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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1941 | 2026-09-29 |
Spatial atlas of diabetic kidney disease reveals a B cell-rich subgroup
2026-May, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-026-10363-4
PMID:42056516
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研究论文 | 本文利用Xenium和CosMx单细胞空间转录组学结合单核RNA测序构建了跨平台肾脏图谱,揭示了糖尿病肾病中一个B细胞富集的亚组,并开发了组织生物标志物和血浆蛋白面板用于患者分层和风险预测 | 构建了跨平台可计算的肾脏空间图谱,定义了可重复的组织生态位和损伤相关微环境,发现了一个以B细胞为主的三级淋巴结构样免疫微环境,该微环境定义了糖尿病肾病的一个独特亚组,并开发了组织生物标志物和匹配的血浆蛋白面板 | 摘要中未明确提及研究限制 | 构建糖尿病肾病的空间图谱,揭示其临床和分子异质性,开发用于预后、无创检测和患者选择的生物标志物 | 糖尿病肾病患者的肾脏组织样本和血浆样本 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞空间转录组学,单核RNA测序 | NA | 空间转录组数据,单核RNA测序数据,图像 | NA | 10x Genomics, NanoString | 单细胞空间转录组学,单核RNA测序 | Xenium, CosMx | NA |
| 1942 | 2026-09-29 |
Robust Algorithm With Contrastive Learning for Identifying Spatial Domains From Noised Spatial Transcriptomics Data
2026 May-Jun, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3683521
PMID:42247557
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研究论文 | 该文提出了一种名为jNFACL的鲁棒性联合框架,通过对比学习从含噪声的空间转录组数据中识别空间域,同时集成了去噪和空间域识别过程 | 首次将去噪与空间域识别同时集成到一个联合框架中,通过非负矩阵分解在特征层面分离噪声,并采用对比学习利用空间邻域信息增强特征质量,无需预处理去噪步骤 | 摘要中未明确提及该方法的局限性 | 解决空间转录组数据中噪声对空间域识别算法设计的挑战,提高含噪声空间转录组数据中空间域识别的准确性和鲁棒性 | 含噪声的空间转录组数据中的空间域 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 对比学习, 非负矩阵分解, 图神经网络 | 空间转录组数据, 图像 | 多个平台和物种的不同噪声水平的数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1943 | 2026-09-29 |
Epigenetic and Transcriptomic Pathways Underlying Animal Models of Cognitive and Psychiatric Disorders: A Scoping Review
2026-Apr-21, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb48040425
PMID:42042085
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综述 | 本文通过范围综述系统梳理了自闭症谱系障碍、精神分裂症、抑郁症和Rett综合征四种神经精神疾病动物模型中的表观遗传和转录组学研究发现 | 系统整合了多组学技术在四种神经精神疾病动物模型中的表观遗传和转录组学证据,揭示了突触结构和抑制性功能相关神经回路中表观遗传紊乱的汇聚性,强调了回路和细胞类型特异性表观遗传学的重要性 | 作为范围综述,未进行定量荟萃分析,研究间异质性较大,且动物模型向人类转化存在固有差距 | 系统梳理和综合四种神经精神疾病动物模型中表观遗传和转录组学研究,识别趋同和趋异的分子通路,揭示转化差距和治疗意义 | 四种神经精神疾病(自闭症谱系障碍、精神分裂症、抑郁症和Rett综合征)的动物模型 | 机器学习 | 精神疾病 | 染色质可及性检测,全基因组DNA甲基化图谱分析,单细胞和批量RNA测序,组蛋白修饰分析,多组学整合 | NA | 文本 | 63项原始实验研究 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,全基因组DNA甲基化测序 | NA | NA |
| 1944 | 2026-09-29 |
Cross-platform transcriptomic data integration identifies an overactive neuro-immune signature in human osteoarthritis synovium
2026-04, Osteoarthritis and cartilage
IF:7.2Q1
DOI:10.1016/j.joca.2025.08.013
PMID:40889615
|
研究论文 | 该研究通过跨平台转录组数据整合,识别出人骨关节炎滑膜中过度活跃的神经免疫特征,并预测了滑膜与背根神经节的潜在相互作用 | 跨平台统计整合多个GEO数据集,结合单细胞RNA测序和背根神经节多组学数据,首次预测滑膜-背根神经节相互作用组,并识别出STAT1、FLI1和VDR调控网络 | 基于公共数据集的再分析,样本量有限(139例),预测的配体-受体相互作用需实验验证 | 表征骨关节炎滑膜的转录表型,重点关注与疼痛相关的信号通路 | 人骨关节炎和非骨关节炎受试者的滑膜组织 | 转录组学 | 骨关节炎 | 微阵列、RNA测序、单细胞RNA测序、多组学分析 | 加权Z检验、基因集富集分析、调控子分析 | 基因表达数据、单细胞转录组数据、多组学数据 | 153例受试者(质量控制后139例),来自8个GEO数据集 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序, 微阵列 | NA | NA |
| 1945 | 2026-09-29 |
Dynamic and cell-type specific transcriptional reprogramming underlies the floral transition in the maize shoot apical meristem
2026-Mar-18, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04033-x
PMID:41851888
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研究论文 | 该研究整合时间序列bulk RNA-seq、单细胞转录组、染色质可及性和转录因子结合谱,构建了玉米茎尖分生组织花转变的时空分子调控框架 | 首次整合bulk RNA-seq、单细胞转录组、染色质可及性和转录因子结合谱构建玉米茎尖分生组织花转变的时空分子框架,揭示了花转变由空间上不同的茎尖分生组织区域协同驱动而非统一的转录开关,并发现了UNBRANCHED2和UNBRANCHED3在促进花转变中的新功能 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 解析玉米茎尖分生组织花转变过程中的分子重编程机制和细胞身份变化 | 玉米茎尖分生组织 | 机器学习 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞转录组, 染色质可及性测序, 转录因子结合谱分析 | NA | 文本, 图像 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 染色质可及性测序 | NA | NA |
| 1946 | 2026-09-29 |
Single-cell RNA sequencing uncovers neutrophil clusters associated with autoimmune neuroinflammation
2026-Mar-18, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-026-03772-9
PMID:41851894
|
研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了Socs3缺失小鼠在中枢神经系统自身免疫性炎症中中性粒细胞的异质性及其致病作用 | 首次在Socs3中性粒细胞特异性敲除小鼠中通过scRNA-Seq鉴定出五个中性粒细胞亚群,发现Neu2和Neu4在EAE中扩增,并揭示Saa3/SAA1作为自身免疫性神经炎症的潜在生物标志物 | 研究主要基于小鼠EAE模型,人类MS患者样本仅验证了血浆SAA1水平,缺乏人类CNS组织中的中性粒细胞亚群验证 | 探究Socs3在中性粒细胞中的特异性作用及其在自身免疫性神经炎症中的致病机制 | Socs3ΔLy6G小鼠(中性粒细胞特异性Socs3敲除小鼠)、EAE模型小鼠及MS患者血浆样本 | 单细胞组学 | 多发性硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1947 | 2026-09-29 |
Excessive reactive oxygen species attenuated IL-17 production in CD161++ CD8+ T cell subset via repression of FOS in HIV-infected immunological non-responders
2026-Mar-18, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-026-02792-5
PMID:41845347
|
研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和TCR测序揭示了HIV感染免疫无应答者中CD161++ CD8+ T细胞亚群的异质性及其功能耗竭机制 | 首次揭示了CD161++ CD8+ T细胞亚群在HIV免疫重建中的关键作用,并阐明了过量活性氧通过抑制FOS削弱IL-17产生的分子机制 | 摘要中未明确说明样本量的具体数量及研究的局限性 | 探究HIV感染免疫无应答者中CD8+ T细胞的功能异质性及其在免疫重建中的作用机制 | HIV感染的免疫应答者(IR)和免疫无应答者(INR)的外周血CD8+ T细胞 | 单细胞组学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序,TCR测序,流式细胞术,qRT-PCR | NA | 单细胞转录组数据,文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序,单细胞TCR测序 | NA | NA |
| 1948 | 2026-09-29 |
Single-cell mitophagy signature-based artificial intelligence model enhances prediction of prognosis and immunotherapy response in non-small-cell lung cancer
2026-Mar-18, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-026-03601-w
PMID:41851738
|
研究论文 | 该研究基于单细胞分辨率下的线粒体自噬相关基因构建人工智能模型,用于预测非小细胞肺癌的预后和免疫治疗反应。 | 首次在单细胞分辨率下基于线粒体自噬相关基因构建人工智能模型,结合LASSO回归与多种机器学习分类器,并整合SHAP分析、免疫浸润评估、药物敏感性预测及实验验证,用于NSCLC预后分层和免疫治疗反应预测。 | 摘要中未明确说明研究局限性,模型仅在内部和外部队列中验证,实验验证仅限于A549细胞系,缺乏更广泛的临床前瞻性验证。 | 构建基于线粒体自噬相关基因的人工智能模型,以改善非小细胞肺癌患者生存预后和免疫治疗获益的预测。 | 初治非小细胞肺癌肿瘤样本及临床免疫治疗试验队列中的NSCLC患者,实验验证使用A549细胞系。 | 数字病理学, 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, Western blotting, 免疫荧光, 细胞迁移和伤口愈合功能实验 | LASSO回归, 梯度提升机, 多种机器学习分类器 | 单细胞RNA测序数据, 图像, 文本 | 18,167个单细胞 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1949 | 2026-09-29 |
Multi-omics Analysis of the Palmitoylation Gene ZDHHC18 Regulating Sphingolipid Metabolic Homeostasis and Its Role in Epilepsy Pathogenesis
2026-Mar-18, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 该研究通过多组学整合策略系统探究棕榈酰化相关基因ZDHHC18通过调控鞘脂代谢稳态参与癫痫发病的分子机制 | 首次提出ZDHHC18-鞘脂代谢轴这一新概念,揭示ZDHHC18通过鞘脂代谢物N-棕榈酰十七碳鞘氨醇(d17:1/16:0)介导癫痫风险的因果通路,并在抑制性神经元中鉴定出ZDHHC18的动态表达模式及其与神经信号传导和神经炎症通路的关联 | 研究主要基于公共数据库和生物信息学分析,缺乏湿实验验证;中介分析推断的代谢网络因果关系需要进一步实验证实;样本来源和规模受限 | 系统研究棕榈酰化相关基因在癫痫发病中的因果贡献及其代谢网络机制 | 癫痫患者外周血转录组数据、血浆代谢物数据及单细胞转录组数据中的棕榈酰化相关基因和鞘脂代谢物 | 多组学整合分析 | 癫痫 | 孟德尔随机化、转录组分析、单细胞RNA测序 | 两样本孟德尔随机化模型、中介模型 | 文本(遗传数据)、转录组数据、单细胞转录组数据、代谢物数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、转录组分析 | NA | NA |
| 1950 | 2026-09-29 |
A differential single-cell transcriptome atlas of left-sided and right-sided colorectal cancer
2026-Mar-17, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04789-5
PMID:41844817
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研究论文 | 该研究通过单细胞转录组分析,构建了左侧与右侧结直肠癌的差异细胞图谱,揭示了分子和细胞层面的差异 | 首次在单细胞分辨率下系统比较左侧和右侧结直肠癌的差异,发现MTRNR2L8基因在右侧结直肠癌中上调并与不良生存相关,以及CD8-EFFECTOR 3和CD4-HSP亚群的分布差异和APP-CD74配体-受体互作增强 | 样本量较小(16例患者),且部分验证依赖于公共数据库,可能受批次效应影响,需要更大规模的前瞻性研究验证 | 旨在解析左侧和右侧结直肠癌在预后和治疗反应差异背后的细胞类型特异性转录程序和微环境相互作用 | 16例结直肠癌患者的单细胞转录组数据(8例左侧和8例右侧),以及独立的单细胞数据集、TCGA bulk RNA-seq数据、qPCR验证样本、空间转录组数据和HPA免疫组化数据 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq, 空间转录组学, qPCR, 免疫组化 | NA | 单细胞转录组数据, 图像, 文本 | 16例患者(8例LCRC和8例RCRC),以及独立验证数据集、TCGA样本、qPCR组织标本、空间转录组数据和HPA数据 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞转录组,10x Visium 用于空间转录组(具体配置未详述) |
| 1951 | 2026-09-29 |
Identification of TRPM4 related genes in LUAD by RNA seq and spatial transcriptomics
2026-Mar-17, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04797-5
PMID:41845138
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研究论文 | 该研究利用RNA测序和空间转录组学技术,识别肺腺癌中与TRPM4相关的基因,并构建生存预测模型。 | 结合了RNA测序和空间转录组学来识别TRPM4相关基因,并构建了基于19个致癌驱动基因的生存预测模型,探索了免疫景观和药物敏感性。 | 摘要中未明确提及研究的局限性。 | 基于TRPM4相关基因建立肺腺癌患者的生存预测模型,探索免疫景观,为未来个性化治疗方案提供新见解。 | 肺腺癌(LUAD)患者 | 数字病理学, 机器学习 | 肺癌 | RNA测序, 空间转录组学, 单细胞测序 | 比例风险回归模型 | RNA测序数据, 空间转录组数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1952 | 2026-09-29 |
Exosome-mediated delivery of miRNA-1290 inhibitor enhances JNK-dependent tissue-resident memory T cell immunity in prostate cancer
2026-Mar-13, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-43719-x
PMID:41826614
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研究论文 | 该研究通过外泌体递送miR-1290抑制剂治疗前列腺癌小鼠模型,发现其通过激活JNK依赖的组织驻留记忆T细胞增强抗肿瘤免疫 | 首次利用外泌体递送miR-1290抑制剂靶向前列腺癌,揭示了miR-1290通过JNK信号通路调控CD8⁺组织驻留记忆T细胞抗肿瘤免疫的新机制 | 研究仅基于TRAMP小鼠模型,尚未在人类前列腺癌患者中验证,外泌体递送系统的临床转化效率和安全性仍需进一步评估 | 评估外泌体递送miR-1290抑制剂在前列腺癌小鼠模型中的治疗效果及免疫调节机制 | TRAMP前列腺癌小鼠模型及RM-1细胞来源的外泌体 | 肿瘤免疫学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1953 | 2026-09-29 |
Artificial intelligence-assisted spatial omics-based biomimetic nanoplatform for intelligent and precise intervention in the immunosuppressive core region of ovarian cancer
2026-Mar-11, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01345-w
PMID:41814059
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综述 | 该文章综述了卵巢癌免疫抑制核心区域的空间组学识别方法、信号网络机制,以及人工智能辅助的仿生纳米平台在精准免疫治疗中的闭环干预框架 | 提出了人工智能辅助的闭环治疗框架,将空间组学识别、仿生纳米药物递送与反馈调节整合为一体,实现对卵巢癌免疫抑制核心区域的智能化精准干预 | 空间图谱标准化、递送系统稳定性以及跨平台兼容性等方面仍存在挑战,需要进一步的技术发展 | 实现对卵巢癌免疫抑制核心区域的精准治疗调控,支持个体化精准免疫治疗 | 卵巢癌及其免疫抑制肿瘤微环境中的核心区域 | 空间组学、人工智能、纳米医学 | 卵巢癌 | 单细胞组学、空间转录组学 | NA | 空间转录组数据、单细胞组学数据 | NA | NA | 单细胞组学、空间转录组学 | NA | NA |
| 1954 | 2026-09-29 |
Vertebrate-wide transcriptomic screening identifies immune cell-specific expression of the conserved OR-κ gene
2026-Feb-07, Zoological letters
IF:1.7Q2
DOI:10.1186/s40851-026-00260-z
PMID:41654976
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研究论文 | 通过对四种脊椎动物13个器官进行转录组筛选,发现化学感受器基因在鼻/口腔外器官中广泛表达,并揭示保守的OR-κ基因在免疫细胞中特异性表达 | 首次从广泛的进化视角系统研究脊椎动物化学感受器基因在鼻/口腔外器官的表达模式,发现OR-κ基因在免疫细胞中特异性表达且独立于经典嗅觉受体基因簇 | 研究主要基于bulk RNA-seq和已有单细胞数据,缺乏功能验证实验来证实OR-κ在免疫系统中的具体功能 | 系统探究脊椎动物化学感受器基因在全身器官中的表达模式及其进化保守性,拓展对化学感受器功能多样性的认识 | 小鼠、非洲爪蟾、多鳍鱼和斑马鱼四种代表性脊椎动物的13个器官 | 转录组学 | NA | bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | 4个物种各13个器官的bulk RNA-seq样本及单细胞RNA-seq数据 | NA | bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1955 | 2026-09-29 |
Decoding the human PBMC isonome: isoform-level resolution with single-cell long-read transcriptomics
2026, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2026.1782221
PMID:42283034
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研究论文 | 利用无微流控的PIPseq工作流程和适用于Oxford Nanopore长读长测序的计算流程,生成了迄今最大的单供体人外周血单个核细胞长读长单细胞数据集,并在免疫细胞中进行了异构体水平分析 | 生成了迄今最大的单供体人PBMC长读长单细胞数据集,首次达到足以检测巨核细胞的细胞数量;发现了126个新异构体;揭示了非经典蛋白编码变体在意外细胞类型中的富集;发现了具有细胞类型特异性特征的新转录本 | 仅来自单个供体的PBMC样本,样本多样性有限,结论的普适性有待更多供体和组织类型验证 | 在异构体水平上解析人PBMC的细胞多样性和疾病机制,定义细胞类型,拓展长读长单细胞测序在异构体景观(isonome)研究中的应用 | 人外周血单个核细胞(PBMCs) | 机器学习 | NA | 单细胞长读长转录组测序 | NA | 文本 | 来自单个供体的人外周血单个核细胞(PBMCs),细胞数量足以检测巨核细胞 | Oxford Nanopore | 单细胞RNA-seq | PIPseq | 无微流控PIPseq工作流程,适配Oxford Nanopore长读长测序 |
| 1956 | 2026-09-29 |
Androgenetic alopecia drugs and male infertility: Evidence from pharmacovigilance and testicular transcriptomics
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0357154
PMID:42784576
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研究论文 | 利用FAERS和EudraVigilance药物警戒数据库评估非那雄胺、度他雄胺和米诺地尔与非育性不良事件的关联,并结合睾丸转录组学等多层次生物信息学分析探索男性不育相关生物学特征 | 采用双数据库复制设计进行药物警戒不成比例分析,结合多层次生物信息学分析(包括毒性预测、药物相关靶点筛选、睾丸转录组分析、单细胞RNA测序、细胞间通讯分析、GSEA和免疫浸润分析)系统评估AGA药物与男性不育的关联 | 药物警戒发现仅为报告信号而非发病率或因果关系,HIF1A相关转录组发现仅提供假设生成性生物学背景,未能建立三种药物与不育之间共享或药物特异性机制 | 识别AGA药物(非那雄胺、度他雄胺和米诺地尔)与男性不育相关不良事件之间的不成比例信号,并利用睾丸转录组数据集探索不育相关生物学特征 | 非那雄胺、度他雄胺和米诺地尔三种AGA药物及其与男性不育的关联 | 药物警戒, 生物信息学, 转录组学 | 男性不育, 雄激素性脱发 | 药物警戒不成比例分析, 转录组学, 单细胞RNA测序, 基因集富集分析, 免疫浸润分析, 毒性预测, 药物靶点筛选, 细胞间通讯分析 | NA | 药物警戒报告数据, 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | FAERS数据库(2004-2025年)和EudraVigilance数据库(2002-2025年)的不良事件报告,睾丸转录组数据集 | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1957 | 2026-09-29 |
scLTF: A self-training clustering framework for large-scale single-cell RNA-Seq data
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0359153
PMID:42784630
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研究论文 | 提出了一种用于大规模单细胞RNA测序数据的自训练聚类框架scLTF,结合Louvain算法和Transformer模型,以提高聚类性能和计算效率 | 结合了快速Louvain算法生成初步聚类和Transformer模型进行迭代表示学习优化,并引入了自定义的“聚类代表性指数”来选择关键细胞 | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 解决现有聚类方法在处理大规模scRNA-seq数据时的性能瓶颈问题 | 大规模单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | Transformer | 文本 | 多个真实世界数据集,具体样本量未提供 | NA | NA | NA | NA |
| 1958 | 2026-09-29 |
Identification and experimental validation of prognostic genes associated with dietary restriction-related signatures in bladder cancer
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1891824
PMID:42798489
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研究论文 | 该研究通过生物信息学分析和实验验证,识别并验证了膀胱癌中与饮食限制相关特征相关的预后基因RBP7、SREBF1和ZFP64,并构建了风险模型 | 首次从计算推断的饮食限制相关基因类别中筛选出膀胱癌候选预后基因,并结合单细胞RNA测序分析、孟德尔随机化分析和多种实验验证手段进行系统研究 | 风险模型的AUC值仅为0.60-0.66,区分能力有限;列线图的预测性能为中等水平 | 识别和验证膀胱癌中与饮食限制相关特征相关的预后基因,并构建风险评估模型 | 膀胱癌(BLCA)患者及其肿瘤组织样本和膀胱癌细胞系 | 机器学习, 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 蛋白质印迹, 细胞转染, 差异表达分析, 单因素Cox回归分析, 孟德尔随机化分析, LASSO回归分析 | LASSO回归, Cox回归 | 基因表达数据, 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1959 | 2026-09-29 |
Single-cell dissection of a collision marrow with coexisting acute myeloid leukemia and a Waldenström-related lymphoplasmacytic compartment
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1844537
PMID:42798504
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研究论文 | 该研究对一例同时患有急性髓系白血病(AML)和华氏巨球蛋白血症(WM)相关淋浆细胞区室的碰撞骨髓进行了单细胞RNA测序分析,解析了细胞结构和共享免疫环境 | 首次对AML与WM相关区室共存的碰撞骨髓进行单细胞转录组解析,揭示了两个区室的细胞状态、CNV特征及免疫微环境,并发现同一治疗方案下两个区室呈现分离的动力学变化 | 仅基于单例病例,样本量小,无法进行统计学推断;WM相关区室的CNV推断受转录组限制分辨率有限;研究为描述性分析,缺乏功能验证 | 利用单细胞RNA测序解析碰撞骨髓中AML和WM相关淋浆细胞区室的细胞结构、克隆特征和免疫背景 | 一名67岁男性AML(髓单核细胞特征)患者,同时经流式验证存在WM相关B/浆细胞区室的诊断性骨髓穿刺样本 | 数字病理学 | 急性髓系白血病, 华氏巨球蛋白血症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞术数据, 血清学数据, 基因突变检测数据 | 1例患者的骨髓穿刺样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1960 | 2026-09-29 |
Single-cell transcriptomic characterization of the immunosuppressive tumor immune microenvironment in hepatocellular carcinoma: implications for SBRT-based radio-immunotherapy
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1928725
PMID:42798509
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研究论文 | 该研究通过单细胞转录组测序分析了肝细胞癌的免疫抑制性肿瘤免疫微环境,并探讨了其对立体定向放射治疗联合免疫治疗的影响 | 揭示了肝细胞癌中髓系细胞优势扩增和T细胞多检查点耗竭的空间/单细胞特征,并通过体外实验证实免疫抑制微环境可减弱放疗诱导的免疫原性细胞死亡 | 单细胞测序数据仅来自单一患者(HCC07),样本量小,缺乏多患者验证和体内实验验证 | 解析肝细胞癌肿瘤免疫微环境的单细胞结构,阐明其免疫抑制机制,为基于SBRT的放射免疫治疗提供理论依据 | 肝细胞癌患者的正常肝脏组织、原发肿瘤组织和门静脉癌栓组织,以及HepG2和Huh-7肝癌细胞系 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本, 图像 | 1例肝细胞癌患者(HCC07,IIIB期)的正常肝脏、原发肿瘤和门静脉癌栓组织,共三个样本;体外使用HepG2和Huh-7细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |