单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 19581 - 19600 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 19581 | 2024-08-04 |
A novel variable neighborhood search approach for cell clustering for spatial transcriptomics
2024, GigaByte (Hong Kong, China)
DOI:10.46471/gigabyte.109
PMID:38440167
|
研究论文 | 本文提出了一种新的基于可变邻域搜索的细胞聚类方法，结合基因表达和空间坐标进行细胞聚类 | 引入了基于可变邻域搜索的模型，超越了传统细胞类型聚类，能够在空间域中进行聚类 | NA | 研究细胞聚类的方法，特别是在空间转录组学领域 | 细胞聚类，基于基因表达和空间坐标的信息 | 数字病理学 | NA | 可变邻域搜索 | NA | 基因表达矩阵和空间坐标 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 19582 | 2024-08-04 |
Identification of biomarkers of renal ischemia-reperfusion injury by bioinformatics analysis and single-cell sequencing analysis combined with in vivo validation
2023-12, Transplant immunology
IF:1.6Q3
DOI:10.1016/j.trim.2023.101928
PMID:37704087
|
研究论文 | 本文研究了与肾缺血再灌注损伤相关的中心基因和通路 | 本研究识别了cyp1a1和pdk4作为肾缺血的潜在生物标志物，并展示了其良好的诊断价值 | 未提及该研究的局限性 | 探索肾缺血再灌注损伤的生物标志物 | 小鼠肾缺血样本 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞分析、qRT-PCR | NA | 转录组表达数据 | 小鼠肾缺血样本的转录组数据，共发现157个差异表达基因 | NA | NA | NA | NA |
| 19583 | 2024-08-07 |
Single Cell Transcriptomes of In Vitro Bradyzoite Infected Cells Reveals Toxoplasma gondii Stage Dependent Host Cell Alterations
2022, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2022.848693
PMID:35372115
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了体外感染布氏锥虫的宿主细胞转录组变化 | 揭示了布氏锥虫感染阶段依赖的宿主细胞转录组变化，并发现了宿主细胞中c-Myc和NF-κB信号通路及能量代谢途径的上调 | 未提及 | 旨在理解宿主细胞与布氏锥虫在转录组层面的相互作用 | 体外感染布氏锥虫的宿主细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 转录组数据 | 未提及具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 19584 | 2024-08-07 |
RNA-Scoop: interactive visualization of transcripts in single-cell transcriptomes
2021-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqab105
PMID:34859209
|
研究论文 | 本文介绍了RNA-Scoop，一个用于分析单细胞转录组中转录本使用情况的交互式细胞簇和转录组可视化工具 | RNA-Scoop允许用户检查不同簇之间的差异转录本表达，并研究特定转录本表达机制在细胞组中的变化 | NA | 开发一个工具来分析单细胞转录组中的转录本使用情况 | 单细胞转录组中的转录本使用情况 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 19585 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA sequencing reveals epithelial cells driving brain metastasis in lung adenocarcinoma
2024-Mar-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109258
PMID:38433899
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了肺腺癌脑转移的上皮细胞角色 | 发现了一种与脑转移相关的上皮细胞群体，这些细胞在脑转移中发挥重要作用 | 缺乏直接证据证明脑转移病灶与淋巴结转移病灶之间的关联 | 阐明肺腺癌脑转移的细胞起源及其驱动因素 | 主要研究肺腺癌、脑转移和淋巴结转移样本中的细胞组成 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 样本 | 涉及的样本包括初级肺腺癌、脑转移和淋巴结转移样本 | NA | NA | NA | NA |
| 19586 | 2024-08-04 |
Targeting ERBB2 and PIK3R1 as a therapeutic strategy for dilated cardiomyopathy: A single-cell sequencing and mendelian randomization analysis
2024-Mar-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e25572
PMID:38434379
|
研究论文 | 这篇文章探讨了靶向ERBB2和PIK3R1作为扩张型心肌病的治疗策略。 | 文章创新地结合了单细胞测序和孟德尔随机化分析来识别药物可治疗的基因。 | 文章未能找到ERBB2的药物激动剂，并且对PIK3R1和心力衰竭的因果关系的探讨有限。 | 本研究旨在识别并验证扩张型心肌病中药物可治疗的基因，并分析其与心力衰竭的因果关系。 | 研究对象是扩张型心肌病中与心力衰竭相关的基因。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 四个微阵列表达谱数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 19587 | 2024-08-07 |
Bioinformatics analysis of MMP14+ myeloid cells affecting endothelial-mesenchymal transformation and immune microenvironment in glioma
2024-Mar-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e26859
PMID:38434278
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析探讨了MMP14+髓系细胞在胶质瘤中影响内皮间质转化和免疫微环境的作用 | 识别MMP14为独立的预后标志物，并发现其通过CCL信号通路介导免疫抑制，为胶质瘤治疗提供了新的策略 | NA | 探讨MMP14+髓系细胞在胶质瘤中的作用及其对治疗策略的影响 | MMP14+髓系细胞在胶质瘤中的功能及其对内皮间质转化和免疫微环境的影响 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 收集了六个批量RNA数据集和一个单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 19588 | 2024-08-04 |
Shotgun lipidomics of human subretinal fluids under rod-dominant retina reveals cone-dominated lipids
2024-Mar, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2024.109807
PMID:38278468
|
研究论文 | 本研究利用质谱技术分析视网膜脱离患者的次视网膜液体脂质组成 | 首次揭示在杆细胞主导的视网膜下，锥细胞主导的脂质在次视网膜液体中的存在 | 样本量仅限于两位患者，可能影响结果的普遍性 | 探究次视网膜液体中脂质的组成及其潜在生理意义 | 研究了来自两位视网膜脱离患者的次视网膜液体样本 | 数字病理学 | 视网膜疾病 | 质谱法 | NA | 生物分子数据 | 2个样本来自2位患者 | NA | NA | NA | NA |
| 19589 | 2024-08-04 |
The detection of Gper1 as an important gene promoting jawbone regeneration in the context of estrogen deficiency
2024-03, Bone
IF:3.5Q2
DOI:10.1016/j.bone.2023.116990
PMID:38141748
|
研究论文 | 本研究揭示了Gper1在雌激素缺乏背景下促进下颌骨再生的重要性 | 探讨了Gper1如何通过cAMP/PKA/pCREB信号通路促进下颌骨再生 | 研究主要基于动物模型，临床应用的相关性尚需进一步验证 | 研究雌激素缺乏条件下维持骨再生的机制 | 分析接受拔牙手术的女性患者及雌激素缺乏的大鼠模型 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序、定量PCR、免疫组织化学等 | NA | 临床病例数据及动物实验数据 | 1102名女性患者及雌激素缺乏的大鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 19590 | 2024-08-07 |
Allosteric inhibitor of SHP2 enhances macrophage endocytosis and bacteria elimination by increasing caveolae activation and protects against bacterial sepsis
2024-Mar, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2024.107096
PMID:38320736
|
研究论文 | 本文研究了SHP2别构抑制剂通过增强巨噬细胞的胞吞作用和细菌清除能力，从而保护机体免受细菌性脓毒症的影响 | 发现SHP2别构抑制剂能有效维持巨噬细胞中Cav-1的磷酸化，增强其胞吞作用和细菌清除能力 | NA | 探讨SHP2别构抑制剂在细菌性脓毒症中的治疗潜力 | 巨噬细胞的胞吞作用和细菌清除能力 | NA | 细菌性脓毒症 | 单细胞RNA测序和批量RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 19591 | 2024-08-07 |
IFN-γ decreases PD-1 in T lymphocytes from convalescent COVID-19 patients via the AKT/GSK3β signaling pathway
2024-02-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-55191-6
PMID:38424104
|
研究论文 | 本文研究了康复期COVID-19患者中IFN-γ通过AKT/GSK3β信号通路降低T淋巴细胞PD-1表达的现象 | 首次揭示了IFN-γ通过AKT/GSK3β信号通路调控康复期COVID-19患者CD8 T细胞PD-1表达的机制 | NA | 探讨康复期COVID-19患者免疫状态异常的原因 | 康复期COVID-19患者的T淋巴细胞和免疫分子 | 免疫学 | COVID-19 | scRNA-seq | NA | 细胞和蛋白质表达数据 | 康复期COVID-19患者的CD8 T细胞和血浆样本 | NA | NA | NA | NA |
| 19592 | 2024-08-07 |
Integrated meta-omics reveals the regulatory landscape involved in lipid metabolism between pig breeds
2024-Feb-20, Microbiome
IF:13.8Q1
DOI:10.1186/s40168-023-01743-3
PMID:38374121
|
研究论文 | 本文通过综合代谢组学和宏基因组学方法，揭示了不同猪品种间脂质代谢调控的分子机制 | 首次系统地研究了不同猪品种间脂质代谢的细胞和分子机制，为改善动物生产和人类疾病提供了新的视角 | NA | 探究不同猪品种间脂质代谢的调控机制 | 猪的空肠、结肠、肝脏和背最长肌组织的细胞类型 | 代谢组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两品种猪的多个组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 19593 | 2024-08-07 |
Mef2c regulates bone mass through Sost-dependent and -independent mechanisms
2024-02, Bone
IF:3.5Q2
DOI:10.1016/j.bone.2023.116976
PMID:38042445
|
研究论文 | 本文研究了转录因子Mef2c通过Sost依赖和非依赖机制调节骨量的作用 | 发现了Mef2c通过Sost以外的机制调节骨量，并识别了新的Mef2c转录靶点 | NA | 识别Mef2c在骨代谢中的新转录靶点 | Mef2c在骨形成中的作用及其转录靶点 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | Mef2c; Dmp1-Cre和Mef2c; Bglap-Cre小鼠的股骨细胞亚群 | NA | NA | NA | NA |
| 19594 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis of MYD88L265P and MYD88WT Waldenström macroglobulinemia patients
2024-Feb, HemaSphere
IF:7.6Q1
DOI:10.1002/hem3.27
PMID:38435423
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了MYD88L265P和MYD88WT基因型的瓦尔登斯特伦巨球蛋白血症患者的CD19阳性细胞，揭示了肿瘤内克隆异质性及其对B细胞组成的潜在影响 | 首次在单细胞水平上分析了两种不同基因型的瓦尔登斯特伦巨球蛋白血症患者的转录组特征，揭示了患者间的转录组差异和共同特征 | 研究样本量较小，仅包括五名MYD88L265P基因型和两名MYD88WT基因型患者以及两名健康对照 | 评估瓦尔登斯特伦巨球蛋白血症中的克隆异质性 | MYD88L265P和MYD88WT基因型的瓦尔登斯特伦巨球蛋白血症患者的CD19阳性细胞 | 数字病理学 | 瓦尔登斯特伦巨球蛋白血症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 五名MYD88L265P基因型患者、两名MYD88WT基因型患者和两名健康对照 | NA | NA | NA | NA |
| 19595 | 2024-08-04 |
Molecular classification of small cell lung cancer subtypes: Characteristics, prognostic factors, and clinical translation
2024-Jan-20, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000002693
PMID:37660289
|
综述 | 本文回顾并总结了小细胞肺癌的分子分类特征、预后因素和临床应用。 | 研究了基于小细胞肺癌的关键转录因子的新兴分子分类，为肿瘤的病理生理学、转移、免疫微环境及获得性治疗抵抗提供了更多信息 | NA | 探讨小细胞肺癌的分子分类及其临床转化 | 小细胞肺癌的不同亚型及其特征 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 19596 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics reveal different maturation stages and sublineage commitment of human thymic invariant natural killer T cells
2024-01-19, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiad113
PMID:37742056
|
研究论文 | 本研究揭示了人类胸腺不变自然杀伤T细胞不同的成熟阶段和亚谱系承诺 | 首次定义了人类不变自然杀伤T细胞在胸腺发育过程中的成熟阶段，并评估了亚谱系承诺 | 研究仅限于从胸腺中提取的细胞，缺乏对外周血中细胞的广泛分析 | 探讨人类不变自然杀伤T细胞在胸腺发育中的成熟阶段和亚谱系承诺 | 人类Vα24+Vβ11+不变自然杀伤T细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 从胸腺提取的Vα24+Vβ11+不变自然杀伤T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 19597 | 2024-08-04 |
Role of immune cells in the pathogenesis of myocarditis
2024-01-19, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiad143
PMID:37949833
|
研究论文 | 此文章总结了免疫细胞在心肌炎发病机制中的角色 | 本研究强调了免疫细胞的复杂性和细胞间相互作用对心肌炎病理过程的重要性 | 目前尚不清楚心肌炎的详细发病机制 | 探讨免疫细胞在心肌炎发病机制中的作用 | 研究涉及心肌炎患者及多种动物模型中的免疫细胞 | 数字病理学 | 心肌炎 | 单细胞测序 | NA | 细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 19598 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics of Treg reveals hallmarks and trajectories of immunological aging
2024-01-05, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiad104
PMID:37675661
|
研究论文 | 研究了与年龄相关的免疫衰老对CD4+调节性T细胞的影响 | 识别了6个转录组特异性克隆的调节性T细胞，并揭示了与衰老相关的特征和变化轨迹 | 主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类的情况 | 探讨老化对调节性T细胞的影响以及与免疫衰老相关的机制 | 小鼠淋巴和脂肪组织来源的调节性T细胞 | 数字病理学 | 代谢疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 细胞 | 针对3个月、18个月和24个月龄小鼠的调节性T细胞进行分析 | NA | NA | NA | NA |
| 19599 | 2024-08-07 |
BCG vaccination induces innate immune memory in γδ T cells in humans
2024-01-05, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiad103
PMID:37672677
|
研究论文 | 本研究探讨了卡介苗（BCG）疫苗是否能在人类γδ T细胞中诱导出训练免疫，从而增强其对异源细菌和真菌感染的交叉保护作用 | 首次证明了BCG疫苗能在人类γδ T细胞中诱导出训练免疫，增强其对异源细菌和真菌刺激的反应性 | NA | 确定人类γδ T细胞是否能通过BCG疫苗诱导出训练免疫，从而增强其交叉保护作用 | 健康人类志愿者的γδ T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序技术 | NA | RNA | 健康人类志愿者 | NA | NA | NA | NA |
| 19600 | 2024-08-04 |
Generating single-cell gene expression profiles for high-resolution spatial transcriptomics based on cell boundary images
2024, GigaByte (Hong Kong, China)
DOI:10.46471/gigabyte.110
PMID:38434932
|
研究论文 | 本研究介绍了一种更新的软件STCellbin，能够生成高分辨率的单细胞空间基因表达特征 | 该软件结合了细胞膜/细胞壁染色图像与空间基因表达图，增强了单细胞基因表达轮廓的捕获能力 | NA | 提升空间转录组学中单细胞基因表达的分析精度 | 小鼠肝脏和种子数据集的单细胞基因表达轮廓 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像 | 多个小鼠肝脏和种子的样本 | NA | NA | NA | NA |