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当前共找到 40345 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-06-11 |
A 4-guanidinobutanoic acid-SLC36A1 axis drives a microbiota‒host feedback loop to regulate intestinal homeostasis
2026-Dec-31, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2026.2639216
PMID:41782409
|
研究论文 | 本研究揭示了肠道微生物代谢物4-胍基丁酸通过SLC36A1轴驱动微生物-宿主反馈回路，调控肠道稳态 | 首次发现4-胍基丁酸作为关键调节因子，通过SLC36A1与Hedgehog信号通路增强肠道干细胞功能和杯状细胞分化，形成微生物-宿主反馈循环，并揭示其在溃疡性结肠炎中的诊断和治疗潜力 | NA（摘要未提供明确局限性信息） | 探究肠道微生物代谢物4-胍基丁酸在调节肠道稳态中的作用机制 | 肠道干细胞、杯状细胞、肠道屏障功能 | 机器学习 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序、非靶向代谢组学、类器官共培养、小鼠模型 | NA | 基因表达数据、代谢组学数据 | NA（未明确样本数量） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2 | 2026-06-11 |
Inferring gene regulatory networks via adversarially regularized directed graph autoencoder
2026-Aug, Neural networks : the official journal of the International Neural Network Society
IF:6.0Q1
DOI:10.1016/j.neunet.2026.108762
PMID:41775092
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研究论文 | 提出了一种通过对抗正则化有向图自编码器推断基因调控网络的方法 | 首次结合一阶和二阶邻近性捕获复杂拓扑，并利用对抗训练策略对基因表达数据进行先验分布正则化 | 未明确提及，但可能依赖于特定类型的先验分布假设或数据规模限制 | 开发一种能处理基因调控网络复杂拓扑且考虑基因表达数据非相同分布特性的推断方法 | 基因调控网络及其推断方法 | 机器学习 | NA | RNA-seq, scRNA-seq | 图自编码器，对抗正则化 | 基因表达数据 | DREAM5数据集和七个单细胞RNA测序数据集 | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3 | 2026-06-11 |
scMAG: Integrating single-cell multi-omics data via multi-stage deep fusion with manifold-aware gating
2026-Aug, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 提出了scMAG算法，一种通过多阶段深度融合与流形感知门控策略整合单细胞多组学数据的方法 | 创新性地提出了多阶段特征深度融合形式化方法，结合多核心流形保持与引导门控优化策略，实现了自适应对齐多组学潜在空间并优化数据分布 | 未明确提及局限性 | 提高单细胞多组学数据的聚类精度和可视化效果，同时实现多组学潜在空间的自适应对齐并抑制生物噪声与测量误差 | 单细胞多组学数据集，包括scRNA-seq、scATAC-seq和ADT数据 | 机器学习 | NA | 单细胞多组学测序 | 深度融合网络 | 单细胞多组学数据 | 配对数据集（scRNA-seq与scATAC-seq和ADT） | NA | 单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq、单细胞多组学 | NA | NA |
| 4 | 2026-06-11 |
Silencing Adamts2 attenuates fibroblast-mediated fibrosis and promotes axonal regeneration in an in vitro model
2026-Jul, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2026.112450
PMID:41785981
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研究论文 | 通过沉默Adamts2减轻成纤维细胞介导的纤维化并促进轴突再生 | 首次利用单细胞测序数据分析脊髓损伤后成纤维细胞的变化，筛选出特异性高表达基因Adamts2，并通过体外模型验证其作为靶点抑制纤维化、促进轴突再生的效果 | 研究基于体外模型，缺乏体内验证；未探讨Adamts2在其他细胞类型或信号通路中的作用 | 探究沉默Adamts2是否能减轻成纤维细胞介导的纤维化并促进轴突再生 | 小鼠脊髓成纤维细胞和运动神经元 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞测序、RNA干扰 | NA | 单细胞测序数据 | 小鼠脊髓损伤后的成纤维细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5 | 2026-06-11 |
Unveiling the impact of electroacupuncture on retinal cells in myopic guinea pigs via single-cell sequencing
2026-Jun, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2026.110954
PMID:41780836
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术系统揭示电针干预对近视豚鼠视网膜各类细胞功能特征的影响 | 首次通过单细胞测序技术全面解析电针调控近视豚鼠视网膜中Müller胶质细胞、视锥细胞和小胶质细胞的具体分子机制 | 未提及具体局限性 | 阐明电针干预通过调节视网膜细胞功能抑制近视进展的细胞机制 | 近视豚鼠的视网膜细胞，包括Müller胶质细胞、视锥细胞和小胶质细胞 | 生物信息学 | 近视 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、scMetabolism代谢差异分析、基因集富集分析（GSEA）、高维加权共表达网络分析（Hd-WGCNA）、伪时间轨迹分析、实时荧光定量PCR（qPCR）、Western blotting | NA | 单细胞转录组数据 | 近视豚鼠视网膜样本 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | NA |
| 6 | 2026-06-11 |
High MAP3K6 expression in spinal cord injury tissues enhances neuronal apoptosis: insights from multi-omics data integrating WGCNA, machine learning and experimental validation
2026-Jun, The International journal of neuroscience
DOI:10.1080/00207454.2026.2639364
PMID:41782555
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研究论文 | 通过多组学数据整合WGCNA、机器学习和实验验证，揭示MAP3K6在脊髓损伤组织中高表达并促进神经元凋亡 | 首次结合多组学分析、共表达网络、机器学习及体外实验，鉴定MAP3K6为脊髓损伤的关键调控因子，并验证其作为诊断标志物和治疗靶点的潜力 | 基于公共数据集分析，样本量有限，且体外实验仅在小鼠脊髓神经元细胞中进行，未在动物模型或人体组织进一步验证 | 探索脊髓损伤的分子机制及关键生物标志物 | 脊髓损伤组织样本和对照样本的基因表达数据，以及小鼠脊髓神经元细胞 | 机器学习 | 脊髓损伤 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, WGCNA, 随机森林 | WGCNA, 随机森林 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | GSE226238数据集（具体样本数未明确），外部验证集GSE151371，及小鼠脊髓神经元细胞 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2026-06-11 |
Locus-Specific Human Endogenous Retrovirus ERVK18 Expression Indicates an Inflamed Microenvironment and Favorable Immunotherapy Outcome in Small Cell Lung Cancer
2026-Jun-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-3302
PMID:41784525
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研究论文 | 本研究鉴定出位点特异性人内源性逆转录病毒ERVK18在小细胞肺癌中与炎症微环境和良好免疫治疗结果相关 | 首次发现特异性ERVK18转录本作为小细胞肺癌免疫治疗的双重预后和预测生物标志物，揭示其与免疫激活通路和T细胞细胞毒性的关联 | 未明确说明局限性 | 探究人内源性逆转录病毒HERV-K在小细胞肺癌中的功能角色，特别是与炎症微环境和免疫治疗结果的关联 | 小细胞肺癌患者肿瘤样本及免疫微环境 | 机器学习 | 肺癌 | RNA-seq，单细胞RNA测序，多重免疫组化，PhenoCycler-Fusion | NA | 图像，文本 | IMpower133队列271例，PKUPH队列40例，组织微阵列48例 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | 10x Chromium，PhenoCycler-Fusion | 10x Chromium用于单细胞RNA测序，PhenoCycler-Fusion用于多重免疫组化 |
| 8 | 2026-06-11 |
Dynamic Reprogramming of PDGFRA-Expressing Stromal Cells Facilitates WNT-Driven Transformation by Promoting a Fetal-Like State in the Intestinal Epithelium
2026-Jun-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-0101
PMID:41784677
|
研究论文 | 本研究揭示PDGFRA表达的成纤维细胞通过分泌配体促进肠上皮进入胎儿样状态，从而驱动WNT介导的肿瘤转化 | 首次阐明PDGFRA+成纤维细胞在WNT驱动的肿瘤发生早期动态重编程并促进肠上皮胎儿样状态，发现TGFβ信号在此过程中的关键作用 | 主要基于小鼠模型和体外类器官实验，缺乏人体组织样本验证；胎儿样状态与肿瘤形成的因果关系需进一步确认 | 探究PDGFRA+基质成纤维细胞在WNT介导的肠道肿瘤发生中的动态变化及其对上皮细胞状态的影响 | PDGFRA表达的成纤维细胞、WNT驱动的肿瘤上皮细胞、肠隐窝绒毛轴 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 9 | 2026-06-11 |
Multi-omics profiling reveals cholic acid-mediated immunosuppression driven by peritumoral ductular reactions in hepatocellular carcinoma
2026-May-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218393
PMID:41780844
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示肝细胞癌中导管反应介导的免疫抑制机制 | 首次整合人工智能病理学、单核多组学、空间转录组学和代谢组学，系统表征肝细胞癌瘤周导管反应，并发现胆酸通过NR1H4依赖性PD1上调诱导CD8 T细胞功能障碍 | 文章摘要未明确指出研究局限性 | 阐明肝细胞癌瘤周导管反应在疾病进展中的作用及其免疫抑制机制 | 肝细胞癌患者肿瘤组织及小鼠模型 | 机器学习 | 肝癌 | 多组学分析、人工智能病理学、单核多组学、空间转录组学、代谢组学 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单核多组学、空间转录组学 | NA | NA |
| 10 | 2026-06-11 |
Targeting FGFR1-regulated SPP1 signaling repolarizes immunosuppressive macrophages and sensitizes Hepatocellular Carcinoma to anti-PD-1 therapy
2026-May-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218361
PMID:41786278
|
研究论文 | 本研究揭示FGFR1通过调控SPP1信号使免疫抑制性巨噬细胞复极化，并增强肝细胞癌对抗PD-1治疗的敏感性 | 首次发现FGFR1在肝细胞癌免疫检查点阻断疗法耐药中的关键作用，并阐明其通过MAPK-SPP1轴调控肿瘤微环境的机制 | 主要基于小鼠模型和临床数据集分析，尚需进一步在大型临床试验中验证FGFR1作为生物标志物和治疗靶点的临床价值 | 探究FGFR1在肝细胞癌免疫检查点阻断疗法耐药中的作用及其机制 | 肝细胞癌小鼠模型及临床患者样本 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型及临床数据集中的肝细胞癌患者样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 11 | 2026-06-11 |
Di-(2-ethylhexyl) terephthalate promotes breast cancer progression: Multi-omics integrated experimental validation
2026-May-25, Chemico-biological interactions
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.cbi.2026.112002
PMID:41780785
|
研究论文 | 该研究整合多组学方法，系统分析了 DOTP 可能通过干扰细胞增殖、基因转录调控、肿瘤微环境及 PI3K-Akt-mTOR 通路来促进乳腺癌进展的致癌机制 | 首次结合网络毒理学、机器学习、分子对接、单细胞测序和空间转录组学等综合方法，系统评估 DOTP 的致癌风险，并通过实验验证其促增殖效应 | NA | 系统性评估 DOTP 的潜在致癌机制及风险 | DOTP（对苯二甲酸二异辛酯）及其影响的核心致癌基因和信号通路 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞测序, 空间转录组学, 分子对接 | NA | 基因表达数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 12 | 2026-06-11 |
Self-reinforcing IL-1β signaling accelerates the development and recurrence of TCF3::HLF-positive B-ALL
2026-May-21, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025031521
PMID:41774513
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研究论文 | 本研究通过建立新的小鼠模型，揭示TCF3::HLF阳性B细胞急性淋巴细胞白血病中自我强化的IL-1β信号网络驱动疾病进展和复发 | 首次建立能忠实再现人类TCF3::HLF B-ALL（包括溶骨性骨病变）的小鼠模型，并发现TCF3::HLF直接结合IL1B基因内含子调控元件，揭示自强化IL-1β信号作为疾病核心驱动机制 | 未提及具体限制 | 探究TCF3::HLF阳性B-ALL的疾病进展和复发机制 | TCF3::HLF阳性B细胞急性淋巴细胞白血病 | 计算机视觉 | B细胞急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 患者样本（诊断与复发配对） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2026-06-11 |
Targeting noncanonical nuclear factor kappa B signalling in CYLD cutaneous syndrome by selective inhibition of IκB kinase alpha
2026-May-19, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljag044
PMID:41779628
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研究论文 | 通过选择性抑制IκB激酶α靶向CYLD皮肤综合征中的非经典核因子κB信号 | 首次在CYLD皮肤综合征肿瘤角质形成细胞中发现非经典NF-κB信号激活，并鉴定IKKα为候选治疗靶点 | 主要基于患者来源的体外模型，缺乏体内实验和临床验证 | 探究CCS肿瘤中NF-κB信号通路，识别可药物靶向的分子 | CCS患者肿瘤细胞及肿瘤球体培养模型 | 医学研究 | CYLD皮肤综合征 | 转录组学,蛋白质组学,单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据,蛋白质组数据,单细胞转录组数据 | 患者来源的CCS肿瘤细胞分群和肿瘤球体培养 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2026-06-11 |
Spatial Transcriptomics Reveals Location-Specific Tumor Cell Subtypes and Signaling within Multifocal Small Intestinal Neuroendocrine Tumors
2026-May-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-2854
PMID:41779010
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研究论文 | 通过空间转录组学揭示多灶性小肠神经内分泌肿瘤中位置特异性的肿瘤细胞亚型及其信号通路 | 首次应用空间转录组学技术分析多灶性小肠神经内分泌肿瘤中肿瘤细胞亚型在不同解剖位置的特异性，并鉴定出四种基于位置的亚型及其独特的配体-受体相互作用网络 | 需要进一步验证，且样本量有限（4名患者） | 表征多灶性小肠神经内分泌肿瘤中肿瘤细胞群在不同解剖位点的表型，并识别影响肿瘤发展的局部微环境因素 | 多灶性小肠神经内分泌肿瘤患者 | 数字病理学 | 小肠神经内分泌肿瘤 | 空间转录组学 | 无监督聚类 | 图像 | 4名患者，72个组织微阵列核心 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 15 | 2026-06-11 |
Identification of Poor Prognosis-Associated Fibroblast Subpopulation Signature Genes Utilizing the Scissor Algorithm to Classify Colorectal Cancer Subtypes and Evaluate the Immune Landscape
2026-May-15, Gut and liver
IF:3.4Q2
DOI:10.5009/gnl250363
PMID:41787974
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研究论文 | 利用Scissor算法识别与结直肠癌预后相关的成纤维细胞亚群特征基因，并据此对结直肠癌亚型进行分类及评估免疫景观 | 首次利用Scissor算法整合单细胞与批量转录组数据，筛选出与结直肠癌极差预后显著相关的Scissor+成纤维细胞亚群，并揭示其激活促转移通路及免疫活化但功能耗竭的特征 | 未明确提及，但可能包括数据来源的偏倚、Scissor算法对细胞亚群识别的可重复性、以及预测标志物的临床验证需求 | 通过整合单细胞与批量转录组数据，识别与预后相关的成纤维细胞亚群特征基因，从而对结直肠癌进行亚型分类并评估其免疫景观 | 结直肠癌患者的批量RNA-seq数据、单细胞RNA-seq数据及临床信息 | 机器学习 | 结直肠癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Scissor算法 | 转录组数据, 单细胞转录组数据, 临床数据 | 来自TCGA和GEO数据库的多个结直肠癌数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 16 | 2026-06-11 |
Mapping cellular heterogeneity and dynamic interactions in pancreatic cancer
2026-May-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2026.114757
PMID:41780688
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在揭示胰腺导管腺癌中细胞异质性与动态相互作用方面的应用，包括样本制备、数据分析流程及治疗靶点发现 | 系统整合了scRNA-seq在解析PDAC肿瘤内异质性、微环境动态变化及生物标志物鉴定中的技术流程与关键发现，并探讨了联合免疫治疗策略 | 未提及Meta分析或计算方法的定量比较，对scRNA-seq技术在PDAC中的临床应用挑战讨论较为笼统 | 阐明单细胞转录组学在胰腺癌异质性及微环境研究中的应用价值与工作流程 | 胰腺导管腺癌肿瘤组织中的肿瘤细胞、免疫细胞、肿瘤相关成纤维细胞及微环境成分 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 17 | 2026-06-11 |
BPHL promotes TNBC stemness by resolving R-loops via POLR2A lactylation inhibition and BARD1-mediated ubiquitination
2026-May-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218388
PMID:41765360
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研究论文 | 本文揭示了BPHL通过抑制POLR2A乳酸化修饰和BARD1介导的泛素化来解析R-loop，从而维持三阴性乳腺癌干细胞的干性 | 首次发现BPHL通过调控R-loop稳态维持三阴性乳腺癌干细胞干性，并阐明了其通过POLR2A乳酸化抑制和BARD1介导的泛素化解决R-loop的分子机制 | 结果主要基于体外和动物模型，临床验证样本量有限 | 阐明三阴性乳腺癌干细胞中R-loop稳态的调控机制及BPHL的作用 | 三阴性乳腺癌干细胞和肿瘤样本 | 机器学习 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 26个乳腺癌样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 18 | 2026-06-11 |
Integrated Bulk and Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals Mitochondrial Transporter Gene Programs in Human Spermatogonial Stem Cells
2026-May, Stem cell reviews and reports
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s12015-026-11092-x
PMID:41770292
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研究论文 | 整合批量芯片和单细胞转录组数据分析揭示人类精原干细胞中线粒体转运蛋白基因程序 | 首次系统性描绘人类精原干细胞中线粒体转运蛋白（TOM/TIM复合体）和转运蛋白基因的转录谱，并识别关键枢纽基因和潜在miRNA调控机制 | 未在功能水平验证预测的miRNA调控关系，且样本量有限可能影响结果的普适性 | 阐明人类精原干细胞中线粒体转运蛋白基因的表达特征和调控网络 | 人类精原干细胞富集群体（每组3个生物学重复） | 机器学习 | NA | 微阵列芯片, scRNA-seq | WGCNA, STRING/cytoHubba, limma | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 3组生物学重复（微阵列芯片）和多个单细胞RNA-seq数据集 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 19 | 2026-06-11 |
SEAL: Semantic-Aware Contrastive Learning for scRNA-Seq Clustering
2026 May-Jun, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3669981
PMID:41774662
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研究论文 | 提出一种语义感知对比学习方法SEAL用于单细胞RNA测序数据聚类 | 首次将语义感知对比学习应用于scRNA-seq数据聚类，通过随机掩码生成增强数据并利用伪标签捕获语义不变表示 | 未明确说明局限性，但文中提到现有方法在高缺失率和噪声数据中无法完全捕获细胞内在特性，该方法可能仍面临类似挑战 | 开发一种稳定的无监督scRNA-seq聚类方法以准确区分不同细胞类型 | 单细胞RNA测序数据中的细胞 | 机器学习 | 不适用 | scRNA-seq | 对比学习（语义感知对比学习） | 基因表达数据 | 不适用 | 不适用 | 单细胞RNA-seq | 不适用 | 不适用 |
| 20 | 2026-06-11 |
Human umbilical cord mesenchymal stem cell-derived small extracellular vesicles accelerate diabetic wound healing by reprogramming fibroblast subpopulations and delivering pro-regenerative cargos
2026-May, Burns : journal of the International Society for Burn Injuries
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.burns.2026.107910
PMID:41775031
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研究论文 | 人脐带间充质干细胞来源的小细胞外囊泡通过重编程成纤维细胞亚群和递送促再生因子加速糖尿病伤口愈合 | 首次利用单细胞转录组测序和邻近条形码分析技术揭示了hUC-MSC-sEVs通过重编程成纤维细胞亚群（特别是Trps1+成纤维细胞）和递送功能特异的sEV亚群（如ITGB1富集亚群）的双重机制来加速糖尿病伤口愈合 | 未明确指出具体局限性 | 探究人脐带间充质干细胞来源的小细胞外囊泡在糖尿病伤口愈合中的作用机制 | 糖尿病小鼠伤口模型中的成纤维细胞和小细胞外囊泡亚群 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞转录组测序、批量RNA测序、邻近条形码分析、免疫荧光 | 未指定 | 基因表达数据 | 糖尿病小鼠（具体数量未提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |