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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1 2026-07-08
Integrative single-cell and spatial transcriptomic approaches to decipher the tumor microenvironment and therapeutic resistance in pancreatic cancer
2026-Dec-31, Cancer biology & therapy IF:4.4Q2
综述 综述单细胞RNA测序和空间转录组学在解析胰腺导管腺癌肿瘤微环境及治疗耐药中的应用 首次系统总结了scRNA-seq与ST技术整合在揭示胰腺癌异质性、基质-免疫相互作用及治疗耐药机制中的独特优势 未提及具体技术整合的挑战或方法局限性 探讨单细胞和空间转录组学整合方法如何促进胰腺癌的生物标志物发现和治疗策略开发 胰腺导管腺癌的肿瘤微环境 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 基因表达数据, 空间转录组数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium FFPE
2 2026-07-08
Identification of novel diagnostic biomarkers and host-directed drug screening for Mycobacterium avium infection: A multi-omics and artificial intelligence study
2026-Sep, SLAS discovery : advancing life sciences R & D IF:2.7Q2
研究论文 结合多组学和人工智能识别鸟分枝杆菌感染的新型诊断标志物并进行宿主导向药物筛选 首次通过单细胞RNA测序与机器学习整合分析,揭示鸟分枝杆菌感染中髓系细胞重编程的MIF-APP轴机制,并基于113种机器学习算法筛选出高精度诊断模型及潜在免疫调节剂Wogonin 依赖外周血样本,未验证组织或不同亚群中的免疫特征;临床验证样本量和动物模型数据有限 解析鸟分枝杆菌感染中的宿主免疫重塑机制,特别是髓系异质性,并识别精准诊断标志物与治疗靶点 鸟分枝杆菌感染患者的外周血样本 机器学习 鸟分枝杆菌感染 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 分子对接 Stepglm+GBM 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
3 2026-07-08
Polystyrene microplastics drive chondrotoxicity in osteoarthritis through inducing ER stress and apoptosis via NFKB1 activation
2026-Sep, Food and chemical toxicology : an international journal published for the British Industrial Biological Research Association IF:3.9Q1
研究论文 本研究结合网络毒理学和转录组学分析,发现聚苯乙烯微塑料通过激活NFKB1诱导内质网应激和细胞凋亡,从而加剧骨关节炎的软骨毒性 首次揭示聚苯乙烯微塑料通过NFKB1驱动内质网应激和凋亡通路促进骨关节炎进展的分子机制,并利用机器学习鉴定了六个潜在的早期诊断生物标志物 研究主要基于体外实验和单细胞RNA测序,缺乏体内动物模型验证,且NFKB1的上下游调控网络尚未完全阐明 阐明聚苯乙烯微塑料在骨关节炎发病机制中的作用及其分子通路 聚苯乙烯微塑料对软骨细胞的影响及骨关节炎相关分子机制 机器学习 骨关节炎 单细胞RNA测序、分子对接、动态模拟 机器学习模型、分子对接模型 转录组数据、单细胞RNA测序数据 未明确说明样本量,涉及网络毒理学分析和体外软骨细胞实验 NA 单细胞RNA测序 NA NA
4 2026-07-08
Integrated Multiomics Reveals Key Drivers and Immune Cell Phenotypes of Infrapopliteal Atherosclerosis and Calcification
2026-Sep, Annals of vascular surgery IF:1.4Q3
研究论文 整合多组学揭示膝下动脉粥样硬化和钙化的关键驱动因子及免疫细胞表型 首次整合bulk RNA-seq、单细胞RNA测序、空间转录组学和孟德尔随机化等多组学方法,鉴定出HLA-B是膝下动脉粥样硬化的关键致病基因,并识别出因果相关的免疫细胞表型 未提及具体局限性 识别驱动膝下动脉粥样硬化和钙化的关键基因和免疫细胞表型,开发靶向治疗策略 膝下动脉粥样硬化和钙化患者样本 机器学习 心血管疾病 bulk RNA-seq, scRNA-seq, ST, SMR, MR NA 转录组数据 NA NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
5 2026-07-08
Separable Decomposition for Ragged Tensors
2026-Aug, IEEE transactions on pattern analysis and machine intelligence IF:20.8Q1
研究论文 提出一种基于CP分解的几何感知可分离分解框架,用于直接分解多维不规则张量数据(即 ragged tensor) 首次引入二元加权张量模型描述ragged tensor的有效域,利用CP因子行与有效元素间的关联将全局目标解耦为独立、良态的子问题,并设计基于近邻交替最小化的闭式稳定更新算法,理论收敛有保障 未明确说明,需进一步阅读全文 发展能够处理多维不规则索引模式(ragged tensor)的张量分解方法 多光谱、高光谱图像以及空间转录组数据 机器学习 NA 张量分解 CANDECOMP/PARAFAC (CP) 分解 图像、空间转录组数据 多个挑战性数据集(具体数量未详述) NA 空间转录组学 NA NA
6 2026-07-08
Fusobacterium nucleatum-Derived Outer Membrane Vesicles Disrupt Epithelial Barrier in Oral Lichen Planus via JNK/c-JUN Mediated Claudin-4 Downregulation
2026-Aug, International dental journal IF:3.2Q1
研究论文 本研究揭示具核梭杆菌外膜囊泡通过JNK/c-JUN通路下调Claudin-4破坏口腔扁平苔藓上皮屏障 首次发现具核梭杆菌外膜囊泡通过激活JNK/c-JUN信号通路下调Claudin-4,揭示微生物驱动口腔扁平苔藓上皮屏障破坏的新机制 未开展体内动物模型验证实验,且主要基于体外细胞系研究,临床相关性需进一步验证 探究具核梭杆菌外膜囊泡在口腔扁平苔藓上皮屏障功能障碍中的作用机制 口腔扁平苔藓患者组织样本及HaCaT角质形成细胞 数字病理学 口腔扁平苔藓 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫组化, RNA测序, qPCR, Western blot NA 基因表达数据, 组织图像 口腔扁平苔藓病变组织样本(具体数量未提及) NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
7 2026-07-08
In Vitro Single-Cell Transcriptomic Profiling of Cultured Stem Cells From Apical Papilla and Dental Pulp Stem Cells: Unveiling Cellular Heterogeneity
2026-Aug, International dental journal IF:3.2Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序比较培养的根尖乳头干细胞和牙髓干细胞的细胞组成,揭示其细胞异质性和独特亚群 首次在单细胞水平上比较培养的根尖乳头干细胞和牙髓干细胞的转录组谱,发现了此前未表征的前体样亚群(簇9)共表达周细胞标志物和间充质基质细胞标志物,并识别出IGFBP3和IGFBP5在根尖乳头干细胞来源簇中特异性富集 基于培养细胞的转录相似性提出伪时间轨迹假设,而非验证性的谱系关系;需要后续使用NOTCH3+/PDGFRB+的前瞻性分离及体外体内功能验证来确认再生潜力 通过单细胞RNA测序比较培养的根尖乳头干细胞和牙髓干细胞的细胞组成,检测其不同再生行为背后的亚群,并识别有助于未来分离和功能靶向的标志物 来自3名人类供体的根尖乳头干细胞和牙髓干细胞,培养至第2代 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达谱 3名人类供体的根尖乳头和牙髓组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA 使用Seurat包进行降维和聚类,统一流形逼近与投影可视化
8 2026-07-08
UPR-CEBPB-MIF Signaling Links to Macrophage Polarization and an Immunosuppressive Tumor Microenvironment in Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2026-Aug, Annals of surgical oncology IF:3.4Q1
研究论文 该论文整合多组学数据,揭示了UPR-CEBPB-MIF信号轴与透明细胞肾细胞癌中巨噬细胞极化及免疫抑制性肿瘤微环境的关联 利用自编码器结合XGBoost鉴别UPR关键基因,并通过单细胞转录组分析映射UPR活性及免疫极化模式,首次阐明UPR-CEBPB-MIF信号轴在ccRCC免疫微环境中的作用 研究主要依赖公共数据库数据,需进一步实验验证信号轴的功能及临床转化潜力 解析UPR信号通路在ccRCC代谢重编程及免疫调控中的机制,并构建预后模型 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)肿瘤样本及细胞通信模式 机器学习 肾癌 多组学分析、单细胞转录组分析 自编码器、XGBoost、LASSO-Cox回归 基因表达数据、转录组数据 来自TCGA、GEO和ArrayExpress的多个队列样本 NA NA NA NA
9 2026-07-08
Multi-Omics Integration Reveals the Genetic Mechanisms of Periodontitis and Predicts Therapeutic Drugs
2026-Aug, International dental journal IF:3.2Q1
研究论文 该研究通过多组学整合分析揭示了牙周炎的遗传机制,并预测了潜在的治疗药物 首次整合GWAS、单细胞空间转录组学和单细胞RNA测序数据,利用人工智能驱动的药物筛选框架(DrugReflector)预测牙周炎的治疗化合物,并发现GNLY基因作为关键调控靶点 主要依赖公开数据集,药物预测结果需进一步的实验验证,且脑和肾脏组织的遗传富集机制仍需深入探索 系统解析牙周炎的遗传基础和关键调控因子,并预测潜在的治疗药物 牙周炎相关的遗传信号、免疫细胞亚群(单核细胞和自然杀伤细胞)及基因(如GNLY) 数字病理学 牙周炎 GWAS, 单细胞空间转录组学, 单细胞RNA-seq, Mendelian Randomization, 分子对接 NA 基因组数据, 单细胞转录组数据 基于Gene-Lifestyle Interactions in Dental Endpoints和FinnGen R11队列的GWAS摘要统计,以及单细胞空间转录组学和单细胞RNA测序数据,具体样本数量未明确 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 10x Chromium, Illumina NovaSeq 10x Chromium单细胞RNA测序和空间转录组学平台,Illumina NovaSeq测序平台
10 2026-07-08
Mitochondrial Metabolic Biomarkers in Periodontitis: Discovery and Clinical Validation
2026-Aug, International dental journal IF:3.2Q1
研究论文 通过综合生物信息学技术鉴定牙周炎中线粒体代谢相关生物标志物,并验证其诊断价值 首次通过整合转录组和单细胞RNA测序数据及机器学习方法,鉴定并临床验证了与牙周炎相关的线粒体代谢生物标志物,并构建了高诊断效能的列线图 未明确提及,可能缺乏大规模前瞻性队列验证 识别牙周炎中线粒体代谢相关的关键生物标志物并评估其诊断潜力 牙周炎患者及大鼠模型 机器学习 牙周炎 RNA测序,单细胞RNA测序,反转录定量聚合酶链反应,免疫组织化学,Western blot分析 机器学习模型,列线图 转录组数据,单细胞RNA测序数据 临床样本(未明确数目)及大鼠模型样本 NA 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 NA NA
11 2026-07-08
Multi-Omics Framework Integrating Genetics, Microbiome, Metabolism, and Immunity for Deciphering Ulcerative Colitis Pathogenesis and Diagnostic Biomarker Discovery
2026-Jul-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 通过多组学框架整合遗传、微生物组、代谢和免疫因素,揭示溃疡性结肠炎发病机制并发现诊断生物标志物 首次将孟德尔随机化与单细胞及空间转录组学相结合,系统评估多组学因素与溃疡性结肠炎的因果关联,并发现Neutrophil_IFITM2细胞亚群及其潜在调控轴 孟德尔随机化分析基于GWAS汇总数据,可能存在未测量的混杂因素,且IFITM2敲低实验仅在体外巨噬细胞系中进行,缺乏体内验证 系统评估与溃疡性结肠炎易感性相关的多组学因素并识别可靠的诊断生物标志物 溃疡性结肠炎患者及健康对照的遗传数据、肠道微生物组、循环代谢物、免疫细胞表型及临床组织样本 机器学习, 数字病理学 溃疡性结肠炎 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, qRT-PCR, siRNA敲低 随机森林 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 多个转录组数据集、独立临床组织样本及THP-1来源的巨噬细胞 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
12 2026-07-08
Interleukin-6 is critical in the development of pulmonary vascular disease in Gcn2-deficient mice
2026-Jul-14, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 研究揭示了GCN2缺失导致小鼠肺血管疾病中白细胞介素-6的关键作用 首次通过单细胞RNA测序鉴定出外膜成纤维细胞是GCN2缺失后转录变化最显著的细胞群,并证明IL-6是GCN2缺失和丝裂霉素C引发肺血管疾病的关键介质 未提及样本量及人类验证数据 探究GCN2缺乏与肺血管病理之间的关联机制 Gcn2基因敲除小鼠和丝裂霉素C诱导的肺血管疾病小鼠模型 数字病理学 肺血管疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
13 2026-07-08
Nav1.5 in the dorsal root ganglion plays a crucial role in mechanical hypersensitivity
2026-Jul-07, Brain : a journal of neurology IF:10.6Q1
研究论文 本研究揭示Nav1.5在背根神经节中主要负责机械敏感性,并影响神经病理性疼痛和内脏痛模型中的机械超敏反应 首次发现传统认为的心脏钠通道Nav1.5在躯体感觉系统中作为机械敏感性的关键决定因子,并证实其在TrkB阳性A纤维神经元中的特异性表达和功能 NA 探究Nav1.5在初级感觉神经元中对机械敏感性和疼痛调控的作用 背根神经节中的TrkB阳性A纤维神经元 神经科学 疼痛相关疾病 单细胞RNA测序, 免疫染色, 条件性基因敲除 NA 单细胞转录组数据, 免疫荧光图像 小鼠模型(具体数量未提及) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 单细胞RNA测序分析背根神经节细胞
14 2026-07-08
Dissecting cellular heterogeneity across two ocular melanoma subtypes by single-cell RNA sequencing
2026-Jul-07, Melanoma research IF:1.5Q4
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示两种眼部黑色素瘤亚型的细胞异质性 首次在单细胞水平上对葡萄膜黑色素瘤和结膜黑色素瘤两种眼部黑色素瘤亚型进行全面比较,揭示其肿瘤细胞和免疫微环境的差异 NA 探究两种眼部黑色素瘤亚型在单细胞水平的肿瘤细胞和微环境异质性 28个眼部黑色素瘤样本,包括14个葡萄膜黑色素瘤和14个结膜黑色素瘤样本 NA 眼部黑色素瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 28个眼部黑色素瘤样本(14个葡萄膜黑色素瘤,14个结膜黑色素瘤) NA 单细胞RNA测序 NA NA
15 2026-07-08
Sirtuin 1 deficiency mediates chronic kidney disease-induced inflammaging cardiovascular calcification
2026-Jul-07, Molecular biomedicine IF:6.3Q1
研究论文 整合群体分析、单细胞转录组学、遗传推断和功能实验,揭示SIRT1缺乏在慢性肾病诱导的主动脉瓣钙化中通过代谢-炎症耦合机制发挥核心作用,并鉴定司美格鲁肽为潜在治疗药物 首次整合群体水平数据、单细胞转录组学和孟德尔随机化等方法,系统阐明SIRT1-NF-κB-NLRP3轴在CKD相关CAVD中的关键作用,并发现GLP-1受体激动剂司美格鲁肽可恢复SIRT1/NLRP3平衡,为治疗提供新策略 未充分描述动物模型与人类病变的差异、样本量有限、机制验证主要依赖体外实验和动物模型需进一步临床转化验证 探究慢性肾病加速钙化性主动脉瓣疾病的分子机制 人类主动脉瓣组织、瓣膜间质细胞、UK Biobank人群数据、大鼠模型 机器学习, 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据, 遗传数据, 人群队列数据 UK Biobank大规模人群数据、人类主动脉瓣单细胞样本(具体数量未说明) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序平台进行人类主动脉瓣单细胞转录组分析
16 2026-07-08
Multi-layer network biology combined with single-cell evidence reveals core regulatory nodes in atherosclerotic plaques and potential drug-targeting directions
2026-Jul-07, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
研究论文 本研究整合多层网络生物学与单细胞证据,揭示动脉粥样硬化斑块中的核心调控节点及潜在药物靶向方向 首次将多层网络分析与单细胞RNA测序证据相结合,识别出七个核心枢纽基因(SMAD4、CASP8、PARP1、CRKL、CDK6、VDAC1、KHDRBS1),并发现槲皮素通过多靶点调控这些基因发挥内皮保护作用 研究基于公共数据集,未进行大规模临床样本验证,且体外实验仅使用oxLDL诱导模型,未在动物模型中验证 解析动脉粥样硬化斑块形成中的核心调控网络并识别潜在治疗靶点 动脉粥样硬化患者的斑块组织、单细胞转录组数据及oxLDL诱导的细胞模型 机器学习(如WGCNA、PPI网络分析)与计算机生物学的交叉应用 动脉粥样硬化 NGS(公共数据集:GSE43292、GSE159677) NA 基因表达数据(bulk RNA-seq)、单细胞转录组数据(scRNA-seq) 32名患者的配对斑块组织(包括晚期斑块和早期病变组织) 10x Genomics 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 10x Chromium 10x Chromium单细胞平台用于scRNA-seq数据(GSE159677)的分析
17 2026-07-08
Angiocrine factors in tumor microenvironment: bidirectional crosstalk, mechanistic insights, and therapeutic strategies
2026-Jul-07, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
综述 综述肿瘤微环境中血管分泌因子的双向串扰、机制见解和治疗策略 系统总结了血管分泌因子在肿瘤进展中的关键功能域,包括Notch和Wnt信号通路及其串扰网络,并强调“一靶多效”治疗策略的潜力 血管分泌因子网络的复杂性和冗余性限制了抗血管治疗的效果,且“一靶多效”策略面临挑战 深入理解血管分泌因子的功能特征和调控机制,为癌症治疗寻找有效靶点 肿瘤微环境中的血管分泌因子及其与肿瘤细胞、内皮细胞的相互作用 NA 肿瘤 NA NA NA NA NA NA NA NA
18 2026-07-08
Integration of bulk RNA-seq and scRNA-seq reveals cell subsets and gene signatures associated with Glaesserella parasuis infection
2026-Jul-07, BMC genomics IF:3.5Q2
研究论文 整合批量RNA-seq和单细胞RNA-seq揭示了与副猪嗜血杆菌感染相关的细胞亚群和基因特征 首次在单细胞分辨率下对副猪嗜血杆菌感染中的巨噬细胞异质性进行多组学解析,识别了与疾病严重程度相关的保护性和致病性细胞程序 未明确提及局限性,但研究基于猪肺泡巨噬细胞模型,可能无法完全反映体内复杂免疫环境 理解副猪嗜血杆菌感染中不同临床结果(从无症状携带到致死性疾病)的分子机制 猪肺泡巨噬细胞 机器学习和生物信息学 副猪嗜血杆菌感染 批量RNA-seq和单细胞RNA-seq NA RNA测序数据(bulk和单细胞) 超过98,000个猪肺泡巨噬细胞,来自对照、轻度和严重感染组 NA 单细胞RNA-seq和批量RNA-seq NA NA
19 2026-07-08
Single-cell and spatial omics in plants: from cellular atlases to regulatory mechanisms
2026-Jul-07, Journal of experimental botany IF:5.6Q1
综述 综述单细胞与空间组学技术在植物研究中的应用,从细胞图谱构建到调控机制解析的进展与挑战 系统总结了植物单细胞研究的技术现状,并提出了未来在木本多年生植物和能源作物中的应用方向 未提及具体实验验证的局限性,主要基于文献综述,可能缺乏对某些新兴技术的深入讨论 概述植物中单细胞与空间组学技术的现状,讨论实验与分析挑战,并展望未来应用 植物(包括草本植物、木本多年生植物和能源作物) 数字病理学 NA 单细胞RNA测序,空间组学,染色质可及性分析,蛋白质组学,代谢组学 网络分析与基因调控网络重建框架 单细胞转录组数据,空间组学数据,多组学整合数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 单细胞RNA测序微流控与文库制备平台
20 2026-07-08
Pleural Fluid Cytology Detects Small Cell Carcinoma Transformation in EGFR-Mutant Lung Adenocarcinoma: A Case Report
2026-Jul-07, Diagnostic cytopathology IF:1.0Q4
病例报告 通过胸腔积液细胞学检测发现EGFR突变肺腺癌向小细胞癌转化 首次通过胸腔积液细胞学结合分子分析,以微创方式监测EGFR突变肺腺癌对EGFR-TKIs获得性耐药后的小细胞转化 仅为一例病例,需要更多研究验证 展示胸腔积液细胞学在检测EGFR突变肺腺癌小细胞转化中的应用价值 一名65岁EGFR突变肺腺癌女性患者 数字病理学 肺癌 细胞学, 免疫组织化学, 分子检测, 单细胞测序 NA 图像, 文本 1例患者 NA NA NA NA
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