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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1 2026-01-13
Spatial transcriptomics in the human left atrial appendage and pulmonary vein sleeve
2026 Mar-Apr, Cardiovascular pathology : the official journal of the Society for Cardiovascular Pathology IF:2.3Q2
研究论文 本研究利用空间转录组学技术分析人类左心耳和肺静脉袖组织的基因表达空间分布 首次在人类肺静脉和左心耳组织中应用空间转录组学技术,揭示了AF相关基因PITX2、SHOX2和HCN4的空间表达模式 样本来源于未使用的移植供体,可能无法完全代表AF患者的病理状态 探究心房颤动(AF)治疗中肺静脉隔离的分子机制和基因表达特征 人类肺静脉(PV)和左心耳(LAA)组织 数字病理学 心血管疾病 空间转录组学 Seurat聚类分析 空间转录组数据 未使用的移植供体组织 NA 空间转录组学 NA NA
2 2026-01-13
NeuN expression in health and disease: A histological perspective on neuronal heterogeneity
2026-Feb, Histology and histopathology IF:2.5Q2
综述 本文综述了NeuN(Rbfox3)作为神经元标记物在健康和疾病状态下的表达模式、分子调控机制及其在神经科学研究与诊断中的意义 提出NeuN不应被视为二元标记物,而是神经元状态的动态指标,并建议采用多标记策略和空间转录组学等分子工具来提高神经元分析的分辨率 NA 探讨NeuN在神经元异质性中的表达变化及其在病理条件下的调控,以改进神经元识别和功能评估 成熟神经元,特别是嗅球僧帽细胞、小脑浦肯野细胞和视网膜光感受器等NeuN阴性神经元类型 数字病理学 神经退行性疾病 免疫组织化学、空间转录组学、RNA测序 NA 图像、文本 NA NA 空间转录组学、RNA测序 NA NA
3 2026-01-13
Deciphering the role of angiogenesis in glioblastoma: Integrative insights from transcriptomic profiling, single-cell sequencing and interpretable machine learning approaches
2026-Feb, Pathology, research and practice
研究论文 本研究通过整合转录组分析、单细胞测序和可解释机器学习方法,揭示了血管生成相关基因在胶质母细胞瘤中的预后价值及其在肿瘤微环境中的作用 识别了六个核心血管生成相关基因(BMP2、FSCN1、NET1、AEBP1、SEMA3G和RAB37),构建了新的风险分层模型,并通过SHAP分析增强了模型的可解释性,同时结合免疫荧光验证了FSCN1蛋白的多功能定位 研究主要基于回顾性队列数据,需要进一步的前瞻性验证和实验研究来确认这些基因的生物学机制和临床转化潜力 系统研究血管生成相关基因在胶质母细胞瘤疾病进展中的功能意义,并开发预后预测模型 胶质母细胞瘤患者及其肿瘤微环境 机器学习 胶质母细胞瘤 单细胞测序,转录组分析 LASSO回归,Cox回归,多种生存预测算法 转录组数据,单细胞测序数据 CGGA-GBM、GSE43378和GSE7696队列中的患者样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
4 2026-01-13
Single-cell transcriptional mapping of Mustn1 exhibits consistent mural cell localization across musculoskeletal tissues
2026-Feb, JBMR plus IF:3.4Q2
研究论文 本研究通过单细胞转录组学方法,系统性地绘制了Mustn1基因在肌肉骨骼组织中的表达图谱,揭示了其在平滑肌细胞中的稳定定位 首次采用自上而下的转录组学策略,结合系统范围和组织特异性映射,证实了Mustn1在多种肌肉骨骼组织(骨、滑膜、肌肉、肌腱)的平滑肌细胞中与Acta2共定位,并发现其与未表征的Sox9谱系细胞簇及肌肉骨骼纤维脂肪源性祖细胞存在重叠 研究依赖于开源单细胞RNA测序数据集,可能受数据质量和样本来源限制,未进行实验验证Mustn1蛋白功能 探究Mustn1基因在肌肉骨骼组织中的细胞特异性表达模式,以理解其在发育和修复中的作用 肌肉骨骼组织(骨、滑膜、肌肉、肌腱)中的细胞,特别是表达aSMA的平滑肌细胞和Sox9谱系细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
5 2026-01-13
New insight into the risk stratification and treatment priority of breast cancer: TMT scoring system
2026-Jan-13, International journal of surgery (London, England)
研究论文 本研究引入了一种基于17个核心基因的肿瘤线粒体转移(TMT)评分系统,用于评估线粒体动力学及其对肿瘤微环境的影响,并探讨其与乳腺癌临床结局的关联 开发了新的TMT评分系统,结合多细胞和单细胞分辨率分析线粒体转移与免疫代谢特征的关联,并通过共培养实验验证发现 研究主要基于TCGA和GEO数据库的回顾性数据,需要进一步的前瞻性临床验证 改善乳腺癌的风险分层和治疗优先级,探索线粒体动力学作为预后生物标志物和治疗靶点 乳腺癌患者及其肿瘤样本 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq),共培养实验 NA 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 基于TCGA-BRCA和GEO数据库的综合数据集,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
6 2026-01-13
Extracellular matrix-derived mechanical force induces CDK4/6 inhibitor resistance by inhibiting NEK10 dependent cell cycle regulation in breast cancer
2026-Jan-12, International journal of surgery (London, England)
研究论文 本研究探讨了细胞外基质来源的生物力学信号如何通过抑制NEK10依赖的细胞周期调控,介导HR+、HER2-乳腺癌对CDK4/6抑制剂的耐药性 首次揭示了ECM生物力学信号通过细胞骨架依赖途径下调NEK10,进而抑制p53/CDKN1A轴并激活CDK2信号,导致CDK4/6抑制剂耐药的分子机制 研究主要基于体外模型和有限临床样本,体内验证和更大规模的前瞻性临床研究仍需进行 探究ECM来源的生物力学信号在乳腺癌CDK4/6抑制剂耐药中的作用及机制 HR+、HER2-乳腺癌细胞、患者肿瘤组织及临床样本 肿瘤生物学 乳腺癌 单细胞RNA测序、转录组分析、Western blotting NA 基因表达数据、蛋白质印迹数据、临床预后数据 23例乳腺癌患者的单细胞测序数据、1092例TCGA患者数据、25例临床样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
7 2026-01-13
HMGB2-RAD21 Axis Promotes Fibro/Adipogenic Progenitor Proliferation and Regulates Fat Infiltration
2026-Jan-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过单细胞测序分析揭示了HMGB2-RAD21轴在调控猪胚胎肌肉中纤维/脂肪祖细胞增殖和脂肪浸润中的关键作用 首次构建了猪胚胎肌肉的发育图谱,并识别出HMGB2亚群作为调控FAP池大小的关键决定因素,揭示了HMGB2通过靶向RAD21在体内调控FAP增殖的新机制 研究主要基于猪和小鼠模型,在人类疾病中的直接应用仍需进一步验证,且对HMGB2-RAD21轴的具体分子通路细节有待深入探索 探究肌肉间脂肪浸润的分子和细胞机制,以改善肉类品质并减轻病理性的脂肪浸润 猪胚胎肌肉组织和小鼠模型中的纤维/脂肪祖细胞 单细胞测序 肌肉疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 猪胚胎肌肉样本和小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
8 2026-01-13
Integrative single cell RNA-sequencing and spatial transcriptomics uncovers distinct macrophage-fibroblast cross-talk in human hip synovium between patients with femoroacetabular impingement and osteoarthritis
2026-Jan-12, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学,揭示了人类髋关节滑膜中巨噬细胞与成纤维细胞在股骨髋臼撞击症和骨关节炎患者之间的独特交互作用 首次结合单细胞RNA测序与空间转录组学技术,系统比较了FAI和髋关节OA患者滑膜细胞的组成、转录组特征及细胞间相互作用,并识别了EREG+成纤维细胞样滑膜细胞的关键作用及其与COL1A1+IGFBP5+纤维化巨噬细胞通过FGF2-SDC4信号通路的交互 样本量较小(每组6例),且研究局限于髋关节滑膜,未全面评估其他关节或疾病阶段的影响 探究股骨髋臼撞击症和髋关节骨关节炎患者滑膜细胞组成、转录组变化及细胞间相互作用的差异,以揭示疾病发展机制 人类髋关节滑膜样本,来自FAI和髋关节OA患者 数字病理学 骨关节炎 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA RNA测序数据, 空间转录组数据 12例患者样本(FAI和髋关节OA各6例) NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
9 2026-01-13
RTCB is Essential for Early Mouse Embryogenesis
2026-Jan-12, Biology of reproduction IF:3.1Q2
研究论文 本研究通过构建Rtcb条件性敲除小鼠模型,揭示了RTCB在早期小鼠胚胎发育中的关键作用及其通过YY1-RTCB-NUSAP1轴调控原肠胚形成的机制 首次在小鼠模型中系统证明了RTCB对早期胚胎发育的必需性,并提出了一个由转录因子YY1调控、通过RTCB稳定Nusap1 mRNA来维持细胞增殖的原肠胚形成新调控轴 研究主要基于小鼠模型,在人类胚胎中的保守性需要进一步验证;YY1-RTCB-NUSAP1轴的具体分子机制仍需深入解析 探究RTCB在哺乳动物生殖和早期胚胎发育中的功能 小鼠胚胎、NIH 3T3细胞系 发育生物学 胚胎发育障碍 条件性基因敲除、组织学分析、免疫组化、定量PCR、单细胞RNA测序 Ddx4-Cre条件敲除小鼠模型 基因表达数据、组织图像、单细胞转录组数据 未明确样本数量的小鼠胚胎及细胞系实验 NA 单细胞RNA测序 NA NA
10 2026-01-13
Progenitor CD8+ T cells and hyper-Treg crosstalk: a driver of immune checkpoint inhibitor resistance in esophageal squamous cell carcinoma
2026-Jan-12, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,探索了食管鳞状细胞癌中肿瘤抗原呈递和肿瘤微环境内细胞间相互作用如何驱动免疫检查点抑制剂耐药性 首次在ESCC中系统揭示了抗原呈递恶性上皮细胞的异质性,并发现了由祖细胞样CD8+ T细胞和过度活化Treg细胞通过CLEC2C-KLRB1轴介导的细胞间通讯是驱动ICI耐药的关键机制 研究基于公开的24例患者数据,样本量相对有限,且为回顾性分析,需要前瞻性研究进一步验证 阐明食管鳞状细胞癌中免疫检查点抑制剂耐药的机制,并寻找潜在的治疗靶点 接受化疗和免疫检查点抑制剂治疗的24例食管鳞状细胞癌患者的肿瘤样本 单细胞组学 食管鳞状细胞癌 单细胞RNA测序,多重免疫荧光 NA 单细胞转录组数据,空间蛋白表达数据 24例食管鳞状细胞癌患者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
11 2026-01-13
Single-cell and spatial transcriptomics reveal mTOR-driven cellular fate of spindle cells and immune evasion in classic Kaposi's sarcoma
2026-Jan-12, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过单细胞和空间转录组学揭示了经典卡波西肉瘤中mTOR驱动的纺锤状细胞命运和免疫逃逸机制,并评估了二甲双胍的治疗潜力 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,系统解析了经典卡波西肉瘤中纺锤状细胞的分化状态及其与免疫细胞的相互作用机制 研究仅纳入两名患者样本,样本量较小,需要更大规模研究验证 评估mTOR抑制剂二甲双胍在经典卡波西肉瘤中的治疗潜力及其分子机制 经典卡波西肉瘤患者组织样本 数字病理学 卡波西肉瘤 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA RNA测序数据, 空间转录组数据 2名经典卡波西肉瘤患者 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
12 2026-01-13
Pathological mechanisms and treatment strategies for immune checkpoint inhibitor-associated myocarditis: insights from single-cell sequencing
2026-Jan-11, Basic research in cardiology IF:7.5Q1
综述 本文综述了单细胞测序技术在免疫检查点抑制剂相关心肌炎(ICI-M)研究中的应用进展,并探讨了基于机制见解的靶向治疗策略 系统总结了单细胞测序技术在揭示ICI-M这一罕见但严重的心脏毒性疾病的细胞组成变化和基因表达特征方面的关键作用,并提出了在不损害抗肿瘤免疫的前提下减轻心脏炎症的精准干预框架 本文是一篇综述,未报告原始实验数据;单细胞测序技术在ICI-M研究中的应用仍处于早期阶段,相关临床转化证据有限 阐明免疫检查点抑制剂相关心肌炎的发病机制,并探讨基于单细胞测序技术发现的靶向治疗策略 免疫检查点抑制剂相关心肌炎 数字病理学 心血管疾病 单细胞测序 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 NA NA
13 2026-01-13
Reconstructing Coherent Functional Landscape From Multi-Modal Multi-Slice Spatial Transcriptomics by a Variational Spatial Gaussian Process
2026-Jan-11, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本文介绍了一种名为stVGP的变分空间高斯过程框架,用于从多模态、多切片空间转录组数据中重建连贯的功能景观 stVGP通过整合空间高斯过程与空间分层变换器,实现了跨切片对齐、批次效应校正和虚拟组织切片生成,支持连续3D重建和基因表达插值 NA 开发一个统一、可扩展的框架,用于建模复杂组织和发育系统中的3D空间景观 多模态、多切片空间转录组数据集 空间转录组学 乳腺癌 空间转录组学 变分空间高斯过程框架 空间转录组数据和病理图像 NA NA 空间转录组学 NA NA
14 2026-01-13
Protoplast-Based Functional Genomics and Genome Editing: Progress, Challenges and Applications
2026-Jan-11, Plant, cell & environment
综述 本文综述了基于原生质体的功能基因组学和基因组编辑技术的进展、挑战与应用 整合了1050篇文献分析,并突出了单细胞转录组学在原生质体系统中的新应用,以及原生质体再生在作物改良中的实际价值 NA 探索植物如何感知和响应环境,并促进作物改良 植物原生质体,包括模式物种和经济作物 功能基因组学 NA 原生质体系统、单细胞转录组学、CRISPR/Cas RNP编辑 NA 文献数据、转录组数据 基于1050篇已发表文章的分析 NA 单细胞RNA-seq NA NA
15 2026-01-13
Prior high fiber intake impinges on the cellular responses of mesenteric adipose and intestinal tissues to subsequent high fat feeding
2026-Jan-10, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究通过饮食转换实验,利用单核及空间转录组学技术,揭示了高纤维饮食预处理如何重塑肠系膜脂肪和肠道组织对后续高脂饮食的细胞反应 首次结合单核转录组学和空间转录组学,系统描绘了饮食转换过程中脂肪和肠道组织的时空动态响应,并发现了性别二态性细胞群重塑现象 研究基于小鼠模型,人类组织的直接适用性需进一步验证;长期饮食效应的分子机制仍需深入探索 探究高纤维饮食预处理对后续高脂饮食挑战下组织特异性反应的调控机制 C57BL/6J小鼠的肠系膜白色脂肪组织和肠道组织(十二指肠和结肠) 空间转录组学 肥胖症 单核转录组测序、空间转录组测序 NA 转录组数据、空间基因表达数据 C57BL/6J小鼠群体(具体数量未在摘要中说明) NA 单核RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
16 2026-01-13
Rumen microbiome biogeography and ventral epithelial architecture in three ruminant species
2026-Jan-10, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究通过多组学方法揭示了三种反刍动物(狍、梅花鹿和绵羊)瘤胃微生物组的空间生物地理分布及腹侧瘤胃上皮的遗传多样性 首次系统揭示了瘤胃微生物组的空间异质性及腹侧瘤胃上皮的单细胞转录组特征,并发现维生素B对上皮生长的促进作用 研究仅涵盖三种反刍动物,样本量有限,且未探讨环境因素对微生物组空间分布的影响 探究反刍动物瘤胃微生物组的空间分布规律及腹侧上皮的细胞功能分化 狍、梅花鹿和绵羊的瘤胃微生物组及腹侧瘤胃上皮组织 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、转座酶可及染色质测序(ATAC-seq)、批量RNA测序(RNA-seq) NA 单细胞转录组数据、表观基因组数据、代谢组数据 三种反刍动物的11个瘤胃囊区域样本 NA 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, 批量RNA-seq NA NA
17 2026-01-13
Molecular characterization of palmitoylation in prostate cancer reveals KIFC2 as a prognostic biomarker and potential therapeutic target
2026-Jan-10, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1
研究论文 本研究通过整合转录组、单细胞RNA测序和空间转录组数据,全面分析了前列腺癌中的蛋白质棕榈酰化相关基因,揭示了KIFC2作为预后生物标志物和潜在治疗靶点 首次系统整合多组学数据(包括单细胞和空间转录组)来表征前列腺癌中的棕榈酰化作用,并鉴定出KIFC2这一新的关键基因 研究主要基于生物信息学分析和体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证和临床样本的直接功能验证 阐明蛋白质棕榈酰化在前列腺癌中的作用机制,并寻找新的生物标志物和治疗靶点 前列腺癌(PCa)组织样本和PC3、DU145前列腺癌细胞系 生物信息学 前列腺癌 RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 无监督共识聚类, 加权基因共表达网络分析 转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 未明确具体样本数量,但使用了多个数据集 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq NA NA
18 2026-01-13
Cannabidiol exerts antiinflammatory effects but maintains T effector memory cell differentiation in humans
2026-Jan-09, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究在单细胞水平上评估了稳态下口服大麻二酚(CBD)联合他克莫司治疗对人体免疫细胞的药效学影响 首次在单细胞水平上描述了稳态CBD联合他克莫司治疗下的人类免疫调节效应,揭示了CBD对T效应记忆细胞分化的独特维持作用及其混合免疫调节特性 研究为体外I期试验,样本量较小(23名参与者),且未评估长期临床结局 阐明CBD在人体内的免疫调节作用机制,特别是对移植受者疼痛管理的临床安全性 23名口服CBD(Epidiolex)参与者的外周血单个核细胞 NA NA 单细胞RNA测序,单核RNA测序,流式细胞术,细胞因子检测,串联质谱 NA 单细胞转录组数据,细胞因子蛋白数据,流式细胞术数据 23名参与者 NA 单细胞RNA测序,单核RNA测序 NA NA
19 2026-01-13
FDX1-mediated cuproptosis promotes cholestatic liver injury exacerbated by taurocholic acid-enhanced copper accumulation
2026-Jan-09, Cell death discovery IF:6.1Q1
研究论文 本研究揭示了胆汁淤积性肝损伤中铜过载通过牛磺胆酸增强和FDX1介导的铜死亡机制驱动肝损伤 首次发现胆汁淤积条件下牛磺胆酸能增强肝脏铜积累,并阐明FDX1通过稳定DLAT单体和LIAS介导的脂酰化在铜死亡中的复杂调控作用 单中心回顾性研究,样本量有限,主要基于动物和细胞模型,临床转化需进一步验证 探究铜在胆汁淤积性肝损伤中的作用及其具体分子机制 胆汁淤积患者肝组织、胆道闭锁患者肝标本、胆汁淤积大鼠模型、肝细胞 数字病理学 肝病 单细胞测序、转录组分析 NA 测序数据、临床数据、实验数据 胆汁淤积患者和胆道闭锁患者的肝组织样本,以及大鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
20 2026-01-13
TLR3 stimulation rejuvenates aged mesenchymal stem cells and restores immunosuppressive function in graft-versus-host disease
2026-Jan-09, Transplant immunology IF:1.6Q3
研究论文 本研究探讨了间充质干细胞衰老对移植物抗宿主病治疗效果的影响,并发现通过TLR3激动剂刺激可逆转衰老表型,恢复其免疫抑制功能 首次在单细胞水平揭示了MSC衰老导致免疫调节亚群丢失和TLR3信号下调的分子机制,并证明TLR3激动剂刺激是一种可临床转化的衰老MSC功能恢复策略 研究主要基于小鼠模型,其结论在人体中的适用性仍需进一步验证;体外扩增条件可能影响衰老表型 探究MSC衰老对GVHD治疗效果的影响,并寻找恢复衰老MSC功能的方法 人类间充质干细胞(早期传代P5和晚期传代P15)及小鼠GVHD模型 单细胞组学 移植物抗宿主病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确说明具体样本数量,涉及早期(P5)和晚期(P15)传代的人类MSC及小鼠GVHD模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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