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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1 2026-05-03
Plasma Proteomics Identifies Thousand-and-One-Amino Acid Kinase 3 as a Potential Biomarker of Rheumatoid Arthritis Activity and a Novel Therapeutic Target
2026-May, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
research paper 通过血浆蛋白质组学鉴定TAOK3作为类风湿关节炎活动性的潜在生物标志物和新治疗靶点 首次发现TAOK3与活动性类风湿关节炎的骨破坏相关,并验证其作为诊断生物标志物和治疗靶点的潜力 研究样本量有限,功能研究主要在体外和动物模型中进行,需进一步临床验证 识别与活动性类风湿关节炎骨破坏相关的新型生物标志物和治疗靶点 类风湿关节炎患者血浆样本、成纤维样滑膜细胞、胶原诱导关节炎小鼠模型 machine learning 类风湿关节炎 蛋白质组学、单细胞RNA测序、酶联免疫吸附试验、多重免疫组化 NA 蛋白质组学数据、单细胞RNA测序数据 160例RA患者和40例健康对照,两个独立验证队列(N1=50, N2=10) NA NA NA NA
2 2026-05-03
Activation of the Cerebrospinal Fluid-Contacting Nucleus Mitigates Systemic Inflammation Induced by Sepsis
2026-May-01, Shock (Augusta, Ga.)
研究论文 本研究揭示脑脊液接触核在脓毒症中通过调节全身炎症反应发挥保护作用 首次发现脑脊液接触核在脓毒症免疫调节中的关键作用,并通过单细胞RNA测序鉴定其调控系统性炎症的关键组分 未明确脑脊液接触核调控免疫下游的具体分子通路,且动物模型可能不完全反映人类脓毒症复杂性 探究脑脊液接触核在脓毒症中调控全身炎症的机制 脓毒症小鼠模型的脑脊液接触核 神经免疫学 脓毒症 单细胞RNA测序, 免疫荧光, 化学遗传学 NA 单细胞转录组数据, 免疫荧光图像, 细胞因子水平 脓毒症小鼠模型(具体数量未明确) NA 单细胞RNA测序 NA NA
3 2026-05-03
A CD57+CD8+ T cell subset links T cell cytotoxicity to fibrotic lung disease in systemic sclerosis
2026-May-01, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 鉴定出一种CD57+CD8+ T细胞亚群,该亚群通过细胞毒性作用与系统性硬化症相关纤维化肺病相关联 首次发现并表征了CD57+效应记忆T细胞在系统性硬化症相关间质性肺病中显著扩增,并明确其与CD155/CD226共刺激通路介导的细胞毒性功能之间的关联 未提及 探究系统性硬化症相关间质性肺病的免疫病理机制,特别是T细胞在肺损伤中的作用 系统性硬化症伴或不伴间质性肺病患者外周血T细胞,以及独立患者肺组织样本 数字病理学 间质性肺病,系统性硬化症 单细胞RNA测序,免疫染色 NA 基因表达数据,组织图像 包括系统性硬化症伴间质性肺病患者、系统性硬化症不伴间质性肺病患者及对照个体的血液样本,以及独立患者的肺活检或外植体样本;同时分析多个间质性肺病队列的公开单细胞RNA测序数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
4 2026-05-03
Cell-specific gene expression plasticity in response to hypoxia promotes high-altitude adaptive evolution
2026-May, Science China. Life sciences
研究论文 利用绵羊平原到高原易位实验,结合单细胞RNA测序和单核RNA测序,揭示了低氧胁迫下细胞特异性基因表达可塑性及其对高海拔适应性进化的促进作用 首次在细胞水平上揭示了基因表达可塑性与遗传适应之间的关系,发现免疫细胞中逆转可塑性促进遗传适应,并解析了AP-1→HIF-BHLHE41调控网络和细胞可塑性(如脑中小胶质细胞激活和心脏中CEC-to-EndMT转变)的机制 未明确说明局限性,但研究仅基于绵羊模型,可能缺乏人类及其他物种的验证 探索低氧响应中基因表达可塑性与遗传适应之间的分子和细胞机制 绵羊的大脑、心脏和肺组织细胞和细胞核 机器学习 高原疾病 单细胞RNA测序、单核RNA测序 NA 基因表达数据 27只绵羊的27个scRNA-seq和54个snRNA-seq数据集,包含236,805个细胞和906,315个细胞核 10x Genomics 单细胞RNA测序、单核RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序和单核RNA测序
5 2026-05-03
Intra- and inter-organ communications in aging and cancer: Local and global spatial perspectives
2026-May, Seminars in cell & developmental biology IF:6.2Q1
综述 探讨衰老和癌症中细胞间通信的局部和全局空间视角,重点分析配体-受体相互作用和器官内及器官间通信推断工具 首次系统整合衰老和癌症转移过程中配体-受体相互作用,并综述器官内和器官间通信推断工具,揭示局部和全局通信机制对疾病进程的协同影响 未提供具体实验验证或定量分析,仅基于现有文献总结,缺乏对新通信轴线的实证数据支撑 阐明衰老和癌症进展中细胞间通信的动态变化及其在组织微环境重塑中的作用,探索潜在治疗靶点 衰老和癌症转移过程中的细胞间相互作用,包括器官内和器官间通信 单细胞与空间转录组学 衰老相关疾病、癌症 NA NA 单细胞转录组数据、空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
6 2026-05-03
Unannotated noncoding transcripts as a source of intratumor heterogeneity in malignant cell states
2026-May, Science China. Life sciences
研究论文 通过对12种癌症类型3'端单细胞RNA-seq数据进行分析,发现未注释的非编码转录本作为恶性细胞状态瘤内异质性的来源,并通过功能实验验证其在肺癌细胞增殖和迁移中的作用 首次揭示未注释转录本(UPTs)通过表观遗传激活驱动转录组瘤内异质性,并实验验证其致癌功能 研究主要基于3'端标签的单细胞RNA-seq数据,可能遗漏部分5'端信息;未对其他癌症类型中的UPTs进行功能验证 探究未注释非编码转录本在恶性细胞状态瘤内异质性中的分子机制 12种常见癌症类型的恶性细胞及肺癌细胞系 机器学习 多种癌症 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 多组学分析 NA 基因表达数据, 表观遗传数据 12种癌症类型的3'端单细胞RNA-seq数据集及多区域采样bulk RNA-seq数据 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq 3'端标签平台 3'端标签的scRNA-seq平台
7 2026-05-03
SPT6 maintains epidermal homeostasis by inhibiting an NF-κB-positive feedback loop to prevent excessive inflammation
2026-May, Cellular & molecular immunology IF:21.8Q1
研究论文 研究SPT6通过抑制RELA基因增强子来阻断NF-κB正反馈环路,维持表皮免疫稳态和防止过度炎症的机制 首次发现SPT6作为转录延伸因子,通过结合RELA基因增强子抑制NF-κB正反馈环路,在表皮干细胞和祖细胞中主动抑制促炎信号通路以维持免疫静息状态 未提及具体局限性,但研究主要基于小鼠模型,需在人类皮肤疾病中进一步验证 探讨SPT6在表皮免疫稳态维持中的作用及其分子机制 表皮干细胞和祖细胞(EPSCs)、角质形成细胞 分子生物学 银屑病 条件性基因敲除、单细胞RNA测序 条件性敲除小鼠模型(K14-CreERT; Supt6) 单细胞转录组数据 条件性敲除小鼠(K14-CreERT; Supt6) NA 单细胞RNA测序 NA NA
8 2026-05-03
Evidence of off-target probe binding affecting 10x Genomics Xenium gene panels compromise accuracy of spatial transcriptomic profiling
2026-May-01, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本文调查了10x Genomics Xenium探针结合的特异性问题,发现脱靶结合会影响空间转录组谱分析的准确性,并开发了OPT软件工具来识别潜在的脱靶结合 首次系统性地评估10x Genomics Xenium技术中探针脱靶结合的影响,并开发了OPT工具来预测和验证脱靶结合事件 仅对Xenium人乳腺基因面板进行了分析;验证依赖于单一乳腺癌数据集;OPT可能无法检测所有类型的脱靶结合 评估探针基原位空间转录组技术中脱靶结合对基因表达谱准确性的影响,并提高空间转录组数据的生物学可解释性 10x Genomics Xenium人乳腺基因面板中的313个基因,以及相应乳腺癌肿瘤块的 Visium CytAssist 和 3' 单细胞RNA-seq数据 机器学习和数字病理学 乳腺癌 空间转录组学和单细胞RNA测序 NA 空间转录组数据、单细胞RNA-seq数据和探针序列数据 一个Xenium乳腺癌数据集(单个肿瘤块),以及Visium CytAssist和3' 单细胞RNA-seq数据来自同一肿瘤块 10x Genomics 空间转录组学、单细胞RNA-seq Xenium、Visium CytAssist 10x Genomics Xenium原位基因表达分析平台、Visium CytAssist空间转录组学平台
9 2026-05-03
Plasma ceramide mediates the association of peripheral T cells with Alzheimer's disease
2026-May, Journal of advanced research IF:11.4Q1
research paper 该研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术鉴定了阿尔茨海默病(AD)进展中外周T细胞亚群的动态变化,并发现血浆神经酰胺介导了CD4效应记忆(EM)T细胞与AD风险之间的关联 首次整合单细胞RNA测序、流式细胞术和孟德尔随机化方法,揭示CD4 EM和CD8 CM T细胞通过神经酰胺代谢途径影响AD风险,并提出免疫代谢通路的新机制 研究主要基于小鼠模型和人群遗传数据,可能无法完全反映人类复杂疾病中的免疫-代谢相互作用,且神经酰胺介导效应仅占11.20%,其他潜在介质未充分探索 确定外周T细胞亚群对AD风险的因果贡献,并探究血液代谢物是否介导这种关联 阿尔茨海默病(AD)患者和APP/PS1小鼠模型中的T细胞亚群及血液代谢物 machine learning 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序,流式细胞术,孟德尔随机化 NA 单细胞基因表达数据,流式细胞术数据,遗传变异数据 NA NA single-cell RNA-seq NA NA
10 2026-05-03
Lung-Targeted HGF mRNA Restores Alveolar Structure in Experimental Emphysema
2026-May-01, The European respiratory journal
研究论文 通过临床阶段SM92脂质纳米颗粒递送HGF mRNA,在实验性肺气肿模型中恢复肺泡结构 首次利用临床阶段SM92脂质纳米颗粒平台实现HGF mRNA的靶向肺部递送,并证明通过雾化和气管内滴注两种方式均能有效治疗肺气肿,通过激活肺泡II型细胞内源性修复通路 研究仅限于小鼠模型和患者来源肺类器官,临床转化性需进一步验证 评估HGF mRNA疗法在肺气肿治疗中的可行性和疗效 人类数据集、肺组织样本、弹性蛋白酶诱导和香烟烟雾诱导的小鼠模型、患者来源肺类器官 数字病理学 慢性阻塞性肺疾病,肺气肿 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据、图像、文本 人类数据集和肺组织样本,以及弹性蛋白酶诱导和香烟烟雾诱导的小鼠模型,具体数量未明确 NA 单细胞RNA测序 NA NA
11 2026-05-03
Using CRISPR barcoding as a molecular clock to capture dynamic processes at single-cell resolution
2026-May-01, Genome research IF:6.2Q1
研究论文 提出scDynaBar方法,结合CRISPR-Cas9动态条形码与单细胞测序,以分子时钟形式捕获单细胞分辨率的动态过程 首次利用CRISPR条形码的累积突变作为时间记录,将遗传条形码与转录组同步测序,实现单细胞水平的时间动态追踪 未提及具体局限性 开发一种新的时间记录方法,用于研究单细胞动态过程 小鼠胚胎干细胞及小鼠胃泌素模型中的多能态到2C样态的转变 单细胞基因组学 NA CRISPR-Cas9动态条形码、单细胞测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠胚胎干细胞和小鼠胃泌素模型中的多种细胞类型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
12 2026-05-03
Unravelling bacterial complexity at high resolution with single-cell transcriptomics
2026-May-01, Nature microbiology IF:20.5Q1
综述 综述了细菌单细胞RNA测序的最新进展及其在理解细菌异质性方面的应用 系统总结了细菌单细胞转录组学的方法学进展和生物学见解,并展望了该领域对理解细菌生理、感染生物学和微生物群落的革命性影响 讨论了前进过程中的技术和计算挑战以及标准化需求 概述细菌单细胞RNA测序研究现状并展望未来方向 细菌 自然语言处理 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
13 2026-05-03
The role of CD34-high endothelial cells and FGF2 in vasa vasorum angiogenesis of Takayasu arteritis
2026-May-01, Clinical rheumatology IF:2.9Q2
研究论文 研究CD34高表达内皮细胞和FGF2信号在Takayasu动脉炎血管外膜新生血管中的作用 首次在TAK患者主动脉壁中鉴定出CD34hi_ECs的显著扩增,并揭示FGF2-FGFR1轴可能介导TAK中的病理性血管新生 样本量较小,仅纳入3名TAK患者和3名对照进行scRNA-seq分析 探讨CD34高表达内皮细胞和FGF2信号在Takayasu动脉炎病理性血管外膜新生血管及炎症进展中的作用 Takayasu动脉炎患者和健康对照者的主动脉组织和血清 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序,免疫组织化学,细胞因子微球阵列 NA 基因表达数据,图像数据 3名TAK患者和3名对照用于scRNA-seq和免疫组化,48名TAK患者和24名健康对照用于血清细胞因子测量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
14 2026-05-03
CD109 is associated with an immunosuppressive microenvironment and M2 macrophage polarization: pan-cancer analysis and functional validation
2026-May-01, BMC cancer IF:3.4Q2
研究论文 通过泛癌分析及功能验证揭示了CD109与免疫抑制微环境和M2型巨噬细胞极化的关联 首次在泛癌水平系统评估CD109的表达、预后相关性及免疫调节作用,并结合单细胞RNA测序和体外功能验证阐明其与M2型巨噬细胞极化和免疫抑制微环境的关系 巨噬细胞相关功能效应仅在肺癌模型中验证,仍需在其他肿瘤类型中进一步研究 探讨CD109在多种癌症中的预后价值及其免疫调节作用 CD109基因及其在肿瘤免疫微环境中的角色 生物信息学 泛癌,非小细胞肺癌 RNA-seq,单细胞RNA测序,siRNA敲低,共培养实验,流式细胞术,qPCR,ELISA,迁移实验 NA 基因表达数据,单细胞转录组数据 GTEx和TCGA数据库中的多癌种样本,以及非小细胞肺癌队列的单细胞RNA测序样本 NA bulk RNA-seq,单细胞RNA测序 NA NA
15 2026-05-03
Unraveling the spatial landscape of dystrophinopathies: a transcriptomic approach to Becker and Duchenne muscular dystrophies
2026-May-01, The Journal of pathology IF:5.6Q1
研究论文 利用空间转录组学技术剖析贝克尔和杜氏肌营养不良症的空间景观 首次使用Visium空间转录组学结合单核RNA测序数据解卷积策略,研究肌营养不良症患者骨骼肌活检中的细胞类型比例、空间定位及细胞间通讯,并识别脂肪斑块及活跃病理区域的富集基因 未明确说明 探究贝克尔和杜氏肌营养不良症的组织病理学变化及其分子机制 肌营养不良症患者(8例)和健康对照者(4例)的骨骼肌活检样本 计算病理学 肌营养不良症 空间转录组学 NA 基因表达数据 8例患者和4例健康对照 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium Visium空间转录组学
16 2026-05-03
Niacin promotes motor function recovery after spinal cord injury via Hcar2-dependent microglia immunometabolic regulation
2026-May, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 该论文研究了烟酸通过Hcar2依赖的小胶质细胞免疫代谢调控促进脊髓损伤后运动功能恢复的机制 首次发现Hcar2作为脊髓损伤后小胶质细胞中保守的损伤诱导代谢检查点,其激活可通过免疫代谢重编程驱动抗炎极化,烟酸靶向Hcar2能促进运动功能恢复 未提及具体局限性,但可能包括研究仅基于小鼠和猕猴模型,需进一步在人体验证;潜在副作用或剂量优化问题未讨论 探究Hcar2在脊髓损伤中的作用及其作为治疗靶点缓解运动缺陷的潜力 小鼠和猕猴的脊髓损伤模型,以及LPS诱导的BV2小胶质细胞模型 神经科学 脊髓损伤 单细胞RNA测序,批量RNA测序,免疫荧光染色,Western blotting,实时聚合酶链反应 NA 单细胞RNA测序数据,基因表达数据 公开可用的单细胞RNA测序数据集(小鼠和猕猴),脊髓损伤小鼠模型(具体数量未提及),体外BV2细胞模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
17 2026-05-03
Excitatory neurons and astrocytes-specific dysregulation and aberrant interactions are vulnerable to FCDI as suggested by single-cell spatial transcriptomics
2026-May, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 利用单细胞空间转录组学揭示I型局灶性皮质发育不良中兴奋性神经元和星形胶质细胞的特异性失调及异常相互作用 首次构建FCDI患者的单细胞空间转录组图谱,并鉴定出CBLN2highEx-1亚群在神经元过度兴奋和皮质发育中的潜在作用 样本量较小(仅3例FCDI患者和3例对照),且未进行功能验证实验 阐明I型局灶性皮质发育不良的分子机制,特别是兴奋性神经元和星形胶质细胞的失调及细胞间通讯异常 3例FCDI患者的致痫性皮质组织和3例相对正常的新皮质组织 数字病理学 神经发育障碍(I型局灶性皮质发育不良) 单细胞RNA测序,空间转录组学,多组学整合 转录因子-枢纽基因调控网络 单细胞转录组数据,空间转录组数据 3例FCDI患者和3例对照的新皮质组织 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
18 2026-05-03
Single-Cell Dissection of Malignant Cell Heterogeneity Reveals Functional Programs and Clinically Relevant Subtypes in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2026-May, IUBMB life IF:3.7Q2
研究论文 综合单细胞RNA测序数据对头颈部鳞状细胞癌恶性细胞异质性进行解析,鉴定功能程序及临床相关亚型 首次整合58例患者的单细胞转录组数据,系统描绘恶性细胞异质性图谱,并开发出25基因恶性细胞评分(MCScore)用于预后和免疫治疗响应预测 主要依赖公开数据集进行分析,缺乏独立外部队列验证 阐明头颈部鳞状细胞癌恶性细胞异质性的功能程序及临床相关亚型 头颈部鳞状细胞癌的恶性细胞亚群 数字病理学 头颈部鳞状细胞癌 单细胞RNA测序、批量RNA测序 hdWGCNA、NMF 单细胞转录组数据、批量转录组数据 58例头颈部鳞状细胞癌患者的181,003个细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
19 2026-05-03
Deep-learning-based de novo discovery and design of therapeutics that reverse disease-associated transcriptional phenotypes
2026-Apr-30, Cell IF:45.5Q1
研究论文 提出基于深度学习的药物发现平台GPS,通过逆转疾病相关的转录表型实现从头药物发现和优化 首次将转录组特征直接用于从头药物发现而非仅药物重定位,并开发仅从化学结构预测转录扰动特征的方法 未充分讨论模型在复杂疾病中的泛化性及化合物合成可行性 开发基于深度学习的药物发现平台,通过逆转疾病相关转录特征实现新药发现 肝细胞癌和特发性肺纤维化疾病模型 机器学习 肝细胞癌, 特发性肺纤维化 RNA-seq 深度学习模型(具体架构未明确)、树搜索优化方法 转录组数据、化学结构数据 多个疾病案例及两项验证(肝细胞癌:两个化合物系列;特发性肺纤维化:一个重定位候选和一种新抗纤维化化合物) NA NA NA NA
20 2026-05-03
Comprehensive analysis of ATF3 as a diagnostic and prognostic biomarker from pan-cancer to clear cell renal cell carcinoma
2026-Apr-30, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 全面分析ATF3从泛癌到肾透明细胞癌作为诊断和预后生物标志物的作用 首次系统评估ATF3在多种癌症类型中的表达、诊断效能、预后意义及其与肿瘤免疫微环境的关联,并利用单细胞RNA测序阐明其在肾透明细胞癌细胞水平的具体作用 主要依赖公共数据库分析,缺乏大规模临床样本验证;ATF3在泛癌中的功能机制尚未深入阐明 评估ATF3在泛癌和肾透明细胞癌中的诊断和预后价值,并探索其在肿瘤免疫微环境中的作用 ATF3基因在多种癌症中的表达及功能 机器学习 肾透明细胞癌 实时荧光定量PCR, Western blot, 免疫荧光, 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 公共数据库中多种癌症的样本数据及肾透明细胞癌细胞系 NA single-cell RNA-seq NA NA
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