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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1 2026-09-19
Unraveling the tapestry: Lessons from multi-omics and spatial biology in hepatocellular cancer
2026-Oct-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
综述 本文综述了空间转录组学、蛋白质组学、基因组学、表观基因组学和代谢组学等多组学技术在肝细胞癌中的应用,探讨了肿瘤微环境的空间组织如何影响肿瘤进展、免疫逃逸和治疗反应。 强调了空间多组学技术在揭示肝细胞癌肿瘤微环境中细胞邻域、免疫屏障和基质生态位等空间关系方面的独特优势,发现了传统批量或单细胞分析无法识别的癌细胞与基质细胞间的通讯轴。 作为综述文章,未提供原始实验数据,且未具体讨论当前空间组学技术在临床转化中面临的技术挑战和标准化问题。 总结空间多组学技术在肝细胞癌研究中的最新进展,探讨其如何揭示肿瘤微环境的空间动态,并展望其在精准肿瘤学中的转化应用。 肝细胞癌(HCC)及其肿瘤微环境 空间生物学、多组学 肝癌 空间转录组学、空间蛋白质组学、空间基因组学、空间表观基因组学、空间代谢组学 NA 空间分子数据、图像 NA NA 空间转录组学、空间蛋白质组学、空间基因组学、空间表观基因组学、空间代谢组学 NA NA
2 2026-09-19
Integrated single-cell and bulk transcriptomic analysis identifies epithelial cell-related biomarkers and immune subtypes in focal segmental glomerulosclerosis
2026-Oct, International urology and nephrology IF:1.8Q3
研究论文 该研究通过整合bulk和单细胞RNA-seq数据,识别了局灶性节段性肾小球硬化(FSGS)中上皮细胞相关的生物标志物和免疫亚型 整合bulk和单细胞转录组数据,结合机器学习算法构建了FSGS诊断基因标签,并定义了与免疫特征相关的分子亚型 需要进一步的实验验证以确认机制的关联性 研究FSGS中上皮细胞相关的分子改变,并构建诊断基因标签和识别免疫亚型 FSGS患者样本 机器学习 局灶性节段性肾小球硬化 bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq 随机森林, 支持向量机 转录组数据 NA NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
3 2026-09-19
Single-cell transcriptome profiling of primordial germ cells reveals differences between right and left gonads in chickens
2026-Oct, Poultry science IF:3.8Q1
研究论文 该研究对雌性鸡胚左右性腺进行单细胞RNA测序,揭示了原始生殖细胞在左右两侧的转录差异 首次在单细胞水平揭示鸡胚原始生殖细胞在左右性腺中的转录差异,发现差异从HH29的DNA损伤/细胞周期程序向HH34的衰老相关程序转变,以及右侧特异性NOTCH相互作用 研究仅基于转录组数据,缺乏功能验证实验;样本量有限;未涉及蛋白质水平或表观遗传调控机制 探究鸟类卵巢不对称发育过程中原始生殖细胞在左右性腺中的差异及其调控机制 雌性鸡胚的左右性腺及其中原始生殖细胞 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 HH29和HH34两个发育阶段的雌性鸡胚左右性腺 NA 单细胞RNA-seq NA NA
4 2026-06-25
Corrigendum to "Single-cell RNA sequencing reveals depot-specific characteristics of adipose progenitor cells in ducks" [Poultry Science, Volume 105/Issue 7, July 2026, 107004]
2026-Oct, Poultry science IF:3.8Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
5 2026-09-19
Clemastine alleviates cognitive dysfunction after SAH by targeting neuronal CNTN1 to regulate the ADA-adenosine pathway
2026-Oct, Acta pharmacologica Sinica IF:6.9Q1
研究论文 该研究通过单细胞RNA测序和转录组测序揭示了SAH后神经元CNTN1下调通过ADA-腺苷通路导致脱髓鞘和认知功能障碍的机制,并发现氯马斯汀可作为潜在治疗药物 首次揭示CNTN1在SAH后特异性在神经元中下调而非少突胶质细胞,提出CNTN1-ADA-ADORA2B信号轴介导脱髓鞘的新机制,并发现氯马斯汀可通过靶向该通路改善认知功能障碍 未在摘要中明确说明 阐明SAH相关脱髓鞘的分子基础并寻找潜在治疗方法 SAH患者脑脊液样本和SAH小鼠模型 机器学习, 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序, 转录组测序 NA 文本, 图像 NA NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
6 2026-09-19
Endothelial PARP1 orchestrates endothelial-to-mesenchymal transition via the PARylation of FHL2 in ischaemic heart failure
2026-Oct, Acta pharmacologica Sinica IF:6.9Q1
研究论文 本文揭示了内皮细胞中PARP1通过PAR化修饰FHL2驱动内皮-间质转化(EndoMT),从而促进缺血性心力衰竭中的心肌纤维化和心功能障碍 首次发现内皮细胞PARP1是缺血性心力衰竭中EndoMT的关键驱动因子,并揭示了PARP1通过催化FHL2的PAR化修饰(Asp50、Glu63和Asp77位点)促进其核滞留、增强与β-catenin的相互作用及转录活性的全新机制 摘要中未明确提及研究局限性 探究PARP1在缺血性心力衰竭中调控内皮-间质转化(EndoMT)的作用及其分子机制,并评估其作为治疗靶点的潜力 扩张型或缺血性心肌病患者、心肌梗死后发展为心力衰竭的患者、小鼠心脏内皮细胞、体外EndoMT模型(缺氧或TGF-β1/IL-1β诱导)、缺血性心力衰竭小鼠模型(永久性左前降支结扎) 机器学习 心力衰竭 单细胞测序 NA 单细胞测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
7 2026-09-19
Cell-based crop phenotyping for future climates
2026-Oct, The New phytologist
综述 本文讨论了基于细胞的作物表型分析技术在应对未来气候挑战中的应用前景与挑战 提出将单细胞组学技术与表型分析相结合,以细胞特异性水平评估作物抗逆性 当前表型分析方法对胁迫生物学的预测价值有限,缺乏合适的表型分析平台 探讨基于细胞的表型分析在作物抗逆育种中的应用,弥合组学技术与表型分析之间的差距 作物(现代栽培作物)在非生物胁迫下的抗逆性 植物科学 NA 单细胞RNA测序,空间组学技术,荧光染料,电生理方法 NA NA NA NA 单细胞RNA测序,空间组学 NA NA
8 2026-09-19
TP53 mutation-biased CD8+ T cell exhaustion drives lethal outcome and therapy resistance in urothelial carcinoma
2026-Oct, British journal of cancer IF:6.4Q1
研究论文 本研究结合内部队列和公共数据集,探究p53状态对尿路上皮癌中CD8+ T细胞临床意义和功能分化的影响 揭示了p53状态以背景依赖的方式决定CD8+ T细胞的临床意义和功能极化,发现p53突变型尿路上皮癌中TIM3+耗竭CD8+ T细胞占主导并伴随Treg和M2巨噬细胞浸润增加 摘要中未明确提及研究局限性 阐明p53状态对尿路上皮癌中CD8+ T细胞临床相关性和功能分化的影响 尿路上皮癌患者及其肿瘤免疫微环境中的CD8+ T细胞 数字病理学 尿路上皮癌 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 免疫组化, 生物信息学分析 NA 图像, 文本 1168例尿路上皮癌患者,其中297例来自两个内部队列,871例来自四个公共数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
9 2026-09-19
Bispecific ANXA2/CD147 CAR-T cell therapy for osteosarcoma
2026-Oct, Oncogene IF:6.9Q1
研究论文 本研究开发了一种靶向ANXA2/CD147的双特异性CAR-T细胞,并在骨肉瘤模型中验证了其抗肿瘤活性 首次构建了同时靶向ANXA2和CD147的双特异性CAR-T细胞,并系统验证了其在骨肉瘤中的抗肿瘤效果,同时揭示了M1巨噬细胞浸润增加可能是其增强抗肿瘤活性的机制之一 transduction效率为47.1%,仍有提升空间;未进行临床前安全性评估(如脱靶毒性、细胞因子释放综合征等);研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中验证 开发一种新型双特异性CAR-T细胞,为改善骨肉瘤的治疗效果提供实验依据 骨肉瘤细胞、CAR-T细胞、骨肉瘤CDX模型小鼠、爪垫异种移植模型小鼠、PDX模型小鼠 数字病理 骨肉瘤 单细胞RNA测序、qRT-PCR、流式细胞术、免疫组织化学、LDH释放实验、ELISA NA 图像、文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
10 2026-09-19
S100A1 Promotes MDM2-Mediated KLF15 Ubiquitination to Regulate ID1-Driven Tubular Injury in Diabetic Kidney Disease
2026-Sep-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 该研究揭示S100A1通过促进MDM2介导的KLF15泛素化降解,解除KLF15对ID1的转录抑制,从而驱动糖尿病肾病肾小管损伤 首次发现S100A1-MDM2-KLF15-ID1调控轴在糖尿病肾病肾小管损伤中的作用,S100A1通过增强MDM2与KLF15互作诱导K48连接泛素化降解KLF15,进而上调ID1 摘要未提及研究局限性 探究S100A1在糖尿病肾病肾小管损伤中的作用及其分子调控机制 健康对照与糖尿病肾病患者肾脏样本、糖尿病肾病患者肾活检标本、高糖刺激的人近端肾小管上皮细胞HK-2、糖尿病小鼠模型 数字病理学 糖尿病肾病 单细胞RNA测序 NA 图像,文本 健康对照和糖尿病肾病患者的肾脏单细胞RNA测序样本及肾活检标本,具体数量未提及 NA 单细胞RNA测序 NA NA
11 2026-09-19
Molecular heterogeneity in systemic sclerosis skin: insights from single-cell and spatial omics, and implications for disease stratification and cutaneous assessment
2026-Sep-18, The British journal of dermatology
综述 本文综述了2021至2025年间应用单细胞和空间多组学技术研究系统性硬化症皮肤分子异质性的成果,并探讨其对疾病分层和皮肤评估的意义 系统整合了单细胞和空间多组学在系统性硬化症皮肤中的最新发现,提出皮肤纤维化并非均一过程,而是由不同细胞和空间程序驱动的异质性疾病模型,并讨论了分子异质性在临床表型、治疗反应异质性和患者亚组划分中的潜在应用 所述分子观察能否改善患者分层、治疗选择或皮肤结局评估,仍依赖于在更大规模且临床特征明确的队列中进行前瞻性验证 综合单细胞和空间多组学研究,探讨系统性硬化症皮肤分子异质性与临床表型的关系,及其对皮肤评估、治疗反应异质性和患者亚组划分的启示 系统性硬化症患者的皮肤组织及皮肤纤维化 数字病理学 系统性硬化症 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 空间多组学 NA 图像, 文本 NA NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 空间多组学 NA NA
12 2026-09-19
Single-cell transcriptomics unveils metabolic and cellular dysregulation in striae gravidarum
2026-Sep-18, The British journal of dermatology
研究论文 该研究通过单细胞和单核RNA测序技术,揭示了妊娠纹(SG)中成纤维细胞异质性、细胞间通讯异常及脂肪酸代谢重编程,并确定ACSBG1为潜在治疗靶点 首次在单细胞分辨率下系统描绘妊娠纹的细胞图谱,发现sC7和sC5成纤维细胞亚群之间的异常通讯轴及从sC7到sC5的分化阻滞,揭示ACSBG1介导的脂肪酸代谢重编程在妊娠纹发病中的关键作用,并通过Triacsin C处理和Acsbg1基因沉默验证了靶向该通路的治疗潜力 样本量相对有限,仅纳入人类妊娠纹病灶及配对健康皮肤标本;动物模型仅验证了Acsbg1沉默的效果,尚未进行临床转化研究;未深入探讨其他细胞类型(如免疫细胞、角质形成细胞)在妊娠纹发病中的具体贡献 在单细胞水平上阐明妊娠纹的细胞景观和分子机制,重点关注成纤维细胞亚群动态、细胞间通讯和代谢重编程 人类妊娠纹病灶皮肤标本及配对的健康皮肤组织,以及小鼠背部皮肤模型 数字病理学 妊娠纹 单细胞RNA测序(scRNAseq)、单核RNA测序(snRNAseq)、定量聚合酶链反应(qPCR)、组织学染色(HE、EVG、天狼星红)、免疫荧光、孟德尔随机化分析 NA 图像、文本 人类妊娠纹病灶及配对的健康皮肤标本(具体数量未在摘要中说明),以及小鼠模型 NA 单细胞RNA测序、单核RNA测序 NA NA
13 2026-09-19
Dermatopathology in 4D: in situ spatial transcriptomics maps the cellular and molecular architecture of skin
2026-Sep-18, The British journal of dermatology
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
14 2026-09-19
A Critical Synthesis of Machine Learning in Autism Spectrum Disorder Genomic Research: From Transcriptomics to Microbiome
2026-09-18, Medeniyet medical journal IF:1.1Q2
综述 本文系统综述了机器学习在自闭症谱系障碍基因组研究中的应用进展,涵盖转录组学、全外显子测序、非编码变异解读、多组学整合、单细胞转录组学、表观遗传学及肠道微生物组分析 采用目的性主题文献综合方法,批判性评估了包括STARNet和SHAP可解释AI框架在内的前沿深度学习架构,指出文献中极端AUC值可能源于过拟合或数据泄漏,并强调可解释性与预测性能是正交属性 文献中部分极端AUC值可能反映过拟合或数据泄漏,原始报告未提供充分信息以明确归因;存在欧洲血统人群偏倚、社会经济确认偏倚、预测效应量有限、关联与因果混淆以及计算预测与临床实用性之间的差距 综合评述机器学习在自闭症谱系障碍基因组研究中的应用,涵盖从转录组学到微生物组的多个领域,并探讨关键挑战与未来方向 自闭症谱系障碍相关的基因组数据,包括基因表达数据、全外显子测序数据、非编码变异、多组学数据、单细胞转录组数据、表观遗传数据及肠道微生物组数据 机器学习 自闭症谱系障碍 全外显子测序, 转录组学, 单细胞转录组学, 表观遗传学分析, 微生物组分析, 多组学整合 深度学习, 神经网络, SHAP可解释AI框架 文本 NA NA NA NA NA
15 2026-09-19
Spatial atlas of the human brain vasculature reveals specialized cell ensembles
2026-Sep-17, Cell IF:45.5Q1
研究论文 该研究构建了涵盖314,535个转录组的人类脑血管细胞图谱,并通过空间转录组学绘制了152万个细胞,揭示了脑血管中特化的血管细胞集群及其与神经系统疾病易感性的关联 首次构建了全面的人类脑血管细胞图谱并定义了共识细胞状态;通过空间转录组学发现了与动静脉架构对齐的血管细胞集群,揭示了其在神经血管耦合、血脑屏障运输和免疫监视中的节段特异性功能;通过叠加遗传风险和药理反应,识别了神经系统疾病的集群特异性易感性和候选治疗靶点 研究主要聚焦于人类颞叶皮层和海马体,可能无法完全代表其他脑区的血管特征;样本来源和数量限制可能影响结论的普适性 构建全面的人类脑血管细胞图谱,解析脑血管的空间组织和功能逻辑,并探索神经系统疾病的易感性和治疗反应 人类大脑血管系统,包括内皮细胞、壁细胞、成纤维细胞和血管周围巨噬细胞 空间转录组学, 单细胞组学 神经系统疾病, 小血管疾病, 中风 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 转录组数据, 空间转录组数据 314,535个转录组和1,529,740个空间映射细胞,来自人类颞叶皮层和海马体 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
16 2026-08-20
Sequencing-free whole-genome spatial transcriptomics at single-molecule resolution
2026-Sep-17, Cell IF:45.5Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
17 2026-09-19
AGTR1 signaling contributes to tumor immunity and therapy response in non-small cell lung cancer
2026-Sep-17, Molecular therapy. Oncology
研究论文 该研究通过bulk RNA测序和单细胞RNA测序数据分析,结合免疫组化验证,探讨了AGTR1信号在非小细胞肺癌肿瘤免疫和治疗反应中的作用,并评估了血管紧张素受体阻滞剂(ARB)对免疫检查点阻断治疗疗效的影响 首次系统性地揭示了AGTR1在非小细胞肺癌中主要表达于癌症相关成纤维细胞(CAFs),并与TGF-β相关的免疫抑制特征相关;发现ARB联合化疗-免疫治疗可显著改善非鳞状NSCLC患者的无进展生存期,尤其是在PD-L1≥1%的患者中 免疫组化验证样本量较小(n=14);研究为回顾性分析,ARB使用的临床影响需要前瞻性随机对照试验进一步验证 探究AGTR1信号在非小细胞肺癌肿瘤微环境及免疫治疗反应中的作用,并评估ARB药物对免疫治疗疗效的影响 非小细胞肺癌(NSCLC)患者及其肿瘤组织样本、接受免疫检查点阻断治疗的患者队列 数字病理学 肺癌 bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 免疫组化 NA 转录组数据, 图像 14例NSCLC标本用于IHC验证,另包含bulk RNA测序和scRNA-seq公共数据集及接受ICB治疗的患者队列 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 NA NA
18 2026-09-19
Whole-transcriptome-scale isoform-resolved spatial imaging of single cells in tissues
2026-Sep-17, Cell IF:45.5Q1
研究论文 该文章介绍了一种原位RNA扩增方法,并将其与MERFISH技术整合,实现了组织内单细胞的全转录组尺度、异构体分辨的空间成像 开发了一种原位RNA扩增方法并与MERFISH整合,首次实现了对短RNA序列的检测,能够进行全转录组尺度、异构体分辨的单细胞空间转录组分析 NA 实现组织内单细胞的全转录组尺度、异构体分辨的空间转录组分析,以系统理解细胞和组织的功能 小鼠大脑组织中的单细胞 空间转录组学 NA MERFISH、原位RNA扩增 NA 图像 小鼠大脑中约33,000个不同RNA,包括约23,000个基因和约10,000个异构体 NA 空间转录组学 MERFISH 原位RNA扩增方法与多重误差鲁棒荧光原位杂交(MERFISH)整合
19 2026-09-19
Machine learning-driven decoding of maternal immune signatures in repeated pregnancy loss
2026-Sep-17, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 该研究通过单细胞RNA测序结合机器学习和基础模型解码复发性流产中母体免疫特征,并识别出CXCR4和JUN为候选药物靶点 结合基因型来源分析、监督机器学习模型和基于Transformer的基础模型(scGPT),优先识别母体T细胞为携带最显著且可泛化RPL相关特征的细胞群体,并通过计算药物重定位和网络中心性分析鉴定可成药分子候选物 研究仅提名候选靶点,尚未进行功能验证实验,且未在摘要中明确说明样本量大小 解析复发性流产中母体免疫耐受破坏的机制,识别与T细胞失调相关的可成药分子靶点 复发性流产患者的蜕膜组织以及孕早期对照组的蜕膜组织 机器学习 复发性流产 单细胞RNA测序 监督机器学习模型, Transformer基础模型(scGPT) 文本(单细胞转录组数据) NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
20 2026-09-19
Balancing lipid synthesis and oxidation promotes B cell response to vaccination during immunosuppression
2026-Sep-17, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 该研究通过高维免疫分析、单细胞转录组学和功能代谢实验,揭示了脂质代谢失衡是实体器官移植受者疫苗应答受损的核心机制,并发现靶向胆固醇合成可部分恢复B细胞功能 首次将脂质代谢失调确定为免疫抑制状态下疫苗应答受损的核心决定因素,发现CD11c+ B细胞通过CPT1A介导的脂肪酸氧化在霉酚酸存在下保留分化能力,并证明药理学抑制胆固醇合成可部分恢复浆母细胞分化 摘要中未明确提及研究的具体局限性,如样本量有限、机制研究主要集中于体外实验、临床干预验证尚需进一步开展等 阐明免疫抑制治疗破坏人类B细胞疫苗应答的机制,并寻找可靶向的调控节点以改善免疫抑制患者的体液免疫 实体器官移植受者(SOTRs)及健康个体的B细胞 免疫学 移植免疫抑制相关免疫缺陷 高维免疫分析、单细胞转录组学、功能代谢实验 NA 单细胞转录组数据、功能代谢数据 实体器官移植受者及健康个体的B细胞样本(具体数量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
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