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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-04-15 |
Bisphenol analogs affected hepatic development and disrupted lipid homeostasis in zebrafish larvae
2026-May-15, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2026.127929
PMID:41812818
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研究论文 | 本研究通过暴露斑马鱼胚胎于BPA及其替代物BPAF和BPG,揭示了这些双酚类似物对肝脏发育和脂质稳态的干扰机制 | 首次系统比较了BPA、BPAF和BPG对斑马鱼幼虫肝脏发育和脂质代谢的影响,并利用10x单细胞RNA-Seq技术揭示了肝细胞中脂质积累和代谢通路的具体变化 | 研究仅基于斑马鱼模型,结果向人类外推需谨慎;暴露浓度设置可能未完全覆盖环境相关水平 | 探究双酚类似物对早期生命发育阶段肝脏发育和脂质稳态的影响机制 | 斑马鱼胚胎和幼虫 | 毒理学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA-Seq, 脂质组学分析, 油红O染色 | NA | 基因表达数据, 脂质组数据, 图像数据 | 斑马鱼胚胎暴露于不同浓度双酚类似物(0.5, 50, 500 μg/L BPA/BPAF; 0.5, 50, 250 μg/L BPG) | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x单细胞RNA-Seq分析系统 |
| 2 | 2026-04-15 |
Longitudinal spatial transcriptomics reveals the molecular dynamics of pulmonary artery remodeling in pulmonary arterial hypertension
2026-May, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
DOI:10.1016/j.healun.2026.01.017
PMID:41577266
|
研究论文 | 本研究通过纵向空间转录组学分析,揭示了肺动脉高压患者肺动脉重塑的分子动态变化 | 首次在肺动脉高压患者中进行纵向空间转录组学分析,比较了13年间两次肺移植样本,揭示了小和大肺动脉在严重重塑病变中的转录组差异,并识别出独特的基因特征 | 研究基于单例患者样本,样本量较小,可能限制结果的普遍性 | 探究肺动脉高压中肺动脉重塑的病理生理机制和分子动态变化 | 肺动脉高压患者的肺组织样本,特别是小和大肺动脉区域 | 空间转录组学 | 肺动脉高压 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 1例患者,在13年间两次肺移植的样本,包括严重和中等重塑两个时间点 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3 | 2026-04-15 |
Novel insights into the mechanism of formaldehyde-induced lung cancer: a network toxicology and molecular docking approach
2026-May, Toxicology mechanisms and methods
IF:2.8Q2
DOI:10.1080/15376516.2026.2621747
PMID:41641566
|
研究论文 | 本研究通过网络毒理学和分子对接技术,探讨了甲醛对肺癌的复杂影响,揭示了其分子机制 | 结合网络毒理学、分子对接和单细胞RNA测序数据分析,系统识别甲醛影响肺癌的关键靶点和通路,揭示了传统毒理学方法难以发现的复杂关系 | 研究主要基于数据库和计算模拟,缺乏实验验证,且样本来源和单细胞数据的具体细节未明确说明 | 探索甲醛诱导肺癌的分子机制,识别关键靶点和通路 | 甲醛与肺癌相关的靶点基因和蛋白质 | 生物信息学 | 肺癌 | 网络毒理学、分子对接、单细胞RNA测序数据分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2026-02-14 |
First longitudinal spatial transcriptomics analysis in pulmonary arterial hypertension
2026-May, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
DOI:10.1016/j.healun.2026.02.003
PMID:41679567
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5 | 2026-04-15 |
Lumican-mediated fibroblast differentiation in skin fibrosis
2026-May, Matrix biology : journal of the International Society for Matrix Biology
IF:4.5Q2
DOI:10.1016/j.matbio.2026.03.006
PMID:41912056
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学,探讨了皮肤纤维化中Lumican介导的成纤维细胞分化机制 | 结合单细胞RNA测序与空间转录组学,系统比较了胎儿皮肤、成人皮肤和瘢痕疙瘩中成纤维细胞的基因表达谱和分化轨迹,并首次验证了Lumican作为成纤维细胞分化的关键调控因子 | 研究主要基于体外模型和动物模型,临床转化仍需进一步验证 | 探究从无瘢痕愈合到病理性纤维化的分子机制,并识别关键调控基因 | 胎儿皮肤、成人皮肤和瘢痕疙瘩组织中的成纤维细胞 | 数字病理学 | 皮肤纤维化 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA测序数据, 空间转录组数据 | 胎儿皮肤、成人皮肤和瘢痕疙瘩组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 6 | 2026-04-15 |
Nanoplastics target lung monocytes, disrupting immune dynamics
2026-May-01, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2026.141961
PMID:41934838
|
研究论文 | 本研究通过活体荧光成像、流式细胞术和单细胞RNA测序,揭示了纳米塑料在小鼠体内的生物分布及其对肺免疫动态的干扰 | 首次发现纳米塑料特异性靶向肺部的非经典单核细胞和CD206间质巨噬细胞亚群,并揭示其通过延迟单核细胞向巨噬细胞分化来重编程免疫动态 | 研究仅使用雌性小鼠模型,未探索性别差异;长期暴露后果和人类相关性需进一步验证 | 探究纳米塑料在体内的生物分布及其对免疫系统的直接细胞响应 | 雌性小鼠的肺组织和血液免疫细胞 | 单细胞组学 | 环境暴露相关免疫失调 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 活体荧光成像 | NA | 单细胞转录组数据, 成像数据, 流式数据 | 未明确样本数量的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2026-04-15 |
Amoeboid-mesenchymal transition and the proteolytic control of cancer invasion plasticity
2026-Apr-14, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2520717123
PMID:41961858
|
研究论文 | 本研究揭示了癌细胞在侵袭过程中通过MMP14介导的蛋白水解作用调控间充质-阿米巴样表型转换的机制 | 挑战了传统观点,发现阿米巴样侵袭程序同样依赖MMP14介导的基质降解,并证明MMP14对维持核完整性至关重要 | 研究主要使用体外3D模型和人组织外植体,体内验证仍需进一步开展 | 探究癌细胞侵袭可塑性(间充质与阿米巴样表型转换)的调控机制 | 癌细胞(乳腺癌模型)、人乳腺癌组织外植体 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、CRISPR/Cas9基因编辑、免疫组织化学 | 3D肿瘤球体模型、人组织外植体模型 | 基因表达数据、空间转录组数据、组织图像数据 | 未明确样本数量,使用癌细胞系模型和人乳腺癌组织外植体 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 8 | 2026-04-15 |
DAPK2 Regulates PKM2 Phosphorylation at Threonine 45 to Facilitate Disturbed Flow-Induced Atherosclerosis
2026-Apr-14, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本研究揭示了死亡相关蛋白激酶2(DAPK2)通过磷酸化丙酮酸激酶M2(PKM2)的第45位苏氨酸,调控内皮细胞炎症反应,从而促进血流扰动诱导的动脉粥样硬化发生的新机制 | 首次发现DAPK2是KLF2下游的振荡剪切力敏感因子,并鉴定出PKM2是DAPK2的直接作用底物,阐明了DAPK2通过磷酸化PKM2第45位苏氨酸促进其二聚化和核转位,进而激活STAT1并上调VCAM-1和ICAM-1表达的完整信号轴 | 研究主要基于小鼠模型,其在人类疾病中的完全转化意义尚需进一步验证;DAPK2-PKM2轴在其他血管病理条件下的作用未予探索 | 阐明振荡剪切力诱导动脉粥样硬化的分子机制,并寻找潜在的治疗靶点 | 内皮细胞、小鼠动脉粥样硬化模型 | 分子细胞生物学 | 心血管疾病 | 质谱分析、免疫共沉淀、邻近连接实验、RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因组学数据、蛋白质组学数据、单细胞转录组数据 | 利用公共数据库资源及Apoe-/-背景的EC特异性基因修饰小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, RNA测序 | NA | NA |
| 9 | 2026-04-15 |
EpCAM supports exit from pluripotency of embryonic stem cells via Eomes
2026-Apr-11, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08734-w
PMID:41963283
|
研究论文 | 本研究揭示了EpCAM通过调控Eomes表达和Wnt信号通路,在小鼠胚胎干细胞退出多能性并分化为心肌细胞过程中的关键作用 | 首次发现EpCAM通过调控Eomes表达和Wnt信号通路,在小鼠胚胎干细胞退出多能性并分化为心肌细胞过程中发挥关键作用,并利用单细胞RNA测序技术验证了EpCAM与Eomes在早期胚胎发育阶段的共表达关系 | 研究主要基于小鼠胚胎干细胞模型和体外胚胎体分化系统,尚未在体内胚胎发育过程中进行验证 | 探究EpCAM在小鼠胚胎干细胞退出多能性并分化为心肌细胞过程中的分子机制 | 小鼠胚胎干细胞、胚胎体 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序、转录组分析、生物信息学分析 | NA | RNA测序数据、单细胞RNA测序数据 | 野生型和Epcam敲除型小鼠胚胎干细胞在不同分化时间点的样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10 | 2026-04-15 |
Experimental and computational methods for allelic imbalance analysis from single-nucleus RNA-seq data
2026-Apr-11, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04062-6
PMID:41965748
|
研究论文 | 本文探讨了实验和计算方法对单细胞RNA-seq数据中等位基因特异性表达分析的影响,并开发了一套单细胞ASE计算工具 | 开发了单细胞ASE计算工具,并展示了在单核RNA-Seq中从内含子区域提取更多ASE信息,以及如何通过读长和杂交选择提高检测能力 | NA | 研究实验和计算方法如何影响基于ASE的分析能力,并开发相关计算工具 | 单核RNA-Seq数据,特别是等位基因特异性表达分析 | 自然语言处理 | 帕金森病 | 单核RNA-Seq | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2026-04-15 |
RESCUE: recovery of unattributed expression patterns in spatial transcriptomics
2026-Apr-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71720-5
PMID:41963343
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为RESCUE的计算方法,用于恢复空间转录组学中现有分析方法遗漏的未归属表达模式 | RESCUE方法能系统性恢复因细胞分割或细胞类型解卷积而丢失的分子表达,包括脆弱细胞类型、亚细胞结构和细胞外表达等来源 | NA | 开发一种计算工具以改善空间转录组数据分析的完整性和准确性 | 空间转录组数据,特别是来自蜜蜂大脑的MERFISH数据和其他ST数据集 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学,MERFISH | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学,MERFISH | NA | NA |
| 12 | 2026-04-15 |
Spatial multi-omics unveils the monoclonal origin, neuroendocrine plasticity, and microenvironment niches in combined small-cell lung cancer
2026-Apr-10, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2026.102741
PMID:41966692
|
研究论文 | 本研究通过空间多组学技术揭示了联合小细胞肺癌的单克隆起源、神经内分泌可塑性及微环境生态位 | 首次在治疗初期的cSCLC肿瘤中整合空间全外显子测序、空间转录组学和单核RNA测序,揭示了不同组织学成分的单克隆起源及与突变模式的关联,并开发了基于突变的cSCLC检测工具 | 研究样本量有限(仅19个肿瘤),且仅针对治疗初期患者,未涉及治疗后的动态变化 | 探究联合小细胞肺癌的生物学特性、谱系可塑性及肿瘤微环境,以改善诊断和治疗策略 | 19个治疗初期的联合小细胞肺癌肿瘤样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间全外显子测序, 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 空间数据 | 19个治疗初期的cSCLC肿瘤 | NA | 空间全外显子测序, 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 13 | 2026-04-15 |
GatorST: A Versatile Contrastive Meta-Learning Framework for Spatial Transcriptomic Data Analysis
2026-Apr-08, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202600006
PMID:41947710
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研究论文 | 提出了一种名为GatorST的新型空间转录组数据分析框架,通过结合图建模与元学习策略来生成具有空间信息的表示 | 首次将基于图的局部空间建模与全局基因表达聚类伪标签相结合,并采用元学习启发的训练策略,有效整合局部与全局空间信息 | 未明确说明框架对特定组织类型或数据质量的敏感性,也未讨论计算资源需求 | 开发一个能够有效整合空间与转录组信息以提升下游分析性能的通用框架 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 图神经网络, 元学习 | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 14 | 2026-04-15 |
TriPDCL: A Tri-Pathway Prototype-Driven Contrastive Learning Framework for Cross-Modality Single-Cell Integration
2026-Apr-08, Journal of chemical information and modeling
IF:5.6Q1
DOI:10.1021/acs.jcim.6c00436
PMID:41952315
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研究论文 | 本文提出了一种基于原型对比学习的三路径框架TriPDCL,用于解决跨模态单细胞数据整合中的异质性对齐和鲁棒学习挑战 | 通过迭代原型学习更新机制实现异质性信息的有效传递,并利用可学习的原型中心精确构建可靠的正负样本对 | 未在摘要中明确说明 | 解决跨模态单细胞数据整合中的技术批次效应和生物异质性差异问题 | 单细胞多组学数据 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 对比学习框架 | 单细胞多组学数据 | 五个数据集 | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 15 | 2026-04-15 |
Single-Cell Sequencing Analysis-Driven Nanomedicine Design for Mimicking Endogenous Immune Repair in Myocardial Infarction
2026-Apr-04, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.6c01251
PMID:41934404
|
研究论文 | 本研究提出了一种基于单细胞测序分析的数据驱动仿生策略,通过顺序递送模拟免疫细胞的纳米颗粒来复制心肌梗死后内源性免疫修复机制 | 利用单细胞RNA测序揭示心肌梗死后免疫细胞动态变化,并据此设计模拟三种巨噬细胞亚型(M2a、M2b、M2c)时空分布的纳米颗粒顺序递送策略 | 未明确说明单细胞测序样本的具体数量、测序平台技术细节以及动物模型验证的局限性 | 开发模拟内源性免疫修复的纳米药物以促进心肌梗死恢复 | 心肌梗死后免疫细胞(特别是巨噬细胞亚型)的动态变化及仿生纳米颗粒 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2026-04-15 |
CellVoyager: AI CompBio agent generates new insights by autonomously analyzing biological data
2026-Apr, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-026-03029-6
PMID:41845065
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研究论文 | 本文介绍了一种基于大语言模型的AI代理CellVoyager,它能在Jupyter笔记本环境中自主生成并执行单细胞RNA测序分析 | CellVoyager通过自主分析生物数据,在COVID-19、细胞间通讯和衰老等案例中生成新颖发现,其创意性和科学可靠性获得专家认可 | NA | 开发一个AI代理以自主分析单细胞RNA测序数据,加速计算生物学研究并发现潜在新见解 | 单细胞RNA测序数据集 | 机器学习 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | 大语言模型 | 文本 | 76项已发表单细胞RNA测序研究 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2026-04-15 |
Molecular Markers Distinguishing Early-Stage Mycosis Fungoides From Atopic Dermatitis Skin Lesions
2026-Apr, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.70240
PMID:41888970
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据,比较早期蕈样肉芽肿与特应性皮炎皮肤病变的转录组特征,揭示了两者在免疫和基质细胞中的分子差异 | 首次在单细胞水平上系统比较早期蕈样肉芽肿与特应性皮炎的转录组特征,识别了恶性T细胞、角质形成细胞、成纤维细胞和髓系细胞中的特异性分子标记 | 研究样本量可能有限,且仅聚焦于早期阶段,未涵盖疾病进展或治疗响应 | 区分早期蕈样肉芽肿与特应性皮炎皮肤病变,以改善诊断和治疗 | 早期蕈样肉芽肿和特应性皮炎患者的皮肤病变样本 | 数字病理学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2026-04-15 |
Ubiquitin-specific protease 20(USP20) mitigates doxorubicin-induced cardiotoxicity by deubiquitinating and stabilizing HuR
2026-Apr, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.151642
PMID:41921794
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研究论文 | 本研究揭示了泛素特异性蛋白酶20(USP20)通过去泛素化并稳定HuR蛋白,从而抑制铁死亡并减轻阿霉素诱导的心肌病 | 首次阐明了USP20在阿霉素诱导心肌病中的保护作用机制,并发现其通过去泛素化HuR来稳定GPX4 mRNA以抑制铁死亡 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体临床样本中得到验证 | 探究USP20在阿霉素诱导心肌病中的作用机制 | 心肌细胞、小鼠心脏组织 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、LC-MS/MS、免疫共沉淀 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 19 | 2026-04-15 |
Multi omics analysis reveals senescence associated genes in metabolic dysfunction associated steatohepatitis related liver cancer and their functional validation
2026-Apr, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.151713
PMID:41933769
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了代谢功能障碍相关脂肪性肝炎相关肝癌(MRLC)中的衰老相关基因,并进行了功能验证 | 结合全球疾病负担数据库、孟德尔随机化、多机器学习方法和单细胞RNA测序,首次系统筛选并验证了MRLC中的核心衰老相关基因及其潜在治疗药物 | 研究主要基于生物信息学分析和动物模型,缺乏临床样本的直接验证 | 探索衰老相关基因在代谢功能障碍相关脂肪性肝炎相关肝癌中的作用及其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎相关肝癌(MRLC)患者数据及C57BL/6小鼠模型 | 生物信息学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、孟德尔随机化、多机器学习方法、分子对接 | 机器学习模型(未指定具体类型)、动物模型 | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、疾病负担数据 | 未明确指定人类样本数量,使用C57BL/6小鼠建立MRLC模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 20 | 2026-04-15 |
Score Matching for Differential Abundance Testing of Compositional High-Throughput Sequencing Data
2026-Apr, Statistics in medicine
IF:1.8Q1
DOI:10.1002/sim.70534
PMID:41944570
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研究论文 | 本文提出了一种扩展的a-b幂交互模型,用于处理具有协变量信息的稀疏组成数据,并开发了cosmoDA方法以降低相关特征在差异丰度测试中的假阳性率 | 扩展了a-b幂交互模型以纳入协变量信息,结合惩罚广义得分匹配开发了cosmoDA方法,能有效估计特征交互并减少相关特征导致的假阳性发现 | 未明确说明模型在极端稀疏数据或大规模数据集上的计算效率限制 | 开发一种针对组成型高通量测序数据的差异丰度测试方法,以准确表征异质群体中的协变量依赖关系 | 单细胞RNA测序数据和微生物扩增子数据 | 生物信息学 | NA | 高通量测序 | a-b幂交互模型 | 组成型测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 微生物扩增子测序 | NA | NA |