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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1 2025-12-10
Integrated multi-omics analyses identified the H3K18la-based spatiotemporal characteristics and risk-stratified treatment strategy in lung adenocarcinoma
2026-Jan-28, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 本研究通过整合多组学数据,探索了肺腺癌的代谢异质性,特别是糖酵解和组蛋白H3K18乳酸化(H3K18la),并开发了一个基于机器学习的预后模型来预测患者生存和免疫治疗反应 首次整合空间转录组学、单细胞RNA测序、H3K18la ChIP-seq、CRISPR数据和批量转录组学,揭示了H3K18la相关基因活动作为肺腺癌进展的标志物,并开发了在线应用工具和风险分层治疗策略 NA 探索肺腺癌的代谢异质性和免疫逃逸机制,开发预后模型和治疗策略 肺腺癌(LUAD) 数字病理学 肺癌 空间转录组学, 单细胞RNA测序, H3K18la ChIP-seq, CRISPR, 批量转录组学 机器学习 多组学数据 NA NA 空间转录组学, 单细胞RNA-seq, ChIP-seq, 批量RNA-seq NA NA
2 2025-12-10
Seeding density-dependent fate divergence of muscle stem cells revealed by single-cell RNA sequencing for cultured pork production
2026-Jan-15, Food research international (Ottawa, Ont.)
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,探讨了不同接种密度下肌肉干细胞在培养过程中的命运分化,以优化培养肉生产 首次通过单细胞RNA测序揭示了接种密度对肌肉干细胞命运分化的影响,并识别了驱动非肌源性转化的基因和通路 研究仅关注了第5代细胞,未探讨长期培养或其他代次的影响,且机制研究尚需进一步实验验证 优化培养肉生产中肌肉干细胞的培养效率,探究细胞命运分化的机制 通过FACS分离的CD56/CD29阳性肌肉干细胞 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 两个接种密度组(低密度1.9×10^4细胞/cm²和高密度1.5×10^5细胞/cm²)的第5代肌肉干细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3 2025-12-10
KRAS-Driven Hypertranscription and Metastatic Dissemination in Colorectal Cancer Could be Overcome by Targeting the NMHC IIA/ PLK1 Signaling Axis with a Novel Acridine Derivative
2026, International journal of biological sciences IF:8.2Q1
研究论文 本研究通过建立患者来源的类器官和异种移植模型,筛选出一种新型吖啶衍生物LS-1-2,可克服KRAS突变结直肠癌的化疗耐药并抑制肝转移 发现了新型吖啶衍生物LS-1-2能通过靶向NMHC IIA/PLK1信号轴,抑制KRAS驱动的过度转录和转移扩散 该研究为临床前研究,其疗效和安全性有待未来临床试验验证 寻找针对KRAS突变型转移性结直肠癌的有效治疗化合物 结直肠癌患者来源的类器官、异种移植模型及细胞系 肿瘤学 结直肠癌 RNA测序,单细胞RNA测序 NA 转录组数据,单细胞转录组数据 来自转移性结直肠癌患者的一系列PDOs和PDXs NA RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
4 2025-12-10
Procyanidin Suppresses Tumor Growth by Activating the B-Cell MAPK Pathway through Remodulation of the Gut Microbiota and Metabolites in Hepatocellular Carcinoma
2026, International journal of biological sciences IF:8.2Q1
研究论文 本研究探讨了原花青素通过重塑肠道菌群及其代谢物,激活B细胞MAPK通路,从而抑制肝细胞癌生长的机制 首次揭示了原花青素通过肠道菌群-代谢物-免疫轴的调控机制,特别是鉴定了5-羟色氨酸作为关键代谢物,连接了肠道菌群重塑与B细胞MAPK通路激活及CD8+T细胞活化的过程 研究主要基于小鼠模型,其结论在人体中的适用性有待验证;肠道菌群的具体物种名称在摘要中未明确 探究原花青素治疗肝细胞癌的作用机制 肝细胞癌小鼠模型(皮下和原位)、肠道菌群、代谢物、肿瘤微环境中的免疫细胞 肿瘤免疫学 肝细胞癌 16S rDNA测序,单细胞RNA测序,代谢组学分析 NA 测序数据,代谢组数据 NA NA 16S rDNA测序,单细胞RNA测序,代谢组学 NA NA
5 2025-12-10
Integrated single-cell transcriptomics and proteomics elucidate the molecular mechanisms and detoxification strategy of rifampicin-induced hepatotoxicity
2026, International journal of biological sciences IF:8.2Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞转录组学、蛋白质组学和代谢组学技术,系统探讨了利福平诱导肝毒性的分子机制及解毒策略 首次结合单细胞RNA测序、蛋白质组学和代谢组学,全面解析了利福平肝毒性的区域特异性肝细胞损伤机制,并提出了RA作为潜在治疗剂 研究基于小鼠模型,结果在人类中的适用性需进一步验证;部分基因表达变化的具体机制尚未完全阐明 阐明利福平诱导肝毒性的分子机制,并探索有效的解毒治疗策略 利福平诱导的肝毒性小鼠模型 数字病理学 肝毒性 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq, 质谱蛋白质组学, 代谢组学 NA 转录组数据, 蛋白质组数据, 代谢组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 蛋白质组学, 代谢组学 NA NA
6 2025-12-10
Deciphering precursor cell dynamics in esophageal preneoplasia via genetic barcoding and single-cell transcriptomics
2025-Dec-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究结合遗传条形码技术与单细胞RNA测序,追踪食管癌前病变细胞的谱系,揭示了高可塑性祖细胞样群体的起源与动态变化 首次将遗传条形码与单细胞转录组学结合用于食管癌前病变研究,建立了高可塑性细胞的评分系统,并通过空间转录组学和小鼠模型验证了关键分子标记 未明确提及研究样本的具体数量限制或技术方法的潜在偏差 阐明食管癌前病变中前体细胞的起源、谱系轨迹和分子特征 食管癌前病变细胞(组织学正常但携带早期遗传改变的细胞) 数字病理学 食管鳞状细胞癌 遗传条形码技术、单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 单细胞转录组数据、空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
7 2025-12-10
scCirclehunter delineates ecDNA-containing cells using single-cell ATAC-seq, with a focus on glioblastoma
2025-Dec-09, Cell discovery IF:13.0Q1
研究论文 本文介绍了一个名为scCirclehunter的框架,用于从单细胞ATAC-seq数据中识别ecDNA,并将其分配到特定细胞群,以研究胶质母细胞瘤中的ecDNA异质性 开发了scCirclehunter框架,首次在单细胞分辨率下分析患者来源的ecDNA,揭示了ecDNA携带细胞在胶质母细胞瘤中的细胞间异质性,并追踪了单个患者内恶性细胞的轨迹 研究基于可用的胶质母细胞瘤数据集,可能受数据样本限制,且ecDNA与线粒体转移频率的潜在联系需进一步验证 研究ecDNA在胶质母细胞瘤中的异质性及其驱动肿瘤进展的机制 胶质母细胞瘤患者中的ecDNA携带细胞 数字病理学 胶质母细胞瘤 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq NA 单细胞ATAC-seq数据, 单细胞RNA-seq数据 基于可用的胶质母细胞瘤数据集,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
8 2025-12-10
Multi-dimensional omics integrated machine learning framework identifies macrophage-fibroblast-tumor co-infiltration patterns to predict prognosis in gastric cancer
2025-Dec-09, NPJ digital medicine IF:12.4Q1
研究论文 本研究通过整合多维组学数据和机器学习框架,识别了胃癌中巨噬细胞-成纤维细胞-肿瘤细胞的共浸润模式,以预测患者预后 开发了基于空间转录组学和scRNA-seq的机器学习框架Gastric-Discovery,首次系统揭示了PLAU-PLAUR信号轴在胃癌TME细胞间通讯中的核心调控作用 研究样本量有限,需要更大规模队列验证;机器学习模型在外部数据集上的泛化能力有待进一步评估 解析胃癌肿瘤微环境的空间异质性,开发预后预测工具 胃癌组织样本及其肿瘤微环境中的巨噬细胞、成纤维细胞和肿瘤细胞 数字病理学 胃癌 空间转录组学,单细胞RNA测序,批量RNA测序,多重免疫荧光 ResNet-50(基于ImageNet预训练),迁移学习 空间转录组数据,单细胞RNA-seq数据,批量RNA-seq数据,免疫荧光图像 未明确说明具体样本数量 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学,批量RNA-seq NA NA
9 2025-12-10
MyD88 Deficiency Protects Mice From Experimental Autoimmune Encephalomyelitis by Influencing Both Dendritic Cells and T Cells
2025-Dec-09, Immunology IF:4.9Q2
研究论文 本研究探讨了MyD88信号通路在实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)发病机制中的作用,特别是其对树突状细胞和T细胞功能及相互作用的影响 通过重新分析多发性硬化症(MS)患者的单细胞RNA测序数据,揭示了MyD88在DC和CD4 T细胞中的显著上调,并首次在EAE模型中系统阐明了MyD88缺陷如何通过影响DC成熟和促炎细胞因子产生来损害Th1/Th17细胞分化和T细胞激活 研究主要基于小鼠EAE模型,其结果向人类MS疾病的直接转化仍需进一步验证;机制研究尚未完全阐明MyD88下游的具体信号通路 阐明MyD88信号在实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)发病机制中,特别是在树突状细胞与T细胞相互作用方面的具体作用 多发性硬化症(MS)患者外周血单个核细胞、实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)小鼠模型 NA 多发性硬化症 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
10 2025-12-10
Expanded but dysfunctional regulatory T cells in treatment-naïve autoimmune hepatitis
2025-Dec-09, Hepatology international IF:5.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序、流式细胞术和免疫组化等方法,评估了自身免疫性肝炎(AIH)患者中调节性T细胞(Tregs)的表型、功能和分布,发现尽管Tregs在肝脏组织中扩增,但其抑制功能受损,表明功能不稳定是AIH免疫失调的关键因素 首次结合单细胞RNA测序和功能实验,揭示了AIH患者Tregs在扩增的同时存在功能缺陷,特别是IL-7R上调提示的功能不稳定性 单细胞RNA测序样本量较小(每组仅一人),且未详细探讨Tregs功能受损的具体分子机制 评估AIH患者中Tregs的表型、功能和分布,并探讨其与免疫失调的潜在关联 57例经活检确诊的AIH患者的外周血和肝脏样本 免疫学 自身免疫性肝炎 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫组化、共培养实验 NA 单细胞RNA测序数据、流式细胞术数据、免疫组化图像 57例AIH患者(外周血单核细胞45例,肝脏组织37例,免疫组化33例,共培养实验25例) NA 单细胞RNA测序 NA NA
11 2025-12-10
IL-1β+ lung-resident macrophages mediate endothelial dysfunction and acute lung injury in sepsis through immune-metabolic crosstalk
2025-Dec-08, Cell death discovery IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过小鼠脓毒症模型,揭示了表达IL-1β的肺驻留巨噬细胞亚群通过免疫代谢交互作用介导内皮功能障碍和急性肺损伤的机制 首次鉴定出IL-1β⁺肺驻留巨噬细胞亚群在脓毒症急性肺损伤中的关键作用,并揭示了其通过免疫代谢轴协调内皮功能障碍的新机制 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中验证;具体代谢通路和临床转化潜力需进一步探索 探究脓毒症诱导的急性肺损伤中免疫细胞与肺内皮相互作用的分子调控机制 小鼠脓毒症模型中的肺驻留巨噬细胞和肺内皮细胞 数字病理学 脓毒症相关急性肺损伤 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、免疫测定、Western印迹、代谢组学、体外共培养实验 NA 单细胞转录组数据、蛋白质数据、代谢组数据、组织病理图像 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
12 2025-12-10
Clonal cell states link gastroesophageal junction tissues with metaplasia and cancer
2025-Dec-08, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞谱系追踪和转录组分析,揭示了Barrett食管与食管腺癌前病变的细胞状态和谱系连接 首次在人类中揭示了Barrett食管起源、维持和进展的细胞状态及谱系连接,并发现其与食管和胃组织的谱系关联 研究样本可能有限,且未详细探讨所有细胞类型的分子机制 解析Barrett食管的细胞状态和谱系连接,以理解其起源、维持和进展机制 来自化生和健康组织的患者细胞 数字病理学 食管癌 单细胞谱系追踪,转录组分析,空间转录组学 NA 单细胞转录组数据,空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
13 2025-12-10
Comprehensive profiling of smoke-induced T cells in mice implicates clonal γδT17 cells as a hallmark of COPD
2025-Dec-08, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞测序等技术,全面解析了吸烟诱导的小鼠T细胞变化,揭示了克隆性γδT17细胞在慢性阻塞性肺疾病(COPD)中的关键作用 首次在单细胞水平上系统描绘了吸烟诱导的T细胞变化图谱,并发现克隆性扩增的γδT17细胞在COPD炎症中具有保护性功能 研究基于小鼠模型,其在人类COPD中的直接适用性仍需进一步验证 阐明吸烟诱导的慢性阻塞性肺疾病(COPD)中T细胞的免疫应答机制 吸烟暴露的小鼠模型中的T细胞 数字病理学 慢性阻塞性肺疾病 单细胞RNA测序,TCR测序,流式细胞术 NA 单细胞转录组数据,TCR序列数据,流式细胞数据 未明确说明具体样本数量,但涉及小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
14 2025-12-10
Identification of a super enhancer associated gene signature for the prognosis prediction and regulatory mechanism exploration in breast cancer
2025-Dec-08, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究构建了一个基于超级增强子相关基因的临床预测模型,用于乳腺癌患者的预后预测和调控机制探索 首次结合超级增强子相关基因和LASSO算法构建Super-Enhancer-Related Score(SERS),并整合临床特征建立高精度预测模型,同时利用单细胞RNA测序数据深入探索调控机制 研究主要基于生物信息学分析,实验验证部分仅通过免疫组化验证了TFF1基因,缺乏更全面的功能实验验证 探索超级增强子相关基因对乳腺癌的影响及其潜在调控机制 乳腺癌患者和健康对照的基因表达数据 生物信息学 乳腺癌 RNA-seq, 单细胞RNA测序, 免疫组化 Cox回归, LASSO算法, 多种机器学习方法 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据, 临床数据 NA NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
15 2025-12-10
Uncovering the prognostic implications and immunological roles of transmembrane protein 208 in bladder cancer by multi omics analysis and experimental verification
2025-Dec-08, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过多组学分析和实验验证,揭示了跨膜蛋白208在膀胱癌中的预后意义和免疫学作用 首次系统性地将TMEM208在膀胱癌中的表达与临床特征、免疫浸润、肿瘤微环境及细胞功能联系起来,并通过实验验证了其促癌功能 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,实验验证部分可能需要在更多细胞系或体内模型中进一步确认 探索跨膜蛋白208在膀胱癌中的生物学功能、预后价值及作为治疗靶点的潜力 膀胱癌患者样本数据及膀胱癌细胞系 生物信息学与计算生物学 膀胱癌 多组学分析、空间转录组学、单细胞测序、细胞功能实验 NA 基因表达数据、临床数据、单细胞数据、空间转录组数据 TCGA数据库及15个GEO数据集中的膀胱癌样本 NA 单细胞测序, 空间转录组学 NA NA
16 2025-12-10
Multi-omics reveals that genes linked to succinylation regulate the onset of epilepsy through metabolic reprogramming
2025-Dec-08, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society IF:2.7Q2
研究论文 本研究结合孟德尔随机化和单细胞转录组技术,揭示了琥珀酰化相关基因CTBP1通过代谢重编程和神经元异质性调控促进癫痫发生的新机制 首次整合多组学证据,将琥珀酰化修饰基因CTBP1、血浆代谢物失调与癫痫风险联系起来,并利用单细胞转录组学在细胞类型特异性层面解析了其调控网络 研究主要基于观察性数据和遗传工具变量分析,因果关系的确立仍需后续实验验证;单细胞数据仅来源于颞叶,可能无法完全代表其他脑区 探究琥珀酰化修饰相关基因、血浆代谢物与癫痫之间的因果关系及潜在代谢介导通路 癫痫患者(具体样本数未明确提及)的遗传数据、血浆代谢物数据及颞叶单细胞转录组数据 生物信息学,多组学整合分析 癫痫 孟德尔随机化分析,单细胞RNA测序 NA 遗传数据(eQTL),血浆代谢物数据,单细胞转录组数据 NA(使用了公开数据库eQTLGen和血浆代谢物数据库,以及癫痫患者颞叶单细胞数据,但具体样本数未明确) NA 单细胞RNA-seq NA NA
17 2025-12-10
Long non-coding RNAs in cancer glycolysis and metabolism: mechanisms and translational opportunities
2025-Dec-08, Cell death & disease IF:8.1Q1
综述 本文综述了长链非编码RNA在癌症糖酵解和代谢中的调控作用及其作为诊断生物标志物和治疗靶点的潜力 强调了lncRNA通过调控糖酵解酶、转录因子和信号通路在癌症代谢重编程中的关键作用,并探讨了lncRNA编码的微肽在代谢控制中的功能多样性 面临递送特异性、脱靶效应和临床验证有限等挑战 探讨lncRNA在癌症代谢特别是糖酵解重编程中的调控机制及其在诊断和治疗中的转化机会 长链非编码RNA及其在癌症代谢中的作用 自然语言处理 癌症 单细胞多组学、空间转录组学、人工智能 NA NA NA NA 单细胞多组学, 空间转录组学 NA NA
18 2025-12-10
RNASEH2C enhances TRAF3IP1 to degrade RAI14 in lysosomes thus hindering macrophage antigen presentation and advancing liver cancer
2025-Dec-08, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 本研究揭示了RNASEH2C通过增强TRAF3IP1表达,促进RAI14在溶酶体中的降解,从而抑制巨噬细胞抗原呈递,进而促进肝癌进展的分子机制 首次发现RNASEH2C在非极化巨噬细胞中通过调控RAI14的溶酶体降解来抑制抗原呈递,并阐明了RAI14作为骨架蛋白在促进MHC II分子和肿瘤相关抗原巨胞饮中的作用 研究主要基于体外细胞模型和小鼠肿瘤模型,尚未在临床样本中进行大规模验证 探究RNASEH2C如何影响巨噬细胞抗原呈递及其在肝细胞癌进展中的作用 巨噬细胞、肝细胞癌 肿瘤免疫学 肝癌 单细胞RNA测序、免疫印迹、免疫荧光、免疫沉淀、流式细胞术 NA RNA测序数据、蛋白质数据、细胞图像数据 未明确说明具体样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
19 2025-12-10
Heterogeneity of active mast cells, endothelial cells, and fibroblasts in hemophilic arthritis defined by synovial single-cell sequencing
2025-Dec-08, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序首次绘制了血友病关节炎滑膜的单细胞转录组图谱,揭示了其与骨关节炎和类风湿关节炎滑膜的显著差异 首次利用单细胞RNA测序技术解析血友病关节炎滑膜的细胞异质性,识别了活化的血管周围肥大细胞和新型SCARA5+成纤维细胞亚群,并提出了铁死亡在疾病进展中的关键作用 样本量有限,且研究主要基于转录组数据,功能验证仍需进一步深入 探索血友病关节炎滑膜的转录组特征,揭示其潜在的病理机制 血友病关节炎患者的滑膜组织 单细胞测序 血友病关节炎 单细胞RNA测序,免疫荧光,免疫组化,体外细胞实验 NA 单细胞转录组数据 从接受全膝关节置换术的血友病关节炎患者获取的滑膜组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
20 2025-12-10
Ferritinophagy-related prognostic genes UBE2Q1, NEDD4L, and TCP11L2 for prognosis prediction in sepsis
2025-Dec-08, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过整合多组学数据识别了与脓毒症预后相关的铁蛋白自噬相关基因,并构建了一个风险模型用于患者分层和死亡率预测 首次结合批量与单细胞转录组学及孟德尔随机化方法,系统识别了脓毒症中铁蛋白自噬相关的预后基因UBE2Q1、NEDD4L和TCP11L2,并构建了有效的风险分层模型 研究为初步探索,提供了铁蛋白与自噬相关基因参与脓毒症发病机制的线索,但具体机制和临床转化潜力需进一步验证 识别脓毒症的预后生物标志物并探索其分子机制,以改善预后评估和治疗干预 脓毒症患者及其相关的基因表达数据 自然语言处理 脓毒症 批量转录组学,单细胞RNA测序,孟德尔随机化 风险预测模型 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
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