单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28135 篇文献，本页显示第 20261 - 20280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 20261 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing analysis and transcriptome analysis constructed the macrophage related gene-related signature in lung adenocarcinoma and verified by an independent cohort
2022-11, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2022.110520
PMID:36372305
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和转录组分析构建了与巨噬细胞相关的基因特征，并在肺腺癌中进行了验证 | 首次基于巨噬细胞在肺腺癌中的不同免疫模式，构建了一个四基因的预后特征 | NA | 探索巨噬细胞与肺腺癌患者预后的关系，并构建预后特征 | 肺腺癌患者的巨噬细胞相关基因和免疫模式 | 数字病理学 | 肺腺癌 | sc-RNAseq, ssGSEA, CIBERSORT | NA | 基因表达数据 | 两个sc-RNAseq数据集，TCGA-LUAD队列，五个GEO-LUAD数据集和包含112个肺腺癌样本的独立队列 |
| 20262 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing highlights the functional role of human endogenous retroviruses in gallbladder cancer
2022-Nov, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2022.104319
PMID:36374772
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了人内源性逆转录病毒在胆囊癌中的功能作用 | 发现HERVs在胆囊癌中以细胞类型特异性的方式转录，并与不同的生物学效应相关，HERVH可能作为胆囊癌的早期诊断标志物 | NA | 探索HERVs在胆囊癌中的转录景观及其潜在功能影响 | 胆囊癌组织及其配对邻近组织中的HERVs | 数字病理学 | 胆囊癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 4名胆囊癌患者的肿瘤组织及其配对邻近组织 |
| 20263 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing Analysis Identified ASTN2 as a Migration Biomarker in Adult Glioblastoma
2022-Oct-30, Brain sciences
IF:2.7Q3
DOI:10.3390/brainsci12111472
PMID:36358398
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，在成人胶质母细胞瘤中鉴定了ASTN2作为迁移生物标志物 | 首次报道了ASTN2在胶质母细胞瘤细胞迁移中的作用，并验证了其在临床预后中的不良影响 | NA | 探索成人胶质母细胞瘤中ASTN2的表达及其对细胞迁移能力的影响 | 成人胶质母细胞瘤细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 20264 | 2024-08-08 |
A Resilience Related Glial-Neurovascular Network Is Transcriptionally Activated after Chronic Social Defeat in Male Mice
2022-10-27, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11213405
PMID:36359800
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研究论文 | 本研究通过数据驱动的行为分层和单细胞转录组学分析，探讨了慢性社交挫败应激后小鼠海马体的分子机制 | 揭示了慢性应激后海马体在神经免疫反应、血管生成、髓鞘形成和神经发生中的作用，并证明了雷帕霉素作为药物干预可以显著增加应激恢复力 | NA | 理解慢性应激反应的分子过程并探索针对性的干预措施 | 小鼠海马体在慢性社交挫败应激后的分子响应 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 20265 | 2024-08-08 |
Multiplexed Digital Spatial Protein Profiling Reveals Distinct Phenotypes of Mononuclear Phagocytes in Livers with Advanced Fibrosis
2022-10-26, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11213387
PMID:36359782
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研究论文 | 本研究利用多重数字空间蛋白质分析技术，揭示了晚期肝纤维化中肝内单核吞噬细胞的独特蛋白质特征 | 首次使用空间定义的基于蛋白质的多重分析技术，展示了早期和晚期肝纤维化中门静脉单核吞噬细胞表型的关键差异 | NA | 旨在通过多重数字空间蛋白质分析技术，推导出预测晚期肝纤维化的独特蛋白质特征 | 肝内单核吞噬细胞在晚期肝纤维化中的表型 | 数字病理学 | 肝病 | 多重数字空间蛋白质分析（Nanostring GeoMX） | NA | 蛋白质数据 | 64个门静脉感兴趣区域（ROIs） |
| 20266 | 2024-08-08 |
Prognosis and Immunological Characteristics of PGK1 in Lung Adenocarcinoma: A Systematic Analysis
2022-Oct-25, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14215228
PMID:36358653
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研究论文 | 本文通过系统分析探讨了磷酸甘油酸激酶1（PGK1）在肺腺癌（LUAD）中的预后和免疫学特性 | 首次确定了PGK1在肺腺癌中改变肿瘤微环境（TME）的作用，并揭示了PGK1与多种免疫细胞和免疫检查点的关联 | 需要更多的实验和临床转化研究来验证PGK1在肺腺癌中的作用 | 研究PGK1在肺腺癌中的预后和免疫学特性，探索潜在的免疫代谢联合治疗策略 | 肺腺癌中的PGK1基因及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 肺腺癌 | DNA测序、mRNA测序、甲基化修饰、单细胞RNA测序、蛋白质组学 | NA | 基因组数据、转录组数据、表观遗传数据、蛋白质数据 | 多个独立公共数据集中的大量样本 |
| 20267 | 2024-08-08 |
Exploring Transcriptomic Landscapes in Red Blood Cells, in Their Extracellular Vesicles and on a Single-Cell Level
2022-Oct-25, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms232112897
PMID:36361688
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研究论文 | 本文通过下一代测序和单细胞RNA测序技术，研究了红细胞及其细胞外囊泡的转录组特征 | 首次在单细胞水平上揭示了红细胞中约10%的细胞含有可检测水平的mRNA，并形成了基于转录组的三个亚群 | 文章未明确提及研究的局限性 | 探索红细胞及其细胞外囊泡的转录组特征，并研究这些转录组在细胞间通讯中的作用 | 红细胞及其细胞外囊泡的转录组 | 数字病理学 | NA | 下一代测序, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 20268 | 2024-08-08 |
Heterogeneity and Differentiation Trajectories of Infiltrating CD8+ T Cells in Lung Adenocarcinoma
2022-Oct-22, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14215183
PMID:36358600
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析了肺腺癌中浸润性CD8+ T细胞的异质性和分化轨迹 | 首次详细描述了肺腺癌中CD8+ T细胞的分化轨迹和功能状态，并筛选出影响患者预后的关键基因 | 研究仅基于单个数据集，结果的普遍性和可重复性有待进一步验证 | 深入理解肺腺癌中浸润性CD8+ T细胞的异质性和功能耗竭，并寻找潜在的治疗靶点 | 肺腺癌中的CD8+ T细胞及其分化轨迹 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 使用了GSE131907数据集中的样本，并在TCGA样本中进行了验证 |
| 20269 | 2024-08-08 |
Novel IKZF3 transcriptomic signature correlates with positive outcomes of skin cutaneous melanoma: A pan-cancer analysis
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.1036402
PMID:36353107
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研究论文 | 本研究通过多数据库分析，探讨了Ikaros家族基因与皮肤皮肤黑色素瘤（SKCM）之间的潜在关系，并评估了其在不同癌症类型中的转录特征和临床预后。 | 首次识别出Ikaros基因家族在不同癌症中的泛癌基因组特征，并发现其高表达与SKCM的良好免疫状态和有益临床结果相关。 | NA | 研究Ikaros家族基因与皮肤皮肤黑色素瘤的关系及其在不同癌症类型中的表达特征和临床预后。 | Ikaros家族基因在皮肤皮肤黑色素瘤及其他癌症中的表达及其与临床预后的关系。 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | 转录组分析 | NA | 转录组数据 | 10,327个转录组样本 |
| 20270 | 2024-08-08 |
Identification of biomarkers for hepatocellular carcinoma based on single cell sequencing and machine learning algorithms
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.873218
PMID:36353113
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和机器学习算法，从八名肝细胞癌患者的肿瘤细胞和配对正常肝细胞中筛选出区分肝细胞癌和正常肝组织的核心生物标志物 | 采用单细胞RNA测序技术揭示肿瘤异质性，并结合机器学习算法筛选生物标志物 | 研究样本量较小，仅涉及八名患者 | 提高肝细胞癌患者的预后 | 肝细胞癌的生物标志物 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 八名肝细胞癌患者 |
| 20271 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics of human gut T cells identifies cytotoxic CD4+CD8A+ T cells related to mouse CD4 cytotoxic T cells
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.977117
PMID:36353619
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，在人类肠道T细胞中鉴定出与小鼠CD4细胞毒性T细胞相关的细胞毒性CD4+CD8A+ T细胞 | 首次在人类肠道中发现细胞毒性CD4+CD8A+ T细胞，并与小鼠CD4细胞毒性T细胞进行比较分析 | 研究主要集中在肠道炎症疾病患者，未涉及其他疾病状态 | 鉴定人类肠道中的细胞毒性CD4 T细胞，并分析其在炎症性肠病（IBD）患者中的特征 | 人类肠道T细胞及炎症性肠病患者的细胞毒性CD4 T细胞 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 20272 | 2024-08-05 |
Establishment and characterization of adult human gastric epithelial progenitor-like cell lines
2023-Jun, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13355
PMID:36331058
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研究论文 | 本研究建立和表征了成人人体胃上皮前体细胞系 | 提出了一种新型的单层细胞培养系统，以克服3D类器官培养的限制 | 目前未提及该培养系统在体内模型中的应用 | 研究成人人体胃上皮前体细胞系的自我更新与分化潜力 | 成人人体胃上皮前体细胞 | 数字病理学 | 胃相关疾病 | 单细胞转录组测序 | 单层细胞培养 | 转录组数据 | 成人人体胃上皮细胞系 |
| 20273 | 2024-08-08 |
Basal Cell-derived WNT7A Promotes Fibrogenesis at the Fibrotic Niche in Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2023-03, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2022-0074OC
PMID:36318668
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研究论文 | 本研究探讨了基底细胞衍生的WNT7A在特发性肺纤维化（IPF）中的促纤维化作用 | 发现基底细胞衍生的WNT7A在IPF进展中起关键作用，并提供了一种新的IPF治疗策略 | NA | 研究基底细胞在特发性肺纤维化中的作用及其机制 | 基底细胞、成纤维细胞和肺泡上皮细胞 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序、Luminex分析、三维器官培养 | NA | 基因表达数据、蛋白质分泌数据 | IPF移植组织和健康供体肺组织的基底细胞 |
| 20274 | 2024-08-08 |
C1Q labels a highly aggressive macrophage-like leukemia population indicating extramedullary infiltration and relapse
2023-02-16, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2022017046
PMID:36322939
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，识别并验证了一种表达C1Q的巨噬细胞样白血病亚群，该亚群与急性髓系白血病（AML）的髓外浸润（EMI）和复发有关。 | 首次发现C1Q标记的巨噬细胞样白血病亚群与AML的髓外浸润和复发密切相关，并揭示了其分子机制和潜在的治疗靶点。 | 研究主要基于单个病例和少数患者的数据，需要进一步的大规模临床验证。 | 探讨AML中髓外浸润的分子机制及其与不良预后的关系。 | 急性髓系白血病患者及其骨髓和髓外浸润样本。 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 多个AML患者样本 |
| 20275 | 2024-08-05 |
TISCH2: expanded datasets and new tools for single-cell transcriptome analyses of the tumor microenvironment
2023-01-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac959
PMID:36321662
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研究论文 | TISCH2是一个用于肿瘤微环境单细胞转录组分析的资源，包含来自人类和小鼠肿瘤的单细胞RNA测序数据 | 更新后的TISCH2包含190个肿瘤scRNA-seq数据集，涵盖600万个细胞，并增加了多个新功能以优化数据利用 | NA | 提供肿瘤微环境中基因表达的全面特征化 | 人类和小鼠肿瘤的单细胞RNA-seq数据 | 数字病理学 | 癌症 | scRNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 190个数据集，覆盖600万个细胞 |
| 20276 | 2024-08-05 |
AE-TPGG: a novel autoencoder-based approach for single-cell RNA-seq data imputation and dimensionality reduction
2023, Frontiers of computer science
IF:3.4Q1
DOI:10.1007/s11704-022-2011-y
PMID:36320820
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研究论文 | 本文介绍了一种基于自编码器的新方法AE-TPGG，用于单细胞RNA测序数据的插补和降维 | 提出了一种基于两部分广义伽马分布的自定义自编码器，能够处理单细胞RNA测序数据中的混合离散-连续随机变量 | 未提及 | 旨在改善单细胞RNA测序数据的分析，特别是针对掉落事件的处理 | 单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 自编码器 | 两部分广义伽马分布模型 | RNA测序数据 | 真实数据集 |
| 20277 | 2024-08-08 |
Pleural CD14+ monocytes/macrophages of healthy adolescents show a high expression of metallothionein family genes
2023-01, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202250019
PMID:36321537
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研究论文 | 本文通过腹腔镜技术从健康年轻成人中分离出胸膜单核细胞/巨噬细胞，并进行RNA测序分析，发现这些细胞中金属硫蛋白家族基因的高表达 | 首次在健康年轻成人的胸膜液中发现高表达金属硫蛋白的巨噬细胞亚群 | 需要进一步研究高表达金属硫蛋白的巨噬细胞亚群在肺防御、修复和稳态中的具体作用 | 研究健康年轻成人胸膜单核细胞/巨噬细胞中金属硫蛋白家族基因的表达 | 健康年轻成人的胸膜单核细胞/巨噬细胞 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | RNA | 健康年轻成人的胸膜单核细胞/巨噬细胞 |
| 20278 | 2024-08-08 |
Vaeda computationally annotates doublets in single-cell RNA sequencing data
2023-01-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac720
PMID:36342203
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Vaeda的新方法，用于计算注释单细胞RNA测序数据中的双细胞 | Vaeda结合了变分自编码器和正无标记学习，生成双细胞得分和二进制双细胞调用，表现优于其他基于Python的方法 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中双细胞/多细胞技术伪影的问题 | 单细胞RNA测序数据中的双细胞/多细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 变分自编码器 | RNA测序数据 | 16个基准数据集 |
| 20279 | 2024-08-08 |
TREM2 knockdown improves the therapeutic effect of PD-1 blockade in hepatocellular carcinoma
2022-12-25, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2022.10.079
PMID:36332476
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研究论文 | 研究通过使用自补体腺相关病毒（scAAV）在体内有效抑制肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）中的TREM2表达，发现TREM2敲低能抑制肝细胞癌的生长，并增强PD-1免疫检查点阻断疗法的效果 | 首次揭示了TREM2在肝细胞癌中肿瘤相关巨噬细胞的表达功能，并发现TREM2敲低能重塑TAMs为免疫刺激状态，增强PD-1阻断疗法的疗效 | NA | 探讨TREM2在肝细胞癌中的作用及其对PD-1阻断疗法效果的影响 | 肝细胞癌中的肿瘤相关巨噬细胞（TAMs） | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用TREM2敲除小鼠和野生型小鼠进行比较研究 |
| 20280 | 2024-08-08 |
Rethinking the visceral innervation --- Peek into the emerging field of molecular dissection of neural signals
2022-12-10, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2022.09.011
PMID:36344152
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研究论文 | 本文探讨了神经系统与内脏之间的交流，特别是内脏神经支配的细胞和分子特性，并介绍了单细胞RNA测序等新兴技术在神经科学中的应用 | 本文利用单细胞RNA测序等新兴技术，为解决内脏神经支配的未解之谜提供了强大的工具 | NA | 旨在基于最新的研究进展，深入理解神经系统在维持体内平衡中的整合作用 | 神经系统与内脏之间的交流及其细胞和分子特性 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |