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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-09-17 |
Stratifying lung adenocarcinoma: a novel prognostic model based on mitochondrial outer membrane permeabilization activity
2026-Oct, 3 Biotech
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s13205-026-05058-6
PMID:42745950
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研究论文 | 该研究利用TCGA-LUAD和GSE42127数据集,通过多种分析方法和机器学习算法构建了一个基于线粒体外膜通透化(MOMP)相关基因的肺腺癌预后模型,并评估其生物学意义和临床价值。 | 首次基于MOMP活性相关基因构建肺腺癌预后模型,结合多种机器学习算法和孟德尔随机化分析,并整合单细胞RNA测序数据揭示免疫微环境重塑。 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 识别与肺腺癌MOMP活性相关的预后基因,构建预后模型,并评估其生物学意义和临床价值。 | 肺腺癌(LUAD)患者 | 机器学习 | 肺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 梯度提升机(GBM) | 基因表达数据, 临床数据, 单细胞数据 | 训练队列TCGA-LUAD和验证队列GSE42127,具体样本量未明确 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2026-09-17 |
S100A1 Promotes MDM2-Mediated KLF15 Ubiquitination to Regulate ID1-Driven Tubular Injury in Diabetic Kidney Disease
2026-Sep-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202603731R
PMID:42745573
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和实验验证,揭示了S100A1通过MDM2介导的KLF15泛素化调控ID1,从而促进糖尿病肾病中肾小管损伤的新机制 | 首次发现S100A1-MDM2-KLF15-ID1调控轴在糖尿病肾病发病机制中的作用,并揭示S100A1通过增强MDM2与KLF15相互作用,诱导KLF15的K48连接泛素化和蛋白酶体降解,进而解除KLF15对ID1的转录抑制 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究S100A1在糖尿病肾病肾小管损伤中的作用及其调控机制 | 糖尿病肾病患者的肾脏样本、肾活检标本、高糖刺激的人近端肾小管上皮细胞(HK-2)、糖尿病小鼠模型 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 文本 | 健康对照和糖尿病肾病患者的肾脏样本(具体数量未提及)、糖尿病肾病患者的肾活检标本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2026-09-17 |
Inhibition of Jaw Bone Marrow Mesenchymal Stem Cell Cuproptosis Attenuates Bone Loss in Apical Periodontitis via Suppressing the FoxO Signalling Pathway
2026-Sep-16, International endodontic journal
IF:5.4Q1
DOI:10.1111/iej.70266
PMID:42746789
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研究论文 | 本研究探讨了铜死亡在根尖周炎骨丧失中的作用,并发现抑制颌骨骨髓间充质干细胞铜死亡可通过FoxO信号通路减轻骨丧失 | 首次揭示铜死亡是根尖周炎牙槽骨丧失的新型驱动因素,并阐明铜死亡通过FoxO/β-catenin轴损害颌骨骨髓间充质细胞成骨功能的机制,提出TTM靶向铜死亡作为治疗策略 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 研究铜死亡在根尖周炎骨丧失中的参与及其调控机制 | 根尖周炎患者根尖周组织标本、根尖周炎大鼠模型、颌骨骨髓间充质干细胞(JBMMSCs) | 单细胞组学、骨生物学 | 根尖周炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、LC-MS/MS蛋白质组学、micro-CT、H&E染色、免疫组化、qRT-PCR、Western blotting | NA | 图像、文本、单细胞转录组数据 | 来自健康受试者或根尖周炎患者的根尖周标本;3个scRNA-seq数据集(GSE171213、GSE181688、GSE197680);根尖周炎大鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-09-17 |
Ruscogenin Targets TXNIP to Suppress PANoptosis and Inflammation in Periodontitis
2026-Sep-15, Oral diseases
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/odi.70402
PMID:42745234
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研究论文 | 本研究探索了PANoptosis在牙周炎中的作用,识别了关键PANoptosis相关基因TXNIP,并验证了Ruscogenin作为靶向TXNIP的小分子抑制剂可抑制PANoptosis和牙周炎症 | 首次揭示TXNIP作为牙周炎中PANoptosis的关键调控因子,并发现Ruscogenin可通过靶向TXNIP抑制PANoptosis和炎症,为牙周炎治疗提供了新的小分子药物候选 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探索PANoptosis在牙周炎中的作用,识别关键PANoptosis相关基因并评估潜在小分子抑制剂 | 牙周炎患者牙龈组织、临床样本、小鼠牙周炎模型及细胞实验 | 机器学习 | 牙周炎 | 单细胞RNA-seq,分子对接,分子动力学模拟,ssGSEA,WGCNA | 多种机器学习方法 | 基因表达数据,图像,文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2026-09-17 |
Multimodal AI and single-cell transcriptomics integrate to construct a histopathological prognostic model for bladder cancer, revealing the RTN3-glycolysis axis in chemoresistance
2026-Sep-15, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-026-00825-w
PMID:42745263
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研究论文 | 该研究整合多模态人工智能与单细胞转录组学,构建了膀胱癌组织病理学预后模型,并揭示了RTN3-糖酵解轴在化疗耐药中的作用机制 | 首次将单细胞水平拷贝数变异异质性作为生物学锚点,结合多模态AI策略从常规H&E染色病理切片构建膀胱癌预后模型,并发现RTN3通过JAK2/STAT3通路转录上调糖酵解酶(PKM2、GLUT1、LDHA)驱动吉西他滨耐药的机制 | 研究仅基于公共单细胞RNA测序数据集进行发现,模型与转录组HCNV活性的相关性显著但较弱,且体外和体内功能实验仅使用膀胱癌细胞系,缺乏大规模前瞻性临床验证 | 揭示单细胞水平CNV异质性与膀胱癌组织形态学特征之间的关系,构建可临床转化的预后预测模型,并阐明化疗耐药的分子机制 | 膀胱癌患者样本及膀胱癌细胞系 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序、inferCNV拷贝数变异推断、多组学分析、深度学习图像分析、体外和体内功能实验 | 多模态人工智能模型、深度学习 | 图像、文本 | 六个公共单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6 | 2026-09-17 |
Machine learning and multi-omics clustering to map cellular rewiring and immune evasion in ccRCC
2026-Sep-15, Human genomics
IF:3.8Q2
DOI:10.1186/s40246-026-01024-8
PMID:42745293
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研究论文 | 该研究结合机器学习与多组学聚类,构建了ccRCC的共识机器学习驱动特征(CMLS),并利用空间转录组和单细胞RNA测序解析了肿瘤微环境中的细胞重编程和免疫逃逸机制 | 开发了一个整合框架,将宏观生存风险与微观肿瘤微环境结构相联系;使用101种机器学习组合生成24基因CMLS;结合空间转录组和14万细胞scRNA-seq图谱解码特征的细胞起源;发现CMLS在预测ICB获益方面优于肿瘤突变负荷 | 样本量相对有限(三个独立队列和17对临床组织),需要更大规模的前瞻性验证;RT-qPCR仅验证了5个核心基因 | 克服ccRCC中肿瘤微环境异质性对免疫检查点阻断疗效的限制,建立连接宏观生存风险与微观TME结构的整合框架,并开发能够预测ICB获益的患者分层工具 | 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)患者及其肿瘤微环境 | 机器学习, 数字病理学, 多组学 | 肾细胞癌 | 多组学聚类, 空间转录组, 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 机器学习 | SuperPC, 机器学习组合模型 | 图像, 文本, 基因表达数据 | 三个独立队列,140,000个细胞的scRNA-seq图谱,17对ccRCC临床组织 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组 | NA | NA |
| 7 | 2026-09-17 |
Muscularis EGR1 Deficiency Impairs M2 Macrophage Polarization and Disrupts Gastric Motility in Diabetic Gastroparesis
2026-Sep, Neurogastroenterology and motility
IF:3.5Q2
DOI:10.1111/nmo.70439
PMID:42745198
|
研究论文 | 该研究揭示糖尿病胃轻瘫中肌肉层EGR1缺失通过破坏TXN2依赖的巨噬细胞氧化磷酸化并触发CCL5/CCR5/NLRP3介导的ICC损伤,从而损害M2巨噬细胞极化并破坏胃动力 | 首次发现EGR1作为连接巨噬细胞极化与ICC完整性的关键分子,阐明EGR1-TXN2-氧化磷酸化-CCL5/CCR5/NLRP3轴在糖尿病胃轻瘫发病中的新机制,并验证局部AAV9-EGR1恢复可改善胃动力 | 研究主要基于动物模型和体外实验,人体样本验证有限,且EGR1恢复未改善全身血糖控制,其长期安全性和临床转化价值尚需进一步验证 | 探究EGR1是否将巨噬细胞极化与糖尿病胃轻瘫中ICC完整性相关联,并评估局部EGR1恢复的治疗潜力 | 人胃体全层组织样本、人幽门肌肉层活检样本、链脲佐菌素诱导的糖尿病胃轻瘫大鼠模型、巨噬细胞和原代ICC | 数字病理学, 机器学习 | 糖尿病胃轻瘫 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, 差异表达分析, 机器学习 | 探索性机器学习 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 图像 | 人胃体全层转录组数据(GSE115601)、单细胞RNA测序数据(GSE252126)及临床幽门肌肉层活检样本,具体样本量未在摘要中明确 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 8 | 2026-09-17 |
Multiomics analyses revealed the roles of the epithelial-mesenchymal transition and novel early candidate diagnostic biomarkers in neonatal necrotising enterocolitis
2026-Sep, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70793
PMID:42745358
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研究论文 | 该研究通过整合大量蛋白质组学、空间蛋白质组学、单细胞RNA测序及动物模型,揭示了新生儿坏死性小肠结肠炎中上皮-间质转化及肠道重构的作用,并筛选出候选早期诊断生物标志物 | 首次将FFPE肠道组织的bulk蛋白质组学、索引病例的空间蛋白质组学和单细胞RNA测序整合分析,揭示NEC中EMT样成纤维细胞/肌成纤维细胞重构;发现ANXA2、RPL13、RPL23A和RPS28为候选组织标志物,并证明血清ANXA2具有诊断和风险分层潜力;通过药理抑制Snail介导的EMT改善小鼠NEC模型结局 | 血清ANXA2的结论属于探索性研究,需要前瞻性多中心验证;空间蛋白质组学仅基于一个索引病例;小鼠模型结果不能完全代表人类新生儿NEC | 探究与新生儿坏死性小肠结肠炎相关的肠道分子改变,并探索候选早期诊断生物标志物 | NEC患儿的FFPE肠道组织、血清样本以及小鼠NEC模型 | 多组学、数字病理学 | 新生儿坏死性小肠结肠炎 | bulk蛋白质组学、空间蛋白质组学、单细胞RNA测序、免疫组织化学、血清酶联免疫吸附试验 | NA | 图像、文本、蛋白质组数据、基因表达数据 | 6例肠道样本用于单细胞测序,另有FFPE肠道组织、血清样本及小鼠NEC模型 | NA | bulk蛋白质组学、空间蛋白质组学、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2026-09-17 |
B-Cell Remodeling and Regulatory Phenotypes During Acute COVID-19 Are Unaffected by Polyclonal Anti-SARS-CoV-2 Antibody XAV-19
2026-Sep, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.70284
PMID:42745635
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研究论文 | 本文是POLYCOR随机对照试验的免疫学子研究,通过光谱流式细胞术、体外功能实验和单细胞RNA测序纵向分析住院COVID-19患者的B细胞动态,评估多克隆抗体XAV-19对B细胞的影响 | 首次系统揭示急性COVID-19期间调节性B细胞的动态重塑及其转录重编程特征,包括干扰素驱动的记忆B细胞特征的出现,并证明XAV-19被动抗体治疗对B细胞稳态、表型和功能影响极小 | 作为子研究,样本量可能有限,随访时间较短,未深入探讨Bregs的具体免疫抑制机制及其与临床结局的关联 | 探究急性COVID-19感染期间B细胞(尤其是调节性B细胞)的动态变化,以及多克隆抗SARS-CoV-2抗体XAV-19对B细胞免疫平衡的影响 | 住院COVID-19患者的B细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 光谱流式细胞术、体外功能实验、单细胞RNA测序 | NA | 流式细胞数据、转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq、流式细胞术 | NA | NA |
| 10 | 2026-09-17 |
TMEM59L promotes neuroendocrine differentiation and enzalutamide resistance in prostate cancer by regulating MUC1/β-catenin/MYC axis
2026-Sep, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70835
PMID:42746692
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研究论文 | 本文揭示了TMEM59L通过调控MUC1/β-catenin/MYC信号轴促进前列腺癌神经内分泌分化及恩杂鲁胺耐药的作用机制 | 首次发现TMEM59L在前列腺癌恩杂鲁胺耐药和神经内分泌分化中的关键驱动作用,并阐明其通过直接结合MUC1促进核积累进而激活β-catenin/MYC信号轴的全新机制 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究TMEM59L在前列腺癌进展、谱系可塑性和治疗耐药中的功能角色及分子机制 | 恩杂鲁胺耐药前列腺癌细胞系及相应小鼠异种移植模型 | 数字病理学 | 前列腺癌 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 共免疫沉淀, GST pull-down, 分子对接 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2026-09-17 |
Long-Read Single-Cell RNA Sequencing Reveals Dynamic Isoform Changes During Corneal Epithelial Wound Healing in Cynomolgus Monkeys
2026-Sep-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.67.11.34
PMID:42747255
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研究论文 | 本研究利用长读长单细胞RNA测序技术,对食蟹猴角膜上皮创伤愈合过程中不同阶段的转录本异构体变化进行了系统表征 | 首次在食蟹猴角膜上皮创伤愈合模型中应用长读长单细胞RNA测序技术(HIT-scISOseq),揭示了基因水平分析无法捕获的广泛异构体水平调控变化,包括异构体使用、多样性及转换的动态改变 | 研究仅涉及食蟹猴角膜缘组织在未损伤、伤后1天和3天三个时间点的样本,时间点覆盖有限;样本量较小;未进行功能验证实验来直接证明关键异构体的生物学功能 | 表征食蟹猴角膜上皮创伤愈合过程中异构体水平的转录变化,揭示异构体调控在角膜上皮修复中的作用 | 食蟹猴角膜缘组织及HCE-T细胞系 | 单细胞转录组学 | 角膜损伤 | 长读长单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 食蟹猴角膜缘组织在未损伤、伤后1天和3天三个时间点的样本 | NA | 单细胞RNA-seq | HIT-scISOseq | HIT-scISOseq长读长单细胞测序技术,可检测全长转录本 |
| 12 | 2026-09-17 |
Single-cell transcriptomics reveals distinct microglial state remodeling associated with the (R)-nicotine/diosmetin combination and galantamine in LPS-challenged BV2 cells
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1901868
PMID:42745774
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研究论文 | 该研究通过单细胞转录组学揭示了(R)-尼古丁/地奥司明联合用药与加兰他敏在LPS刺激的BV2细胞中诱导的不同小胶质细胞状态重塑。 | 首次在单细胞分辨率上比较了(R)-尼古丁、地奥司明、其联合用药(DR)及加兰他敏对LPS刺激BV2小胶质细胞异质性转录状态的影响,并结合RNA velocity与SCENIC调控子推断揭示了不同治疗相关的转录与调控模式差异。 | 研究使用BV2小胶质细胞样细胞系而非原代小胶质细胞或体内模型,可能无法完全反映体内小胶质细胞的复杂性与微环境相互作用。 | 在单细胞分辨率上比较(R)-尼古丁、地奥司明、其联合用药及加兰他敏对LPS刺激的BV2小胶质细胞异质性转录状态的重塑作用。 | LPS刺激的BV2小胶质细胞样细胞 | 机器学习 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | 每组3个生物学重复,共4组(LPS对照、(R)-尼古丁、地奥司明、DR联合用药、加兰他敏),共12个样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 13 | 2026-09-17 |
Donor-dependent heterogeneity and matrix-remodeling transcriptional programs in COL2A1-variant urine-derived cell cultures with IGF1-associated cell-state shifts
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1920598
PMID:42745831
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研究论文 | 该研究通过软骨诱导尿液来源细胞(chUDCs)比较COL2A1变异患者与健康对照的转录组差异,并探索IGF1对细胞状态的影响 | 首次利用COL2A1变异患者来源的尿液衍生细胞进行软骨诱导,结合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq揭示供体依赖性异质性和基质重塑转录程序,并发现IGF1相关细胞状态转变 | 未对IGF1处理的对照供体细胞系进行单细胞测序分析,因此IGF1相关变化仅为探索性结果,不能声称是COL2A1特异性效应;样本量较小(3例患者和3例对照) | 探索COL2A1相关生长障碍中软骨生物学和生长因子响应性的转录程序 | 携带杂合致病性COL2A1变异的个体的尿液来源细胞及健康对照的尿液来源细胞 | 数字病理学, 机器学习 | COL2A1相关骨骼发育不良 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 文本, 图像 | 3例COL2A1变异患者和3例健康对照的尿液来源细胞,其中2例患者来源细胞系进行了单细胞RNA测序 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 14 | 2026-09-17 |
Network-informed deconvolution of bulk immune gene co-expression reveals single-cell programs and spatial organization
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1843602
PMID:42745838
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研究论文 | 该研究开发了一种网络信息引导的解卷积框架,利用批量RNA-seq数据构建免疫相关基因的贝叶斯网络调控结构,并将其投影到单细胞RNA-seq数据上以识别免疫细胞状态,同时结合空间转录组学评估其空间一致性 | 提出了一种网络信息引导的解卷积框架,利用贝叶斯网络从批量RNA-seq数据中提取调控结构,并将网络标志物投影到单细胞数据中以定义免疫细胞状态,而非仅依赖传统的基于表达的聚类分析,同时整合了批量转录组、单细胞转录组和空间转录组三个尺度的数据 | 摘要中未明确说明该研究的局限性 | 开发一种网络信息引导的解卷积框架,以识别免疫细胞亚群并表征其功能,同时将批量免疫基因共表达、单细胞程序和空间组织联系起来 | 外周血单个核细胞(PBMC)和肺腺癌(LUAD)单细胞RNA-seq数据集,以及空间转录组数据集和背景匹配的批量RNA-seq队列 | 机器学习 | 肺癌 | scRNA-seq, 批量RNA-seq, 空间转录组学 | 贝叶斯网络 | 文本(基因表达数据) | NA | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | NA |
| 15 | 2026-09-17 |
PAFAH1B1 governs follicular development by modulating the protein complex of CCNE1-CDK2-CDK1 to induce cell cycle arrest
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1919659
PMID:42745890
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和整合分析发现PAFAH1B1参与细胞周期调控,并证实PAFAH1B1通过结合CCNE1-CDK2-CDK1复合物阻滞G2/M期,从而抑制颗粒细胞增殖和卵泡发育 | 首次在猪基因型-组织表达数据库中发现PAFAH1B1作为细胞周期的新型调控因子,揭示了PAFAH1B1通过物理结合CCNE1-CDK2-CDK1复合物阻滞G2/M期来抑制颗粒细胞增殖和卵泡发育的新机制,并证明了CpG岛去甲基化可促进PAFAH1B1转录 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究卵泡发育过程中颗粒细胞增殖和细胞周期调控的分子机制,鉴定参与细胞周期调控的新基因 | 猪卵巢颗粒细胞和卵泡 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序,免疫共沉淀,流式细胞术,EdU染色,HE染色,TUNEL检测,染色质可及性分析,CRISPR/dCas9-TET1表观遗传编辑 | NA | 图像,文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 16 | 2026-09-17 |
Identification of Wnt/β-catenin- and immune-related genes in hepatic ischemia-reperfusion injury using bulk transcriptomics, single-cell RNA sequencing, and a murine model
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1745640
PMID:42745923
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研究论文 | 该研究通过整合肝脏移植相关转录组数据集与单细胞RNA测序数据,结合小鼠肝缺血再灌注损伤模型,筛选并验证了与Wnt/β-catenin信号通路评分和免疫调控相关的关键基因HSP90AA1、HSP90AB1、NFATC1和THBS1 | 首次联合bulk转录组学、单细胞RNA测序和非移植小鼠HIRI模型,基于Wnt/β-catenin信号评分和免疫调控整合分析,识别并验证了HSP90AA1、HSP90AB1、NFATC1和THBS1四个关键生物标志物,并构建了TF-mRNA及lncRNA-miRNA-mRNA调控网络 | 非移植小鼠HIRI模型仅提供初步表达验证,关键基因的时间依赖性意义和 therapeutic 价值仍需在肝移植模型及基因功能干预实验中进一步验证 | 筛选与肝移植后肝缺血再灌注损伤中Wnt/β-catenin信号评分和免疫调控相关的关键基因 | 肝移植相关肝缺血再灌注损伤患者转录组数据及非移植小鼠HIRI模型 | 数字病理学 | 肝移植相关肝缺血再灌注损伤 | bulk转录组测序, 单细胞RNA测序, qPCR, Western blot, 组织学分析, 血清学评估 | WGCNA, Boruta, LASSO, CIBERSORT | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 图像, 文本 | 三个肝移植相关转录组数据集(GSE151648、GSE12720、GSE189539)及非移植小鼠HIRI模型样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2026-09-17 |
Tekt2 regulates hair cell development and function by maintaining normal kinocilium morphology in zebrafish
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1898887
PMID:42745927
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序、原位杂交、基因功能缺失与拯救实验、行为学检测、扫描电镜和FM染料摄取等方法,揭示了Tekt2在斑马鱼感觉毛细胞中通过维持动纤毛正常形态来调控毛细胞发育与功能的作用 | 首次系统阐明Tekt2在斑马鱼感觉毛细胞中富集于毛细胞顶端和动纤毛,并证明其缺失会导致动纤毛形态异常、毛束组织紊乱、顶端极性破坏及机械转导功能受损,明确了tektin家族蛋白在感觉毛细胞形态发生和功能中的关键作用 | 研究主要基于斑马鱼模型,未在哺乳动物或人类毛细胞中验证Tekt2功能的保守性,且对Tekt2调控动纤毛形态的具体分子机制探讨尚不深入 | 探究tektin 2(tekt2)在斑马鱼感觉毛细胞中的表达模式及其在毛细胞形态发生、动纤毛维持和机械转导功能中的作用 | 斑马鱼的感觉毛细胞,包括神经丘、斑和嵴中的毛细胞 | 发育生物学、听力与平衡觉研究 | 听力障碍、前庭功能障碍 | 单细胞RNA测序、整胚原位杂交、基因功能缺失与拯救分析、行为学检测、扫描电子显微镜、FM染料摄取实验 | 斑马鱼基因敲除与转基因拯救模型 | 图像、文本、行为学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 18 | 2026-09-17 |
Complement expression profiles in human glomerular mesangial cells, endothelial cells, podocytes and proximal tubular epithelial cells
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1881549
PMID:42746023
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研究论文 | 该研究综合表征了非疾病人肾组织中肾小球系膜细胞、肾小球内皮细胞、足细胞和近端肾小管上皮细胞中补体成分的表达谱 | 首次系统全面地比较了四种人肾固有细胞中经典途径、凝集素途径和替代途径相关补体成分及其调控因子的表达特征,并结合培养细胞实验与单细胞RNA测序数据进行了验证 | 研究主要基于体外培养细胞和公共数据库及单细胞测序数据,缺乏蛋白质水平的全面验证,且仅关注非疾病肾组织,未涉及疾病状态下的补体表达变化 | 全面表征非疾病人肾组织中四种肾固有细胞的补体成分表达谱 | 人肾小球系膜细胞、肾小球内皮细胞、足细胞和近端肾小管上皮细胞 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | RT-PCR、免疫荧光染色、单细胞RNA测序 | NA | 图像、文本 | 四种人肾固有细胞(培养细胞)及公共单细胞RNA测序数据集中的非疾病人肾组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序 |
| 19 | 2026-09-17 |
Aqueous humour extracellular vesicle membrane protein profiling reveals pathological features of refractory macular edema
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1880885
PMID:42746022
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研究论文 | 本研究通过分析房水来源的细胞外囊泡膜蛋白,揭示了难治性糖尿病性黄斑水肿和视网膜静脉阻塞相关黄斑水肿的不同病理特征和通路 | 首次利用EV Array芯片对房水细胞外囊泡膜蛋白进行高通量分析,发现了难治性DME和RVO-ME的病因特异性通路的差异,并鉴定出可高精度区分难治性病例的EV蛋白标志物 | 样本量较小(共28例患者),需要更大规模的队列研究验证;仅分析了膜蛋白,未涵盖EV其他组分;随访时间未明确 | 探究房水来源的细胞外囊泡膜蛋白能否表征黄斑水肿对抗VEGF治疗的难治性,并揭示不同病因的特异性通路 | 28例DME或RVO-ME患者(各14例),分为初治亚组和难治亚组 | 数字病理学 | 黄斑水肿 | EV Array芯片蛋白组学分析、生物信息学分析、单细胞RNA-seq数据分析 | NA | 蛋白表达数据、文本 | 28例患者房水样本(14例DME,14例RVO-ME) | NA | bulk RNA-seq | EV Array芯片(435抗体) | EV Array芯片靶向435种抗体进行细胞外囊泡膜蛋白谱分析,并利用公共单细胞RNA-seq数据进行细胞来源映射 |
| 20 | 2026-09-17 |
Spatial immune biomarkers in triple-negative breast cancer: emerging evidence, technology trade-offs, and barriers to clinical translation
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1899098
PMID:42746148
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综述 | 本文综述了三阴性乳腺癌中空间免疫生物标志物的研究进展,比较了多种空间成像与转录组技术,并讨论了其临床转化的障碍 | 系统梳理了TNBC中空间免疫生物标志物的新兴证据,并对多重免疫荧光、MIBI-TOF、成像质谱流式、空间转录组学和基于H&E的人工智能等技术进行了多维度比较,指出了临床转化面临的采样、分割和阈值选择等挑战 | 大多数报告的预后或治疗反应关联仍为回顾性或探索性,标志物定义对采样、分割和阈值选择敏感,缺乏前瞻性验证 | 探讨三阴性乳腺癌中空间免疫生物标志物的研究现状、技术权衡及临床转化障碍 | 三阴性乳腺癌患者的肿瘤免疫微环境 | 数字病理学, 空间生物学 | 三阴性乳腺癌 | 多重免疫荧光, 飞行时间多重离子束成像, 成像质谱流式, 空间转录组学, 基于H&E的人工智能 | 人工智能 | 图像, 空间转录组数据 | NA | NA | 多重免疫荧光, 飞行时间多重离子束成像, 成像质谱流式, 空间转录组学 | NA | NA |