单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 42995 篇文献,本页显示第 1 - 20 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1 2026-09-03
Integrated multi-omics analyses identify an RAS-SLC11A2-associated molecular framework linking iron metabolism with PCOS-related cardiometabolic risk
2026-Dec-31, Clinical and experimental hypertension (New York, N.Y. : 1993)
研究论文 整合多组学分析识别出RAS-SLC11A2分子框架,将铁代谢与多囊卵巢综合征(PCOS)相关的心脏代谢风险联系起来 首次揭示RAS-SLC11A2轴在PCOS合并心脏代谢疾病中的共同分子机制,并提出龙胆苦苷作为潜在治疗药物 研究主要基于计算分析和体外实验,缺乏体内动物模型和临床试验验证 探讨肾素-血管紧张素系统与铁代谢轴在PCOS相关心脏代谢风险中的作用机制及治疗潜力 PCOS、高血压、非酒精性脂肪肝和2型糖尿病相关分子途径和细胞类型 多组学整合分析、机器学习 多囊卵巢综合征、心血管疾病、代谢性疾病 转录组学、单细胞RNA测序、孟德尔随机化、机器学习、分子对接、细胞功能实验 机器学习模型(具体类型未提及) 转录组数据、单细胞RNA数据、遗传关联数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
2 2026-09-03
PPRC1 is a prognostic biomarker and key regulator of mitochondrial oxidative phosphorylation in multiple myeloma
2026-12, Annals of medicine IF:4.9Q1
研究论文 本研究旨在探讨多发性骨髓瘤中PPRC1的临床和生物学意义,发现其作为预后生物标志物和线粒体氧化磷酸化的关键调节因子 首次揭示PPRC1在多发性骨髓瘤中作为独立预后因素,并通过功能实验证实其通过维持线粒体氧化磷酸化促进肿瘤生存,提出其作为潜在治疗靶点 研究主要基于公共数据库和本地队列,功能实验局限于体外细胞系,缺乏体内模型验证 评估PPRC1在多发性骨髓瘤中的预后价值及其对肿瘤代谢和生存的影响 多发性骨髓瘤患者样本和细胞系 数字病理学 多发性骨髓瘤 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, siRNA敲低 Cox回归模型, 列线图 基因表达数据, 临床数据, 单细胞数据 未明确样本数量,包含公共数据库和本地队列 NA 转录组测序, 单细胞转录组测序 NA NA
3 2026-09-03
Single-cell RNA sequencing provides further insights into the immunostimulatory action of freeze-dried Lactiplantibacillus plantarum on Penaeus vannamei shrimp
2026-Nov, Fish & shellfish immunology IF:4.1Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,探讨冻干植物乳杆菌对凡纳滨对虾免疫刺激作用的细胞机制。 首次在虾类中应用单细胞RNA测序来揭示益生菌免疫刺激的细胞水平机制,发现转录组变化不仅由基因表达改变驱动,还受细胞群体动态影响。 研究仅针对对虾鳃组织,可能未覆盖其他免疫相关组织;单细胞分析中细胞类型分辨率有限。 通过单细胞RNA测序,深入了解冻干植物乳杆菌喂养如何调节凡纳滨对虾的宿主免疫反应,揭示在批量RNA测序中可能被掩盖的机制。 凡纳滨对虾(Penaeus vannamei)的鳃组织细胞。 单细胞转录组学 对虾疾病(如副溶血性弧菌病和白斑综合征) 单细胞RNA测序 单细胞转录组数据 未明确样本量,但涉及对虾鳃组织样本。 NA 单细胞RNA测序 NA NA
4 2026-09-03
Dual role of fibroblasts in fibrous scar formation after spinal cord injury: Single-cell sequencing and experimental verification
2026-Nov-01, Neural regeneration research IF:5.9Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
5 2026-09-03
Decoding the spatiotemporal patterns of food spoilage microbial communities: Integrating multi-omics and artificial intelligence to enable precision preservation
2026-Oct-31, Food research international (Ottawa, Ont.)
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
6 2026-09-03
Pleural Fluid Cytology Detects Small Cell Carcinoma Transformation in EGFR-Mutant Lung Adenocarcinoma: A Case Report
2026-Oct, Diagnostic cytopathology IF:1.0Q4
病例报告 本文报告一例EGFR突变肺腺癌患者在接受埃克替尼治疗后发生恶性胸腔积液,通过胸水细胞学和分子检测诊断出小细胞癌转化,表明这种微创方法可用于监测EGFR-TKIs获得性耐药。 首次通过胸水细胞学结合分子检测(包括单细胞测序)确诊EGFR突变肺腺癌向小细胞癌的转化,提供了一种无需组织再活检的微创监测方法。 仅为一例报告,结果缺乏普遍性;单细胞测序的详细数据和临床随访信息未在摘要中提供。 探讨通过胸水细胞学检测EGFR突变肺腺癌向小细胞癌的转化,并验证其作为监测EGFR-TKIs耐药的非侵入性方法。 一名65岁EGFR突变肺腺癌女性患者及其胸腔积液样本。 数字病理学 肺癌 细胞学, 免疫组织化学, 分子检测, 单细胞测序 NA 细胞学图像, 免疫组化结果, 分子检测数据, 单细胞测序数据 1例患者的胸腔积液样本,其中细胞块用于免疫组化,并进行了分子检测和单细胞测序。 NA 单细胞测序 NA NA
7 2026-09-03
Decoding tumor immune microenvironment heterogeneity by single-cell and spatial multi-omics: From immunotherapy resistance to translational biomarkers
2026-Oct, Neoplasia (New York, N.Y.)
综述 本文综述了单细胞和空间多组学技术如何揭示肿瘤免疫微环境在免疫治疗耐药中的异质性,并探讨了新的转化生物标志物 提出免疫治疗生物标志物应从静态单一标记物转向纵向、空间分辨和可解释的多组学模型,以指导精准联合免疫治疗 未提及具体局限性 总结单细胞和空间多组学在免疫治疗耐药中重新定义肿瘤免疫微环境异质性的作用,并讨论用于患者分层的转化生物标志物 肿瘤免疫微环境中的免疫细胞、基质细胞及其空间生态位 数字病理学 癌症 单细胞组学、空间转录组学、空间蛋白质组学、成像技术 NA 图像、文本 NA NA 单细胞RNA测序、空间转录组学、空间蛋白质组学 NA NA
8 2026-09-03
Decoding chromosomal instability in neutrophil signature in the pathogenesis of periodontitis: evidence from artificial intelligence-driven multi-omics and in vitro validation
2026-Oct, Cytotechnology IF:2.0Q4
研究论文 利用人工智能驱动的多组学分析和体外验证,解码染色体不稳定性在中性粒细胞特征中对牙周炎发病机制的作用 首次在牙周炎中发现染色体不稳定性相关的共表达模式,并确定TFF3作为与促炎性中性粒细胞状态相关的候选中心基因 未提供明确的局限性信息 探索染色体不稳定性在牙周炎发病机制中的作用,并识别相关的诊断和治疗靶点 牙周炎患者和健康对照的牙龈组织 多组学分析、人工智能、机器学习 牙周炎 批量RNA测序、单细胞RNA测序、WGCNA、NMF、机器学习、SHAP分析、体外实验 机器学习框架 基因表达数据(批量RNA-seq和单细胞RNA-seq) 未明确说明样本数量 NA 批量RNA测序、单细胞RNA测序 NA NA
9 2026-09-03
Activation of sigma non-opioid intracellular receptor 1 (S1R) receptor inhibits plexin domain containing 2 (Plxdc2) driven microglial inflammation to ameliorate depressive-like behaviours in mice
2026-Oct, British journal of pharmacology IF:6.8Q1
研究论文 本文研究了S1R受体通过抑制Plxdc2驱动的神经炎症来缓解小鼠抑郁样行为的作用机制 首次将机器学习与单细胞转录组学结合,发现Plxdc2为抑郁中微胶质细胞功能异常的关键基因,并揭示S1R激活通过抑制Plxdc2介导的N-连接糖基化通路发挥抗抑郁作用 尚不明确Plxdc2在人类抑郁症中的具体作用,且实验仅在脂多糖模型和BV-2细胞系中进行,需要进一步临床验证 探索S1R受体如何调节抑郁症相关的神经炎症 小鼠抑郁模型、LPS刺激的BV-2细胞以及内侧前额叶皮层微胶质细胞 机器学习、单细胞转录组学、神经科学 抑郁症 单细胞RNA测序、机器学习、基因敲低和过表达技术 机器学习集成模型 单细胞转录组数据、行为学数据 不适用(实验涉及特定动物模型和细胞系) 不适用 单细胞RNA测序 不适用 不适用
10 2026-09-03
Polyamine metabolic reprogramming in ependymal cells promotes endogenous repair after spinal cord injury
2026-Oct-01, Neurobiology of disease IF:5.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和计算代谢分析,揭示了脊髓损伤后室管膜细胞内多胺代谢重编程促进内源性修复的机制 首次整合单细胞转录组与代谢分析,描绘了损伤反应性室管膜细胞的时间动态代谢重编程,并发现PLP依赖性ODC1介导的多胺代谢作为可操作的内源性脊髓再生靶点 未明确提及限制 阐明脊髓损伤后内源性室管膜细胞激活的代谢机制,并评估靶向多胺代谢促进再生的可行性 小鼠脊髓损伤模型中的室管膜细胞 神经科学、单细胞组学 脊髓损伤 单细胞RNA-seq、计算代谢分析、分子对接、分子动力学模拟 轨迹推断模型 单细胞基因表达数据、分子结构数据 小鼠脊髓损伤模型,具体样本数未明确提及 NA 单细胞RNA-seq NA NA
11 2026-09-03
Peripheral pain threshold, glycaemic status, and LAMP3 genetic variation: A community-based analysis
2026-Oct-01, Neurobiology of disease IF:5.1Q1
研究论文 本研究基于社区人群,探讨了外周疼痛阈值、血糖状态与LAMP3基因变异之间的关联 首次在社区人群中结合电刺激疼痛阈值测量、GWAS和单细胞RNA测序,揭示LAMP3基因变异与疼痛感知差异及神经免疫相互作用的潜在关联 遗传证据为提示性且机制数据为间接性,结果应视为探索性和假设生成性 探究外周疼痛阈值的临床、代谢和遗传决定因素,特别是LAMP3基因变异的作用 来自Iwaki健康促进项目2017的906名参与者,以及人类皮肤样本 基因组学、单细胞转录组学、神经科学 糖尿病多发性神经病变、疼痛感知异常 基因组关联分析、单细胞RNA测序、皮肤活组织检查 NA 基因型数据、电刺激疼痛阈值数据、单细胞转录组数据、皮肤组织学数据 906名参与者;皮肤样本来自尸检 NA 单细胞RNA测序 NA NA
12 2026-09-03
Single-cell spatial transcriptomics reveals rewiring of RPE and Müller glia signaling toward photoreceptors following outer segment disruption in Prph2C213Y mice
2026-Oct-01, Neurobiology of disease IF:5.1Q1
研究论文 本研究利用单细胞空间转录组学揭示了Prph2C213Y小鼠中感光细胞外节破坏后,视网膜色素上皮和Müller胶质细胞信号向感光细胞的重构 首次通过单细胞空间转录组学在Prph2突变小鼠模型中解析了视网膜色素上皮和Müller胶质细胞在感光细胞外节破坏后的信号重连,并识别出候选的治疗靶点 未提供明确的局限性信息 探究PRPH2突变引起的感光细胞外节破坏如何重塑周围视网膜,特别是视网膜色素上皮和Müller胶质细胞的反应 Prph2C213Y杂合小鼠模型的视网膜细胞 数字病理学 遗传性视网膜营养不良 单细胞空间转录组学 NA 基因表达数据 分别在1、3、6个月龄时使用独立年龄和性别匹配的队列 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium空间转录组学平台
13 2026-09-03
Machine learning of sunitinib resistance genes reveals that SP5 regulates angiogenesis and sunitinib resistance in RCC via the VEGFA/AKT axis
2026-Oct, Neoplasia (New York, N.Y.)
研究论文 本研究通过机器学习分析肾细胞癌中舒尼替尼耐药相关基因,发现SP5通过VEGFA/AKT轴调控血管生成和耐药性,并鉴定苏拉明为潜在抑制剂。 首次将SP5与肾细胞癌舒尼替尼耐药及血管生成联系起来,利用117种机器学习算法构建预后模型,并通过虚拟筛选发现苏拉明靶向SP5-VEGFA相互作用。 文章未提及局限性。 阐明肾细胞癌中舒尼替尼耐药的分子机制,并寻找潜在的治疗策略。 肾细胞癌患者样本及细胞系,包括GSE172165、GSE173572、GSE216494和GSE156632数据集,以及体外和异种移植模型。 机器学习 肾细胞癌 RNA-seq, 单细胞转录组, CUT&RUN, 分子对接 机器学习算法(包括117种,未指定具体类型) 基因表达数据, 单细胞数据, 影像数据(未明确) 多个独立队列的数据集(具体数量未提供) NA bulk RNA-seq, 单细胞转录组 NA NA
14 2026-09-03
Rbp-Jκ controls NK cell late maturation and migration via chromatin landscape remodeling
2026-Sep-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 该研究通过条件性敲除小鼠NK细胞中的Rbp-Jκ,结合多组学分析,揭示Rbp-Jκ通过染色质重塑调控NK细胞晚期成熟与组织迁移的功能与机制 首次揭示Rbp-Jκ通过直接结合并激活Klf2启动子,介导染色质重塑,在NK细胞晚期成熟及组织归巢中的关键调控作用,并发现其在NK细胞中的抑制激活与细胞毒功能却促进组织动员的新机制 研究主要基于小鼠模型,尚需在人类NK细胞中验证其保守性;且未详细阐明Rbp-Jκ如何协调染色质重塑导致基因表达变化的精细分子机制 阐明转录因子Rbp-Jκ在NK细胞成熟和迁移中的内在作用及其分子机制 小鼠自然杀伤细胞(NK细胞)及B16F10肺癌转移模型 免疫学, 分子生物学 肺癌(转移) 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 单细胞ATAC测序(scATAC-seq), 批量ATAC测序(bulk ATAC-seq), CUT&Tag, ChIP-qPCR 条件性基因敲除小鼠模型 基因表达及染色质开放性数据(单细胞及批量) 小鼠NK细胞(具体数量未在摘要中说明) 10x Genomics 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 批量ATAC测序 10x Chromium 用于单细胞RNA和ATAC测序,详细信息未在摘要中给出
15 2026-09-03
JUN Specifies the Local Differentiation and Maintenance of Pro-tumoral Monocyte-Derived Macrophages
2026-Sep-02, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本研究确定了AP-1转录因子JUN在单核细胞来源的肿瘤相关巨噬细胞分化与维持中的作用,并指定前肿瘤营养功能,为癌症治疗提供新靶点 首次明确JUN在单核细胞来源的肿瘤相关巨噬细胞分化和维持中的特定作用,以及其在前肿瘤营养功能中的指定作用,而免疫调节功能则JUN独立,为选择性靶向TAM治疗提供可能 未提及具体局限性,可能涉及研究仅限于特定模型或需进一步验证 阐明JUN在肿瘤相关巨噬细胞亚型分化中的作用及其对肿瘤发展的影响 肿瘤相关巨噬细胞,特别是单核细胞来源的巨噬细胞和常驻组织巨噬细胞 转录组学 癌症 单细胞转录组学 NA 单细胞转录组数据 未提供具体样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
16 2026-09-03
Coordinated Immune Activation Following KRAS Inhibition in Syngeneic Models Reveals Molecular Pathways that Potentiate and Limit Antitumor Immunity
2026-Sep-02, Cancer immunology research IF:8.1Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序、流式细胞术和空间转录组学等方法,比较了KRAS G12C抑制和MEK抑制在同基因肿瘤模型中的作用机制,揭示了不同的肿瘤细胞命运和免疫激活途径,并探讨了联合PD-1免疫治疗的效果 首次区分KRAS G12C抑制和MEK抑制在肿瘤微环境中引发的不同免疫机制,发现KRAS G12C抑制诱导特异性的cDC1驱动的成熟树突状细胞状态,而联合抗PD-1治疗可进一步增强效应T细胞状态和促炎巨噬细胞反应 研究基于同基因小鼠模型,可能无法完全代表人类肿瘤微环境的复杂性,且未涉及KRAS抑制后肿瘤耐药机制的深入探究 探究KRAS G12C抑制或MEK抑制在肿瘤内驱动的变化,并识别可增强抗肿瘤免疫的分子通路,以最大化治疗效果 同基因肿瘤模型中的肿瘤细胞、树突状细胞亚群、细胞毒性T细胞、巨噬细胞等免疫细胞以及肿瘤微环境 数字病理学 癌症 单细胞RNA测序、流式细胞术、空间转录组学 NA 单细胞表达数据、空间转录组数据、流式细胞术数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序、空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞3',10x Visium空间转录组学
17 2026-09-03
Cancer-Intrinsic Protein Neddylation Modulates the Intratumoral Immune Landscape to Constrain Immune Checkpoint Blockade Therapy
2026-Sep-02, Cancer immunology research IF:8.1Q1
研究论文 本研究揭示了癌细胞内在的蛋白质类泛素化修饰通过调节肿瘤内免疫景观来限制免疫检查点阻断疗法的疗效,并提出了增强免疫治疗的新策略 首次发现癌细胞中NEDD8表达与PD-1阻断治疗反应负相关,并通过遗传消融和药物筛选证明抑制蛋白质类泛素化可增强免疫治疗效果 未提及具体局限性 探索癌细胞内在的蛋白质类泛素化网络对免疫检查点阻断疗法反应的影响及其机制 乳腺癌患者、小鼠肿瘤模型、人乳腺癌细胞系 癌症免疫学 乳腺癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 基因敲除, 高内涵筛选 NA 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 影像数据 乳腺癌患者(具体人数未提供), 小鼠肿瘤模型(未提供具体数量), 人乳腺癌细胞系(未提供具体数量) 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium用于单细胞RNA测序, 10x Visium用于空间转录组;具体配置未提供
18 2026-09-03
Multinucleated Giant Cells in Human Pancreatic Cancer Are a Distinct Macrophage Population Undergoing a DNA Damage Response and Associated with an Aggressive Tumor Microenvironment
2026-Sep-02, Cancer immunology research IF:8.1Q1
研究论文 本研究在胰腺导管腺癌(PDAC)中发现了一类源于巨噬细胞的多核巨细胞(MGC),其特征为缺乏典型极化标志物且具有独特的转录程序,并与侵袭性肿瘤微环境及较差预后相关 首次在胰腺癌中系统鉴定并表征了巨噬细胞来源的多核巨细胞(MGC)群体,揭示了其独特的转录特征、DNA损伤反应状态及与缺氧和应激信号的关系 未在结论中明确指出局限性,但可能包括样本来源单一(单机构队列)、需要进一步的功能验证等 阐明胰腺导管腺癌中巨噬细胞异质性,特别是多核巨细胞(MGC)的生物学特征及其与肿瘤微环境和预后的关联 145例PDAC组织标本中的巨噬细胞来源的多核巨细胞(MGC) 数字病理学 胰腺癌 空间转录组学、定量成像、免疫荧光、形态计量学 NA 组织切片图像、空间转录组数据、临床数据 145例PDAC组织标本,其中28%含有MGC NA 空间转录组学 NA NA
19 2026-09-03
VISTA+ Neutrophils Contribute to Platinum Resistance by Suppressing CD8+ T Cells in High-Grade Serous Ovarian Cancer
2026-Sep-02, Cancer immunology research IF:8.1Q1
研究论文 本研究通过回顾性分析、免疫组化、蛋白质组学和单细胞RNA测序,发现VISTA+中性粒细胞亚群通过抑制CD8+ T细胞促进高级别浆液性卵巢癌的铂耐药。 首次鉴定出VISTA+中性粒细胞作为免疫抑制亚群,与铂耐药和CD8+ T细胞抑制相关,并验证了抗VISTA联合顺铂的疗效。 未明确提及局限性。 探究高NLR与铂耐药关联的生物学基础,并评估VISTA+中性粒细胞作为治疗靶点和生物标志物的潜力。 高级别浆液性卵巢癌患者的肿瘤样本和小鼠模型。 数字病理学 卵巢癌 单细胞RNA测序, 免疫组化, 蛋白质组学 免疫活性小鼠模型 图像, 文本, 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据 434例患者样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
20 2026-09-03
The Impact of Low-Protein Diet on the Molecular and Cellular Development of the Fetal Kidney
2026-Sep-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN IF:10.3Q1
研究论文 本研究探讨母体低蛋白饮食对胎儿肾脏分子和细胞发育的影响,发现其通过损害肾单位祖细胞承诺和改变分支形态发生来减少肾单位数量 利用单细胞RNA测序结合断层和共聚焦成像,全面解析低蛋白饮食对肾脏发育过程中细胞和分子过程的影响 未提供明确的局限性信息 阐明母体低蛋白饮食如何影响肾单位形成过程中的细胞和分子机制,从而减少肾单位 endowment 胎儿肾脏发育过程中的肾单位祖细胞、输尿管尖端细胞及肾源性微环境 发育生物学 慢性肾脏病 单细胞RNA测序、光学投影断层扫描、共聚焦显微镜 NA 图像数据、单细胞转录组数据 胎鼠和成年鼠肾脏样本(具体数量未提供) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
回到顶部