单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 38991 篇文献,本页显示第 1 - 20 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1 2026-05-02
Integrating bulk and single-cell transcriptomic data to construct a risk model for histidine metabolism-related epithelial cell features in lung adenocarcinoma, predicting prognosis and immune landscape
2026-Dec-31, RNA biology IF:3.6Q2
研究论文 整合批量与单细胞转录组数据构建基于组氨酸代谢相关上皮细胞特征的肺腺癌风险模型,用于预测预后和免疫微环境 首次通过整合批量RNA-seq和单细胞RNA-seq数据,聚焦于组氨酸代谢相关的上皮细胞亚群,构建了具有预后意义的风险模型,并鉴定了七个关键基因 未在独立外部队列中验证模型的通用性,且未进行功能性实验验证基因的生物学机制 构建基于组氨酸代谢相关上皮细胞特征的肺腺癌预后风险模型,并评估其与免疫微环境的关系 肺腺癌患者 机器学习 肺癌 RNA-seq, 单细胞RNA测序 Cox回归模型, LASSO回归模型 转录组数据 多组公共数据集中的批量RNA-seq和单细胞RNA-seq样本 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq UCSC Xena, Code Ocean NA
2 2026-05-02
Nigrostriatal dopaminergic vulnerability in Parkinson's disease: Neuroprotective strategies
2026-Aug-01, Neural regeneration research IF:5.9Q1
综述 综述帕金森病中黑质纹状体多巴胺能神经元选择性易损性的机制及神经保护策略 整合单核RNA测序和空间转录组学揭示的多巴胺能亚型特异性转录应激特征,并提出基于亚型选择性的精准靶向治疗策略 未详细讨论不同神经保护策略的临床试验结果或转化障碍 理解黑质纹状体多巴胺能神经元选择性易损性的分子和细胞机制,并评估新兴神经保护策略 帕金森病中黑质纹状体多巴胺能神经元及其亚型(如AGTR1+/SOX6+和RIT2+群体) 数字病理学 帕金森病 单核RNA测序, 空间转录组学 NA NA NA NA 单核RNA测序, 空间转录组学 NA NA
3 2026-05-02
Alveolar macrophage subtypes express cholesterol and inflammation genes in cystic fibrosis
2026-Jul, Life science alliance IF:3.3Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序技术分析囊性纤维化患者肺泡巨噬细胞亚型及其在胆固醇代谢和炎症中的作用 首次通过无偏聚类鉴定出12种肺泡巨噬细胞亚型,发现表达CDKN1A和LDLR的巨噬细胞亚型与胆固醇代谢和炎症有关 样本量有限,且仅分析了支气管肺泡灌洗液中的细胞,未涉及肺组织其他区域的免疫细胞 阐明囊性纤维化患者肺泡巨噬细胞亚型及其与单核细胞在肺部炎症中的相互作用 囊性纤维化患者和健康对照者的肺泡巨噬细胞和单核细胞 单细胞组学 囊性纤维化 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 囊性纤维化患者和健康对照者,具体数量未提及 NA 单细胞RNA测序 NA NA
4 2026-05-02
Aquaporin 4 knockdown alleviates traumatic brain edema and reduces neuronal axonal growth cone collapse via the RhoA/ROCK pathway
2026-06-01, Neurobiology of disease IF:5.1Q1
研究论文 通过调控AQP4表达,探讨其对创伤性脑损伤后脑水肿及神经修复的作用机制 首次通过单细胞RNA测序揭示AQP4敲低通过减少星形胶质细胞分泌Sema3A,经RhoA/ROCK通路减轻神经元轴突生长锥塌陷,从而发挥神经保护作用 NA 阐明AQP4过表达引起的水肿对神经元修复的影响机制,并评估其作为临床治疗靶点的潜力 创伤性脑损伤小鼠模型 机器学习和数字病理学 创伤性脑损伤 scRNA-seq, DTI-MRI NA 单细胞转录组数据, 磁共振成像数据 创伤性脑损伤小鼠,样本量未明确 NA 单细胞RNA测序 NA NA
5 2026-05-02
Tet2 deficiency alters CD4+ T cell function and promotes T cell lymphoma with a TFH cell immunophenotype
2026-Jun-01, The Journal of experimental medicine IF:12.6Q1
研究论文 Tet2缺失改变CD4+ T细胞功能并促进具有TFH细胞免疫表型的T细胞淋巴瘤发生 首次揭示了Tet2缺失通过表观遗传改变导致TFH样淋巴瘤转化的机制,并发现ICOS(L)-PI3K信号通路在其中的关键作用 NA 探究Tet2突变如何通过表观遗传失调启动恶性T细胞转化 Tet2基因敲除的CD4+ T细胞及小鼠T细胞淋巴瘤模型 机器学习 T细胞淋巴瘤 scRNA-seq, 转录组学, 表观遗传学分析 NA 基因表达数据, 单细胞转录组数据 Tet2缺失小鼠及人类CD4+ T细胞样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
6 2026-05-02
Screening of metabolic-related biomarkers linking intervertebral disc degeneration and type 2 diabetes based on comprehensive bioinformatics analysis and machine learning
2026-Jun, Biochemistry and biophysics reports IF:2.3Q3
研究论文 基于生物信息学分析和机器学习筛选椎间盘退变与2型糖尿病相关的代谢生物标志物 首次综合运用多种机器学习算法(Boruta、随机森林、支持向量机、XGBoost)和单细胞测序技术鉴定IVDD与T2D的共同生物标志物AMBP,并验证其与BCAA代谢及免疫细胞浸润的相关性 缺少对AMBP在两种疾病中直接因果机制的深入实验验证,且因数据库限制可能有数据偏差 识别椎间盘退变(IVDD)和2型糖尿病(T2D)的共同生物标志物并评估其诊断价值 椎间盘退变组织和2型糖尿病患者样本 机器学习, 生物信息学 椎间盘退变, 2型糖尿病 差异表达分析, 机器学习(Boruta、RF、SVM、XGBoost), CYBERSORT免疫浸润分析, 单细胞测序, 临床样本验证 Boruta, 随机森林, 支持向量机, XGBoost 基因表达数据(GEO数据库), 单细胞RNA测序数据 两个GEO数据集(具体数量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
7 2026-05-02
Impact of enteric neuronal loss on intestinal cell composition
2026-May-15, iScience IF:4.6Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序研究肠神经元缺失对野生型和突变型斑马鱼肠道细胞组成的影响,并验证于人类HSCR组织 首次系统揭示肠神经系统缺失对肠道细胞组成的影响,包括免疫细胞增加、上皮细胞代谢紊乱及ECM产生细胞纤维化标志物富集,并验证了临床相关性 未提及具体局限 探究肠神经元缺失对肠道稳态维持的影响及其潜在机制 野生型和突变型(HSCR模型)斑马鱼以及人类HSCR组织 数字病理学 先天性巨结肠 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确说明样本数量,包括野生型和突变型斑马鱼及人类HSCR组织 NA 单细胞RNA测序 NA NA
8 2026-05-02
Wnt3-mediated fibrosis and carcinogenesis of lung squamous cell carcinoma in idiopathic pulmonary fibrosis
2026-May-15, iScience IF:4.6Q1
研究论文 通过多组学分析揭示特发性肺纤维化相关肺鳞癌中Wnt3介导的纤维化与癌变机制 首次利用单细胞RNA测序和数字空间分析,阐明IPF相关LUSC起源于AT2细胞转分化的化生基底细胞,并揭示Wnt3在此过程中的关键作用 样本量较小(仅7例UIP患者),且机制验证主要依赖细胞系模型,需进一步在体内模型中确认 探索IPF增加LUSC风险的分子机制,特别是Wnt信号在纤维化与癌变关联中的作用 伴有寻常型间质性肺炎的肺鳞癌标本 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序、数字空间分析、多组学分析 NA 基因表达数据、空间转录组数据 7例UIP患者的LUSC标本 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
9 2026-05-02
Molecular features of response and resistance to glofitamab, a T-cell engager for treatment of large B-cell lymphoma
2026-May-12, Blood advances IF:7.4Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析,揭示格洛菲他单抗治疗大B细胞淋巴瘤反应与耐药性的分子特征,发现早期维持幼稚样T细胞状态与临床疗效相关 首次通过纵向单细胞RNA测序揭示T细胞衔接器治疗中幼稚样T细胞状态(特别是新鲜细胞毒性T细胞)的维持与临床疗效关联,并提出4-1BB共刺激可克服TCE耐药性 研究主要基于外周血免疫细胞分析,肿瘤内T细胞数据来自临床前模型,缺乏大样本临床验证 阐明T细胞衔接器格洛菲他单抗治疗大B细胞淋巴瘤的疗效和耐药机制,为改善免疫治疗提供新策略 格洛菲他单抗治疗的复发/难治性B细胞非霍奇金淋巴瘤患者的外周血单核细胞及临床前肿瘤模型中的肿瘤内T细胞 单细胞转录组学 大B细胞淋巴瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 接受格洛菲他单抗治疗的R/R B-NHL患者,包括完全代谢反应者和进展性代谢疾病者 NA 单细胞RNA-seq NA 纵向单细胞RNA测序分析
10 2026-05-02
Integrated analysis of scRNA-seq and bulk RNA-seq identifies matrisome-related biomarkers for prognostic stratification and immune landscape in lung adenocarcinoma
2026-May-01, The Korean journal of physiology & pharmacology : official journal of the Korean Physiological Society and the Korean Society of Pharmacology
研究论文 整合scRNA-seq与bulk RNA-seq数据,识别与基质体相关基因相关的生物标志物,用于肺腺癌预后分层及免疫景观分析 通过整合单细胞与批量转录组数据,构建了一个七基因风险模型(ANGPTL4, C1QTNF6, CCL20, CLEC3B, FCN1, LAMA3, PRELP),能够有效区分肺腺癌患者的生存风险,并揭示免疫微环境特征 未提及 探索基质体相关基因(MRGs)在肺腺癌肿瘤微环境和免疫调控中的作用,构建预后分层模型并指导个体化治疗 肺腺癌患者的转录组及临床数据,包括TCGA、GEO(GSE31210)和单细胞数据(GSE189357) 机器学习 肺癌 RNA-seq, scRNA-seq LASSO-Cox风险比例模型 基因表达数据 多个数据集,具体例数未明确报告 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
11 2026-05-02
PD-1 Blockade-Induced DKK1 Expression by CD8+ T Cells Promotes Blood-Brain Barrier Permeabilization
2026-May-01, Cancer discovery IF:29.7Q1
研究论文 揭示抗PD-1疗法通过CD8+ T细胞表达的DKK1促进血脑屏障通透性的机制 首次发现抗PD-1治疗会特异性损害血脑屏障完整性,并阐明DKK1是介导此效应的关键分子 研究主要基于小鼠模型和肺癌患者数据,对其他肿瘤类型和ICI药物的普适性尚需验证 阐明抗PD-1治疗在脑转移中产生异质性反应的宿主驱动机制 脑转移小鼠模型及肺癌患者的脑微环境 数字病理学 肺癌脑转移 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 包含小鼠脑转移模型和肺癌患者血浆样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3' 测序平台
12 2026-05-02
Circulating Tumor Cells Predict Response to the DLL3-Targeting Bispecific Antibody Tarlatamab
2026-May-01, Cancer discovery IF:29.7Q1
研究论文 通过分析循环肿瘤细胞上的DLL3表达,预测双特异性抗体塔拉他单抗在小细胞肺癌中的治疗效果 首次证明循环肿瘤细胞上的DLL3表达水平可预测塔拉他单抗的临床获益,且具有高敏感性和特异性,并揭示了获得性耐药的两种机制 前瞻性队列样本量较小(20例患者),可能限制结果的推广性;未提及长期随访数据 探究循环肿瘤细胞作为生物标志物预测塔拉他单抗在SCLC中的疗效和耐药机制 小细胞肺癌患者及循环肿瘤细胞 机器学习 小细胞肺癌 单细胞RNA测序,循环肿瘤细胞分析 NA 单细胞转录组数据,循环肿瘤细胞定量数据 20例小细胞肺癌患者 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium NA
13 2026-05-02
Beyond the Cell Atlas: Functional Communities as the Essential Pathologic Units Driving Kidney Disease
2026-May-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN IF:10.3Q1
综述 本文提出“功能群落”概念,将其作为肾脏疾病的关键病理单位,并综述了空间和多组学技术、人工智能整合以及未来诊断和治疗转化的方向 首次提出“功能群落”这一空间约束的、互作的多细胞邻域作为肾脏疾病的决定性病理单位,而非传统上聚焦的单一细胞状态 文中未详细讨论功能群落概念验证中的实际数据挑战、技术可及性及临床转化中的监管障碍 引入功能群落的概念框架,以弥补当前单细胞图谱在解释细胞空间协作引发器官衰竭方面的不足,并探讨其在肾脏疾病诊断和治疗中的临床实用性 肾脏疾病中的三种原型病理群落:适应不良修复小生境、促纤维化小生境和组织破坏性免疫小生境 数字病理学 肾脏疾病 空间转录组学、多组学技术、人工智能 虚拟模型(用于模拟和预测动态细胞间相互作用) 多组学数据 NA NA 空间转录组学, 多组学 NA NA
14 2026-05-02
Adenosine A2B Receptor Promotes Tumor Progression and Metastases in Undifferentiated Pleomorphic Sarcoma
2026-May-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1
研究论文 采用多组学方法分析未分化多形性肉瘤原发与转移配对样本,发现ADORA2B促进肿瘤进展和转移 首次在未分化多形性肉瘤中发现ADORA2B作为转移关键驱动因子,利用空间转录组学和CRISPR-Cas9敲除进行功能验证 样本量较小(13名患者),需进一步在更大队列中验证,且主要基于体外和动物模型 揭示未分化多形性肉瘤转移的分子机制和潜在治疗靶点 未分化多形性肉瘤患者的原发和转移配对肿瘤样本 数字病理学 未分化多形性肉瘤 空间转录组学、批量RNA测序、CRISPR-Cas9敲除 无特定模型(功能实验使用CRISPR-Cas9敲除细胞系和体内模型) 转录组数据(空间转录组和批量RNA测序) 13名患者的原发和转移配对肿瘤样本 NA 空间转录组学、批量RNA测序 NA NA
15 2026-05-02
A CD57+CD8+ T cell subset links T cell cytotoxicity to fibrotic lung disease in systemic sclerosis
2026-May-01, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本研究鉴定出一种在系统性硬化症相关间质性肺病(SSc-ILD)患者中显著扩增的CD57+ CD8+ T细胞亚群,并揭示其通过CD155-CD226共刺激通路介导细胞毒性,可能驱动肺纤维化损伤 首次发现CD57+效应记忆CD8+T细胞在SSc-ILD中特异性扩增,并阐明其与终末分化Temra细胞在转录组和功能上的差异,以及CD155-CD226共刺激通路在增强细胞毒性中的作用 未明确说明样本量及功能验证实验的局限性,但依赖公开scRNA-seq数据集且未进行体内动物模型验证 阐明系统性硬化症相关间质性肺病中T细胞驱动的免疫病理机制 系统性硬化症伴或不伴间质性肺病患者的外周血T细胞及肺组织样本 数字病理学 自身免疫性疾病、间质性肺病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、免疫组化染色、流式细胞术 NA 基因表达数据、图像 研究纳入SSc-ILD患者及对照组外周血样本,另分析独立患者肺活检或切除组织,以及多个ILD队列的公开scRNA-seq数据集 NA 单细胞RNA测序 NA 分析公开肺scRNA-seq数据集(具体平台未注明)
16 2026-05-02
α -Klotho Promotes Cell Death and Suppresses Inflammation through TNF-Cellular Inhibitor of Apoptosis Protein 1 Signaling in Autosomal Dominant Polycystic Kidney Disease
2026-May-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN IF:10.3Q1
研究论文 该研究揭示了α-Klotho通过TNF-细胞凋亡抑制蛋白1信号通路促进常染色体显性多囊肾病中细胞死亡并抑制炎症的机制 首次阐明了α-Klotho在ADPKD中的新作用及机制,即通过与细胞凋亡抑制蛋白1相互作用并使其不稳定,调控TNF依赖性囊肿细胞凋亡和炎症 未提及 研究α-Klotho在常染色体显性多囊肾病中的作用及其分子机制 常染色体显性多囊肾病中的Pkd1突变小鼠模型及其肾脏细胞 机器学习 常染色体显性多囊肾病 单细胞RNA测序 转基因小鼠模型 单细胞转录组数据 Pkd1突变小鼠和Pkd1-HOMO-KLTg转基因小鼠的肾脏样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
17 2026-05-02
Guidelines for evaluating endothelial function in vascular tissue
2026-May-01, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
指南 提供了评估血管组织中内皮功能的指南,综合传统功能测定与现代分子方法 整合了传统肌动描记技术与新兴的转录组学、蛋白质组学和先进成像方法,形成评估内皮功能的最佳实践共识 未具体说明,但指南可能受限于专家共识的依赖以及技术快速迭代带来的时效性挑战 建立评估内皮功能的标准方法,提高内皮生物学研究的严谨性和可重复性 内皮细胞培养物至离体血管组织 数字病理学 心血管疾病 转录组学、蛋白质组学、先进成像 NA 文本 NA NA 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 NA NA
18 2026-05-02
scSurvival: Single-Cell Survival Analysis of Clinical Cancer Cohort Data at Cellular Resolution
2026-May-01, Cancer discovery IF:29.7Q1
研究论文 提出scSurvival模型,利用注意力机制的多实例Cox回归从单细胞数据直接建模患者和细胞层面的生存结果 首次从单细胞数据直接建模生存结果,结合变分自编码器处理高维度和批量效应,实现患者和细胞双重层面预测 未提及具体限制(基于摘要,无明确信息) 开发一种直接从单细胞测序数据预测癌症患者生存结果的方法 黑色素瘤和肝癌单细胞RNA测序(scRNA-seq)队列样本 机器学习 黑色素瘤, 肝癌 scRNA-seq 注意力机制多实例Cox回归, 变分自编码器 基因表达矩阵 黑色素瘤和肝癌单细胞RNA测序队列(具体样本数未明确) NA 单细胞RNA测序 NA NA
19 2026-05-02
Single-Cell RNA-seq Analysis Reveals Distinct Tumor and Immunosuppressive T-Cell Phenotypes in Patients with CLL Treated with Ibrutinib
2026-May-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序分析揭示ibrutinib治疗的慢性淋巴细胞白血病患者中肿瘤和免疫抑制性T细胞的不同表型 首次在单细胞水平上揭示了ibrutinib敏感和耐药CLL患者的肿瘤和免疫微环境的转录异质性,并发现T细胞耗竭和单核细胞极化与耐药性相关 未提及具体局限性,但可能包括样本量较小或缺乏对耐药机制的进一步功能验证 理解ibrutinib敏感和耐药CLL细胞及其免疫微环境的差异,以确定控制BTKi治疗期间残留疾病的治疗策略 接受ibrutinib治疗的CLL患者的外周血单核细胞 自然语言处理 慢性淋巴细胞白血病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 来自ibrutinib治疗患者的多个样本 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序平台
20 2026-05-02
GPR183 contributes to renal macrophage infiltration and fibrosis in kidney injury
2026-May-01, American journal of physiology. Renal physiology
研究论文 本研究首次揭示了GPR183在肾损伤中促进巨噬细胞浸润和纤维化的作用及机制 首次发现GPR183作为肾损伤中巨噬细胞表型的关键调控因子,并证实oxysterol-GPR183轴通过NF-κB信号促进M1型巨噬细胞极化和肾纤维化 未提及具体研究局限性 探究GPR183在肾损伤中对巨噬细胞浸润和纤维化的作用 腺嘌呤饮食诱导的慢性肾病和叶酸诱导的肾病小鼠模型 机器学 肾病 NA 小鼠模型 单细胞RNA测序数据 公开人类慢性肾病患者单细胞RNA测序数据 NA 单细胞RNA测序 NA NA
回到顶部