本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1961 | 2026-05-01 |
Exploring tumor microenvironment interactions and apoptosis pathways in NSCLC through spatial transcriptomics and machine learning
2024-Dec, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-024-01025-6
PMID:39699801
|
研究论文 | 通过空间转录组学和机器学习探索非小细胞肺癌中肿瘤微环境相互作用与凋亡通路 | 结合单细胞测序、空间转录组学、孟德尔随机化和多种机器学习算法构建预后模型,并验证SLC7A5基因在NSCLC中的功能 | 未提及具体局限性 | 探索程序性细胞死亡在NSCLC中的作用机制及潜在治疗靶点 | 非小细胞肺癌(NSCLC)细胞及其肿瘤微环境 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞测序, 空间转录组学, 孟德尔随机化 | 多种机器学习算法(如LASSO、随机森林等) | 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA(未提及具体样本量) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学 |
| 1962 | 2026-05-01 |
YY1 knockout in pro-B cells impairs lineage commitment, enabling unusual hematopoietic lineage plasticity
2024-10-16, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.351734.124
PMID:39362773
|
研究论文 | 本研究揭示YY1转录因子在pro-B细胞中敲除后导致B细胞谱系承诺丧失,赋予细胞异常的造血谱系可塑性 | 首次发现YY1在pro-B细胞阶段敲除可完全消除B细胞谱系承诺,并使细胞重获向T细胞等多谱系分化的能力,揭示了YY1在造血谱系决定中的关键调控作用 | 未明确说明研究限制 | 探究YY1转录因子在B细胞发育中pro-B细胞阶段对谱系承诺的调控作用 | YY1敲除的pro-B细胞及其分化后的T细胞样细胞 | 机器学习 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序、RNA测序、ChIP测序、单细胞ATAC测序 | NA | 基因表达数据、染色质可及性数据 | 未明确说明样本量 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 1963 | 2026-05-01 |
Exploring the impact of PDGFD in osteosarcoma metastasis through single-cell sequencing analysis
2024-Oct, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-024-00949-3
PMID:38652223
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析探究PDGFD在骨肉瘤转移中的作用 | 首次利用单细胞RNA测序技术揭示非转移性骨肉瘤原发灶中PDGF信号通路激活,并发现PDGFD通过抑制EMT信号通路发挥抑制骨肉瘤转移的作用 | 仅纳入两例原发骨肉瘤样本(1例非转移性和1例转移性),样本量较小;机制研究主要基于体外实验,缺乏体内验证 | 验证非转移性与转移性骨肉瘤之间的差异表达基因和信号通路,加深对转移机制的理解并发现潜在治疗靶点 | 两例原发骨肉瘤病变(1例非转移性和1例转移性) | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 2例原发骨肉瘤病变(1例非转移性和1例转移性) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1964 | 2026-04-01 |
Integrated analysis of single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq reveals immune suppression subtypes and establishes a novel signature for determining the prognosis in lung adenocarcinoma
2024-Oct, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-024-00948-4
PMID:38616208
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和bulk RNA测序数据,揭示了肺腺癌中的免疫抑制亚型,并建立了一个新的预后特征 | 结合单细胞和bulk RNA测序进行多组学聚类,识别出与不良生存相关的免疫抑制亚型,并发现CDC25C基因作为新的预后生物标志物 | 样本量较小(仅6对配对组织),且未明确说明单细胞测序平台的具体技术细节 | 探索肺腺癌的生物学特性,识别新的生物标志物和治疗靶点 | 肺腺癌(LUAD)患者组织样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、bulk RNA测序、全外显子组测序 | NA | RNA测序数据 | 6对配对的原发性和邻近肺腺癌组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1965 | 2026-05-01 |
Machine-learning and scRNA-Seq-based diagnostic and prognostic models illustrating survival and therapy response of lung adenocarcinoma
2024-10, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-024-00289-0
PMID:39075270
|
研究论文 | 通过机器学习与单细胞RNA测序数据构建肺腺癌诊断和预后模型,以提高生存预测和治疗反应评估的准确性 | 利用阶段特异性肿瘤细胞标志物开发了高度灵敏和特异的诊断与预后模型,诊断模型准确率达96.4%,AUC达0.993,预后模型能有效预测总生存期,并揭示了风险评分与癌症相关成纤维细胞比例及免疫逃逸的关联 | 模型可能依赖于特定数据集,需在更多独立队列中验证其泛化能力 | 开发基于单细胞RNA测序数据的肺腺癌精确诊断与预后模型,以优化临床决策 | 肺腺癌肿瘤微环境中的细胞和分子特征 | 机器学习 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | 随机森林, Cox回归 | 单细胞RNA测序数据 | 涉及多个独立队列,具体样本量未明确 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 1966 | 2026-05-01 |
Deciphering the molecular landscape: evolutionary progression from gynecomastia to aggressive male breast cancer
2024-Oct, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-024-00964-4
PMID:38888848
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序解析男性乳腺增生到男性乳腺癌的进化过程及分子机制 | 首次在单细胞分辨率下揭示男性乳腺增生向男性乳腺癌演进的潜在致癌机制,发现共享突变特征(18p+和18q+)及CD13在驱动这一转变中的关键作用 | 未提及明确的局限性 | 阐明从男性乳腺增生到男性乳腺癌的进化进展及潜在分子机制 | 男性乳腺增生组织和男性乳腺癌细胞 | 数字病理 | 男性乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1967 | 2026-05-01 |
Epigenetic reprogramming of CAR T cells for in vivo functional persistence against solid tumors
2024-10, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-024-00262-x
PMID:38388813
|
研究论文 | 通过在CAR T细胞中敲除SUV39H1基因,实现表观遗传重编程,增强其在实体瘤中的持续功能 | 首次证明通过抑制SUV39H1甲基转移酶活性可重编程CAR T细胞表型,使其获得自我更新和干细胞样特性,显著提升抗实体瘤持久性 | 主要基于体外和动物模型验证,尚需临床前安全性验证及大规模生产可行性评估,且实体瘤微环境其他免疫抑制机制可能影响实际疗效 | 探究通过表观遗传修饰增强CAR T细胞治疗实体瘤功能持久性的方法 | SUV39H1基因敲除的人源CAR T细胞及肿瘤浸润CAR T细胞 | 数字病理学 | 实体瘤 | 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 | NA | 基因表达数据,染色质开放性数据 | 人源CAR T细胞样本(具体数量未提及)及肿瘤浸润样本(具体数量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞基因表达与染色质可及性联合分析平台 |
| 1968 | 2026-05-01 |
Disrupting YAP1-mediated glutamine metabolism induces synthetic lethality alongside ODC1 inhibition in osteosarcoma
2024-Oct, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-024-00967-1
PMID:39115605
|
研究论文 | 本研究探讨了在骨肉瘤中,破坏YAP1介导的谷氨酰胺代谢与ODC1抑制联合诱导合成致死性的机制 | 首次揭示YAP1介导的谷氨酰胺代谢作为多胺代谢抑制后DFMO的重要旁路机制,并提出DFMO与YAP1抑制剂CIL56联合治疗的“一记重拳”策略 | NA | 发现转移性和复发性骨肉瘤的新型治疗靶点 | 骨肉瘤细胞、PDX和CDX模型、复发与非复发患者组织 | 机器学习和转录组学分析 | 骨肉瘤 | 单细胞转录组测序、转录组测序、高通量药物筛选、RNA-seq、代谢组学 | NA | 单细胞转录组数据、转录组测序数据、代谢组数据 | 包括单细胞RNA-seq数据、复发和非复发患者组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序, 代谢组学 | NA | NA |
| 1969 | 2026-05-01 |
Single-cell RNA transcriptomic analyses of tumor microenvironment of ovarian metastasis in gastric cancer
2024-Oct, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-024-00974-2
PMID:39162990
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析胃癌卵巢转移的肿瘤免疫微环境 | 首次对胃癌卵巢转移配对临床标本进行单细胞RNA测序分析,揭示免疫微环境异质性及特定肿瘤相关成纤维细胞亚群 | 样本量较小,仅涉及两对配对临床标本,且缺乏功能验证实验 | 阐明胃癌卵巢转移的免疫微环境特征,为治疗策略开发提供基础 | 胃癌卵巢转移组织、原发肿瘤组织及配对的非肿瘤邻近组织 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 2对配对临床标本(原发肿瘤与卵巢转移组织) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒 |
| 1970 | 2026-05-01 |
Integrated analysis reveals NLRC4 as a potential biomarker in sepsis pathogenesis
2024-10, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-024-00293-4
PMID:39181981
|
研究论文 | 综合运用多种技术分析发现NLRC4作为脓毒症发病机制中的潜在生物标志物 | 首次通过整合bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq和ELISA等多种技术,系统鉴定NLRC4在脓毒症中的表达升高及其在单核细胞和中性粒细胞中的变化,并利用pySCENIC识别调控NLRC4的上游转录因子 | NA | 揭示脓毒症免疫应答的分子机制并鉴定潜在生物标志物 | 脓毒症患者和健康个体的外周血样本 | 机器学习 | 脓毒症 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, ELISA, WGCNA, PPI, pySCENIC | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | 包含新诊断脓毒症、脓毒症诊断6小时后及健康样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1971 | 2026-05-01 |
Integrated analyses reveal CST7 and DUSP5 regulate Th2 cells differentiation to promote chronic HBV infection
2024-10, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-024-00296-1
PMID:39237681
|
研究论文 | 通过整合分析揭示CST7和DUSP5调节Th2细胞分化促进慢性HBV感染的机制 | 首次发现CST7和DUSP5在慢性乙型肝炎中高表达,并通过调控Th2细胞分化促进感染慢性化,为免疫治疗提供新靶点 | 未提及 | 探究慢性HBV感染中关键基因和免疫细胞的作用机制 | 慢性乙型肝炎患者肝组织样本(来自GSE83148、GSE84044和GSE182159数据集) | 机器学习 | 慢性乙型肝炎 | RNA-seq, scRNA-seq | 加权基因共表达网络分析(WGCNA) | bulk RNA-seq数据, scRNA-seq数据 | GSE83148和GSE84044的bulk表达数据集,GSE182159的scRNA-seq数据(具体样本数量未提及) | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1972 | 2026-05-01 |
Developmental regulation of dermal adipose tissue by BCL11b
2024-09-19, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.351907.124
PMID:39266447
|
研究论文 | 利用单细胞转录组学技术研究BCL11b对小鼠胚胎真皮脂肪组织发育的调控作用 | 首次发现BCL11b表达通过调节Wnt信号微环境促进真皮脂肪细胞分化,揭示了真皮与皮下及内脏脂肪组织在胚胎发育中的不同调控机制 | 未提供 | 研究胚胎发生过程中真皮脂肪组织的发育调控机制及其对代谢疾病的影响 | 小鼠胚胎发生过程中的细胞群体 | 单细胞转录组学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠胚胎样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium 单细胞3'测序 |
| 1973 | 2026-05-01 |
The shared role of neutrophils in ankylosing spondylitis and ulcerative colitis
2024-08, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-024-00286-3
PMID:39060428
|
研究论文 | 通过单细胞测序数据分析强直性脊柱炎和溃疡性结肠炎中免疫细胞相互作用,发现中性粒细胞在两种疾病中的共同作用 | 首次通过单细胞测序分析揭示中性粒细胞在强直性脊柱炎和溃疡性结肠炎中的共存免疫机制,并鉴定XBP1为两种疾病的共同关键基因 | 样本量较小(仅3例AS患者),未涉及UC患者样本的直接测序验证 | 探究强直性脊柱炎和溃疡性结肠炎中免疫细胞的相互作用及共享免疫机制 | 强直性脊柱炎和溃疡性结肠炎患者 | 自然语言处理 | 自身免疫性疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 3例强直性脊柱炎患者 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞测序平台 |
| 1974 | 2026-05-01 |
TRPV1 inhibition suppresses non-small cell lung cancer progression by inhibiting tumour growth and enhancing the immune response
2024-Jun, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-023-00894-7
PMID:37902941
|
研究论文 | 研究发现TRPV1在非小细胞肺癌中表达上调,抑制TRPV1可通过阻断Ca2+-IGF1R信号和抑制GABA分泌来抑制肿瘤生长并增强免疫反应 | 首次揭示TRPV1通过Ca2+-IGF1R信号通路促进NSCLC增殖并抑制凋亡,同时发现TRPV1通过调节GABA分泌影响肿瘤免疫微环境的新机制 | 未提及具体局限性 | 探索TRPV1在非小细胞肺癌发展中的作用及其机制 | 非小细胞肺癌细胞系和BALB/C、C57BL/6J小鼠肿瘤模型 | 机器学习 | 肺癌 | NA | NA | 空间转录组数据 | TCGA数据库;10× Genomics空间转录组数据集 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x 空间转录组学 | NA |
| 1975 | 2026-05-01 |
ITGB2-ICAM1 axis promotes liver metastasis in BAP1-mutated uveal melanoma with retained hypoxia and ECM signatures
2024-Jun, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-023-00908-4
PMID:38150154
|
研究论文 | 揭示ITGB2-ICAM1轴在BAP1突变葡萄膜黑色素瘤肝转移中的作用及机制 | 首次通过单细胞RNA测序和免疫活性小鼠模型发现ITGB2-ICAM1轴在BAP1突变相关葡萄膜黑色素瘤转移中维持缺氧和细胞外基质特征的关键作用 | 未提及具体局限性 | 探索BAP1缺失驱动葡萄膜黑色素瘤转移的分子机制 | 葡萄膜黑色素瘤原发和转移肿瘤细胞、小鼠肝转移模型 | 单细胞转录组学 | 葡萄膜黑色素瘤 | scRNA-Seq | NA | 单细胞转录组数据 | 包含原发和转移性葡萄膜黑色素瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1976 | 2026-05-01 |
SUMOylation inhibitors activate anti-tumor immunity by reshaping the immune microenvironment in a preclinical model of hepatocellular carcinoma
2024-Apr, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-023-00880-z
PMID:38055116
|
研究论文 | 本文研究了SUMO化抑制剂在肝细胞癌临床前模型中通过重塑免疫微环境激活抗肿瘤免疫的作用机制 | 首次发现SUMO化抑制剂TAK-981和ML-792能通过减少耗竭CD8+T细胞并增强细胞毒性NK细胞、M1巨噬细胞和CTL细胞来重塑肿瘤微环境,同时发现其可通过调节肠道微生物群丰度来恢复抗肿瘤免疫 | 该研究为临床前模型结果,尚未在人体临床试验中验证,其疗效和安全性仍需进一步评估 | 评估SUMO化抑制剂治疗肝细胞癌的效果并探索其免疫调节机制 | 小鼠肝细胞癌皮下模型和原位模型 | 机器学习 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、质谱流式细胞术、流式细胞术、多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据、质谱流式数据 | 小鼠肝细胞癌模型样本(皮下和原位模型) | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式 | NA | NA |
| 1977 | 2026-05-01 |
Single-cell transcriptomic profiling reveals immune cell heterogeneity in acute myeloid leukaemia peripheral blood mononuclear cells after chemotherapy
2024-Feb, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-023-00853-2
PMID:37615858
|
研究论文 | 利用单细胞转录组测序揭示化疗后急性髓系白血病外周血单个核细胞中的免疫细胞异质性 | 首次在单细胞水平上描绘化疗后AML患者PBMC的免疫细胞图谱,发现NK细胞和单核-树突状细胞在转录因子表达和染色体拷贝数变异方面存在显著变化,并观察到造血干细胞祖细胞的拷贝数变异和细胞间相互作用网络高度异质 | 样本量较小(仅5位AML患者和6位健康供者),化疗方案不同可能引入混杂因素,未进行功能验证实验 | 探索化疗后急性髓系白血病患者的免疫微环境,为精准医学和免疫治疗提供见解 | 5名接受不同化疗方案的AML患者和6名健康供者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 91,772个高质量细胞(来自5名AML患者的44,950个PBMC和6名健康供者的46,822个PBMC) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'解决方案 |
| 1978 | 2026-05-01 |
Single-cell RNA sequencing reveals the cellular and molecular characteristics of high-grade and metastatic bladder cancer
2023-Oct, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-023-00820-x
PMID:37170046
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示高级别和转移性膀胱癌的细胞与分子特征 | 首次通过单细胞转录组分析揭示了高级别与转移性膀胱癌在肿瘤微环境中细胞和分子层面的相似性与差异性,发现了炎症性癌相关成纤维细胞和肿瘤相关巨噬细胞在T细胞耗竭及肿瘤微环境形成中的关键作用 | 样本量较小,仅包括癌旁正常组织、原发性肿瘤和淋巴结转移样本,且未涉及纵向动态分析 | 阐明高级别和转移性膀胱癌的细胞与分子特征,为潜在治疗靶点提供依据 | 膀胱癌患者的癌旁正常组织、原发性肿瘤和淋巴结转移样本 | 单细胞测序 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 50,158个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序试剂盒 |
| 1979 | 2026-05-01 |
Identification of an adipose tissue-resident pro-preadipocyte population
2023-05-30, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112440
PMID:37119138
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序发现脂肪组织中一种驻留的前前脂肪细胞群体 | 识别并定位了一种新的前前脂肪细胞群体,将其置于前脂肪细胞分化的上游层次结构中,并揭示了调节脂肪生成的生理机制 | 仅基于单细胞RNA测序数据,未提供体内功能验证或谱系追踪实验 | 阐明脂肪细胞分化过程中的过渡阶段,并识别新的祖细胞群体 | 脂肪组织基质血管组分中的CD31阴性CD45阴性细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 1980 | 2026-05-01 |
Inhibition of a signaling modality within the gp130 receptor enhances tissue regeneration and mitigates osteoarthritis
2023-03-22, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abq2395
PMID:36947594
|
研究论文 | 研究发现gp130受体内的一个信号模块抑制后可以增强组织再生并缓解骨关节炎 | 首次发现gp130受体中的Y814酪氨酸作为细胞应激传感器,通过遗传和药理手段调控其活性可促进组织再生并抑制炎症 | 主要基于小鼠模型,在犬模型中初步验证但缺乏大动物和人体研究数据 | 探究gp130受体信号调控对组织再生和骨关节炎的影响机制 | 小鼠(野生型和F814突变体)、大鼠和犬的皮肤伤口及关节组织 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠(具体数量未明确)、大鼠和犬各若干只 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |