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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-01-05 |
Gut microbiota dysbiosis exacerbates acute pancreatitis via Escherichia coli-driven neutrophil heterogeneity and NETosis
2026-Dec-31, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2025.2606480
PMID:41439481
|
研究论文 | 本研究揭示了肠道菌群失调,特别是大肠杆菌的增多,通过重塑免疫系统、促进异常中性粒细胞胞外诱捕网形成,从而加剧急性胰腺炎的机制 | 首次将肠道菌群失调与急性胰腺炎中特定的中性粒细胞亚群异质性及NETosis通路激活联系起来,并明确了革兰氏阴性菌(尤其是大肠杆菌)是关键驱动因素 | 研究主要基于小鼠模型,人体样本验证相对有限;特定细菌与免疫亚群之间的直接因果机制仍需进一步阐明 | 探究肠道菌群失调加剧急性胰腺炎的具体微生物种类及其免疫学机制 | 无菌小鼠、无特定病原体小鼠、急性胰腺炎患者的粪便样本 | 微生物组学与免疫学 | 急性胰腺炎 | 单细胞RNA测序、鸟枪法宏基因组测序、粪便微生物移植、抗生素调节实验、单菌定植实验 | NA | 单细胞转录组数据、宏基因组数据、病理学数据 | 小鼠模型及急性胰腺炎患者的粪便样本(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA-seq, 宏基因组测序 | NA | NA |
| 2 | 2026-01-05 |
Single-cell landscape of peripheral and tumor-infiltrating immune cells in HPV-negative HNSCC
2026-Dec-31, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2025.2605741
PMID:41467967
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间蛋白质组学数据,揭示了HPV阴性头颈鳞状细胞癌中肿瘤浸润免疫细胞与循环免疫细胞之间的差异,并识别了空间定位的细胞毒性细胞耗竭作为关键的免疫逃逸机制 | 首次在HPV阴性HNSCC中整合大规模单细胞转录组(scRNA-seq)与空间多色免疫荧光数据,系统描绘了肿瘤进展和淋巴结转移过程中的免疫重编程,并发现了巨噬细胞与细胞毒性细胞间免疫抑制性串扰与疾病进展相关 | 研究样本主要来源于舌侧腹黏膜(9例空间验证样本),可能无法完全代表HPV阴性HNSCC所有解剖部位的异质性;单细胞数据整合来自两个独立数据集,可能存在批次效应 | 深入解析HPV阴性头颈鳞状细胞癌的肿瘤局部免疫景观,以发现可操作的免疫治疗靶点 | HPV阴性头颈鳞状细胞癌患者的肿瘤浸润免疫细胞和循环免疫细胞 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光, 空间蛋白质组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间蛋白质表达数据 | 29个样本(总计近30万个免疫细胞),包括14个外周血单个核细胞样本和21个肿瘤浸润免疫细胞状态;另对9例局部侵袭性HPV阴性HNSCC(均来自舌侧腹黏膜)进行空间验证 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学/蛋白质组学 | NA | NA |
| 3 | 2026-01-05 |
Integrated Multi-Omics Analysis Reveals Cytokine Network Dynamics and Prognostic Signatures in Hepatitis B Virus-Associated Hepatocellular Carcinoma
2026-Jan-04, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-025-05528-2
PMID:41484748
|
研究论文 | 本研究通过整合bulk RNA测序和单细胞RNA测序,揭示了细胞因子网络在HBV相关肝细胞癌中的动态变化,并构建了一个基于六种细胞因子的预后风险模型 | 首次整合bulk和单细胞转录组学分析HBV-HCC中的细胞因子网络,构建了基于LASSO的六细胞因子预后特征,并通过功能实验验证了关键细胞因子GHR的作用 | 研究主要基于转录组数据,缺乏蛋白质水平的验证;样本量可能有限,需要更大规模的前瞻性研究验证预后模型的临床适用性 | 阐明细胞因子在HBV相关肝细胞癌中的作用机制,并开发预后风险分层模型 | HBV相关肝细胞癌患者样本(包括肿瘤组织和血清) | 数字病理学 | 肝细胞癌 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 血清学检测, 体外功能实验 | LASSO回归模型 | RNA测序数据, 单细胞转录组数据, 血清蛋白数据 | 训练和验证队列中的HBV-HCC患者样本(具体数量未明确说明) | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-01-05 |
Tight junction-high and CDH17-positive cell population is the source of colorectal cancer liver metastases
2026-Jan-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-68169-3
PMID:41484106
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研究论文 | 本研究揭示了结直肠癌中一种由紧密连接重塑驱动的、具有转移能力的上皮细胞状态,并发现IKKα缺失通过稳定紧密连接成分促进肝转移 | 首次发现IKKα缺失通过稳定紧密连接成分(如CLDN2)促进结直肠癌转移,并鉴定出CDH17⁺/CLDN2⁺上皮亚群是肝转移灶的主要细胞来源 | 研究主要基于患者来源类器官和单细胞转录组学,体内转移过程的动态机制和临床相关性仍需进一步验证 | 探究结直肠癌转移的细胞特征和分子机制 | 结直肠癌患者来源类器官、转移性肿瘤组织 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组测序、组织染色、遗传学与药理学抑制 | NA | 转录组数据、组织图像数据 | 未明确说明具体样本数量,涉及患者来源类器官和肿瘤组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5 | 2026-01-05 |
Oxidative stress and GPX2 control pancreatic vs. non-pancreatic cell fate in human endoderm
2026-Jan-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-68145-x
PMID:41484137
|
研究论文 | 本研究揭示了氧化应激和GPX2在调控人类后前肠分化中决定胰腺与非胰腺细胞命运的关键作用 | 首次将氧化应激确立为胰腺细胞命运的关键调控因子,并发现GPX2通过调节转录因子和细胞外基质重塑来影响谱系分化 | 研究主要基于体外分化模型,体内验证和临床转化潜力尚需进一步探索 | 探究代谢产物在人类内胚层发育中细胞命运决定的作用机制 | 人类后前肠分化过程中的细胞 | 发育生物学 | NA | 批量转录组学、单细胞转录组学、染色质可及性分析 | NA | 转录组数据、染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2026-01-05 |
Spatial transcriptomics of developing human lungs defines cellular phenotypes associated with age, lineage and location
2026-Jan-03, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-34594-z
PMID:41484334
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7 | 2026-01-05 |
An insulin receptor activity surge in follicle cells drives vitellogenesis by upregulating CrebA
2026-Jan-03, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-025-00672-6
PMID:41484377
|
研究论文 | 本研究探讨了胰岛素信号在果蝇卵泡细胞中的作用,揭示了胰岛素受体活性激增通过上调CrebA驱动卵黄生成,并发现这一调控轴在人类颗粒细胞中保守 | 利用基于相分离的报告系统观察到卵泡细胞中胰岛素受体活性激增,并通过单细胞RNA-seq识别出对饮食敏感的卵泡细胞亚群,揭示了CrebA在胰岛素信号阶段特异性效应中的关键作用 | 研究主要基于果蝇模型,人类颗粒细胞中的保守性验证可能需进一步实验支持,且高蔗糖饮食的影响机制尚未完全阐明 | 探究胰岛素信号在果蝇卵泡细胞发育和卵黄生成中的功能及机制 | 果蝇卵泡细胞和人类颗粒细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 未明确指定样本数量,但涉及果蝇卵泡细胞单细胞RNA-seq分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8 | 2026-01-05 |
A human pathophysiological 3D-bone marrow model reveals immune and stromal cell heterogeneity
2026-Jan-03, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09433-6
PMID:41484482
|
研究论文 | 本文介绍了一种标准化的三维人类骨髓模型,用于模拟骨髓微环境的关键特征 | 开发了一种三维骨髓模型,能更好地模拟人类骨髓微环境,相比二维培养,单核细胞/巨噬细胞表现出更强的促炎表型,造血祖细胞在长期培养中保持干性 | NA | 研究人类骨髓微环境的生理和病理机制 | 骨髓微环境中的基质细胞、内皮细胞、免疫细胞和造血细胞 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2026-01-05 |
Microglia Mitochondrial Metabolism in Neurological Diseases
2026-Jan-03, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-025-05640-8
PMID:41484491
|
综述 | 本文综述了小胶质细胞线粒体代谢在神经退行性疾病中的作用机制及其对神经炎症和疾病进展的影响 | 提出了线粒体质量控制失败导致线粒体DNA释放并激活cGAS-STING通路形成“表观遗传锁”的统一致病机制,并强调代谢灵活性丧失(而非糖酵解本身)是病理的真正驱动因素 | 缺乏纵向人类数据验证,缺少经过验证的生物标志物,实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)模型在多发性硬化症研究中存在争议 | 阐明小胶质细胞线粒体代谢在神经疾病中的作用机制,并提出针对恢复线粒体动力学和代谢灵活性的精准医学框架 | 小胶质细胞(中枢神经系统的常驻免疫细胞) | 神经科学 | 阿尔茨海默病、帕金森病、多发性硬化症、缺血性中风 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10 | 2026-01-05 |
Integrated experimental and computational workflows for single-cell transcriptomics in plants
2026-Jan-03, Plant methods
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s13007-025-01490-6
PMID:41484617
|
研究论文 | 本研究为植物单细胞转录组学建立了优化的实验和计算工作流程,通过系统基准测试和集成策略,提高了数据质量和细胞类型识别的稳健性 | 开发了改进的bulk RNA-seq协议作为单细胞数据参考,比较了原生质体、新鲜核和冷冻核三种输入类型在组织中的转录组可比性,并利用bulk RNA-seq提供额外生物学背景以验证单细胞发现 | 所有实验数据均来源于玉米,可能限制了在其他植物物种中的直接适用性,但原则和策略具有普适性指导意义 | 优化植物单细胞转录组学的实验和计算工作流程,以解决组织制备、核分离和转录组质量等挑战 | 玉米(Zea mays)组织,包括原生质体、新鲜核和冷冻核作为输入类型 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2026-01-05 |
Comprehensive profiling of lactylation-associated genes in pulmonary hypertension through bulk and single-cell RNA sequencing integration
2026-Jan-03, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-025-03446-9
PMID:41484613
|
研究论文 | 本研究通过整合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据,全面分析了肺动脉高压中乳酸化相关基因,并鉴定出LCP1作为核心诊断标志物 | 首次在肺动脉高压中系统整合bulk和单细胞RNA-seq数据来研究乳酸化相关基因,并发现LCP1作为关键乳酸化相关枢纽基因 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证仅限于体外细胞模型,缺乏更深入的体内功能验证 | 探究乳酸化在肺动脉高压发生发展中的作用机制 | 肺动脉高压患者和对照组的基因表达数据,以及缺氧诱导的肺动脉平滑肌细胞 | 生物信息学 | 肺动脉高压 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, RT-PCR, western blot | NA | 基因表达数据 | 包含多个数据集(GSE113439, GSE186996, GSE210248)的肺动脉高压患者和对照组样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2026-01-05 |
Identification of Cuproptosis-Associated Biomarker Candidates in Hypertrophic Cardiomyopathy via Machine Learning and Multi-Omics Integration
2026-Jan-03, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-025-05533-5
PMID:41484731
|
研究论文 | 本研究通过整合机器学习与多组学数据,识别了与肥厚型心肌病相关的铜死亡生物标志物候选物 | 首次将铜死亡相关基因与肥厚型心肌病关联,并利用机器学习整合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据构建诊断模型 | 研究发现是关联性的且为假设生成性质,需要前瞻性临床评估和机制研究(如铜稳态扰动和基因操作)才能做出治疗推断 | 识别肥厚型心肌病的新型生物标志物候选物和治疗靶点 | 健康对照和肥厚型心肌病患者的基因表达数据 | 机器学习 | 心血管疾病 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 加权基因共表达网络分析, 诊断模型 | 基因表达数据 | 来自健康对照和HCM患者的bulk RNA-seq和scRNA-seq数据 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2026-01-05 |
A pan-cancer single cell landscape reveals heterogeneity and functional diversity of double-negative T cells
2026-Jan-03, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02548-8
PMID:41484771
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据,揭示了双阴性T细胞在肿瘤微环境中的异质性和功能多样性 | 首次在泛癌水平上构建了双阴性T细胞的单细胞图谱,识别了14个不同的DNT亚群,并阐明了它们在肿瘤免疫治疗中的关键作用 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据,功能验证仍需进一步实验支持 | 探究双阴性T细胞在肿瘤微环境中的异质性、功能多样性及其对免疫治疗反应的影响 | 双阴性T细胞 | 单细胞组学 | 泛癌 | 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 图像数据 | 2,369个样本,涵盖23种癌症类型,包含157,025个高质量DNT细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 14 | 2026-01-05 |
Single-cell RNA sequencing unveils enhanced antitumor immunity in colorectal cancer with PD-1 blockade and LINC00673 deletion
2026-Jan-03, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-025-00888-7
PMID:41484808
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 15 | 2026-01-05 |
Autologous human iPSC-derived alveolus-on-chip reveals early pathological events of Mycobacterium tuberculosis infection
2026-Jan-02, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aea9874
PMID:41477823
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研究论文 | 本研究开发了一种基于单供体人类诱导多能干细胞衍生的肺芯片模型,用于模拟人类远端肺的细胞组成和机械环境,并应用于结核分枝杆菌感染的早期病理事件研究 | 首次构建了包含肺泡上皮细胞、血管内皮细胞和巨噬细胞的自体人类诱导多能干细胞衍生的肺芯片模型,结合微流体技术模拟三维机械拉伸和气液界面,用于研究结核分枝杆菌感染的早期病理机制 | 模型可能无法完全模拟体内复杂的免疫微环境和长期感染动态,且基于单供体细胞,个体差异影响未评估 | 开发一种免疫活性且实验可及的人类肺泡系统模型,以研究呼吸系统疾病如结核病的病理机制 | 人类诱导多能干细胞衍生的肺泡上皮细胞、血管内皮细胞和巨噬细胞,以及结核分枝杆菌 | 数字病理学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | 器官芯片 | 图像,单细胞RNA测序数据 | 基于单供体人类诱导多能干细胞的模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2026-01-05 |
Apolipoprotein E drives microglia activation in the development of autoimmune uveitis through up-regulation of peptidyl prolyl isomerase F
2026-Jan-02, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aeb3991
PMID:41477830
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研究论文 | 本研究探讨了载脂蛋白E通过上调肽基脯氨酰异构酶F驱动小胶质细胞激活,在自身免疫性葡萄膜炎发展中的作用机制 | 首次揭示了ApoE通过ROS途径调控小胶质细胞激活,并验证了其在EAU模型和AU患者PBMCs中的关键作用 | 研究主要基于小鼠EAU模型和体外细胞实验,人类样本验证有限,且具体信号通路细节需进一步探索 | 阐明ApoE在自身免疫性葡萄膜炎发病机制中的作用及其与小胶质细胞激活的关联 | 小鼠实验性自身免疫性葡萄膜炎模型、小胶质细胞、AU患者外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 自身免疫性葡萄膜炎 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 蛋白质组分析 | NA | RNA-seq数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2026-01-05 |
BCMA/CD19 CAR T cell therapy for refractory myasthenia gravis: Proteomic signatures and single-cell transcriptomics of disease flares
2026-Jan-02, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aeb6424
PMID:41481736
|
研究论文 | 本研究评估了BCMA/CD19 CAR T细胞疗法治疗难治性重症肌无力的可行性、安全性和有效性,并利用蛋白质组学和单细胞转录组学分析了疾病复发的分子特征 | 首次将BCMA/CD19双靶点CAR T细胞疗法应用于难治性重症肌无力,并发现FCRL5是疾病复发中一个先前未被识别的潜在靶点 | 样本量较小(仅6例患者),且为单臂研究,缺乏对照组 | 评估CAR T细胞疗法在自身免疫性疾病中的疗效并探索其作用机制 | 难治性重症肌无力患者 | 单细胞转录组学 | 重症肌无力 | 单细胞RNA测序,蛋白质组学分析 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质组数据 | 6名难治性重症肌无力患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2026-01-05 |
Treatment nonresponders in lupus nephritis characteristically exhibit persistent type I interferon signalling in monocytes: a longitudinal single-cell transcriptomic analysis
2026-Jan-02, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.12.002
PMID:41484050
|
研究论文 | 本研究通过纵向单细胞RNA测序分析,揭示了狼疮性肾炎治疗无应答者中单核细胞持续I型干扰素信号的特征 | 首次通过纵向单细胞转录组分析,识别出狼疮性肾炎治疗无应答者单核细胞中持续的I型干扰素信号通路激活 | 样本量较小(n=10),需在更大独立队列中进一步验证 | 表征狼疮性肾炎治疗应答相关的动态转录变化 | 狼疮性肾炎患者的PBMCs和单核细胞 | 单细胞转录组学 | 狼疮性肾炎 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | 加权基因共表达网络分析 | 转录组数据 | 单细胞RNA测序队列10例患者,bulk RNA测序验证队列13例患者 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 19 | 2026-01-05 |
Integrating single-cell and bulk transcriptomes identifies B cell features associated with neoadjuvant chemoradiotherapy sensitivity in rectal cancer
2026-Jan-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-31068-0
PMID:41484196
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据,识别了与直肠癌新辅助放化疗敏感性相关的B细胞亚群及其特征基因 | 应用Scissor算法整合单细胞RNA-seq和批量转录组数据,首次在直肠癌中鉴定出与nCRT反应相关的特定B细胞亚群,并基于此开发了机器学习预测模型 | 样本量有限,验证队列仅包含64个样本,且研究主要基于转录组数据,缺乏功能实验验证 | 探究B细胞在直肠癌新辅助放化疗反应中的作用,并开发预测模型 | 直肠癌患者样本 | 数字病理学 | 直肠癌 | 单细胞RNA-seq, 批量转录组测序 | 机器学习模型 | RNA-seq数据 | 未明确总样本数,验证队列包含64个样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2026-01-05 |
Unravelling the progression of the zebrafish primary body axis with reconstructed spatiotemporal transcriptomics
2026-Jan-02, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03917-8
PMID:41484648
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研究论文 | 本研究开发了一种名为Palette的流程,通过整合批量RNA-seq数据和空间转录组学数据,重建了斑马鱼胚胎发育过程中的时空基因表达谱,并识别了调控前后轴发育的关键形态发生素和转录因子 | 提出了Palette流程,能够从批量RNA-seq数据中推断详细的空间基因表达模式,仅需现有空间转录组数据作为参考;创建了斑马鱼时空表达谱(zSTEP)这一综合性图谱资源 | 未明确说明Palette流程在不同组织或物种中的通用性验证;空间转录组参考数据的质量和覆盖范围可能影响推断结果的准确性 | 研究斑马鱼胚胎发育过程中基因表达的时空动态,特别是前后轴建立的调控机制 | 斑马鱼胚胎 | 空间转录组学 | NA | 批量RNA-seq, 空间转录组学 | 机器学习 | RNA-seq数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 三个发育阶段的53个连续切片批量RNA-seq数据 | NA | 批量RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |