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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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20221 | 2024-08-07 |
Dynamic interplay between IL-1 and WNT pathways in regulating dermal adipocyte lineage cells during skin development and wound regeneration
2023-06-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112647
PMID:37330908
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research paper | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了发育中或受伤的小鼠皮肤中的真皮成纤维细胞(dFBs),并探讨了IL-1和WNT信号通路在调控真皮脂肪细胞谱系细胞中的作用 | 首次详细描述了IL-1和WNT信号通路在真皮脂肪细胞谱系细胞的可塑性中的分子机制 | NA | 揭示真皮脂肪细胞谱系细胞的可塑性背后的分子机制,并为缺陷性伤口愈合和瘢痕形成定义潜在的治疗靶点 | 真皮成纤维细胞(dFBs)及其在皮肤发育和伤口再生中的分化和去分化过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 小鼠皮肤样本 | NA | NA | NA | NA |
20222 | 2024-08-04 |
Inhibition of a signaling modality within the gp130 receptor enhances tissue regeneration and mitigates osteoarthritis
2023-03-22, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abq2395
PMID:36947594
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研究论文 | 该研究探讨了gp130受体内一种信号方式的抑制如何促进组织再生并减轻骨关节炎 | 通过对gp130的Y814位点的遗传和药理干预,首次明确了其在组织再生中的关键作用 | 研究主要集中于小鼠和大鼠,可能无法完全应用于人体 | 旨在探讨如何增强组织再生能力和减轻骨关节炎的机制 | 研究对象为gp130受体及其在小鼠和大鼠模型中的作用 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 药理调节和基因编辑 | 小鼠模型和大鼠模型 | 单细胞测序数据 | 小鼠和大鼠的样本数量未具体说明 | NA | NA | NA | NA |
20223 | 2024-08-04 |
A cofunctional grouping-based approach for non-redundant feature gene selection in unannotated single-cell RNA-seq analysis
2023-03-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad042
PMID:36754847
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研究论文 | 本研究开发了一种新颖的计算方法GeneClust,用于选择scRNA-seq细胞聚类的特征基因 | 该方法通过基因表达谱对基因进行分组,并旨在最大化相关性、最小化冗余和保持互补性 | 未提及研究限制 | 研究目标是改善单细胞RNA测序分析中的细胞聚类性能 | 研究对象是在未注释的单细胞RNA测序数据集中的特征基因 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
20224 | 2024-08-07 |
Implanted Tissue-Engineered Vascular Graft Cell Isolation with Single-Cell RNA Sequencing Analysis
2023-02, Tissue engineering. Part C, Methods
DOI:10.1089/ten.TEC.2022.0189
PMID:36719780
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研究论文 | 本文介绍了一种简单且商业可用的方法,用于从组织工程血管移植物(TEVG)中分离细胞,以便进行单细胞RNA测序(scRNA-Seq)分析,并揭示了参与TEVG早期新生组织重塑阶段的细胞亚群。 | 首次描述了植入的组织工程血管移植物在单细胞基因表达水平上的细胞组成,并展示了磁性细胞分离技术在生成高质量细胞悬液用于scRNA-Seq分析中的有效性。 | 该方法主要针对使用可生物降解合成材料作为支架成分的其他可植入材料,其广泛适用性尚需进一步验证。 | 利用单细胞RNA测序技术深入了解组织工程血管移植物的细胞组成和基因表达异质性,特别是在新生组织形成和重塑过程中的应用。 | 组织工程血管移植物(TEVG)中的细胞分离和单细胞RNA测序分析。 | 生物技术 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中明确提及 | NA | NA | NA | NA |
20225 | 2024-08-04 |
Integration of Single-Cell RNA-Sequencing and Network Analysis to Investigate Mechanisms of Drug Resistance
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3163-8_7
PMID:37191792
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研究论文 | 本研究探讨了抗癌药物耐药机制的单细胞RNA测序与网络分析的结合 | 提出了一种通过单细胞RNA测序结合网络分析的新方法,以识别与药物耐药相关的通路 | 未在摘要中提供具体的实验数据或样本限制信息 | 探索抗癌药物耐药的机制以发展替代治疗方法 | 药物敏感和耐药变体的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | PANDA | 表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
20226 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing of neurofibromas reveals a tumor microenvironment favorable for neural regeneration and immune suppression in a neurofibromatosis type 1 porcine model
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1253659
PMID:37817770
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研究论文 | 本研究揭示了神经纤维瘤的细胞组成和信号传导,强调其肿瘤微环境对神经再生及免疫抑制的影响 | 首次在神经纤维瘤动物模型中观察到肿瘤相关的树突状细胞,并识别到新的成纤维细胞和免疫细胞群体 | 尚未探索成熟、非皮肤神经纤维瘤中的细胞信号网络 | 旨在探讨神经纤维瘤的细胞组成及其与正常组织的信号传导对比 | 研究对象为猪模型中的成熟神经纤维瘤及其相邻正常组织 | 数字病理学 | 神经纤维瘤病1型 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 组织样本 | 猪模型中的多个成熟神经纤维瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
20227 | 2024-08-07 |
Immunological Analysis of Cryptococcal Meningoencephalitis in a Murine Model
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3199-7_5
PMID:37145276
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研究论文 | 本文描述了一种诱导产生与人类隐球菌病免疫病理学多个方面相符的C. neoformans中枢神经系统感染小鼠模型的方法,并进行了详细的免疫学分析 | 结合基因敲除小鼠、抗体阻断、细胞转移以及单细胞RNA测序等高通量技术,该模型为揭示隐球菌中枢神经系统疾病的发病机制提供了新见解 | NA | 研究隐球菌性脑膜脑炎的免疫学机制,以开发更有效的治疗策略 | 隐球菌性脑膜脑炎的免疫病理学和小鼠模型的建立 | NA | 隐球菌性脑膜脑炎 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
20228 | 2024-08-07 |
Multi-omics segregate different transcriptomic impacts of anti-IL-17A blockade on type 17 T-cells and regulatory immune cells in psoriasis skin
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1250504
PMID:37781383
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研究论文 | 本研究探讨了系统性IL-17A阻断对银屑病皮肤中1型17 T细胞和调节性免疫细胞转录组的影响 | 首次通过多组学方法整合免疫细胞富集的scRNA-seq、微阵列和免疫组化数据,揭示了系统性IL-17A阻断在银屑病皮肤中对T17轴和调节性DC转录组的调控作用 | 研究样本量有限,且仅限于银屑病患者的皮肤样本,可能限制了结果的普遍性 | 寻找系统性IL-17A阻断促进银屑病皮肤免疫细胞亚群调节性转录组修饰的转化证据 | 银屑病患者的皮肤样本,包括治疗前后的6mm穿刺活检组织 | 数字病理学 | 银屑病 | scRNA-seq, 微阵列, 免疫组化 | NA | RNA | scRNA-seq样本18个,微阵列样本61个,免疫组化样本61个,正常对照皮肤scRNA-seq样本10个,微阵列样本8个 | NA | NA | NA | NA |
20229 | 2024-08-07 |
Elevated pentose phosphate pathway flux supports appendage regeneration
2022-10-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111552
PMID:36288713
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research paper | 本文研究了Xenopus tropicalis附肢再生过程中的代谢重编程,特别是戊糖磷酸途径(PPP)的作用。 | 首次详细描述了再生组织中葡萄糖流向PPP的增加,以及PPP在促进细胞增殖和再生中的关键作用。 | NA | 探究再生过程中支持快速生长的代谢途径。 | Xenopus tropicalis的附肢再生过程。 | NA | NA | 液相色谱-质谱联用(LC-MS)、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 代谢物、RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
20230 | 2024-08-07 |
'Youthful' phenotype of c-Kit+ cardiac fibroblasts
2022-Jul-16, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-022-04449-1
PMID:35841449
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研究论文 | 本文研究了c-Kit阳性心脏成纤维细胞的'年轻'表型,探讨了c-Kit在心脏成纤维细胞中的生物学意义及其与DDR2标记的关系。 | 首次评估了c-Kit在DDR2阳性心脏成纤维细胞中的生物学特性,并揭示了其与'年轻'细胞表型的关联。 | NA | 探讨c-Kit在心脏成纤维细胞中的生物学意义及其对心肌生物学、病理损伤反应和生理衰老的影响。 | c-Kit阳性心脏成纤维细胞及其与DDR2标记的关系。 | NA | NA | 流式细胞术、免疫组化、单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 涉及约8%的总心脏间质细胞 | NA | NA | NA | NA |
20231 | 2024-08-07 |
Age-Dependent Changes in the Plasma and Brain Pharmacokinetics of Amyloid-β Peptides and Insulin
2022, Journal of Alzheimer's disease : JAD
DOI:10.3233/JAD-215128
PMID:34924382
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研究论文 | 研究年龄对小鼠血浆和脑中Aβ肽和胰岛素药代动力学的影响 | 首次探讨了年龄对Aβ同工型和胰岛素在血浆药代动力学和脑内流入的差异性影响,以及这种影响如何潜在增加阿尔茨海默病风险 | NA | 识别年龄相关的小鼠血浆分布和血脑屏障(BBB)中Aβ肽和胰岛素的转运变化 | 野生型(WT)和阿尔茨海默病转基因(APP/PS1)小鼠 | NA | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-Seq数据 | 不同年龄的野生型(WT)和APP/PS1转基因小鼠 | NA | NA | NA | NA |
20232 | 2024-08-07 |
New insights into hematopoietic differentiation landscapes from single-cell RNA sequencing
2019-03-28, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood-2018-08-835355
PMID:30728144
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学在解析造血分化景观中的应用 | 探讨了单细胞分子 profiling 如何在高分辨率下绘制时间解析的分化轨迹,并挑战了我们对干细胞和祖细胞类型及其组织的先前认知 | 依赖于对转录组景观的推断,并基于某些假设 | 深入理解造血层次结构 | 造血分化过程及其相关细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞 RNA 测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
20233 | 2024-08-05 |
The unfolded protein response pathway as a possible link in the pathogenesis of COVID-19 and sepsis
2024-Jan-08, Archives of virology
IF:2.5Q3
DOI:10.1007/s00705-023-05948-7
PMID:38191819
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研究论文 | 本研究揭示了在单细胞水平上COVID-19和脓毒症的发病机制中未折叠蛋白反应(UPR)通路的重要性 | 提供了COVID-19与脓毒症之间的共同发病机制的新分子视角 | 未在研究中提及具体的生物标志物或临床数据的长时间追踪 | 探讨COVID-19与脓毒症之间的潜在联系及其共同的发病机制 | COVID-19和脓毒症病例的单细胞RNA-seq数据及转录组数据 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA-seq | 机器学习模型 | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
20234 | 2024-08-05 |
Single-Cell Suspension Preparation from Nile Tilapia Intestine for Single-Cell Sequencing
2023-02-10, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/64688
PMID:36847395
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研究论文 | 本研究展示了一种优化的鲤鱼肠道单细胞悬浮液制备协议 | 提出并优化了针对尼罗河罗非鱼肠道的单细胞悬浮液制备方法 | 该方法主要针对特定鱼类的肠道,其他组织或鱼种可能需要进一步优化 | 开发高质量单细胞悬浮液制备方案以支持单细胞层级研究 | 尼罗河罗非鱼的肠道细胞 | 数字病理学 | NA | 胶原酶/解聚酶 | NA | 细胞悬浮液 | NA | NA | NA | NA | NA |
20235 | 2024-08-07 |
Characterizing allele- and haplotype-specific copy numbers in single cells with CHISEL
2021-02, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-020-0661-6
PMID:32879467
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research paper | 本文介绍了一种名为CHISEL的方法,用于在单细胞和细胞亚群中推断等位基因和单体型特异性的拷贝数 | CHISEL方法通过聚合数百或数千个单个细胞的稀疏信号,能够推断出等位基因和单体型特异性的拷贝数,这在低序列覆盖率的情况下尤为重要 | NA | 研究目的是开发一种方法来推断单细胞中的等位基因和单体型特异性拷贝数,特别是在低序列覆盖率的情况下 | 研究对象是乳腺癌患者的单细胞序列数据 | digital pathology | breast cancer | single-cell sequencing | NA | genome | 约2,000个细胞,来自两名乳腺癌患者 | NA | NA | NA | NA |
20236 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the impact of mechanical loading on knee tibial cartilage in osteoarthritis
2024-Feb-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.111496
PMID:38224628
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了机械负荷对膝骨关节炎患者膝关节胫骨软骨中软骨细胞亚群的影响 | 首次识别出一种新的软骨细胞亚群HTC-C,并分析了其在不同机械负荷条件下的功能和细胞间相互作用 | 研究仅限于KOA患者的膝关节胫骨软骨,且样本量未具体说明 | 探究机械负荷对膝骨关节炎发展中软骨细胞亚群的影响及其分子机制 | 膝骨关节炎患者的膝关节胫骨软骨 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本量未提及 | NA | NA | NA | NA |
20237 | 2024-08-07 |
Elevated enteric putrescine suppresses differentiation of intestinal germinal center B cells
2024-Feb-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.111544
PMID:38266445
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研究论文 | 本研究探讨了外源性腐胺对肠道微环境中B细胞分化的影响 | 发现腐胺通过影响B细胞受体信号通路和脂肪酸氧化相关基因,抑制肠道B细胞分化,并揭示了腐胺在不同癌症中的免疫调节作用 | NA | 研究腐胺与B细胞成熟和代谢失调之间的因果关系及其机制 | 肠道微环境中的B细胞分化 | 免疫学 | NA | bulk RNA测序和单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
20238 | 2024-08-07 |
Autoreactive T cells target peripheral nerves in Guillain-Barré syndrome
2024-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06916-6
PMID:38233524
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研究论文 | 本文通过结合体外T细胞筛选、单细胞RNA测序和T细胞受体(TCR)测序,研究了Guillain-Barré综合征(GBS)中自身反应性T细胞的作用 | 首次鉴定出具有细胞毒性T辅助1(T1)样表型的自身反应性记忆CD4细胞和针对周围神经髓鞘抗原的稀有CD8 T细胞,并揭示了多克隆TCR谱系、短CDR3β长度、偏好HLA-DR限制和识别免疫优势表位 | NA | 揭示Guillain-Barré综合征中自身反应性T细胞的免疫机制 | Guillain-Barré综合征患者中的自身反应性T细胞 | NA | Guillain-Barré综合征 | 单细胞RNA测序、T细胞受体测序 | NA | RNA | 超过1,000个自身反应性单T细胞克隆 | NA | NA | NA | NA |
20239 | 2024-08-07 |
The Gut Microbiome Controls Liver Tumors via the Vagus Nerve
2024-Jan-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.23.576951
PMID:38328040
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研究论文 | 本文探讨了肠道微生物群通过迷走神经影响肝脏肿瘤的机制 | 首次揭示肠道微生物群通过迷走神经调节肝脏肿瘤的机制,并发现迷走神经通过乙酰胆碱影响CD8+ T细胞活性 | 研究主要集中在小鼠模型上,需要进一步在人体中验证 | 研究肠道微生物群与迷走神经在肝脏肿瘤发展中的相互作用 | 肝脏肿瘤、肠道微生物群、迷走神经、CD8+ T细胞 | NA | 肝脏肿瘤 | scRNA-seq | NA | 微生物群数据 | 涉及Rag1KO小鼠和无肿瘤小鼠 | NA | NA | NA | NA |
20240 | 2024-08-05 |
Molecular functional characterization of the setdb1 and its potential target gene sox5 illuminate the histone modification-mediated orchestration of gonadal development in Chinese tongue sole (Cynoglossus semilaevis)
2024-Apr-05, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2024.148199
PMID:38253299
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研究论文 | 该研究揭示了setdb1在中国舌鳎性别分化和生殖细胞发育中的作用 | 首次在中国舌鳎中详细描述了setdb1及其潜在靶基因sox5在性别发育调控中的分子机制 | 缺乏对setdb1在其他发育阶段的功能研究 | 探讨setdb1如何通过调控sox5的转录影响性别分化和生殖细胞发育 | 中国舌鳎的setdb1基因及其靶基因sox5 | 数字病理学 | NA | qRT-PCR, 单细胞RNA测序 | NA | 基因序列, RNA数据 | NA | NA | NA | NA | NA |