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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-03-19 |
High-sensitivity in situ detection of Sox21 reveals transcript asymmetry from the zygote stage
2026-May, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2026.02.002
PMID:41692143
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研究论文 | 本研究利用高灵敏度原位检测技术,揭示了小鼠胚胎发育中Sox21基因转录不对称性早在2细胞阶段就已出现 | 首次在2细胞阶段检测到Sox21 mRNA的异质性表达,并发现其优先从雄性原核表达,这为哺乳动物早期谱系决定的机制提供了新见解 | 研究主要基于小鼠模型,在人类或其他哺乳动物中的普适性尚需验证,且技术方法可能无法完全排除检测假阳性的可能性 | 探究哺乳动物早期胚胎发育中谱系决定的时间点和分子机制 | 小鼠早期胚胎(从受精卵到4细胞阶段) | 发育生物学 | NA | 杂交链式反应(HCR)结合共聚焦成像,单细胞RNA-seq | NA | 图像数据,转录组数据 | 未明确说明具体样本数量,但涉及多个发育阶段的小鼠胚胎 | NA | 单细胞RNA-seq,原位杂交 | NA | NA |
| 2 | 2026-03-19 |
Immune landscape in NOD.H-2h4 mouse model thyroid revealed by single-cell RNA sequencing
2026-04-16, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2026.153484
PMID:41734714
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了NOD.H-2h4小鼠甲状腺在桥本甲状腺炎不同阶段的免疫景观 | 首次在NOD.H-2h4小鼠模型中构建甲状腺单细胞转录组图谱,揭示了甲状腺细胞可塑性和Treg功能障碍作为疾病进展的潜在驱动因素 | 研究基于小鼠模型,结果可能无法完全反映人类桥本甲状腺炎的复杂性 | 探究桥本甲状腺炎中甲状腺细胞类型在免疫失调中的具体作用 | NOD.H-2h4小鼠的甲状腺组织 | 数字病理学 | 桥本甲状腺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 38,461个细胞,来自三个疾病阶段(4、8和16周)的小鼠甲状腺组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3 | 2026-03-19 |
Identification and experimental confirmation of TBC1D10C as a shared transcriptional link between abdominal aortic aneurysm and major depressive disorder
2026-04-09, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2026.153456
PMID:41702190
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据,识别并实验验证了TBC1D10C作为腹主动脉瘤和重度抑郁症之间的共享转录调控因子 | 首次发现TBC1D10C作为AAA和MDD的共同关键枢纽基因,并通过scRNA-seq和小鼠模型验证其在免疫细胞中的表达与淋巴细胞活化的负相关性 | 研究主要基于生物信息学分析和动物模型验证,缺乏直接的人类临床干预数据 | 揭示腹主动脉瘤和重度抑郁症之间的共享分子通路,寻找共同治疗靶点 | 腹主动脉瘤和重度抑郁症患者及小鼠模型的基因表达数据 | 生物信息学 | 心血管疾病 | RNA-seq, scRNA-seq | 机器学习 | 基因表达数据 | 七个基因表达数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-03-19 |
Refinement of histologic subtypes and identification of biomarkers linked to unfavorable prognosis in cholangiocarcinoma: The ENSCCA registries' framework for digital twin advancement
2026-Apr-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001425
PMID:40513068
|
研究论文 | 本研究通过建立欧洲胆管癌组织学注册库,分析了胆管癌的组织学异质性及其与临床预后的关联,并利用空间转录组学等技术识别了与不良预后相关的生物标志物 | 首次通过多中心数字化注册库系统评估胆管癌组织学亚型(如PAS HIGH LBD iCCA)的临床意义,并整合空间转录组学、影像组学和血清学数据构建数字孪生框架 | 样本量相对有限(共293例患者),空间转录组学分析仅覆盖18例病例,可能影响统计功效和泛化性 | 评估胆管癌组织学异质性的临床相关性,并识别与不良预后相关的组织生物标志物 | 胆管癌患者(包括肝内和肝门部亚型)的组织样本、影像数据和临床信息 | 数字病理学 | 胆管癌 | 免疫组织化学染色、空间转录组学分析、影像组学技术、CT扫描形态学分析 | Cox回归模型 | 组织图像、CT影像、转录组数据、临床数据 | 293例患者(其中112例有CT扫描,18例进行空间转录组学分析) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5 | 2026-03-19 |
MIF-mediated crosstalk between THRSP + hepatocytes and CD74 + lipid-associated macrophages in hepatic periportal zone drives MASH
2026-Apr-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001429
PMID:40590856
|
研究论文 | 本研究揭示了THRSP通过MIF介导在肝脏门静脉区招募CD74+脂质相关巨噬细胞驱动MASH进展的机制 | 首次阐明了THRSP+肝细胞与CD74+脂质相关巨噬细胞在肝脏门静脉区通过MIF介导的相互作用在MASH进展中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限,且THRSP抑制剂C6的临床转化潜力需进一步评估 | 探究代谢功能障碍相关脂肪性肝炎(MASH)进展的空间分区机制及细胞间相互作用 | MASH小鼠模型、MASH患者肝脏样本、THRSP+肝细胞、CD74+脂质相关巨噬细胞 | 空间转录组学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎 | 空间转录组学、CellPhoneDB分析、基因过表达/敲除实验 | NA | 空间转录组数据、基因表达数据 | MASH小鼠模型及患者肝脏样本(具体数量未明确说明) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6 | 2026-03-19 |
Pathological mechanisms and treatment strategies for immune checkpoint inhibitor-associated myocarditis: insights from single-cell sequencing
2026-Apr, Basic research in cardiology
IF:7.5Q1
DOI:10.1007/s00395-025-01156-3
PMID:41520297
|
综述 | 本文综述了单细胞测序技术在免疫检查点抑制剂相关心肌炎(ICI-M)研究中的应用进展,并探讨了基于机制见解的靶向治疗策略 | 系统总结了单细胞测序技术如何从单细胞分辨率揭示ICI-M的细胞组成变化和基因表达特征,为理解其发病机制提供了关键见解,并在此基础上讨论了不损害抗肿瘤免疫力的精准干预新策略 | 本文是一篇综述,未涉及原始实验数据;单细胞测序技术本身可能存在技术偏差,且其在ICI-M中的应用仍处于早期阶段 | 阐明免疫检查点抑制剂相关心肌炎的病理机制,并探索精准治疗策略 | 免疫检查点抑制剂相关心肌炎 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 7 | 2026-03-19 |
Cardiac lymphatics: functional plasticity in development, disease, and precision-targeted therapies
2026-Apr, Basic research in cardiology
IF:7.5Q1
DOI:10.1007/s00395-025-01159-0
PMID:41571961
|
综述 | 本文综述了心脏淋巴系统在发育、疾病中的功能可塑性及其精准靶向治疗的最新进展 | 利用单细胞转录组学揭示了心脏淋巴内皮细胞的功能亚群,并提出了性别特异性分子调控和精准纳米治疗等新兴策略 | 自主神经与淋巴系统的整合以及谱系特异性表观遗传记忆等关键问题尚未解决 | 探讨心脏淋巴系统在维持心肌稳态中的功能及其在疾病治疗中的转化潜力 | 心脏淋巴系统、淋巴内皮细胞(LECs) | NA | 心血管疾病 | 单细胞转录组学(scRNA-seq) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8 | 2026-03-19 |
Immunosuppressive immune microenvironment landscapes in VISTA-high gastric cancer
2026-Apr, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03290-0
PMID:41588173
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了VISTA在胃癌中的表达模式及其在免疫抑制微环境中的关键作用 | 首次系统性地结合多重免疫组化、单细胞RNA测序和空间转录组学技术,全面解析了VISTA高表达胃癌的免疫微环境特征,并发现了VISTA+单核-巨噬细胞通过LGALS9-PTPRC信号轴促进T细胞耗竭的新机制 | 样本量相对有限(单细胞测序n=17,空间转录组学n=3),且为观察性研究,需要进一步的功能实验验证机制 | 探究VISTA在胃癌中的表达模式及其在肿瘤免疫微环境中的功能特性 | 胃癌患者的肿瘤样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 多重免疫组化,单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 图像,RNA测序数据 | 172例患者肿瘤样本(多重免疫组化),17例单细胞RNA测序,3例空间转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 9 | 2026-03-19 |
A microfluidic-engineered vascularized endometrium micro-organoid platform for functional repair of intrauterine adhesion
2026-Mar-18, Biofabrication
IF:8.2Q1
DOI:10.1088/1758-5090/ae4f26
PMID:41802406
|
研究论文 | 本文介绍了一种微流控生物制造策略,用于构建血管化子宫内膜微器官平台,以功能性修复宫腔粘连 | 通过微流控技术共封装人子宫内膜基质细胞、上皮类器官和内皮细胞,构建了支持激素响应、蜕膜化和病理重塑的3D血管化微器官平台 | 研究基于小鼠模型,临床转化需进一步验证;微器官的长期稳定性和规模化生产有待优化 | 开发一种功能性修复宫腔粘连的血管化子宫内膜微器官平台 | 人子宫内膜基质细胞、上皮类器官、内皮细胞(HUVECs)及小鼠宫腔粘连模型 | 组织工程与再生医学 | 宫腔粘连 | 微流控生物制造、单细胞测序、转录组分析 | NA | 单细胞测序数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 10 | 2026-03-19 |
Age-stratified treatment response in rheumatoid arthritis: a systematic review, meta-analysis, and integrated genetic and single-cell evidence implicating IL6R/TYK2 signaling
2026-Mar-18, Clinical rheumatology
IF:2.9Q2
DOI:10.1007/s10067-026-08029-7
PMID:41845003
|
系统综述与荟萃分析 | 本研究通过系统综述、荟萃分析、孟德尔随机化和单细胞RNA测序,评估了晚发性类风湿关节炎(LORA)与年轻发病类风湿关节炎(YORA)在治疗反应上的差异,并探讨了IL6R/TYK2信号通路在其中的作用 | 首次整合了临床荟萃分析、遗传学孟德尔随机化和单细胞RNA测序数据,系统揭示了年龄分层(LORA vs. YORA)在类风湿关节炎治疗反应中的差异,并确定了IL6R和TYK2通路作为潜在机制靶点 | 纳入的临床研究数量有限(12项),且单细胞数据来源于特定数据集(GSE299518),可能无法完全代表所有患者群体,未来需要更大样本和前瞻性研究验证 | 评估晚发性类风湿关节炎(LORA)与年轻发病类风湿关节炎(YORA)患者对改善病情抗风湿药(DMARDs)的治疗反应差异,并探索其潜在的分子机制 | 类风湿关节炎患者,特别是根据发病年龄分为晚发性(≥60岁)和年轻发病(<60岁)的亚组 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 系统综述与荟萃分析,孟德尔随机化,单细胞RNA测序 | 随机效应模型,两样本孟德尔随机化,单细胞数据分析(包括拟时序分析) | 临床研究数据,全基因组关联研究汇总统计数据,单细胞RNA测序数据 | 超过5000名患者(来自12项研究),以及来自关节组织的13,979个细胞的单细胞数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11 | 2026-03-19 |
Single-cell analysis of a salmonid immune system (river brown trout Salmo trutta fario) reveals evolutionary divergence and hatchery-induced transcriptional reprogramming
2026-Mar-18, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-026-02554-2
PMID:41845393
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析,揭示了河鳟免疫系统的进化分化和养殖环境诱导的转录重编程 | 首次对河鳟免疫细胞进行单细胞转录组分析,揭示了全基因组复制衍生的同源基因对的转录分歧以及养殖环境对免疫细胞转录身份的影响 | 研究主要基于肾脏来源的免疫细胞,可能未全面覆盖其他免疫组织;且养殖环境的影响机制尚未完全阐明 | 探究河鳟免疫系统的进化多样性和养殖环境对免疫细胞转录组的影响 | 河鳟(Salmo trutta fario)的免疫细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过83,000个肾脏来源的免疫细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2026-03-19 |
Deciphering transcriptional plasticity in pancreatic ductal adenocarcinoma reveals alterations in sensory neuron innervation
2026-Mar-18, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.70233
PMID:41847880
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了胰腺和胰腺导管腺癌(PDAC)中的感觉神经元转录组,揭示了肿瘤相关神经重塑的分子机制 | 首次在PDAC小鼠模型中鉴定出感觉神经元内存在肿瘤来源的RNA,提示了细胞外囊泡介导的RNA转移新机制 | 研究基于小鼠模型,结果在人类PDAC中的适用性需进一步验证 | 探究胰腺导管腺癌中感觉神经元转录组的变化及其在肿瘤进展中的作用 | 野生型和PDAC小鼠模型中的胰腺感觉神经元 | 单细胞转录组学 | 胰腺导管腺癌 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、类器官培养、qPCR | NA | 单细胞转录组数据 | 野生型和PDAC小鼠的背根神经节感觉神经元 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2026-03-19 |
Tumor Necrosis Factor Receptor-Associated Factor 1 Inhibits Macrophage Killing of Sporothrix schenckii by Enhancing Expression and Activity of Inducible Nitric Oxide Synthase
2026-Mar-17, The Journal of infectious diseases
IF:5.0Q1
DOI:10.1093/infdis/jiaf646
PMID:41428466
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和实验模型,揭示了TRAF1通过稳定NOS2表达抑制巨噬细胞杀伤申克孢子丝菌的机制,并探讨了局部热疗的治疗作用 | 首次发现TRAF1通过结合NOS2抑制其泛素化降解,从而延迟孢子丝菌病愈合,并阐明热疗通过下调TRAF1和NOS2表达发挥治疗作用 | 机制研究主要在体外和动物模型中进行,临床转化需进一步验证 | 探究TRAF1和NOS2在孢子丝菌病免疫逃逸中的作用及热疗的治疗机制 | 申克孢子丝菌感染的巨噬细胞及孢子丝菌病病变组织 | NA | 孢子丝菌病 | 单细胞RNA测序, 免疫共沉淀, 泛素化分析, 定点突变 | NA | 单细胞RNA测序数据, 实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2026-03-19 |
The Fd4 transcription factor translates transient spatial cues in progenitors into long-term lineage identity
2026-Mar-17, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.109188
PMID:41842930
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序,鉴定出转录因子Fd4在特定神经祖细胞及其新生后代中持续表达,将短暂的时空信号转化为长期的谱系身份,从而激活谱系特异性终末选择基因 | 首次提出“谱系身份基因”概念,并鉴定出Fd4作为该类别基因的先驱成员,揭示了其连接短暂空间因子与谱系特异性终末选择基因的机制 | 研究主要基于果蝇模型,在哺乳动物系统中的普适性有待验证;单细胞测序数据可能未完全覆盖所有发育阶段 | 探究神经祖细胞在空间信号消失后如何维持其独特身份,以确保后代表达正确的谱系特异性终末选择基因 | 果蝇的神经祖细胞(神经母细胞NB7-1)及其新生神经元后代 | 发育神经生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2026-03-19 |
Maternal opioid use and hepatitis C infection disrupt the placental immune landscape and structure
2026-Mar-17, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.199606
PMID:41842943
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研究论文 | 本研究探讨了母体阿片类药物使用障碍(OUD)和丙型肝炎病毒(HCV)感染对胎盘免疫景观和结构的破坏作用 | 首次结合流式细胞术、组织学、空间转录组学和单细胞转录组学,系统揭示OUD对胎盘组织的多层面影响,并基于母体HCV状态进行分层分析 | 研究样本量未明确说明,且未详细讨论OUD与HCV感染的独立或交互效应 | 探究母体OUD和HCV感染如何影响胎盘结构和免疫功能 | 胎盘组织 | 数字病理学 | 丙型肝炎 | 流式细胞术、组织学、空间转录组学、单细胞转录组学 | CellChat分析 | 图像、转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 16 | 2026-03-19 |
Association of CCL21+ CAFs with B-cell recruitment and TLS maturation in penile squamous cell carcinoma
2026-Mar-17, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-026-04348-5
PMID:41843154
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研究论文 | 本研究通过整合多种技术手段,揭示了CCL21+ CAFs在阴茎鳞状细胞癌中与B细胞招募及三级淋巴结构成熟之间的关联 | 首次在PSCC中量化TLS成熟度,并识别出与成熟TLS相关的CCL21+ CAF亚群及其空间分布特征,提出了CCL21-CCR7轴作为治疗靶点的潜力 | 研究样本量有限,且为观察性研究,未进行功能性验证实验 | 探究阴茎鳞状细胞癌中三级淋巴结构的成熟机制及其与肿瘤免疫微环境的关联 | 阴茎鳞状细胞癌患者组织样本 | 数字病理学 | 阴茎癌 | H&E染色、多重免疫组化、空间转录组学、单细胞RNA测序、bulk RNA测序 | NA | 图像、空间转录组数据、单细胞RNA测序数据、bulk RNA测序数据 | 未明确指定样本数量,但涉及PSCC患者组织 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 17 | 2026-03-19 |
A Novel Low-Dimensional Sparse and Low-Rank Representation Method for Single-Cell RNA Sequencing Data Clustering
2026-Mar-17, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3674992
PMID:41843533
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研究论文 | 本文提出了一种名为LDSLRR的新型低维稀疏低秩表示方法,用于单细胞RNA测序数据的聚类分析 | 将降维、自表示矩阵构建和聚类过程集成到一个端到端模型中,通过同时优化这三个模块来提高聚类准确性 | NA | 解决单细胞RNA测序数据因高维度和稀疏性带来的聚类挑战,以实现更精确的细胞聚类 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | LDSLRR(低维稀疏低秩表示模型),结合图正则化非负矩阵分解 | 基因表达矩阵 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2026-03-19 |
Single-cell landscape of piglet lung response with Actinobacillus pleuropneumoniae
2026-Mar-17, Virulence
IF:5.5Q1
DOI:10.1080/21505594.2026.2646800
PMID:41843736
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了仔猪肺部在胸膜肺炎放线杆菌感染下的免疫反应和纤维化特征 | 首次在仔猪模型中应用单细胞RNA测序技术,系统性地解析了胸膜肺炎放线杆菌感染引起的肺部免疫细胞动态变化和纤维化机制,并识别了关键的细胞亚群和信号通路 | 研究仅基于仔猪模型,结果可能不完全适用于人类疾病;样本量可能有限,且未涉及长期感染或治疗干预的效果 | 阐明胸膜肺炎放线杆菌感染引起的仔猪肺部免疫反应和纤维化机制,为开发针对性治疗策略提供分子资源 | 仔猪肺部组织 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 未明确指定,但涉及感染和未感染的仔猪肺部样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 19 | 2026-03-19 |
DUSP6 ablation restores CAR T-cell fitness impaired by tumor CD58 loss through invigoration of AP-1 signaling
2026-Mar-17, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-026-02597-5
PMID:41844571
|
研究论文 | 本研究揭示了肿瘤CD58缺失通过减弱AP-1信号导致CAR-T细胞功能障碍,并发现阻断DUSP6可恢复CAR-T细胞的适应性 | 重新定位CD58不仅是免疫突触成分,更是CAR-T细胞生物学中的代谢检查点,并确定DUSP6阻断是增强CAR-T细胞效力的新工程靶点 | 未明确说明 | 探究肿瘤CD58缺失导致CAR-T细胞功能障碍的机制,并寻找恢复CAR-T细胞适应性的治疗策略 | CAR-T细胞 | 肿瘤免疫治疗 | 癌症 | CRISPR/Cas9筛选、单细胞RNA-seq、转录组分析 | NA | 转录组数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2026-03-19 |
Epigenetic context defines the transcriptional activity of canonical and noncanonical NF-κB signaling in pancreatic cancer
2026-Mar-17, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-026-03019-9
PMID:41844578
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研究论文 | 本研究通过转录组、基因组和表观基因组分析,揭示了胰腺导管腺癌中NF-κB信号通路的经典与非经典途径在TNFα和TWEAK激活下的差异调控机制 | 首次系统比较了RELA和RELB在胰腺癌中的时空动态、染色质结合特性及与AP1的协同调控关系,并利用单细胞技术解析了它们在肿瘤微环境中的空间分布 | 研究主要基于体外刺激模型和有限的原发组织样本,尚未在更大队列或体内模型中验证功能后果 | 阐明胰腺导管腺癌中经典与非经典NF-κB信号通路的激活机制、转录调控功能及其在肿瘤微环境中的作用 | 胰腺导管腺癌细胞系及原发肿瘤组织 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 转录组基因表达谱分析、全基因组占据图谱、表观基因组分析、单细胞RNA测序、多重免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据、染色质可及性数据、单细胞转录组数据、免疫荧光图像 | 未明确样本数量,涉及细胞系刺激实验和原发PDAC组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |