本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2026-03-21 |
Coronary artery disease risk gene PRDM16 regulates smooth muscle homeostasis
2026-Apr, Journal of molecular and cellular cardiology
IF:4.9Q2
DOI:10.1016/j.yjmcc.2026.02.002
PMID:41667033
|
研究论文 | 本研究通过分析动脉组织中的超级增强子调控转录因子,发现CAD风险基因PRDM16在血管平滑肌细胞中高表达,并作为VSMC稳态和新内膜形成的新调控因子 | 首次发现PRDM16在动脉组织中具有超级增强子富集,并揭示其在血管平滑肌细胞稳态和新内膜形成中的调控作用,特别是在男性小鼠中抑制VSMC增殖 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限,且性别特异性效应仅在雄性小鼠中观察到 | 识别血管平滑肌细胞稳态的新调控因子,以理解冠状动脉疾病等血管疾病的发病机制 | 人类动脉组织、小鼠主动脉组织、血管平滑肌细胞 | 分子生物学 | 冠状动脉疾病 | ChIP-seq, RNA-seq, scRNA-seq, qRT-PCR, Western blotting | NA | 基因组学数据、转录组学数据、蛋白质数据 | 多个动脉组织样本、小鼠模型(诱导型和组成型Prdm16 SMC特异性敲除小鼠) | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 182 | 2026-03-21 |
Multiomics Analysis Reveals Distinct Changes in the Cellular Composition of Vulvar Lichen Sclerosus
2026-Apr-01, Journal of lower genital tract disease
IF:2.4Q2
DOI:10.1097/LGT.0000000000000932
PMID:41711590
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和脂质代谢组学分析,揭示了外阴硬化性苔藓(VLS)组织中细胞组成和基因/通路的变化 | 首次结合单细胞RNA测序和脂质代谢组学技术,系统分析了VLS组织的细胞组成变化,并识别出特定的T细胞亚群和炎症通路异常 | 样本量相对较小(4个VLS样本用于scRNA-seq,15个用于脂质代谢分析),且为单中心研究,可能限制结果的普适性 | 探究VLS与正常皮肤在细胞组成、基因表达和代谢通路上的差异,以理解其发病机制 | 外阴硬化性苔藓(VLS)组织和正常外阴皮肤组织 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),脂质代谢组学,免疫荧光验证 | NA | 单细胞转录组数据,脂质代谢数据,图像数据 | 4个VLS样本和自身对照外阴皮肤用于scRNA-seq,15个VLS样本用于脂质代谢分析 | NA | 单细胞RNA-seq,脂质代谢组学 | NA | NA |
| 183 | 2026-03-21 |
Immunotherapy-driven remodeling of the tumor immune microenvironment: Spatiotemporal heterogeneity and multidimensional dynamics
2026-Apr, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2026.189544
PMID:41610921
|
综述 | 本文综述了免疫治疗过程中肿瘤免疫微环境的时空异质性和多维动态变化 | 系统整合了scRNA-seq和空间转录组学等前沿技术揭示的TME动态轨迹,并分析了ICB治疗下免疫细胞亚群的时空演化规律 | NA | 阐述免疫治疗过程中肿瘤微环境的动态轨迹和表型变化,为癌症免疫治疗提供见解 | 肿瘤免疫微环境 | 数字病理学 | 癌症 | scRNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 184 | 2026-03-21 |
Single-Cell Analysis of Fibroblast Subpopulations in Skin and Oral Mucosa
2026-Apr, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345251380210
PMID:41123093
|
综述 | 本文综述了皮肤和口腔黏膜中成纤维细胞亚群的最新研究进展,重点关注其转录组特征和功能 | 通过单细胞RNA测序技术,以前所未有的分辨率揭示了成纤维细胞在健康和疾病状态下的细胞多样性和组织特异性功能 | NA | 探讨成纤维细胞亚群在组织再生和免疫调节中的作用,为精准治疗提供理论基础 | 皮肤和口腔黏膜中的成纤维细胞亚群 | 数字病理学 | 慢性炎症性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 185 | 2026-03-21 |
Three-dimensional (3D) culture-primed placental mesenchymal stem cells decrease cellular heterogeneity, significantly enhancing osteogenesis via improving mitochondrial function
2026-Apr, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2026.103012
PMID:41859648
|
研究论文 | 本研究探讨了三维培养对胎盘间充质干细胞(PMSCs)和骨髓间充质干细胞(BMMSCs)线粒体功能及成骨分化的差异性影响 | 发现短期三维培养可显著增强PMSCs的线粒体功能和成骨分化能力,并通过单细胞RNA测序揭示了三维培养能促进PMSCs的细胞均质性,富集高线粒体和成骨表达细胞群 | 未明确说明研究的样本数量,且主要关注短期培养效果,长期效应和体内验证可能不足 | 探究三维培养条件如何差异性地调节PMSCs和BMMSCs的功能,以改善基于MSCs的骨再生疗法 | 胎盘间充质干细胞(PMSCs)和骨髓间充质干细胞(BMMSCs) | 干细胞生物学与组织工程 | 骨组织再生 | 单细胞RNA测序,转录组分析 | NA | RNA测序数据,功能验证数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 186 | 2026-03-21 |
Augmenting the Endogenous RBM3 Response Protects Against Burn-Induced Acute Kidney Injury by Enhancing Macrophage-Mediated Resolution of Inflammation
2026-Mar-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202503604RR
PMID:41849090
|
研究论文 | 本研究探讨了RBM3通过调控Slfn4表达,促进巨噬细胞向M2型极化并增强胞葬作用,从而减轻烧伤诱导的急性肾损伤的机制 | 首次揭示了RBM3-Slfn4轴在调控巨噬细胞功能以缓解烧伤相关急性肾损伤中的作用,并提出了该轴作为潜在治疗靶点 | 研究主要在动物模型中进行,其结论在人体中的适用性有待进一步验证;机制研究虽深入,但临床转化路径尚不明确 | 阐明RBM3调控巨噬细胞功能以缓解烧伤诱导的急性肾损伤的分子机制 | 大鼠烧伤模型、骨髓源性巨噬细胞 | NA | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序、qRT-PCR、Western blot、免疫组化、流式细胞术、免疫荧光、TUNEL染色 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、细胞表型数据、组织病理图像 | 大鼠模型(具体数量未在摘要中明确),在伤后24、48、72小时进行评估 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 187 | 2026-03-21 |
Jagged1 regulates extracellular matrix deposition and remodeling in triple-negative breast cancer
2026-Mar-20, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aea9562
PMID:41849611
|
研究论文 | 本文探讨了Jagged1在三阴性乳腺癌中如何通过调节细胞外基质沉积和重塑来促进肿瘤进展 | 揭示了Jagged1通过增强成纤维细胞活化和TGFβ活性来调控ECM重塑的新机制,并提出了Jagged1、ECM硬度和TGFβ之间的正反馈循环 | 研究主要基于体外和体内共培养模型,临床样本验证有限,且未深入探讨Jagged1调控的具体下游信号通路 | 研究Jagged1在三阴性乳腺癌中调控细胞外基质重塑的分子机制及其对肿瘤微环境的影响 | 三阴性乳腺癌细胞、成纤维细胞、肿瘤微环境中的细胞外基质 | 肿瘤生物学 | 乳腺癌 | 转录组学、蛋白质组学、单细胞RNA测序、成像技术 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 188 | 2026-03-21 |
LMO1 expression in neuroblastoma cells reprograms tumor-associated macrophages to promote metastasis
2026-Mar-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115144
PMID:41858882
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了神经母细胞瘤中LMO1基因表达通过重编程肿瘤相关巨噬细胞促进转移的机制 | 首次在转基因斑马鱼模型中证明LMO1与MYCN协同作用可改变肿瘤微环境中巨噬细胞的转录特征,并阐明其通过激活PI3K-Akt信号通路促进转移的具体机制 | 研究主要基于斑马鱼模型,在人类临床样本中的验证尚不充分;未深入探讨其他免疫细胞在转移过程中的作用 | 探究LMO1基因在神经母细胞瘤转移过程中对肿瘤微环境的重编程作用 | 转基因斑马鱼模型中的神经母细胞瘤肿瘤组织及肿瘤相关巨噬细胞 | 单细胞组学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 转基因斑马鱼的原发肿瘤组织(MYCN过表达组及MYCN+LMO1共表达组) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 189 | 2026-03-21 |
ZBED6-IGF2-PIK3C3 autophagy axis drives ccRCC progression: A multi-omics integration study
2026-Mar-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.114952
PMID:41858898
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据,揭示了ZBED6-IGF2-PIK3C3轴通过调控自噬驱动透明细胞肾细胞癌进展的机制,并构建了六基因预后特征 | 首次整合bulk、单细胞和空间转录组学数据,系统阐明了ZBED6通过抑制IGF2激活PIK3C3表达从而驱动促肿瘤自噬的调控轴,并开发了具有预后和治疗指导价值的六基因特征 | 未在更大规模的前瞻性临床队列中验证六基因特征的普适性,且对ZBED6调控自噬的具体下游效应器研究尚不充分 | 阐明透明细胞肾细胞癌中自噬的上游调控机制,并开发预后和治疗反应预测工具 | 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)的肿瘤组织、细胞系及患者临床数据 | 数字病理学 | 肾癌 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 转录组数据、空间表达数据 | 未在摘要中明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 190 | 2026-03-21 |
Cross-species scRNA-seq finds ideal mouse models for aortic dissection mechanisms
2026-Mar-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115147
PMID:41858900
|
研究论文 | 本研究通过跨物种单细胞RNA测序,系统评估了五种小鼠模型在模拟人类主动脉夹层疾病机制方面的保真度 | 首次采用跨物种单细胞RNA测序方法,系统比较人类主动脉夹层与多种小鼠模型的转录组相似性,为模型选择提供单细胞水平的比较框架 | 研究仅基于转录组数据,未涉及蛋白质组或功能验证,且样本数量可能有限 | 评估不同小鼠模型在模拟人类主动脉夹层疾病机制方面的保真度 | 人类主动脉夹层样本及五种小鼠模型(BAPN、Ang-II、Ang-II apoE、弹性蛋白酶和CaCl) | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类主动脉夹层样本及五种小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 191 | 2026-03-21 |
Harnessing arginase 2-specific CD8+ T cells to target immunosuppressive cutaneous T-cell lymphoma
2026-Mar-19, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljaf450
PMID:41208405
|
研究论文 | 本研究探讨了利用精氨酸酶2特异性CD8+ T细胞靶向表达高ARG2的皮肤T细胞淋巴瘤细胞,作为一种新型免疫治疗策略 | 首次证明恶性CTCL细胞可被ARG2特异性CD8+ T细胞靶向,揭示了ARG2作为CTCL免疫治疗新靶点的潜力 | 研究仅基于细胞系和公共单细胞RNA测序数据集,缺乏体内实验验证,且样本量有限 | 评估ARG2在CTCL中的表达及其作为免疫治疗靶点的可行性 | 皮肤T细胞淋巴瘤细胞系和患者病变组织中的恶性T细胞 | 免疫治疗 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | Western blotting, 单细胞RNA测序, CRISPR-Cas9基因敲低, ELISA斑点检测 | NA | 蛋白质表达数据, 基因表达数据 | 8个CTCL细胞系和公共单细胞RNA测序数据集中的患者病变样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 192 | 2026-03-21 |
Single-cell RNA sequencing and proteomics uncover glycolytic dysregulation linking skin and systemic inflammation in dermatomyositis
2026-Mar-19, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljaf486
PMID:41329255
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和蛋白质组学分析,揭示了皮肌炎中皮肤和全身炎症的糖酵解失调机制 | 首次构建了皮肌炎皮肤病变的高分辨率单细胞图谱,识别了炎症成纤维细胞作为主要信号细胞,并建立了IFN-I信号通路和CXCL10-糖酵解轴作为核心炎症机制 | 研究主要基于成人经典皮肌炎样本,可能不适用于所有亚型或儿童患者,且动物模型验证仍需进一步临床转化 | 定义皮肌炎的系统性和皮肤病变炎症景观,并探究其潜在的致病机制 | 皮肌炎患者的皮肤病变组织及实验性自身免疫性肌炎小鼠模型 | 数字病理学 | 皮肌炎 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 转录组学分析 | 实验性自身免疫性肌炎小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组数据, 转录组数据 | 成人经典皮肌炎患者的皮肤病变样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 193 | 2026-03-20 |
Single-cell RNA sequencing: a tool for precision dermatology
2026-Mar-19, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljag013
PMID:41518002
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 194 | 2026-03-21 |
What is spatial transcriptomics?
2026-Mar-19, Archives of disease in childhood. Education and practice edition
DOI:10.1136/archdischild-2025-328924
PMID:40866122
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 195 | 2026-03-21 |
Single-Cell CRISPR: An Efficient Strategy for Decoding Plant Cis-Regulatory Complexity
2026-Mar-19, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70647
PMID:41854240
|
综述 | 本文综述了单细胞CRISPR(scCRISPR)系统在植物顺式调控元件功能分析中的最新进展,强调其在单细胞遗传筛选中的革命性潜力 | 整合单细胞技术与全基因组遗传筛选,特别是scCRISPR系统,为解码植物顺式调控复杂性提供了高效策略,能识别关键调控元件并揭示基因表达控制机制 | 在植物研究中应用这些方法仍面临挑战,如技术优化和数据分析复杂性 | 解码植物顺式调控元件的复杂性,以理解复杂调控通路并改进宏观表型修饰能力 | 植物中的转录顺式调控元件(CREs) | 自然语言处理 | NA | 单细胞转录组学,全基因组遗传筛选,scCRISPR系统 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 196 | 2026-03-21 |
Hypoxia-related and immune phenotype-related fusion model for non-invasive prognostication of hepatocellular carcinoma treated by TACE: a multicentre study
2026-Mar-19, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2025-337938
PMID:41856522
|
研究论文 | 本研究开发并验证了一个多模态预后模型,用于非侵入性预测接受TACE治疗的肝细胞癌患者的生存结果 | 结合了深度学习、传统影像组学、临床变量以及多组学分析(包括单细胞RNA测序和TCGA数据),构建了一个具有生物学可解释性的融合模型,能够实现更精细的风险分层 | 研究为回顾性多中心设计,可能存在选择偏倚;模型的外部验证和临床应用仍需进一步前瞻性研究确认 | 开发并验证一个用于精确评估接受TACE治疗的肝细胞癌患者生存结果的多模态预后模型 | 肝细胞癌患者 | 计算机视觉 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,对比增强CT成像,深度学习,影像组学 | 早期融合模型,晚期融合模型,临床-影像学模型 | 图像,临床数据,转录组数据 | 共1448名患者,包括TACE队列(1349名)、随机试验生物标志物子集(41名)、单细胞RNA测序队列和TCGA肝细胞癌队列(50名) | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 197 | 2026-03-21 |
Fel d 1-Expressing Plant-Derived Bioparticle: A Novel Treatment for Cat Allergy
2026-Mar-19, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.70280
PMID:41856757
|
研究论文 | 本文研究了一种表达猫过敏原Fel d 1的植物源性生物颗粒(Fel d 1 eBP)作为猫过敏新型疗法的过敏性和免疫原性特征 | 开发了基于植物源性生物颗粒的Fel d 1过敏原表达系统,相比传统过敏原免疫疗法具有低过敏性和免疫调节特性 | 研究样本量较小(12名猫过敏患者和12名非过敏对照),且为开放标签的0期研究,需要更大规模的临床试验验证 | 评估Fel d 1 eBP作为猫过敏新型治疗候选物的过敏性和免疫原性 | 猫过敏患者和非过敏对照个体的T细胞、B细胞、嗜碱性粒细胞及皮肤反应 | 免疫学 | 过敏性疾病 | 流式细胞术、单细胞RNA测序、嗜碱性粒细胞激活试验、皮肤点刺试验 | NA | 单细胞RNA测序数据、流式细胞术数据、临床观察数据 | 12名猫过敏患者和12名非过敏对照用于体外实验,20名猫过敏个体用于体内皮肤点刺试验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 198 | 2026-03-21 |
Seamless vessel-microenvironment bioprinting reveals contact-dependent vascular communications
2026-Mar-19, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2026.02.003
PMID:41856805
|
研究论文 | 本研究开发了一种无缝血管-微环境生物打印系统,用于模拟无界面干扰的血管-基质相互作用 | 采用纳米级PEG化多面体低聚倍半硅氧烷修饰的胶原蛋白构建了同质生物墨水-支撑浴系统,实现了无材料边界的血管-微环境建模 | 未明确说明系统的长期稳定性或体内验证情况 | 研究血管-微环境相互作用在组织发育和疾病中的作用机制 | 血管、基质细胞、肿瘤细胞和癌症相关成纤维细胞 | 组织工程与生物打印 | 肿瘤血管生成 | 单细胞RNA测序、细胞-细胞通讯分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 199 | 2026-03-21 |
Histone lactylation-driven feedback loop modulates pyrimidine metabolism to promote oral carcinogenesis
2026-Mar-19, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08580-w
PMID:41857010
|
研究论文 | 本研究揭示了组蛋白乳酸化,特别是H3K18la,在口腔鳞状细胞癌(OSCC)发生中的关键作用,并阐明了一个由糖酵解/H3K18la/TK1/β-catenin组成的正反馈环路 | 首次揭示了组蛋白乳酸化(特别是H3K18la)通过激活TK1转录和嘧啶代谢,驱动口腔癌发生的分子机制,并发现了一个新的正反馈环路 | 研究主要基于体外和动物模型,临床转化潜力需进一步验证;对H3K18la在其他癌症类型中的普适性未探讨 | 探究组蛋白乳酸化在口腔癌发生中的作用及其分子机制 | 口腔白斑(OLK)和口腔鳞状细胞癌(OSCC)组织及细胞 | 表观遗传学 | 口腔鳞状细胞癌 | 免疫组化、CUT&Tag、scRNA-seq、ChIP-qPCR | NA | 组织样本、细胞系、测序数据 | 未明确指定具体样本数量,但涉及OLK和OSCC组织、细胞系及动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 200 | 2026-03-21 |
Integrated machine learning and multi-omics analysis identifies ALOX5 as a potential therapeutic target for tubulointerstitial inflammation in diabetic kidney disease
2026-Mar-19, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-44445-0
PMID:41857149
|
研究论文 | 本研究通过整合机器学习与多组学分析,识别出ALOX5作为糖尿病肾病肾小管间质炎症的潜在治疗靶点 | 首次结合多数据集、WGCNA、机器学习及单细胞测序伪时序分析,系统鉴定ALOX5在DKD免疫微环境中的关键作用,并筛选出天然小分子抑制剂和厚朴酚 | 研究主要基于生物信息学分析和体外验证,缺乏体内实验验证和临床前模型的数据支持 | 识别糖尿病肾病肾小管组织中的关键炎症生物标志物并阐明其免疫调节机制 | 糖尿病肾病患者的肾小管组织及其中表达的基因与免疫细胞 | 机器学习 | 糖尿病肾病 | 转录组测序, 单细胞测序, 多重免疫组化 | LASSO, Random Forest | 基因表达数据, 单细胞数据, 图像数据 | 多个GEO转录组数据集中的样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |