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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-12-25 |
Gut microbiota dysbiosis exacerbates acute pancreatitis via Escherichia coli-driven neutrophil heterogeneity and NETosis
2026-Dec-31, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2025.2606480
PMID:41439481
|
研究论文 | 本研究揭示了肠道菌群失调通过大肠杆菌驱动的中性粒细胞异质性和NETosis加剧急性胰腺炎的机制 | 首次明确了特定革兰氏阴性菌(尤其是大肠杆菌)在急性胰腺炎恶化中的关键作用,并利用单细胞RNA测序揭示了菌群失调如何重塑局部和全身免疫景观,促进促炎性中性粒细胞亚群的扩增和NETosis相关通路的激活 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限;特定细菌作用的分子机制细节仍需进一步阐明 | 探究肠道菌群失调加剧急性胰腺炎的具体微生物和分子机制 | 无菌小鼠、无特定病原体小鼠、急性胰腺炎患者粪便样本 | 微生物组学与免疫学 | 急性胰腺炎 | 单细胞RNA测序、鸟枪法宏基因组测序、粪便微生物移植、抗生素调节、单菌定植实验 | NA | 基因表达数据、宏基因组数据 | 小鼠模型及急性胰腺炎患者粪便样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 宏基因组测序 | NA | NA |
| 2 | 2025-12-25 |
Opportunities for RNA sequencing in physiology: from big data to understanding homeostasis and heterogeneity
2026-Feb-01, Function (Oxford, England)
DOI:10.1152/function.019.2025
PMID:41401424
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综述 | 本文综述了RNA测序在生理学中的应用,从大数据分析到理解稳态和异质性 | 强调非编码RNA(如lncRNA)的重要性,并讨论单细胞和空间转录组学的最新进展 | NA | 探讨RNA测序在生理学中的机遇,以增强对疾病机制和个性化医疗的理解 | RNA分子,包括编码和非编码RNA,以及其在细胞、组织和器官生理学中的作用 | 自然语言处理 | NA | RNA测序,单细胞转录组学,空间转录组学 | NA | RNA序列数据 | 超过百万个RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3 | 2025-12-25 |
Fibroblast Dysregulation in Multiple Idiopathic External Cervical Resorption: Laboratory Investigation From a Rare Case of 13 Affected Teeth
2026-Jan, International endodontic journal
IF:5.4Q1
DOI:10.1111/iej.70037
PMID:40988149
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研究论文 | 本研究通过全外显子组测序、单细胞RNA测序和体外实验,探讨了多发性特发性外部颈吸收的发病机制,特别是成纤维细胞异常活动的作用 | 首次结合全外显子组测序和单细胞RNA测序技术,揭示了GNAS错义突变和成纤维细胞异常增殖及破骨特性在MIECR发病中的关键作用 | 研究基于单个罕见病例,样本量有限,结果可能不具有普遍性 | 探究多发性特发性外部颈吸收的病因和发病机制 | 一名患有MIECR的药剂师患者的病变组织和健康牙龈组织 | 数字病理学 | 牙科疾病 | 全外显子组测序, 单细胞RNA测序, 组织病理学分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 组织图像 | 1名患者的病变组织和健康牙龈组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2025-12-25 |
Endothelial Heterogeneity in Pulmonary Hypertension
2026-Jan, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.125.322482
PMID:41230600
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序揭示的肺内皮细胞异质性及其在肺动脉高压发病机制中的作用,并探讨了靶向内皮功能障碍的新型治疗策略 | 整合前沿技术(特别是单细胞RNA测序)来理解内皮异质性如何塑造肺动脉高压的疾病轨迹,为未来治疗创新开辟新途径 | NA | 阐明肺内皮细胞异质性在肺动脉高压发病机制中的作用,并探索靶向内皮功能障碍的治疗机会 | 肺内皮细胞及其在肺动脉高压中的功能亚群 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2025-12-25 |
Endothelial CEPT1 Promotes Angiogenesis Through PPARα and VEGF-A Signaling
2026-Jan, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.125.323302
PMID:41263082
|
研究论文 | 本研究探讨了内皮细胞中CEPT1基因过表达通过PPARα和VEGF-A信号通路促进血管生成的作用 | 首次揭示了CEPT1在糖尿病背景下通过PPARα/VEGF-A信号轴促进缺血后血管生成的新机制,并利用单细胞RNA测序技术验证了其功能 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本验证相对有限,且糖尿病模型的复杂性可能影响机制解释 | 探究CEPT1在糖尿病缺血性血管疾病中促进血管生成和功能恢复的分子机制 | 人类外周动脉疾病患者样本、内皮细胞特异性Cept1过表达转基因小鼠、小鼠主动脉和内皮细胞 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、分子通路分析、基因工程小鼠模型 | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据、功能实验数据 | 人类患者样本(未明确数量)、C57BL/6J小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6 | 2025-12-25 |
The prognostic value of tumor macroscopic morphology in colorectal cancer
2026-Jan, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102607
PMID:41319390
|
研究论文 | 本研究评估了结直肠癌肿瘤宏观形态的预后价值,并探讨了不同形态背后的分子机制 | 提出了修订的结直肠癌肿瘤宏观形态分类系统,并首次将内镜和CT影像形态作为术前疾病无进展生存期的预测因子 | 研究包含回顾性和前瞻性队列,可能存在选择偏倚,且样本量相对有限 | 评估结直肠癌肿瘤宏观形态的预后价值并理解其分子机制 | 结直肠癌患者 | 数字病理学 | 结直肠癌 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学 | NA | RNA测序数据, 单细胞数据, 图像数据 | 642名患者(335名前瞻性研究,307名回顾性研究) | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2025-12-25 |
Pericytes and Lung Vascular Remodeling
2026-Jan, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.125.322518
PMID:41342143
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综述 | 本文综述了周细胞在肺血管重塑中的作用,特别是在肺动脉高压中的病理生物学机制 | 利用单细胞RNA测序技术识别了新的特异性周细胞标记物,揭示了周细胞亚型,并阐明了其在缺氧信号、TGF-β等机制下的表型转换 | 周细胞由于与其他壁细胞共享标记物和谱系关系,在单细胞数据集中存在识别重叠和代表性不足的问题 | 探讨周细胞在肺血管重塑和肺动脉高压病理生物学中的作用及潜在治疗靶点 | 周细胞(毛细血管壁细胞)及其在肺等器官中的功能 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8 | 2025-12-25 |
Multi-omics analysis unveils tumor heterogeneity and immunotherapy predictive model in breast cancer for precision medicine and early detection
2026-Jan, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2025.101260
PMID:41344266
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和批量RNA测序数据,揭示了乳腺癌的肿瘤异质性,并开发了一个用于预测患者生存和免疫治疗反应的稳健预后模型 | 整合多组学数据(scRNA-seq、空间转录组学、批量RNA-seq)来表征肿瘤亚群,并利用CoxBoost+GBM算法构建了一个新的预后模型,特别强调了基底样乳腺癌细胞在免疫逃逸和治疗抵抗中的核心作用 | 研究依赖于公共数据库(如TCGA和GEO)的数据,可能受限于样本的异质性和可用临床信息的完整性,且模型需要在独立的前瞻性队列中进行进一步验证 | 探索乳腺癌的肿瘤异质性,并开发一个用于精准医疗和早期检测的免疫治疗预测模型 | 乳腺癌肿瘤样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组学、批量RNA测序(bulk RNA-seq) | CoxBoost+GBM算法 | 基因表达数据(单细胞、空间和批量RNA-seq) | 来自TCGA和GEO队列的多个乳腺癌样本(具体数量未在摘要中明确) | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2025-12-25 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal P4HA2-mediated radiotherapy resistance mechanisms in breast cancer
2026, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.121257
PMID:41424847
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学揭示了P4HA2介导的乳腺癌放疗抵抗机制 | 结合单细胞与空间转录组学、机器学习及孟德尔随机化,构建了SSRR预后模型,并验证了P4HA2在放疗抵抗中的关键作用 | 研究基于特定队列数据,需进一步实验验证机制,且模型在临床应用中需外部验证 | 探究乳腺癌放疗抵抗的分子决定因素和细胞群体,以开发预后模型和治疗靶点 | 乳腺癌患者样本,包括TCGA-BRCA和GSE120798队列数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 机器学习模型(SuperPC和StepCox-based) | 转录组数据 | 来自TCGA-BRCA和GSE120798队列的乳腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 10 | 2025-12-25 |
Macrophages in Colorectal Cancer: from Normal Mucosa to Distant Metastasis: Beyond the M1/M2 Paradigm
2026, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.126772
PMID:41438574
|
综述 | 本文综述了结直肠癌中巨噬细胞从正常黏膜到远处转移的演变过程,超越了传统的M1/M2二分法 | 利用单细胞RNA测序和空间转录组学揭示巨噬细胞表型是一个连续谱系,挑战了经典的M1/M2二分法 | 综述性质文章,未进行原始实验研究,依赖现有文献总结 | 探讨巨噬细胞在结直肠癌发展、免疫微环境和转移中的作用 | 结直肠癌中的肿瘤相关巨噬细胞 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 11 | 2025-12-25 |
Comprehensive characterization of AP-1 adaptor complex genes in lung cancer reveals AP1AR as a novel prognostic and therapeutic biomarker
2026, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.125763
PMID:41438582
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研究论文 | 本研究通过多组学数据系统分析了AP-1衔接复合体基因在肺癌中的作用,发现AP1AR是一个新的预后和治疗生物标志物 | 首次在家族水平系统表征AP-1衔接复合体基因在肺癌中的作用,并鉴定出AP1AR作为新型预后和治疗生物标志物 | 研究主要基于生物信息学分析,需要进一步的实验验证来确认AP1AR的功能机制 | 阐明AP-1衔接复合体基因在肺癌进展和治疗分层中的作用 | 肺癌(特别是肺腺癌)患者样本和细胞 | 生物信息学 | 肺癌 | 多组学数据分析、单细胞RNA测序、细胞-细胞通讯建模 | CellChat模型、伪时间分析 | 基因组、转录组、蛋白质组、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12 | 2025-12-25 |
Multi-Omics and Single-Cell Dissection of Exostosin Glycosyltransferases (EXT1/EXT2) Reveals Divergent Oncogenic Roles and Therapeutic Vulnerabilities in Gliomas
2026, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.123965
PMID:41438585
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研究论文 | 本文通过多组学和单细胞分析揭示了EXT1和EXT2在胶质瘤中的不同致癌作用和治疗脆弱性 | 首次整合多组学和单细胞数据系统解析EXT1/EXT2在胶质瘤中的转录、表观遗传和微环境景观,并识别其作为预后生物标志物和治疗靶点的潜力 | 研究主要基于公共数据库和体外分析,缺乏体内功能验证实验 | 阐明EXT1和EXT2在胶质瘤中的生物学功能和临床意义 | 胶质瘤患者样本和公共数据库中的转录组数据 | 生物信息学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序, 免疫组化, 基因集富集分析 | CIBERSORT, ESTIMATE | 转录组数据, 表观遗传数据, 单细胞数据 | 来自TCGA和CGGA数据库的胶质瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 多组学分析 | NA | NA |
| 13 | 2025-12-25 |
Identification of key ferroptosis-related targets in colorectal cancer: A transcriptomics-driven study via machine learning and AUcell analysis of single-cell RNA-sequencing
2026, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.114522
PMID:41438584
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研究论文 | 本研究通过机器学习方法和AUcell分析,识别了结直肠癌中铁死亡相关的关键基因,并探讨了其分子机制和治疗潜力 | 结合机器学习(LASSO和SVM-RFE)与单细胞RNA测序的AUcell分析,系统识别并验证了结直肠癌中铁死亡相关的核心生物标志物 | qRT-PCR验证中AQP8和NR5A2的表达未显示预期差异,且研究依赖于公共数据库数据,需进一步实验验证 | 阐明结直肠癌中铁死亡相关的关键基因和分子机制,以指导治疗策略和预后评估 | 结直肠癌(CRC) | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,qRT-PCR,免疫组织化学(IHC) | LASSO,SVM-RFE,AUcell算法,CIBERSORT | 转录组数据,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 14 | 2025-12-25 |
Single-Cell Multi-Omics Reveals B2M-Mediated Myeloid Reprogramming and Constructs a Predictive Model for Early Hepatocellular Carcinoma Recurrence
2025-Dec-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202503144R
PMID:41427790
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学整合分析,揭示了B2M介导的髓系细胞重编程在肝细胞癌早期复发中的作用,并构建了一个预测模型 | 首次在单细胞分辨率下整合RNA测序、蛋白质组学、转录组学和临床特征,系统性地探索了肝细胞癌早期复发的驱动因素,并识别出B2M相关的髓系细胞重编程这一新机制 | 预测模型在训练和验证队列中的AUC仅大于0.65,性能为中等,需要进一步的外部验证和优化 | 探索肝细胞癌早期复发的分子机制并开发预测框架 | 肝细胞癌患者肿瘤组织 | 单细胞多组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 转录组学, LASSO回归 | LASSO回归模型 | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组数据, 转录组数据, 临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 15 | 2025-12-25 |
Post-Translational Modification Mediated By Acylation Modification Related Genes Induces Immunosuppression and Immunotherapy Resistance in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2025-Dec-26, Journal of immunotherapy (Hagerstown, Md. : 1997)
DOI:10.1097/CJI.0000000000000594
PMID:41439580
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研究论文 | 本研究通过构建酰化修饰相关基因的评分系统(AM.score),揭示了其在头颈鳞状细胞癌(HNSCC)中的预后价值及与免疫治疗反应的关系 | 首次系统整合11种酰化修饰类型,利用机器学习方法构建AM.score,并验证其在多个独立队列中预测HNSCC患者预后和免疫治疗疗效的能力 | 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证;样本来源为公共数据库和内部队列,可能存在选择偏倚 | 探究酰化修饰相关基因在头颈鳞状细胞癌中的预后意义及其与免疫微环境和免疫治疗反应的关系 | 头颈鳞状细胞癌(HNSCC)患者 | 生物信息学 | 头颈鳞状细胞癌 | WGCNA、机器学习、scRNA-seq | 机器学习模型 | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 多个队列(TCGA-HNSCC、GSE41613、GSE42743、GSE65858及内部队列) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2025-12-25 |
Single-Cell Transcriptome Meta-Analysis Reveals Epigenomic and Chromatin Dysregulation in Developing Neurons Derived From Human ESCs With 1q21.1 CNVs
2025-Dec-24, Autism research : official journal of the International Society for Autism Research
IF:5.3Q1
DOI:10.1002/aur.70156
PMID:41437869
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组元分析,揭示了携带1q21.1拷贝数变异的人类胚胎干细胞来源发育神经元中的表观基因组和染色质调控异常 | 结合公共数据和内部疾病模型单细胞组学数据,开发了实用的分析流程,并首次将BPTF识别为与神经精神疾病相关的转录组变化潜在靶点 | NA | 阐明复杂人类神经精神疾病的分子基础 | 来自携带1q21.1拷贝数变异的人类胚胎干细胞模型的发育神经元 | 单细胞组学 | 自闭症谱系障碍、双相情感障碍、精神分裂症 | 单细胞转录组分析 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2025-12-25 |
Senescent Mesenchymal Stromal Cells Differentially Alter Adipogenesis in Adipose Tissue, Skeletal Muscle, and Bone Marrow
2025-Dec-24, Obesity (Silver Spring, Md.)
DOI:10.1002/oby.70119
PMID:41437892
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研究论文 | 本研究探讨了衰老的间充质基质细胞如何以组织特异性的方式调节脂肪生成,从而影响衰老过程中脂肪在脂肪组织、骨骼肌和骨髓中的重新分布 | 揭示了衰老MSCs通过旁分泌作用对脂肪生成产生组织特异性影响(促进骨髓MSCs的脂肪生成,但抑制脂肪组织和骨骼肌MSCs的脂肪生成),阐明了衰老相关脂肪重新分布的非细胞自主性机制 | 研究主要在体外和小鼠模型中进行,人体内的验证和具体信号通路有待进一步研究 | 探究衰老的间充质基质细胞如何调节不同组织中的脂肪生成,以阐明衰老相关脂肪重新分布的机制 | 从小鼠骨骼肌、脂肪组织和骨髓中分离的原代间充质基质细胞 | NA | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序,体外脂肪生成分化实验,DNA损伤诱导衰老实验,条件培养基分析 | NA | RNA测序数据,细胞表型数据 | 来自小鼠三种组织(骨骼肌、脂肪组织、骨髓)的原代MSCs | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2025-12-25 |
Mycn regulates vascular development through PI3K signaling pathway in zebrafish
2025-Dec-24, Developmental dynamics : an official publication of the American Association of Anatomists
IF:2.0Q3
DOI:10.1002/dvdy.70104
PMID:41439407
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和活体成像分析,确认了Mycn在斑马鱼血管生成过程中的表达,并利用基因工程突变体探究了Mycn在血管发育中的关键作用 | 首次在斑马鱼模型中证实Mycn通过PI3K信号通路调控血管发育,揭示了Mycn缺陷导致血管异常的具体机制 | 研究仅限于斑马鱼模型,未在哺乳动物或人类系统中验证 | 探究Mycn在血管发育中的具体作用机制 | 斑马鱼(Danio rerio) | 发育生物学 | 血管发育异常 | 单细胞RNA测序,活体成像,基因工程突变 | 斑马鱼遗传模型 | RNA-seq数据,成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 19 | 2025-12-25 |
Phospholipid scramblase 1 (PLSCR1) regulates interferon-lambda receptor 1 (IFN-λR1) and IFN-λ signaling in influenza A virus (IAV) infection
2025-Dec-24, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.104359
PMID:41439508
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研究论文 | 本研究探讨了磷脂爬行酶1(PLSCR1)在甲型流感病毒(IAV)感染中如何通过调控干扰素-λ受体1(IFN-λR1)和干扰素-λ信号通路发挥抗病毒作用 | 揭示了PLSCR1通过结合Ifn-λr1启动子调控其表达,并在肺上皮细胞表面与IFN-λR1相互作用以调节干扰素-λ信号,同时发现其脂质爬行酶活性对抗流感功能非必需,并利用单细胞RNA测序技术明确了PLSCR1在纤毛气道上皮细胞中的特异性上调 | 仅在小鼠模型中进行研究,人体组织或临床样本数据有限,且PLSCR1的具体作用机制仍需进一步探索 | 阐明PLSCR1在IAV感染中的抗病毒机制,特别是其如何调控干扰素-λ信号通路,以促进针对宿主靶点如PLSCR1的新型抗流感药物开发 | 甲型流感病毒(IAV)感染的小鼠模型、肺上皮细胞(特别是纤毛气道上皮细胞) | 分子生物学与病毒学 | 流感 | 单细胞RNA测序、转录组分析、蛋白质相互作用研究 | NA | RNA测序数据、转录组数据、蛋白质相互作用数据 | 小鼠模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 20 | 2025-12-25 |
D-Mannose-Modified M2 Macrophage Membrane-Derived Decoy Nanovesicles for Synergistic Immunotherapy of Asthma
2025-Dec-24, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.5c04996
PMID:41441854
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研究论文 | 本研究开发了一种基于M2巨噬细胞膜衍生的纳米诱饵,用于协同免疫治疗哮喘 | 利用D-甘露糖修饰的M2巨噬细胞膜纳米诱饵,同时靶向多种2型细胞因子,并通过靶向甘露糖受体增强细胞因子的吞噬清除 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人体临床试验中验证 | 开发一种基于纳米技术的协同免疫疗法,用于治疗哮喘和其他2型炎症性疾病 | M2巨噬细胞膜衍生的纳米诱饵、D-甘露糖修饰的纳米囊泡 | 免疫治疗 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |