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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1961 | 2026-04-23 |
YY1-mediated NDUFA9 upregulation promotes NSCLC cell growth through mitochondrial and Akt-mTOR pathway modulation
2026-Apr-21, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08562-y
PMID:42014681
|
研究论文 | 本研究揭示了YY1介导的NDUFA9上调通过调节线粒体功能和Akt-mTOR通路促进非小细胞肺癌细胞生长的机制 | 首次系统阐明了NDUFA9在NSCLC中的表达模式、功能作用及其转录调控机制,特别是发现了YY1作为其关键转录因子 | 研究主要基于细胞系和动物模型,临床样本验证相对有限,且未深入探讨NDUFA9在不同NSCLC亚型中的特异性作用 | 探究NDUFA9在非小细胞肺癌发生发展中的表达、功能及调控机制 | 非小细胞肺癌细胞系、患者组织样本及小鼠移植瘤模型 | 癌症生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、生物信息学分析、shRNA敲低、基因敲除、过表达、线粒体功能检测、免疫印迹、染色质免疫沉淀 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、单细胞测序数据 | TCGA数据库数据、单细胞RNA测序数据、本地患者组织及多种NSCLC细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1962 | 2026-04-23 |
Chromosome-level genome assembly of the sponge Halisarca dujardinii
2026-Apr-21, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-026-07161-y
PMID:42014710
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研究论文 | 本文首次报道了海绵Halisarca dujardinii的染色体级别基因组组装,为研究其再生机制和海绵进化提供了重要资源 | 首次生成Halisarca dujardinii的染色体级别基因组组装,结合了长读长、短读长和Hi-C数据,并提供了线粒体基因组和全面的基因注释 | NA | 研究海绵Halisarca dujardinii的基因组结构,以探索其再生能力和进化背景 | 海绵Halisarca dujardinii | 基因组学 | NA | Oxford Nanopore长读长测序, Illumina短读长测序, Hi-C, 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组序列数据, RNA测序数据 | NA | Oxford Nanopore, Illumina | 长读长测序, 短读长测序, Hi-C, 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Oxford Nanopore平台, Illumina平台 | NA |
| 1963 | 2026-04-23 |
Identifying omic biomarkers for chronic inflammatory diseases associated with periodontitis using percolation on multi-disease gene co-expression networks
2026-Apr-21, Communications medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1038/s43856-026-01591-w
PMID:42014834
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研究论文 | 本研究开发了一种名为PMGCN的计算框架,用于识别与牙周炎相关的慢性炎症疾病的组学生物标志物 | 利用多疾病基因共表达网络上的最优渗流方法,首次将牙周炎与多种慢性炎症疾病的关联应用于生物标志物计算 | 方法主要基于批量转录组数据,可能未充分捕捉单细胞水平的异质性,且验证依赖于公开数据集 | 开发计算框架以识别慢性炎症疾病的组学生物标志物,并探索其与牙周炎的关联 | 溃疡性结肠炎、克罗恩病、阿尔茨海默病和帕金森病等慢性炎症疾病 | 生物信息学 | 慢性炎症疾病 | 批量转录组基因表达谱分析,单细胞RNA-seq | 多疾病基因共表达网络渗流模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1964 | 2026-04-23 |
A velocity-informed framework for resolving functional stratification in rare human stem cells
2026-Apr-21, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-026-02956-9
PMID:42014860
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研究论文 | 本文介绍了一种基于速度信息的框架,用于解析人类罕见干细胞中的功能分层,以人脐带血中的非常小胚胎样干细胞(VSELs)为概念验证模型 | 通过整合单细胞RNA测序与动态RNA速度分析,识别出两个动力学不同的VSEL亚群,并揭示了状态特异性应激反应、代谢调控和发育基因网络程序 | 研究依赖于间接的动力学建模,缺乏直接的功能验证,且主要针对特定罕见干细胞类型,通用性需进一步验证 | 开发一种框架来解析罕见和静息干细胞群体的转录分层和功能异质性 | 人脐带血中的非常小胚胎样干细胞(VSELs) | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序,RNA速度分析 | 动力学模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1965 | 2026-04-23 |
SpaNiche: spatial niche analysis to explore colocalization patterns and cellular interactions in spatial transcriptomics data
2026-Apr-21, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04069-z
PMID:42015285
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研究论文 | 本文提出了一个名为SpaNiche的计算框架,用于空间转录组学数据中的空间生态位分析,以揭示共定位模式并推断潜在的配体-受体相互作用 | SpaNiche利用图正则化联合非负矩阵分解整合细胞丰度和配体-受体表达信息,同时识别细胞类型间的空间共定位模式并提供相关配体-受体相互作用的见解 | NA | 探索空间转录组学数据中的共定位模式和细胞相互作用 | 结直肠癌、前列腺癌和早期阿尔茨海默病大脑皮层的微环境生态型 | 空间转录组学 | 结直肠癌、前列腺癌、阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | 图正则化联合非负矩阵分解、共识聚类 | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1966 | 2026-04-23 |
Exploring the CeRNA landscape in plants: advances, methods, and challenges
2026-Apr-20, TAG. Theoretical and applied genetics. Theoretische und angewandte Genetik
DOI:10.1007/s00122-025-05135-z
PMID:42008014
|
综述 | 本文综述了植物中竞争性内源RNA(ceRNA)的研究进展、方法及挑战,揭示了植物与动物ceRNA的关键差异 | 总结了植物ceRNA在序列特征、互作模式和功能上与动物的差异,并提出了结合单细胞测序和空间转录组学等前沿技术的研究方法 | 现有生物信息学工具预测准确性有限,且在复杂植物组织中进行功能验证存在困难 | 探索植物ceRNA在基因调控中的作用,特别是在胁迫响应和作物改良中的应用 | 植物中的竞争性内源RNA(ceRNA) | 自然语言处理 | NA | 单细胞测序, 空间转录组学, 多组学工具 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1967 | 2026-04-23 |
High-quality acinar cell isolation enables single-cell analysis of healthy and injured pancreas
2026-Apr-20, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2026.101415
PMID:42013858
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研究论文 | 本文开发了一种从健康和损伤胰腺组织中快速消化获取高质量单细胞的方法,用于单细胞RNA测序分析 | 开发了一种改进的胰腺消化协议,显著提高了腺泡细胞的分离质量和比例,克服了现有方法中腺泡细胞代表性不足的问题 | 方法主要在小鼠模型中验证,在人类胰腺组织中的应用效果尚需进一步研究 | 改进胰腺单细胞分离方法,实现对腺泡细胞群体的全面表征 | 小鼠胰腺组织(包括健康和急性胰腺炎模型) | 单细胞组学 | 胰腺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1968 | 2026-04-23 |
Molecular signatures of cell diversity modulated by long noncoding RNAs in the human fetal spinal cord
2026-Apr-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115399
PMID:42006319
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术,探索了人类胎儿脊髓中神经干细胞谱系、运动神经元和胶质细胞的分子特征及长链非编码RNA的表达模式 | 结合scRNA-seq和scStereo RNA-seq技术,首次在人类胎儿脊髓中系统解析了长链非编码RNA与邻近编码基因的空间共表达网络及其在细胞多样性调控中的作用 | 研究仅覆盖妊娠8至12周的胎儿样本,未涉及更早或更晚发育阶段,且样本量有限 | 揭示人类胎儿脊髓中细胞多样性的分子调控机制,特别是长链非编码RNA在神经发育中的功能 | 人类胎儿脊髓组织中的神经干细胞、运动神经元、星形胶质细胞和少突胶质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间表达数据 | 妊娠8至12周的人类胎儿脊髓样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞Stereo RNA-seq | NA | NA |
| 1969 | 2026-04-23 |
Transcriptional noise sets fundamental limits to decoding circadian clock phase from single-cell RNA snapshots
2026-Apr-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115394
PMID:42006364
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研究论文 | 本研究探讨了从单细胞RNA快照解码生物钟相位的根本限制,发现转录噪声限制了单细胞水平的相位估计精度 | 结合多重smFISH技术和基于高斯过程的算法,首次量化了核心生物钟基因的转录噪声对单细胞相位估计的影响,并提出了通过平均多个细胞数据来克服噪声的方法 | 研究主要基于小鼠成纤维细胞,结论在其他细胞类型或生物体中的普适性有待验证;单细胞RNA-seq数据中非核心基因的噪声问题尚未完全解决 | 评估从单细胞RNA测量中准确推断生物钟相位的可行性,并探索克服转录噪声的策略 | 小鼠成纤维细胞中的核心生物钟基因(如Per1, Per2, Cry1, Cry2, Bmal1, Rev-erbα) | 单细胞转录组学 | NA | 多重smFISH(单分子荧光原位杂交),单细胞RNA-seq | 基于高斯过程的算法 | 图像(smFISH),RNA序列数据 | 涉及超过70个小鼠成纤维细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1970 | 2026-04-23 |
Targeting keratin 6 A overcomes gemcitabine resistance by restoring equilibrative nucleoside transporter 1 and TAM-mediated metabolic compensation in pancreatic cancer
2026-Apr-17, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy
IF:15.8Q1
DOI:10.1016/j.drup.2026.101404
PMID:42013581
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研究论文 | 本研究揭示了角蛋白6A(KRT6A)通过抑制ENT1介导的药物摄取和通过MIF-CD74/CD44轴及TAM-M2极化促进胞苷富集微环境,从而驱动胰腺癌对吉西他滨耐药的新机制,并开发了一种靶向递送siKRT6A的纳米载体以恢复化疗敏感性 | 首次将KRT6A鉴定为胰腺癌吉西他滨耐药的关键驱动因子,阐明了其通过调控ENT1和MIF-CD74/CD44轴及TAM-M2极化重塑肿瘤微环境的分子机制,并创新性地设计了cRGD修饰的脂质纳米载体(c-Lip@siKRT6A)实现靶向治疗 | 研究主要基于细胞系和异种移植模型,临床前数据需进一步在人体临床试验中验证;纳米载体的长期安全性和体内分布特性需更深入评估 | 识别吉西他滨耐药的关键驱动因子并开发靶向策略以恢复胰腺癌的化疗敏感性 | 胰腺癌细胞系、临床患者组织样本(包括组织微阵列)、异种移植小鼠模型 | 数字病理学 | 胰腺癌 | RT-qPCR、空间转录组学、单细胞转录组学、多组学分析、代谢分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、空间转录组数据、单细胞转录组数据、临床生存数据 | 吉西他滨治疗队列(n=90)、公共数据集中的胰腺癌队列、组织微阵列 | NA | 空间转录组学, 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 1971 | 2026-04-23 |
PIM1 kinase-regulated cellular metabolism sustains differentiation and function of effector CD8+ T cells during chronic viral infection
2026-Apr-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkag062
PMID:42001517
|
研究论文 | 本文研究了在慢性病毒感染期间,PIM1激酶通过调控细胞代谢来维持效应CD8+ T细胞的分化和功能 | 揭示了PIM1激酶在IL-21信号下游调控效应CD8+ T细胞代谢和功能的新机制,并利用单细胞RNA测序数据通过Compass算法分析了CD8+ T细胞亚群的代谢异质性 | 研究主要基于小鼠模型(淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒克隆13),结果在人类系统中的适用性尚需验证 | 探究慢性病毒感染期间CD8+ T细胞分化的代谢调控机制 | 病毒特异性CD8+ T细胞亚群(祖细胞、效应细胞和耗竭细胞) | 免疫学 | 慢性病毒感染 | 单细胞RNA测序,代谢通量分析 | Compass算法 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1972 | 2026-04-11 |
Single-cell RNA sequencing analysis reveals the evolution and regulatory features of specialized endothelial cell subsets in non-traumatic osteonecrosis of the femoral head
2026-Apr-10, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-026-00774-8
PMID:41957812
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1973 | 2026-04-23 |
Impaired insulin signaling limits osteogenic potential of bone marrow stromal cells in type 2 diabetes
2026-Apr-06, European journal of endocrinology
IF:5.3Q1
DOI:10.1093/ejendo/lvag063
PMID:41985043
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研究论文 | 本研究探讨了2型糖尿病患者骨髓基质细胞中胰岛素信号受损如何限制其成骨潜能 | 首次在人类骨髓基质细胞中证明2型糖尿病导致胰岛素信号通路受损,并发现其与成骨分化能力下降及体内骨形成率降低直接相关 | 样本量较小(16例患者),且仅使用骨髓基质细胞进行研究,未涉及其他骨细胞类型 | 探究2型糖尿病患者骨髓基质细胞胰岛素信号通路异常与骨形成受损之间的关联 | 人类骨髓基质细胞 | NA | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序、定量磷酸化蛋白质组学 | NA | RNA测序数据、蛋白质组学数据 | 16例长期2型糖尿病患者(男女均有)及年龄性别匹配的健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1974 | 2026-04-23 |
Multi-omics analysis of patient-derived organoids reveals that E3 ligase COP1 promotes liver metastasis and oxaliplatin resistance in colorectal cancer through LUZP1 degradation and MYL9 phosphorylation
2026-Apr-05, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-026-00771-7
PMID:41937206
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研究论文 | 本研究通过多组学分析患者来源的类器官,揭示了E3连接酶COP1通过降解LUZP1和磷酸化MYL9,促进结直肠癌肝转移和奥沙利铂耐药 | 首次利用配对的结直肠癌原发灶和肝转移灶来源的类器官生物库进行整合多组学分析,鉴定出COP1-LUZP1-MYL9轴是驱动肝转移和化疗耐药的关键通路,并提出了基于PDOs的COP1表达谱分析作为精准治疗策略 | NA | 阐明结直肠癌肝转移和奥沙利铂耐药的分子机制,并寻找潜在的治疗靶点 | 结直肠癌患者来源的类器官,特别是来自配对的原发肿瘤和肝转移灶的样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 多组学分析,包括全外显子组测序、bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | 基因组数据、转录组数据、单细胞转录组数据 | 基于五个初始临床队列的分析,并使用来自配对原发灶和肝转移灶的类器官生物库 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, WES | NA | NA |
| 1975 | 2026-04-23 |
Anticancer Treatment Influences TREM2 in Tumor-Associated Macrophages in Lung Cancer
2026-Apr, Cancer research and treatment
IF:4.1Q2
DOI:10.4143/crt.2024.1245
PMID:40575951
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研究论文 | 本研究探讨了抗癌治疗(化疗)对肺腺癌肿瘤微环境中表达TREM2的巨噬细胞的影响 | 首次在单细胞水平上揭示了化疗药物(如顺铂和奥希替尼)如何影响肺腺癌肿瘤微环境中TREM2+巨噬细胞的表型、比例及功能,并阐明了TREM2+细胞通过FN:CD44和MIF:CD74+CXCR4等通路与其他免疫细胞互作的机制 | 研究主要基于单细胞测序数据集和细胞模型,缺乏大规模临床队列验证;对TREM2功能的具体分子机制和下游信号通路探索尚不深入 | 探究抗癌治疗对肺腺癌肿瘤微环境中TREM2表达及巨噬细胞表型与功能的影响 | 人及小鼠肺腺癌组织、正常肺组织、THP-1单核细胞系 | 单细胞组学与肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、细胞实验数据 | 包含配对正常肺组织与肿瘤组织的人和小鼠样本,以及THP-1细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1976 | 2026-04-23 |
NK cells undergo transcriptional and functional reprogramming following Streptococcus pneumoniae infection
2026-Apr, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2025.11.012
PMID:41320160
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了自然杀伤细胞在肺炎链球菌感染后的转录和功能重编程过程 | 首次在细菌感染背景下系统揭示了NK细胞的转录重编程和记忆反应机制,并识别了特定的记忆NK细胞亚群 | 研究主要关注肺炎链球菌感染模型,其他细菌感染的普适性尚需验证 | 探究NK细胞在细菌感染中的记忆形成机制和功能特性 | 自然杀伤细胞在肺炎链球菌感染后的转录组和功能变化 | 单细胞转录组学 | 细菌感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1977 | 2026-04-23 |
A trispecific antibody engaging T cells with tumour and myeloid cells augments antitumour immunity
2026-Apr, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-025-01569-4
PMID:41372583
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研究论文 | 本研究开发了一种靶向B7H3、CD3和PDL1的三特异性抗体,用于重定向旁观者T细胞并克服免疫抑制微环境,以增强实体瘤的抗肿瘤免疫 | 首次设计并验证了一种同时靶向肿瘤抗原(B7H3)、T细胞(CD3)和免疫检查点(PDL1)的三特异性抗体,能够重定向非肿瘤特异性(旁观者)T细胞并解除免疫抑制 | 研究主要基于体外和动物模型验证,临床疗效和安全性仍需进一步临床试验证实 | 开发一种新型免疫疗法,以克服免疫检查点抑制剂在免疫无应答肿瘤中的耐药性 | 实体瘤(特别是卵巢癌和结直肠癌)中的旁观者T细胞和免疫抑制微环境 | 机器学习 | 卵巢癌, 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 转录组数据, 细胞毒性数据 | 来自17种肿瘤类型的300名患者的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1978 | 2026-04-23 |
MDA5-MAVS and interferon-lambda signaling in the intestinal epithelium limit murine astrovirus infection
2026-Apr, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2025.12.002
PMID:41435889
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,揭示了小鼠星状病毒(muAstV)感染中MDA5-MAVS通路和干扰素-λ信号在肠道上皮细胞中的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序证实muAstV对多种肠道上皮细胞的趋向性,并明确了MDA5-MAVS通路调控干扰素-λ诱导的具体机制 | 研究主要基于小鼠模型,结果向人类星状病毒感染的直接转化需进一步验证 | 阐明muAstV感染中先天免疫信号通路的调控机制 | 小鼠星状病毒(muAstV)及其感染的肠道上皮细胞 | 单细胞转录组学 | 病毒性胃肠炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1979 | 2026-04-23 |
Single-cell transcriptome analysis reveals the association between ketone body synthesis and morphogenic profile of intestinal epithelia in neonatal mice
2026-Apr, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2025.12.005
PMID:41478463
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了新生小鼠肠道上皮细胞中酮体合成与细胞形态发生特征之间的关联 | 首次在新生小鼠肠道上皮细胞中发现了酮体合成基因的上调与细胞形态发生基因高表达之间的相关性,而非主要作为能量来源 | 研究仅关注了10天和21天两个时间点的小鼠,未涵盖更广泛的发育阶段;且仅分析了特定病原体无菌和普通条件下的样本,可能未完全反映真实肠道环境 | 探究新生儿期肠道上皮细胞的早期生命特征及其成熟过程 | 新生(10天)和幼年(21天)小鼠的肠道上皮细胞 | 单细胞转录组学 | 肠道疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 新生和幼年小鼠的肠道上皮细胞,具体样本数量未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1980 | 2026-04-23 |
Integrated human and mouse single-cell profiling reveals immune-stromal niche driving silicosis
2026-Apr, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2026.01.003
PMID:41520918
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研究论文 | 本研究通过整合人类和小鼠的单细胞RNA测序数据,揭示了驱动矽肺病的免疫-基质微环境的关键细胞亚群及其相互作用 | 开发了使用微型支气管镜的位点特异性矽肺小鼠模型,并结合单细胞测序与细胞间通讯模型,首次系统性地揭示了CCL2-hi单核样巨噬细胞(MLM)亚群的分化轨迹及其与基质细胞(如Sfrp1-hi/Spp1-hi成纤维细胞)的互作网络 | 研究主要基于全肺灌洗液样本,可能无法完全代表肺组织原位微环境;小鼠模型虽具位点特异性,但与人类疾病进程的完全对应仍需进一步验证 | 阐明矽肺病中巨噬细胞与基质细胞相互作用的分子机制,以识别可干预的免疫-基质轴靶点 | 矽肺病患者(人类)和矽肺病小鼠模型的肺组织免疫与基质细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化/矽肺病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),细胞间通讯建模 | 细胞间通讯网络模型 | 单细胞转录组数据 | 人类矽肺病患者全肺灌洗液样本及矽肺病小鼠模型样本(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |