单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27574 篇文献，本页显示第 19641 - 19660 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 19641 | 2024-08-08 |
Identification of diagnostic genes for both Alzheimer's disease and Metabolic syndrome by the machine learning algorithm
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1037318
PMID:36405716
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研究论文 | 本研究通过机器学习算法识别阿尔茨海默病和代谢综合征的共同诊断基因 | 首次使用机器学习方法识别在阿尔茨海默病和代谢综合征中具有共同诊断作用的基因，并探讨了这些基因与免疫细胞浸润的关系 | NA | 旨在识别对阿尔茨海默病和代谢综合征具有共同诊断作用的基因 | 阿尔茨海默病和代谢综合征的共同诊断基因 | 机器学习 | 阿尔茨海默病, 代谢综合征 | WGCNA, RF, LASSO, XGBoost, CIBERSORT, scRNA-seq, ssGSEA | 机器学习模型 | 微阵列数据, 单细胞RNA测序数据 | 阿尔茨海默病数据集（GSE63060和GSE63061合并），代谢综合征数据集（GSE98895），以及阿尔茨海默病患者和正常个体的外周血单个核细胞单细胞RNA测序数据 |
| 19642 | 2024-08-08 |
Pan-cancer analysis identifies migrasome-related genes as a potential immunotherapeutic target: A bulk omics research and single cell sequencing validation
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.994828
PMID:36405728
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研究论文 | 本研究通过泛癌分析和单细胞测序验证，探讨了migrasome相关基因作为潜在免疫治疗靶点的可能性 | 首次进行了migrasome的泛癌分析，并发现其在肿瘤发展和免疫逃逸中的重要作用 | NA | 探究migrasome在肿瘤免疫和肿瘤微环境中的作用及其作为免疫治疗靶点的潜力 | migrasome相关基因在33种癌症类型中的表达、预后、遗传变异和药物敏感性 | 数字病理学 | NA | 免疫组织化学(IHC), 单细胞转录组测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据, 拷贝数变异原始数据, 甲基化数据 | 33种癌症类型的基因数据, 114例结直肠癌的免疫组织化学验证 |
| 19643 | 2024-08-08 |
Identifying hub genes of calcific aortic valve disease and revealing the immune infiltration landscape based on multiple WGCNA and single-cell sequence analysis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1035285
PMID:36405745
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析，结合加权基因共表达网络分析（WGCNA）和单细胞测序技术，鉴定了钙化性主动脉瓣疾病（CAVD）中的关键基因，并揭示了免疫细胞浸润的特征 | 本研究首次结合WGCNA和单细胞测序技术，鉴定了CAVD中的关键基因S100A8和S100A9，并分析了这些基因在不同表达水平下的免疫细胞浸润差异 | NA | 旨在确定关键基因和免疫细胞浸润在CAVD进展中的作用 | 钙化性主动脉瓣疾病（CAVD）中的关键基因和免疫细胞浸润 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA）、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 从GEO数据库获取454个差异表达基因，基于六种不同的人类主动脉瓣叶进行单细胞RNA测序 |
| 19644 | 2024-08-08 |
Integrating bulk and single-cell sequencing reveals the phenotype-associated cell subpopulations in sepsis-induced acute lung injury
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.981784
PMID:36405762
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研究论文 | 本研究通过整合批量和单细胞测序数据，揭示了败血症诱导的急性肺损伤中与表型相关的细胞亚群 | 首次提供了败血症肺损伤中单细胞水平的细胞变化视图，并通过Scissors方法整合批量和单细胞数据，识别了与败血症肺损伤表型最相关的细胞亚群 | NA | 系统阐明败血症损伤肺组织中主要构成细胞的转录组变化 | 败血症和对照小鼠的肺组织样本 | 数字病理学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 25044个细胞，包括11317个免疫细胞和13727个非免疫细胞 |
| 19645 | 2024-08-08 |
Identification of Glucose Metabolism-Related Genes in the Progression from Nonalcoholic Fatty Liver Disease to Hepatocellular Carcinoma
2022, Genetics research
IF:1.4Q4
DOI:10.1155/2022/8566342
PMID:36407083
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研究论文 | 本研究通过加权基因共表达网络分析，基于多组学数据识别出两个共表达模块，用于区分非酒精性脂肪肝病亚型，并构建了肝细胞癌患者的预后模型 | 首次发现葡萄糖代谢途径在非酒精性脂肪肝病向肝细胞癌进展中的重要作用，并识别出三个可能的免疫治疗靶点 | NA | 探索非酒精性脂肪肝病与肝细胞癌之间的分子联系，并识别潜在的治疗靶点 | 非酒精性脂肪肝病患者的肝组织及肝细胞癌细胞 | NA | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 19例非酒精性脂肪肝病患者肝组织 |
| 19646 | 2024-08-08 |
Intercellular communication analysis of the human retinal pigment epithelial and choroidal cells predicts pathways associated with aging, cellular senescence and age-related macular degeneration
2022, Frontiers in aging neuroscience
IF:4.1Q2
DOI:10.3389/fnagi.2022.1016293
PMID:36408112
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研究论文 | 研究分析了人视网膜色素上皮细胞和脉络膜细胞间的细胞间通讯，预测了与衰老、细胞衰老及年龄相关性黄斑变性相关的通路 | 通过应用CellChat和scDiffCom分析公开的scRNA-seq数据集，识别了与衰老和细胞衰老相关的细胞间通讯通路，并发现这些通路的信号强度在具有高衰老评分的细胞亚群中增强 | 研究依赖于公开的scRNA-seq和微阵列数据集，可能存在数据质量和样本代表性的限制 | 探讨视网膜色素上皮细胞和脉络膜细胞间的细胞间通讯在衰老、细胞衰老及年龄相关性黄斑变性中的作用 | 人视网膜色素上皮细胞和脉络膜细胞 | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | scRNA-seq, 微阵列 | CellChat, scDiffCom | scRNA-seq数据, 微阵列数据 | 三个健康人和三个AMD患者的样本 |
| 19647 | 2024-08-05 |
Cytoskeletal protein SPTA1 mediating the decrease in erectile function induced by high-fat diet via Hippo signaling pathway
2023-03, Andrology
IF:3.2Q1
DOI:10.1111/andr.13338
PMID:36374586
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研究论文 | 本研究探讨了细胞骨架蛋白SPTA1在高脂饮食诱导的勃起功能下降中的作用 | 揭示了SPTA1通过激活Hippo信号通路导致勃起功能下降的机制 | 研究主要基于小鼠和大鼠模型，临床应用的直接性待进一步验证 | 探索高脂饮食诱导勃起功能异常的机制 | 正常饮食和高脂饮食下的小鼠阴茎组织 | 数字病理学 | NA | 转录组学、免疫组化、实时定量PCR | NA | 生物组织 | 多只普通大鼠和小鼠样本 |
| 19648 | 2024-08-05 |
Biglycan promotes hepatic fibrosis through activating heat shock protein 47
2023-Feb, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver
IF:6.0Q1
DOI:10.1111/liv.15477
PMID:36371672
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研究论文 | 本研究探讨了大肌糖蛋白（BGN）在肝纤维化中的作用及其机制。 | 确认了BGN通过调节HSP47依赖机制影响肝纤维化和细胞外基质沉积。 | 该研究主要基于小鼠模型和细胞实验，临床相关性需要进一步验证。 | 研究BGN在肝纤维化中的作用及其调控机制。 | 使用人类肝样本、BGN缺失小鼠模型及人类LX-2肝星状细胞模型进行研究。 | 数字病理学 | 肝纤维化 | qRT-PCR, 西方印迹, 免疫共沉淀, 免疫荧光染色 | NA | 生物信息数据, 单细胞RNA-seq数据 | 人类肝样本和BGN缺失小鼠模型, LX-2细胞模型 |
| 19649 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-seq uncovers cellular heterogeneity and provides a signature for paediatric sleep apnoea
2023-02, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.01465-2022
PMID:36356973
|
研究论文 | 这篇文章通过单细胞转录组学分析揭示了阻塞性睡眠呼吸暂停（OSA）对外周血单核细胞（PBMC）构成的影响 | 提出了一个由32个基因组成的分子特征，可以精确区分OSA患者与各种对照组 | 文章未详细讨论样本大小和选取的具体标准 | 研究OSA对循环免疫细胞异质性的影响 | 外周血单核细胞（PBMC） | 数字病理学 | 睡眠呼吸暂停 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 机器学习 | 基因表达数据 | 独立PBMC大规模RNA表达数据集 |
| 19650 | 2024-08-05 |
Human scattered tubular cells represent a heterogeneous population of glycolytic dedifferentiated proximal tubule cells
2023-02, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6029
PMID:36373978
|
研究论文 | 本研究表征了人类的散布管细胞（STCs）群体，这是一种在急性肾损伤后数量增加的特殊细胞群体 | 本研究首次揭示了人类STCs是异质性群体，并表明其代谢向糖酵解转变，可能促进肾损伤后的细胞存活 | 研究主要集中于人类STCs的特征，缺乏对其他类型肾细胞的全面比较 | 研究人类散布管细胞（STCs）的特征及其在肾损伤中的角色 | 研究对象为散布管细胞和肾小管上皮细胞 | 数字病理 | 肾脏疾病 | RNA测序 | NA | 组织样本 | 分析了若干人类肾组织样本 |
| 19651 | 2024-08-08 |
Single-cell atlas of epithelial and stromal cell heterogeneity by lobe and strain in the mouse prostate
2023-02, The Prostate
DOI:10.1002/pros.24460
PMID:36373171
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了两种常用小鼠品系（FVB/NJ和C57BL/6J）的6个月龄小鼠前列腺中不同前列腺叶的细胞转录组 | 揭示了基底细胞和腔细胞在小鼠品系和前列腺叶之间存在特定的转录组差异，并发现了三种稀有的独立于品系和叶的细胞群 | NA | 评估组织微环境中细胞类型的复杂相互作用，以理解前列腺疾病的发生和发展及干预机会 | 小鼠前列腺中的上皮细胞和基质细胞 | 数字病理学 | 前列腺疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | FVB/NJ品系2只小鼠，C57BL/6J品系3只小鼠，每只小鼠的前列腺分为前叶、背叶、侧叶和腹叶 |
| 19652 | 2024-08-08 |
Cancer-associated fibroblasts potentiate colorectal cancer progression by crosstalk of the IGF2-IGF1R and Hippo-YAP1 signaling pathways
2023-02, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6033
PMID:36373776
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研究论文 | 本研究探讨了癌症相关成纤维细胞（CAFs）通过IGF2-IGF1R和Hippo-YAP1信号通路的交叉对话促进结直肠癌（CRC）进展的新分子机制 | 发现CAFs分泌的胰岛素样生长因子2（IGF2）通过激活IGF1R和YAP1信号通路促进CRC的肿瘤生长、迁移和侵袭 | NA | 阐明CAF分泌的IGF2在结直肠癌发生中的新分子机制 | 癌症相关成纤维细胞（CAFs）和结直肠癌细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | HCT 116和DLD-1细胞，CRC类器官和体内研究 |
| 19653 | 2024-08-08 |
scHumanNet: a single-cell network analysis platform for the study of cell-type specificity of disease genes
2023-01-25, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac1042
PMID:36350625
|
研究论文 | 介绍了一个名为scHumanNet的单细胞网络分析平台，用于研究疾病基因的细胞类型特异性 | scHumanNet基于细胞类型特异性基因网络（CGNs）构建，显示出比其他方法更高的细胞功能相关性，并能优先考虑与特定细胞类型相关的基因 | NA | 提高精准医学中细胞类型特异性基因功能的识别 | 单细胞生物学中的细胞类型特异性基因功能 | 生物信息学 | 乳腺癌, 自闭症谱系障碍 | 单细胞转录组数据分析 | 细胞类型特异性基因网络（CGNs） | 基因网络数据 | NA |
| 19654 | 2024-08-05 |
Liver sinusoidal endothelial cells induce BMP6 expression in response to non-transferrin-bound iron
2023-01-19, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2022016987
PMID:36351237
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研究论文 | 本文研究了肝窦内皮细胞如何在非转铁蛋白结合的铁的刺激下诱导BMP6表达 | 研究揭示了肝窦内皮细胞内铁感应机制，并提出了Tfr1在低铁条件下的作用 | 在铁挑战下，尽管最终能够诱导Bmp6，但相对于肝脏铁含量的水平有时略低 | 探讨肝窦内皮细胞对系统性铁过载的适应机制 | 使用转铁蛋白受体1特异性缺失的转基因小鼠进行单细胞转录组分析 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | 转基因小鼠 | mRNA | TfrcTek-Cre和Tfrcfl/fl小鼠 |
| 19655 | 2024-08-05 |
TEDD: a database of temporal gene expression patterns during multiple developmental periods in human and model organisms
2023-01-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac978
PMID:36350663
|
研究论文 | TEDD是一个关于人类和模式生物在多个发育阶段的时间基因表达模式的数据库。 | 系统策划并整合了来自2760个大样本和超过510万个单细胞的最新和最全面的测序数据集。 | 本研究未提及具体的局限性。 | 研究基因在组织/器官发育以及导致疾病的机制中的作用。 | 涉及481种细胞类型、79种组织类型和92个时间点的基因表达和染色质可及性分析。 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 数据集 | 2760个大样本和超过510万个单细胞 |
| 19656 | 2024-08-08 |
NPInter v5.0: ncRNA interaction database in a new era
2023-01-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac1002
PMID:36373614
|
研究论文 | 本文介绍了NPInter数据库的第五次更新，该数据库记录了非编码RNA（ncRNA）与其他生物分子之间的相互作用 | 通过手动文献挖掘和高通量数据处理，ncRNA相互作用条目数量翻倍，并集成了来自iMARGI、ChAR-seq和GRID-seq的全球RNA-DNA相互作用数据，显著增加了RNA-DNA相互作用的记录数量 | NA | 更新和扩展NPInter数据库，以记录更多的ncRNA相互作用，为生物学研究提供有价值的信息 | ncRNA与其他生物分子之间的相互作用 | 生物信息学 | NA | 高通量测序 | NA | 文本 | ncRNA相互作用条目从1,100,618增加到2,596,695，RNA-DNA相互作用从888,915增加到8,329,382 |
| 19657 | 2024-08-08 |
Single-cell profiling reveals mechanisms of uncontrolled inflammation and glycolysis in decidual stromal cell subtypes in recurrent miscarriage
2023-01-05, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/deac240
PMID:36355621
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序揭示了反复流产中基质细胞亚型的炎症和糖酵解机制 | 首次鉴定出三种基质细胞亚型，其中炎症型和糖酵解型在反复流产中显著富集，并提出了一个由缺氧压力、失控炎症和异常糖酵解驱动的病理模型 | 单细胞RNA测序的基质样本数量有限，未来研究需要深入的功能研究 | 探究反复流产中基质细胞亚型的存在及其在疾病中的作用 | 基质细胞亚型及其在反复流产中的作用 | NA | 反复流产 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 15个早期基质样本，包括5个健康供体和10个反复流产患者 |
| 19658 | 2024-08-05 |
A novel cuproptosis-related gene signature of prognosis and immune microenvironment in head and neck squamous cell carcinoma cancer
2023-Jan, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-022-04471-7
PMID:36376617
|
研究论文 | 该研究系统评估了与cuproptosis相关的基因在头颈癌中的表达和遗传变化，并构建了风险模型来预测患者的生存率 | 提出了cuproptosis相关基因的风险模型，并分析了其与免疫微环境的关系 | 本研究尚未在临床应用中进行验证 | 探讨cuproptosis相关基因在头颈鳞状细胞癌患者中的预后价值 | 头颈鳞状细胞癌患者及其非癌性组织样本 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞测序 | Cox回归和Lasso回归模型 | 基因表达数据 | 涉及19个cuproptosis相关基因的头颈鳞状细胞癌和非癌性组织样本 |
| 19659 | 2024-08-08 |
Isolation of Murine Articular Chondrocytes for Single-Cell RNA or Bulk RNA Sequencing Analysis
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2839-3_14
PMID:36355293
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研究论文 | 本文介绍了一种从啮齿动物模型关节中分离软骨细胞的技术，用于单细胞RNA或批量RNA测序分析 | 提出了一种优化的技术，通过一系列酶消化和双阴性选择过程，使用流式细胞术从密集的细胞外基质中分离出软骨细胞 | NA | 开发一种有效的方法来分离软骨细胞，以便进行单细胞RNA测序分析 | 啮齿动物模型的关节软骨细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), 流式细胞术 (FACS) | NA | RNA | NA |
| 19660 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing of peripheral blood reveals that monocytes with high cathepsin S expression aggravate cerebral ischemia-reperfusion injury
2023-01, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2022.11.001
PMID:36371010
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了外周血中单核细胞的cathepsin S表达在脑缺血-再灌注损伤中的作用 | 首次揭示了cathepsin S在单核细胞中的表达模式及其在脑缺血-再灌注损伤中的关键作用 | NA | 探讨外周免疫细胞如何影响中枢炎症反应及干预措施对缺血-再灌注损伤的影响 | 小鼠外周血中的单核细胞及其在脑缺血-再灌注损伤中的作用 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠外周血样本 |