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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-02-02 |
A single cell transcriptomics-based analysis provides mechanistic insights into the chronic low-concentration effects on hematopoietic disruption in zebrafish(Danio rerio) by Antinomy
2026-Mar-01, Chemico-biological interactions
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.cbi.2025.111892
PMID:41519218
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析,揭示了低浓度锑暴露对斑马鱼造血功能的慢性影响及其机制 | 首次利用单细胞RNA测序技术系统解析低浓度锑暴露下斑马鱼造血细胞群体的变化,并阐明IL-17通路介导的炎症反应在锑毒性中的作用 | 研究仅基于斑马鱼模型,结果外推至哺乳动物或人类需谨慎;未探讨长期暴露后的恢复潜力 | 探究低浓度锑暴露对造血功能的慢性毒性效应及分子机制 | 斑马鱼(Danio rerio) | 单细胞组学 | 造血功能障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 斑马鱼暴露于0、5、50、500和5000 μg/L锑浓度28天 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2026-02-02 |
Spatial Location of SPP1+TAMs and Mutually Exclusive Subsets Based on Single-Cell and Transcriptome Data
2026-Feb, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.70247
PMID:41273053
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间转录组数据,揭示了SPP1+肿瘤相关巨噬细胞在肺腺癌中的空间定位和互斥亚群特征 | 首次结合单细胞和空间转录组数据,系统阐明了SPP1+TAMs与MARCO+M2巨噬细胞在肺腺癌不同阶段的互斥分布模式及其空间定位特征 | 研究主要基于公共数据库数据,缺乏大规模独立队列验证,且空间转录组样本量有限 | 阐明SPP1+肿瘤相关巨噬细胞在肺腺癌中的空间定位和互斥亚群特征,为肺腺癌精准治疗提供科学依据 | 肺腺癌组织样本、肿瘤相关巨噬细胞亚群(SPP1+M2和MARCO+M2) | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组测序、免疫组化分析 | UMAP降维分析 | 转录组数据、单细胞数据、空间转录组数据、免疫组化图像数据 | TCGA和GTEx数据库的转录组数据、GEO数据库的单细胞和空间转录组数据、HPA数据库的免疫组化数据以及本地肺腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3 | 2026-02-02 |
Microglia and Myeloid Cell Populations of the Developing Mouse Retina
2026-Feb, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.70115
PMID:41388751
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研究论文 | 本研究通过单细胞和单核RNA测序技术,识别了小鼠视网膜发育过程中独特的髓系细胞群体,并验证了它们在神经纤维层和血管生成前缘的解剖位置及功能 | 首次在视网膜中识别并验证了发育特异性微胶质细胞群体,特别是由Spp1和Hmox1基因标记的两种微胶质细胞,揭示了NRF2转录因子在调控其状态转换中的作用 | 研究主要基于小鼠模型,结果在人类或其他物种中的适用性尚未验证,且功能机制仍需进一步探究 | 探究微胶质细胞在小鼠视网膜发育过程中的分子特征和功能角色 | 小鼠视网膜中的微胶质细胞和其他髓系细胞群体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 多个发育时间点的小鼠视网膜样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-02-02 |
Single-cell sequencing: accurate disease detection
2026-Feb, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-025-04007-8
PMID:40819160
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在疾病检测中的应用,特别是在神经系统疾病早期诊断中的潜力 | 突破了传统测序的局限,能在单细胞水平分析基因组和转录组,清晰展示细胞间异质性 | 面临数据处理复杂和检测成本高的挑战 | 探讨单细胞测序技术如何实现疾病的早期和准确检测 | 神经系统疾病中的神经细胞 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2026-02-02 |
Multi-omics characterization of cachexia-related genes reveals prognostic signatures and immune landscape in breast cancer
2026-Feb, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-025-04025-6
PMID:40880013
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了恶病质相关基因在乳腺癌中的预后和免疫学意义,并构建了一个基于11个基因的预后模型 | 首次构建了一个基于恶病质相关基因的乳腺癌预后风险评分模型(CRSBC),并通过单细胞RNA-seq分析揭示了HCCS基因在乳腺癌细胞和巨噬细胞招募中的关键作用 | 研究主要基于TCGA等公共数据库数据,缺乏外部实验验证,且样本来源和临床特征可能存在异质性 | 探究恶病质相关基因在乳腺癌中的预后价值和免疫微环境中的作用 | 乳腺癌患者及其相关的恶病质相关基因 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 差异表达分析,加权基因共表达网络分析(WGCNA),LASSO-Cox回归,单细胞RNA-seq分析 | LASSO-Cox回归模型 | 基因表达数据,单细胞RNA-seq数据 | 基于TCGA-BRCA队列数据,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2026-02-02 |
Immunomodulatory Mechanism of Baiyaojian Decoction on Periodontitis: Network Pharmacology, Single-Cell RNA Sequencing and Molecular Docking
2026-Feb, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.71034
PMID:41605874
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研究论文 | 本研究通过网络药理学、单细胞RNA测序和分子对接,探讨了白药煎剂治疗牙周炎的免疫调节机制 | 首次整合网络药理学、单细胞RNA测序和分子对接技术,系统揭示白药煎剂治疗牙周炎的多成分、多靶点免疫调节机制 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验验证,缺乏体内动物模型或临床试验的进一步验证 | 探究白药煎剂治疗牙周炎的分子机制和免疫调节作用 | 牙周炎患者组织样本(来自GEO数据库的RNA-seq数据)及白药煎剂的活性成分 | 生物信息学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、分子对接、qRT-PCR、流式细胞术、ELISA | 网络药理学分析、细胞间通讯网络分析(CellChat)、细胞分化轨迹分析(monocle3) | 基因表达数据、分子结构数据 | 包含GSE16134(批量RNA-seq)、GSE152042和GSE171213(单细胞RNA-seq)等多个公共数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2026-02-02 |
Comprehensive tumour-immune profiling reveals TREM2+ tumour-associated macrophages facilitating lymph node metastasis in head and neck squamous cell carcinoma
2026-Feb, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70604
PMID:41612852
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了头颈鳞状细胞癌中TREM2+肿瘤相关巨噬细胞通过SPP1-CD44-BHLHE40轴促进CD8+ T细胞耗竭,从而驱动淋巴结转移的机制 | 首次在头颈鳞状细胞癌中鉴定出与淋巴结转移相关的TREM2+肿瘤相关巨噬细胞亚群,并阐明了其通过SPP1-CD44-BHLHE40轴促进CD8+ T细胞耗竭的具体分子机制 | 研究主要基于单细胞转录组数据和体外实验,缺乏体内动物模型验证;临床队列样本量可能有限,需要更大规模验证 | 探究头颈鳞状细胞癌淋巴结转移的肿瘤免疫微环境特征及机制 | 头颈鳞状细胞癌患者样本(包括原发灶和转移淋巴结) | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,微阵列分析,多重免疫组化染色,体外共培养实验 | 机器学习算法(未指定具体模型) | 单细胞转录组数据,微阵列数据,免疫组化图像数据 | 212个头颈鳞状细胞癌样本,共688,866个单细胞转录组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8 | 2026-02-02 |
A Glucose-Responsive Intelligent Antibacterial and Oxygen-Producing Hydrogel Promotes the Healing of Diabetic Wounds by Regulating Cellular Heterogeneity
2026-Jan-31, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202517028
PMID:41619261
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研究论文 | 本研究开发了一种葡萄糖响应型智能抗菌产氧水凝胶CF-CPGaMPN,用于促进糖尿病感染伤口的愈合 | 通过结合PVP@CaO纳米颗粒、过氧化氢酶和GaMPN纳米颗粒,实现了葡萄糖触发的按需药物释放,并利用单细胞RNA测序分析了伤口周围的多细胞生态系统 | NA | 开发一种智能水凝胶以促进糖尿病感染伤口的愈合 | 糖尿病感染伤口及其周围的多细胞生态系统 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2026-02-02 |
COL14A1 drives ischemic cardiac injury in PCOS: an artificial intelligence-identified biomarker
2026-Jan-31, QJM : monthly journal of the Association of Physicians
DOI:10.1093/qjmed/hcag033
PMID:41619759
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据与人工智能方法,鉴定出COL14A1是多囊卵巢综合征与缺血性心肌病共享的关键生物标志物,并揭示了其在免疫-纤维化轴中的作用机制 | 首次通过整合多组学数据与105种机器学习模型组合,系统鉴定出连接PCOS与缺血性心脏损伤的共享生物标志物COL14A1,并利用单细胞及空间转录组学解析其细胞特异性与组织定位 | 研究结论主要基于生物信息学分析与体外数据,缺乏体内实验验证;候选药物罗非昔布的疗效尚未经过临床验证 | 鉴定PCOS与缺血性心肌病之间的共享诊断生物标志物并阐明其生物学基础 | 多囊卵巢综合征患者与缺血性心肌病患者的转录组数据 | 机器学习 | 心血管疾病 | 转录组测序,单细胞RNA测序,空间转录组学,分子对接 | Elastic Net | 基因表达数据 | 来自多个GEO队列的PCOS与ICM转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 10 | 2026-02-02 |
A spectral dimension reduction technique that improves pattern detection in multivariate spatial data
2026-Jan-31, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag052
PMID:41619788
|
研究论文 | 本文介绍了一种用于多变量空间转录组学数据模式识别的统计方法,通过构建低维特征空间投影来最大化空间依赖性度量Moran's I | 提出了一种无需参数调优的算法,能有效减少非空间变异并优于主成分分析预处理,同时提供校准的空间基因表达测试 | NA | 提高多变量空间数据中模式检测的准确性 | 多变量空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 统计降维算法 | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 11 | 2026-02-02 |
A spatiotemporal atlas of cerebrovascular development in zebrafish
2026-Jan-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68995-z
PMID:41620404
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研究论文 | 本研究结合原位测序、单细胞转录组学和3D血管重建技术,绘制了斑马鱼大脑内皮发育的时空图谱 | 整合多尺度数据(分子、细胞和结构)揭示脑血管发育动态,识别出6种内皮亚型并验证了三个未表征基因在血管模式和血脑屏障完整性中的作用 | 研究聚焦于斑马鱼模型,结果向哺乳动物的直接转化需进一步验证 | 探究脊椎动物大脑脑血管发育的分子和细胞动力学 | 斑马鱼大脑内皮细胞(3-11天受精后) | 数字病理学 | NA | 原位测序, 单细胞转录组学, 3D血管重建, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间数据, 3D图像 | 斑马鱼大脑内皮细胞(3-11 dpf),具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 12 | 2026-02-02 |
Neoadjuvant modified FOLFIRINOX plus nivolumab in borderline-resectable pancreatic ductal adenocarcinoma: a pilot phase 1 trial
2026-Jan-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68976-2
PMID:41620440
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研究论文 | 这是一项评估新辅助改良FOLFIRINOX联合纳武利尤单抗治疗临界可切除胰腺导管腺癌的1b/2期临床试验 | 首次在临界可切除PDAC患者中评估化疗联合免疫检查点抑制剂的新辅助治疗方案,并采用空间转录组学等先进技术进行转化研究 | 单臂研究设计,样本量较小(28例患者),缺乏随机对照组 | 评估改良FOLFIRINOX联合纳武利尤单抗新辅助治疗的安全性和病理缓解率 | 临界可切除胰腺导管腺癌患者 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 基因表达分析、免疫组织化学、空间转录组学 | NA | 临床数据、基因表达数据、空间转录组数据 | 28例患者(22例接受手术) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 13 | 2026-02-02 |
Molecular signatures of resilience to Alzheimer's disease in neocortical layer 4 neurons
2026-Jan-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68920-4
PMID:41620473
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研究论文 | 本研究利用单核和空间转录组学技术,识别了阿尔茨海默病中具有韧性的神经元群体,并发现KCNIP4作为关键韧性因子 | 首次在阿尔茨海默病中识别出初级视觉皮层第4层神经元中的韧性群体,并揭示KCNIP4作为关键韧性因子,通过补偿机制对抗神经元过度兴奋 | 研究主要基于男性App小鼠模型,可能未全面反映人类阿尔茨海默病的复杂性 | 探究阿尔茨海默病中神经元韧性的分子基础 | 阿尔茨海默病早期受影响(前额叶皮层、楔前叶)和晚期受影响(初级视觉皮层)的新皮层区域神经元 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单核转录组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单核RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 14 | 2026-02-02 |
Oxidative stress-associated genes TPPP3 and VEGFA in COPD revealed by bulk and single-cell sequencing analysis
2026-Jan-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-37375-4
PMID:41620539
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学和实验方法,识别并验证了慢性阻塞性肺疾病(COPD)中与氧化应激相关的关键基因和通路 | 结合了批量测序和单细胞RNA测序分析,识别出COPD中与氧化应激相关的12个枢纽基因,并特别强调了TPPP3和VEGFA在上皮细胞中的关键作用 | 研究主要基于公共数据库和体外细胞模型,需要在更多临床样本和体内模型中进一步验证 | 识别和验证COPD中与氧化应激相关的关键基因和通路,探索新的治疗策略和潜在生物标志物 | 慢性阻塞性肺疾病(COPD)患者数据、人支气管上皮细胞(BEAS-2B) | 生物信息学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 批量RNA测序、单细胞RNA测序、机器学习算法 | LASSO回归、随机森林 | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 来自GEO数据库的公共COPD数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2026-02-02 |
ACACA modulates R-loop homeostasis to enhance lipid metabolism and microenvironmental interactions in ccRCC
2026-Jan-31, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01319-y
PMID:41620551
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研究论文 | 本研究通过整合公开的ccRCC转录组和临床数据集,量化R-loop相关活性并构建预后模型,发现ACACA作为R-loop相关代谢驱动因子,连接基因组应激与脂质重编程及肿瘤微环境重塑 | 首次揭示ACACA在ccRCC中作为R-loop相关代谢驱动因子,连接基因组应激、脂质代谢重编程和肿瘤微环境相互作用 | 研究主要基于公开数据集和体外实验,缺乏大规模临床样本验证和体内机制的深入探索 | 探究R-loop在ccRCC肿瘤微环境中的作用,并识别关键代谢驱动因子 | 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)的肿瘤微环境、R-loop结构和ACACA基因 | 生物信息学与癌症研究 | 肾细胞癌 | 单样本基因集富集分析(ssGSEA)、线性机器学习算法、单细胞转录组学、空间转录组学、体外实验和异种移植实验 | 线性机器学习算法 | 转录组数据、临床数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 基于公开的ccRCC转录组和临床数据集,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 16 | 2026-02-02 |
Spatial transcriptomic profiling uncovers the molecular effects of the neurotoxicant polychlorinated biphenyls (PCBs) in the brains of adult mice
2026-Jan-31, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-026-03466-x
PMID:41620578
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术,探讨了多氯联苯(PCBs)暴露对成年小鼠大脑功能和认知的影响 | 首次结合空间转录组学分析,揭示了PCBs暴露在小鼠多个大脑区域(如海马体、新皮层)的分子特征及其与血脑屏障完整性的关联 | 研究仅使用雄性C57BL/6J小鼠,未考虑性别差异;暴露时间为七周,长期效应未评估;样本量未明确说明 | 评估PCBs暴露对大脑功能和认知的分子机制影响 | 成年雄性C57BL/6J小鼠 | 空间转录组学 | 神经毒性相关认知障碍 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 17 | 2026-02-02 |
Revealing FPR1 as a potential pathogenic biomarker for aortic dissection based on Mendelian randomization, single-cell transcriptome and clinical data analysis
2026-Jan-31, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-026-00732-4
PMID:41620799
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 18 | 2026-02-02 |
Microenvironmental niches dictate divergent fibroblast fates in reversible versus progressive lung fibrosis
2026-Jan-30, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2026.106142
PMID:41619352
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和单细胞RNA测序技术,比较了不同间质性肺疾病中成纤维细胞命运的微环境调控机制 | 首次在空间原位水平比较了可逆性修复与进行性纤维化中疾病特异性细胞微环境如何塑造成纤维细胞命运,并揭示了糖皮质激素敏感性与抵抗性的分子机制 | 研究样本量相对有限,且体外实验可能无法完全模拟体内复杂的微环境相互作用 | 阐明间质性肺疾病中成纤维细胞行为从可逆修复向进行性纤维化转变的微环境调控机制 | 人外周肺组织样本(包括对照组、机化性肺炎、结缔组织病相关间质性肺疾病和特发性肺纤维化患者) | 数字病理学 | 肺纤维化 | 空间转录组学,单细胞RNA测序,免疫荧光,体外细胞培养 | 细胞类型反卷积分析,配体-受体相互作用预测 | 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据,图像数据 | 未明确具体样本数量,涉及对照组、OP、CTD-ILD和IPF患者的外周肺组织 | 10x Genomics | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | Visium | High-Definition Visium空间转录组学平台 |
| 19 | 2026-02-02 |
Runx1 transcription factor modulates opioid analgesia and withdrawal in humans and rodents
2026-Jan-30, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2025.11.018
PMID:41619726
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研究论文 | 本研究揭示了Runx1转录因子通过调控小胶质细胞转录组,影响人类和啮齿类动物的阿片类镇痛效果和戒断反应 | 首次将Runx1确定为阿片类镇痛反应和戒断的遗传决定因素,并通过单细胞RNA测序和染色质免疫沉淀测序揭示了其在小胶质细胞中的独特调控机制 | 研究主要基于动物模型,人类关联分析可能需要更大样本验证,且未详细探讨Runx1在其他细胞类型中的作用 | 探究Runx1转录因子在阿片类镇痛和戒断反应个体差异中的作用机制 | 小鼠模型和人类个体 | 神经科学 | 疼痛管理 | 单细胞RNA测序, 染色质免疫沉淀测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 20 | 2026-02-02 |
A pan-cancer single-cell transcriptomic atlas of human bone metastases
2026-Jan-30, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102583
PMID:41619722
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研究论文 | 本研究构建了一个涵盖13种不同来源的62例骨转移样本的单细胞转录组图谱,揭示了骨转移的分子机制和免疫治疗新靶点 | 首次创建了人类骨转移的单细胞转录组全景图谱,整合了大规模原发性和转移性泛癌数据集,并验证了抗PD-1/TIGIT联合免疫疗法在骨转移小鼠模型中的有效性 | 样本量相对有限(62例骨转移样本),且主要基于单细胞RNA测序数据,可能未涵盖所有分子机制 | 探究人类骨转移的分子机制,并寻找免疫治疗优化策略 | 骨转移样本、配对的原发肿瘤和正常骨髓样本 | 数字病理学 | 骨转移 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类 | 单细胞转录组数据 | 62例骨转移样本,涵盖13种不同癌症来源 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |