单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27574 篇文献，本页显示第 19681 - 19700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 19681 | 2024-08-08 |
A flexible cross-platform single-cell data processing pipeline
2022-11-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-34681-z
PMID:36369450
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研究论文 | 介绍了一种名为UniverSC的通用单细胞RNA测序数据处理工具，支持基于任何唯一分子标识符的平台，并提供跨平台的图形用户界面 | UniverSC工具支持多种平台，并提供了一个图形用户界面，使得非生物信息学专业的研究人员也能进行数据处理 | NA | 开发一种通用的单细胞RNA测序数据处理工具，以简化数据处理过程 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA |
| 19682 | 2024-08-08 |
Droplet Microfluidics Enables Tracing of Target Cells at the Single-Cell Transcriptome Resolution
2022-Nov-10, Bioengineering (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/bioengineering9110674
PMID:36354585
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研究论文 | 本文开发了一种基于液滴微流控技术的全液滴方法，用于TCR-T细胞的监测，实现了从液滴筛选到单细胞转录组测序的一体化流程 | 本文提出的全液滴方法避免了传统方法中液滴破乳和重新封装的繁琐操作，提高了操作的便捷性和芯片的市场化进程 | NA | 开发一种高效、便捷的单细胞转录组测序技术，用于监测TCR-T细胞，推动过继性T细胞免疫治疗的发展 | TCR-T细胞 | 生物技术 | NA | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | TCR-T细胞 |
| 19683 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveals cellular heterogeneity and molecular stratification of cervical cancer
2022-11-10, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-04142-w
PMID:36357663
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了宫颈癌的细胞异质性和分子分层 | 首次揭示了宫颈癌细胞的广泛异质性，并识别了不同亚型的宫颈癌及其预后特征 | NA | 探究宫颈癌的细胞异质性和分子分层，为精准预后和治疗分层提供基础 | 宫颈癌及其配对的正常邻近非肿瘤样本 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 57,669个细胞，来自三个宫颈癌肿瘤及其配对的正常邻近非肿瘤样本 |
| 19684 | 2024-08-08 |
Pan-cancer analysis of UBE2T with a focus on prognostic and immunological roles in lung adenocarcinoma
2022-Nov-10, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-022-02226-z
PMID:36357897
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研究论文 | 本文通过分析UBE2T在33种肿瘤类型中的表达及其对预后的影响，探讨了其在肺癌腺癌中的功能和免疫学作用 | 首次进行了UBE2T在泛癌中的功能、预后和预测意义的分析 | NA | 研究UBE2T在多种癌症中的作用及其对预后和免疫治疗反应的预测价值 | UBE2T基因在泛癌中的表达及其对肺癌腺癌预后和免疫学影响 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | LASSO Cox回归模型 | 基因表达数据 | 33种肿瘤类型的数据，以及TCGA和ICGC数据库中的肺癌腺癌患者数据 |
| 19685 | 2024-08-08 |
Dysregulation of neuroprotective astrocytes, a spectrum of microglial activation states, and altered hippocampal neurogenesis are revealed by single-cell RNA sequencing in prion disease
2022-11-09, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-022-01450-4
PMID:36352465
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，分析了感染朊病毒并出现临床症状的小鼠大脑皮层和海马区的单细胞转录组图谱，揭示了神经保护性星形胶质细胞的失调、微胶质细胞激活状态的多样性以及海马神经发生的变化。 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了朊病毒疾病中大脑细胞类型及其亚型的转录特征，特别是星形胶质细胞和微胶质细胞的功能变化。 | 研究仅限于小鼠模型，可能需要进一步的人体研究来验证这些发现。 | 旨在通过单细胞RNA测序技术深入理解朊病毒疾病中的细胞互作和神经退行性变的机制。 | 感染朊病毒的小鼠大脑皮层和海马区的单细胞转录组。 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 转录组 | 147,536个单细胞转录组 |
| 19686 | 2024-08-08 |
Single cell sequencing reveals that CD39 inhibition mediates changes to the tumor microenvironment
2022-11-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-34495-z
PMID:36347860
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术分析，发现CD39抑制剂能改变膀胱癌的肿瘤微环境，从而限制肿瘤生长并提高携带肿瘤小鼠的总体生存率 | 首次通过单细胞转录组分析确定CD39为膀胱癌的治疗靶点，并发现CD39抑制剂能增加肿瘤内NK细胞、cDC1和CD8+ T细胞的数量，减少Treg细胞的数量 | 研究未探讨CD39抑制剂与其他免疫检查点抑制剂联合使用的协同效应 | 探索CD39作为膀胱癌免疫治疗新靶点的潜力 | 膀胱癌及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及皮下肿瘤模型和原位膀胱癌模型中的小鼠样本 |
| 19687 | 2024-08-08 |
Laying the foundation for single-cell studies in bats
2022-11-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2022.10.010
PMID:36351371
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组学技术研究了Eonycteris spelaea蝙蝠肺组织中的免疫细胞谱，揭示了Pteropine orthoreovirus (PRV3M)感染后的体内免疫反应 | 首次在蝙蝠中应用单细胞转录组学技术，为未来比较免疫学研究提供了范例 | NA | 探索蝙蝠作为病毒宿主的免疫反应机制 | Eonycteris spelaea蝙蝠肺组织中的免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 19688 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome analysis of the in vivo response to viral infection in the cave nectar bat Eonycteris spelaea
2022-11-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2022.10.008
PMID:36351376
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术分析了洞果蝠在体内感染双链RNA病毒后的免疫反应 | 首次详细描述了洞果蝠在病毒感染后肺部免疫细胞的动态变化及其分子机制 | NA | 探究洞果蝠在病毒感染后的免疫反应机制 | 洞果蝠的肺部免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 19689 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome profiling and chromatin accessibility reveal an exhausted regulatory CD4+ T cell subset in systemic lupus erythematosus
2022-11-08, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111606
PMID:36351407
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研究论文 | 本研究通过ATAC-seq和单细胞转录组测序技术，分析了系统性红斑狼疮（SLE）患者和健康对照者的外周CD4 T细胞的异质性，揭示了Treg细胞的转录功能障碍及其与疾病严重性的关联。 | 本研究首次揭示了SLE患者中具有功能性衰竭特征的CCR7CD74 Treg亚群，为理解SLE的发病机制提供了新的视角。 | NA | 探索系统性红斑狼疮（SLE）中CD4 T细胞的调控组异质性及其与疾病发生的关系。 | 系统性红斑狼疮（SLE）患者和健康对照者的外周CD4 T细胞。 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | ATAC-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 72名SLE患者和30名健康对照者的外周CD4 T细胞 |
| 19690 | 2024-08-08 |
Progesterone Promotes In Vitro Maturation of Domestic Dog Oocytes Leading to Successful Live Births
2022-Nov-03, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life12111778
PMID:36362933
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研究论文 | 本研究探讨了孕酮在体外成熟犬卵母细胞中的作用，并通过优化体外成熟系统成功获得了活体犬。 | 首次通过添加孕酮优化犬卵母细胞的体外成熟系统，成功获得活体犬，并建立了一种新的低成本犬只生产方法。 | NA | 研究孕酮在犬卵母细胞体外成熟中的作用，并优化体外成熟系统以提高效率和降低成本。 | 犬卵母细胞的体外成熟及其质量评估。 | 生物医学研究 | NA | 体外受精和单细胞RNA测序 | NA | 卵母细胞 | 使用了不同孕酮浓度的微滴培养的犬卵母细胞 |
| 19691 | 2024-08-08 |
Gonadal Sex Differentiation and Ovarian Organogenesis along the Cortical-Medullary Axis in Mammals
2022-Nov-02, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms232113373
PMID:36362161
|
综述 | 本文综述了哺乳动物沿着皮质-髓质轴的性腺性别分化和卵巢器官发生的机制 | 揭示了支持细胞系的双波增殖及其在性腺性别分化早期阶段和围产期阶段的形成过程中的细胞和分子事件 | NA | 探讨性腺性别分化沿着皮质-髓质轴的机制，并比较不同哺乳动物卵巢皮质和髓质区域的特征 | 哺乳动物的性腺性别分化和卵巢器官发生 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组 | NA |
| 19692 | 2024-08-08 |
Spatial transcriptomics with light barcodes in intact tissues
2022-11, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01577-8
PMID:36347989
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 19693 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq relates GWAS variants to disease risk
2022-11, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01570-1
PMID:36347991
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 19694 | 2024-08-08 |
Cross-protection against African swine fever virus upon intranasal vaccination is associated with an adaptive-innate immune crosstalk
2022-11, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1010931
PMID:36350837
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研究论文 | 本研究探讨了通过鼻内疫苗接种非洲猪瘟病毒（ASFV）后诱导的免疫反应及其对病毒的交叉保护作用 | 首次详细描述了鼻内接种BA71ΔCD2突变病毒后，从适应性免疫到先天免疫的正反馈机制，以及这种机制如何促进对ASFV的交叉保护 | NA | 研究非洲猪瘟病毒的免疫保护机制，为开发有效疫苗提供理论基础 | 非洲猪瘟病毒及接种疫苗后的猪免疫细胞反应 | NA | 非洲猪瘟 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 接种疫苗的猪的血液和淋巴结细胞 |
| 19695 | 2024-08-08 |
A spatiotemporally resolved single-cell atlas of the Plasmodium liver stage
2022-Nov, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-05406-5
PMID:36352220
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序和单分子转录成像技术，研究了鼠疟原虫在肝脏阶段与宿主肝细胞的时空表达程序 | 首次揭示了肝细胞分区对寄生虫分子水平发育的影响，并识别了不同区域中寄生虫基因表达的差异 | NA | 旨在深入理解疟原虫肝脏阶段的感染机制 | 鼠疟原虫Plasmodium berghei ANKA及其宿主肝细胞 | 数字病理学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序，单分子转录成像 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未明确提及 |
| 19696 | 2024-08-08 |
The neurons that restore walking after paralysis
2022-Nov, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-05385-7
PMID:36352232
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研究论文 | 本文展示了通过在神经康复期间对腰椎脊髓进行时空经皮电刺激（EES），在九名慢性脊髓损伤患者中恢复行走能力 | 本文首次识别出在脊髓损伤后通过EES恢复行走所必需的特定神经元亚群，并展示了这些神经元在恢复行走中的关键作用 | NA | 旨在识别脊髓损伤后恢复行走所必需的神经元亚群 | 慢性脊髓损伤患者及小鼠模型 | 神经科学 | 脊髓损伤 | 单核RNA测序和空间转录组学 | NA | 分子数据 | 九名慢性脊髓损伤患者及小鼠模型 |
| 19697 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Distinct Cardiac-Derived Stromal Cell Subpopulations
2022-Nov-01, Journal of cardiovascular development and disease
IF:2.4Q2
DOI:10.3390/jcdd9110374
PMID:36354773
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了新生儿和儿童来源的心脏基质细胞亚群，以优化基于心脏基质细胞的治疗并改善患者预后 | 首次使用单细胞RNA测序技术深入研究新生儿和儿童心脏基质细胞的亚群差异，并识别出与纤维化和免疫反应相关的基因上调 | 研究仅限于新生儿和儿童的心脏基质细胞样本，未来研究需扩展到更多年龄段和样本类型 | 旨在通过单细胞水平的研究，识别和表征心脏基质细胞亚型，以优化基于心脏基质细胞的治疗 | 新生儿和儿童的心脏基质细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 4个新生儿心脏基质细胞样本和5个儿童心脏基质细胞样本 |
| 19698 | 2024-08-08 |
A Case Series Exploration of Multi-Regional Expression Heterogeneity in Triple-Negative Breast Cancer Patients
2022-Nov-01, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms232113322
PMID:36362107
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研究论文 | 本研究探索了三阴性乳腺癌患者中的多区域表达异质性，通过评估基因表达和影像学来源的多区域差异 | 开发了一种新的分析框架来解析和表征不同类型的变异性，并进行了贝叶斯变化点分析来评估和分类区域变异性 | 研究样本量有限，仅涉及10名三阴性乳腺癌患者 | 探索三阴性乳腺癌中的肿瘤内异质性及其对治疗抵抗的影响 | 三阴性乳腺癌患者的肿瘤组织 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA测序 | 贝叶斯变化点分析 | 基因表达数据和影像数据 | 10名三阴性乳腺癌患者，每个肿瘤2-4个区域 |
| 19699 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing analysis and transcriptome analysis constructed the macrophage related gene-related signature in lung adenocarcinoma and verified by an independent cohort
2022-11, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2022.110520
PMID:36372305
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和转录组分析构建了与巨噬细胞相关的基因特征，并在肺腺癌中进行了验证 | 首次基于巨噬细胞在肺腺癌中的不同免疫模式，构建了一个四基因的预后特征 | NA | 探索巨噬细胞与肺腺癌患者预后的关系，并构建预后特征 | 肺腺癌患者的巨噬细胞相关基因和免疫模式 | 数字病理学 | 肺腺癌 | sc-RNAseq, ssGSEA, CIBERSORT | NA | 基因表达数据 | 两个sc-RNAseq数据集，TCGA-LUAD队列，五个GEO-LUAD数据集和包含112个肺腺癌样本的独立队列 |
| 19700 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing highlights the functional role of human endogenous retroviruses in gallbladder cancer
2022-Nov, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2022.104319
PMID:36374772
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了人内源性逆转录病毒在胆囊癌中的功能作用 | 发现HERVs在胆囊癌中以细胞类型特异性的方式转录，并与不同的生物学效应相关，HERVH可能作为胆囊癌的早期诊断标志物 | NA | 探索HERVs在胆囊癌中的转录景观及其潜在功能影响 | 胆囊癌组织及其配对邻近组织中的HERVs | 数字病理学 | 胆囊癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 4名胆囊癌患者的肿瘤组织及其配对邻近组织 |