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当前共找到 34375 篇文献,本页显示第 1 - 20 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1 2025-12-23
Pathway to precision: machine learning and bioinformatics in diabetes gene expression studies
2026-Jun, Journal of diabetes and metabolic disorders IF:1.8Q4
综述 本文综述了2020年至2024年间糖尿病基因表达研究中机器学习与生物信息学的应用现状与进展 系统性地将现有研究归纳为六个类别,并量化分析了最常用的数据采集技术、生物信息学方法和机器学习技术,同时指出了RNA-seq和单细胞RNA-seq等新技术在糖尿病研究中的应用不足 纳入文献仅限于2020-2024年发表的开放获取英文文章,可能遗漏更早或非英文的重要研究;且为综述性文章,未进行原始数据分析 总结糖尿病研究中生物信息学、基因表达分析和机器学习的最新进展,以促进糖尿病精准医疗的发展 糖尿病相关的基因表达数据、生物标志物及研究方法 生物信息学 糖尿病 微阵列、RNA-seq、单细胞RNA-seq LASSO, PCA 基因表达数据 基于96篇文献的综述 NA NA NA NA
2 2025-12-23
Decoding CNS regeneration: Insights from single-cell RNA sequencing in SCI and TBI across multiple species
2026-Jan-09, Neuroscience IF:2.9Q2
综述 本文综述了利用单细胞RNA测序技术研究脊髓损伤和创伤性脑损伤后中枢神经系统再生机制的多物种研究成果 通过整合哺乳动物、青蛙和斑马鱼等多种物种的scRNA-seq数据,进行跨物种比较分析,揭示了中枢神经系统损伤后保守的细胞反应和再生机制 NA 深入理解中枢神经系统损伤与修复的分子和细胞机制 脊髓损伤和创伤性脑损伤模型中的细胞 数字病理学 神经系统疾病 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3 2025-12-23
Single-cell RNA seq reveals heterogeneous survival strategies of Vibrio parahaemolyticus against ampicillin
2026-Jan, Journal of microbiological methods IF:1.7Q4
研究论文 本研究创新性地应用基于液滴的单细胞RNA测序技术,揭示了副溶血弧菌在氨苄青霉素压力下的异质性生存策略 首次将液滴单细胞RNA测序技术应用于细菌耐药性异质性分析,突破了传统批量RNA测序只能获取群体平均表达水平的限制 研究仅针对氨苄青霉素一种抗生素,未涉及其他抗生素或联合用药场景 解析副溶血弧菌对抗生素的异质性耐药机制 副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus) 微生物学 细菌感染 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA 基于液滴的单细胞RNA测序技术
4 2025-12-23
Machine learning and multi-omics-based identification of hub paternal imprinted genes PEG11/RTL1, PEG9/DLK1, PEG6/NDN, and PEG5/NNAT in sperm of couples experiencing idiopathic recurrent pregnancy loss
2026-Jan-01, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序、DNA甲基化分析和机器学习方法,鉴定了在特发性复发性妊娠丢失(IRPL)患者精子中异常表达和甲基化的关键父源印记基因 首次结合多组学数据和机器学习模型,系统性地揭示了父源印记基因在IRPL中的关键作用,并构建了高预测准确性的共识模型 样本量相对有限,且研究主要聚焦于特定父源印记基因,未全面评估其他潜在遗传或表观遗传因素 探究父源印记基因在特发性复发性妊娠丢失(IRPL)中的遗传和表观遗传贡献,并识别潜在的诊断生物标志物和治疗靶点 经历特发性复发性妊娠丢失(IRPL)的夫妇的精子样本 机器学习 生殖系统疾病 单细胞RNA-seq, DNA甲基化分析 Random Survival Forest 基因表达数据, DNA甲基化数据 未明确指定样本数量,但涉及IRPL组和对照组的精子样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
5 2025-12-23
Ischemia/Reperfusion Injury and Outcomes in Liver Transplantation Assessed by Omics Technologies: Where Do We Stand?
2026-Jan-01, Transplantation IF:5.3Q1
综述 本文综述了利用组学技术(如表观基因组学、转录组学和蛋白质组学)评估肝移植中缺血/再灌注损伤的研究进展 强调了单细胞RNA测序、空间转录组学和多重蛋白质组学等前沿组学技术的整合应用,为肝移植监测提供精确生物标志物和新疗法开发铺平道路 NA 深入理解肝移植中的生物学挑战,以改善患者护理和移植结果 肝移植过程中的缺血/再灌注损伤、移植物排斥或耐受以及疾病复发 数字病理学 肝移植相关并发症 表观基因组学、转录组学、蛋白质组学、单细胞RNA测序、空间转录组学、多重蛋白质组学 NA 组学数据 NA NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重蛋白质组学 NA NA
6 2025-12-23
Single-cell and spatial transcriptomics reveal P4HA2-mediated radiotherapy resistance mechanisms in breast cancer
2026, Theranostics IF:12.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞和空间转录组学分析,揭示了P4HA2介导的乳腺癌放疗抵抗机制 整合了单细胞转录组、空间转录组、机器学习、孟德尔随机化和功能验证,构建了放疗抵抗基因集和预后模型SSRR,并首次系统性地将P4HA2鉴定为关键的放疗抵抗驱动因子和治疗靶点 研究主要基于公共数据库和体外实验,缺乏大规模的前瞻性临床队列验证和体内动物模型的功能验证 阐明乳腺癌放疗抵抗的分子决定因素和细胞群体,并开发预后预测模型 乳腺癌肿瘤组织、TCGA-BRCA和GSE120798队列数据、RRhigh上皮细胞 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序、空间转录组学、机器学习、孟德尔随机化、WGCNA SuperPC、StepCox 转录组数据、单细胞数据、空间转录组数据 TCGA-BRCA和GSE120798队列数据,具体样本数量未在摘要中明确 NA 单细胞RNA-seq、空间转录组学 NA NA
7 2025-12-23
Single-Cell Multi-Omics Reveals B2M-Mediated Myeloid Reprogramming and Constructs a Predictive Model for Early Hepatocellular Carcinoma Recurrence
2025-Dec-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过单细胞多组学分析揭示了B2M介导的髓系细胞重编程在肝细胞癌早期复发中的作用,并构建了一个预测模型 首次在单细胞分辨率上整合多组学数据(RNA测序、蛋白质组学、转录组学)探索肝细胞癌早期复发的驱动因素,并识别出B2M相关的髓系细胞重编程这一新机制 预测模型在训练和验证队列中的性能仅为中等(AUC > 0.65),需要更大样本量进一步验证 探索肝细胞癌早期复发的分子机制并开发预测框架 肝细胞癌患者肿瘤组织 数字病理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 转录组学 LASSO回归模型 单细胞RNA测序数据, 蛋白质表达数据, 转录组数据, 临床特征数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 NA NA
8 2025-12-23
Bronchial epithelial transcriptome reveals dysregulated interferon and inflammatory responses to rhinovirus in exacerbation-prone pediatric asthma
2025-Dec-22, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究通过器官型支气管上皮细胞培养,结合bulk和单细胞转录组学及靶向蛋白分析,揭示了易急性加重儿童哮喘患者对鼻病毒感染的易感性机制 首次在器官型支气管上皮细胞模型中,结合bulk和单细胞转录组学,系统揭示了易急性加重儿童哮喘患者对鼻病毒感染的易感性机制,并发现低基线IFN状态是关键可调控因素 研究样本量有限,且基于体外细胞培养模型,可能无法完全反映体内复杂环境 探究儿童哮喘患者对鼻病毒感染易感性的宿主因素 哮喘儿童和健康儿童的支气管上皮细胞 数字病理学 哮喘 bulk转录组学, 单细胞转录组学, 靶向蛋白分析 NA 转录组数据, 蛋白数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
9 2025-12-23
MAGIC: A Multimodal Adaptive GRN Inference Constructor
2025-Dec-22, Journal of chemical information and modeling IF:5.6Q1
研究论文 本研究提出了一种名为MAGIC的多模态自适应基因调控网络推断方法,通过整合基因表达、序列和语义特征来改进单细胞RNA测序数据的GRN推断 MAGIC首次将基因表达、序列和语义特征进行多模态对齐与整合,并构建共识相似性网络与已知GRN形成双拓扑网络,同时采用共享图注意力权重对齐模块和知识感知多模态融合模块来应对数据稀疏性问题 方法依赖于已知GRN和生物知识库的准确性,且在非常稀疏的单细胞数据中性能可能受限 改进单细胞RNA测序数据中的基因调控网络推断 基因调控网络 生物信息学 膀胱癌, 乳腺癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学 图注意力网络, 多模态融合模型 基因表达数据, 序列数据, 语义特征 七个单细胞RNA测序数据集和两个空间转录组数据集 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
10 2025-12-23
Islet amyloid disrupts MHC class II antigen presentation and delays autoimmune diabetes in NOD mice
2025-Dec-22, Diabetologia IF:8.4Q1
研究论文 本研究探讨了胰岛淀粉样蛋白如何通过下调胰岛巨噬细胞中的MHC II类抗原呈递基因,从而延缓NOD小鼠的自身免疫性糖尿病 揭示了IAPP聚集体在减少MHC II类抗原呈递中的新作用,并表明尽管巨噬细胞对IAPP聚集体有已知的促炎反应,但早期淀粉样蛋白形成期间的摄取会破坏β细胞自身免疫并延缓糖尿病 研究主要基于小鼠模型,人类相关性需进一步验证;机制细节如吞噬作用依赖性途径需更深入探索 理解胰岛淀粉样蛋白对胰岛巨噬细胞和β细胞自身免疫的影响 NOD小鼠、胰岛巨噬细胞、树突状细胞、胰岛淀粉样多肽(IAPP) 免疫学 糖尿病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、遗传敲入、过继转移研究、体外抗原呈递细胞分析 NA 基因表达数据、免疫表型数据 使用hIAPP转基因和遗传敲入的NOD小鼠及同窝对照 NA 单细胞RNA测序 NA NA
11 2025-12-23
METTL3/RBM15 augments the stability of Kdm6b mRNA and promotes STAT1-mediated macrophage activation and atherosclerosis
2025-Dec-22, Experimental & molecular medicine
研究论文 本研究揭示了METTL3/RBM15通过m6A修饰调控Kdm6b mRNA稳定性,进而促进STAT1介导的巨噬细胞激活和动脉粥样硬化发展的机制 首次系统研究了m6A修饰在巨噬细胞分化和激活过程中的作用,并阐明了METTL3/RBM15-Kdm6b-STAT1轴在动脉粥样硬化中的调控网络 研究主要基于小鼠模型,人类临床样本验证尚需进一步开展 阐明m6A修饰在巨噬细胞激活和动脉粥样硬化发展中的分子机制 巨噬细胞、细胞毒性T淋巴细胞、动脉粥样硬化斑块 分子生物学 心血管疾病 MeRIP-seq, RNA-seq, 单细胞RNA-seq, Western blot, qPCR, RIP-qPCR, 共免疫沉淀 基因敲除小鼠模型 测序数据、蛋白质印迹数据、PCR数据 巨噬细胞特异性Kdm6b敲除小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
12 2025-12-23
Dynamic Landscape of H3K4me3 and H3K27me3 Modification During Postnatal Leydig Cell Fate Determination
2025-Dec-22, Andrology IF:3.2Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序、CUT&Tag测序、批量RNA测序和免疫组化技术,揭示了小鼠出生后Leydig细胞分化过程中H3K4me3和H3K27me3修饰的动态变化 首次系统性地描绘了出生后Leydig细胞分化过程中H3K4me3和H3K27me3修饰的阶段性动态景观,并提出了H3K4me3/H3K27me3-转录因子-靶基因轴作为核心调控机制 研究主要基于小鼠模型,结果在人类或其他物种中的普适性尚未验证,且未深入探讨其他组蛋白修饰的潜在影响 阐明出生后Leydig细胞分化过程中H3K4me3和H3K27me3修饰的动态变化 小鼠出生后Leydig细胞 表观遗传学 NA 单细胞RNA测序, CUT&Tag测序, 批量RNA测序, 免疫组化 NA RNA测序数据, 表观遗传数据, 图像数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
13 2025-12-23
Dysfunctional Dendritic Cells in Radiation-Induced Jaw Injury: Insights From Single-Cell Transcriptomic Analysis of the Osteoimmune Microenvironment
2025-Dec-22, Immunology IF:4.9Q2
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序分析了辐射诱导下颌骨损伤中的骨免疫微环境,揭示了树突状细胞功能失调及其与SPP1信号通路的关系 首次在单细胞分辨率下描绘辐射诱导下颌骨损伤的转录景观,鉴定出迁移性树突状细胞亚群,并发现SPP1/CD44/NF-κB信号通路在调节树突状细胞成熟中的新机制 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证不足;机制研究主要聚焦SPP1通路,其他潜在调控因素未充分探索 阐明辐射诱导下颌骨损伤中骨免疫微环境的细胞和分子机制 辐射处理后的小鼠下颌骨骨髓细胞 数字病理学 头颈部放疗并发症 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确说明样本数量的小鼠下颌骨骨髓样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
14 2025-12-23
Data mining based on multiomic data integration to explore the mechanism by which a proprietary Chinese medicine improves cardiac hypertrophy in heart failure
2025-Dec-22, Histology and histopathology IF:2.5Q2
研究论文 本研究通过整合多组学数据,探索了心阳片改善心力衰竭中心肌肥大的机制 首次结合UHPLC-MS、网络药理学、RNA-seq和scRNA-seq等多组学方法,系统揭示了心阳片通过靶向HDAC2抑制AKT/GSK-3β信号通路来减轻氧化应激和心肌肥大的新机制 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,临床转化仍需进一步验证;多组学数据的整合分析可能存在技术偏差 阐明心阳片在心力衰竭中治疗心肌肥大的作用机制,重点关注氧化应激和肥厚通路 TAC诱导的心力衰竭小鼠模型和AngII处理的HL-1心肌细胞 多组学整合分析 心血管疾病 UHPLC-MS, RNA-seq, scRNA-seq, 网络药理学, 组织学染色, 氧化应激标记物检测 NA 多组学数据(代谢组、转录组)、图像、分子数据 小鼠模型和HL-1细胞系,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
15 2025-12-23
Integrating epidemiological and bioinformatics analyses identified the effects of organophosphate pesticides accelerating biological aging
2025-Dec-22, International journal of surgery (London, England)
研究论文 本研究通过流行病学与生物信息学分析,揭示了有机磷农药暴露与生物衰老加速之间的关联及其潜在机制 首次整合大规模人群队列(NHANES)、孟德尔随机化、单细胞测序分析和体外实验,系统阐明有机磷农药通过炎症和磷酸化介导的细胞凋亡通路加速生物衰老 横断面研究设计无法完全确定因果关系,环境暴露测量可能存在误差,体外实验结果需在体内进一步验证 探究有机磷农药暴露与生物衰老加速之间的关联及分子机制 NHANES队列参与者(发现队列9,795人,验证队列2,494人)及体外细胞模型 生物信息学 老年疾病 单细胞RNA测序,qPCR,Western blot,RNA干扰,流式细胞术 多元线性回归,限制性立方样条,孟德尔随机化,网络毒理学 流行病学数据,基因组数据,转录组数据,蛋白质数据 总样本12,289人(发现队列9,795人,验证队列2,494人) NA 单细胞RNA-seq NA NA
16 2025-12-23
Extracellular matrix-derived mechanical force induces CDK4/6 inhibitor resistance by inhibiting NEK10 dependent cell cycle regulation in breast cancer
2025-Dec-22, International journal of surgery (London, England)
研究论文 本研究探讨了细胞外基质(ECM)来源的生物力学信号如何通过抑制NEK10依赖的细胞周期调控,介导HR+、HER2-乳腺癌对CDK4/6抑制剂的耐药性 揭示了ECM生物力学信号通过细胞骨架依赖途径下调NEK10表达,进而抑制NEK10/p53/CDKN1A轴并激活CDK2信号通路,从而驱动CDK4/6抑制剂耐药的新机制 NA 研究ECM来源的生物力学信号在介导HR+、HER2-乳腺癌对CDK4/6抑制剂耐药中的作用 乳腺癌细胞、患者样本(包括单细胞测序数据、TCGA数据及临床样本) 肿瘤生物学 乳腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、转录组分析、Western blotting NA 测序数据、蛋白质印迹数据、临床数据 23名乳腺癌患者的单细胞测序数据、TCGA中1092名患者的数据、25个临床样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
17 2025-12-23
New insight into the risk stratification and treatment priority of breast cancer: TMT scoring system
2025-Dec-22, International journal of surgery (London, England)
研究论文 本研究提出了一种基于17个核心基因的新型肿瘤线粒体转移评分系统,用于评估乳腺癌患者的预后 首次开发了基于多基因的肿瘤线粒体转移评分系统,并在单细胞分辨率下揭示了线粒体转移与肿瘤微环境免疫代谢特征的关联 研究主要基于回顾性数据库分析,需要进一步的前瞻性临床验证 开发乳腺癌风险分层新工具并探索线粒体动力学的治疗潜力 乳腺癌患者肿瘤组织 计算生物学 乳腺癌 单细胞RNA测序,共培养实验 评分系统 基因表达数据,单细胞转录组数据 TCGA-BRCA和GEO数据库中的乳腺癌样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
18 2025-12-23
Novel common target genes for breast cancer and colorectal cancer: a Mendelian randomization and spatial transcriptomics study
2025-Dec-22, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过孟德尔随机化和空间转录组学分析,识别了乳腺癌和结直肠癌在中央记忆CD8+ T细胞中的共同靶基因 结合单细胞RNA测序、孟德尔随机化分析和空间转录组学技术,首次在中央记忆CD8+ T细胞中鉴定出乳腺癌和结直肠癌的共同关联基因 研究依赖于公开数据库数据,样本量可能有限,且需要进一步实验验证基因功能 识别乳腺癌和结直肠癌在中央记忆T细胞中的共同信号分子,以促进对这两种疾病的理解并开发有效疗法 乳腺癌和结直肠癌患者的单细胞RNA测序数据,重点关注中央记忆CD8+ T细胞 生物信息学 乳腺癌, 结直肠癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 孟德尔随机化分析 NA 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 来自GEO数据库的乳腺癌(GSE161529)和结直肠癌(GSE222300)患者数据 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
19 2025-12-23
Multi-omics analysis identifies SMPD1 as a key contributor in sphingolipid pathway for Type 2 diabetes pathogenesis
2025-Dec-22, Genes & genomics IF:1.6Q3
研究论文 本研究通过多组学分析,识别出SMPD1作为鞘脂代谢通路中的关键因子,在2型糖尿病发病机制中发挥重要作用 首次通过整合基因组、转录组和代谢组数据,结合孟德尔随机化分析和体内实验,系统性地证实了SMPD1在2型糖尿病发病中的因果作用和致病机制 研究主要基于小鼠模型和人类关联数据,尚未在更广泛的人群中进行临床验证,且SMPD1的具体调控机制和下游信号通路有待进一步阐明 识别并表征导致2型糖尿病发病的关键鞘脂通路成分 小鼠模型(瘦型和ob/ob型)、人类2型糖尿病患者数据、代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD)肝组织样本 NA 2型糖尿病 多组学分析(基因组学、转录组学、代谢组学)、孟德尔随机化分析、全基因组关联研究(GWAS)、RNA-seq(bulk和单细胞) NA 基因组数据、转录组数据、代谢组数据、RNA-seq数据 涉及小鼠模型和人类患者数据,具体样本数量未在摘要中明确说明 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
20 2025-12-23
CD168 Identifies Proliferating Pancreatic Islet Cells in Murine and Human
2025-Dec-21, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本文发现CD168作为小鼠和人类胰岛中增殖细胞的保守表面标志物,用于富集活体增殖β细胞 首次鉴定CD168为特异性富集小鼠和人类胰岛增殖细胞的表面标志物,并开发了CD168-CreERT2小鼠模型进行谱系追踪 NA 研究糖尿病治疗中通过增殖恢复功能性β细胞质量的目标 小鼠和人类胰岛细胞 NA 糖尿病 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫染色、谱系追踪、多组学分析 CD168-CreERT2小鼠模型 RNA-seq数据、图像数据、谱系追踪数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
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