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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1921 | 2026-08-20 |
Association of HPGDS Expression with Prognosis and Immune Microenvironment Remodeling in Pancreatic Cancer
2026, Cancer management and research
IF:2.5Q3
DOI:10.2147/CMAR.S619196
PMID:42610087
|
研究论文 | 本研究整合公共转录组、生存队列、免疫治疗相关数据集、单细胞RNA测序及体外验证实验,评估HPGDS在胰腺癌中的表达模式、临床相关性、免疫关联及功能作用 | 首次系统性地将HPGDS表达与胰腺癌的预后及免疫微环境重塑相关联,并结合多组学数据和体外实验进行验证 | 多数发现基于回顾性公共数据集和相关性分析,需要进一步的机制研究、体内实验和临床验证 | 探讨HPGDS在胰腺癌中的表达及其与预后和免疫微环境的关系,评估其作为潜在生物标志物的可能性 | 胰腺导管腺癌(PAAD)组织和细胞系,以及公共转录组和单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 胰腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据、临床数据 | 多个公共数据集和队列,具体样本数未在摘要中说明 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1922 | 2026-08-20 |
Single-Cell RNA-Seq Reveals a Glycolysis-Biased EMT State in Keloid Keratinocytes That Amplifies the Pro-Inflammatory and Fibrotic Microenvironment
2026, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S621521
PMID:42610115
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示瘢痕疙瘩角质形成细胞中偏向糖酵解的EMT状态及其对促炎和纤维化微环境的放大作用 | 首次在瘢痕疙瘩角质形成细胞中鉴定出具有糖酵解偏向和EMT倾向的特定基底角质形成细胞亚群,并揭示其通过转录因子REL和ESRRA调控及与促炎成纤维细胞的通讯机制 | 未提及,可能缺乏体内验证或临床样本的多样性 | 探究瘢痕疙瘩角质形成细胞的代谢改变及其在维持促炎和纤维化微环境中的作用 | 瘢痕疙瘩和正常皮肤组织中的角质形成细胞 | 单细胞转录组学 | 瘢痕疙瘩 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 46,690个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1923 | 2026-08-20 |
Ovarian somatic tissue rejuvenates circulating apolipoproteins and promotes cognitive health in postreproductive female mice
2025-Dec-13, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-025-02019-4
PMID:41388182
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研究论文 | 本研究探讨年轻卵巢体细胞移植对老年雌性小鼠脂质信号、认知功能及痴呆风险的恢复作用 | 首次通过单细胞转录组学和拉曼光谱鉴定出与脂质信号介导的健康恢复相关的两种卵巢体细胞类型 | 未提供明确的局限性信息 | 探索年轻卵巢体细胞移植恢复老年雌性小鼠健康的关键细胞和通路 | 老年生殖后期雌性小鼠及其卵巢组织和细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组学、拉曼光谱 | NA | 分子数据、组织学图像、行为数据 | 未提供具体样本量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1924 | 2026-08-20 |
Distinct senotypes in p16- and p21-positive cells across human and mouse aging tissues
2025-Dec, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-025-00601-2
PMID:41162753
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研究论文 | 本研究通过分析多个单细胞RNA测序数据集,揭示了衰老过程中p21和p16阳性细胞在人和小鼠组织中的异质性及其独立的细胞轨迹。 | 首次系统性地跨物种、跨组织比较p21和p16阳性细胞的转录状态,发现其缺乏共表达,并识别出组织特异性的SASP特征和共同的核心SASP因子。 | 研究主要基于已有单细胞RNA测序数据集,可能受限于样本来源和批次效应,且未进行功能验证实验。 | 阐明p21和p16作为衰老标志物在体内的角色,揭示细胞衰老和SASP的异质性。 | 人和小鼠的多种组织细胞,特别是p21阳性和p16阳性的衰老细胞。 | 单细胞转录组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个小鼠和人类衰老组织的单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1925 | 2026-08-20 |
Benchmarking porcine pancreatic ductal organoids for drug screening applications
2025-12, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.1038/s44321-025-00330-3
PMID:41188536
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研究论文 | 建立了猪胰管类器官(PPDO)作为药物筛选平台,并通过单细胞RNA测序和蛋白质组学与人类胰管类器官及原代猪胰腺进行比较,验证了其在评估药物安全性方面的应用。 | 首次建立了猪胰管类器官作为可重复、遗传背景明确的模型,并通过多组学方法进行基准测试,证明了其在药物筛选中的保守毒性反应。 | 供体材料的可用性、遗传变异以及缺乏与健康和疾病胰腺的广泛基准测试限制了应用范围。 | 建立猪胰管类器官模型,用于研究胰腺导管/祖细胞生物学,并作为药物筛选平台评估药物安全性。 | 猪胰管类器官、人胰管类器官和原代猪胰腺。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq)、蛋白质组学。 | 类器官模型 | 基因表达数据、蛋白质组学数据。 | 不同发育阶段的猪胰管类器官(数量未指定)及人类胰管类器官。 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序。 |
| 1926 | 2026-08-20 |
Sequencing-free whole-genome spatial transcriptomics at single-molecule resolution
2025-Nov-26, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.09.006
PMID:41038164
|
研究论文 | 本文开发了RAEFISH技术,一种无需测序的全基因组空间转录组学方法,具有单分子分辨率,可在完整组织中实现23,000个人类或22,000个小鼠基因的空间表达谱分析。 | 该方法结合了全基因组覆盖和单分子分辨率,无需测序,并支持直接读取gRNA,适用于高内容CRISPR筛选。 | 尚未提及具体局限性,但可能包括技术复杂性或成像深度限制。 | 开发一种高覆盖、高分辨率的空间转录组学技术,以促进无偏见的转录组分析。 | 人类和小鼠基因的转录本,以及CRISPR筛选中的gRNA。 | 空间转录组学 | 不适用 | RAEFISH(基于图像的空间转录组学) | 不适用 | 图像 | 23,000个人类或22,000个小鼠基因的转录本,具体样本数量未提及。 | 不适用 | 空间转录组学 | 不适用 | 不适用 |
| 1927 | 2026-08-20 |
GPC3-based circular RNA vaccine suppresses hepatocellular carcinoma progression by activating adaptive immune responses
2025-Nov-07, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001605
PMID:41201153
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于GPC3的环状RNA疫苗,通过激活适应性免疫反应抑制肝细胞癌进展 | 首次设计并评估了circGPC3疫苗在肝细胞癌中的治疗潜力,通过持续抗原生产克服传统mRNA疫苗的局限性,并结合TLR4激动剂增强免疫应答 | 摘要未提及具体局限性 | 开发针对肝细胞癌的circRNA疫苗,提高抗原稳定性和抗肿瘤免疫应答 | 肝细胞癌小鼠模型及肿瘤微环境 | 癌症免疫治疗 | 肝细胞癌 | 环状RNA疫苗技术、多重免疫荧光、单细胞测序、空间转录组学、质谱流式细胞术 | 环状RNA疫苗 | 测序数据、图像数据、蛋白质表达数据 | 小鼠模型样本(具体数量未在摘要中提及) | NA | 单细胞测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 1928 | 2026-08-20 |
Oligo-CALL: A next-generation barcoding platform for studying resistance to targeted therapy
2025-11-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adw9990
PMID:41202131
|
研究论文 | 开发了一种名为Oligo-CALL的下一代条形码平台,用于研究靶向治疗耐药性,并在肺癌细胞中验证其功能 | Oligo-CALL是一种寡核苷酸诱导的CRISPR转录激活因子辅助谱系标记系统,实现了精确的谱系追踪、活克隆分离以及与单细胞RNA测序的无缝整合,且具有高效性 | 未明确提及局限性 | 开发一种高效、兼容单细胞转录组的谱系追踪平台,以研究靶向治疗耐药性的克隆演化 | 肺癌细胞,经KRAS抑制剂处理,包括初治和耐药群体中的克隆 | 分子生物学与基因组学 | 肺癌 | CRISPR基因编辑、单细胞RNA测序 | NA | 基因组和转录组数据 | 肺癌细胞系中的克隆,具体数量未说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1929 | 2026-08-20 |
Glycans on non-structural protein 1 prevent premature T-cell mediated dengue virus clearance
2025-11, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.1038/s44321-025-00311-6
PMID:40962941
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研究论文 | 本研究揭示登革病毒NS1蛋白上的N207糖基化位点通过调节早期炎症反应和PD-L1/PD-1轴,防止T细胞过早清除病毒,从而促进病毒免疫逃逸 | 首次揭示NS1蛋白N207位点去糖基化通过抑制早期炎症反应和PD-L1上调来限制T细胞凋亡的免疫逃逸新机制,并鉴定PD-L1/PD-1为登革热免疫病理的新机制 | 未提供明确的局限性信息 | 探究登革病毒NS1蛋白N-糖基化位点的生物学作用及其在病毒感染和免疫逃逸中的机制 | 登革病毒NS1蛋白及其N207糖基化位点,以及感染小鼠模型中的免疫反应 | 免疫学及病毒感染 | 登革热 | RNA-seq(包括bulk和单细胞RNA测序)、细胞因子测定、免疫表型分析 | 小鼠模型 | 基因表达数据、免疫表型数据 | 临床相关小鼠模型(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序 | NA | NA |
| 1930 | 2026-08-20 |
Diamond-Inspired DNA Hydrogel Based on Tetrahedral Framework Nucleic Acids for Burn Wound Healing
2025-11, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202509727
PMID:40817796
|
研究论文 | 本研究受钻石结构启发,利用四面体框架核酸制备出具有增强机械强度的DNA水凝胶,用于促进烧伤创面愈合 | 首次通过钻石启发结构增强纯DNA水凝胶的机械性能,并系统评估其在再生医学中的多重功能,包括ROS清除、止血、粘附、注射性、剪切稀化和自愈合能力 | 研究主要在动物模型上进行,临床转化潜力需进一步验证;水凝胶的长期稳定性和体内降解行为未深入探讨 | 开发一种新型DNA水凝胶敷料,通过调节免疫微环境促进烧伤创面愈合,并增强DNA水凝胶的机械强度 | DNA水凝胶,基于四面体框架核酸,用于烧伤创面愈合 | 组织工程与再生医学 | 烧伤创面 | 单细胞测序 | 不适用 | 单细胞转录组数据 | 小鼠皮肤样本,具体数量未提供 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 1931 | 2026-08-20 |
A comprehensive molecular atlas of the mesenchymal cell types in the mouse liver
2025-Nov, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-025-00580-9
PMID:40954217
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研究论文 | 通过对成年小鼠肝脏进行深度单细胞RNA测序,构建了包含主要细胞类型的全面分子图谱,特别揭示了内皮细胞和间充质细胞的多样性及其在肝纤维化中的反应 | 首次提供了小鼠肝脏中门静脉周围微血管、窦状隙和门静脉内皮细胞的详细亚型,并识别出位于不同解剖区域的肝星状细胞、成纤维细胞和血管壁细胞的独特亚群,发现一种未被识别的囊状肝星状细胞群体在纤维化疾病中扩张 | 研究仅限于小鼠模型,未涉及人类肝脏;未提供功能验证实验 | 构建成年小鼠肝脏的全面分子图谱,以增进对肝脏细胞组成和疾病反应的理解 | 成年小鼠肝脏中的内皮细胞和间充质细胞(包括肝星状细胞、成纤维细胞和血管壁细胞) | 单细胞转录组学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠肝脏样本(具体数量未提供) | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 1932 | 2026-08-20 |
White and brown adipose tissue share a convergent fibro-adipogenic progenitor population
2025-Nov, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-025-00591-6
PMID:41062857
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析培养的原代白色和棕色前脂肪细胞,发现两种主要的祖细胞亚群,并揭示了棕色脂肪组织中存在的纤维-脂肪祖细胞样细胞,这些发现扩展了对脂肪组织异质性的理解 | 首次在棕色脂肪组织中发现纤维-脂肪祖细胞样细胞,并证明白色和棕色脂肪中的这类细胞具有趋同的促纤维化和应激反应特征,挑战了以往对棕色脂肪祖细胞群体的认知 | 研究基于体外培养条件,可能无法完全反映体内微环境对祖细胞身份的影响,且未提供功能验证实验来确认这些细胞在体内的具体作用 | 评估体外培养条件对白色和棕色前脂肪细胞祖细胞身份的影响,并探索脂肪组织中的祖细胞异质性 | 培养的原代白色和棕色前脂肪细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 轨迹分析和调控子分析 | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量,涉及培养的白色和棕色前脂肪细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1933 | 2026-08-20 |
Hemocytes facilitate interclonal cooperation-induced tumor malignancy by hijacking the innate immune system in Drosophila
2025-Oct, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-025-00547-5
PMID:40846901
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研究论文 | 本研究建立果蝇幼虫眼盘上皮肿瘤异质性模型,结合遗传学与单细胞RNA测序,揭示血细胞通过劫持先天免疫系统促进肿瘤恶性转化的机制 | 首次在果蝇中建立肿瘤异质性模型,发现三细胞连接蛋白M6突变与RasV12良性肿瘤协同作用,并通过血细胞介导的Pvf1-Pvr和Spz-Toll信号轴促进恶性转化 | 摘要未提及研究局限性 | 阐明肿瘤微环境中不同细胞类型间的通讯及其在肿瘤进展中的作用机制 | 果蝇幼虫眼盘上皮中的RasV12良性肿瘤细胞、M6突变细胞及肿瘤相关血细胞 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1934 | 2026-08-20 |
Spatial transcriptomics elucidates localized immune responses in atherosclerotic coronary artery
2025-10, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.1038/s44321-025-00280-w
PMID:40847214
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研究论文 | 利用空间转录组学技术分析人类冠状动脉不同严重程度的动脉粥样硬化病变,揭示局部免疫反应及其在疾病进展中的作用 | 结合GeoMx和CosMx两种空间转录组学平台,在单细胞水平上无偏地识别与动脉粥样硬化发病机制相关的分子和通路,并整合通路分析、细胞分型和邻域分析 | 摘要中未提及具体局限性 | 阐明动脉粥样硬化进展过程中免疫细胞的空间组织和作用,为减轻斑块发展和破裂提供新的治疗靶点 | 来自不同动脉粥样硬化病变严重程度患者的人类冠状动脉连续切片 | 空间转录组学 | 动脉粥样硬化 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 未明确提及样本数量 | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx, CosMx | NA |
| 1935 | 2026-08-20 |
GNAS/PKA signaling promotes aberrant osteochondral differentiation of Gli1+ tendon sheath progenitors
2025-Oct, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-025-00553-7
PMID:40890486
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研究论文 | 本研究揭示了Gli1+腱鞘祖细胞通过GNAS/PKA信号通路促进异常骨软骨分化的机制 | 首次通过谱系追踪和单细胞RNA测序识别出具有骨软骨分化能力的Gli1腱鞘祖细胞亚群,并阐明GNAS/PKA信号通路在异位骨化中的作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 | 探究肌腱损伤后异常骨软骨分化的细胞亚群及其分子机制,寻找潜在治疗靶点 | 小鼠跟腱损伤模型和人类肌腱干细胞 | 数字病理学 | 肌腱异位骨化 | 谱系追踪、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、组织学图像 | 小鼠跟腱损伤样本及人类肌腱干细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒 |
| 1936 | 2026-08-20 |
Genotype by Environment Interactions in Gene Regulation Underlie the Response to Soil Drying in the Model Grass Brachypodium distachyon
2025-10-01, Molecular biology and evolution
IF:11.0Q1
DOI:10.1093/molbev/msaf218
PMID:41065272
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研究论文 | 利用高重复RNA测序数据,研究模型草类二穗短柄草两个自然品种在土壤干旱响应中的基因型与环境互作效应,并揭示基因调控网络的重连现象 | 提出一个可扩展的框架,利用因果推断预测基因-基因互作,并筛选特定于基因型、处理或G×E的调控网络变化,填补了基因组尺度上G×E调控网络研究的空白 | 研究仅限于两个自然品种,可能限制了发现的普遍性;且主要依赖RNA测序数据,未覆盖其他层次的调控信息 | 理解基因型与环境互作在基因调控中的机制,预测自然群体对气候变化的响应,并确保作物在不同环境下的稳定性能 | 二穗短柄草的两个自然品种及其对土壤干旱的响应 | 基因表达调控、生态基因组学 | NA | RNA测序 | 因果推断模型 | 基因表达数据、生理代谢数据 | 两个自然品种,高重复RNA测序数据集(具体样本数未在摘要中提及) | NA | RNA-seq | NA | NA |
| 1937 | 2026-08-20 |
Decoding functional and developmental trajectories of tissue-resident uterine dendritic cells through integrative omics
2025-Sep-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113351
PMID:40949104
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和CITE-seq技术,解码人类子宫内膜中组织驻留树突状细胞的功能和发育轨迹 | 首次在人类子宫内膜中识别出驻留祖细胞来源的树突状细胞亚型,并描绘其发育轨迹和功能分化 | 未在体外或体内验证功能,样本数量有限,需要进一步研究确认 | 阐明人类子宫内膜中组织驻留树突状细胞的起源和功能,为生殖障碍提供参考 | 人类子宫内膜组织中的树突状细胞亚型,包括驻留祖细胞 | 单细胞组学 | 不孕症和妊娠并发症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、CITE-seq | 无 | 单细胞转录组数据、表面蛋白表达数据 | 不同月经周期阶段和早期妊娠的子宫内膜样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 和 CITE-seq 试剂盒 |
| 1938 | 2026-08-20 |
Integrated Analyses to Identify the Roles of GPX1 in Frailty and Hypertension
2025-08, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979)
|
研究论文 | 通过整合孟德尔随机化、RNA表达谱、单细胞RNA测序及分子对接,本研究鉴定GPX1在衰弱和高血压中的因果作用及潜在治疗靶点 | 首次利用双样本孟德尔随机化结合多组学数据,系统评估GPX1对衰弱和高血压的因果效应,并通过中介分析揭示甘氨酸和肉碱/麦角硫因的介导机制 | 研究依赖于公开数据库,可能存在人群异质性;中介分析和分子对接结果需进一步实验验证 | 识别衰弱和高血压的共同有效药物靶点 | GPX1基因及其在衰弱和高血压中的作用 | 机器学习 | 心血管疾病、老年疾病 | 孟德尔随机化、RNA-seq、单细胞RNA测序、分子对接 | NA | 基因组、转录组、单细胞表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1939 | 2026-08-20 |
Interpretable machine learning-guided single-cell mapping deciphers multi-lineage pancreatic dysregulation in type 2 diabetes
2025-07-24, Cardiovascular diabetology
IF:8.5Q1
DOI:10.1186/s12933-025-02865-8
PMID:40707916
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研究论文 | 本研究利用可解释机器学习指导的单细胞测序分析,揭示了2型糖尿病中胰腺多谱系的失调机制 | 开发了两种新型工具PanSubPred(两阶段特征选择/XGBoost分类器)和PSC-Stat(XGBoost/Gini优化),实现了多谱系细胞注释和星状细胞活化分析,发现了64个细胞类型特异性标记物(其中38个为新发现)和15基因糖尿病导管细胞特征 | 未提及明确的局限性 | 利用机器学习框架解码胰腺细胞异质性,系统绘制糖尿病中的胰腺细胞改变图谱 | 2型糖尿病患者的胰腺细胞,包括β细胞、腺泡细胞、导管细胞和星状细胞等 | 机器学习 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | XGBoost分类器 | 单细胞转录组数据 | 未在摘要中明确说明具体样本量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1940 | 2026-08-20 |
Lineage-resolved analysis of embryonic gene expression evolution in C. elegans and C. briggsae
2025-06-19, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adu8249
PMID:40536976
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序比较了秀丽隐杆线虫和布氏杆线虫胚胎发育过程中的基因表达进化,发现尽管物种间分化了数千万年,基因表达程序仍高度相似,但数千个基因的细胞类型特异性表达存在差异,尤其在神经元细胞类型中更为显著 | 首次利用谱系分辨的单细胞RNA测序技术,在具有保守不变胚胎谱系的两种线虫中系统比较了同源细胞的基因表达进化,揭示了发育过程中基因表达进化的约束和分化模式 | 文章未提供明确的局限性信息,可能包括对神经元亚型差异的深入机制解析不足或未涉及非神经元功能验证等 | 探究发育过程中基因表达模式进化的约束,并识别细胞类型特异性表达差异的基因及其功能富集 | 秀丽隐杆线虫和布氏杆线虫的胚胎细胞 | 单细胞转录组学 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 单细胞基因表达数据 | 两种线虫的胚胎样本,具体数量未提供 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |