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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-04-30 |
Integrating bulk and single-cell transcriptomic data to construct a risk model for histidine metabolism-related epithelial cell features in lung adenocarcinoma, predicting prognosis and immune landscape
2026-Dec-31, RNA biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/15476286.2026.2662721
PMID:42003422
|
研究论文 | 整合批量与单细胞转录组数据,构建与组氨酸代谢相关上皮细胞特征的风险模型,用于预测肺腺癌预后和免疫微环境 | 首次将组氨酸代谢相关的上皮细胞特异性基因与肺腺癌预后风险模型结合,通过单细胞和批量RNA-seq数据整合识别关键效应细胞群体 | 未提供具体限制信息 | 探讨组氨酸代谢在肺腺癌发病机制中的作用,并构建预后风险模型 | 肺腺癌患者 | 机器学习 | 肺癌 | RNA-seq | Cox比例风险模型, LASSO回归 | 转录组数据(批量与单细胞RNA-seq) | 未提供具体样本数量 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2026-04-30 |
3C suppresses PINK1-mediated mitophagy and contributes to coxsackievirus B3 replication
2026-Dec, Virulence
IF:5.5Q1
DOI:10.1080/21505594.2026.2662767
PMID:42035472
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研究论文 | 揭示柯萨奇病毒B3非结构蛋白3C通过抑制PINK1介导的线粒体自噬促进病毒复制的机制 | 首次发现转录因子FOSL1作为PINK1转录的负调控因子,并阐明3C/FOSL1/PINK1/MAVS信号轴在病毒性心肌炎发病机制中的关键作用 | 未提及具体限制 | 研究柯萨奇病毒B3如何通过抑制PINK1介导的线粒体自噬促进病毒复制 | 柯萨奇病毒B3感染的心肌细胞和小鼠模型 | 数字病理学 | 病毒性心肌炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2026-04-30 |
T cells in antibody-associated CNS autoimmunity: a mechanistic approach across autoimmune encephalitis and paraneoplastic disorders
2026-Jun-01, Current opinion in neurology
IF:4.1Q2
DOI:10.1097/WCO.0000000000001492
PMID:41982079
|
综述 | 本文综述了T细胞在抗体相关中枢神经系统自身免疫性疾病(包括自身免疫性脑炎、副肿瘤神经综合征和胶质细胞抗体介导的疾病)中的作用机制,重点关注循环衰竭型辅助T细胞记忆、鞘内T-B细胞协作和实质组织驻留细胞毒性三个维度 | 从T细胞免疫的三个新兴维度(循环衰竭型辅助T细胞记忆、鞘内T-B协作、实质组织驻留细胞毒性)系统解析传统抗体分类的自身免疫性疾病的临床病理特征,为理解临床悖论和治疗策略提供新框架 | 未提供具体的实验数据或临床试验结果,主要基于现有文献综述 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4 | 2026-04-30 |
Tet2 deficiency alters CD4+ T cell function and promotes T cell lymphoma with a TFH cell immunophenotype
2026-Jun-01, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20250194
PMID:42047684
|
研究论文 | 研究表明Tet2缺失导致CD4+ T细胞功能改变并促进具有滤泡辅助性T细胞免疫表型的T细胞淋巴瘤发展 | 首次揭示Tet2缺失通过表观遗传重编程驱动TFH样T细胞淋巴瘤的机制 | 未明确TET2突变以外的表观遗传改变在淋巴瘤转化中的作用 | 研究TET2突变如何通过表观遗传失调启动恶性T细胞转化 | Tet2基因敲除小鼠(Cd4cre;Tet2FL/FL)和人CD4+ T细胞 | 机器学习 | T细胞淋巴瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 表观遗传学分析 | 基因敲除小鼠模型, 异种移植模型 | 转录组数据, 表观基因组数据, 单细胞转录组数据 | Tet2-/-小鼠和TET2-KO人CD4+ T细胞样本 | Illumina | 单细胞RNA-seq, 表观遗传学分析 | Illumina NovaSeq | NA |
| 5 | 2026-04-30 |
Protectin D1/GPR37 Signaling Enhances Macrophage-Dependent Efferocytosis to Attenuate Experimental Abdominal Aortic Aneurysm Formation
2026-May-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202600063R
PMID:42048112
|
研究论文 | 该研究探讨了Protectin D1通过GPR37信号增强巨噬细胞介导的胞葬作用,从而减轻实验性腹主动脉瘤形成 | 首次揭示Protectin D1/GPR37信号通路通过增强巨噬细胞胞葬作用来促进炎症消退,从而减缓腹主动脉瘤进展并防止主动脉破裂 | 该研究基于小鼠模型和人类组织样本,未在临床试验中验证,且具体机制还需进一步探索 | 研究Protectin D1通过GPR37信号对巨噬细胞的免疫调节作用,以减轻腹主动脉瘤进展和防止主动脉破裂 | 人类腹主动脉瘤组织和小鼠模型(包括弹力蛋白酶诱导的AAA模型和弹力蛋白酶+BAPN主动脉破裂模型)的巨噬细胞、血管平滑肌细胞和主动脉组织 | 机器学习 | 腹主动脉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | 人类组织样本(AAA及对照主动脉组织)和小鼠模型(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6 | 2026-04-30 |
Integrated analysis of scRNA-seq and bulk RNA-seq identifies matrisome-related biomarkers for prognostic stratification and immune landscape in lung adenocarcinoma
2026-May-01, The Korean journal of physiology & pharmacology : official journal of the Korean Physiological Society and the Korean Society of Pharmacology
DOI:10.4196/kjpp.25.293
PMID:41496514
|
研究论文 | 整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,鉴定与基质体相关的生物标志物,用于肺腺癌的预后分层和免疫景观分析 | 首次构建基于7个基质体相关基因的风险模型,结合单细胞和批量转录组数据揭示肿瘤微环境中的细胞通信和免疫特征 | NA | 探索基质体相关基因在肺腺癌中的预后价值及其与免疫微环境的关系 | 肺腺癌患者的转录组和临床数据,包括TCGA、GEO(GSE31210)和单细胞数据(GSE189357) | 计算机视觉, 自然语言处理, 机器学习, 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | LASSO-Cox回归模型 | 基因表达数据, 单细胞数据, 临床数据 | NA | NA | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7 | 2026-04-30 |
Acinar Metaplastic Cells Generate Semi-Homogeneous Niches and Interact With Immune Cells
2026-May, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2025.12.014
PMID:41758082
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析,揭示了胰腺腺泡化生细胞的非随机分布及其与免疫细胞的互作机制 | 首次发现化生细胞在病灶中呈非随机分布模式,并鉴定出特定化生细胞亚型与免疫抑制性中性粒细胞和巨噬细胞的近距离互作 | 未提及具体技术或样本量限制 | 探究腺泡化生细胞在胰腺癌前病变中的空间分布、细胞间互作及其与免疫细胞的交互作用 | 小鼠和人胰腺样本中的腺泡化生细胞及其与基质细胞和免疫细胞的相互作用 | 数字病理学 | 胰腺导管腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、苏木精-伊红染色 | NA | 基因表达数据、图像 | 小鼠和人胰腺样本(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 8 | 2026-04-30 |
Activation of the Integrin αV-YAP-CTGF Axis in Liver Sinusoidal Endothelial Cells Promotes Liver Fibrogenesis, Leading to Portal Hypertension and Liver Carcinogenesis in Congestive Hepatopathy
2026-May, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2025.11.014
PMID:41758081
|
研究论文 | 该研究揭示了肝脏血窦内皮细胞中整合素αV-YAP-CTGF轴在充血性肝病中促进肝纤维化、门静脉高压和肝癌发生的机制 | 首次阐明充血性肝病中肝脏血窦内皮细胞通过整合素αV-YAP-CTGF轴驱动肝纤维化、门静脉高压和肝癌发生的关键机制 | 研究主要基于小鼠模型和临床样本的关联分析,机制验证主要局限于体外和动物实验,临床应用前景尚需进一步验证 | 阐明充血性肝病中肝脏血窦内皮细胞介导的肝纤维化机制 | 小鼠肝脏血窦内皮细胞及人Fontan相关肝病患者的肝脏组织 | 机器学习 | 肝病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型与人Fontan相关肝病患者样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 10x Chromium,10x Visium | 10x Chromium单细胞RNA测序,10x Visium空间转录组学 |
| 9 | 2026-04-30 |
Multi-Transcriptomic Analysis Reveals That EREG-Driven TME Crosstalk Defines Anti-EGFR Response in Colorectal Cancer
2026-May, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.71853
PMID:42043480
|
研究论文 | 通过多转录组分析揭示EREG驱动的肿瘤微环境串扰决定结直肠癌对抗EGFR治疗的反应 | 首次从肿瘤微环境角度阐明EREG/EGFR/CSF轴在EGFR抑制剂敏感性中的关键作用,并发现肿瘤微环境特征比肿瘤侧向性更能精确预测EGFR抑制剂疗效 | 未提及,但标题和摘要中未明确说明局限性 | 探究决定结直肠癌对EGFR抑制剂不同敏感性的机制,特别是肿瘤微环境的作用 | 结直肠癌肿瘤微环境中的癌细胞、肿瘤相关成纤维细胞和肿瘤相关巨噬细胞/单核细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 10 | 2026-04-30 |
Single-cell profiling reveals hepatic monocyte-derived macrophages heterogeneity during steatotic liver disease
2026-May-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000928
PMID:42043879
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示脂肪性肝病进展中肝脏单核细胞来源巨噬细胞的异质性 | 首次发现非经典CCR3+和CCR7+巨噬细胞亚群,并揭示驻留的c1基础巨噬细胞具有可塑性,可转化为CD14+/CCR7+亚群,暗示其局部起源而非仅依赖骨髓募集 | 未提及具体局限性 | 解析单核细胞来源巨噬细胞在代谢功能障碍相关脂肪性肝病中的异质性和动态变化,为靶向巨噬细胞的治疗策略提供新见解 | 小鼠(NCD和MCD饲料喂养)和人类MASLD样本中的肝脏单核细胞来源巨噬细胞 | 机器学习 | 脂肪性肝病 | 单细胞RNA测序 | Monocle 2, CellChat | 单细胞基因表达数据 | 小鼠肝脏样本(具体数量未提供)和人类MASLD样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11 | 2026-04-30 |
Single-Cell Analysis of Preeclamptic Cord Blood Mononuclear Cells Revealed Activation of Heme-Associated Signalling Pathways
2026-May, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.71150
PMID:42050777
|
研究论文 | 通过对先兆子痫脐血单核细胞进行单细胞分析,揭示血红素相关信号通路的激活 | 首次对先兆子痫孕妇的脐血细胞进行单细胞RNA测序,发现铁和血红素相关信号通路在不同细胞类型中激活 | 需要进一步研究以阐明这些机制与胎盘血红素代谢之间的直接关系 | 探究先兆子痫脐血单核细胞的分子病理机制 | 先兆子痫和对照组脐血单核细胞 | 单细胞生物学 | 妊娠并发症(先兆子痫) | 流式细胞术、单细胞RNA测序、生物信息学分析 | NA | 单细胞基因表达数据、批量RNA测序数据 | 先兆子痫和对照组脐血样本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12 | 2026-04-30 |
Modern Mining: The Role of Single-cell RNA Sequencing in Advancing Neuroscience Research
2026-May, BioEssays : news and reviews in molecular, cellular and developmental biology
IF:3.2Q1
DOI:10.1002/bies.70140
PMID:42051033
|
综述 | 单细胞RNA测序在神经科学研究中的应用与进展综述 | 系统阐述了scRNA-seq技术如何以单细胞分辨率揭示神经细胞类型的异质性、发育轨迹及功能特化 | 未提及具体技术局限性和未来挑战 | 综述单细胞RNA测序技术如何推动神经科学研究 | 多种模式生物的神经细胞类型(斑马鱼、果蝇、小鼠、人类) | 机器学习 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 13 | 2026-04-30 |
Integration of Single-Cell and Spatial Transcriptomics With Experimental Validation Uncovers Macrophage Diversity and Spatial Landscape in Carotid Atherosclerosis
2026-May, IUBMB life
IF:3.7Q2
DOI:10.1002/iub.70105
PMID:42052790
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序、体外模型和空间转录组学,系统研究了颈动脉粥样硬化中巨噬细胞的多样性、功能特征及空间定位规律 | 首次结合单细胞转录组学、空间转录组学与体外实验,解析了颈动脉粥样硬化中七种巨噬细胞亚型的异质性、发育轨迹及SPP1信号通路网络的空间连接模式 | NA | 阐明颈动脉粥样硬化中巨噬细胞亚群的调控机制及空间分布特征 | 颈动脉粥样硬化斑块中的巨噬细胞及其亚群 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学 |
| 14 | 2026-04-30 |
Novel Approaches for Investigating Host Responses to HIV Infection in Ex Vivo Human Genital Tissues
2026-May, American journal of reproductive immunology (New York, N.Y. : 1989)
DOI:10.1111/aji.70240
PMID:42053961
|
综述 | 本文综述了利用离体人生殖组织研究宿主对HIV感染反应的新方法,重点介绍空间转录组学和多重成像技术 | 创新地结合空间转录组学和多重成像技术,针对生殖组织形态学定制计算工作流,实现高分辨率分析局部免疫反应和组织结构变化 | 当前限制包括分辨率不足和成本较高 | 研究离体人生殖组织中宿主对HIV感染的反应,以了解黏膜屏障功能和HIV发病机制 | 离体人生殖组织中的免疫反应和组织结构变化 | 数字病理学 | 艾滋病 | 空间转录组学,多重成像 | NA | 图像,基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学,多重成像 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台和多重成像技术 |
| 15 | 2026-04-30 |
KDM6A promotes diabetic retinopathy via H3K27me3-dependent ferroptosis in Müller cells
2026-Apr-29, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08816-9
PMID:42049713
|
研究论文 | 发现组蛋白去甲基化酶KDM6A通过H3K27me3依赖的铁死亡通路调控Müller细胞促进糖尿病视网膜病变的病理进程 | 首次揭示KDM6A通过表观遗传机制调控Müller细胞铁死亡在糖尿病视网膜病变中的关键作用 | 未提及 | 探索糖尿病视网膜病变中表观遗传调控机制 | 糖尿病视网膜病变患者视网膜组织、糖尿病小鼠模型、Müller细胞 | 机器学习 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类糖尿病视网膜病变视网膜样本及小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium平台进行单细胞RNA测序 |
| 16 | 2026-04-30 |
Single-cell phenotype-associated subpopulation identification via transfer foundation model and statistical ensemble learning
2026-Apr-29, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-026-02613-8
PMID:42050525
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研究论文 | 介绍scPASI,一种结合单细胞和大量组学信息以揭示表型相关细胞亚群的方法 | scPASI创新性地将预训练基础模型与残差变分自编码器相结合,并通过LASSO和稀疏组LASSO模型推断表型关联,能够将细胞分为四个不同表型关联程度的亚群 | 未在文中明确说明,可能受限于单细胞数据质量和表型数据的可用性 | 连接细胞异质性与复杂性状及疾病结果,揭示与表型相关的细胞亚群 | 单细胞RNA测序数据中的细胞和大量组学样本 | 机器学习 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | 预训练基础模型、残差变分自编码器、LASSO、稀疏组LASSO | 基因表达数据 | 在多个数据集上进行了广泛评估,具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2026-04-30 |
Telomerase-Associated Genes as Prognostic Markers in High-Grade Serous Ovarian Cancer
2026-Apr-29, Medical science monitor : international medical journal of experimental and clinical research
IF:2.2Q3
DOI:10.12659/MSM.951804
PMID:42050900
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研究论文 | 本研究通过单细胞和 bulk RNA-seq 数据分析端粒酶相关基因在高浆液性卵巢癌中的预后价值,并构建了预后风险模型 | 首次结合单细胞 RNA 测序与 bulk RNA 测序数据,系统分析端粒酶相关基因在 HGSOC 中的细胞间通讯及预后作用,并开发了基于这些基因的预后模型 | 数据来源为公共数据库,缺乏独立外部验证组;研究为假设生成性质,需进一步实验验证 | 识别高浆液性卵巢癌(HGSOC)中端粒酶相关基因(TAGs)及其细胞相互作用,以发现新型预后标志物 | 高浆液性卵巢癌患者组织样本及正常组织样本 | 数字病理学和机器学习 | 卵巢癌 | 单细胞 RNA 测序、Bulk RNA 测序 | Cox 比例风险模型、LASSO 回归 | 基因表达数据(单细胞与 bulk RNA-seq) | 来自公共数据集的多个样本,具体数量未在摘要中说明 | NA | 单细胞 RNA 测序、Bulk RNA 测序 | NA | NA |
| 18 | 2026-04-30 |
Uterine natural killer cell-mediated immune imbalance impairs uterine vascular remodeling and contributes to adverse pregnancy outcomes in dengue virus-infected mice
2026-Apr-29, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.03429-25
PMID:42053322
|
研究论文 | 该研究探讨了登革病毒感染小鼠模型中子宫自然杀伤细胞介导的免疫失衡如何损害子宫血管重塑并导致不良妊娠结局 | 首次揭示了子宫自然杀伤细胞(uNK)亚群uNK2通过SPP1-CD44信号轴调控单核/巨噬细胞介导的中性粒细胞招募,从而导致子宫血管损伤和不良妊娠结局的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型,结果向人类妊娠的转化需要进一步验证 | 阐明登革病毒感染导致子宫损伤的病理机制,为登革相关妊娠疾病的治疗干预提供新靶点 | 登革病毒感染的妊娠小鼠模型 | 机器学 | 登革热相关妊娠并发症 | 转录组分析、单细胞RNA测序、组织病理学分析 | NA | 基因表达数据、组织图像 | 登革病毒感染的小鼠模型(具体数量未在摘要中明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 19 | 2026-04-30 |
Gonadotrope Remodeling in Sustained Low Estrogen States: Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals Gonadotrope Subtypes and Activation of Stem Cell Populations
2026-Apr-29, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioag091
PMID:42053376
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序分析低雌激素状态下垂体促性腺激素细胞的亚型及干细胞激活 | 首次通过单细胞转录组学揭示低雌激素状态下促性腺激素细胞存在两个亚群(GON1和GON2),并发现垂体干细胞激活参与促性腺激素细胞群体扩张 | 基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类,且未对VCD模型与自然绝经的直接差异进行对比验证 | 研究低雌激素和绝经状态对雌性垂体功能的影响,特别是促性腺激素细胞的基因表达和细胞状态变化 | VCD诱导卵巢衰竭模型小鼠的垂体细胞 | 单细胞转录组学 | NA | scRNA-seq, RT-qPCR | NA | 基因表达数据 | VCD处理小鼠与正常发情期小鼠的垂体样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 20 | 2026-04-30 |
Characterizing Infiltrating Macrophages in Intracranial Aneurysm with IA Animal Models and Spatial Transcriptomics
2026-Apr-29, Translational stroke research
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s12975-026-01437-6
PMID:42053685
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |