单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 44757 篇文献，本页显示第 1961 - 1980 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1961 | 2026-09-29 |
MAFF as a potential novel protective factor against Parkinson's disease: evidence from Mendelian randomization and single-cell RNA sequencing
2026, Frontiers in aging neuroscience
IF:4.1Q2
DOI:10.3389/fnagi.2026.1759121
PMID:42798606
|
研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化和单细胞RNA测序等多种方法，探讨了MAFF基因在帕金森病中的潜在保护作用及分子机制 | 首次综合运用孟德尔随机化、单细胞RNA测序、分子对接和药物预测等多种方法，系统揭示MAFF作为帕金森病潜在保护因子的作用机制，并发现MAFF在内皮细胞晚期分化阶段高表达 | 研究主要基于公共数据库数据，临床样本量有限，MAFF的具体调控机制仍需进一步体内外实验验证 | 探究MAFF在帕金森病中的潜在作用机制，并寻找新的治疗靶点 | 帕金森病患者样本、小鼠模型、公共数据库中的帕金森病相关数据集 | 机器学习 | 帕金森病 | 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序, RT-qPCR, ELISA, 分子对接 | NA | 基因表达数据, 图像, 文本 | 多个公共数据库数据集及小鼠和临床血清样本，具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1962 | 2026-09-29 |
Single-cell and bulk transcriptomic analyses define an IFI27-centered interferon-response epithelial state in bladder cancer and its transcriptional response to irradiation
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1920354
PMID:42798643
|
研究论文 | 该研究通过单细胞和批量转录组分析，在膀胱癌中定义了一种以IFI27为中心的干扰素反应性上皮细胞状态，并探讨了其对电离辐射的转录反应 | 首次通过重复非负矩阵分解（NMF）在膀胱癌中可重复地鉴定出以IFI27为中心的上皮干扰素反应程序，并构建了基于IFI27、ISG15和IFI6的三基因干扰素反应评分，揭示了该状态在患者间的显著变异及其与抗原呈递、趋化因子和免疫调节特征的协调关系，同时证明了该程序组分对电离辐射具有剂量相关的转录反应 | 研究主要基于转录组数据分析，缺乏空间、蛋白质水平和功能层面的验证；CD274表达稀疏且与连续评分无稳定关联；体外实验仅使用T24细胞系和qRT-PCR验证有限转录本，样本量有限 | 在膀胱癌中解析可重复的上皮干扰素反应状态，表征其免疫背景，并确定其转录组分是否在体外对电离辐射产生反应 | 七例原发性膀胱肿瘤和一份癌旁正常样本的单细胞RNA测序数据，以及TCGA-BLCA队列和T24膀胱癌细胞系 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, qRT-PCR | 非负矩阵分解（NMF） | 转录组数据（单细胞和批量RNA测序数据）, 图像数据 | 39,224个细胞（来自七例原发性膀胱肿瘤和一份癌旁正常样本），其中29,777个为身份门控的肿瘤上皮细胞；TCGA-BLCA队列；T24细胞系接受0、2、4、8 Gy照射 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1963 | 2026-09-29 |
Integrative single-cell and bulk transcriptomics uncovers a lipid metabolism-related lncRNA signature alongside the ELFN1-AS1/LYPLA1 axis driving osteosarcoma progression
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1945005
PMID:42798652
|
研究论文 | 该研究整合骨肉瘤单细胞与批量转录组数据，构建了脂质代谢相关lncRNA预后特征，并验证ELFN1-AS1/LYPLA1轴驱动骨肉瘤进展 | 首次整合单细胞和批量转录组构建骨肉瘤脂质代谢相关lncRNA预后特征，并通过虚拟敲除筛选结合体内外实验验证了ELFN1-AS1/LYPLA1调控轴的功能 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，样本量有限，ELFN1-AS1/LYPLA1轴的分子机制仍需更深入的体内验证 | 揭示脂质代谢相关lncRNA在骨肉瘤中的预后意义和分子调控功能，建立预后分层模型并识别治疗靶点 | 骨肉瘤患者的单细胞转录组数据（GSE152048）和批量转录组及临床数据（TARGET-OS），以及骨肉瘤细胞系和动物模型 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序， 批量转录组测序， WGCNA， LASSO回归， Cox回归， 虚拟敲除筛选 | AUCell， Monocle， CellChat， scTenifoldKnk， LASSO-Cox | 转录组数据， 临床数据， 图像 | GSE152048单细胞数据及TARGET-OS批量转录组和临床数据，具体样本量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq， 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1964 | 2026-09-29 |
Crosstalk between innate immune signaling pathways and integrated TLR, NLRP3 inflammasome, cGAS-STING, and NF-κB networks in sepsis
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1935200
PMID:42798827
|
综述 | 本文全面综述了脓毒症中TLR、NLRP3炎症小体、cGAS-STING和NF-κB先天免疫信号网络之间的串扰及其分子机制 | 将经典和新兴信号通路整合到统一的分子框架中，强调信号网络间的串扰而非单一通路的孤立激活，并结合单细胞转录组学和空间多组学等系统生物学方法提供网络层面的理解 | 作为综述文章，未提供原始实验数据验证所提出的分子框架；对新兴信号通路的讨论可能受限于现有文献的覆盖范围 | 阐明脓毒症中先天免疫信号通路之间的分子架构和动态相互作用，探讨新型生物标志物和治疗靶点 | 脓毒症中TLR、NLRP3炎症小体、cGAS-STING和NF-κB信号网络及其相互作用 | 机器学习 | 脓毒症 | 单细胞转录组学, 空间多组学, 系统生物学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1965 | 2026-09-29 |
Poly pipeline: a polyvalent spatial transcriptomics workflow validated across polyploid and diploid organisms
2026, GigaByte (Hong Kong, China)
DOI:10.46471/gigabyte.190
PMID:42798842
|
研究论文 | 该文章介绍了Poly Pipeline，一个用于空间转录组学分析的通用生物信息学工作流，并在多倍体和二倍体生物中进行了验证 | 提出了一个稳健且通用的生物信息学工作流，集成了专有格式转换器、聚类算法和hdWGCNA共表达网络，能够间接保留低表达重复基因的表达特征，特别针对多倍体植物复杂基因组分析进行了优化 | 摘要中未明确提及该研究的局限性 | 解决空间转录组学在数据标准化、稀疏性以及复杂基因组（尤其是多倍体植物）分析方面的挑战 | 小麦、水稻和小鼠的空间转录组学数据集 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | hdWGCNA共表达网络 | 图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1966 | 2026-09-29 |
Single-cell RNA sequencing data processing using cloud-based serverless computing
2026, GigaByte (Hong Kong, China)
DOI:10.46471/gigabyte.191
PMID:42798834
|
研究论文 | 本文提出了一种利用无服务器云计算加速单细胞RNA测序数据分析流程的新方法，并在多个数据集上验证了其性能 | 首次将无服务器云函数用于单细胞RNA测序数据分析，构建按需“超级计算机”，显著加速计算密集型工作流 | 未提及具体局限性，可能受限于云服务提供商的函数计算限制、冷启动延迟、数据传输成本等 | 利用无服务器云计算优化单细胞RNA测序数据分析流程，提高计算效率 | 外周血单核细胞数据集和人类胰腺分化敲除数据集 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | 两个公开PBMC数据集和一个包含13个样本的450 GB人类scRNA-seq敲除数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1967 | 2026-09-29 |
Multi-omics characterization of anoikis-related hub genes and macrophage-centered immune persistence with validation of HAVCR2 in atherosclerosis
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1918938
PMID:42798870
|
研究论文 | 该研究通过整合批量转录组数据和单细胞RNA测序数据，结合机器学习算法鉴定动脉粥样硬化中与失巢凋亡相关的核心枢纽基因，并以HAVCR2为重点在体内外实验中进行验证 | 首次系统性地将失巢凋亡相关基因与动脉粥样硬化的免疫持续性和斑块进展联系起来，揭示了以巨噬细胞为中心的失巢凋亡相关免疫特征，并通过多组学整合和实验验证确定了HAVCR2等八个核心枢纽基因作为潜在的诊断和治疗靶点 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据分析，样本量有限，缺乏大规模前瞻性临床队列验证；HAVCR2在动脉粥样硬化中的具体分子机制尚未完全阐明 | 系统表征动脉粥样硬化中失巢凋亡相关枢纽基因及以巨噬细胞为中心的免疫持续性，并验证HAVCR2在动脉粥样硬化中的作用 | 动脉粥样硬化患者血管组织样本、oxLDL刺激的THP-1来源巨噬细胞、高脂饮食喂养的ApoE-/-小鼠 | 机器学习, 数字病理学 | 心血管疾病 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 | LASSO回归, 随机森林 | 基因表达数据, 图像 | 两个公共批量转录组数据集（GSE100927和GSE28829），具体样本数未在摘要中明确说明 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1968 | 2026-09-29 |
Fibroblast-centered mechanisms of chronic inflammation and airway remodeling in allergic bronchopulmonary aspergillosis
2026, Frontiers in allergy
IF:3.3Q2
DOI:10.3389/falgy.2026.1952768
PMID:42798922
|
综述 | 本文综述了过敏性支气管肺曲霉病（ABPA）中成纤维细胞在慢性炎症和气道重塑中的核心作用机制 | 提出以成纤维细胞为中心的机制框架，整合ABPA、真菌相关气道疾病和肺纤维化的证据，系统阐述成纤维细胞亚群通过趋化因子招募嗜酸性粒细胞形成正反馈环路，以及驱动肌成纤维细胞转化和不可逆气道重塑的机制 | 作为综述文章，缺乏原始实验数据验证所提出的机制框架；单细胞转录组学、空间组学等新技术的整合应用尚处于展望阶段 | 系统阐明成纤维细胞在ABPA慢性炎症和气道重塑中的机制，探索从单纯免疫抑制向组织修复联合调控的治疗转变 | ABPA患者、真菌相关气道疾病及肺纤维化相关的成纤维细胞及其亚群 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组学， 空间组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序， 空间转录组学 | NA | NA |
| 1969 | 2026-09-29 |
Integrative identification and preliminary validation of senescence-associated secretory phenotype-related candidate biomarkers in type 2 diabetes
2026, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.21729
PMID:42799503
|
研究论文 | 该研究通过文献挖掘、差异表达分析和机器学习筛选与2型糖尿病衰老相关分泌表型（SASP）相关的候选生物标志物，并在多个独立队列中进行验证，发现CCL8和MMP9是关键候选基因。 | 首次系统性地筛选和验证了T2DM中SASP相关的血液候选生物标志物，并提供了整合性工作流程 | RT-qPCR的验证仅在小队列中进行，属于探索性支持 | 系统筛选和验证2型糖尿病中SASP相关的候选生物标志物 | 2型糖尿病患者的血液样本及相关基因表达数据 | 机器学习 | 2型糖尿病 | 转录组分析, RT-qPCR | 机器学习 | 基因表达数据, 文本 | 多个队列包括GSE184050和GSE280401，以及一个小队列用于RT-qPCR验证 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1970 | 2026-09-29 |
Spatially varying gene regulation network inference from spatial transcriptomics
2026, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbag230
PMID:42801027
|
研究论文 | 提出SVGRN深度学习框架，从空间转录组数据推断空间变化的基因调控网络 | 首次在结构方程建模框架中整合基因表达、调控相互作用和空间坐标，通过条件变分自编码器以无监督方式学习非线性空间变化的调控程序，将组织水平调控细化到spot或细胞特异性水平 | 摘要中未明确提及 | 从空间转录组数据推断空间变化的高分辨率基因调控网络 | 模拟数据集、seqFISH小鼠胚胎数据、Visium人类皮肤鳞状细胞癌和输卵管数据集 | 机器学习 | 皮肤鳞状细胞癌 | 空间转录组学 | 条件变分自编码器 | 图像、文本 | NA | NA | 空间转录组学 | seqFISH, 10x Visium | NA |
| 1971 | 2026-09-29 |
Liposomal-Mitoxantrone Overcomes Acquired Resistance and Enhances Venetoclax Synergy in AML-Mechanistic Insights and Preliminary Clinical Evidence
2026, International journal of nanomedicine
IF:6.6Q1
DOI:10.2147/IJN.S634276
PMID:42801107
|
研究论文 | 该研究比较了脂质体米托蒽醌与游离米托蒽醌在急性髓系白血病中的抗白血病活性、血液学毒性、耐药演变及细胞死亡通路，并结合初步临床观察 | 首次系统揭示脂质体再制剂可从根本上重塑米托蒽醌的治疗反应与耐药演化，不仅降低血液学毒性，还能抑制耐药克隆的出现并增强与维奈克拉的协同效应 | 临床证据仅来自四例患者的探索性观察，样本量有限，机制研究主要基于MLL-AF9小鼠模型和MOLM13细胞系，尚需更大规模临床试验验证 | 探究脂质体再制剂是否能以及如何从根本上重塑化疗药物的治疗反应和耐药演化 | MLL-AF9驱动的急性髓系白血病小鼠模型、MOLM13细胞系以及接受脂质体米托蒽醌联合维奈克拉治疗的四例患者 | 机器学习, 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本, 图像 | MLL-AF9驱动急性髓系白血病小鼠模型、MOLM13细胞系以及四例接受脂质体米托蒽醌联合维奈克拉治疗的患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1972 | 2026-09-29 |
Integrated Multi-Omics Analyses Identify TYMP as a Candidate Protective Immunoregulatory Marker in CD4⁺ T Cells During Sepsis
2026, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S632459
PMID:42801117
|
研究论文 | 该研究通过整合单细胞eQTL孟德尔随机化、批量转录组分析、遗传共定位、单细胞RNA测序及前瞻性临床队列，鉴定TYMP为脓毒症中CD4⁺T细胞的候选保护性免疫调节标志物 | 首次整合sc-eQTL孟德尔随机化、遗传共定位、单细胞转录组和前瞻性临床队列多组学分析，从遗传学角度支持TYMP作为脓毒症中CD4⁺T细胞保护性免疫调节标志物 | 前瞻性验证队列样本量较小（仅30例），且单细胞数据集为公共数据重分析，结论仍需更大队列验证 | 通过整合多组学分析鉴定与脓毒症相关的、有遗传学支持的候选免疫遗传调控因子 | 脓毒症患者及公共数据库中脓毒症相关数据集 | 机器学习, 数字病理学 | 脓毒症 | sc-eQTL孟德尔随机化, 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 遗传共定位, ELISA | 孟德尔随机化, 共定位分析, 伪时间轨迹分析 | 文本, 图像, 临床数据 | 公共数据集（FinnGen脓毒症GWAS、OneK1K sc-eQTL、GSE65682批量转录组、GSE167363和GSE151263单细胞数据集）及30例前瞻性脓毒症患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, sc-eQTL | NA | NA |
| 1973 | 2026-09-29 |
ScGeo reveals non-canonical trajectories beyond RNA velocity in radiation-induced hematopoietic recovery
2026, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbag266
PMID:42801126
|
研究论文 | 该文提出ScGeo框架，将单细胞嵌入作为定量对象，评估扰动相关的几何位移、样本不确定性、局部几何保持、跨表示稳定性及与RNA velocity的一致性，并在多个辐射造血恢复等数据集上验证 | 提出表示感知的ScGeo框架，将嵌入视为定量对象并报告稳健状态位移、生物样本不确定性、局部几何保持、跨表示稳定性、分布变化以及与独立动力学估计的一致性，避免仅凭可视化解读扰动几何 | 合成基准显示局部失真的细粒度定位仍然有限，GSE249479因缺乏生物重复身份仅能作描述性分析，部分数据集受表示敏感性影响 | 建立一个可审计的下游分析层，区分稳定、中性、覆盖不足和表示敏感的解释，而非假设单一潜在空间具有生物学决定性 | 辐射后造血恢复、胰腺发育、炎症刺激的造血干祖细胞以及肺辐射损伤的单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | GSE280305辐照后造血恢复、GSE132188胰腺发育、GSE249479造血干祖细胞炎症、GSE211713肺辐射等多个数据集，具体样本数未明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1974 | 2026-09-29 |
Integrated Transcriptomic and Machine Learning Analyses Identify KCNN3 and TLR10 as Candidate Cell-Type-Associated Molecules in Idiopathic Membranous Nephropathy
2026, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S633417
PMID:42801211
|
研究论文 | 该研究整合批量RNA测序、机器学习和单细胞RNA测序，筛选并初步验证特发性膜性肾病的细胞类型相关关键分子 | 联合批量转录组、机器学习和单细胞转录组筛选出KCNN3和TLR10作为IMN细胞类型相关候选分子，并预测足细胞与树突状细胞通过CXCL12-CXCR4轴相互作用 | 外部数据集验证中KCNN3和TLR10表达趋势不一致，联合AUC较单基因模型无显著提升，且样本量有限 | 筛选并初步验证特发性膜性肾病进展相关的关键分子，为后续研究提供依据 | 特发性膜性肾病患者尿液和肾脏组织样本 | 机器学习 | 特发性膜性肾病 | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 免疫荧光 | 机器学习 | 文本, 图像 | 未明确说明 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1975 | 2026-09-29 |
Neutrophil-Related Gene Signatures for Ischemic Stroke Diagnosis
2026, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究通过机器学习和单细胞RNA测序探索中性粒细胞胞外诱捕网相关基因在缺血性脑卒中中的诊断价值 | 首次结合机器学习和scRNA-seq识别缺血性脑卒中中性粒细胞胞外诱捕网相关基因的诊断模型 | 需要更多实验验证DE-NRGs在缺血性脑卒中中的作用 | 探索NRGs在缺血性脑卒中中的机制及其诊断潜力 | 缺血性脑卒中患者和小鼠大脑中动脉闭塞模型 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1976 | 2026-09-29 |
Integrative transcriptomic analysis of peripheral blood identifies NETosis-associated programs and a stratified adaptive immune suppression pattern in severe acute pancreatitis
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0349692
PMID:42789536
|
研究论文 | 该研究对外周血RNA-seq数据进行整合转录组分析，识别严重急性胰腺炎中的NETosis相关程序及分层适应性免疫抑制模式 | 建立SAP vs HC与SAP vs MAP双重比较框架以区分广泛AP相关改变与器官衰竭相关特征，并整合三种机器学习算法、WGCNA与ssGSEA识别候选基因及免疫特征，提出分层适应性免疫抑制模式和NETosis相关基因三联体 | 缺乏独立外部验证队列，大鼠回肠scRNA-seq仅提供支持性跨物种细胞类型背景而非确定性验证，单基因估计仅通过重复分层5折交叉验证支持内部稳定性 | 阐明从轻度急性胰腺炎向重症谱系疾病进展的转录组机制，并识别有持续器官衰竭风险患者的早期候选转录组标志物 | 外周血RNA-seq数据来自GSE194331，包括健康对照、轻度急性胰腺炎和重症谱系AP患者；大鼠回肠组织scRNA-seq数据来自GSE244963作为支持性细胞类型背景 | 转录组学, 机器学习 | 急性胰腺炎, 严重急性胰腺炎, 器官衰竭 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 基因集富集分析, ssGSEA, LASSO, 随机森林, SVM-RFE, WGCNA | LASSO, 随机森林, SVM-RFE | 转录组数据, 基因表达数据 | GSE194331共119例：健康对照32例、轻度急性胰腺炎57例、重症谱系AP组30例（MSAP 20例和SAP 10例），入院24小时内采样；GSE244963为大鼠回肠单细胞RNA-seq支持性数据 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1977 | 2026-09-29 |
APOE4 to APOE2 allelic switching in mice improves Alzheimer's disease-related metabolic signatures, neuropathology and cognition
2025-Dec, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-025-02094-y
PMID:41219507
|
研究论文 | 该研究开发了一种可诱导的APOE4到APOE2等位基因切换小鼠模型，发现全身或星形胶质细胞特异性切换可改善AD相关代谢、神经病理和认知 | 首次构建了可诱导的APOE4到APOE2等位基因切换敲入小鼠模型（APOE4s2），并证明星形胶质细胞特异性APOE替换可同时减少多种AD相关病理 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证；长期切换效果和安全性未知；未明确切换的最佳时间窗口 | 探究APOE4到APOE2等位基因切换对阿尔茨海默病相关代谢特征、神经病理和认知功能的影响 | APOE4s2敲入小鼠模型、5xFAD背景小鼠、人类APOE2/E2代谢谱 | 机器学习, 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 基因表达分析, 蛋白质组学分析, 单细胞转录组, 脂质组学 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学, 脂质组学 | NA | NA |
| 1978 | 2026-09-29 |
Analysis of individual patient pathway coordination in a cross-species single-cell kidney atlas
2025-Aug, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-025-02285-0
PMID:40775269
|
研究论文 | 该研究构建了跨物种单细胞肾脏图谱，并开发了计算工具CellSpectra，用于量化个体患者中细胞类型特异性的基因表达协调变化 | 构建了包含超过100万个细胞、140个样本的跨物种单细胞肾脏图谱，定义了70多种保守的细胞状态；开发了CellSpectra工具，能够量化细胞功能中基因表达协调的变化，并生成患者级别的单细胞功能分析报告 | 未明确提及 | 推动单细胞方法在临床精准医学中的应用，通过跨物种图谱和计算工具识别个体患者中可靶向的分子变化 | 人类和啮齿类动物模型的肾脏样本，以及肾脏和肺癌数据 | 单细胞分析、精准医学 | 肾脏疾病、肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 140个样本，超过100万个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1979 | 2026-09-29 |
A single-cell plume transcriptome atlas of the cold-seep tubeworm Paraescarpia echinospica
2025-06-17, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-025-05392-z
PMID:40527908
|
研究论文 | 该文章构建了深海管虫Paraescarpia echinospica羽状器官的单细胞转录组图谱，并分析了其中的细胞类型和功能基因 | 首次对深海管虫的羽状器官进行单细胞分辨率分析，揭示了六种细胞簇及其与免疫和运输相关的基因 | 摘要中未提及研究局限性 | 解析深海管虫Paraescarpia echinospica羽状器官的细胞异质性，为后续单细胞研究奠定基础 | 深海管虫Paraescarpia echinospica的羽状器官 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1980 | 2026-09-29 |
A single-cell RNA-seq dataset of synovial fluid from rheumatoid arthritis treated with TNF-α/JAK inhibitor
2025-06-10, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-025-05339-4
PMID:40494845
|
研究论文 | 该研究对接受TNF-α抑制剂阿达木单抗或JAK抑制剂托法替布治疗的类风湿关节炎患者滑液进行单细胞RNA测序分析，涵盖治疗前后配对样本 | 首次针对类风湿关节炎患者滑液进行配对治疗前后的单细胞RNA测序，并比较TNF-α抑制剂与JAK抑制剂的单细胞水平影响 | 摘要未提及具体局限性 | 探索TNF-α和JAK抑制剂对类风湿关节炎的单细胞影响，推动类风湿关节炎精准医学发展 | 接受托法替布或阿达木单抗治疗的类风湿关节炎患者的滑液样本 | 单细胞组学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 100387个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |