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当前共找到 39915 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-06-01 |
Airway-derived emphysema-specific alveolar type II cells exhibit impaired regenerative potential in COPD
2024-Dec, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.02071-2023
PMID:39147413
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研究论文 | 发现了一种位于肺泡远端囊泡中的特异性ATII细胞亚群（asATII细胞），该细胞在COPD中表现出再生潜力受损，并可能成为新的治疗靶点 | 首次发现并描述了一种同时表达肺泡标记物表面活性蛋白C和club细胞标记物SCGB3A2的肺气肿特异性ATII细胞亚群（asATII细胞），并在小鼠模型中证实其来源于club细胞 | 未提及具体研究局限，但基于摘要可推断可能包括：研究主要在体外类器官模型中进行，缺乏体内功能验证；样本量及临床相关性有待进一步确认 | 探究COPD肺气肿中组织再生受损的驱动因素，特别是肺上皮祖细胞异常 | COPD患者和健康对照的肺泡II型（ATII）细胞及气道club细胞 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序、谱系标记 | NA | 基因表达数据 | 人及小鼠样本（具体数量未提供） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2 | 2026-06-01 |
Graph attention automatic encoder based on contrastive learning for domain recognition of spatial transcriptomics
2024-10-18, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-07037-0
PMID:39424696
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研究论文 | 提出了一种基于图注意力自动编码器和对比学习的空间转录组数据域识别方法GAAEST | 引入自监督对比学习从局部、全局和上下文三个层次捕捉空间信息，显著提升空间域识别性能 | 未明确讨论方法的计算开销或对大规模数据集的扩展性 | 从空间转录组数据中准确识别空间域 | 空间转录组数据的空间域识别 | 机器学习, 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 图注意力自动编码器 (GAAEST) | 基因表达数据，空间位置信息 | 基于多个数据集进行实验 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3 | 2026-06-01 |
Insights into the molecular characteristics of embryonic cranial neural crest cells and their derived mesenchymal cell pools
2024-10-18, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-07056-x
PMID:39424998
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析，揭示胚胎颅神经嵴细胞及其衍生间充质细胞池的分子特征 | 首次发现鹿茸源性祖细胞与牙髓间充质细胞在转录组特征上的惊人相似性，并揭示全基因组DNA甲基化分析中再生性鹿茸骨膜中CNCC衍生特征基因的低甲基化现象 | 未明确提及 | 研究颅神经嵴细胞衍生间充质细胞的分子特征及其再生潜力 | 鹿的牙齿和鹿茸组织中的颅神经嵴衍生间充质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、全基因组DNA甲基化分析 | NA | 基因表达数据、DNA甲基化数据 | 未明确说明样本数量，涉及鹿的牙齿和鹿茸组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2026-06-01 |
scRNA-Explorer: An End-user Online Tool for Single Cell RNA-seq Data Analysis Featuring Gene Correlation and Data Filtering
2024-09-01, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2024.168654
PMID:39237193
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研究论文 | 提出了面向最终用户的单细胞RNA-seq数据在线分析工具scRNA-Explorer，支持基因相关性分析和数据过滤 | 开发了交互式在线工具，整合基因相关性分析、生物学重要性评估和基因富集分析，简化了单细胞RNA-seq数据的下游分析 | NA | 简化单细胞RNA-seq数据分析流程，提供面向非专业用户的交互式在线分析工具 | 单细胞RNA测序数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2026-06-01 |
Loss of cell junctional components and matrix alterations drive cell desquamation and fibrotic changes in Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2024-Jun-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.17.599411
PMID:38948715
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研究论文 | 本文通过空间转录组学和空间蛋白质组学分析，揭示了特发性肺纤维化中细胞连接成分丢失和基质改变导致上皮脱屑和纤维化变化 | 首次鉴定了IPF中远端细支气管上皮脱屑现象，并揭示了细胞连接丢失与基质失调之间的相互作用机制 | NA | 探究特发性肺纤维化中上皮脱屑的分子机制 | IPF患者和健康对照的远端细支气管上皮细胞和基底膜 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | 空间转录组数据, 空间蛋白质组数据 | IPF患者和健康对照的肺组织样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台 |
| 6 | 2026-06-01 |
Progress of single-cell RNA sequencing combined with spatial transcriptomics in tumour microenvironment and treatment of pancreatic cancer
2024-06-12, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05307-3
PMID:38867230
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序结合空间转录组学在胰腺癌肿瘤微环境和治疗中的研究进展 | 系统阐述了scRNA-seq与ST联合分析在揭示肿瘤异质性和细胞间相互作用中的互补优势，特别是在胰腺癌治疗中的新见解 | 单细胞RNA测序无法获取细胞的空间位置信息，需依赖空间转录组学进行补充 | 总结单细胞RNA测序与空间转录组学在胰腺癌肿瘤微环境和治疗中的应用进展 | 胰腺癌的肿瘤微环境及治疗相关研究 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序， 空间转录组学 | NA | 转录组数据， 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序， 空间转录组学 | NA | NA |
| 7 | 2026-06-01 |
Lysine acetyltransferase 14 mediates TGF-β-induced fibrosis in ovarian endometrioma via co-operation with serum response factor
2024-06-12, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05243-2
PMID:38867256
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研究论文 | 研究揭示了赖氨酸乙酰转移酶14通过与血清响应因子协同作用，介导TGF-β诱导的卵巢子宫内膜瘤纤维化 | 首次发现KAT14通过与SRF相互作用，增强组蛋白H4乙酰化，促进α-SMA表达，从而驱动TGF-β诱导的纤维化进程，并验证了KAT14/SRF复合物在子宫内膜瘤纤维化中的关键作用 | 未提及具体局限性 | 阐明KAT14在TGF-β诱导的卵巢子宫内膜瘤纤维化中的分子机制 | 卵巢子宫内膜瘤患者的异位病灶、永生化人子宫内膜间质细胞、原代异位子宫内膜间质细胞、小鼠子宫内膜异位症模型 | 数字病理学 | 卵巢子宫内膜瘤 | 基因过表达、敲除、敲低、腺相关病毒介导的基因沉默、单细胞转录组测序 | NA | 图像 | 子宫内膜瘤患者和健康对照者的子宫内膜活检样本、已发表的子宫内膜异位症单细胞转录组数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8 | 2026-06-01 |
Macrophage and fibroblast trajectory inference and crosstalk analysis during myocardial infarction using integrated single-cell transcriptomic datasets
2024-06-12, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05353-x
PMID:38867219
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research paper | 通过整合单细胞转录组数据集，分析心肌梗死后巨噬细胞和成纤维细胞的轨迹及其相互作用 | 首次利用多个单细胞RNA测序数据集的综合分析，揭示了心肌梗死后ECM生成成纤维细胞亚群（修复性心脏成纤维细胞和基质成纤维细胞）的动态变化和转录特征，并发现了SPP1hi巨噬细胞与成纤维细胞在胶原沉积和瘢痕形成中的特定相互作用 | 仅基于公开数据集进行二次分析，缺乏大样本前瞻性验证；动物模型和体外实验的验证范围有限，可能无法完全反映人类疾病复杂性 | 阐明心肌梗死后巨噬细胞和成纤维细胞亚群的异质性、分化轨迹及细胞间相互作用 | 心肌梗死后的心脏组织样本（人类和小鼠）中的巨噬细胞和成纤维细胞 | machine learning | cardiovascular disease | single-cell RNA-seq, single-nucleus RNA-seq, scVelo, PAGA, Slingshot, CellphoneDB, NicheNet, immunofluorescence staining | NA | gene expression data | 12个不同研究的单细胞和单核RNA测序数据集 | NA | single-cell RNA-seq, single-nucleus RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2026-06-01 |
Unveiling novel cell clusters and biomarkers in glioblastoma and its peritumoral microenvironment at the single-cell perspective
2024-06-08, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05313-5
PMID:38851695
|
研究论文 | 从单细胞视角揭示胶质母细胞瘤及其瘤周微环境中的新型细胞群和生物标志物 | 首次在单细胞水平上描绘了胶质母细胞瘤不同区域（肿瘤与瘤周）的细胞景观，发现了具有线粒体基因高表达的增殖性少突胶质细胞群以及两种不同表型的髓系细胞群，并识别出XIST、KCNH7、SYT1和DIAPH3作为潜在恶性细胞增殖相关因子 | 研究样本量较小，仅来自4名患者，可能无法完全代表胶质母细胞瘤的异质性；此外，研究结果尚需在更大样本和临床环境中验证 | 从单细胞视角揭示胶质母细胞瘤及其瘤周微环境的细胞组成和异质性，为精准治疗提供理论基础 | 4名胶质母细胞瘤患者的8个组织样本 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 10x单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 4名患者的8个组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x单细胞转录组测序 |
| 10 | 2026-06-01 |
Decoding the universal human chromatin landscape through teratoma-based profiling
2024-04-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae021
PMID:38281248
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研究论文 | 本研究通过畸胎瘤分析，整合人类胚胎干细胞来源畸胎瘤的表观基因组和转录组，构建表观遗传特征矩阵，并利用单细胞多组学图谱揭示组织异质性 | 首次构建基于畸胎瘤的全人类染色质图谱，整合单细胞多组学（RNA-Seq和ATAC-Seq）与组织学数字染色工具，实现细胞类型注释和表观遗传景观量化 | 未提及，可能涉及畸胎瘤模型的生理相关性或样本规模限制 | 解析人类畸胎瘤的表观基因组和转录组景观，建立通用性染色质状态模型 | 人类胚胎干细胞来源的畸胎瘤组织及其细胞类型 | 数字病理学, 单细胞组学 | NA | RNA-seq, scRNA-seq, scATAC-seq, 组织学数字染色 | CNN, 特征矩阵模型 | 基因表达数据, 染色质可及性数据, 组织学图像 | 基于畸胎瘤样本（具体数量未提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞多组学平台用于scRNA-Seq和scATAC-Seq分析 |
| 11 | 2026-06-01 |
q-Diffusion leverages the full dimensionality of gene coexpression in single-cell transcriptomics
2024-04-02, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06104-w
PMID:38565955
|
研究论文 | 提出q-diffusion框架，利用单细胞转录组中基因共表达的完整维度，提升数据分析效果 | 首次提出能捕获整个基因库共表达结构的q-diffusion框架，在统计显著性、分类精度和聚类效果上超越现有方法 | 未明确说明局限 | 开发一种能充分利用单细胞RNA测序数据全维度信息的方法，以增强细胞生物学理解 | 转移性结直肠癌患者、外周血单个核细胞（PBMC）、人类皮层组织 | 机器学习 | 转移性结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | q-diffusion | 基因表达数据 | CALGB/SWOG 80405临床试验样本、体外PBMC数据集、Tabula Sapiens人类图谱、空间scRNAseq人皮层组织数据 | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 12 | 2026-06-01 |
Plasma cells in human pancreatic ductal adenocarcinoma secrete antibodies against self-antigens
2023-11-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.172449
PMID:37751306
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和免疫球蛋白测序，研究了人类胰腺导管腺癌中浆细胞分泌的自身抗体及其靶向抗原 | 首次鉴定了胰腺导管腺癌中浆细胞分泌的抗体靶向的三种细胞内自身抗原（F-肌动蛋白、RUVBL2和HSPD1），并发现这些自身抗体在患者血浆中显著升高 | 样本量较小（仅7个原发性胰腺导管腺癌样本），且自身抗体在胰腺导管腺癌发生发展中的具体作用机制尚不明确 | 探究胰腺导管腺癌中驱动B细胞反应的抗原，并研究浆细胞分泌的抗体反应性 | 人类胰腺导管腺癌肿瘤微环境中的免疫细胞，特别是浆细胞和B细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 免疫球蛋白测序 | NA | 基因表达数据, 免疫球蛋白序列数据 | 7个原发性胰腺导管腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 13 | 2026-06-01 |
Spatial transcriptomics stratifies psoriatic disease severity by emergent cellular ecosystems
2023-06-08, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abq7991
PMID:37267384
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研究论文 | 利用空间转录组学分析银屑病（PsO）皮肤活检样本，揭示健康与发炎皮肤之间免疫微环境的显著差异，以及疾病严重程度分层的组织生态系统特征 | 首次通过空间转录组学对银屑病的组织生态系统进行系统性分类，发现轻度和重度银屑病具有不同的分子特征，且重度银屑病可能从分子水平改变远端未受累皮肤区域 | 样本量较小（25例活检样本），且未提及空间转录组学的分辨率限制或潜在批次效应；单细胞数据的整合可能受公共数据异质性影响 | 探究银屑病（一种炎症性皮肤病）的组织空间特征及其与疾病严重程度和系统性表现的关系 | 银屑病患者和健康对照者的皮肤活检样本（包括活动性皮损、临床未受累皮肤和健康皮肤） | 空间转录组学 | 银屑病 | 空间转录组学（ST）、单细胞转录组学整合分析 | NA | 空间转录组数据、单细胞转录组数据 | 25例皮肤活检样本（包括健康、活动性皮损和临床未受累皮肤） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 14 | 2026-06-01 |
Treatment with an antigen-specific dual microparticle system reverses advanced multiple sclerosis in mice
2022-10-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2205417119
PMID:36256820
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研究论文 | 开发一种抗原特异性双微颗粒系统，可逆转晚期多发性硬化症小鼠模型的后肢瘫痪 | 首次证明抗原特异性双微颗粒疗法能在临床晚期阶段逆转实验性自身免疫性脑脊髓炎小鼠的瘫痪，且不引起广泛免疫抑制 | 未明确说明局限性 | 评估抗原特异性双微颗粒系统在晚期多发性硬化症小鼠模型中的治疗效果及其免疫机制 | 患有晚期实验性自身免疫性脑脊髓炎的小鼠 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 基因表达数据 | 不适用（小鼠样本，具体数量未提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'基因表达分析 |
| 15 | 2026-06-01 |
Cryopreservation and post-thaw characterization of dissociated human islet cells
2022, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0263005
PMID:35081145
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研究论文 | 优化分散胰岛细胞的冻存方法，并通过单细胞转录组分析验证其功能完整性 | 提出了一种优化的梯度冷冻方法，能够维持冻存后分散胰岛细胞的膜完整性、分子和功能表型，为糖尿病研究和细胞治疗提供了可靠细胞来源 | 未提及冻存过程中可能存在的细胞亚群偏好性损伤或长期稳定性数据 | 优化分散胰岛细胞的冻存技术，获得可用于单细胞转录组研究的活性细胞 | 分散的人胰岛细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类胰岛细胞样本（具体数量未说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 16 | 2026-06-01 |
High-definition spatial transcriptomics for in situ tissue profiling
2019-10, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-019-0548-y
PMID:31501547
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研究论文 | 开发了一种高分辨率空间转录组学技术，用于原位组织分析 | 利用密集空间条形码微珠阵列，实现了2微米分辨率下捕获组织切片中的RNA，可同时获取空间位置和分子信息 | 未提及技术局限性 | 开发高分辨率空间转录组学方法，实现对组织切片的空间分子图谱分析 | 小鼠大脑和原发性乳腺癌组织 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | 图像和转录组数据 | 小鼠大脑和原发性乳腺癌组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | 高密度空间条形码微珠阵列，2微米分辨率 |
| 17 | 2026-05-31 |
Wumei Wan restores the colonic mucus barrier by modulating TGF-β/Smad signaling to promote goblet cell differentiation in ulcerative colitis
2026-Sep-15, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2026.121837
PMID:42140533
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研究论文 | 乌梅丸通过调控TGF-β/Smad信号促进杯状细胞分化，恢复溃疡性结肠炎结肠黏液屏障 | 首次揭示乌梅丸通过抑制TGF-β-Smad2/3信号通路，驱动肠道祖细胞向杯状细胞分化，扩增杯状细胞池并修复黏液屏障的分子机制 | 研究中只使用了一种DSS结肠炎模型，可能无法全面代表人类溃疡性结肠炎的复杂病理 | 阐明乌梅丸改善溃疡性结肠炎中杯状细胞命运调控和黏液屏障修复的分子机制 | DSS结肠炎小鼠模型、结肠类器官及细胞系 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 定量蛋白质组学、单细胞RNA测序、结肠类器官、Western blot、免疫荧光、UHPLC-HRMS、分子对接 | NA | 蛋白质组学数据、转录组数据、图像数据 | 小鼠结肠组织样本、结肠类器官样本、细胞系样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 18 | 2026-05-31 |
Portulaca Oleracea polysaccharides attenuate zearalenone-induced macrophage activation and Leydig cell dysfunction in testis: A single-cell and multi-omics study
2026-Aug-31, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2026.119481
PMID:42215139
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研究论文 | 通过单细胞转录组学、代谢组学和肠道微生物组分析，研究马齿苋多糖对玉米赤霉烯酮诱导小鼠睾丸巨噬细胞激活和间质细胞功能障碍的缓解作用 | 首次整合单细胞转录组、睾丸和血清代谢组以及肠道微生物组分析，揭示马齿苋多糖通过肠-血-睾轴调节肠道菌群和代谢物缓解玉米赤霉烯酮诱导的雄性生殖毒性 | 仅使用雄性昆明小鼠模型，未在其他物种或人类中验证；未探讨多糖具体活性成分和作用剂量依赖关系 | 阐明马齿苋多糖对玉米赤霉烯酮诱导小鼠睾丸毒性的解毒机制，特别是靶细胞类型和肠-血-睾轴调控 | 雄性昆明小鼠模型，靶细胞包括巨噬细胞和间质细胞 | 数字病理学，机器学习 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序，代谢组学，肠道微生物组分析 | NA | 单细胞基因表达数据，代谢组数据，微生物组数据 | 雄性昆明小鼠（具体数量未从摘要中给出，需查看全文） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 19 | 2026-05-31 |
Integrative multi-omics and experimental validation reveal UBE2C as a central hub gene and prognostic biomarker in hepatocellular carcinoma
2026-Aug-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116866
PMID:42155390
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research paper | 通过多组学整合和实验验证，揭示UBE2C在肝细胞癌中作为中枢枢纽基因和预后生物标志物的作用 | 首次结合共表达网络、蛋白质相互作用分析、单细胞转录组学和空间转录组学，全面解析UBE2C在肝细胞癌免疫微环境中的影响 | 研究主要基于公开数据库，缺乏大规模临床队列验证 | 探讨UBE2C在肝细胞癌中的作用机制及其作为预后和免疫治疗分层生物标志物的潜力 | 肝细胞癌组织和细胞系 | machine learning | liver cancer | RNA-seq, single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics, quantitative reverse transcription-PCR, immunoblotting | Cox regression | gene expression data, single-cell transcriptomic data, spatial transcriptomic data | 来自TCGA、GEO和CPTAC数据库的肝细胞癌样本，具体数量未提供 | NA | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2026-05-31 |
Integrating gene-microbiome interactions and single-cell transcriptomics reveals therapeutic strategies for aortic aneurysm
2026-Jun-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115939
PMID:42211118
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研究论文 | 通过整合基因-微生物组相互作用与单细胞转录组学，揭示主动脉瘤的潜在治疗策略 | 首次利用孟德尔随机化方法鉴定出肠道菌属对主动脉瘤风险的保护性因果效应，并结合单细胞RNA测序揭示血管平滑肌细胞中基因缺陷如何通过CXCL12-CXCR4信号轴招募中性粒细胞并促进中性粒细胞胞外陷阱形成，为肠道微生物、宿主遗传与血管炎症之间的机制联系提供了单细胞分辨率的见解 | 未提及具体局限性 | 探究肠道微生物与宿主基因相互作用在主动脉瘤发展中的机制，并寻找治疗靶点 | 主动脉瘤患者及肠道菌群相关基因 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 孟德尔随机化、单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |