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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-03-18 |
PANX1-mediated NLRP3 inflammasome activation promotes an adaptive doxorubicin resistance through IL-1β signaling in breast cancer
2026-May-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218387
PMID:41765358
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研究论文 | 本研究揭示了PANX1通过激活NLRP3炎症小体和IL-1β信号通路,促进乳腺癌对阿霉素产生适应性耐药的新机制 | 首次发现PANX1在乳腺癌化疗耐药中的关键作用,并阐明其通过NLRP3-IL-1β信号轴介导适应性耐药的分子机制 | 研究主要基于临床队列和动物模型,需要在更大规模的前瞻性临床试验中进一步验证PANX1作为生物标志物和治疗靶点的有效性 | 探究PANX1在乳腺癌化疗耐药中的作用机制,并评估其作为预测生物标志物和治疗靶点的潜力 | 乳腺癌患者队列、乳腺癌细胞系和动物模型 | 肿瘤生物学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组学、空间转录组学、药理学抑制、基因敲低 | 动物模型、细胞模型 | 转录组数据、临床数据 | 患者队列(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2 | 2026-03-18 |
Artificial sweeteners and male infertility: Network toxicology and experimental evidence reveal FGFR1 as the critical target
2026-04, Reproductive toxicology (Elmsford, N.Y.)
DOI:10.1016/j.reprotox.2026.109191
PMID:41713522
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研究论文 | 本研究通过整合计算预测、网络分析和湿实验验证,探讨人工甜味剂导致男性不育的机制,并确定FGFR1为关键靶点 | 首次结合网络毒理学、机器学习特征选择、分子对接与动力学模拟以及单细胞RNA-seq分析,系统揭示人工甜味剂通过FGFR1信号通路影响男性生殖功能的分子机制 | 研究主要基于体外细胞实验和计算模拟,缺乏体内实验和蛋白质水平验证,且仅针对部分人工甜味剂 | 探索人工甜味剂导致男性不育的潜在分子机制 | 七种人工甜味剂(如阿斯巴甜、纽甜、三氯蔗糖)及其与男性生殖系统相关的分子靶点 | 网络毒理学 | 男性不育 | 单细胞RNA-seq、RT-qPCR、分子对接、分子动力学模拟、机器学习特征选择 | 机器学习特征选择 | 基因表达数据、分子结构数据、单细胞转录组数据 | TM3 Leydig细胞系暴露于阿斯巴甜(0.5-2 mM)48小时 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3 | 2026-03-18 |
Integrating histology and spatial transcriptomics via multimodal transformers and contrastive representation learning for accurate gene expression prediction
2026-Apr, Journal of biomedical informatics
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbi.2026.105003
PMID:41763376
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研究论文 | 本文提出了一种统一的多模态学习框架,通过结合组织学图像和空间转录组学数据,利用多模态Transformer和对比表示学习来准确预测基因表达 | 采用ResNet50卷积主干和MobileViT Transformer编码器提取层次视觉表示,并通过对比学习目标在共享潜在空间中对齐图像和转录组特征,显著提高了预测准确性 | NA | 从组织学图像预测空间基因表达,以理解组织结构和分子表型 | 人类肝脏组织 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | ResNet50, MobileViT Transformer | 图像, 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Genomics Visium数据集 |
| 4 | 2026-03-18 |
GITR activation potentiates anti-tumor immunity of tumor-infiltrating lymphocytes expanded from glioblastoma by rescuing exhaustion
2026-Apr, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-026-03705-z
PMID:41776051
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研究论文 | 本研究优化了从胶质母细胞瘤病灶体外扩增肿瘤浸润淋巴细胞的方法,并通过单细胞RNA测序揭示了其异质性,发现GITR激活可通过NF-κB/KALRN信号轴增强CD8 TIL的抗肿瘤免疫,为改善胶质母细胞瘤的TIL疗法提供了新策略 | 发现GITR不仅高表达于免疫抑制性Treg细胞,也高表达于耗竭的CD8 TILs;GITR激动剂具有双重作用:直接增强CD8 TIL活化同时消除Treg介导的免疫抑制;揭示了GITR激活通过NF-κB/KALRN信号轴促进免疫突触形成的作用机制 | NA | 探索改善胶质母细胞瘤自体肿瘤浸润淋巴细胞疗法疗效的策略 | 从胶质母细胞瘤病灶扩增的肿瘤浸润淋巴细胞 | NA | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2026-03-18 |
L1TD1 promotes colorectal mucinous adenocarcinoma progression by enhancing ABCC3 mRNA stability
2026-Apr, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-026-03716-w
PMID:41776049
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了L1TD1在结直肠黏液腺癌中通过增强ABCC3 mRNA稳定性促进黏液产生和肿瘤进展的机制 | 首次发现L1TD1作为RNA结合蛋白,通过其RRM结构域结合ABCC3 mRNA的3'-UTR区域,增加其稳定性,从而激活MAPK信号通路,促进结直肠黏液腺癌的黏液产生和进展 | 未明确L1TD1-ABCC3轴在其他癌症类型中的普遍性,且体内实验验证可能不足 | 探究结直肠黏液腺癌中黏液产生的具体调控机制及其对肿瘤进展的影响 | 结直肠黏液腺癌组织、正常组织及癌细胞 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2026-03-18 |
KRAS-extrachromosomal DNA drives intratumoral heterogeneity in gastric cancer
2026-Apr, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-026-03713-z
PMID:41786878
|
研究论文 | 本研究通过全基因组测序和单细胞RNA测序揭示了胃癌中KRAS基因在染色体外DNA(ecDNA)上的扩增及其在肿瘤内异质性中的关键作用 | 首次在胃癌中鉴定出KRAS-ecDNA,并系统分析了其驱动的转录异质性、功能特征及药物反应预测,为靶向ecDNA驱动的致癌程序提供了新策略 | 研究仅基于单个胃癌样本,样本量有限,且功能验证和临床相关性需进一步探索 | 探究KRAS基因通过染色体外DNA(ecDNA)在胃癌中的功能影响及肿瘤内异质性机制 | 胃癌样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 全基因组测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 1个胃癌样本 | NA | 全基因组测序, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2026-03-18 |
Tumor Necrosis Factor Receptor-Associated Factor 1 Inhibits Macrophage Killing of Sporothrix schenckii by Enhancing Expression and Activity of Inducible Nitric Oxide Synthase
2026-Mar-17, The Journal of infectious diseases
IF:5.0Q1
DOI:10.1093/infdis/jiaf646
PMID:41428466
|
研究论文 | 本研究首次揭示TRAF1通过稳定NOS2表达抑制巨噬细胞对申克孢子丝菌的杀伤,从而延缓孢子丝菌病愈合,并发现局部热疗可通过下调TRAF1和NOS2表达靶向该通路 | 首次发现TRAF1在申克孢子丝菌感染中通过结合并稳定NOS2蛋白,抑制其泛素化降解,从而削弱巨噬细胞的杀菌能力,并阐明局部热疗通过调控TRAF1-NOS2轴发挥治疗作用的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类临床样本验证不足;热疗的具体分子调控网络尚未完全解析 | 探究TRAF1和NOS2在孢子丝菌病免疫逃逸中的作用机制,以及局部热疗的治疗原理 | 申克孢子丝菌感染的巨噬细胞及小鼠孢子丝菌病模型 | NA | 孢子丝菌病 | 单细胞RNA测序、免疫共沉淀、泛素化实验、定点诱变 | NA | 单细胞RNA测序数据、体外和体内实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8 | 2026-03-18 |
Single-Atom Nanozyme Driven Lactate Reversal Fuels Oxidative Metabolism and Represses Lactylation to Heal Diabetic Wounds
2026-Mar-17, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.5c20192
PMID:41757688
|
研究论文 | 本研究开发了一种磷掺杂单原子铁纳米酶(Fe@CN-P),用于通过乳酸氧化和ROS清除促进糖尿病伤口愈合 | 通过磷掺杂调控铁活性中心的电子密度,实现金属基纳米酶的高效乳酸氧化,并建立“逆转-再利用”代谢通路 | 未明确提及实验样本量或临床验证的局限性 | 设计具有精确电子调控和治疗功能的单原子纳米酶,以调节炎症并促进糖尿病伤口愈合 | 糖尿病伤口愈合过程中的乳酸代谢和线粒体活性 | 单细胞分析 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9 | 2026-03-18 |
Metabolic RNA Labeling-Enabled Time-Resolved Single-Cell RNA Sequencing
2026-Mar-17, Accounts of chemical research
IF:16.4Q1
DOI:10.1021/acs.accounts.6c00010
PMID:41758996
|
综述 | 本文综述了代谢RNA标记技术结合单细胞RNA测序在时间分辨转录组分析中的最新进展,包括方法开发、应用扩展及未来展望 | 开发了Well-TEMP-seq和scDUAL-seq等新技术,提高了时间分辨单细胞RNA测序的性能,并实现了从体外到体内、从时间到时空的维度扩展 | 当前化学工具在单细胞RNA动态分析中仍存在局限性,如标记效率和准确性有待进一步提升 | 研究单细胞水平上基因表达的异质性和动态调控机制 | 细胞在胚胎发育、疾病进展和刺激响应等过程中的转录组动态变化 | 单细胞组学 | NA | 代谢RNA标记、单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2026-03-18 |
CRLF1 Secreted by Cardiac Fibroblasts Promotes Human Hypertrophic Cardiomyopathy
2026-Mar-17, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本研究通过整合分析肥厚型心肌病患者的组织样本,发现心脏成纤维细胞分泌的CRLF1是驱动心肌细胞肥大的关键旁分泌因子,揭示了HCM发病的非遗传性共同机制 | 首次鉴定出CRLF1作为HCM的通用致病因子,跨越遗传异质性患者,提供了一种新的非遗传性旁分泌机制解释 | 研究主要基于手术切除的梗阻性HCM患者样本,可能不适用于所有HCM亚型;动物模型为Myh6 R404Q/+小鼠,与人类疾病存在物种差异 | 探究肥厚型心肌病的统一分子基础,寻找跨越遗传异质性的共同致病通路 | 269名接受手术心肌切除术的梗阻性HCM患者的肥厚室间隔组织,以及Myh6 R404Q/+小鼠模型 | 心血管疾病研究 | 肥厚型心肌病 | 靶向肌节基因筛查、bulk RNA测序、加权基因共表达网络分析、单细胞RNA测序、生化检测、功能获得与缺失研究 | NA | 基因序列数据、RNA表达数据、单细胞转录组数据 | 269名HCM患者组织样本及小鼠模型 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11 | 2026-03-18 |
Single-cell sequencing combined with transcriptome sequencing to reveal the molecular mechanisms related to integrated stress responses in atherosclerosis
2026-Mar-17, Journal of cardiothoracic surgery
IF:1.5Q3
DOI:10.1186/s13019-026-03862-y
PMID:41840716
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 12 | 2026-03-18 |
ChemR23 prevents phenotypic switching of vascular smooth muscle cells into macrophage-like foam cells in atherosclerosis
2026-Mar-16, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaf258
PMID:41264461
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研究论文 | 本研究探讨了ChemR23在血管平滑肌细胞表型转换中的作用及其对动脉粥样硬化的影响 | 揭示了ChemR23在非造血细胞(特别是血管平滑肌细胞)中调控表型转换的新功能,并发现其配体C9和抑制剂α-NETA在动脉粥样硬化中的治疗潜力 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,人类数据仅来自单细胞转录组分析,缺乏直接的人类体内验证 | 阐明ChemR23在血管平滑肌细胞表型转换和动脉粥样硬化发展中的具体作用 | 小鼠模型(Apoe-/-和ChemR23e/e双缺陷小鼠)和人类主动脉平滑肌细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序, bulk RNA测序 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 小鼠模型(具体数量未明确), 人类动脉粥样硬化斑块单细胞数据 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2026-03-18 |
Representation learning of single-cell RNA-seq data
2026-Mar-16, RNA (New York, N.Y.)
DOI:10.1261/rna.080889.125
PMID:41506911
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序数据的表示学习方法,包括因子模型、自编码器、对比学习和基于Transformer的基础模型 | 提出了一个连贯的分类法,阐明了这些方法的理论基础、共同假设和关键区别,并讨论了基准测试和未来挑战 | NA | 探讨单细胞RNA测序数据的表示学习,以降低噪声并保留关键变异,用于聚类、可视化、轨迹推断等下游任务 | 单细胞RNA测序数据 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | 因子模型, 自编码器, 对比学习, Transformer | 基因表达数据 | 超过1亿个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 14 | 2026-03-18 |
miRNA regulation in brain tissue space: the 3'UTR perspective
2026-Mar-16, RNA (New York, N.Y.)
DOI:10.1261/rna.080850.125
PMID:41672779
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综述 | 本文综述了大脑组织中miRNA及其靶点3'UTR的空间调控作用,总结了当前空间定量技术面临的挑战并提出了未来研究方向 | 首次系统探讨了大脑组织中miRNA与3'UTR异构体空间共定位定量技术的缺失问题,并提出了整合解决方案 | 作为综述文章,未提供原创实验数据,主要基于现有文献分析 | 探讨大脑发育与神经功能中miRNA-3'UTR空间调控机制的研究现状与未来方向 | 大脑组织中的microRNAs(miRNAs)及其靶基因的3'非翻译区(3'UTRs) | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间RNA表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 15 | 2026-03-18 |
ADAMTS7 promotes smooth muscle foam cell expansion in atherosclerosis
2026-Mar-16, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI187451
PMID:41609669
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研究论文 | 本文研究了ADAMTS7在动脉粥样硬化中促进平滑肌泡沫细胞扩张的机制 | 揭示了ADAMTS7通过AP-1/PU.1/CD36调控轴驱动平滑肌细胞泡沫细胞形成的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 | 探究ADAMTS7在动脉粥样硬化中的细胞特异性促动脉粥样硬化机制 | 平滑肌细胞、内皮细胞、成纤维细胞 | 心血管疾病 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq | 条件敲除小鼠、转基因小鼠 | RNA-seq数据、ATAC-seq数据 | 人类颈动脉粥样硬化单细胞RNA-seq数据、小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |
| 16 | 2026-03-18 |
MAP4K2 suppresses antitumor immunity in a pancreatic cancer model by promoting Treg differentiation
2026-Mar-16, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI196379
PMID:41615953
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研究论文 | 本研究通过T细胞特异性敲除Map4k2小鼠、单细胞RNA测序和质谱分析,揭示了MAP4K2通过磷酸化DDX39B促进其核转位,进而诱导Foxp3基因表达和Treg分化,从而抑制胰腺癌模型中的抗肿瘤免疫 | 首次在体内阐明了MAP4K2在免疫调节中的作用机制,发现其通过DDX39B介导的Foxp3 RNA剪接促进Treg分化,并证明靶向MAP4K2可增强抗PD-1免疫疗法在胰腺癌中的疗效 | 研究主要基于小鼠模型,人类胰腺癌患者数据仅通过单细胞RNA测序分析进行验证,缺乏更深入的临床干预研究 | 探究MAP4K2在T细胞介导的免疫调节中的作用及其对胰腺癌抗肿瘤免疫的影响 | T细胞、调节性T细胞(Treg)、胰腺癌小鼠模型、人类胰腺癌患者样本 | 免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、质谱分析、条件性基因敲除、过继性转移 | 条件性敲除小鼠模型、过继性转移嵌合小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质互作数据 | T细胞特异性Map4k2敲除小鼠、Treg特异性Map4k2缺陷小鼠、过继性转移嵌合小鼠、MAP4K2抑制剂处理小鼠及人类胰腺癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 17 | 2026-03-18 |
Equine endometrial organoids preserve tissue structure and cycle-stage transcriptional identity†
2026-Mar-16, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioaf232
PMID:41074771
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研究论文 | 本研究评估了马子宫内膜类器官在生殖周期阶段和长期培养中的结构和分子保真度 | 首次详细表征了马子宫内膜类器官,揭示了其保留组织结构和周期特异性转录特征的能力,并明确了长期培养中特征的衰减 | 类器官与原生组织在细胞组成(如纤毛细胞、增殖性腺体细胞、内皮细胞等代表性不足)和基因表达谱(如分化、血管生成和免疫反应相关基因表达较低)上存在差异,且周期特异性特征在长期培养中会减弱 | 评估马子宫内膜类器官作为研究模型的保真度和适用性 | 马子宫内膜类器官 | 组织工程与再生医学 | NA | 组织学、免疫组织化学、电子显微镜、bulk RNA测序、单细胞RNA测序 | 类器官模型 | 图像、转录组数据 | 从发情期和黄体期采集的活检组织生成的类器官 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2026-03-18 |
Decoding neurodegeneration one cell at a time
2026-Mar-16, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI199841
PMID:41837285
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综述 | 本文综述了单细胞基因组学技术如何推动对神经退行性疾病中神经元选择性脆弱性的分子理解 | 整合单细胞转录组学、表观基因组学和空间转录组学技术,系统揭示多种神经退行性疾病中神经元选择性脆弱性的分子机制 | 综述性文章,未涉及原始实验数据,技术应用仍处于发展阶段,因果机制验证需进一步研究 | 探讨单细胞基因组学技术在解析神经退行性疾病选择性神经元脆弱性分子基础中的应用 | 阿尔茨海默病、帕金森病、肌萎缩侧索硬化症、额颞叶痴呆和亨廷顿病中的神经元 | 单细胞组学 | 神经退行性疾病 | 单细胞转录组学、单细胞表观基因组学、空间转录组学、单细胞扰动筛选 | NA | 单细胞基因表达数据、表观遗传数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 19 | 2026-03-18 |
Characterization of intestinal immune responses in generalized human and murine lipodystrophy
2026-Mar-16, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI192322
PMID:41837291
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研究论文 | 本研究通过质谱流式细胞术和单细胞RNA-seq技术,探究了获得性全身性脂肪营养不良症(AGL)中肠道免疫反应的特征,并揭示了NRAS突变在克隆性T细胞扩增和肠道炎症中的作用 | 首次在AGL合并克罗恩病的患者中观察到外周和炎症肠道中T细胞的寡克隆扩增,并通过小鼠模型和基因测序发现NRAS突变是驱动克隆性T细胞扩增和肠道炎症的关键因素,而非脂肪组织缺失本身 | 研究仅基于一名患者和小鼠模型,样本量有限,且AGL的病因尚未完全阐明 | 探究脂肪组织缺失对肠道炎症的影响以及AGL中克隆性T细胞扩增的机制 | 获得性全身性脂肪营养不良症(AGL)患者和小鼠模型 | 免疫学 | 代谢性疾病 | 质谱流式细胞术, 单细胞RNA-seq, 基因测序 | NA | 单细胞数据, 基因序列数据 | 一名AGL合并克罗恩病的患者和一组脂肪营养不良小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2026-03-18 |
Integrated single-cell and spatial analysis reveals context-dependent myeloid-T cell interactions in response to immune checkpoint blockade in head and neck cancer
2026-Mar-16, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-2300
PMID:41837744
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间组学数据,系统评估了头颈癌患者在接受免疫检查点阻断治疗后的肿瘤浸润免疫细胞间的相互作用 | 结合Visium空间转录组学和CosMx SMI单细胞空间组学技术,首次在头颈癌中揭示了免疫检查点阻断响应者与非响应者之间髓系细胞与T细胞相互作用的上下文依赖性 | 样本量相对有限(23例患者的单细胞数据和8例患者的空间RNA-seq数据),且主要基于生物信息学分析,缺乏深入的实验验证 | 评估头颈癌患者免疫检查点阻断治疗后的肿瘤微环境中细胞间相互作用,以识别响应相关的生物标志物和治疗靶点 | 头颈鳞状细胞癌患者的肿瘤浸润免疫细胞 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | 单细胞RNA和蛋白质数据, 空间RNA-seq数据 | 23例患者的522,399个单细胞(RNA和蛋白质分析), 8例患者的空间RNA-seq数据 | 10x Genomics, NanoString | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞空间组学 | 10x Visium, CosMx SMI | Visium spot-based spatial transcriptomics, CosMx SMI single-cell spatial omics with 64-plex protein panel and 1000-gene RNA panel |