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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-04-28 |
3C suppresses PINK1-mediated mitophagy and contributes to coxsackievirus B3 replication
2026-Dec, Virulence
IF:5.5Q1
DOI:10.1080/21505594.2026.2662767
PMID:42035472
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序揭示3C蛋白通过抑制PINK1介导的线粒体自噬促进柯萨奇病毒B3复制,并阐明其致病机制 | 首次发现CVB3非结构蛋白3C通过FOSL1抑制PINK1转录,并揭示MAVS与PINK1形成调控环路,为病毒性心肌炎提供新治疗靶点 | 未提及具体局限性信息 | 探究CVB3感染抑制线粒体自噬的分子机制及其对病毒复制和心肌损伤的影响 | 柯萨奇病毒B3感染的心肌细胞和小鼠模型 | 机器学习和数字病理学(基于单细胞测序分析) | 病毒性心肌炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA(未提及具体样本量) | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | NA |
| 2 | 2026-04-28 |
Spatial Robustness of Prostate Cancer Biomarkers Evaluated by Spatial Transcriptomics
2026-Jun, The Prostate
DOI:10.1002/pros.70164
PMID:41911496
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研究论文 | 利用空间转录组学评估两种患者前列腺癌组织切片中四种预后生物标志物基因的空间稳健性 | 首次通过空间转录组学评估多个预后生物标志物面板(Oncotype DX、Prolaris、Decipher和ProClass)在高度异质的前列腺癌组织中的空间表达模式,并提出“空间稳健”面板概念 | 仅分析两名患者共37个组织切片,样本量小;低丰度基因可能受当前技术限制影响,难以进行稳健空间分析 | 探究空间转录组学在验证和优化前列腺癌预后生物标志物面板中的潜在用途,评估生物标志物基因的空间变异性 | 两名患有局部高等级前列腺癌患者的37个组织切片 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 空间转录组学 | 加权基因共表达网络分析 | 空间基因表达数据 | 37个组织切片(来自2名患者) | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium Spatial Platform | Visium空间平台 |
| 3 | 2026-04-28 |
Single-Cell Sequencing Reveals That CCL2+ Adipose-Derived Stem Cells Promote Diabetic Wound Healing Through the CCL2-ACKR1 Signaling Axis
2026-May-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202601311R
PMID:42033160
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research paper | 利用单细胞RNA测序揭示CCL2阳性脂肪干细胞及其外泌体通过CCL2-ACKR1信号轴促进糖尿病伤口愈合的机制 | 首次在单细胞水平鉴定出CCL2阳性脂肪干细胞亚群,并揭示其外泌体通过CCL2-ACKR1轴激活PI3K/AKT/mTOR/HIF-1α通路促进血管生成、M2巨噬细胞极化和细胞外基质重塑的多细胞多靶点治疗作用 | 未明确说明研究中涉及的潜在局限性 | 探究CCL2阳性脂肪干细胞亚群及其外泌体在糖尿病伤口愈合中的作用机制 | 人类脂肪组织、糖尿病伤口组织、糖尿病小鼠伤口模型、内皮细胞 | digital pathology | diabetic wound | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类脂肪和糖尿病伤口组织样本,具体数量未提及;糖尿病小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2026-04-28 |
Mechanisms, precision therapies, and technological frontiers in coronary atherosclerosis: a comprehensive review
2026-May, Acta pharmacologica Sinica
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41401-025-01729-x
PMID:41593207
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综述 | 全面综述冠状动脉粥样硬化的机制、精准疗法和技术前沿 | 综合了单细胞转录组学、多基因风险评分、人工智能斑块分析等先进技术,以及CRISPR-Cas9基因编辑、纳米技术药物递送和肠道菌群调节等新兴治疗策略 | 可及性、健康公平性和临床实施方面仍面临挑战 | 总结冠状动脉粥样硬化的当代疾病机制理解和新出现治疗策略 | 冠状动脉粥样硬化患者及相关分子和细胞机制 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学、多组学技术、高分辨率成像 | NA | 转录组数据、成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2026-04-28 |
Diminished and Altered Cellular Senescence Response in Delayed Wound Healing of Aging
2026-May, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70493
PMID:42033084
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研究论文 | 研究揭示了衰老小鼠伤口愈合延迟与细胞衰老反应减弱和功能转变相关 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定出年轻小鼠伤口中具有促愈合功能的p16/p21/Ki67衰老成纤维细胞亚群,并发现衰老导致该细胞数量减少且功能从促愈合的细胞外基质重塑转向促炎状态 | 未提供具体局限性信息 | 探索细胞衰老反应在老年个体皮肤伤口延迟愈合中的作用机制 | 年轻和老年小鼠的全层背部皮肤伤口组织,以及年轻人类供体的伤口组织 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像、基因表达数据 | 年轻和老年小鼠的伤口组织样本,以及年轻人类供体的伤口组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6 | 2026-04-28 |
TriPDCL: A Tri-Pathway Prototype-Driven Contrastive Learning Framework for Cross-Modality Single-Cell Integration
2026-Apr-27, Journal of chemical information and modeling
IF:5.6Q1
DOI:10.1021/acs.jcim.6c00436
PMID:41952315
|
研究论文 | 提出TriPDCL框架,一种基于原型的三路径对比学习方法,用于跨模态单细胞数据集成 | 通过迭代原型学习更新机制实现异质性信息的有效传递,并利用可学习的原型中心精确构建可靠的正负样本对 | 未在摘要中明确说明 | 解决多组学分析中跨模态异质性对齐和鲁棒学习两个主要挑战 | 单细胞多组学数据 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 对比学习(原型驱动) | 单细胞多组学数据 | 五个数据集 | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 7 | 2026-04-28 |
Single-cell insights into plant growth, adaptation, and evolution
2026-Apr-27, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.70272
PMID:42037106
|
综述 | 综述了单细胞多组学技术在理解植物生长、适应性和进化中的应用 | 整合单细胞转录组学、表观基因组学和空间组学,系统解析作物发育、胁迫响应和进化中的细胞异质性 | 原生质体分离技术困难、多模态数据计算整合挑战以及跨物种可扩展性不足 | 利用单细胞技术揭示植物细胞类型特异性程序,推动功能基因组学和精准育种 | 作物植物及其细胞类型 | 机器学习 | NA | 单细胞多组学 | NA | 转录组、表观基因组、空间组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞表观基因组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 8 | 2026-04-28 |
Integration of Spatiotemporal Multi-Omics in Peach Fruit Unravels a Metabolic Niche and the Genetic Basis of Trichome-Mediated Stress Adaptation
2026-Apr-27, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202520438
PMID:42037236
|
研究论文 | 整合空间转录组学和质谱成像技术,构建桃果实早期发育的多维图谱,揭示代谢异质性、组织特异性基因表达及毛状介导胁迫适应的遗传基础 | 首次为蔷薇科果实构建空间分辨的多组学资源,揭示毛状体特异性代谢微环境及其在干旱胁迫适应中的整合调控机制 | 该研究仅在桃及其油桃变种中进行,结果可能不直接推广至其他蔷薇科物种;毛状体调控基因功能验证限于异源系统 | 解析果实发育早期基因表达和代谢的时空协调机制,以及毛状体在逆境适应中的遗传基础 | 桃果实及其光皮变种油桃的早期发育果实 | 空间生物学 | NA | 空间转录组学, 质谱成像 | NA | 图像, 转录组序列, 代谢组数据 | 桃和油桃多个早期发育阶段果实样本,具体数量未提供 | NA | 空间转录组学, 质谱成像 | NA | 空间转录组学采用10x Visium平台,质谱成像采用MALDI-MSI技术 |
| 9 | 2026-04-28 |
Depletion of macrophages during early postnatal development leads to disrupted tooth root development and altered Gli1⁺ MSC trajectory
2026-Apr-26, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08753-7
PMID:42036413
|
研究论文 | 该研究揭示了出生后早期发育过程中巨噬细胞耗竭会导致小鼠磨牙牙根发育异常,并改变Gli1⁺间充质干细胞的命运轨迹 | 首次阐明了巨噬细胞作为牙根发育微环境的关键组分,通过TGF-β信号通路调控Gli1⁺间充质干细胞的分化命运,揭示了免疫-间充质互作在牙齿形态发生中的重要作用 | 研究主要基于小鼠模型,结论在人类牙齿发育中的适用性尚待验证;同时巨噬细胞耗竭方法的非特异性可能影响其他免疫细胞功能 | 探究巨噬细胞在小鼠出生后牙根发育过程中的功能重要性及其分子机制 | 小鼠磨牙及周围组织中的巨噬细胞和Gli1⁺间充质干细胞 | 数字病理学 | 牙齿发育相关疾病 | 单细胞RNA测序, 氯膦酸脂质体介导的巨噬细胞耗竭 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型(具体数量未在摘要中说明) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 10 | 2026-04-28 |
GR2ST: Spatial Transcriptomics Prediction based on Graph-Enhanced Multimodal Contrastive Learning
2026-Apr-26, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag209
PMID:42036805
|
研究论文 | 提出GR2ST模型,通过图增强多模态对比学习从组织学图像预测空间转录组学数据 | 利用大型预训练病理模型提取组织学特征,设计动态阈值功能图和半径约束空间图的双分支图架构,通过多模态对比学习对齐图像与基因表达,并引入细胞类型引导的多分支回归头实现自适应基因表达生成 | NA | 开发一种深度学习模型,从组织学图像预测空间转录组学数据,降低实验成本和时间 | 皮肤鳞状细胞癌和两种人类乳腺癌的空间转录组学数据集 | 计算机视觉 | 皮肤鳞状细胞癌, 乳腺癌 | 空间转录组学 | 图神经网络, 多模态对比学习 | 图像, 基因表达数据 | 三个癌症相关的空间转录组学数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 11 | 2026-04-28 |
A macrophage co-expression signature enables robust prognostic prediction in glioblastoma
2026-Apr-25, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102784
PMID:42035563
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研究论文 | 整合单细胞巨噬细胞异质性与共表达网络,构建了胶质母细胞瘤中稳健的预后预测模型MCRS,并验证了SPP1的关键作用 | 首次将单细胞巨噬细胞异质性与加权基因共表达网络分析hdWGCNA结合,构建多算法机器学习框架MCRS,并在多个独立队列中验证其预后和免疫分层能力 | 未提及具体局限性,但虚拟敲除分析可能无法完全模拟体内环境,实验验证仅限细胞系水平 | 开发基于巨噬细胞共表达特征的预后风险评分模型,并阐明其在胶质母细胞瘤免疫微环境中的作用机制 | 胶质母细胞瘤中的巨噬细胞亚群、肿瘤细胞系以及TCGA、CGGA、GEO等多个独立队列的转录组数据 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、R-SCENIC、hdWGCNA、多算法机器学习 | 多算法机器学习框架(MCRS) | 单细胞转录组数据、批量转录组数据 | TCGA、CGGA、GEO等多个独立队列(具体样本量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 12 | 2026-04-28 |
Emodin Inhibitsg Hepatocellular Carcinoma Invasion and Migration by Regulating the HDAC4/NF-[Formula: see text]B (p65)/CXCL12 Signaling Axis and Suppressing M2 Macrophage Polarization
2026-Apr-25, The American journal of Chinese medicine
DOI:10.1142/S0192415X26500369
PMID:42036631
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研究论文 | 本研究探讨了大黄素通过HDAC4/NF-κB(p65)/CXCL12信号轴调节巨噬细胞极化,从而抑制肝细胞癌侵袭和迁移的作用机制 | 首次阐明大黄素通过靶向HDAC4调控NF-κB/CXCL12通路抑制M2型巨噬细胞极化,从而阻碍肝癌进展的新机制 | 实验主要在体外细胞模型和动物模型中进行,尚需更多临床样本验证 | 探究大黄素调节巨噬细胞极化及抑制肝细胞癌进展的分子机制 | HepG2肝癌细胞和巨噬细胞 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 13 | 2026-04-28 |
The dual molecular identity of vestibular kinocilia bridges structural and functional traits of primary and motile cilia
2026-Apr-24, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.108071
PMID:42029006
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、免疫染色和活体成像,揭示了前庭动纤毛兼具初级纤毛和运动纤毛的分子特征,并发现其具有自发运动能力 | 首次发现前庭动纤毛同时表达初级纤毛和运动纤毛相关基因,并证实其具有自发运动能力,挑战了动纤毛仅为静态结构的传统认知 | 未明确动纤毛自发运动在毛细胞机械转导中的具体功能机制 | 阐明前庭动纤毛的结构、分子组成和功能特征 | 成年小鼠前庭和耳蜗毛细胞、斑马鱼和人前庭毛细胞、牛蛙和小鼠壶腹嵴毛细胞 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序、免疫染色、活体成像 | NA | 基因表达数据、图像数据 | 成年小鼠前庭和耳蜗毛细胞、斑马鱼和人前庭毛细胞、牛蛙和小鼠壶腹嵴毛细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2026-04-28 |
Study on the Mechanisms of Allogeneic NK Cells Combined with Myeloid Cells in Treating Acute Myeloid Leukemia
2026-Apr-24, Transplantation and cellular therapy
IF:3.6Q1
DOI:10.1016/j.jtct.2026.03.043
PMID:42035877
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研究论文 | 该研究探讨了粒细胞集落刺激因子动员的同种异体NK细胞在急性髓系白血病微移植中的抗肿瘤作用及其与髓系细胞的相互作用机制 | 首次通过单细胞RNA测序揭示G-CSF动员后NK细胞上调免疫调节及与髓系细胞互作相关基因,提出NK细胞可能通过C5AR1和CCL5途径与髓系细胞间接发挥抗肿瘤作用的假设 | 单变量分析中NK细胞剂量与生存改善相关,但多变量调整后未保持统计学显著性;KIR配体错配和供者激活受体数无显著影响;仅纳入少数供者(8例)进行功能验证;体外实验结果需进一步通过体内模型验证 | 研究G-CSF动员后NK细胞表型、杀伤功能变化及其与髓系细胞的潜在互作机制 | 急性髓系白血病AML患者及G-CSF动员前后供者的NK细胞 | 机器学习 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 72例AML患者(回顾性分析),8例供者(NK细胞表型与功能分析) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2026-04-28 |
Molecular Traces of Microbial Cross-Kingdom Migration: From the Gut Ecosystem to the Intervertebral Disc Microenvironment
2026-Apr-24, The spine journal : official journal of the North American Spine Society
DOI:10.1016/j.spinee.2026.04.027
PMID:42035921
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研究论文 | 该研究通过多组学方法发现肠道微生物Phocaeicola vulgatus可能通过LPS-TLR4-MYD88信号轴激活软骨细胞炎症反应并重塑细胞间通讯网络,从而促进椎间盘退变 | 首次利用多组学联合分析揭示肠道微生物与椎间盘退变之间的跨界迁移分子机制,并发现Phocaeicola vulgatus通过LPS信号通路介导的微生物-宿主互作新机制 | 未提及具体的局限性信息 | 利用多组学方法鉴定肠道微生物中促进椎间盘退变的关键菌群,并阐明其通过调控宿主细胞功能参与椎间盘退变的具体分子机制 | 113例接受手术治疗的症状性腰椎退变患者的退变椎间盘组织和配对粪便样本 | 机器学习 | 椎间盘退变 | 宏基因组二代测序、单细胞RNA测序、批量RNA测序、AUCell评分、CellChat算法 | NA | 测序数据 | 113例患者的退变椎间盘组织和配对粪便样本 | NA | 宏基因组二代测序、单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 16 | 2026-04-28 |
PHC2 promotes hepatocellular carcinoma progression and serves as a robust prognostic biomarker: A pancancer multiomics and clinical validation study
2026-Apr-21, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2026.112555
PMID:42025893
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研究论文 | 通过泛癌多组学与临床验证,揭示PHC2在肝细胞癌进展中的致癌作用及预后价值 | 首次系统阐明PHC2在肝细胞癌中的表达模式、预后价值及致癌功能,并发现其与巨噬细胞浸润的潜在关联 | 未深入探讨PHC2调控肿瘤微环境重塑的具体分子机制,且临床验证样本量相对有限 | 阐明PHC2在肝细胞癌进展中的表达模式、预后价值及致癌作用 | PHC2(多同源物2)及其在肝细胞癌中的功能 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA-seq,单细胞RNA测序,免疫组织化学 | NA | 多组学数据,组织微阵列图像 | 94份肝细胞癌患者样本(组织微阵列队列) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 17 | 2026-04-28 |
Fosb promotes ferroptosis in vascular smooth muscle cells via the NF-κB pathway to exacerbate abdominal aortic aneurysm progression
2026-Apr-19, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2026.112544
PMID:42013987
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研究论文 | 该论文探讨了Fosb通过NF-κB通路促进血管平滑肌细胞铁死亡进而加重腹主动脉瘤进展的机制 | 首次揭示Fosb在腹主动脉瘤中通过NF-κB通路驱动平滑肌细胞铁死亡和炎症表型转换的关键作用 | 目前研究主要基于细胞和小鼠模型,临床样本验证有限,且Fosb下游具体靶点尚未完全阐明 | 阐明Fosb在腹主动脉瘤进展中促进平滑肌细胞表型转换和铁死亡的作用机制 | 腹主动脉瘤患者单细胞数据、T/G HA-VSMC细胞系、ApoE-/-小鼠 | 生物医学 | 腹主动脉瘤 | 单细胞RNA测序、qRT-PCR、Western blot、CCK8、Transwell、流式细胞术、ELISA、免疫组化 | NA | 基因表达数据、细胞实验数据、动物实验数据 | 腹主动脉瘤患者单细胞RNA测序数据(具体样本量未明确)、细胞实验和动物实验(ApoE-/-小鼠模型) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台用于腹主动脉瘤患者scRNA-seq |
| 18 | 2026-04-28 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals intra-tumoral heterogeneity and immunotherapy strategies in high-grade serous ovarian cancer
2026-Apr-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115266
PMID:41907410
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示高级别浆液性卵巢癌的肿瘤内异质性和免疫治疗策略 | 首次系统描绘了HGSOC中七种主要细胞类型的变化,特别是发现高表达MHC Ⅰ类分子的上皮细胞与抗原呈递和肿瘤免疫监视的关联,并验证了其与CD8 T细胞激活的关系,为免疫治疗提供新靶点 | 未明确提及,但可能包括样本量有限、主要基于转录组分析缺乏功能验证、多重免疫组化验证的队列规模可能较小 | 解析高级别浆液性卵巢癌的肿瘤内异质性和免疫治疗潜在机制 | 高级别浆液性卵巢癌肿瘤组织 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 19 | 2026-04-28 |
Integrated multi-omics identifies macrophage ARG1-mediated deacetylation with causal and diagnostic implications in ischemic stroke
2026-Apr-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115269
PMID:41907424
|
研究论文 | 通过整合多组学数据,发现巨噬细胞ARG1介导的去乙酰化在缺血性卒中中具有因果和诊断意义 | 整合多组学数据识别出ARG1作为缺血性卒中的因果因子,并基于去乙酰化相关基因将患者分为两个免疫分子亚型 | 研究主要基于小鼠模型和队列数据,ARG1在人类缺血性卒中的功能机制仍需进一步验证 | 探究去乙酰化相关基因在缺血性卒中中的因果和诊断作用 | 缺血性卒中患者和MCAO小鼠模型 | 机器学习 | 缺血性卒中 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 孟德尔随机化分析 | NA | 多组学数据(转录组、单细胞转录组等) | 患者队列和小鼠模型的样本数量未在摘要中明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2026-04-28 |
AK5 suppresses breast cancer progression and modulates anti-PD-L1 efficacy via the miR-182-5p/PD-L1 axis
2026-Apr-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115260
PMID:41907408
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研究论文 | 本文揭示了腺苷酸激酶5(AK5)通过miR-182-5p/PD-L1轴抑制乳腺癌进展并调节抗PD-L1疗效 | 首次发现AK5通过其激酶活性依赖方式抑制miR-182-5p成熟,从而上调PD-L1表达,并在乳腺癌中发挥抑癌作用 | 未提及具体局限性 | 探究AK5在乳腺癌中的作用及其分子机制 | 乳腺癌细胞及小鼠模型 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未提及具体样本量 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'转录组 |