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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-06-20 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal mTOR-driven cellular fate of spindle cells and immune evasion in classic Kaposi's sarcoma
2026-Jul, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-025-04063-0
PMID:41525037
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示mTOR驱动经典卡波西肉瘤中梭形细胞的命运和免疫逃逸 | 首次在经典卡波西肉瘤患者中利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示mTOR抑制剂二甲双胍的分子机制,并发现梭形细胞与免疫细胞通过CXCL9-CXCR3信号轴相互作用 | 样本量较小(仅2例患者),需要更大规模研究验证结果 | 评估mTOR抑制剂二甲双胍在经典卡波西肉瘤患者中的治疗潜力及其分子机制 | 经典卡波西肉瘤患者的肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 卡波西肉瘤 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据 | 2例经典卡波西肉瘤患者 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞RNA测序和10x Visium空间转录组学 |
| 2 | 2026-06-20 |
Malignant cell-secreted chemokines drive colorectal cancer progression through endothelial cell activation
2026-Jul, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-025-04188-2
PMID:41557142
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序等技术,揭示恶性细胞分泌的趋化因子CXCL2通过激活内皮细胞上的ACKR1促进结直肠癌进展的机制 | 首次利用单细胞RNA测序、拷贝数变异推断和非负矩阵分解分析不同T分期的CRC肿瘤微环境动态变化,确定CXCL2-ACKR1轴在肿瘤侵袭中的关键作用,并提出阶段特异性干预策略 | 未在更大队列或体内模型中验证CXCL2-ACKR1相互作用的临床相关性,且仅以CXCL2为单一候选因子,可能忽略其他微环境组分的影响 | 阐明结直肠癌进展过程中肿瘤微环境细胞互作机制,识别促进肿瘤侵袭的关键趋化因子及其靶向策略 | 26例结直肠癌患者(根据T分期分层为T2、T3、T4a)的肿瘤样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、拷贝数变异推断、非负矩阵分解 | NA | 单细胞基因表达数据 | 26例结直肠癌患者(T2、T3、T4a分期) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3 | 2026-06-20 |
STING Drives Psoriatic Inflammation by Promoting Neutrophil Recruitment and Facilitating NETosis
2026-07, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.70130
PMID:41775627
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研究论文 | 研究揭示STING信号通路通过促进中性粒细胞招募和NETosis加重银屑病炎症 | 首次阐明STING信号通路在中性粒细胞介导的银屑病炎症中不仅调控细胞招募,还直接驱动NETs产物的终末效应功能,并发现不同小鼠品系间STING通路活化的遗传异质性 | 未涉及STING通路在不同银屑病亚型中的差异及长期治疗安全性评价 | 探索STING信号通路在中性粒细胞介导银屑病炎症中的具体作用机制 | 银屑病患者病变组织和外周血中性粒细胞、IMQ诱导的银屑病小鼠模型(野生型、STING-/-、PADi4-/-)及HL-60细胞 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 临床样本包含银屑病病变组织和外周血,小鼠模型涵盖不同品系 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 4 | 2026-06-20 |
Gut Microbiota-Induced CTLA4 Expression on CD8 + T Cells Impairs Antitumor Immunity and Promotes Colorectal Cancer Progression
2026-07, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.70128
PMID:41780914
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研究论文 | 揭示了肠道微生物群通过诱导CD8+ T细胞上CTLA4表达抑制抗肿瘤免疫并促进结直肠癌进展的机制 | 首次发现肠道菌群失调通过上调CD8 T细胞CTLA4表达促进T细胞耗竭和肿瘤免疫逃逸,建立了菌群-CTLA4轴这一新的免疫抑制通路 | 未提及 | 研究肠道微生物群在结直肠癌中调控CTLA4表达及抗肿瘤免疫的作用机制 | 结直肠癌患者及小鼠模型 | 机器学习和数字病理学 | 结直肠癌 | 16S rRNA测序,单细胞转录组学,空间转录组学,粪便微生物移植 | NA | 测序数据,空间转录组数据 | 结直肠癌患者样本及小鼠模型样本 | Illumina | 16S rRNA测序,单细胞RNA测序,空间转录组学 | Illumina测序平台 | 16S rRNA基因测序及单细胞转录组学分析 |
| 5 | 2026-06-20 |
Single-Cell CRISPR: An Efficient Strategy for Decoding Plant Cis-Regulatory Complexity
2026-Jul, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70647
PMID:41854240
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综述 | 综述了利用单细胞CRISPR系统解析植物顺式调控元件复杂性的策略 | 强调了单细胞CRISPR系统在功能基因组分析中鉴定关键调控元件的潜力 | 植物研究中应用这些方法仍面临挑战 | 解析植物顺式调控元件在基因表达调控中的功能 | 植物的顺式调控元件 | 机器学习 | NA | 单细胞CRISPR | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 6 | 2026-06-20 |
Enzyme-converted O kidneys allow ABO-incompatible transplantation without hyperacute rejection in a human decedent model
2026-Jun, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-025-01513-6
PMID:41044341
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研究论文 | 通过酶转化O型血肾脏实现ABO血型不相容移植而不引发超急性排斥反应的人体模型研究 | 首次在人体模型上采用供体中心脱敏方案,通过低温灌注将A型肾脏转化为酶转化O型肾脏,成功避免超急性排斥反应,并提出长期耐受的潜力 | 移植后第3天开始出现抗体介导的损伤和补体沉积,伴随A抗原再生,提示需要进一步研究以延长耐受期 | 探索供体中心器官工程策略,以扩大ABO血型不相容肾移植的应用范围 | A型血肾脏和O型血脑死亡受体 | NA | 肾脏疾病 | 单细胞测序 | NA | 测序数据 | 一个酶转化O型肾脏移植给一名高抗A抗体滴度的O型脑死亡受体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2026-06-20 |
Alterations in NK Cell Function and Glucose Metabolism Characteristics in Patients With Progressive Hepatocellular Carcinoma
2026-05, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.70095
PMID:41500969
|
研究论文 | 本研究探讨进展性肝细胞癌患者NK细胞的功能与代谢改变及其与疾病进展的关系 | 首次在单细胞水平揭示进展性肝癌中NK细胞存在TIM3高表达亚群、其功能受损且糖酵解关键酶下调,并确定TIM3为潜在治疗靶点 | NA | 阐明进展性肝细胞癌中NK细胞在单细胞层面的免疫抑制和代谢重编程特征 | 6例初治肝细胞癌患者的外周血、肿瘤及癌旁组织样本 | 单细胞转录组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 6例初治肝细胞癌患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8 | 2026-06-20 |
GPR56 Outperforms CD319 as a Discriminative Marker for CD4 + Cytotoxic T Lymphocytes and Is Elevated in Primary Sjögren's Syndrome
2026-04, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.70073
PMID:41324175
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研究论文 | 本研究探讨GPR56和CD319作为CD4+细胞毒性T淋巴细胞表面标志物的潜力,并发现GPR56在原发性干燥综合征中升高 | 首次识别GPR56作为CD4 CTL的新型表面标志物,并揭示其在原发性干燥综合征中的功能相关性 | 未提及研究的局限性,可能包括样本量较小或机制探索不足 | 鉴定CD4 CTL的表面标志物并评估其在自身免疫疾病中的意义 | CD4+细胞毒性T淋巴细胞和原发性干燥综合征患者 | 数字病理学 | 干燥综合征 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | 原发性干燥综合征患者样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 9 | 2026-06-20 |
MyD88 Deficiency Protects Mice From Experimental Autoimmune Encephalomyelitis by Influencing Both Dendritic Cells and T Cells
2026-04, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.70079
PMID:41363121
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研究论文 | 研究发现MyD88缺陷通过影响树突状细胞和T细胞保护小鼠免受实验性自身免疫性脑脊髓炎 | 首次通过单细胞RNA测序重新分析多发性硬化症患者数据,揭示了MyD88在树突状细胞和CD4 T细胞中的显著上调,并证明MyD88缺陷通过影响DC成熟、促炎因子产生及Th1/Th17分化来减轻神经炎症 | MyD88在EAE不同细胞类型中的具体贡献仍不完全清楚 | 探究MyD88信号通路在多发性硬化症及其动物模型的发病机制中在不同细胞类型中的具体作用 | 多发性硬化症患者外周血单核细胞来源的树突状细胞和CD4 T细胞,以及实验性自身免疫性脑脊髓炎小鼠模型中的树突状细胞和T细胞 | 自然语言处理 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多发性硬化症患者样本及实验性自身免疫性脑脊髓炎小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10 | 2026-06-20 |
Single cell and multi-omics analysis reveal senescence-related molecular subtypes and a prognostic signature in clear cell renal cell carcinoma
2026-Mar-02, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04674-1
PMID:41770477
|
研究论文 | 通过单细胞和多组学分析,揭示了透明细胞肾细胞癌中与衰老相关的分子亚型并构建了预后风险评分模型 | 首次结合单细胞RNA测序和批量转录组数据,系统表征ccRCC中细胞衰老的特征,并基于随机生存森林构建了具有强预后价值的风险评分模型,同时鉴定出ALDH18A1作为潜在生物标志物和治疗靶点 | 研究中使用的数据来自公共数据库,缺乏多中心前瞻性队列验证;另外,SASP特征的评估可能受限于现有数据的分辨率和选择偏差 | 阐明透明细胞肾细胞癌中细胞衰老的全面特征及其临床意义 | 透明细胞肾细胞癌患者样本和组织细胞系 | 计算机视觉 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | 随机生存森林 | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | TCGA-KIRC队列537例,E-MTAB-1980队列101例,CPTAC-ccRCC队列105例,以及两个scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11 | 2026-06-20 |
Identification of PANoptosis-related genes in lung cancer and investigation of their role mechanisms in the immune microenvironment
2026-Feb-28, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04739-1
PMID:41760846
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研究论文 | 整合批量与单细胞RNA-seq数据,鉴定肺癌中PANoptosis相关基因,并探讨其在肿瘤免疫微环境中的作用机制 | 首次系统鉴定并验证了与PANoptosis相关的八个关键基因(DAPK2、CAV1、PDK4、IL3RA、NOTCH1、CHMP4B、IRAK1、SFN)在肺癌中的异常表达,并揭示CHMP4B和IRAK1在调控肿瘤免疫微环境中的新作用 | 结果主要基于公开数据库的转录组数据分析,缺乏大规模前瞻性临床样本验证;机制研究尚处于生物信息学预测和初步实验验证阶段,未深入阐明分子调控网络 | 揭示PANoptosis相关基因在肺癌发生发展中的作用,并评估其作为预后生物标志物和治疗靶点的潜力 | 肺癌患者肿瘤组织和正常对照组织;肺癌细胞系;TCGA和GEO数据库中的转录组数据 | 机器学习 | 肺癌 | RNA-seq,单细胞RNA-seq,qPCR,免疫组化 | NA | 基因表达数据,图像 | 肺癌细胞系及临床组织标本(具体数量未在摘要中明确) | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2026-06-20 |
Dominant intragraft plasma cells targeting bilirubin implicate local heme catabolism in human cardiac allograft vasculopathy
2026-02-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI194138
PMID:41289018
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和免疫球蛋白基因分析,发现心脏移植物血管病变中占主导的移植物内浆细胞靶向胆红素,揭示了局部血红素分解代谢在病变发展中的作用 | 首次发现并证明心脏移植物血管病变中,移植物内浆细胞克隆产生的抗体主要靶向胆红素,并关联局部血红素分解代谢途径 | 未在文中明确提及研究局限性 | 探讨心脏移植物血管病变中移植物内浆细胞反应的抗原驱动因素及其在病变发病机制中的作用 | 心脏移植后发生血管病变的患者心脏外植体及其中浸润的免疫细胞 | 免疫学 | 心脏移植血管病变 | 单细胞RNA测序, 免疫球蛋白基因谱分析, 重组抗体生成, 抗原筛选, 组织学分析 | NA | DNA测序数据, 组织图像, 抗体结合数据 | 37个来自移植物内浆细胞克隆的重组单克隆抗体和24个来自外周血浆细胞的对照抗体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 通过单细胞RNA测序和免疫球蛋白基因谱分析技术研究心脏移植血管病变患者样本 |
| 13 | 2026-06-20 |
CARD9-dependent macrophage plasticity regulates effective fungal clearance
2026-02-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI188827
PMID:41329515
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研究论文 | 研究CARD9缺陷如何通过调节巨噬细胞可塑性影响真菌清除效率 | 揭示CARD9缺陷通过NF-κB/CREB/C/EBPβ通路促进TREM2hi巨噬细胞分化,导致Th1细胞耗竭和抗真菌功能受损,并发现靶向TREM2可增强抗真菌免疫反应 | 未提及具体局限性 | 阐明CARD9缺陷导致慢性真菌感染的细胞机制 | 小鼠和人类皮肤样本中的免疫细胞 | 数字病理学 | 慢性真菌感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠和人类皮肤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 14 | 2026-06-20 |
Vinculin influences essential processes in enteric nervous system development and Hirschsprung disease pathogenesis
2026-02-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI198531
PMID:41364504
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研究论文 | 探究Vinculin在肠神经系统发育和Hirschsprung病发病机制中的关键作用 | 首次发现Vinculin突变与Hirschsprung病关联,并通过体内外实验揭示其对ENS发育和肠-间充质相互作用的调控机制 | 未明确说明限制 | 阐明Vinculin在肠神经系统发育中的作用及其与Hirschsprung病的关系 | 肠神经系统发育和Hirschsprung病相关基因与细胞相互作用 | 机器学习(应用于单细胞和空间转录组学数据分析) | Hirschsprung病 | 全基因组测序、体外实验、单细胞转录组学、空间RNA-seq | NA | 基因测序数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 人类HSCR患者样本(4个VCL突变)、神经嵴特异性Vcl敲除小鼠、Ptn敲除小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 15 | 2026-06-20 |
TNF superfamily member 14 drives post-influenza depletion of alveolar macrophages, enabling secondary pneumococcal pneumonia
2026-01-16, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI185390
PMID:41252214
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研究论文 | 该研究发现肿瘤坏死因子超家族成员14(TNFSF14)是流感病毒感染后肺泡巨噬细胞减少的关键驱动因子,从而促进继发性肺炎球菌肺炎的发生 | 首次揭示TNFSF14配体/受体轴在流感后肺泡巨噬细胞耗竭中的驱动作用,并证明通过基因修饰的肺泡巨噬细胞移植或抗体中和可减轻疾病严重程度 | NA | 阐明流感病毒感染后组织驻留肺泡巨噬细胞(TR-AM)减少的分子机制,并确定治疗靶点 | 甲型流感病毒感染和流感-肺炎链球菌共感染的体内模型,以及严重病毒性急性呼吸窘迫综合征患者 | NA | 肺炎球菌肺炎,流感诱导的肺损伤 | 单细胞转录组学,细胞特异性PCR分析 | NA | 单细胞转录组数据,基因表达谱 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 16 | 2026-06-20 |
Clonal hematopoiesis activates procalcific pathways in macrophages and promotes aortic valve stenosis
2026-01-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI171634
PMID:41252200
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research paper | 研究发现克隆性造血通过激活巨噬细胞中的促钙化通路促进主动脉瓣狭窄 | 首次揭示克隆性造血(特别是TET2突变)在主动脉瓣狭窄发病机制中的直接作用,并阐明了OSM信号因子的关键角色 | NA | 研究克隆性造血在主动脉瓣狭窄发病中的作用机制 | 克隆性造血患者、主动脉瓣狭窄患者、Tet2基因敲除小鼠 | machine learning | cardiovascular disease | meta-analysis, single-cell RNA-seq, 基因沉默 | NA | NA | 来自All of Us、BioVU和UK Biobank的多个队列的患者数据 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2026-06-20 |
Integrative single-cell transcriptomic and experimental analyses unveil Qihuang granule's protection against retinal photodamage via PI3K/AKT/mTOR-mediated autophagy
2026-01, The international journal of biochemistry & cell biology
DOI:10.1016/j.biocel.2025.106881
PMID:41318054
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研究论文 | 通过整合单细胞转录组学与实验分析,揭示芪黄颗粒通过PI3K/AKT/mTOR介导的自噬保护视网膜光损伤的作用机制 | 首次利用单细胞RNA测序技术从细胞异质性角度解析传统中药芪黄颗粒保护视网膜光损伤的分子机制,聚焦于PI3K/AKT/mTOR信号通路与自噬的调控关系 | 未明确指出局限性 | 探究芪黄颗粒对视网膜光损伤的保护作用及其潜在分子机制 | 蓝光诱导视网膜损伤大鼠模型和ARPE-19细胞模型 | 单细胞转录组学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序、Western blot、qPCR | NA | 单细胞转录组数据、蛋白表达数据、基因表达数据 | 大鼠模型和ARPE-19细胞模型(具体数量未详述) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2026-06-20 |
Workshop Introduction: Advances of AI Methods in Single Cell Spatial Omics
2026, Pacific Symposium on Biocomputing. Pacific Symposium on Biocomputing
DOI:10.1142/9789819824755_0061
PMID:41758189
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研讨会介绍 | 介绍单细胞空间组学中人工智能方法的最新进展 | 强调AI和机器学习在空间转录组学、蛋白质组学和代谢组学中的前沿应用,涵盖数据整合、细胞间相互作用建模以及疾病和精准医学的转化应用 | 未明确提及具体局限 | 展示AI方法在单细胞空间组学中的最新发展及其在疾病和精准医学中的应用 | 单细胞空间组学中的AI和机器学习方法 | 机器学习 | NA | 空间转录组学, 蛋白质组学, 代谢组学 | NA | 空间组学数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 空间代谢组学 | NA | NA |
| 19 | 2026-06-20 |
Molecular glue degrader function of SPOP inhibitors enhances STING-dependent immunotherapy efficacy in melanoma models
2025-12-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI191772
PMID:41148213
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研究论文 | 揭示SPOP抑制剂通过分子胶降解STING和CBX4增强黑色素瘤免疫治疗疗效的机制 | 首次发现SPOP抑制剂具有分子胶降解剂功能,可重定向SPOP降解新底物CBX4,激活STING依赖的先天免疫 | 研究主要基于小鼠模型,需在人类样本中验证SPOP抑制剂的临床转化潜力 | 探索SPOP E3连接酶在肿瘤免疫中的角色及其抑制剂作为免疫治疗增敏剂的潜力 | 黑色素瘤细胞系、B16小鼠肿瘤模型、CAR.CD19-T细胞治疗模型 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | B16肿瘤模型小鼠(具体数量未明确) | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 平台用于单细胞RNA-seq分析 |
| 20 | 2026-06-20 |
Integrated bulk and single-cell RNA sequencing identifies oxidative stress signatures of radiation-induced lung injury in mice through machine learning
2025-12, The international journal of biochemistry & cell biology
DOI:10.1016/j.biocel.2025.106863
PMID:40967560
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研究论文 | 整合批量RNA测序和单细胞RNA测序,通过机器学习识别小鼠放射性肺损伤的氧化应激标志 | 首次结合批量与单细胞RNA测序及多种机器学习算法(随机森林、支持向量机),系统筛选出放射性肺损伤中与氧化应激相关的五个关键基因(Stk4、Aaas、Ets1、Sesn2、Kit),并构建了高准确率的诊断模型 | 研究基于小鼠模型,结果需进一步在人类样本中验证;未探讨五个关键基因在临床样本中的表达及功能 | 系统分析放射性肺损伤中与氧化应激相关的分子特征,筛选可用于早期诊断和靶向干预的生物标志物及分子机制 | 放射性肺损伤小鼠模型 | 机器学习 | 放射性肺损伤 | RNA测序、单细胞RNA测序、RT-PCR、免疫组化 | 随机森林、支持向量机、LASSO回归 | 基因表达数据 | 未明确样本数量,涉及小鼠批量与单细胞样本 | 未提供 | 批量RNA测序、单细胞RNA测序 | 未提供 | 未提供 |