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当前共找到 38125 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-04-07 |
Mapping cellular heterogeneity and dynamic interactions in pancreatic cancer
2026-May-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2026.114757
PMID:41780688
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在胰腺导管腺癌（PDAC）中用于解析肿瘤内异质性、微环境成分及动态细胞相互作用的应用 | 系统总结了scRNA-seq在PDAC研究中的工作流程、数据分析方法及其在识别细胞亚群转化、生物标志物和治疗靶点方面的创新应用 | 作为综述文章，未进行原始实验研究，主要依赖现有文献总结，可能未涵盖所有最新技术进展 | 探讨scRNA-seq技术如何帮助理解PDAC的肿瘤内异质性、微环境动态及潜在治疗策略 | 胰腺导管腺癌（PDAC）的肿瘤细胞、微环境成分（如免疫细胞、癌症相关成纤维细胞）及相关生物标志物 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2026-04-07 |
Exploring adenoid basal carcinoma to squamous cell carcinoma of the uterine cervix transformation using spatial transcriptomics
2026-May, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.70036
PMID:41670056
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学探索了子宫颈腺样基底癌向鳞状细胞癌转化的分子机制 | 首次应用空间转录组学技术分析腺样基底癌、过渡巢、鳞状细胞癌和高级别鳞状上皮内病变之间的分子差异，并识别出区分过渡巢的关键基因CK13和SCCA2 | 样本量有限（仅4例用于空间转录组分析），未来需要更大规模的研究来指导临床决策 | 阐明腺样基底癌与鳞状细胞癌之间的转化关系，为治疗策略提供指导 | 子宫颈腺样基底癌及其伴随的鳞状细胞癌、过渡巢和高级别鳞状上皮内病变 | 数字病理学 | 子宫颈癌 | 空间转录组学，免疫组织化学 | NA | 空间转录组数据，组织图像 | 20例腺样基底癌病例，其中4例用于空间转录组分析 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3 | 2026-04-07 |
The immune-metabolism interactome in efferocytosis: a new paradigm for the central nervous system diseases revealed by single-cell sequencing analysis
2026-May, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.70031
PMID:41693397
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综述 | 本文综述了胞葬作用在维持中枢神经系统稳态中的基本过程、免疫-代谢交互作用及其调控，并基于单细胞测序分析探讨了其在多种中枢神经系统疾病中的关键作用 | 提出了免疫-代谢相互作用组在胞葬作用中的新范式，并利用单细胞测序分析揭示了小胶质细胞在胞葬过程中的异质性 | NA | 总结胞葬作用在中枢神经系统发育、衰老及疾病中的作用，并探讨其潜在治疗策略 | 小胶质细胞、中枢神经系统疾病（如脑缺血、脑出血、创伤性脑损伤、重度抑郁症、多形性胶质母细胞瘤、阿尔茨海默病、帕金森病等） | 数字病理学 | 老年性疾病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-04-07 |
Xenium-based spatial transcriptomic analyses uncover prognosis-associated heterogeneity in the tumor microenvironment (TME) of angioimmunoblastic T-cell lymphoma (AITL)
2026-May, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.70035
PMID:41711078
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研究论文 | 本研究利用Xenium空间转录组学技术，比较了难治/复发性和治疗敏感的血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤样本，揭示了肿瘤微环境的异质性并鉴定出与预后相关的新型Tfh细胞亚群 | 首次在AITL中鉴定出具有干细胞样特征的NEIL3+ Tfh细胞亚群，并系统描绘了难治/复发与治疗敏感病例间肿瘤微环境免疫细胞组成的空间分布差异 | 样本量较小（10例临床样本），且为观察性研究，需要更大规模队列和功能实验验证 | 解析血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤肿瘤微环境的异质性及其与治疗抵抗的关联 | 血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤患者的临床组织样本 | 空间转录组学 | 淋巴瘤 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 10例临床样本（包括难治/复发和治疗敏感病例） | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | Xenium空间转录组分析平台 |
| 5 | 2026-04-07 |
Intervention of Rutin and Ochnaflavone in the Attenuation of Neuroinflammation and Neuronal Apoptosis in Spinal Cord Injury
2026-Apr, Global spine journal
IF:2.6Q1
DOI:10.1177/21925682251383489
PMID:41001708
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研究论文 | 本研究探讨了芦丁和欧查黄酮在脊髓损伤中通过调节小胶质细胞和PI3K/AKT及NF-κB信号通路减轻神经炎症和神经元凋亡的神经保护机制 | 首次结合单细胞RNA测序和网络药理学方法，揭示了芦丁和欧查黄酮协同抑制小胶质细胞激活及下游信号通路的分子机制，为脊髓损伤提供了一种新的联合治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，尚未在人类临床中进行验证，且具体剂量和长期安全性需进一步评估 | 阐明芦丁和欧查黄酮在脊髓损伤中的神经保护作用机制，特别是对次级损伤过程的调控 | 脊髓损伤小鼠模型、LPS刺激的BV2小胶质细胞、小胶质细胞-神经元共培养系统 | 神经科学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序、网络药理学、Western blotting、免疫荧光、ELISA | NA | 基因表达数据、蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6 | 2026-04-07 |
A universal and cost-efficient sample labeling approach for multiplexed single-cell RNA-seq based on recombinant HUH-endonuclease-agglutinin tagging
2026-Apr, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2025.10.004
PMID:41167558
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研究论文 | 本文提出了一种基于重组HUH-核酸内切酶-凝集素标记（HEATag）的通用且成本效益高的样本标记方法，用于多重单细胞RNA测序 | 结合鸭圆环病毒HUH核酸内切酶（DCV）和小麦胚芽凝集素（WGA），开发了一种新型通用细胞膜标记方法，实现了快速、序列特异性的索引单链DNA标记，且适用于新鲜或固定细胞及多种物种 | NA | 解决单细胞转录组学中多重样本标记方法成本高或操作复杂的问题，以降低单细胞测序的每样本成本 | 细胞膜（适用于新鲜或固定细胞及多种物种） | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 兼容商业平台和定制系统，可适配多种单细胞组学工作流程 |
| 7 | 2026-04-07 |
Multi-modal molecular and spatial profiling reveals NNT as a prognostic biomarker in obesity-associated colorectal cancer
2026-Apr, Journal of gastroenterology
IF:6.9Q1
DOI:10.1007/s00535-025-02339-4
PMID:41457181
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研究论文 | 本研究通过整合转录组学数据、临床验证和空间分析，揭示了NNT作为肥胖相关结直肠癌预后生物标志物的潜力 | 结合多模态分子和空间分析，首次将NNT鉴定为肥胖相关结直肠癌的预后生物标志物，并揭示了其与肿瘤微环境的关联 | 研究依赖于现有数据集和独立队列验证，可能存在样本选择偏差，且空间分析仅限于GeoMx DSP平台 | 识别反映肥胖相关肿瘤特征的分子生物标志物并分层患者预后 | 结直肠癌患者样本，包括正常、健康体重和肥胖个体 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 转录组学分析、免疫组织化学、空间转录组学 | NA | 转录组数据、临床数据、空间转录组数据 | TCGA-COADREAD数据集和独立验证队列 | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx DSP | GeoMx数字空间分析仪 |
| 8 | 2026-04-07 |
Efferocytosis deficiency exacerbates local inflammation and predicts recurrence in chronic rhinosinusitis with nasal polyps
2026-Apr, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2025.12.1016
PMID:41638263
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研究论文 | 本研究全面表征了慢性鼻窦炎（CRS）中胞葬作用的缺陷，并探讨了其与炎症内型及临床结局的关联 | 首次在单细胞分辨率下系统揭示了CRS中胞葬作用的广泛缺陷，并识别出与疾病复发相关的5分子特征预测面板 | 研究主要基于组织样本分析，缺乏体内功能验证实验 | 探究胞葬作用在慢性鼻窦炎（特别是伴鼻息肉型）中的作用机制及其临床意义 | 慢性鼻窦炎（CRS）患者，特别是伴鼻息肉型（CRSwNP）的鼻息肉组织与健康鼻黏膜 | 数字病理学 | 慢性鼻窦炎 | 定量实时PCR、免疫组织化学、单细胞RNA测序 | 回归模型、受试者工作特征分析 | 基因表达数据、组织图像数据 | 未明确样本数量，涉及CRS患者与健康对照的鼻组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9 | 2026-04-07 |
Endogenous oestrogens as neuroprotective modulators in the human retina: Evidence from transcriptomic profiling and aromatase inhibition
2026-Apr, Journal of neuroendocrinology
IF:3.3Q2
DOI:10.1111/jne.70171
PMID:41877439
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析和小鼠视网膜外植体实验，探讨了内源性雌激素在人视网膜中的神经保护作用及其细胞类型特异性表达 | 首次在单细胞水平上系统描绘了人视网膜中类固醇激素代谢和雌激素信号通路基因的表达图谱，并利用芳香化酶抑制剂验证了局部雌激素合成对光感受器维持和免疫调节的功能相关性 | 研究主要基于小鼠视网膜外植体模型，可能无法完全模拟人视网膜的生理环境；且实验仅使用单一浓度（20 μM）的来曲唑进行抑制，缺乏剂量依赖性验证 | 探究内源性雌激素在人视网膜中的神经保护作用及其细胞类型特异性功能 | 人视网膜单细胞RNA测序数据和小鼠视网膜外植体 | 数字病理学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 基于公开数据集E-MTAB-7316，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2026-04-07 |
Pathogenic GM-CSF drives functional diversification of inflammatory macrophages in autoimmune arthritis
2026-Mar-27, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aec0986
PMID:41880492
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研究论文 | 本研究探讨了在自身免疫性关节炎中，致病性GM-CSF如何驱动炎症性巨噬细胞的功能多样化，从而加剧关节炎症和疼痛 | 揭示了GM-CSF在促进关节浸润单核细胞分化为功能不同的巨噬细胞亚群中的关键作用，并识别了两个GM-CSF依赖的致病性滑膜巨噬细胞亚群 | 研究基于T辅助17细胞介导的自身免疫性关节炎模型，可能不适用于所有类型的关节炎，且单细胞RNA测序的样本量有限 | 阐明自身免疫性关节炎中巨噬细胞发育和功能多样化的机制 | 关节浸润的Ly6C单核细胞和滑膜巨噬细胞 | 免疫学 | 自身免疫性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2026-04-07 |
Machine learning-directed massively parallel programmable nucleic acid amplification
2026-Mar-27, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aec9175
PMID:41880514
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研究论文 | 本研究开发了一种基于热力学的可编程核酸扩增方法，通过机器学习优化，提高了扩增效率的调控精度，应用于DNA数据存储和临床诊断 | 通过引物标签补偿策略解耦序列特异性和杂交能量调控，实现了连续精确的扩增效率调制，并利用机器学习模型显著提升预测准确性 | 未明确说明方法在单细胞测序和空间转录组学中的具体应用验证，临床验证仅基于模拟测序深度 | 开发可编程核酸扩增技术，用于分子诊断和DNA数据存储 | 核酸扩增过程、DNA数据存储系统、宫颈癌RNA变异 | 机器学习 | 宫颈癌 | 核酸扩增、机器学习建模 | 机器学习模型 | 实验数据 | 2483个实验数据点 | NA | NA | NA | NA |
| 12 | 2026-04-07 |
Subtypes estimation in single-cell multi-omics data via S-multi-SNE
2026-Mar-25, Journal of theoretical biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1016/j.jtbi.2026.112442
PMID:41895518
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研究论文 | 本文提出S-multi-SNE方法，用于单细胞多组学数据的细胞亚型估计和可视化 | 将多视图降维方法multi-SNE和S-multi-SNE应用于单细胞RNA测序数据，能够整合来自不同个体、物种和测序技术的信息进行细胞亚型识别 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中细胞亚型可视化和分类的挑战 | 单细胞RNA测序数据和单细胞多组学数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | S-multi-SNE, multi-SNE | mRNA计数矩阵, 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 13 | 2026-03-28 |
Correction: Single-cell RNA-seq integrated with multi-omics reveals SERPINE2 as a target for metastasis in advanced renal cell carcinoma
2026-Mar-24, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08472-z
PMID:41876448
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 14 | 2026-04-07 |
Vascular invasion-associated gene expression is detectable in pre-surgical biopsies of stage I lung adenocarcinoma
2026-Mar-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70600-2
PMID:41876493
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研究论文 | 本研究通过分析I期肺腺癌的基因表达数据，发现血管侵犯相关的基因特征可在术前活检中检测到，为术前风险分层提供了潜在生物标志物 | 首次在I期肺腺癌中识别出与血管侵犯相关的可重复基因表达特征，并证明该特征在术前活检中具有检测潜力 | 研究样本量有限（162个切除肿瘤），且需要进一步独立验证以确认其临床适用性 | 开发能够术前预测I期肺腺癌血管侵犯的生物标志物，以改善复发风险评估和治疗决策 | I期肺腺癌患者的手术切除肿瘤样本和术前活检样本 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序，空间转录组学 | NA | 基因表达数据，空间转录组数据 | 162个切除肿瘤样本，部分样本进行空间转录组分析，另有一个独立验证队列和术前活检队列 | NA | bulk RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 15 | 2026-04-07 |
A single-cell and spatial transcriptomic atlas of human tuberculous constrictive pericardium
2026-Mar-23, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2026.106233
PMID:41875497
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研究论文 | 本研究构建了人类结核性缩窄性心包炎的单细胞和空间转录组图谱，揭示了其细胞组成、空间结构及驱动纤维化的关键细胞间通讯网络 | 首次整合单细胞RNA测序与空间转录组学，系统描绘了结核性缩窄性心包炎的细胞景观和空间组织结构，并识别出连接免疫激活与纤维化的关键细胞间信号通路 | 样本量较小（6例患者和3例对照），且为横断面研究，无法确定观察到的细胞状态变化的时间动态 | 阐明结核性心包炎进展为纤维化缩窄性心包炎的细胞和分子机制 | 手术切除的结核性缩窄性心包炎患者的心包组织及正常对照心包组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，空间转录组学，组织学，免疫组织化学，多重免疫荧光 | NA | 单细胞基因表达数据，空间基因表达数据，组织图像 | 来自6名结核性缩窄性心包炎患者和3名正常对照的81,634个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 16 | 2026-04-07 |
STiLE: Automated Tissue Microarray Dearraying for Spatial Transcriptomics
2026-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.17.712359
PMID:41890059
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研究论文 | 本文介绍了一种名为STiLE的工具，用于自动化组织微阵列（TMA）的去阵列化，仅基于细胞质心坐标操作，无需依赖组织学图像 | STiLE是首个仅基于细胞质心坐标的自动化TMA去阵列化工具，消除了对图像数据的依赖，提高了对染色质量变化和光照不均等伪影的鲁棒性 | 未在真实世界大规模数据集上进行广泛验证，可能对某些极端伪影情况处理不足 | 开发一种自动化工具，用于空间转录组学中组织微阵列的去阵列化，以解决手动分配细胞到各自核心的瓶颈问题 | 组织微阵列（TMA）样本中的细胞质心坐标 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | HDBSCAN（基于密度的聚类算法） | 细胞质心坐标 | 11个公共TMA样本（50-150个核心）和396个合成数据集 | Vizgen, 10x Genomics, NanoString | 空间转录组学 | Vizgen MERSCOPE, 10x Xenium, NanoString CosMx | 支持多种空间转录组学平台，包括Vizgen MERSCOPE、10x Xenium和NanoString CosMx |
| 17 | 2026-04-07 |
Spatial remodeling of the tumor immune microenvironment in hepatocellular carcinoma with cirrhosis driven by Treg-CD8⁺T cell crosstalk via the SPP1-ITGA4 axis
2026-Mar-18, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102734
PMID:41855857
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研究论文 | 本研究系统比较了肝硬化与非肝硬化肝细胞癌的肿瘤免疫微环境，揭示了Treg-CD8⁺T细胞通过SPP1-ITGA4轴的空间互作机制 | 首次在肝硬化背景下解析肝细胞癌免疫微空间结构，发现Treg-CD8⁺T细胞通过SPP1-ITGA4轴形成免疫抑制微环境 | 研究样本仅限HBV阳性病例，未涵盖其他病因的肝细胞癌；空间分析依赖特定技术平台 | 比较肝硬化与非肝硬化肝细胞癌的肿瘤微环境空间结构与免疫调控差异 | 278例HBV阳性肝细胞癌患者的肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | 空间分析模型 | 空间转录组数据，单细胞RNA-seq数据 | 278例HBV阳性肝细胞癌病例，包含2,837,999个细胞 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2026-04-07 |
Subcellular transcriptome sequencing with single cell APEX-seq identifies regulators of cell-cell interactions
2026-Mar-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.17.712496
PMID:41889815
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研究论文 | 本文介绍了一种名为单细胞APEX-seq（scAPEX-seq）的新方法，用于在单细胞分辨率下绘制亚细胞转录组图谱，并应用于肿瘤-巨噬细胞和CAR T细胞共培养系统，以揭示细胞间相互作用的调控因子 | 开发了基于邻近标记的单细胞APEX-seq方法，首次实现了亚细胞转录组在单细胞水平的高通量映射，特别关注内质网相关转录本，克服了传统单细胞RNA测序在解析细胞表面和分泌转录本方面的不足 | 方法主要针对内质网相关转录本，可能未全面覆盖其他亚细胞区域的RNA定位；依赖于特定的探针设计和RNA回收优化，技术门槛较高 | 研究细胞间相互作用的调控机制，通过亚细胞转录组分析揭示细胞状态和转录特征 | 肿瘤细胞（包括HER2+肿瘤细胞）、巨噬细胞和人类嵌合抗原受体（CAR）T细胞 | 单细胞测序技术 | 癌症 | 单细胞RNA测序，邻近标记技术，APEX-seq | NA | RNA序列数据 | 数千个单个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq，基于液滴的RNA-seq | NA | NA |
| 19 | 2026-04-07 |
A Rare T-Cell Factor 4 Lineage-negative Epithelial Stem Cell Supports Wound Repair and APC-deletion-induced Colon Tumorigenesis
2026-Mar-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.17.712502
PMID:41889847
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研究论文 | 本研究通过小鼠谱系追踪、免疫组化和单细胞测序技术，鉴定了一种罕见的非CBC、Tcf4谱系阴性干细胞群，该细胞群在伤口修复和APC缺失诱导的结肠肿瘤发生中发挥关键作用 | 首次发现并鉴定了一种新的Tcf4谱系阴性干细胞群，揭示了其在肠道屏障修复和特定基因背景下的结肠肿瘤起源中的独特功能 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中验证；单细胞测序样本量有限 | 探索结肠上皮干细胞异质性及其在组织稳态和肿瘤发生中的作用 | 小鼠结肠上皮细胞，特别是Tcf4谱系阴性和阳性干细胞群 | 单细胞生物学 | 结肠肿瘤 | 谱系追踪，免疫组织化学，单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据，组织图像数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 20 | 2026-04-07 |
Binary-SPA: A Reference-Free Method for Cell Annotation in High-Resolution Spatial Transcriptomics
2026-Mar-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.17.712369
PMID:41889971
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研究论文 | 本文提出了一种名为Binary-SPA的计算框架，用于高分辨率空间转录组学数据的细胞类型注释，无需依赖外部参考数据 | 开发了一种两阶段参考自由注释方法，结合二进制分类和内部参考锚点标记转移，克服了传统标记依赖和参考数据匹配的限制 | 未明确说明方法在极低表达或高度异质性组织中的性能限制 | 解决高分辨率空间转录组学中细胞类型注释的准确性和覆盖范围问题 | 高分辨率空间转录组学数据中的细胞 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 二进制分类模型 | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |