单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 43267 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-09-13 |
GenAR: Next-scale autoregressive generation for spatial gene expression prediction
2026-Nov, Medical image analysis
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.media.2026.104232
PMID:42503259
|
研究论文 | 提出GenAR，一种多尺度自回归框架，从H&E染色图像预测空间基因表达，通过层次化基因分组和离散计数token生成实现由粗到细的预测 | 将基因聚类为层次化组以捕捉跨基因依赖关系；将表达建模为固定整数计数token词汇表上的离散token生成以直接预测原始计数；在融合的组织学和空间嵌入上条件化解码 | 摘要中未明确提及 | 从广泛可用的H&E染色图像预测空间基因表达，作为空间转录组学的低成本替代方案 | 五种不同组织类型的空间转录组学数据集 | 计算机视觉, 机器学习, 数字病理学 | NA | 空间转录组学, H&E染色 | 自回归模型, 多尺度自回归框架 | 图像, 基因表达计数数据 | 五个空间转录组学数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2 | 2026-09-13 |
Tumoral AMER1 driven dopamine synthesis triggers cancer cell pyroptosis and licenses CD8+ T cell immunity in colorectal cancer
2026-Oct-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218772
PMID:42546913
|
研究论文 | 该研究发现结直肠癌中AMER1通过稳定DDC维持肿瘤多巴胺分泌，诱导GSDMD依赖的肿瘤细胞焦亡并重塑CD8+ T细胞免疫微环境 | 首次将AMER1定义为免疫代谢门控因子，揭示肿瘤多巴胺合成作为连接肿瘤抑制与免疫监视的保守神经代谢效应器，并提出神经递质代谢旁路作为结直肠癌治疗策略 | 摘要中未明确说明研究局限性 | 探究经典肿瘤抑制因子AMER1在结直肠癌中对肿瘤免疫代谢微环境的外在调控作用及其机制 | 结直肠癌患者样本、多种免疫背景的小鼠同种移植模型、结直肠癌细胞 | 数字病理, 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 多组学整合分析, 生化追踪 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2026-09-13 |
Therapy-associated lineage plasticity in DIPG following combined CDK4/6 inhibitor, temozolomide, and radiation
2026-Oct-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218771
PMID:42532370
|
研究论文 | 评估CDK4/6抑制剂abemaciclib联合替莫唑胺和放疗在DIPG患者来源原位异种移植模型中的疗效及治疗相关细胞状态可塑性 | 揭示了不同疾病背景DIPG模型对联合治疗的反应差异及治疗耐受细胞状态，发现了放疗抵抗亚群及候选放疗增敏靶基因NPAS3、TBC1D15和INPP4B | 仅基于两个患者来源原位异种移植模型，样本量有限，需要更大队列验证 | 探究abemaciclib联合替莫唑胺和放疗对DIPG的治疗效果及残余细胞状态可塑性变化 | DIPG患者来源原位异种移植模型（IBs-9119DIPG来自初治活检，IBs-A0317DIPG来自既往治疗后的尸检肿瘤） | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像 | 2个患者来源原位异种移植模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2026-09-13 |
Loss of PBRM1 accelerates pancreatic cancer progression by inducing acquisition of mesenchymal phenotype and inflammatory cancer-associated fibroblasts reprogramming
2026-Oct-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218797
PMID:42632513
|
研究论文 | 本文研究了PBRM1在胰腺导管腺癌（PDAC）中的抑癌作用，发现其缺失通过表观遗传重塑上调Zeb1，促进间充质表型获得和炎症性癌症相关成纤维细胞重编程，从而加速肿瘤进展 | 首次通过胰腺特异性Pbrm1敲除小鼠模型结合单细胞转录组学，揭示了PBRM1缺失通过表观遗传调控Zeb1表达，驱动PDAC肿瘤细胞间充质转化和基质炎症性CAF重编程的双重机制 | 未明确说明样本量及具体公共基因组数据集信息，机制研究主要依赖小鼠模型，人类PDAC样本验证有限 | 探究PBRM1在胰腺导管腺癌中的分子功能及其临床相关性 | 人类PDAC样本、公共基因组数据集、Kras驱动及Kras/Trp53突变PDAC小鼠模型 | digital pathology | 胰腺癌 | 单细胞转录组学、批量转录组学、表观遗传染色质重塑分析 | NA | 转录组数据、基因组数据 | 人类PDAC样本及公共基因组数据集（数量未明确），小鼠模型（数量未明确） | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2026-09-13 |
Ophiopogonin D induced Plet1+ macrophage differentiation to treat acute lung injury through blocking the interaction between NCOR1 and PPARγ
2026-Oct-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.117173
PMID:42497662
|
研究论文 | 该研究发现麦冬皂苷D通过结合NCOR1并阻断NCOR1与PPARγ的相互作用，激活PPARγ，促进Plet1+巨噬细胞分化，从而改善LPS诱导的急性肺损伤 | 首次揭示OPD通过直接结合NCOR1、阻断NCOR1-PPARγ相互作用来激活PPARγ，进而诱导Plet1+巨噬细胞（一种M2样亚群）分化，阐明了OPD治疗ALI的新机制 | 研究主要基于小鼠LPS诱导的ALI模型，尚未在临床患者中验证OPD的疗效；Plet1+巨噬细胞在人体中的功能和OPD的临床转化潜力仍需进一步研究 | 探究OPD治疗急性肺损伤的疗效及其分子机制 | LPS诱导的急性肺损伤小鼠模型及巨噬细胞 | 机器学习 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序, 热蛋白质组分析 | NA | 文本, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6 | 2026-09-13 |
PLOD2 promotes colorectal cancer progression and immune escape via attenuating CD8+ T cells function
2026-Oct-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.117190
PMID:42503264
|
研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和功能实验揭示了PLOD2通过稳定c-Myc上调PD-L1、抑制CD8+ T细胞功能从而促进结直肠癌进展和免疫逃逸的机制 | 首次阐明PLOD2通过与c-Myc直接互作并阻止其蛋白酶体降解，进而上调PD-L1表达，介导结直肠癌免疫逃逸；并证明靶向PLOD2可增强抗CTLA-4免疫治疗疗效 | 研究主要基于细胞系和小鼠模型，缺乏大规模临床样本验证；PLOD2作为生物标志物的临床应用价值尚需进一步前瞻性研究确认 | 探究PLOD2在结直肠癌免疫调节和免疫治疗响应中的作用及其分子机制 | 结直肠癌细胞系、小鼠肿瘤模型及结直肠癌组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7 | 2026-09-13 |
Macrophage-associated TLR9 signaling contributes to chronic cardiac allograft fibrosis via macrophage-to-myofibroblast transition and paracrine fibroblast activation
2026-Oct-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.117194
PMID:42526370
|
研究论文 | 该研究揭示了受体TLR9信号通过巨噬细胞-肌成纤维细胞转化和旁分泌成纤维细胞活化促进慢性心脏移植物纤维化的机制，并评估了羟氯喹对该通路的药理调控作用 | 首次发现受体TLR9信号是巨噬细胞相关慢性心脏移植物纤维化重塑的重要调节因子，阐明了TLR9通过TGF-β1/Smad3轴驱动巨噬细胞-肌成纤维细胞转化以及通过IL-6/Stat3旁分泌途径激活成纤维细胞的双重机制，并证明羟氯喹可靶向该通路改善移植物存活 | 研究主要基于小鼠异位心脏移植模型，尚未在人类临床样本中验证TLR9通路的作用；羟氯喹的非特异性免疫调节效应可能涉及其他通路；单细胞RNA测序的细胞数量和时间点覆盖可能有限 | 探究受体TLR9信号在慢性同种异体移植物排斥反应中对巨噬细胞相关纤维化重塑的贡献，并评估药物调控该通路的治疗潜力 | 小鼠异位心脏移植模型中的巨噬细胞、成纤维细胞及移植物组织 | 数字病理学, 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8 | 2026-09-13 |
MXRA7: A potential link between macrophage M1 polarization and epithelial Pyroptosis in ulcerative colitis
2026-Oct-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.117187
PMID:42537348
|
研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序分析、临床样本和DSS诱导小鼠结肠炎模型，揭示MXRA7通过抑制NF-κB通路减少巨噬细胞M1极化并缓解上皮细胞焦亡，从而减轻溃疡性结肠炎结肠组织损伤 | 首次揭示MXRA7在溃疡性结肠炎中通过双重调控机制发挥作用：一方面抑制NF-κB信号通路减少巨噬细胞M1极化，另一方面缓解M1型巨噬细胞诱导的结肠上皮细胞焦亡 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究MXRA7在溃疡性结肠炎进展中的作用及其与巨噬细胞M1极化和结肠上皮细胞焦亡之间的相互作用机制 | 溃疡性结肠炎患者的临床结肠组织、DSS诱导的小鼠结肠炎模型、体外共培养细胞体系 | 机器学习, 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, 细胞间通讯分析, 基因敲低/过表达, 分子生物学实验, 体外细胞共培养 | NA | 图像, 文本 | GSE214695单细胞RNA测序数据集、UC患者临床结肠组织及DSS诱导小鼠结肠炎模型组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9 | 2026-09-13 |
Macrophage VISTA restrains inflammatory and antigen-presenting programs during alloimmune tissue injury
2026-Oct-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.117235
PMID:42561669
|
研究论文 | 本文利用急性心脏同种异体移植排斥模型，发现巨噬细胞中VISTA（由Vsir编码）在移植排斥过程中表达下降，并揭示VISTA通过限制炎症和抗原呈递程序来抑制同种免疫组织损伤 | 首次将VISTA鉴定为巨噬细胞炎症编程的内在调控因子，并揭示了H3K4me3相关的染色质重塑是VISTA介导炎症抑制的调控层 | 摘要中未明确说明研究的局限性 | 探究限制巨噬细胞炎症编程的内在检查点机制，以及VISTA在巨噬细胞炎症和抗原呈递调控中的作用 | 急性心脏同种异体移植排斥模型中的移植物巨噬细胞 | 单细胞组学，免疫学 | 同种免疫组织损伤，心脏移植排斥 | 单细胞RNA测序，CUT&Tag，RNA-seq，假时序分析 | NA | 文本，图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10 | 2026-09-13 |
Targeting IMPDH2 by Casticin attenuates psoriatic inflammation by suppressing STAT3 activation in keratinocytes
2026-Oct-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.117249
PMID:42567108
|
研究论文 | 该研究通过整合bulk和单细胞RNA测序数据，发现IMPDH2在银屑病角质形成细胞中上调，并揭示Casticin通过抑制IMPDH2-GTP-STAT3轴减轻银屑病炎症 | 首次识别IMPDH2为银屑病炎症的关键代谢调节因子，并揭示IMPDH2通过GTP依赖性激活STAT3信号促进角质形成细胞炎症的新机制，同时提名Casticin为银屑病治疗候选药物 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，缺乏临床试验数据验证Casticin在人类银屑病患者中的疗效和安全性 | 探究IMPDH2在银屑病角质形成细胞生物学和发病机制中的作用，并评估Casticin作为银屑病治疗药物的潜力 | 银屑病角质形成细胞、IMQ诱导的小鼠银屑病模型、患者皮肤活检样本 | 机器学习 | 银屑病 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 免疫荧光染色 | NA | 文本, 图像 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2026-09-13 |
KLF6-driven macrophage-to-myofibroblast transition promotes PD-L1-mediated immune evasion in bladder cancer
2026-Oct-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.117201
PMID:42574804
|
研究论文 | 该研究通过多组学分析揭示了膀胱癌中KLF6驱动的巨噬细胞向肌成纤维细胞转分化（MMT）通过上调PD-L1介导免疫逃逸的机制，并筛选出靶向KLF6-MMT轴的候选药物Periplocymarin | 首次对膀胱癌中的MMT进行多组学表征，识别KLF6为MMT的关键驱动因子，揭示KLF6驱动的MMT通过细胞间通讯上调肿瘤PD-L1，并通过虚拟筛选和分子对接发现Periplocymarin为靶向KLF6-MMT轴的候选化合物 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 表征膀胱癌中的MMT细胞，构建MMT基因签名，识别MMT的关键驱动因子，并筛选靶向KLF6-MMT轴的药物以克服免疫治疗耐药 | 膀胱癌患者样本及肿瘤模型 | 数字病理学 | 膀胱癌 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 空间伪时间分析, 体外过表达, 虚拟敲除, FIMO基序扫描, 体内肿瘤模型, 虚拟筛选, 分子对接 | NA | 图像, 文本 | TCGA-BLCA队列（408例肿瘤，19例正常），空间转录组学9个切片，两个独立免疫治疗队列（Kim 2019，n=348；IMvigor210，n=298） | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 12 | 2026-09-13 |
Screening of potential targets of (2S)-2'-methoxykurarinone against sepsis and in vivo verification in zebrafish model
2026-Oct-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.117200
PMID:42520680
|
研究论文 | 该研究通过生物信息学分析、临床样本验证和斑马鱼脓毒症模型，筛选(2S)-2'-甲氧基苦参酮抗脓毒症的潜在核心靶点并验证其体内药理功效 | 首次系统筛选(2S)-2'-甲氧基苦参酮抗脓毒症的核心靶点，结合多数据集整合、12种机器学习算法、SHAP可解释性分析和人工神经网络模型鉴定出五个核心基因（PRKCQ、DYRK2、CD2、BACH2、AAK1），并通过分子对接和LPS诱导斑马鱼脓毒症模型进行了体内药效验证 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 筛选(2S)-2'-甲氧基苦参酮抗脓毒症的潜在核心靶点，并通过生物信息学分析、临床样本验证和LPS诱导斑马鱼脓毒症模型探索其体内药理功效及潜在作用机制 | 脓毒症患者外周血样本、GEO转录组数据集（GSE310929等）、LPS诱导的斑马鱼脓毒症模型 | 机器学习 | 脓毒症 | 转录组测序、单细胞转录组分析、WGCNA、机器学习、分子对接 | 人工神经网络（ANN）、WGCNA、12种机器学习算法、SHAP | 文本（基因表达数据）、图像（斑马鱼表型观察） | 22例脓毒症患者和10例健康对照的外周血样本，以及多个GEO数据集 | NA | bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2026-09-13 |
Integrated single-cell and spatial transcriptomic atlas of multi-etiology acute lung injury reveals etiology-dependent neutrophil fate decisions and a prognostic neutrophil-monocyte/macrophage interaction signature
2026-Oct-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.117182
PMID:42520679
|
研究论文 | 该研究整合了七种不同病因急性肺损伤模型中小鼠肺部的单细胞与空间转录组数据，揭示了病因依赖的中性粒细胞命运决定，并构建了具有预后价值的中性粒细胞-单核/巨噬细胞互作特征 | 首次构建跨七种急性肺损伤病因的多病因中性粒细胞图谱，揭示了中性粒细胞从骨髓样未成熟起源向不同效应分支的病因依赖性分叉，并定义了26基因中性粒细胞-单核/巨噬细胞互作指数用于脓毒症死亡预后，同时验证了THBS1-CD36作为感染和内毒素驱动急性肺损伤的治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型，人体临床转化仍需进一步验证，且部分机制验证主要依赖体外实验和有限体内实验 | 构建多病因急性肺损伤的中性粒细胞综合图谱，解析不同病因下中性粒细胞的功能异质性及其与单核/巨噬细胞的互作，并寻找预后标志物和治疗靶点 | 七种急性肺损伤小鼠模型中的肺部免疫细胞，特别是中性粒细胞和单核/巨噬细胞 | 数字病理学, 机器学习 | 急性肺损伤/急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 图像, 文本 | 180,031个小鼠肺细胞，来自七种急性肺损伤模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | NA |
| 14 | 2026-09-13 |
Engineering functional ventral midbrain dopaminergic neurons in human organoids through WNT modulation and bioreactor culture
2026-Oct, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-026-03667-4
PMID:42310192
|
研究论文 | 该研究通过三阶段WNT调控结合动态生物反应器培养，构建了富含SNpc样多巴胺能神经元的人中脑类器官，并验证其作为帕金森病模型的潜力 | 将三阶段WNT调控与动态生物反应器培养相结合，显著提高了SNpc样多巴胺能神经元的产量和功能成熟度，并首次在该系统中验证了α-突触核蛋白预制纤维诱导的病理表型 | 摘要中未明确提及研究的具体局限性 | 建立一种能够高效生成功能性SNpc样多巴胺能神经元的人中脑类器官分化策略，并用于帕金森病相关病理机制研究 | 人诱导多能干细胞来源的中脑类器官及其中多巴胺能神经元 | 干细胞生物学、神经科学、类器官 | 帕金森病、神经精神疾病 | 单细胞转录组学、电生理记录、免疫荧光、生物反应器培养 | 人诱导多能干细胞来源的中脑类器官模型 | 单细胞转录组数据、电生理数据、图像数据 | 摘要中未提供具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2026-09-13 |
Effects of SSRIs on the spatial transcriptome of dorsal raphe serotonin neurons
2026-Oct, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-026-03644-x
PMID:42141080
|
研究论文 | 该研究利用空间转录组学技术分析了选择性5-羟色胺再摄取抑制剂（SSRIs）对小鼠背侧中缝核5-羟色胺神经元空间转录组的影响 | 首次在完整脑组织中对背侧中缝核进行空间转录组分析，揭示了6种不同的5-羟色胺能亚群及其独特的分子特征和空间分布，并发现了SSRI治疗对神经肽（Trh和Pdyn）的空间依赖性双向转录调控 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类中验证；样本量有限；仅使用了氟西汀一种SSRI药物 | 探究SSRI给药对5-羟色胺神经元的分子和转录效应，揭示SSRI在背侧中缝核中的作用机制 | 小鼠脑切片中的背侧中缝核及邻近中脑结构 | 空间转录组学 | 抑郁症 | 空间转录组学，原位杂交 | NA | 空间转录组数据，图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 16 | 2026-09-13 |
Spatial Transcriptomics Delineates the Inflammatory Landscape of Human Dental Pulp: Regional Crosstalk and Therapeutic Implications
2026-Oct, International endodontic journal
IF:5.4Q1
DOI:10.1111/iej.70200
PMID:42295016
|
研究论文 | 该研究利用Visium HD空间转录组技术，对健康和炎症牙髓组织进行空间细胞架构和分子互作分析，揭示牙髓炎的病理机制和潜在治疗靶点 | 首次利用空间转录组测序技术鉴定出牙髓中九种细胞群及其空间定位和细胞间通讯，并绘制了牙髓炎症图谱，揭示了APP抑制、CXCL14缺失和TGFβ激活驱动的细胞重塑是牙髓炎进展的核心机制 | 样本量较小，仅纳入两例健康个体和两例牙髓炎患者，属于初步的空间转录组基础研究，需要更大样本量验证 | 利用空间转录组技术研究健康和炎症牙髓的空间细胞架构和分子互作，阐明牙髓炎的病理机制并鉴定活髓治疗的潜在治疗靶点 | 健康和炎症的人牙髓组织 | 空间转录组学 | 牙髓炎 | 空间转录组测序 | NA | 空间转录组数据 | 4例牙髓组织样本（2例健康个体和2例牙髓炎患者） | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium HD | 10x Genomics Visium HD空间转录组平台 |
| 17 | 2026-09-13 |
Spatial transcriptomic decoupling and magnetic resonance imaging identify the genetic and cytoarchitectonic correlates of regional vulnerability in Alzheimer's disease
2026-Oct-01, NeuroImage
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.neuroimage.2026.122144
PMID:42486312
|
研究论文 | 通过关联MRI衍生的灰白质对比度与空间转录组学，识别阿尔茨海默病中区域脆弱性的遗传和细胞构筑相关性 | 将空间转录组学与神经影像学整合，识别AD相关基因与皮质脂质含量的关联，揭示基因-C耦合的改变 | 摘要中未明确提及研究限制 | 理解阿尔茨海默病中神经退行性变的遗传和细胞构筑因素，通过连接基因表达与宏观神经解剖特征 | 认知正常成人和阿尔茨海默病成人 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学，磁共振成像 | NA | 图像，文本 | NACC中2286人（CN=1443，AD=1443），ADNI中608人 | NA | 空间转录组学，磁共振成像 | NA | NA |
| 18 | 2026-09-13 |
Insights Into Spatial Transcriptomics: Exploring Recent Technical Developments and Their Diverse Applications
2026-Sep-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202502942RRR
PMID:42726466
|
综述 | 本文系统总结了四种主要的空间转录组学技术，对比分析了不同的研究方法，并探讨了其在多组学整合和疾病模型构建中的应用及未来发展方向 | 对四种主要空间转录组学技术进行了系统性的比较分析，并着重阐述了空间转录组学在多组学整合分析和疾病模型开发中的关键作用 | 空间转录组学仍面临对特定样本类型的依赖、可视化基因的分辨率限制、商业可行性以及获取全面单细胞数据的能力等挑战 | 总结空间转录组学的最新进展，比较分析不同技术方法，以改进实验设计和分析评估 | 空间转录组学技术及其在不同组织区域中的应用 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 19 | 2026-09-13 |
Spatial transcriptomics identifies a suppressive, T-cell-excluded tumor microenvironment in extramedullary myeloma
2026-Sep-22, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2026020500
PMID:42379250
|
研究论文 | 本文通过空间转录组学技术对髓外骨髓瘤肿瘤活检样本进行分析，揭示了免疫抑制性、T细胞排斥的肿瘤微环境特征 | 首次对髓外骨髓瘤进行空间转录组学分析，识别出三种复发性肿瘤微环境生态位（免疫排斥型、免疫抑制型、免疫允许型），揭示了生态位替代而非生态位独立的空间组织模式 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 表征髓外骨髓瘤的肿瘤微环境组织架构，探索其与骨髓限制性骨髓瘤微环境的差异 | 髓外骨髓瘤患者的肿瘤活检样本 | 空间转录组学 | 多发性骨髓瘤 | 空间转录组学 | 细胞间相互作用模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 20 | 2026-09-13 |
Single-cell mapping of homocysteine-induced perturbations in avian embryogenesis using LMO and BD rhapsody transcriptomics
2026-Sep-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.117392
PMID:42724731
|
研究论文 | 该研究结合脂质修饰寡核苷酸细胞标记与BD Rhapsody平台，对暴露于不同同型半胱氨酸条件的早期鸡胚细胞进行单细胞RNA测序，揭示了同型半胱氨酸诱导的转录扰动 | 将脂质修饰寡核苷酸（LMO）细胞标记与BD Rhapsody平台结合，实现跨物种的样本多重标记，可在同一批次中同时处理不同处理条件，减少批次效应，并发现数据整合可能掩盖敏感细胞群体的特异性转录特征 | 研究仅基于鸡胚模型，结论是否适用于其他物种或发育模型尚需验证；数据整合方法可能掩盖细微的生物学响应 | 利用单细胞转录组学技术研究同型半胱氨酸对禽类胚胎发育过程中细胞异质性和转录调控的影响 | 早期鸡胚尾部组织细胞，暴露于不同同型半胱氨酸条件 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | BD Biosciences | 单细胞RNA-seq | BD Rhapsody | BD Rhapsody单细胞分析系统结合脂质修饰寡核苷酸（LMO）细胞标记技术 |