巴结B细胞滤泡中持续存在的免疫调控机制 | 首次发现HLA-E-NKG2A轴在调节滤泡CD8+T细胞功能中的关键作用，揭示了HIV免疫逃避的新机制 | 研究样本仅限于HIV感染者，缺乏健康对照组比较 | 探究淋巴结B细胞滤泡中HIV持续存在的免疫调控机制 | HIV感染者的淋巴结组织样本 | 数字病理学 | HIV感染 | 空间转录组学,高维组织细胞计量,荧光激活细胞分选 | NA | 空间转录组数据,组织图像,流式细胞数据 | 不同抗逆转录病毒治疗阶段的HIV感染者淋巴结样本 | NA | 空间转录组学,单细胞分析 | NA | NA |
| 2044 | 2025-10-05 |
Junctional adhesion molecule C limits glioblastoma stem-like cell invasion by regulating integrin adhesion at the endothelial interface
2025-Sep-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116194
PMID:40875295
|
研究论文 | 本研究揭示了连接粘附分子C（JAMC）通过调节整合素粘附在限制胶质母细胞瘤干细胞样细胞侵袭中的关键作用 | 首次发现JAMC通过调节整合素粘附在胶质母细胞瘤干细胞样细胞与内皮细胞界面相互作用中的关键调控功能 | 研究主要基于体外实验和小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探索胶质母细胞瘤干细胞样细胞与血管内皮界面相互作用的分子机制 | 胶质母细胞瘤干细胞样细胞（GSCs） | 癌症生物学 | 胶质母细胞瘤 | 空间转录组学，定量蛋白质组学，脱细胞基质，共培养，器官型脑切片 | NA | 转录组数据，蛋白质组数据，细胞行为数据 | 人类样本和小鼠模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2045 | 2025-10-05 |
Single-cell transcriptomic reconstruction of the human hair cycle: Capturing the temporal dynamics of skin tissue remodeling
2025-Sep-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116196
PMID:40884793
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序重建人类毛发周期的时间动态，揭示皮肤组织重塑的分子机制 | 首次在人类皮肤组织中构建了毛发周期的伪时间序列，揭示了16种不同细胞群体在毛发周期中的连续基因表达变化 | 样本数量有限（19个皮肤组织），且为计算重建的伪时间序列而非真实时间序列 | 研究人类皮肤组织在毛发周期中的动态重塑过程 | 人类皮肤组织中的毛囊及相关细胞群体 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 伪时间序列分析 | 单细胞转录组数据 | 19个人类皮肤组织样本，每个样本包含单个毛囊 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2046 | 2025-10-05 |
Advances in artificial intelligence for spatial transcriptomics in cancer: Special focus on Yin Yang 1 (YY1) and Raf kinase inhibitor protein (RKIP)
2025-Sep-22, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2025.189456
PMID:40992707
|
综述 | 探讨人工智能在癌症空间转录组学中的应用，特别关注YY1和RKIP基因 | 聚焦于整合机器学习、人工智能和统计方法来解析空间转录组数据，并以YY1和RKIP基因为例展示应用 | NA | 推进空间转录组学在癌症研究和个性化医疗中的应用 | 癌症微环境中的基因表达模式，特别是YY1和RKIP基因 | 空间转录组学 | 癌症 | 空间转录组学，机器学习，人工智能 | 支持向量机(SVM)，随机森林(RF)，主成分分析(PCA)，t-SNE，UMAP | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2047 | 2025-10-05 |
Epac1 deletion attenuates Müller glial pathological activation and mitigates retinal neurodegeneration in ischemia-induced retinopathy
2025-Sep-19, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.09.031
PMID:40976555
|
研究论文 | 本研究通过基因敲除Epac1探索其在缺血性视网膜病变中对Müller胶质细胞病理激活和视网膜神经变性的作用机制 | 首次揭示Epac1通过调节Müller细胞中VEGF信号通路促进视网膜神经变性的新机制 | 研究仅使用小鼠OIR模型，尚未在人类疾病中验证 | 探究Epac1在缺血性视网膜病变中的作用及其分子机制 | 氧诱导视网膜病变(OIR)小鼠模型和原代Müller细胞 | 眼科疾病研究 | 缺血性视网膜病变 | 单细胞RNA测序,免疫染色,qPCR,Western blot,邻近连接分析 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,蛋白质数据,组织形态数据 | 未明确样本数量的小鼠视网膜组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2048 | 2025-10-05 |
Immune microenvironment and fibroblast subpopulation in diabetic wound healing
2025-Sep-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113440
PMID:40995117
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析糖尿病足溃疡肉芽组织，揭示免疫微环境和成纤维细胞亚群在伤口愈合中的作用 | 首次在单细胞水平系统描绘糖尿病伤口修复微环境中免疫细胞和成纤维细胞亚群的特定改变 | NA | 探究糖尿病足溃疡愈合障碍的细胞分子机制 | 糖尿病足溃疡患者的肉芽组织 | 数字病理学 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序，荧光成像 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2049 | 2025-10-05 |
Single-cell analysis of heterogeneity and molecular changes in cultured corneal epithelial stem cells during serial passage
2025-Sep-17, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxaf041
PMID:40574692
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析长期传代培养的角膜缘干细胞群体动态和基因表达变化 | 首次在单细胞水平识别出三种不同的角膜缘祖细胞亚群，并发现RepSox小分子处理可部分维持长期培养中的干细胞特性 | 研究主要基于体外培养模型，体内验证仍需进一步研究 | 探索长期传代培养中角膜缘干细胞异质性和分子变化机制 | 培养的角膜上皮干细胞 | 单细胞生物学 | 角膜疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 22708个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2050 | 2025-10-05 |
Consistent self-organized emergence of hyaline cartilage in human induced pluripotent stem cell-derived multi-tissue organoids
2025-Sep-17, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxaf043
PMID:40577622
|
研究论文 | 开发了一种利用人多能干细胞生成透明软骨的简化多组织类器官方案 | 建立了无需异源成分和饲养层的简单培养方案，实现了透明软骨在类器官中的稳定形成 | 未提及临床转化应用的具体验证数据 | 开发稳定生成透明软骨的hiPSC培养方案 | 人诱导多能干细胞衍生的多组织类器官 | 组织工程 | 软骨相关疾病 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, 组织学, 免疫组织化学 | 多组织类器官模型 | 基因表达数据, 组织图像 | 未明确说明具体样本数量 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2051 | 2025-10-05 |
Human-mouse cross-species comparison identifies common and unique aspects of intestinal mesenchyme development
2025-Sep-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.03.674033
PMID:40950081
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和组织学方法比较小鼠和人类肠道间充质发育的异同 | 首次进行跨物种比较揭示肠道间充质细胞类型的高度保守性及物种特异性基因表达差异 | 研究仅关注发育阶段，未涉及成熟或病理状态下的间充质细胞 | 探究小鼠和人类肠道间充质细胞发育的保守性和差异性 | 发育中小鼠和人类肠道的间充质（成纤维细胞）群体 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 荧光原位杂交, 免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 空间图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2052 | 2025-10-05 |
FemXpress: Systematic Analysis of X Chromosome Inactivation Heterogeneity in Female Single-Cell RNA-Seq Samples
2025-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202504754
PMID:40583143
|
研究论文 | 介绍了一种名为FemXpress的计算工具，用于分析女性单细胞RNA测序数据中的X染色体失活异质性 | 开发了首个不依赖亲本基因组信息即可基于X连锁SNPs对单细胞进行X染色体失活起源分类的计算工具 | NA | 开发分析女性单细胞RNA测序数据中X染色体失活异质性的计算方法 | 女性单细胞RNA测序样本 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 多个组织的食蟹猴单细胞RNA测序数据，以及胚胎和结肠肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2053 | 2025-10-05 |
Tracing and Capturing the Epiblast Pluripotency of Sheep Preimplantation Embryos
2025-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202417764
PMID:40586282
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了绵羊植入前胚胎中上胚层多能性的变化，并成功建立了绵羊形成性和定型多能干细胞 | 首次在绵羊中建立了能够长期传代的形成性和定型多能干细胞，并揭示了物种间早期胚胎发育的保守性和差异性 | 研究主要聚焦于绵羊模型，跨物种比较的深度和广度有待进一步扩展 | 研究绵羊植入前胚胎上胚层多能性的变化规律及其调控机制 | 绵羊植入前胚胎（E1-E14天）及衍生的多能干细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 绵羊胚胎E1至E14天发育时间点的单细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2054 | 2025-10-05 |
Integrated Transcriptome and Metabolomics Analyses Show MYC as a Potential Therapeutic Target for Behçet's Uveitis
2025-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202417843
PMID:40586758
|
研究论文 | 本研究通过整合转录组和代谢组学分析，揭示MYC作为贝赫切特葡萄膜炎潜在治疗靶点 | 首次结合非靶向代谢组学和单细胞RNA测序技术，发现MYC通过调控糖酵解促进效应T细胞异常反应的新机制 | 研究样本量有限，主要基于实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠模型，需要更多临床验证 | 探索贝赫切特葡萄膜炎的疾病特异性代谢改变及其治疗靶点 | 贝赫切特葡萄膜炎患者、健康对照者和实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠 | 生物信息学 | 自身免疫性疾病 | 非靶向代谢组学,单细胞RNA测序 | NA | 代谢组数据,单细胞转录组数据 | 贝赫切特葡萄膜炎患者和健康对照者 | NA | 单细胞RNA测序,代谢组学 | NA | NA |
| 2055 | 2025-10-05 |
Choroid Plexus Fibroblast-ILC2 Niche Promotes Adult Hippocampal Neurogenesis after Traumatic Brain Injury
2025-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202415984
PMID:40605604
|
研究论文 | 本研究揭示创伤性脑损伤后脉络丛中ILC2细胞的积累及其通过调节免疫微环境和促进海马神经发生改善神经功能的机制 | 首次发现脉络丛成纤维细胞与ILC2形成的生态位在创伤性脑损伤后促进海马神经发生的作用机制 | NA | 探究创伤性脑损伤后脉络丛结构变化和免疫细胞浸润特征及其对神经修复的影响 | 创伤性脑损伤小鼠模型中的脉络丛组织和海马组织 | 神经科学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序,单核RNA测序,组织学分析 | NA | 基因表达数据,组织图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,单核RNA测序 | NA | NA |
| 2056 | 2025-10-05 |
Roadmap for spatial transcriptomics of HIV in tissues
2025-Sep-01, Current opinion in HIV and AIDS
IF:4.5Q1
DOI:10.1097/COH.0000000000000961
PMID:40626838
|
综述 | 本文概述了空间转录组学在HIV组织研究中的应用路线图，包括平台选择、工作流程和生物信息学分析 | 提出了HIV组织持久性研究的空间转录组学路线图，整合了多种空间分析技术 | 目标RNA捕获中目标数量增加会降低灵敏度，分析需要确保严谨性并验证发现 | 探索HIV在组织中的持久性机制并为治疗策略提供信息 | HIV感染细胞及其周围组织微环境 | 空间转录组学 | HIV感染 | 空间转录组学, ATAC-seq, T细胞受体测序 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 2057 | 2025-10-05 |
The Evolutionary Trajectory and Prognostic Value of GITR+ Tregs Reprogramed by Tumor-Intrinsic PD-1/c-MET Signaling in Pancreatic Cancer
2025-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202500806
PMID:40673866
|
研究论文 | 本研究揭示了胰腺癌中肿瘤内在PD-1/c-MET信号通路通过驱动GITR⁺ Tregs的积累促进免疫逃逸的机制 | 首次发现MET信号通路选择性驱动具有强免疫抑制功能的GITR⁺ Tregs亚群积累，并阐明MET-IL-23-STAT4轴在其中的关键作用 | 研究主要基于胰腺导管腺癌模型，在其他癌症类型中的普适性需要进一步验证 | 探究肿瘤内在PD-1/c-MET信号通路的免疫调节作用及其在胰腺癌免疫逃逸中的机制 | 胰腺导管腺癌(PDAC)肿瘤微环境中的免疫细胞，特别是GITR⁺调节性T细胞 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序，原位肿瘤模型 | NA | 基因表达数据，免疫组化数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2058 | 2025-10-05 |
Enhanced Media Optimize Bovine Myogenesis in 2D and 3D Models for Cultivated Meat Applications
2025-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202413998
PMID:40720723
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析开发了增强牛肌源性祖细胞分化的培养基，优化了培养肉的2D和3D肌肉模型 | 首次通过多组学方法系统表征牛肌源性祖细胞分化分子图谱，并开发出能同时促进肌细胞分化和维持祖细胞特性的增强培养基 | 研究主要聚焦于体外模型，需要进一步验证在规模化培养肉生产中的适用性 | 优化培养肉生产技术，提高肌肉细胞分化效率 | 牛肌源性祖细胞(MPCs) | 组织工程 | NA | 多组学分析、单细胞转录组学、蛋白质组学 | 2D培养模型、3D骨骼肌构建体 | 转录组数据、蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq、蛋白质组学 | NA | NA |
| 2059 | 2025-10-05 |
Neuro-immuno-stromal context in colorectal cancer: An enteric glial cell-driven prognostic model via machine learning predicts survival, recurrence, and therapy response
2025-Sep-01, Experimental cell research
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.yexcr.2025.114733
PMID:40914542
|
研究论文 | 基于肠胶质细胞相关基因构建机器学习预后模型，用于预测结直肠癌患者的生存、复发和治疗反应 | 首次整合肠胶质细胞和结直肠癌相关基因表达，通过机器学习构建预后模型，揭示神经-免疫-基质微环境在结直肠癌中的作用 | 需要进一步验证模型的临床适用性 | 开发并验证结直肠癌预后预测模型 | 结直肠癌患者 | 机器学习 | 结直肠癌 | RNA测序 | RSF随机森林 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 2060 | 2025-10-05 |
Role of Tunneling Nanotubes in Arachidonic Acid Transfer and Macrophage Function Reprogramming in Intrahepatic Cholangiocarcinoma
2025-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202500148
PMID:40552574
|
研究论文 | 本研究揭示隧道纳米管通过转移花生四烯酸重编程肿瘤相关巨噬细胞功能促进肝内胆管癌进展的机制 | 首次发现隧道纳米管是肿瘤源性脂肪酸转移的主要途径，并阐明花生四烯酸通过PI3K-AKT通路驱动巨噬细胞表型重编程 | 研究主要基于异种移植模型，需要在人类原代样本中进一步验证 | 探究隧道纳米管在肿瘤微环境中巨噬细胞功能重编程中的作用机制 | 肿瘤相关巨噬细胞和肝内胆管癌细胞 | 肿瘤免疫学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序, 脂质组学, 代谢组学, 转录组分析 | NA | 基因表达数据, 代谢物数据, 脂质数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |