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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1 2026-07-15
A Porcine Model of Intervertebral Disc Injury Recapitulates Human Discogenic Pain Via Notochordal Cell Loss and Pain-Inducing Nucleus Pulposus Cell Emergence
2026-Sep, JOR spine IF:3.4Q1
研究论文 通过猪模型研究椎间盘损伤引发的椎间盘源性疼痛,并验证其与人类病理的关联 首次在猪模型中结合MRI、生物行为测试和多组学分析全面量化椎间盘源性疼痛,并发现脊索细胞向髓核细胞分化与疼痛机制相关 猪模型中脊索细胞持续存在与人类不同,可能影响疼痛模型的直接转化性 建立猪椎间盘损伤模型的疼痛量化方法并验证其与人类椎间盘源性疼痛的相关性 猪的椎间盘和背根神经节组织 NA 椎间盘源性疼痛 单细胞转录组学、轨迹分析、细胞间通讯分析 NA 多组学数据(转录组、单细胞转录组)、MRI图像、行为测试数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
2 2026-07-15
A systematic benchmark of bioinformatics methods for single-cell and spatial RNA-seq nanopore long reads data
2026-Sep, NAR genomics and bioinformatics IF:4.0Q1
研究论文 针对单细胞和空间长读RNA-seq数据,系统评估了十种生物信息学方法的性能 首次通过配对短读和纳米孔长读单细胞数据集,全面比较了条形码/UMI检测、解复用、基因表达谱分析和异构体检测等四个分析维度的工具性能 未提及长期稳定性评估或不同平台间通用性分析 评估和比较用于单细胞和空间长读转录组数据处理的生物信息学方法 十种现有最先进的生物信息学方法,包括条形码/UMI检测、解复用、基因表达分析和异构体检测工具 计算生物学 无特定疾病 纳米孔长读测序 NA RNA测序数据(包含短读和长读) 实验和模拟数据集,包含不同协议、测序深度和化学试剂条件下的样本 Oxford Nanopore Technologies 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 Nanopore 使用配对短读和纳米孔长读数据集,具体配置未详细说明
3 2026-07-15
Enhancing glioma immunotherapy by disrupting RBP-J-mediated NNMT signaling in tumor microenvironment
2026-Aug, Oncogene IF:6.9Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学,揭示了转录因子RBP-J通过激活CAFs中的NNMT信号驱动胶质瘤免疫逃逸的机制 首次发现RBP-J/NNMT/SAA3轴作为胶质瘤微环境中基质驱动的免疫逃逸关键通路,并证实靶向该通路可增强免疫治疗效果 NA 揭示胶质瘤免疫微环境中基质细胞介导的免疫逃逸机制 胶质瘤微环境中的癌相关成纤维细胞(CAFs)和免疫细胞 数字病理学 胶质瘤 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
4 2026-07-15
Decoding the complexity of intestinal immunity with spatial transcriptomics
2026-Aug, Current opinion in immunology IF:6.6Q1
综述 本文综述了空间转录组学在解析肠道免疫复杂性中的应用,讨论了该技术的适用性、关键发现、互补技术、当前挑战及未来机遇 首次系统综述了空间转录组学在肠道免疫研究中的多方面应用,包括其与传统技术的对比和未来发展方向 当前空间转录组学技术仍面临分辨率、成本和数据分析挑战,且与肠道免疫微环境的深度整合有待进一步探索 评估空间转录组学在肠道免疫系统研究中的适用性,总结关键发现,并展望未来应用 肠道免疫系统及其与肠道微环境的相互作用 自然语言处理 NA 空间转录组学 NA 基因表达数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
5 2026-07-15
New learnings from the molecular pathology of the synovial tissue in rheumatoid arthritis: from pathogenesis to therapeutic targeting toward precision medicine
2026-Aug, Current opinion in immunology IF:6.6Q1
综述 本文综述了类风湿关节炎滑膜组织分子病理学的新发现,从发病机制到治疗靶向,推动精准医学发展 通过单细胞RNA测序和质谱流式细胞术揭示滑膜组织异质性,识别新的致病细胞亚群和炎症互作网络,为治疗反应预测和新靶点开发提供创新见解 该领域仍处于早期阶段,滑膜多组学与临床数据的整合及人工智能应用尚需进一步发展 探讨滑膜组织分子病理学在类风湿关节炎精准医学中的作用,包括疾病分层、治疗预测和靶向治疗开发 类风湿关节炎患者的滑膜组织及其细胞和分子特征 机器学习 类风湿关节炎 单细胞RNA测序,质谱流式细胞术 NA 图像,文本 NA NA 单细胞RNA测序,质谱流式细胞术 NA NA
6 2026-07-15
Spatial omics of immunity: Mapping cellular landscapes in tissue microenvironments
2026-Aug, Current opinion in immunology IF:6.6Q1
综述 本文综述了用于解析肿瘤微环境中免疫细胞空间组织的多种空间组学技术 系统总结了高分辨率空间转录组学和蛋白质组学技术在组织免疫研究中的最新进展,包括计算工具创新及可视化数据解读方法 当前空间分子分析技术在分辨率和分析复杂性上存在技术限制,且跨平台数据缺乏标准化影响结果的可重复性和可比性 旨在通过空间分子图谱技术深入理解肿瘤微环境中的免疫细胞组织、功能及细胞间相互作用 肿瘤微环境中的免疫细胞及其空间组织、细胞间相互作用 数字病理学 肿瘤微环境相关疾病(泛癌种) 空间转录组学、空间蛋白质组学、多组学整合分析 NA RNA表达数据、蛋白质表达数据 NA NA 空间转录组学, 空间蛋白质组学 NA NA
7 2026-07-15
Microplastic Exposure Aggravates Cardiomyopathy Under Hemodynamic Stress Through the Gut-Heart Axis
2026-Jul-14, Circulation IF:35.5Q1
研究论文 该研究揭示双酚F(BPF)通过肠道微生物代谢产生的N-乙酰腐胺(NAP)引起心肌肥厚和肠道屏障损伤的机制 首次发现肠道微生物在BPF诱导心脏毒性中的关键作用,并阐明了一条新的肠-心轴通路:色醇/Sat1-NAP通路 NA 研究BPF对心血管系统和肠道屏障的毒性作用及其机制 BPF对小鼠和人类的心血管及肠道系统的影响 数字病理学 心血管疾病 单细胞测序, 代谢组学, 空间代谢组学 NA 测序数据, 代谢组数据 285份人类尿液样本及小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
8 2026-07-15
Multi-omics Mendelian randomization and experimental validation identify PRKAB1 as a regulator of phosphatidylcholine metabolism in IBD
2026-Jul-14, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
研究论文 整合多组学孟德尔随机化与实验验证,揭示PRKAB1在炎症性肠病中调控磷脂酰胆碱代谢的作用 首次通过多组学定量性状位点分析与孟德尔随机化相结合,鉴定PRKAB1为IBD中磷脂酰胆碱代谢的关键调控因子,并通过敲低实验验证其功能 未在独立的队列中验证PRKAB1的因果关系,且药物预测缺乏体内实验验证 探索磷脂酰胆碱代谢相关基因与炎症性肠病的因果遗传关联 磷脂酰胆碱代谢相关基因(PRKAB1等)及78种脂质物种 机器学习 炎症性肠病 孟德尔随机化、多组学QTL分析、单细胞RNA测序、基因敲低实验、分子对接 NA 多组学数据(DNA甲基化、基因表达、蛋白质丰度)、单细胞RNA测序数据 FinnGen研究和IBD Genetics Consortium的数据集,包含78种脂质物种 Illumina, 10x Genomics 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 Illumina NovaSeq, 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞RNA测序,Illumina NovaSeq用于批量测序
9 2026-07-15
Multi-omics machine learning-driven investigation of super-enhancers signatures and prognostic biomarkers in lung adenocarcinoma
2026-Jul-14, Functional & integrative genomics IF:3.9Q1
研究论文 通过多组学与机器学习结合的方法,探索肺腺癌中超级增强子特征及预后生物标志物 首次整合批量、单细胞和空间转录组学数据,结合10种聚类算法识别肺腺癌中超增强子相关分子亚型,并构建基于超增强子相关基因的风险评分预后模型 未提及具体限制 揭示肺腺癌中超级增强子的促肿瘤和肿瘤微环境调控特征,建立分子分型和预后模型 肺腺癌患者的肿瘤组织样本及体外细胞实验 机器学习 肺癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 Lasso + StepCox算法 批量转录组, 单细胞转录组, 空间转录组数据 涉及肺腺癌患者样本(具体数量未提及) 未提及 bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 未提及 未提及
10 2026-07-15
Adenosine-A Regulator of Human Testicular Peritubular Cells
2026-Jul-14, Andrology IF:3.2Q1
研究论文 研究了腺苷对人睾丸周管细胞(HTPCs)的调控作用,发现腺苷通过受体介导的信号通路影响细胞功能 首次揭示腺苷通过ADORA2B受体上调IL33和StAR蛋白,并发现其诱导类固醇生成和炎症信号,拓展了对睾丸嘌呤信号系统的认知 结果基于体外细胞实验,可能无法完全反映体内实际情况;未明确腺苷在体内对男性生育功能的直接生理影响 探究腺苷对人睾丸周管细胞的调控机制及其生理功能 人睾丸周管细胞(HTPCs) 数字病理学 男性不育症 单细胞RNA测序、蛋白质组学、qPCR NA 基因表达数据、蛋白质组数据 睾丸组织样本来源的HTPCs细胞系 NA 单细胞RNA测序 NA NA
11 2026-07-15
Single-Cell and Spatial Analysis Reveal the Differences Between Left-Sided and Right-Sided Colorectal Cancer
2026-Jul-14, Cell proliferation IF:5.9Q2
研究论文 通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示左右侧结直肠癌的分子差异 首次利用单细胞和空间分析技术系统揭示左右侧结直肠癌的特异性免疫微环境差异,包括右侧肿瘤中增强的生发中心B细胞浸润和CXCL13 T细胞富集,以及左侧肿瘤中血管生成和代谢重编程相关的基质-上皮相互作用 NA 解析左右侧结直肠癌的分子和免疫微环境差异,为精准治疗策略提供依据 左右侧结直肠癌组织样本 计算机视觉 结直肠癌 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA 基因表达数据,空间转录组数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间基因表达
12 2026-07-15
African swine fever virus MGF_110-3L and MGF_110-4L signal TLR2-mediated lethal inflammation
2026-Jul-14, Protein & cell IF:13.6Q1
研究论文 揭示非洲猪瘟病毒MGF_110-3L和MGF_110-4L通过TLR2介导致命性炎症的机制 首次发现ASFV编码的MGF_110-3L和MGF_110-4L为分泌型毒力因子,通过结合TLR2并激活MyD88依赖性NF-κB信号通路诱导细胞因子风暴和免疫病理 未提及具体局限性,但可能包括体外模型与体内炎症过程的差异以及样本规模对结果普适性的影响 探究ASFV中导致系统性炎症的病毒因子及其分子机制 非洲猪瘟病毒MGF_110-3L和MGF_110-4L蛋白,及猪外周血单核细胞 分子生物学 非洲猪瘟 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 猪外周血单核细胞样本 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
13 2026-07-15
Single-cell analysis of Powassan virus-infected brains reveals age-dependent neuroinflammatory crosstalk and progressive Alzheimer's-like APP/Aβ accumulation
2026-Jul-14, mBio IF:5.1Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析波瓦桑病毒感染小鼠大脑,揭示年龄依赖性神经炎症交互作用及进行性阿尔茨海默样APP/Aβ积累 首次在单细胞水平阐明波瓦桑病毒触发的年龄依赖性胶质细胞反应和Trem2-ApoE轴相关疾病相关小胶质细胞转录程序,并发现病毒诱导的进行性APP/Aβ积累与阿尔茨海默病病理特征相似 基于小鼠模型,结果可能不完全反映人类疾病复杂性;APP/Aβ积累在幸存者中的长期影响未详细探讨 探究波瓦桑病毒导致年龄依赖性致死和长期神经后遗症的细胞机制 年轻(10周龄)和老龄(50周龄)C57BL/6小鼠的大脑细胞对波瓦桑病毒LI9株的应答 单细胞转录组学 脑炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 年轻和老龄小鼠各一组,每组具体数量未明确 NA 单细胞RNA测序 NA NA
14 2026-07-15
High-Risk Rhabdomyosarcomas Feature a Convergent Cell State
2026-Jul-14, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 该论文通过单细胞转录组学等技术发现高危横纹肌肉瘤的癌细胞无论FOXO1融合状态如何,均会汇聚到一个共同的细胞状态,并表现出神经特征 首次发现高危横纹肌肉瘤存在超越传统分子和组织学边界的汇聚性细胞状态,并揭示该状态表现出神经特征 摘要中未提及局限性 研究高危横纹肌肉瘤的细胞状态特征及其与FOXO1融合状态的关系 高危横纹肌肉瘤的癌细胞 数字病理学 横纹肌肉瘤 单细胞转录组测序、核转录组学、染色质可及性分析、空间转录组学、扰动研究 未提及 单细胞转录组数据、核转录组数据、染色质可及性数据、空间转录组数据 未提及具体样本数量 未提及 单细胞RNA测序、空间转录组学 未提及 未提及
15 2026-07-15
Concurrent genetic and non-genetic resistance mechanisms to KRAS inhibition in colorectal cancer
2026-Jul-13, Cancer cell IF:48.8Q1
研究论文 该研究利用靶向外显子测序和空间转录组学技术,探究结直肠癌患者对KRAS抑制剂与EGFR抑制剂联合治疗产生耐药性的遗传与非遗传机制 首次在患者匹配的结直肠癌活检样本中,结合靶向外显子测序与空间转录组学,揭示KRAS抑制剂耐药过程中遗传事件与转录适应状态共存,并发现TBK1可作为克服耐药的新靶点 未明确说明具体局限性 阐明结直肠癌对KRAS抑制剂产生耐药性的遗传与非遗传机制 结直肠癌患者活检样本、人类和小鼠类器官模型 数字病理学 结直肠癌 靶向外显子测序、空间转录组学 NA 测序数据、空间转录组数据 患者匹配的结直肠癌活检样本 NA 空间转录组学 NA NA
16 2026-07-15
Hypoxia shapes both therapeutic response and resistance in metastatic clear cell renal cell carcinoma
2026-Jul-13, Cancer cell IF:48.8Q1
研究论文 研究低氧在转移性透明细胞肾细胞癌中如何同时塑造治疗反应和耐药性 鉴定出低氧响应的SPP1肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)作为治疗反应和耐药性的双重标志,揭示低氧在VEGFR-TKI/aPD-1治疗中的双面作用 主要基于小鼠模型,人类数据来自队列分析,需要进一步验证低氧机制在临床中的应用 探究VEGFR-TKI和aPD-1联合治疗下肿瘤微环境演变及低氧在ccRCC治疗反应与耐药中的作用 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)肿瘤微环境中的巨噬细胞和低氧状态 生物信息学, 癌症免疫学 透明细胞肾细胞癌(ccRCC) 单细胞RNA测序, 成像质谱流式 NA 单细胞转录组数据, 成像数据 包含转基因ccRCC小鼠模型以及人类治疗队列样本,具体数量未指定 NA 单细胞RNA测序, 成像质谱流式 NA NA
17 2026-07-15
Pathogenesis of diffuse large B cell lymphoma proteogenotypes
2026-Jul-13, Cancer cell IF:48.8Q1
研究论文 通过整合蛋白质组、转录组和基因组数据,识别出弥漫性大B细胞淋巴瘤的七种蛋白质基因组型,揭示其病理生理特征 首次基于蛋白质组学数据对DLBCL进行分子分型,发现与预后不良相关的新亚型PG4,并揭示其独特的肿瘤微环境特征 未明确说明研究局限性,但蛋白质组学数据的覆盖深度和样本量可能限制某些罕见亚型的发现 解析弥漫性大B细胞淋巴瘤的临床和分子异质性,为诊断和治疗提供蛋白质基因组学框架 478例弥漫性大B细胞淋巴瘤肿瘤样本 数字病理学 弥漫性大B细胞淋巴瘤 蛋白质组学、转录组学、基因组学、单细胞测序、空间转录组学 NA 蛋白质组、转录组、基因组、单细胞、空间转录组数据 478例DLBCL肿瘤样本 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
18 2026-07-15
Construction and multi-omics validation of a five-gene ferroptosis-based model for predicting prognosis and therapy response in pancreatic ductal adenocarcinoma with immune landscape analysis
2026-Jul-13, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 构建了一个基于铁死亡的5基因预后模型,并在胰腺导管腺癌中进行了多组学验证,结合免疫景观分析预测预后和治疗反应 首次结合铁死亡相关基因与多组学分析(包括单细胞RNA测序、空间转录组学和免疫浸润分析)构建胰腺导管腺癌的预后模型,并验证了其与免疫逃逸和药物反应的关联 模型基于公开数据集,可能受样本异质性影响,且铁死亡相关基因的功能机制尚未完全阐明 建立基于铁死亡相关基因的预后模型,评估其在胰腺导管腺癌中的临床意义和治疗反应预测能力 胰腺导管腺癌患者样本及其转录组数据、单细胞RNA测序数据和空间转录组数据 机器学习 胰腺导管腺癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 Cox回归模型(单变量、LASSO、多变量) 基因表达数据 TCGA-PDAC队列、GTEx数据、GEO数据集(GSE62452、GSE78229、GSE183795、GSE212966)和空间转录组样本GSM8452850 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
19 2026-07-15
A machine learning-guided epithelial plasticity score refines prognostication and immune-context stratification in muscle-invasive bladder cancer
2026-Jul-13, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 开发了基于机器学习的上皮可塑性评分(EPRS)用于改善肌层浸润性膀胱癌的预后评估和免疫微环境分层 首次通过整合机器学习策略和连续可塑性指数,构建了可塑性相关风险评分,揭示了基底-腔上皮可塑性轴与基质-免疫重塑的关联 未提及外部验证队列的种族多样性及潜在选择偏倚 开发并验证一个基于上皮可塑性的风险评分,以改善MIBC患者的预后分层和免疫特征理解 肌层浸润性膀胱癌(MIBC)患者样本 机器学习 膀胱癌 RNA-seq, 单细胞RNA测序 Ridge回归模型 转录组数据 368例TCGA-MIBC原发性病例 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
20 2026-07-15
Sustained AMPAR expression in CA3 neurons may mediate neuroprotection following FLASH-RT
2026-Jul-13, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 通过空间转录组学揭示FLASH放疗对正常脑组织长期神经保护作用的早期机制,发现CA3神经元中AMPAR持续表达可能介导神经保护 首次利用空间转录组学技术分析FLASH放疗后海马CA3区和齿状回神经元的早期转录特征,发现Gria基因上调及AMPAR蛋白持续表达与长期认知保护相关 仅基于小鼠模型,需进一步验证人类脑组织中的机制 阐明FLASH放疗在正常脑组织中产生长期神经保护效应的早期分子机制 C57BL/6J小鼠的海马CA3区和齿状回神经元及神经祖细胞 机器学习 神经退行性疾病 空间转录组学 NA 转录组数据 C57BL/6J小鼠全脑照射后样本,涉及1或3次10 Gy照射的不同剂量率组 Nanostring 空间转录组学 Nanostring空间转录组学平台 Nanostring空间转录组学分析
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