单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1	2025-05-18	Faecalibacterium prausnitzii prevents age-related heart failure by suppressing ferroptosis in cardiomyocytes through butyrate-mediated LCN2 regulation 2025-Dec, Gut microbes IF:12.2Q1 DOI:10.1080/19490976.2025.2505119 PMID:40364435	研究论文	本研究探讨了老年肠道微生物群变化与心力衰竭（HF）之间的潜在联系，发现Faecalibacterium prausnitzii及其代谢产物丁酸盐通过抑制心肌细胞铁死亡来预防老年相关心力衰竭	首次揭示了老年肠道微生物群通过铁死亡机制影响心力衰竭，并提出Faecalibacterium prausnitzii和丁酸盐作为潜在治疗靶点	研究主要基于动物模型和体外实验，尚未在人类临床试验中验证	探索老年肠道微生物群变化与心力衰竭之间的关系及其潜在机制	老年心力衰竭患者、大鼠模型、心肌细胞	微生物组学与心血管疾病	心血管疾病	16S rRNA测序、PCR定量、单细胞测序、基因编辑技术	动物模型（大鼠）	测序数据、PCR数据、单细胞数据	老年心力衰竭患者和健康老年人的肠道微生物样本、大鼠模型
2	2025-05-18	Integrating scRNA-seq to explore offspring neurodevelopmental toxicity induced by Cyfluthrin exposure during pregnancy: A fate decision for NSCs 2025-Jul-15, Journal of hazardous materials IF:12.2Q1 DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.138205 PMID:40209410	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术探索孕期暴露于Cyfluthrin对后代神经发育的毒性机制	首次构建了孕期暴露于Cyfluthrin的后代大脑海马单细胞图谱，揭示了神经干细胞命运改变是发育毒性的主要原因	研究仅针对大鼠模型，人类相关性尚需进一步验证	探究孕期Cyfluthrin暴露导致后代神经发育毒性的分子机制	孕期暴露于Cyfluthrin的大鼠后代海马组织	神经毒理学	神经发育障碍	scRNA-seq	NA	单细胞转录组数据	不同年龄段的孕期暴露大鼠后代
3	2025-05-18	Aboral cell types of Clytia and coral larvae have shared features and link taurine to the regulation of settlement 2025-May-16, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.adv1159 PMID:40378222	research paper	该研究通过比较三种刺胞动物幼虫的前端转录组和单细胞RNA测序数据，定义了幼虫前端细胞的共同特征，并发现了与牛磺酸摄取和分解代谢相关的基因在调节幼虫定居中的作用	首次整合多种刺胞动物幼虫的单细胞RNA测序数据，揭示了前端细胞的共同分子特征，并发现牛磺酸在调节幼虫定居中的新功能	研究仅针对三种刺胞动物物种，可能无法完全代表整个刺胞动物门的多样性	理解刺胞动物幼虫定居的细胞和分子调控机制	刺胞动物（水母、珊瑚、海葵和水螅）的幼虫	进化生物学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	三种刺胞动物物种的幼虫
4	2025-05-18	O-GlcNAcylation stabilized WTAP promotes GBM malignant progression in an N6-methyladenosine-dependent manner 2025-May-15, Neuro-oncology IF:16.4Q1 DOI:10.1093/neuonc/noae268 PMID:39671515	研究论文	本文研究了O-GlcNAcylation稳定的WTAP通过N6-甲基腺苷依赖的方式促进胶质母细胞瘤(GBM)恶性进展的机制	揭示了WTAP通过O-GlcNAcylation和USP7介导的去泛素化增强蛋白稳定性，进而通过m6A修饰调控LOXL2的表达，促进GBM的免疫逃逸	研究主要基于体外和体内实验，临床转化效果需进一步验证	探究m6A甲基转移酶WTAP在GBM肿瘤免疫抑制微环境(TIME)形成中的作用机制	间充质胶质母细胞瘤干细胞(MES GSCs)和髓系来源巨噬细胞(MDMs)	肿瘤生物学	胶质母细胞瘤	单细胞RNA测序、RNA免疫沉淀(RIP)、质谱分析	NA	RNA测序数据、蛋白质相互作用数据	NA
5	2025-05-18	Intratumoral Fusobacterium nucleatum Recruits Tumor-Associated Neutrophils to Promote Gastric Cancer Progression and Immune Evasion 2025-May-15, Cancer research IF:12.5Q1 DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-2580 PMID:39992708	研究论文	研究探讨了瘤内微生物群对胃癌进展和免疫逃逸的影响，特别是梭杆菌属（Fusobacterium nucleatum）如何通过招募肿瘤相关中性粒细胞（TAN）重塑肿瘤免疫微环境	揭示了F. nucleatum通过激活IL17/NF-κB/RelB信号通路诱导TAN招募，并促进TAN向促肿瘤亚型分化，进而增强PD-L1表达和免疫逃逸的机制	研究主要基于小鼠模型和人类胃癌组织样本，尚未在更广泛的临床环境中验证	探究瘤内微生物群对胃癌免疫微环境的影响及其在免疫逃逸中的作用	胃癌组织和瘤内微生物群，特别是Fusobacterium nucleatum	肿瘤免疫学	胃癌	16S rRNA扩增子测序，单细胞RNA测序	小鼠模型	基因测序数据，组织样本	人类胃癌组织样本和小鼠模型
6	2025-05-18	Engineering sonogenetic EchoBack-CAR T cells 2025-May-15, Cell IF:45.5Q1 DOI:10.1016/j.cell.2025.02.035 PMID:40179881	研究论文	本文设计了一种声遗传学EchoBack-CAR T细胞，用于治疗实体瘤，通过超声刺激实现持久的CAR表达	利用从库中筛选的超敏感热休克启动子与CAR信号的正反馈回路结合，实现了在聚焦超声刺激下持久的CAR表达	NA	开发一种高效且安全的实体瘤治疗策略	EchoBack-CAR T细胞	生物医学工程	胶质母细胞瘤和前列腺癌	单细胞RNA测序	NA	NA	3D胶质母细胞瘤模型和小鼠模型
7	2025-05-18	Rorγt-positive dendritic cells are required for the induction of peripheral regulatory T cells in response to oral antigens 2025-May-15, Cell IF:45.5Q1 DOI:10.1016/j.cell.2025.03.020 PMID:40185101	研究论文	该研究探讨了Rorγt阳性树突状细胞在口服抗原诱导外周调节性T细胞中的作用	通过删除Rorc编码RORγt的特定顺式调控元件，开发了一种RORγt抗原呈递细胞减少的小鼠模型，揭示了RORγt DCs在维持肠道免疫平衡中的关键作用	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证	研究RORγt阳性树突状细胞在诱导外周调节性T细胞中的作用及其对肠道免疫平衡的影响	小鼠模型中的RORγt阳性树突状细胞和调节性T细胞	免疫学	炎症性肠病、食物过敏	单细胞RNA测序、流式细胞术分析、谱系追踪	NA	基因表达数据、细胞表型数据	NA
8	2025-05-18	Channel synapse mediates neurotransmission of airway protective chemoreflexes 2025-May-15, Cell IF:45.5Q1 DOI:10.1016/j.cell.2025.03.007 PMID:40187347	研究论文	本研究揭示了Pou2f3化学感受细胞家族通过通道突触与迷走神经元通信，介导气道保护性化学反射的神经传递	首次发现Pou2f3上皮细胞通过CALHM1/3通道突触作为气道保护性反射的化学感受终末器官及其超反应性位点	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体验证	阐明咽喉部化学物质引起神经反射以保护气道的分子机制	小鼠咽喉部的Pou2f3化学感受细胞家族和迷走神经元	神经生物学	慢性咳嗽	单细胞转录组学、光遗传学刺激	基因敲除小鼠模型(Calhm3和Pou2f3敲除)	基因表达数据、行为反射数据	NA
9	2025-05-18	Fenofibrate inhibits activation of cGAS-STING pathway by alleviating mitochondrial damage to attenuate inflammatory response in diabetic dry eye 2025-May-15, Free radical biology & medicine DOI:10.1016/j.freeradbiomed.2025.05.383 PMID:40339725	研究论文	本研究探讨了cGAS-STING信号通路在糖尿病干眼症(DDE)中的作用，并研究了非诺贝特在DDE中的治疗效果及机制	首次揭示了cGAS-STING信号通路在DDE发病机制中的关键作用，并发现非诺贝特通过减轻线粒体损伤抑制该通路	研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，尚未进行人体临床试验	探究cGAS-STING信号通路在DDE中的作用及非诺贝特的治疗机制	糖尿病干眼症(DDE)小鼠模型和永生化人角膜上皮细胞(HCE-T)	分子生物学	糖尿病干眼症	单细胞RNA测序(scRNA-Seq)	STZ诱导的DDE小鼠模型	基因表达数据	未明确说明具体样本量，使用了GEO数据库数据和小鼠模型
10	2025-05-18	Single-Cell RNA Sequencing of Ewing Sarcoma Tumors Demonstrates Transcriptional Heterogeneity and Clonal Evolution 2025-May-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1 DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-2040 PMID:40029262	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术分析了尤文肉瘤肿瘤的转录异质性和克隆进化	首次在尤文肉瘤中应用单细胞RNA测序揭示转录异质性和克隆进化，并鉴定出TSPAN8作为潜在治疗靶点	样本量较小（7例未治疗患者），需要更大规模研究验证发现	探究尤文肉瘤肿瘤的转录异质性和克隆进化特征，寻找新的治疗靶点	尤文肉瘤肿瘤组织、循环肿瘤细胞(CTC)及其微环境	癌症基因组学	尤文肉瘤	单细胞RNA测序、免疫荧光	NA	RNA测序数据、免疫荧光图像	7例未治疗尤文肉瘤患者的肿瘤样本及循环肿瘤细胞
11	2025-05-18	IGFBP3 enhances adipose-derived stem cell function in soft tissue injury repair via ITGB1 and ERK pathway activation 2025-May-15, Cell biology and toxicology IF:5.3Q1 DOI:10.1007/s10565-025-10024-8 PMID:40369223	研究论文	本研究探讨了IGFBP3蛋白在脂肪来源干细胞（ADSCs）中对软组织损伤修复的作用及其分子机制	利用单细胞多组学技术和3D生物打印模型揭示了IGFBP3通过ITGB1和ERK通路激活促进ADSCs功能的新机制	研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证	阐明IGFBP3在ADSCs中介导软组织损伤修复的分子机制	脂肪来源干细胞（ADSCs）和软组织损伤修复	组织工程与再生医学	软组织损伤	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、3D生物打印、高通量转录组学	小鼠软组织损伤模型	单细胞转录组数据、图像数据	NA
12	2025-05-18	scRNA-seq and scATAC-seq reveal that Sertoli cell mediates spermatogenesis disorders through stage-specific communications in non-obstructive azoospermia 2025-May-15, eLife IF:6.4Q1 DOI:10.7554/eLife.97958 PMID:40371706	research paper	该研究通过单细胞RNA测序和单细胞染色质可及性测序揭示了非梗阻性无精子症中Sertoli细胞通过阶段特异性通讯介导精子发生障碍的机制	鉴定了三种新的Sertoli细胞亚型表型(SC4/未成熟型、SC7/成熟型和SC8/进一步成熟型)，并发现了生殖细胞与Sertoli细胞亚型之间存在阶段特异性匹配的相互作用模式	样本量相对有限，且仅针对特定类型的无精子症患者进行研究	探究非梗阻性无精子症中精子发生障碍的细胞类型特异性异常	梗阻性无精子症和非梗阻性无精子症患者的睾丸组织	生殖医学	男性不育症	scRNA-seq, scATAC-seq, 免疫荧光	NA	单细胞转录组数据、染色质可及性数据	梗阻性无精子症和非梗阻性无精子症患者的睾丸组织样本
13	2025-05-18	ARHGDIB as a prognostic biomarker and modulator of the immunosuppressive microenvironment in glioma 2025-May-15, Cancer immunology, immunotherapy : CII DOI:10.1007/s00262-025-04063-7 PMID:40372473	研究论文	本研究探讨了ARHGDIB作为胶质瘤预后生物标志物及其在免疫抑制微环境中的调节作用	首次揭示了ARHGDIB在胶质瘤免疫抑制微环境中的关键作用，并证实其作为新型肿瘤相关巨噬细胞标志物的潜力	研究主要基于公共数据库和体外实验，需要更多临床样本验证	探究ARHGDIB在胶质瘤免疫微环境中的调控机制及其预后价值	胶质瘤患者样本和细胞模型	肿瘤免疫学	胶质瘤	qPCR, IHC, 单细胞测序, 免疫荧光	LASSO-Cox回归	mRNA表达数据, 蛋白质表达数据, 单细胞数据	公共数据库数据+自建队列样本
14	2025-05-18	Time-resolved single-cell atlas identifies the spatiotemporal transcription dynamics in vernalization response in Brassica rapa 2025-May-15, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2025.115725 PMID:40378040	研究论文	该研究通过单细胞RNA测序技术，分析了Brassica rapa在春化过程中的响应机制，揭示了不同细胞类型在低温条件下的基因表达动态	首次在单细胞水平上解析了春化反应的时空转录动态，发现了叶片细胞和维管组织在低温响应中的不同作用模式	研究仅针对Brassica rapa一种植物，结果可能不适用于其他物种	探究植物春化过程中单细胞水平的基因表达动态	Brassica rapa植物	植物分子生物学	NA	单细胞RNA测序	NA	单细胞转录组数据	未明确说明样本数量
15	2025-05-18	Single-cell meta-analysis of T cells reveals clonal dynamics of response to checkpoint immunotherapy 2025-May-14, Cell genomics IF:11.1Q1 DOI:10.1016/j.xgen.2025.100842 PMID:40187353	研究论文	该研究通过单细胞RNA测序和T细胞受体测序分析了460个样本中的767,606个T细胞，揭示了T细胞克隆在免疫检查点抑制剂治疗中的动态变化及其与临床结果的关联	发现了基于扩增CD8克隆的响应特征，能够区分响应者和非响应者，并揭示了克隆转录状态与患者响应之间的差异	研究仅涵盖了6种癌症类型，可能无法代表所有癌症类型的T细胞克隆动态	探究T细胞克隆在免疫检查点抑制剂治疗中的动态变化及其与临床结果的关联	T细胞克隆	数字病理学	癌症	单细胞RNA测序/T细胞受体测序	NA	单细胞RNA测序数据	460个样本中的767,606个T细胞，涵盖6种癌症类型
16	2025-05-18	Enhanced interpretation of immune cell phenotype and function through a rhesus macaque single-cell atlas 2025-May-14, Cell genomics IF:11.1Q1 DOI:10.1016/j.xgen.2025.100849 PMID:40233746	研究论文	本文介绍了恒河猴免疫参考图谱（RIRA），这是首个以免疫为重点的恒河猴单细胞多组织图谱，旨在通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）增强对免疫细胞表型和功能的理解	首次构建了恒河猴免疫参考图谱（RIRA），并对比了转录谱与免疫谱系，利用表面蛋白和标记基因作为真实标准，识别了具有高区分/诊断价值的基因程序	在T细胞和自然杀伤（NK）细胞中，许多功能不同的亚群缺乏明确的标记，且强烈的共享表达程序（如细胞毒性）导致无监督聚类时出现系统性混合	通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）增强对免疫细胞表型和功能的理解	恒河猴的免疫细胞	生物信息学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	转录组数据	多组织样本（具体数量未提及）
17	2025-05-18	Subcellular level spatial transcriptomics with PHOTON 2025-May-14, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-025-59801-3 PMID:40368943	研究论文	介绍了一种名为PHOTON的方法，结合高分辨率成像与高通量测序，实现亚细胞水平空间转录组分析	PHOTON方法首次实现了在亚细胞分辨率下进行空间转录组分析，揭示了RNA在亚细胞结构中的分布及其功能	NA	开发一种新方法以研究RNA在亚细胞水平的空间分布及其功能	RNA在亚细胞结构中的分布，如核仁、线粒体和应激颗粒	空间转录组学	NA	高分辨率成像与高通量测序	NA	RNA空间分布数据	NA
18	2025-05-18	Differential memory enrichment of cytotoxic CD4 T cells in Parkinson's disease patients reactive to α-synuclein 2025-May-14, NPJ Parkinson's disease DOI:10.1038/s41531-025-00981-6 PMID:40368950	research paper	该研究探讨了帕金森病(PD)患者中对α-突触核蛋白(α-syn)有反应的细胞毒性CD4 T细胞的记忆富集差异	发现CELSR2在PD患者CD4效应记忆T细胞中的表达显著增加，并揭示了PD患者中细胞毒性T细胞的减少	研究样本量有限，且需要进一步验证细胞毒性T细胞在PD病理中的作用	深入了解对α-syn有反应的PD患者中T细胞亚群的扰动	帕金森病患者和健康对照组的CD4 T细胞	神经免疫学	帕金森病	单细胞RNA测序、流式细胞术	NA	基因表达数据、蛋白质表达数据	PD患者和健康对照组
19	2025-05-18	Single-cell RNA sequencing reveals immunological link between house dust mite allergy and childhood asthma 2025-May-14, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-01538-6 PMID:40368964	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了儿童哮喘与屋尘螨过敏之间的免疫学联系，并探索了潜在的诊断标志物	首次在单细胞分辨率下揭示了屋尘螨过敏儿童哮喘的免疫特征，并鉴定了HLA-DR和HLA-DP作为主要标志受体	样本量较小（仅8名儿童），且年龄范围有限（4-11岁）	探索屋尘螨过敏儿童哮喘的免疫学特征，寻找潜在的诊断标志物	屋尘螨过敏的哮喘儿童	免疫学	哮喘	单细胞RNA测序	LASSO回归	基因表达数据	8名4-11岁的经医生诊断的哮喘儿童
20	2025-05-18	Spatial transcriptomics reveals human cortical layer and area specification 2025-May-14, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-025-09010-1 PMID:40369074	研究论文	利用空间转录组学技术揭示人类大脑皮层分层和区域特异性	首次使用MERFISH技术结合深度学习核分割，在空间单细胞分辨率下研究人类胎儿皮层的分子、细胞和结构发育，发现了两种不同的皮层区域化模式	研究仅关注胎儿发育阶段，未涉及成人皮层	探索人类大脑皮层分层和区域化的分子机制	人类胎儿大脑皮层	空间转录组学	NA	MERFISH（多重误差鲁棒荧光原位杂交），单核RNA测序	深度学习	空间转录组数据，图像数据	超过1800万个单细胞，涵盖7个发育时间点的8个皮层区域