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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1 2026-03-07
TimeVault turns vault particles into molecular memory of transcriptional states: how to decode the cellular black box
2026-Dec, Cell cycle (Georgetown, Tex.)
研究论文 TimeVault技术通过改造vault核糖核蛋白颗粒,在活细胞内存储内源性转录组,实现转录状态的分子记忆 首次利用vault颗粒在活细胞内长期存储转录组,实现转录历史的回顾性重建,突破了传统转录组学方法的破坏性限制 未明确说明技术在不同细胞类型或复杂生物系统中的普适性,以及长期存储的稳定性验证细节 开发一种能够在活细胞内长期记录转录状态的技术,以揭示瞬时基因表达与长期表型结果之间的因果关系 活细胞(包括应激反应模型和癌症模型中的细胞) 分子生物学 癌症 单细胞RNA测序,转录组存档技术 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2 2026-03-07
Unveiling the Roles of PRDX6 and SLC6A9 in Intracerebral Hemorrhage-Associated White Matter Lesions
2026-Mar-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过整合生物信息学方法,结合孟德尔随机化分析和单细胞RNA测序,揭示了PRDX6和SLC6A9在脑出血相关白质病变中的潜在作用 首次将两性状孟德尔随机化分析与单细胞RNA测序相结合,系统探索脑出血后白质病变的遗传贡献者,并识别出PRDX6和SLC6A9的关键作用 研究主要基于生物信息学分析和动物模型数据,尚未在临床样本中进行实验验证,且分子机制的具体作用通路仍需进一步阐明 探究脑出血诱导的白质病变的分子机制,识别潜在的遗传风险基因 脑出血相关的白质病变,重点关注PRDX6和SLC6A9基因 生物信息学 脑血管疾病 单细胞RNA测序,孟德尔随机化分析,表达数量性状位点分析,功能富集分析 NA 基因表达数据,单细胞转录组数据 未明确说明具体样本数量,涉及正常和脑出血影响的小鼠脑组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3 2026-03-07
Multi-Omics Data Reveal Estrogen-Driven Dysregulation and Stromal-Epithelial Signaling Alterations in Endometrial Polyps
2026-Mar-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析,揭示了子宫内膜息肉中雌激素信号增强、上皮细胞增殖增加以及基质-上皮细胞通讯异常等关键病理特征 首次在单细胞水平上系统描绘了子宫内膜息肉的多组学特征,并利用空间转录组学和体外类器官模型验证了基质-上皮细胞互常在息肉形成中的作用 样本量相对有限,且未涉及长期随访或治疗干预效果的评估 阐明子宫内膜息肉的发病机制,并探索潜在的治疗靶点 正常子宫内膜、息肉旁组织和息肉组织 数字病理学 子宫内膜息肉 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA RNA测序数据, 空间转录组数据 未明确指定具体数量,但包括正常、息肉旁和息肉组织样本 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
4 2026-03-07
[Crosstalk of KRT17+ epithelial cells with CD8+ T cells in oral lichen planus and clinical relevance]
2026-Mar-06, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
研究论文 本研究探讨了口腔扁平苔藓中KRT17阳性上皮细胞与CD8⁺ T细胞的相互作用及其与临床严重程度的相关性 首次在单细胞水平揭示了KRT17⁺上皮细胞通过HLA-A/B/C-CD8和MIF-CD74/CXCR4等信号通路与CD8⁺ T细胞互作,并证实KRT17表达与OLP临床严重程度正相关 样本量较小(单细胞数据仅5例),且为单中心研究,需要更大样本验证 探究口腔扁平苔藓的发病机制,特别是上皮细胞与免疫细胞的相互作用 口腔扁平苔藓患者(非糜烂型和糜烂型)及健康对照的口腔黏膜组织 数字病理 口腔扁平苔藓 单细胞RNA测序,批量RNA测序,多重免疫荧光染色 CIBERSORT反卷积算法,CellChat细胞互作分析 单细胞转录组数据,批量转录组数据,组织图像数据 单细胞数据:5例(2例NEOLP,2例EOLP,1例HC);批量RNA数据:40例(27例NEOLP,13例EOLP);验证样本:45例(20例NEOLP,20例EOLP,5例HC) NA 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq NA NA
5 2026-03-07
Identification of Poor Prognosis-Associated Fibroblast Subpopulation Signature Genes Utilizing the Scissor Algorithm to Classify Colorectal Cancer Subtypes and Evaluate the Immune Landscape
2026-Mar-06, Gut and liver IF:3.4Q2
研究论文 本研究利用Scissor算法整合单细胞与批量转录组数据,首次识别出与结直肠癌不良预后显著相关的成纤维细胞亚群,并揭示了其在促进转移和免疫抑制微环境中的作用 首次应用Scissor算法整合单细胞与批量转录组数据识别结直肠癌中与预后相关的成纤维细胞亚群,并系统揭示了该亚群通过激活促转移通路和塑造免疫抑制微环境影响临床预后的机制 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,缺乏独立的前瞻性队列验证;Scissor算法对数据质量和临床信息的完整性依赖较强 识别结直肠癌中与不良预后相关的成纤维细胞亚群,解析其分子特征及对肿瘤微环境的影响,为预后评估和个性化治疗提供新视角 结直肠癌患者肿瘤组织中的成纤维细胞亚群 数字病理学 结直肠癌 RNA-seq Scissor算法 转录组数据(批量与单细胞) 来自TCGA和GEO数据库的结直肠癌样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
6 2026-03-07
Mosaic human cortical organoids model mTOR-related focal cortical dysplasia through DEPDC5 deletion
2026-Mar-06, Brain : a journal of neurology IF:10.6Q1
研究论文 本研究利用患者来源的人类皮质类器官建立了DEPDC5双等位基因失活嵌合模型,模拟了mTOR相关局灶性皮质发育不良的病理特征 首次在人类皮质类器官中建立DEPDC5双等位基因失活嵌合模型,系统揭示了该基因缺陷如何通过影响神经元分化、信号通路和细胞代谢导致癫痫病理 研究基于体外类器官模型,与真实脑组织环境存在差异;单细胞测序仅涵盖三个发育阶段 探究DEPDC5基因缺陷导致局灶性皮质发育不良II型的分子机制 患者来源的人类皮质类器官 神经科学 癫痫 单细胞转录组测序 人类皮质类器官模型 基因表达数据 未明确样本数量 NA 单细胞RNA-seq NA NA
7 2026-03-07
Autocrine SFRP2 (secreted frizzled related protein 2) enhances lung myofibroblast fibrogenic activity by suppressing PINK1-mediated mitophagy initiation
2026-Mar-06, Autophagy IF:14.6Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序发现SFRP2在特发性肺纤维化中作为关键介质,通过自分泌方式抑制PINK1介导的线粒体自噬,从而增强肺肌成纤维细胞的纤维化活性 揭示了SFRP2通过激活非经典WNT-Ca信号通路,导致PINK1降解并抑制线粒体自噬的新机制,为肺纤维化治疗提供了新靶点 研究主要基于小鼠模型和体外实验,尚未在人类患者中进行验证,且长期疗效和安全性需进一步评估 探究特发性肺纤维化中肺肌成纤维细胞持续活化的调控机制 特发性肺纤维化患者的肺组织样本及博来霉素诱导的小鼠肺纤维化模型 单细胞组学 肺纤维化 单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
8 2026-03-07
Type I interferon-induced CD169+ macrophages play a protective role in periodontitis
2026-Mar-06, Journal of periodontology IF:4.2Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序等技术,揭示了I型干扰素诱导的CD169+巨噬细胞在牙周炎中的保护作用及其分化机制 首次在牙周炎背景下系统描述了CD169+巨噬细胞的转录特征、分化微环境及其通过产生CCL18和IL10维持免疫稳态的保护性功能,并明确了I型干扰素-IRF7轴在其分化中的关键作用 研究样本量相对有限(健康对照8例,牙周炎患者10例),且主要基于观察性数据和动物模型验证,其治疗转化潜力仍需进一步临床研究证实 探究牙周组织中CD169+巨噬细胞的转录特征、分化微环境及其对牙周炎的影响 人牙周组织样本(健康对照与牙周炎患者)及小鼠模型 数字病理学 牙周炎 单细胞RNA测序,免疫组织化学染色,免疫荧光染色,流式细胞术,SCENIC分析,体外实验 NA 单细胞转录组数据,图像数据 18例人牙周组织样本(健康对照8例,牙周炎患者10例)及小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
9 2026-03-07
SpatioFreq: A Deep Learning Framework for Decoding Cellular and Tissue Landscapes Across Organisms Using Spatial Transcriptomics
2026-Mar-06, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
研究论文 本文提出了一个名为SpatioFreq的深度学习框架,用于通过空间转录组学解码生物体中的细胞和组织景观 引入了一种创新方法,利用拉普拉斯矩阵提取频域特征以检测空间数据中的细微结构和动态模式,并结合图自监督对比学习优化空间数据中的长程依赖关系,通过双任务设计实现任务间信息共享 未明确提及 提高空间转录组学分析的准确性和效率,揭示组织内细胞的空间组织结构 空间转录组学数据 空间转录组学 乳腺癌 空间转录组学 深度学习框架 空间转录组学数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
10 2026-03-07
Histological, ultrastructural, and single-cell profiling reveal immune-mediated remodeling in gallbladder inflammation
2026-Mar-05, Cell and tissue research IF:3.2Q3
研究论文 本研究通过组织学、超微结构和单细胞分析,揭示了胆囊炎症中免疫介导的重塑过程 首次结合单细胞RNA测序与超微结构分析,系统定义了急性与慢性胆囊炎症中不同的免疫-基质程序 样本量相对有限(41例患者),且未探讨炎症状态之间的时间动态转换 旨在阐明急性与慢性胆囊炎症的细胞和结构特征,并关联上皮、免疫和基质改变 胆囊炎症患者(包括急性胆囊炎和慢性胆石症)的组织与血液样本 数字病理学 胆囊疾病 单细胞RNA测序,组织病理学,免疫组化,透射电子显微镜,靶向细胞因子表达分析 NA 单细胞转录组数据,组织图像,血液样本数据 41例患者(12例急性胆囊炎,29例慢性胆石症) NA 单细胞RNA测序 NA NA
11 2026-03-07
TNF-α Blockade Mitigates Immune Checkpoint-Related Nephritis in a Humanized Mouse Model
2026-Mar-05, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究利用人源化PD-1/PD-L1嵌合小鼠模型,评估了免疫检查点抑制剂(ICIs)单独或联合促炎细胞因子对肾脏的影响,并测试了选择性TNF-α阻断能否预防ICI相关的急性间质性肾炎(ICI-AIN) 首次在人源化小鼠模型中揭示了ICIs与促炎细胞因子在诱发ICI-AIN中的协同作用,并验证了TNF-α阻断的保护性效果 研究基于小鼠模型,其结论在人体中的适用性仍需进一步临床验证 探究免疫检查点抑制剂(ICIs)诱发急性间质性肾炎(ICI-AIN)的机制,并评估TNF-α阻断作为预防策略的潜力 人源化PD-1/PD-L1嵌合小鼠 NA 急性间质性肾炎 单细胞RNA测序,ELISA,组织学分析 人源化PD-1/PD-L1嵌合小鼠模型 RNA测序数据,细胞因子数据,组织图像 四组实验小鼠(对照组、ICI单独组、ICI-细胞因子联合组、ICI-TNF-α阻断组) NA 单细胞RNA-seq NA NA
12 2026-03-07
Prospective study of patients with immune checkpoint inhibitor-induced hepatitis; characterization of liver injury, outcome of therapy, and management of steroid-unresponsive and steroid-dependent hepatitis
2026-Mar-05, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究前瞻性调查了免疫检查点抑制剂诱导的肝炎患者,描述了肝损伤特征、治疗结果以及类固醇无反应和类固醇依赖性肝炎的管理 首次前瞻性研究免疫相关肝炎的类固醇无反应和类固醇依赖性表型,并利用多重免疫组化和单细胞RNA测序进行免疫学分析 样本量较小(34例患者),且为单中心研究,可能限制结果的普遍性 评估免疫检查点抑制剂诱导的肝炎的发病率、特征和治疗反应,特别是对类固醇初始治疗反应不足的患者 接受免疫检查点抑制剂治疗并出现3-4级免疫相关肝炎的患者 数字病理学 肝损伤 多重免疫组化,单细胞RNA测序 NA 组织样本,血液样本 34例患者 NA 单细胞RNA测序 NA NA
13 2026-03-07
Scalable cell-specific coexpression networks for granular regulatory pattern discovery with NeighbourNet
2026-Mar-05, Genome research IF:6.2Q1
研究论文 本文介绍了NeighbourNet(NNet)方法,用于构建细胞特异性共表达网络,以发现单细胞RNA测序数据中的精细调控模式 NNet通过主成分分析和局部回归在K最近邻内量化共表达,提高了计算效率并稳定了估计,克服了scRNA-seq数据噪声和稀疏性的挑战,支持可扩展的下游分析 未在摘要中明确提及具体限制,但可能包括对KNN参数选择的依赖或数据预处理要求 开发一种方法以在单细胞分辨率下推断基因网络,捕捉个体细胞间的动态调控变化 单细胞RNA测序数据中的基因表达模式 生物信息学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 主成分分析(PCA)、K最近邻(KNN)回归 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
14 2026-03-07
KRAS-extrachromosomal DNA drives intratumoral heterogeneity in gastric cancer
2026-Mar-05, Oncogene IF:6.9Q1
研究论文 本研究通过全基因组测序和单细胞RNA测序,揭示了胃癌中KRAS基因在染色体外DNA(ecDNA)上的扩增如何驱动肿瘤内异质性,并探讨了其功能影响和潜在治疗策略 首次在胃癌中鉴定出KRAS-ecDNA,并系统分析了其导致的转录异质性、功能通路改变及药物反应预测,为靶向ecDNA驱动的致癌程序提供了新见解 研究仅基于单个胃癌样本,样本量有限,且功能验证和临床相关性需进一步探索 探究胃癌中KRAS基因通过染色体外DNA(ecDNA)扩增的功能意义及其对肿瘤异质性和治疗反应的影响 胃癌样本 数字病理学 胃癌 全基因组测序, 单细胞RNA测序 NA 基因组数据, 转录组数据 1个胃癌样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
15 2026-03-07
Identification and validation of prognostic genes associated with M2 macrophage and heme metabolism in lung adenocarcinoma through bulk and single-cell RNA sequencing analysis
2026-Mar-05, Discover oncology IF:2.8Q2
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
16 2026-03-07
Neutrophil extracellular traps-associated candidate genes in IgA vasculitis: an exploratory multi-omics analysis integrating transcriptomics and Mendelian randomization
2026-Mar-05, Pediatric rheumatology online journal
研究论文 本研究通过整合转录组学和孟德尔随机化方法,探索性地识别了与IgA血管炎相关的NET相关候选基因 采用多组学整合方法,结合bulk转录组数据、NET相关基因集分析、孟德尔随机化和单细胞RNA测序,系统性地识别了IgA血管炎中NET相关的候选基因及其在免疫细胞中的特异性表达 研究为探索性分析,样本量有限,结果需在更大队列和功能研究中进一步验证 探索NET相关基因在IgA血管炎发病机制中的作用 IgA血管炎患者和健康对照者的外周血样本 生物信息学 IgA血管炎 转录组学分析、孟德尔随机化、单细胞RNA测序 基因集富集分析、基因集变异分析、孟德尔随机化模型 转录组数据 未明确指定样本数量,涉及IgA血管炎患者和健康对照 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
17 2026-03-07
FFAR4 negatively regulates colorectal cancer growth via blocking oxidative phosphorylation
2026-Mar-05, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究探讨了FFAR4在结直肠癌中的表达、临床相关性及其通过调节线粒体功能和细胞代谢抑制肿瘤生长的机制 首次通过整合多组学方法将FFAR4鉴定为结直肠癌FFAR家族中的关键候选基因,并揭示了其通过阻断氧化磷酸化抑制肿瘤生长的代谢调控机制 研究主要基于细胞系和动物模型,临床样本验证相对有限,且FFAR4的具体下游信号通路尚未完全阐明 探究FFAR4在结直肠癌发生发展中的作用及其作为诊断生物标志物和治疗靶点的潜力 结直肠癌组织、CRC细胞系(如MC38同基因肿瘤模型) 癌症研究 结直肠癌 单细胞RNA测序、转录组学、代谢分析、细胞外通量分析 NA 转录组数据、代谢数据、免疫荧光图像 临床CRC组织样本、CRC细胞系、MC38同基因肿瘤模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
18 2026-03-07
TWIST1-Mediated Induction of AEBP1 in Fibroblast-like Synoviocytes Activates TGF-β Signaling to Drive Angiogenesis and Promote Rheumatoid Arthritis
2026-Mar-05, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
研究论文 本研究通过整合多种组学技术,揭示了TWIST1-AEBP1-POSTN轴在类风湿关节炎滑膜成纤维细胞激活和血管生成中的关键作用 首次鉴定出位于滑膜下层的致病性POSTN+ FLS亚群,并阐明TWIST1通过诱导AEBP1激活TGF-β信号通路驱动关节炎进展的分子机制 研究主要基于动物模型和体外实验,尚未在人类患者中进行临床验证 阐明类风湿关节炎中致病性滑膜成纤维细胞亚群的分子调控机制并探索治疗新靶点 类风湿关节炎患者的滑膜组织、成纤维样滑膜细胞、胶原诱导性关节炎小鼠模型 单细胞组学 类风湿关节炎 bulk RNA测序, 蛋白质组学, 单细胞转录组学 NA 基因表达数据, 蛋白质数据, 单细胞转录组数据 未明确说明具体样本数量 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
19 2026-03-07
Dual-Targeting BCMA-CD19 CAR-T Cell Therapy in Systemic Lupus Erythematosus: Single-Cell and Immune Repertoire Analysis Reveals Mechanisms of Immune Reconstitution
2026-Mar-05, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和免疫受体测序,探讨了BCMA-CD19双靶向CAR-T疗法在系统性红斑狼疮患者中诱导外周免疫重建的机制 首次在SLE患者中应用双靶向CAR-T疗法,并通过单细胞分析揭示了其对浆细胞谱系的深度耗竭和免疫分子特征的逆转 样本量较小(仅5名患者),且为探索性研究,需要更大规模的直接比较研究来确认临床优势 研究BCMA-CD19双靶向CAR-T疗法在系统性红斑狼疮患者中的外周免疫重建机制 系统性红斑狼疮患者的外周血单个核细胞 单细胞测序分析 系统性红斑狼疮 单细胞RNA测序,BCR/TCR测序 NA 单细胞转录组数据,免疫受体序列数据 5名SLE患者(双靶向治疗组),整合公共数据集共15名受试者,分析176,182个单细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
20 2026-03-07
Cancer-immunity cycle-based molecular subtypes in breast cancer predict the response to immune checkpoint inhibitors
2026-Mar-05, Cancer biology & medicine IF:5.6Q1
研究论文 本研究基于癌症-免疫循环(CIC)构建了一个分子亚型分类系统,用于预测乳腺癌患者对免疫检查点抑制剂(ICI)的反应 首次在乳腺癌中基于CIC的六个步骤构建分子亚型分类系统,揭示了不同亚型在免疫浸润、基因组特征和代谢通路上的差异,并验证了其预测ICI反应的潜力 研究主要基于回顾性队列,需要前瞻性临床试验进一步验证CIC亚型分类的临床实用性 评估乳腺癌患者的癌症-免疫循环状态,以准确评估免疫状态并筛选适合免疫检查点抑制剂治疗的患者 乳腺癌患者 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序, 基因组学分析, 代谢组学分析 NA 基因组数据, 代谢组数据, 单细胞RNA测序数据 752例乳腺癌患者(来自已发表队列) NA 单细胞RNA测序 NA NA
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