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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-11-15 |
FlyAnatoView: Visualization of Drosophila Single-cell RNA-seq Datasets on Anatomographs
2026-Nov-14, G3 (Bethesda, Md.)
DOI:10.1093/g3journal/jkag309
PMID:43031443
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研究论文 | 该论文开发了FlyAnatoView,一个将果蝇单细胞RNA-seq数据投射到解剖图上的可视化资源,以恢复细胞的空间上下文 | 将单细胞转录组数据与解剖图结合,恢复组织解离丢失的空间关系,提供直观的基因表达模式探索方式 | 仅针对果蝇,依赖于已有的解剖图,可能无法直接推广到其他物种;未提及是否整合空间转录组数据验证 | 解决单细胞RNA-seq中组织解离导致空间信息丢失的问题,帮助解释基因表达模式与组织解剖结构的关系 | 果蝇(Drosophila melanogaster)的单细胞RNA-seq数据集 | 生物信息学,单细胞分析,可视化 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 单细胞基因表达数据,图像(解剖图) | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2026-11-15 |
CROST 2.0: an expanded repository of spatial transcriptomics
2026-Nov-14, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag1190
PMID:43031546
|
研究论文 | 该论文介绍了CROST 2.0,一个扩展的空间转录组学数据库,提供了544个项目、3538个样本,并新增了空间微环境分析框架和在线细胞类型注释工具 | 样本量扩展近三倍;新增空间共定位和空间变异癌症基因资源;引入生态位相关差异表达、空间基因集活性分析、空间交互热点和主题分析、分子和细胞类型生态位分析等分析框架;提供空间比较功能和癌症生态位差异表达模块;整合SCType在线细胞类型注释工具 | 摘要中未明确说明 | 构建一个集成的空间转录组学资源,用于表征空间微环境、研究癌症相关空间特征以及比较样本间的空间模式 | 空间转录组学数据集和样本 | 空间转录组学 | 癌症 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 544个项目、3538个样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3 | 2026-11-15 |
Luteolin and Naringenin from Herbal Medicines Suppress Pulmonary Arterial Smooth Muscle Cell Hyperproliferation in Pulmonary Arterial Hypertension by Modulating IGF1R/PI3K/AKT Signaling
2026-Nov-08, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms272110018
PMID:43028262
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研究论文 | 该研究通过UHPLC-Q-Exactive MS分析草药复方GLTL的化学成分,结合网络药理学、转录组学与单细胞RNA测序,发现木犀草素和柚皮素通过靶向IGF1R抑制PI3K/AKT信号通路,从而抑制PDGF-BB刺激的肺动脉平滑肌细胞增殖并促进凋亡 | 首次从GLTL中鉴定出木犀草素和柚皮素作为抗PAH活性成分,并首次通过CETSA和DARTS实验证实二者直接结合IGF1R,揭示其抑制PASMC增殖的新机制 | 研究仅基于体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证;未进行临床试验评估其安全性和有效性 | 从经验有效的草药复方GLTL中发现抗肺动脉高压的活性成分并阐明其作用机制 | 草药复方GLTL及其化学成分、PDGF-BB刺激的肺动脉平滑肌细胞(PASMCs) | 药物发现与网络药理学 | 肺动脉高压 | UHPLC-Q-Exactive MS、RNA测序、单细胞RNA测序、网络药理学、分子对接、分子动力学模拟、细胞热转移实验(CETSA)、药物亲和靶稳定性实验(DARTS) | NA | 化学质谱数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据、文本数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2026-11-15 |
Hypoxia-Associated Glycolytic-Lipogenic Reprogramming and Impaired Antigen Presentation in SPP1+ Tumor-Associated Macrophages in Ovarian Cancer
2026-Nov-05, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27219904
PMID:43028149
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和空间转录组分析,揭示了卵巢癌中SPP1+肿瘤相关巨噬细胞在缺氧微环境下的糖酵解-脂质合成重编程及抗原呈递功能受损的特征 | 结合单细胞和空间转录组,首次系统刻画SPP1+ TAM作为一种缺氧相关功能状态,并揭示其糖酵解-脂质合成重编程和MHC II类分子下调 | 缺乏蛋白质水平和功能验证,未直接检验HIF1A依赖性 | 确定SPP1是否标记卵巢癌中离散的TAM亚群或功能状态,定义其转录和代谢程序,并检验局部缺氧与其的关联 | 治疗初治的高级别浆液性卵巢癌患者肿瘤样本及ID8同系小鼠模型 | 单细胞转录组学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 基因表达数据, 图像 | 47例患者,385,504个细胞;TCGA-OV队列429例;8个空间转录组切片;ID8小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 10x Visium | Seurat v5和Harmony用于聚类和批次校正;Visium空间转录组(GSE263920) |
| 5 | 2026-11-15 |
scLAP: A Liver-Adapted Contrastive Shared-Latent Framework for Pseudo-Pairing Single-Cell Transcriptomes and Chromatin Accessibility Profiles
2026-Nov-04, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27219888
PMID:43028133
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研究论文 | 提出了一种适应肝脏的对比共享潜在框架scLAP,用于跨研究单细胞转录组和染色质可及性谱的伪配对 | 开发了肝脏适应的对比共享潜在框架,整合了转录因子基序活性评分和潜在语义索引成分,实现了跨研究的RNA-ATAC伪配对 | 精确配对检索率有限,对未见样本的泛化能力不足,与其它方法的比较仅限于特定研究 | 解决肝细胞癌中配对单细胞RNA-seq和scATAC-seq数据有限的问题,实现跨研究的RNA-ATAC伪配对 | 肝细胞癌的单细胞转录组和染色质可及性数据 | 单细胞多组学 | 肝癌 | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | 对比学习, 共享潜在空间模型 | 单细胞转录组数据, 单细胞ATAC-seq数据 | 3235个细胞(测试集),以及独立HCC数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 6 | 2026-11-15 |
Single-Cell RNA Sequencing of Human Lamina Cribrosa Fibroblasts in Glaucoma
2026-Nov-04, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27219892
PMID:43028138
|
研究论文 | 该研究首次利用单细胞RNA测序技术表征青光眼患者筛板成纤维细胞的转录组变化,揭示其促纤维化转录谱及整合应激反应特征 | 首次对人类青光眼筛板细胞进行单细胞RNA测序,鉴定出肌成纤维细胞基因、EMT相关促纤维化转录程序及细胞周期信号通路、转录因子调控元件和应激反应基因的表达增加 | 样本量有限,仅分析了6131个筛板细胞,未提及具体供体眼数量,且体外药物处理实验的临床转化意义尚需进一步验证 | 表征青光眼与正常眼人类筛板细胞的转录变化,识别参与视神经乳头重塑的信号通路 | 青光眼和正常供体眼的筛板细胞 | 数字病理学 | 青光眼 | 单细胞RNA测序 | Seurat、SingleR、GSEA、i-cisTarget | 单细胞转录组数据 | 6131个筛板细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7 | 2026-11-15 |
From Glomerular Endothelial Remodeling to Kidney Protection: Emerging Molecular Mechanisms and Biomarker Signatures of GLP-1 Receptor Agonists
2026-Nov-04, Diagnostics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/diagnostics16213645
PMID:43028516
|
综述 | 本文综述了GLP-1受体激动剂肾脏保护作用的临床与机制证据,聚焦于肾小球内皮重塑、炎症信号、线粒体功能障碍及细胞外基质周转,并探讨了新兴分子机制与生物标志物特征 | 整合了FLOW和REMODEL等最新临床试验结果,结合单核RNA测序和空间转录组学等分子分析,提出微血管重塑可能贡献于肾脏保护,并系统讨论了超越传统肾功能和白蛋白尿指标的新型蛋白质组学和细胞外基质生物标志物 | GLP-1受体在肾小球内皮细胞中的直接表达仍有待确认,实验系统中鉴定的通路在人类肾脏疾病中的因果作用尚未证实,REMODEL试验未在共同主要影像终点上显示显著改善 | 批判性总结GLP-1受体激动剂肾脏保护的临床和机制证据,阐明从肾小球内皮重塑到肾脏保护的分子机制及生物标志物特征 | 糖尿病患者的肾脏保护、肾小球内皮细胞、GLP-1受体激动剂(如司美格鲁肽) | 数字病理 | 糖尿病肾病 | 单核RNA测序,空间转录组学,蛋白质组学 | NA | 文本,图像,分子数据 | NA | NA | 单核RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 8 | 2026-11-15 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis of Rat Urethral Tissue Following Simulated Childbirth Injury and Microenergy Acoustic Pulse Therapy
2026-Nov-03, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27219833
PMID:43028081
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序分析模拟分娩损伤及微能量声脉冲治疗对大鼠尿道组织转录组的影响 | 首次在单细胞水平上系统解析微能量声脉冲治疗对分娩相关尿道损伤后尿道微环境的多细胞效应 | 研究结果仅为描述性和假设生成性,样本量小(每组仅两只大鼠),单细胞数据的UMAP仅为描述性,肌肉含量差异来自独立的组织学分析,需在独立重复队列中验证 | 探索微能量声脉冲治疗对分娩相关尿道损伤后尿道微环境的治疗和损伤相关差异 | 八只雌性Sprague-Dawley大鼠的尿道组织 | 单细胞转录组学 | 分娩相关尿道损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、组织学图像数据 | 8只大鼠(每组2只,共4组),单细胞数据集包含23,128个细胞 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2026-11-15 |
TSPO and LRBA Expression Is Associated with Acute Renal Allograft Rejection: An Integrative Transcriptomic Analysis
2026-Nov-02, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27219830
PMID:43028077
|
研究论文 | 该研究通过整合公共肾移植转录组数据集,结合差异表达分析、WGCNA和机器学习,识别出与急性肾移植排斥相关的线粒体自噬基因TSPO和LRBA,并在多个队列和小鼠模型中验证其表达及临床关联 | 首次发现线粒体自噬相关基因TSPO和LRBA与急性肾移植排斥相关,构建了TSPO/LRBA双基因模型,并结合单细胞分析、虚拟敲除和qPCR验证其与单核/巨噬细胞及免疫通路的关联 | TSPO/LRBA双基因模型区分排斥与非排斥样本的效能有限,属于探索性分析,需要更大规模的前瞻性研究验证其临床实用性 | 探究线粒体自噬相关基因与急性肾移植排斥的关系,寻找潜在的生物标志物 | 肾移植受者的活检组织转录组数据及外周血样本,以及小鼠肾移植模型 | 转录组学 | 肾移植排斥 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 定量PCR | 机器学习模型 | 转录组数据, 基因表达数据 | 多个公共肾移植活检队列(具体样本量未在摘要中说明),外部队列,以及小鼠肾移植模型 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 定量PCR | NA | NA |
| 10 | 2026-11-15 |
Vitamin K3 (Menadione) Targets TBK1 to Enhance the Efficacy of Pirfenidone in a Mouse Model of Bleomycin-Induced Pulmonary Fibrosis
2026-Oct-30, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27219739
PMID:43027987
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研究论文 | 该研究通过整合单细胞转录组学与Drug2Cell算法筛选出维生素K3(甲萘醌)作为肺纤维化候选药物,并验证其与吡非尼酮联用可增强抗纤维化疗效,机制上VK3靶向TBK1 | 首次将单细胞转录组学与Drug2Cell算法结合进行单细胞分辨率的药物优先级排序;发现VK3的抗纤维化活性不依赖于转化为维生素K2;首次通过热蛋白质组分析鉴定TBK1为VK3的主要靶点,并通过生物层干涉和差示扫描荧光法证实纳摩尔级直接结合;提出VK3作为吡非尼酮辅助用药的新策略 | VK3具有剂量依赖性细胞毒性,不能直接作为单药临床使用;研究主要基于细胞和动物模型,尚需进一步临床验证;需进行先导化合物优化以获得更安全的抗IPF药物 | 寻找新型抗特发性肺纤维化治疗策略,通过单细胞分辨率药物筛选鉴定候选药物,并探索其与现有抗纤维化药物吡非尼酮联用的增效作用及分子机制 | 特发性肺纤维化(IPF);博来霉素刺激的A549细胞;博来霉素诱导的小鼠肺纤维化模型 | 数字病理, 机器学习 | 肺纤维化 | 单细胞转录组学, 热蛋白质组分析, 分子对接, 分子动力学模拟, 生物层干涉, 差示扫描荧光法 | Drug2Cell | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11 | 2026-11-15 |
Integrative Single-Cell and Radiomics Analyses Identify N-Acetylneuraminate Synthase (NANS)-High Signature Associated with Adverse Prognosis and Immune Remodeling in Glioblastoma
2026-Oct-28, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27219635
PMID:43027883
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研究论文 | 该研究结合单细胞和bulk转录组分析与MRI影像组学,鉴定出NANS高表达巨噬细胞特征与胶质母细胞瘤不良预后及免疫重塑相关,并构建影像组学模型无创预测该特征状态 | 首次将NANS鉴定为胶质母细胞瘤中预后相关的巨噬细胞相关生物标志物,揭示NANS高表达骨髓来源巨噬细胞的免疫重塑功能及LGALS9为中心的细胞通讯程序,并创新性地构建MRI影像组学模型实现对该细胞状态的无创预测 | 影像组学模型样本量有限,仅基于TCGA-GBM单一队列建模,外部验证不足,缺乏实验功能验证,且为回顾性研究 | 表征NANS在胶质母细胞瘤中的预后和免疫相关性,并开发MRI影像组学模型无创预测NANS高表达骨髓来源巨噬细胞状态的肿瘤 | 胶质母细胞瘤患者肿瘤样本及影像数据 | 数字病理, 影像组学, 单细胞分析 | 胶质母细胞瘤 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序, MRI影像组学 | 弹性网络逻辑回归, CellChat细胞通讯分析 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 图像 | TCGA-GBM和两个CGGA队列(具体样本量未在摘要中说明) | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2026-11-15 |
An Epigenetically Remodeled EMT-Inflammatory Clone Associated with Spatial Immune Exclusion in Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2026-Oct-28, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27219668
PMID:43027916
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研究论文 | 该研究整合单细胞RNA测序、配对单细胞ATAC测序、空间转录组学及多个批量队列,识别出驱动透明细胞肾细胞癌进展并导致空间免疫排斥的恶性亚群AEIC | 首次鉴定出同时激活EMT和炎症程序的侵袭性EMT-炎症克隆(AEIC),揭示其以ZEB1为中心的染色质可及性网络,并发现AEIC富集区域形成富含细胞外基质的屏障导致NK_CD16-细胞空间排斥,同时构建了16基因预后特征并预测药物敏感性 | 摘要中未明确说明研究的具体局限性 | 识别驱动透明细胞肾细胞癌空间免疫排斥的恶性细胞亚群并阐明其分子特征与临床相关性 | 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)肿瘤样本及恶性细胞亚群 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学, 批量转录组测序 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 13 | 2026-11-15 |
Integrated Transcriptomic Analysis Identifies a Ferroptosis-Related Gene Signature Underlying Macrophage Heterogeneity and Immune Dysregulation in Rheumatoid Arthritis Synovium
2026-Oct-26, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27219552
PMID:43027808
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研究论文 | 通过整合批量与单细胞转录组分析,鉴定出由六个铁死亡相关基因组成的诊断特征,并揭示其在类风湿关节炎滑膜巨噬细胞异质性和免疫失调中的作用 | 整合批量转录组、单细胞RNA测序、拟时序、CellChat和虚拟基因扰动分析,将铁死亡相关基因特征定位到滑膜巨噬细胞,并提出其与线粒体氧化磷酸化网络及NF-κB/TNF/IL-17炎症终末状态的关联 | RA与健康样本未能完全独立于数据集来源,单细胞发现具有假设生成性质;虽去除性染色体基因后虚拟扰动结果仍稳健,但仍不能完全排除残余的性别相关效应 | 鉴定稳健的铁死亡相关生物标志物,并通过整合转录组框架界定其细胞背景与功能 | 类风湿关节炎患者及健康对照(并以骨关节炎对照验证)的滑膜组织转录组与单细胞数据 | 数字病理学, 机器学习 | 类风湿关节炎 | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 生物信息学分析(WGCNA、伪时序、CellChat、虚拟基因扰动) | NA | 文本(基因表达矩阵), 单细胞转录组数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 14 | 2026-11-15 |
Spatial Transcriptomics in Chronic Rhinosinusitis: Deciphering Tissue Architecture, Immune Niches, and Precision Therapeutics
2026-Oct-24, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27219510
PMID:43027759
|
综述 | 本文综述了空间转录组学在慢性鼻窦炎(CRS)研究中的应用,围绕从空间生态位到分子特征、机制、表型/内型、临床意义及治疗相关性的转化链条进行证据分级总结 | 提出以"空间生态位→分子特征→生物学机制→CRS表型/内型→临床意义→治疗相关性→验证状态"为核心的证据分级框架,并将直接CRS空间转录组证据与单细胞RNA测序支持、计算预测、蛋白或原位证据、实验扰动、临床验证及跨疾病外推明确区分 | 多数配体-受体推断仍为预测性,空间关联本身不能确立功能因果性,临床承诺(生物标志物筛选、生物制剂匹配、疗效监测)仍需独立队列、锁定检测、患者层面可重复性及前瞻性结局研究验证 | 系统梳理空间转录组学在慢性鼻窦炎组织构筑、免疫生态位及精准治疗中的研究进展与转化前景 | 慢性鼻窦炎(CRS)患者的鼻腔鼻窦组织及相关炎症微环境 | 空间转录组学 | 慢性鼻窦炎 | 空间转录组学 | NA | RNA空间表达数据、蛋白空间数据、图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 15 | 2026-11-15 |
Machine Learning-Based Screening and Experimental Validation of PIK3C2A as a Candidate Angiogenesis-Related Molecule in Pulmonary Hypertension
2026-Oct-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27219421
PMID:43027676
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研究论文 | 该文通过整合转录组分析和实验验证,识别肺动脉高压中与血管生成相关的关键分子,并建立候选分子特征 | 结合多种机器学习算法(逻辑回归、随机森林、LASSO)和单细胞RNA测序数据筛选血管生成相关基因,并在两种大鼠肺动脉高压模型中进行实验验证 | 样本量有限,仅基于公共数据集和大鼠模型,未在人类临床样本中广泛验证 | 识别肺动脉高压中血管生成相关的关键分子,建立候选分子特征并评估其诊断潜力 | 肺动脉高压患者转录组数据、人肺动脉单细胞RNA测序数据、MCT和SuHx大鼠模型 | 机器学习、转录组学、单细胞分析 | 肺动脉高压 | bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、qRT-PCR | 逻辑回归、随机森林、LASSO | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | GSE15197(主要发现数据集)、GSE1909(跨物种验证)、GSE210248(单细胞数据)、MCT和SuHx大鼠模型 | NA | bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2026-11-15 |
TMC8 is associated with a paradoxical immune landscape and promotes clear cell renal cell carcinoma progression
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1979912
PMID:43031750
|
研究论文 | 该研究系统探究了TMC8在透明细胞肾细胞癌中的免疫和生物学作用 | 揭示了TMC8与矛盾免疫景观的关联,发现其性别特异性效应,并通过体内外实验验证了其促癌功能 | 需要进一步验证TMC8作为治疗靶点的潜力,具体分子机制尚待阐明 | 系统研究TMC8在ccRCC中的免疫学和生物学潜力 | 透明细胞肾细胞癌患者及ccRCC细胞模型 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 批量转录组测序, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据, 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2026-11-14 |
Identification and validation of serum EPHB2 as a candidate biomarker for colorectal cancer and precancerous lesions
2026-Nov-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.118125
PMID:43017150
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研究论文 | 该研究通过多队列转录组学、泛癌数据库和单细胞RNA测序鉴定血清EPHB2作为结直肠癌及癌前病变早期检测的非侵入性候选生物标志物,并通过ELISA在临床队列中进行验证 | 首次系统鉴定并验证血清EPHB2作为结直肠癌及癌前腺瘤的非侵入性候选生物标志物,发现其表达从癌前病变到晚期癌逐步升高,且与Wnt/β-catenin信号通路激活相关 | 需要进一步的前瞻性评估来确认血清EPHB2作为结直肠肿瘤早期检测生物标志物的临床价值 | 鉴定和验证血清EPHB2作为结直肠癌和癌前病变早期检测的非侵入性候选生物标志物 | 结直肠癌患者、癌前腺瘤患者和健康对照者的血清样本及组织样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 转录组学分析、单细胞RNA测序、ELISA、免疫组织化学 | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据、血清ELISA数据、组织免疫组化图像 | 前瞻性本地队列和独立外部验证队列(具体样本量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2026-11-14 |
Cell-cycle inhibition preserves robust development but rebalances lineages in mouse gastruloids
2026-Nov-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.118084
PMID:43022676
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研究论文 | 利用小鼠类原肠胚模型研究细胞周期抑制对哺乳动物发育的影响,发现核心分化程序具有稳健性但谱系比例发生重平衡 | 首次系统性地在小鼠类原肠胚中揭示细胞周期动态对哺乳动物发育中谱系特异性分化时序和效率的调控作用,并利用未剪接/已剪接循环转录本的差异动力学比较不同细胞类型的增殖速率 | 研究仅基于小鼠类原肠胚体外模型,可能无法完全反映体内胚胎发育的复杂性;细胞周期抑制的具体分子机制尚未完全阐明 | 探究正常细胞周期动态在哺乳动物发育中的必要性及细胞周期抑制对胚胎发育的影响 | 小鼠类原肠胚(mouse gastruloids) | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组测序,显微成像 | NA | 图像,文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 19 | 2026-11-14 |
A Topology-Feature Disentangled Deep Clustering Method for scRNA-seq Based on Graph-to-MLP Distillation
2026-Nov-13, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag827
PMID:43021569
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研究论文 | 提出基于图到MLP知识蒸馏的单细胞RNA测序数据深度聚类方法scAdaG2M | 结合图到MLP知识蒸馏与AdaBoost动态重加权策略,实现图建模与无图推理解耦,缓解过平滑并降低大规模图计算开销 | 未在摘要中明确说明 | 充分利用scRNA-seq数据中的表达谱和拓扑信息,提升单细胞聚类性能并克服GNN过平滑、图依赖和计算密集等问题 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习, 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq | GNN, MLP, AdaBoost, 知识蒸馏 | 基因表达数据, 图数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2026-11-14 |
Neutrophil Extracellular Traps Contribute to Peri-Implant Bone Loss: Insights Into Pro-Inflammatory Macrophage-Neutrophil Crosstalk
2026-Nov-13, Journal of clinical periodontology
IF:5.8Q1
DOI:10.1111/jcpe.70226
PMID:43021680
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研究论文 | 本研究探讨中性粒细胞胞外诱捕网(NETs)在种植体周围骨丢失中的作用,并揭示促炎巨噬细胞通过MIF-CD74-p38 MAPK信号通路调控NETs形成的上游机制 | 首次揭示了促炎巨噬细胞与中性粒细胞之间的MIF-CD74-p38 MAPK信号轴在种植体周围炎NETs形成和骨丢失中的调控作用,并结合单细胞和空间转录组学鉴定出具有NETs形成表型的中性粒细胞亚群(NNeu) | 动物模型为 rats 种植体周围炎模型,与人类疾病的复杂性可能存在差异;机制验证主要依赖体外实验和实验性调控,临床转化仍需进一步研究 | 研究NETs对种植体周围骨丢失的贡献,并探索与异常NETosis相关的上游细胞机制 | 种植体周围炎临床标本、大鼠种植体周围炎模型、中性粒细胞和巨噬细胞 | 数字病理学、单细胞转录组学、空间转录组学 | 种植体周围炎、牙周疾病 | 单细胞转录组测序、空间转录组学、细胞间通讯分析、DNase I治疗 | NA | 图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |