单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27536 篇文献，本页显示第 19841 - 19860 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 19841 | 2024-08-08 |
Insights into skeletal stem cells
2022-Oct-19, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-022-00235-8
PMID:36261411
|
综述 | 本文回顾了骨骼干细胞（SSCs）的鉴定和功能研究，讨论了鉴定真正SSCs的原则和方法，并强调了绘制SSCs谱系图谱的开创性发现。 | 利用荧光激活细胞分选、谱系追踪和单细胞测序技术，识别了多种类型的SSCs，并绘制了谱系承诺轨迹，部分揭示了其在生理和病理条件下的特性。 | 文章主要集中在争议和SSC研究中的挑战，未详细说明具体的局限性。 | 回顾和讨论骨骼干细胞的鉴定、功能及其在骨骼系统中的作用。 | 骨骼干细胞及其在长骨、颅面组织和骨膜中的作用。 | NA | NA | 荧光激活细胞分选、谱系追踪、单细胞测序 | NA | 细胞 | 未具体说明样本数量 |
| 19842 | 2024-08-08 |
Spatial transcriptome profiling of normal human liver
2022-10-19, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-022-01676-w
PMID:36261431
|
研究论文 | 本文通过空间转录组学技术对正常人肝脏组织切片进行了详细研究，提供了肝脏分区在转录水平上的详细信息 | 本文首次提供了来自两个正常人肝脏捐赠者的6581个高质量spot，并对肝细胞进行了四个亚组的分类 | NA | 研究人类肝脏的空间细胞解剖结构，以解决肝脏疾病的细胞起源问题 | 正常人肝脏组织 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 两个正常人肝脏捐赠者的6581个高质量spot |
| 19843 | 2024-08-08 |
scRNA-seq generates a molecular map of emerging cell subtypes after sciatic nerve injury in rats
2022-10-19, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-03970-0
PMID:36261573
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，生成了大鼠坐骨神经损伤后新兴细胞亚型的分子图谱 | 首次提供了高分辨率的转录组图谱，揭示了神经损伤后细胞异质性的详细分子特征 | NA | 开发针对外周神经损伤、病毒感染或代谢紊乱引起的神经痛的新疗法 | 大鼠坐骨神经损伤后的细胞亚型及其分子特征 | 数字病理学 | 神经痛 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过110,000个单个细胞 |
| 19844 | 2024-08-08 |
Reprogramming of myeloid cells and their progenitors in patients with non-medullary thyroid carcinoma
2022-10-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-33907-4
PMID:36257966
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和功能分析，探讨了非髓性甲状腺癌患者骨髓细胞及其前体细胞在治疗前后的转录和功能变化 | 首次展示了非髓性甲状腺癌患者骨髓细胞及其前体细胞在肿瘤浸润前的转录和功能变化，并揭示了治疗对其的影响 | NA | 研究非髓性甲状腺癌患者骨髓细胞及其前体细胞的转录和功能变化及其对治疗的反应 | 非髓性甲状腺癌患者的骨髓细胞及其前体细胞 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 19845 | 2024-08-08 |
Dissecting the genetic and microenvironmental factors of gastric tumorigenesis in mice
2022-10-18, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111482
PMID:36261019
|
研究论文 | 本研究通过基因编辑的小鼠胃类器官生成了一系列原发性胃癌模型，揭示了从异型增生到分化良好和分化不良胃癌的遗传驱动因素，并探讨了微环境在胃癌转移中的关键作用。 | 本研究首次通过基因编辑的小鼠胃类器官模型，详细解析了胃癌发生过程中的遗传和微环境因素，特别是揭示了特定细胞间相互作用在胃癌远端转移中的作用。 | 研究主要在小鼠模型中进行，其结果在人类胃癌中的适用性需要进一步验证。 | 探讨胃癌发生和进展的遗传和微环境机制。 | 小鼠胃癌模型及其遗传和微环境因素。 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 一系列基因编辑的小鼠胃类器官 |
| 19846 | 2024-08-08 |
Self-organizing in vitro mouse neural tube organoids mimic embryonic development
2022-10-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.201052
PMID:36268933
|
研究论文 | 本文报道了一种由单个小鼠胚胎干细胞衍生的自组织3D神经管类器官模型，该模型展示了与体内相似的组织结构、细胞类型组成和前后模式 | 首次实现了在哺乳动物模型中实时观察迁移的神经嵴细胞的吞噬作用 | NA | 研究早期神经发育过程中的关键形态发生和细胞类型衍生事件 | 小鼠胚胎干细胞衍生的3D神经管类器官 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组分析 | 3D神经管类器官模型 | 细胞 | 单个小鼠胚胎干细胞 |
| 19847 | 2024-08-08 |
Mapping the adult human esophagus in vivo and in vitro
2022-10-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.200614
PMID:36278875
|
研究论文 | 本文创建了成人食管细胞类型的图谱，并建立了用于研究稳态和损伤的体外食管组织生物库，同时使用成人食管图谱对体外模型进行了基准测试。 | 首次创建了成人食管的单细胞RNA测序参考图谱，并展示了体外培养模型可以用于模拟完整的食管上皮层。 | NA | 研究人类食管的发育、稳态和疾病。 | 成人食管的细胞类型和体外模型。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 55条患者来源的体外培养线 |
| 19848 | 2024-08-08 |
Biopsy-based single-cell transcriptomics reveals MAIT cells as potential targets for controlling fibrosis-related liver inflammation due to chronic hepatitis-B infection
2022-10, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1073
PMID:36263680
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 19849 | 2024-08-08 |
Comparison and critical assessment of single-cell Hi-C protocols
2022-Oct, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2022.e11023
PMID:36281413
|
研究论文 | 本文比较了两种常用的单细胞Hi-C协议，并分析了它们在效率、偏差、规模和成本上的差异 | 使用长读长测序技术分析Hi-C检测的分子产物，揭示了全基因组扩增步骤导致的伪影增多、覆盖偏差增大和噪声增加 | 仅比较了两种常用的单细胞Hi-C协议，未涵盖所有可用协议 | 评估不同单细胞Hi-C协议的优劣，为研究染色质结构提供指导 | 单细胞Hi-C协议的效率、偏差、规模和成本 | 基因组学 | NA | 长读长测序 | NA | 基因组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 19850 | 2024-08-08 |
Exploring biomarkers and transcriptional factors in type 2 diabetes by comprehensive bioinformatics analysis on RNA-Seq and scRNA-Seq data
2022-Sep, Annals of translational medicine
DOI:10.21037/atm-22-4303
PMID:36267740
|
研究论文 | 本研究通过综合生物信息学分析RNA-Seq和scRNA-Seq数据，探索了2型糖尿病的生物标志物和转录因子 | 本研究通过结合转录组和单细胞测序数据，为2型糖尿病的分子机制和诊断提供了新的见解 | NA | 探索2型糖尿病的生物标志物和转录因子 | 2型糖尿病患者和健康人群的RNA-Seq和scRNA-Seq数据 | 生物信息学 | 2型糖尿病 | RNA-Seq, scRNA-Seq | LASSO算法, ROC分析 | 基因表达数据 | GSE41762数据集包括健康和2型糖尿病患者的RNA-seq数据，E-MTAB-5061数据集包括1,515个2型糖尿病细胞和1,817个健康细胞 |
| 19851 | 2024-08-08 |
Th1 cytokine endotype discriminates and predicts severe complications in COVID-19
2022-06-01, European cytokine network
IF:2.2Q4
DOI:10.1684/ecn.2022.0477
PMID:36266985
|
研究论文 | 本研究通过多重免疫表型分析和单细胞RNA测序，探讨了Th1和Th2细胞因子/趋化因子与COVID-19患者细胞介导免疫的关系，并根据血清细胞因子和全身炎症标志物将COVID-19病例分为四个严重程度递增的集群 | 本研究首次将COVID-19病例根据特定的炎症标志物进行集群分类，并探讨了这些集群与临床结果的关系 | NA | 研究Th1和Th2细胞因子/趋化因子与COVID-19患者细胞介导免疫的关系，并预测严重并发症 | COVID-19患者的Th1和Th2细胞因子/趋化因子及其与细胞介导免疫的关系 | NA | COVID-19 | 多重免疫表型分析，单细胞RNA测序 | NA | 血清细胞因子，全身炎症标志物 | 多个COVID-19患者的外周血单个核细胞 |
| 19852 | 2024-08-08 |
Transcriptional Profiling of Pseudomonas aeruginosa Infections
2022, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-031-08491-1_11
PMID:36258077
|
综述 | 本文综述了近年来在转录组学层面上的进展，阐释了这些进展如何为理解铜绿假单胞菌感染的建立和维持提供新的见解 | 应用先进的RNA-seq技术，如体外RNA-seq、宿主-病原体对话（双RNA-seq）或记录细菌群体内的转录异质性（单细胞RNA-seq），以及如何利用来自多种临床分离株的大量转录组数据来扩展对感染过程中细菌适应性的理解 | NA | 探讨铜绿假单胞菌如何通过不同的长期和短期适应机制增加其适应性，并在个体细胞水平上通过适应基因表达来促进其在感染宿主位点的生存 | 铜绿假单胞菌的转录组特征及其在感染过程中的适应性 | 基因组学 | NA | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 多种临床分离株 |
| 19853 | 2024-08-08 |
Heterogeneity of T cells and macrophages in chlorine-induced acute lung injury in mice using single-cell RNA sequencing
2022, Inhalation toxicology
IF:2.0Q4
DOI:10.1080/08958378.2022.2134526
PMID:36260290
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术探讨了氯气诱导的小鼠急性肺损伤中T细胞和巨噬细胞的分子机制 | 发现了T细胞和巨噬细胞中几种新的高表达抗炎和促炎基因，并通过体外实验进一步验证 | NA | 探索氯气诱导的小鼠急性肺损伤中免疫细胞的作用机制 | T细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 5316至7742个细胞 |
| 19854 | 2024-08-08 |
Unveiling the Noncanonical Autophagy-Independent Role of ATG7 and ATG9B in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma (HNSCC)
2022, Journal of oncology
DOI:10.1155/2022/9253938
PMID:36262348
|
研究论文 | 本研究通过TCGA和单细胞测序数据分析了头颈鳞状细胞癌（HNSCC）中自噬相关基因的非经典自噬独立作用 | 揭示了ATG7和ATG9B在HNSCC中的非经典自噬独立功能，这些基因通过调节癌症细胞的上皮间质转化（EMT）和免疫抑制环境发挥作用 | NA | 探讨自噬相关基因在头颈鳞状细胞癌中的非经典自噬独立作用 | ATG7和ATG9B在头颈鳞状细胞癌中的作用 | NA | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞测序 | NA | 基因数据 | 使用了TCGA和GSE103322的测序数据 |
| 19855 | 2024-08-08 |
Deeper insights into transcriptional features of cancer-associated fibroblasts: An integrated meta-analysis of single-cell and bulk RNA-sequencing data
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.825014
PMID:36263012
|
meta-analysis | 本文通过综合分析单细胞和批量RNA测序数据，深入研究了癌症相关成纤维细胞的转录特征 | 本研究通过整合大量单细胞RNA测序数据，识别了9种不同癌症类型的癌症相关成纤维细胞特异性基因表达特征，并发现了10种蛋白质标记物 | 研究主要依赖于现有数据库中的IHC图像分析，可能存在样本选择偏倚 | 旨在更好地识别癌症相关成纤维细胞的可靠标记物 | 癌症相关成纤维细胞及其在肿瘤微环境中的作用 | digital pathology | NA | RNA-seq | NA | single-cell RNA-sequencing data | 涉及多种肿瘤类型及其对应正常组织的单细胞RNA测序数据 |
| 19856 | 2024-08-08 |
Distinct responses of newly identified monocyte subsets to advanced gastrointestinal cancer and COVID-19
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.967737
PMID:36263038
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，深入剖析了健康捐赠者循环中单核细胞的异质性，并识别出9种具有特定功能特征的不同单核细胞亚群，探讨了这些新识别的单核细胞亚群在胃肠道癌症和COVID-19中的不同反应。 | 本研究首次在单细胞水平上详细分析了人类循环中单核细胞的异质性，并识别出多个具有特定功能特征的新单核细胞亚群，为理解单核细胞在疾病发展中的作用提供了新的视角。 | 研究主要基于公共单细胞转录组数据集，可能存在样本选择偏倚；此外，研究未涉及临床干预性实验，对单核细胞亚群在疾病治疗中的潜在应用价值探讨有限。 | 揭示人类循环中单核细胞的复杂性和特定亚群在不同病理背景下的作用。 | 人类循环中的单核细胞及其在胃肠道癌症和COVID-19中的反应。 | 免疫学 | 胃肠道癌症, COVID-19 | 单细胞转录组分析 | 机器学习 | 转录组数据 | 使用了来自胃肠道癌症和COVID-19患者的公共单细胞转录组数据集 |
| 19857 | 2024-08-08 |
Identification of cuproptosis-related subtypes in lung adenocarcinoma and its potential significance
2022, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2022.934722
PMID:36263125
|
研究论文 | 本研究探讨了铜死亡相关基因（CRGs）在肺腺癌（LUAD）中的转录和遗传改变，及其在肿瘤微环境和预测LUAD预后中的潜在意义 | 首次识别出与铜死亡相关的肺腺癌分子亚型，并开发了铜死亡相关基因评分（CRG_score），用于预测免疫治疗反应和临床价值 | NA | 研究铜死亡相关基因在肺腺癌中的功能及其在临床病理特征、药物敏感性和预后中的作用 | 肺腺癌患者及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 三个独立队列和临床亚型 |
| 19858 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing in atherosclerosis: Mechanism and precision medicine
2022, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2022.977490
PMID:36267275
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在动脉粥样硬化研究中的应用，旨在揭示其发生、发展和治疗机制 | 利用单细胞RNA测序技术揭示细胞水平的生物机制，解决传统批量RNA测序无法解决的细胞异质性问题 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在动脉粥样硬化研究中的应用 | 动脉粥样硬化的发生、发展和治疗机制 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 19859 | 2024-08-08 |
Atlas of human dental pulp cells at multiple spatial and temporal levels based on single-cell sequencing analysis
2022, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2022.993478
PMID:36267574
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序分析技术，探讨了人类牙髓细胞在不同空间和时间水平上的细胞异质性 | 首次揭示了牙髓细胞在不同发育阶段的细胞异质性，特别是牙髓干细胞的异质性 | 研究仅限于四个不同发育阶段的牙髓样本，可能无法涵盖所有可能的细胞类型和状态 | 阐明牙髓再生机制及牙髓干细胞在发育和再生中的作用 | 人类牙髓细胞及其在不同空间和时间水平上的细胞异质性 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 四个不同发育阶段的牙髓样本 |
| 19860 | 2024-08-08 |
Comprehensive single cell analysis of pandemic influenza A virus infection in the human airways uncovers cell-type specific host transcriptional signatures relevant for disease progression and pathogenesis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.978824
PMID:36268025
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了人类呼吸道上皮细胞对流感A病毒感染的细胞类型特异性宿主转录反应 | 首次全面分析了人类呼吸道上皮细胞在流感病毒感染中的细胞类型特异性宿主抗病毒反应 | NA | 探究不同细胞类型在流感A病毒感染中的宿主转录反应及其对疾病进展和发病机制的影响 | 人类呼吸道上皮细胞在流感A病毒感染中的反应 | 数字病理学 | 流感 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 超过19,000个单细胞 |