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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1921 | 2026-09-29 |
PDGFRα+/Integrin α2+ Fibroblasts Orchestrate Tumor Budding in Oral Squamous Cell Carcinoma via Mechano-Metabolic Symbiosis: E-Cadherin/Integrin α2β1 Adhesion and Mitochondrial Transfer
2026-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.76385
PMID:42376922
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研究论文 | 该研究开发了肿瘤出芽类器官模型,并结合单细胞RNA测序和原位RNA测序,揭示了PDGFRα+/整合素α2+癌症相关成纤维细胞通过力学-代谢共生机制驱动口腔鳞状细胞癌肿瘤出芽 | 首次建立肿瘤出芽类器官模型忠实再现口腔鳞状细胞癌肿瘤-基质界面和出芽动态,发现PDGFRα+/整合素α2+ CAFs通过E-钙黏蛋白/整合素α2β1黏附传递生物力学信号激活YAP信号通路诱导EMT样程序,以及通过隧道纳米管介导的线粒体转移增强氧化磷酸化和生物能量供应,揭示力学-代谢共生驱动肿瘤出芽的新机制 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究驱动口腔鳞状细胞癌肿瘤出芽的基质调控因子和分子机制 | 口腔鳞状细胞癌肿瘤出芽 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序、原位RNA测序 | 肿瘤出芽类器官模型 | 图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序、原位RNA测序 | NA | NA |
| 1922 | 2026-09-29 |
Liver Endothelia Orchestrate MASH-Associated Macrophage Zonation Through FSTL1-ITGA4 Axis
2026-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.76410
PMID:42545862
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研究论文 | 该研究揭示了肝脏内皮细胞通过Kit/STAT2/FSTL1/ITGA4轴调控MASH相关巨噬细胞分区分布的机制 | 首次发现肝窦内皮细胞中Kit的分区丢失通过STAT2磷酸化抑制FSTL1,进而通过FSTL1-ITGA4轴驱动促炎巨噬细胞向小叶中心聚集,揭示了内皮功能障碍驱动空间免疫重组的机制 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 阐明分区化LSEC Kit如何调控MASH中巨噬细胞的分布 | 肝窦内皮细胞(LSECs)、巨噬细胞、MASH小鼠模型及人类数据 | 数字病理学、空间转录组学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎(MASH) | 空间转录组学、分区分选、内皮特异性基因敲除 | NA | 图像、文本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1923 | 2026-09-29 |
Chemokine-Driven Intercellular Crosstalk in the Osteosarcoma Microenvironment After Neoadjuvant Chemotherapy: A Single-Cell RNA Sequencing Study
2026-Aug-31, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines14091966
PMID:42792709
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序分析新辅助化疗前后骨肉瘤微环境的细胞异质性和趋化因子介导的细胞间通讯 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘新辅助化疗后骨肉瘤微环境的重塑过程,并鉴定出内皮细胞来源的CXCL2通过CXCR2促进巨噬细胞趋化,揭示趋化因子驱动的化疗耐药机制 | 样本量较小(12例患者),验证实验仅限于体外transwell和Western blotting,缺乏体内功能验证和更大规模队列的验证 | 表征新辅助化疗后骨肉瘤肿瘤微环境的细胞异质性,并鉴定驱动化疗耐药的趋化因子介导的细胞间通讯 | 12例骨肉瘤患者的手术标本,其中6例未经治疗,6例接受新辅助化疗后 | 单细胞组学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 12例骨肉瘤患者样本,共77,616个细胞(36,214个来自初治患者,41,402个来自新辅助化疗后样本) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1924 | 2026-09-29 |
Single-Cell Transcriptomic Identification of a Proliferative Intermediate State During Early Anagen Hair Follicle Regeneration
2026-Aug-31, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17091058
PMID:42792952
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组分析、调控分析和细胞间通讯分析,鉴定出早期毛囊再生过程中从次级毛芽相关细胞向下部毛囊相关细胞转变的增殖性中间转录状态 | 首次鉴定出增殖性下部毛囊样细胞(PR-loHF)作为次级毛芽相关细胞向下部毛囊相关细胞转变过程中的转录中间状态,揭示了该中间状态具有独特的细胞周期活性、上皮重塑、细胞外基质组织和发育调控等生物学程序的富集,以及独特的转录因子调控子和细胞间通讯模式 | 研究主要基于已发表的小鼠背部皮肤单细胞RNA测序数据的再分析,缺乏实验验证;仅聚焦于早期毛囊再生阶段,未涵盖完整的毛囊周期;PR-loHF状态的功能意义和调控机制仍需进一步体内实验验证 | 表征次级毛芽相关细胞向下部毛囊相关细胞转变过程中的转录变化,鉴定早期毛囊再生过程中的增殖性中间转录状态,并深入理解细胞状态转变和微环境变化 | 小鼠背部皮肤毛囊上皮细胞,包括次级毛芽相关细胞、增殖性下部毛囊样细胞(PR-loHF)和下部毛囊相关细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 文本 | 小鼠背部皮肤在毛囊周期第0、5、10、15、20、25和30天的组织切片样本,以及已发表的小鼠背部皮肤早期毛囊期单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1925 | 2026-09-29 |
Drug Repositioning Based on Single-Cell Transcriptomics Data Identifies Quinidine as a Potential Drug for Treating Osteoporosis
2026-Aug-31, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17091060
PMID:42792954
|
研究论文 | 基于单细胞转录组学数据进行药物重定位,鉴定出奎尼丁是治疗骨质疏松症的潜在药物 | 利用单细胞转录组学数据发现奎尼丁作为治疗糖皮质激素诱导的骨质疏松症的潜在药物 | 摘要中未提及 | 识别可重定位用于糖皮质激素诱导的骨质疏松症的药物 | 骨质疏松症(OP),特别是糖皮质激素诱导的骨质疏松症 | 机器学习 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本(单细胞转录组学数据) | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1926 | 2026-09-29 |
Diurnal Insulin Clearance and Circadian Metabolic Gene Signatures in MASLD: Integrative Multi-Dataset Physiological and Transcriptomic Analysis
2026-Aug-29, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo16090629
PMID:42783754
|
研究论文 | 该研究整合多个公共数据集,探索MASLD中胰岛素清除的昼夜节律变化及其与昼夜代谢基因特征的关系 | 首次整合单受试者试点评估、高胰岛素-正葡萄糖钳夹数据集、昼夜转录组数据集、空间转录组数据及HFD小鼠时间序列数据,系统探讨MASLD中胰岛素清除的昼夜变化与昼夜节律代谢基因特征的关联 | 单受试者试点评估样本量极小,缺乏大规模受控人体研究验证,结论需进一步验证 | 探索人体胰岛素清除的昼夜变化,并检查MASLD中相关的代谢基因特征 | 健康个体和MASLD患者、公共昼夜转录组数据集、空间转录组数据、HFD诱导小鼠模型 | 机器学习 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | 高胰岛素-正葡萄糖钳夹、转录组分析、空间转录组学 | NA | 转录组数据、生理指标数据 | 单受试者试点评估1例,以及多个公共数据集中的健康个体和MASLD患者样本 | NA | bulk RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 1927 | 2026-09-29 |
Peripheral Nerve Injury Induces an Interferon-Responsive State Centered on Satellite Glial Cells in the DRG That Sustains Neuropathic Pain Through STAT1 and CXCL10 Signaling
2026-Aug-29, Brain sciences
IF:2.7Q3
DOI:10.3390/brainsci16090921
PMID:42793346
|
研究论文 | 该研究结合单细胞转录组学与组织学、行为学和电生理学方法,发现周围神经损伤后背根神经节中卫星胶质细胞出现干扰素响应状态,并通过STAT1和CXCL10信号维持神经病理性疼痛 | 首次在背根神经节中鉴定出干扰素响应的卫星胶质细胞状态,并揭示其通过STAT1依赖的CXCL10/CXCR3趋化因子信号维持神经病理性疼痛,同时证明靶向该通路可缓解疼痛及运动功能缺陷 | 摘要中未明确说明研究的局限性 | 阐明周围神经损伤后维持神经病理性疼痛的细胞状态及细胞间信号机制 | 背根神经节中的卫星胶质细胞、感觉神经元和免疫细胞,以及 spared nerve injury 小鼠模型 | 单细胞转录组学 | 神经病理性疼痛 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据、组织学数据、行为学数据、电生理学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1928 | 2026-09-29 |
Integrating Multi-Omics and Machine Learning to Reveal a Prognostic Model for Prostate Cancer Metastatic Recurrence Associated with Epithelial-Mesenchymal Transition Features
2026-Aug-27, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17091015
PMID:42792911
|
研究论文 | 该研究整合批量转录组、单细胞RNA测序和空间转录组数据,结合91种机器学习算法组合构建了一个与上皮-间质转化特征相关的三基因预后模型,用于前列腺癌转移复发风险分层 | 首次整合多组学数据与91种机器学习算法组合,构建了基于EMT相关基因(INHBA、FAP、ITGBL1)的前列腺癌转移复发预后模型,并结合SHAP分析增强模型可解释性,同时通过单细胞和空间转录组推断出COMP+成纤维细胞向NELL2+成纤维细胞的转录转变 | 空间分析仅基于一个组织切片,样本量有限;研究结果属于假设生成性证据,仍需实验验证;外部验证队列的AUC值(0.62-0.77)低于训练队列(0.93),模型泛化能力有待进一步验证 | 开发基于机器学习和多组学整合的前列腺癌预后模型,识别与EMT相关的转移复发风险标志物,实现精准风险分层 | 前列腺癌患者及其肿瘤组织样本 | 机器学习 | 前列腺癌 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | Random Forest, Lasso, CoxBoost, 共识聚类, WGCNA, SHAP | 转录组数据, 图像 | 训练队列248例(GSE116918),三个外部验证队列(TCGA-PRAD、GSE70769、GSE46602),单细胞RNA测序10,672个细胞(GSE268307),空间转录组1个组织切片 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 10x Genomics Visium | 10x Genomics Visium FFPE |
| 1929 | 2026-09-29 |
Single-Cell RNA Sequencing Combined with MEBOCOST Reveals Alveolar Macrophage-Mediated Immunometabolic Communication Mechanisms in Sepsis-Induced Acute Lung Injury
2026-Aug-27, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17091019
PMID:42792913
|
研究论文 | 该研究通过整合单细胞和批量转录组数据,结合CellChat和MEBOCOST重建蛋白质-代谢物双重通讯网络,揭示了脓毒症诱导急性肺损伤中肺泡巨噬细胞介导的免疫代谢通讯机制 | 首次建立SI-ALI的双层细胞通讯图谱,提出以巨噬细胞为中心的代谢炎症调控模型,并识别出铁-Slc40a1和LTB4-Ltb4r1信号主导的肺泡巨噬细胞-中性粒细胞免疫代谢轴 | 研究主要基于CLP诱导的脓毒症小鼠模型,尚未在人类临床样本中验证;MEBOCOST预测的代谢物通讯需要更多实验验证 | 阐明脓毒症诱导急性肺损伤中代谢物介导的免疫信号传递机制,特别是肺泡巨噬细胞作为中心代谢协调者的作用 | CLP诱导的脓毒症小鼠肺组织 | 机器学习, 数字病理学 | 脓毒症诱导急性肺损伤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | LASSO回归, 随机森林 | 基因表达数据, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1930 | 2026-09-29 |
Prognostic Significance of CDKL2 in Non-Small Cell Lung Cancer: A Favorable Association in Lung Adenocarcinoma
2026-Aug-27, Medicina (Kaunas, Lithuania)
DOI:10.3390/medicina62091638
PMID:42796245
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研究论文 | 该研究评估了CDKL2表达与非小细胞肺癌不同组织学亚型(肺腺癌和肺鳞癌)预后之间的关联差异 | 揭示了CDKL2在肺腺癌和肺鳞癌中具有相反的预后关联,且通过组织学交互项验证了这种差异的统计学显著性 | LUSC的不良预后关联仅为初步结果,外部验证队列中未支持该关联,CDKL2应被视为候选预后标志物而非已确立的临床生物标志物 | 评估CDKL2表达在不同非小细胞肺癌组织学亚型中的预后意义是否存在差异 | 非小细胞肺癌患者,包括肺腺癌和肺鳞癌患者 | 数字病理学, 机器学习 | 肺癌 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 多变量Cox比例风险模型 | 基因表达数据, 临床数据, 图像 | TCGA队列943例患者(471例LUAD,472例LUSC,375例死亡),外部验证队列GSE30219 | Illumina | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | TCGA表达数据及GSE30219数据集 |
| 1931 | 2026-09-29 |
The cellular and molecular basis of gyrus-sulcus specialization in the primate brain
2026-Aug-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-77086-y
PMID:42786222
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研究论文 | 该研究利用成年雄性猕猴脑的单细胞空间转录组数据,开发了深度学习框架gsModel,用于区分脑回和脑沟,并揭示了其细胞和分子基础 | 开发了gsModel深度学习框架,仅基于局部细胞类型组成即可区分脑沟和脑回,准确率超过90%,并整合扩散MRI纤维束追踪,将局部分子结构与宏观连接联系起来 | 研究仅基于成年雄性猕猴,样本有限,未涉及其他物种或发育阶段,且未进行功能验证实验 | 探究灵长类大脑脑回和脑沟特化的细胞和分子基础 | 成年雄性猕猴的大脑皮层 | 空间转录组学、深度学习、神经科学 | NA | 单细胞空间转录组学、扩散MRI纤维束追踪 | 深度学习框架(gsModel) | 空间转录组数据、图像数据(MRI) | 成年雄性猕猴大脑样本(具体数量未提及) | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 1932 | 2026-09-29 |
Single-Cell RNA-Seq Reveals Chromosomal Instability-Associated Transcriptomic Profiles in Breast Cancer
2026-Aug-26, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines14091902
PMID:42792645
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据量化乳腺癌中的染色体不稳定性水平和克隆异质性,并揭示其转录组学特征 | 在单细胞分辨率下量化染色体不稳定性,揭示其与克隆异质性的关联,并发现新的候选生物标志物 | 染色体不稳定性与克隆异质性之间的正相关趋势在统计学上不显著 | 量化HER2阳性和三阴性乳腺癌中的染色体不稳定性水平和克隆异质性,探索其转录组学特征 | HER2阳性和三阴性乳腺癌肿瘤及非恶性对照样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1933 | 2026-09-29 |
An L1CAM-Positive Fibroblast-Associated Stromal State Is Associated with Reduced T/NK Cytotoxicity Features in Colorectal Cancer
2026-Aug-26, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines14091900
PMID:42792643
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研究论文 | 本研究利用公共批量与单细胞数据集,刻画了结直肠癌中L1CAM的表达模式、细胞定位及免疫相关特征 | 发现L1CAM主要表达于罕见的成纤维细胞和上皮细胞亚群而非T/NK细胞,并揭示L1CAM阳性成纤维细胞相关基质状态与T/NK细胞毒性特征降低相关 | 研究为假设生成性,结论具有数据集特异性,补充外部数据集未能重复相同方向的关联,需要空间和功能验证 | 表征结直肠癌中L1CAM的表达模式、细胞定位及免疫微环境相关特征 | 结直肠癌患者样本及公共数据库中的泛癌数据 | 数字病理学 | 结直肠癌 | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | 文本(基因表达数据) | TCGA、GTEx、CPTAC/UALCAN泛癌数据集及GSE178341单细胞数据集 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1934 | 2026-09-29 |
CSNK2B Expression Aligns with a GDF15-Associated Immune Molecular State in Hepatocellular Carcinoma
2026-Aug-26, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines14091909
PMID:42792651
|
研究论文 | 该研究整合多组学数据,分析肝细胞癌中CSNK2B表达与GDF15相关免疫分子状态之间的关联 | 首次将CSNK2B表达与GDF15相关Treg/检查点转录模块在肝细胞癌中建立可重复的关联,并结合单细胞RNA测序、去卷积和CellChat推断进行多维度验证 | 证据仅为关联性,无法提供因果或治疗预测声明;去卷积结果较弱且异质性大;候选的肝细胞到T/NK细胞的GDF15-TGFBR2配受体对未能在合并数据或患者分层分析中重现 | 探讨CSNK2B在肝细胞癌中的表达与免疫状态之间的关系 | 肝细胞癌(HCC)患者样本及公共数据库数据 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 蛋白质组学 | NA | 图像, 文本 | TCGA-LIHC队列、6个GEO队列-平台组合、GSE149614单细胞RNA测序数据以及10例患者分层的CellChat分析 | Illumina | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | Illumina NovaSeq | TCGA-LIHC和GEO队列的批量RNA测序数据、GSE149614单细胞RNA测序数据 |
| 1935 | 2026-09-29 |
An Exploratory Single-Cell Analysis Identifies Candidate Shared Molecular Features in Proliferative Diabetic Retinopathy and Parkinson's Disease
2026-Aug-26, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17091004
PMID:42792898
|
研究论文 | 该研究整合了增殖性糖尿病视网膜病变(PDR)视网膜纤维血管膜和帕金森病(PD)脑组织的单细胞RNA测序数据集,以探索两种疾病之间共享的分子和细胞特征 | 首次通过整合PDR和PD的单细胞RNA测序数据,识别出A2M、NRP1和ETS2等候选共享转录特征,并预测了ITGB2-ICAM1配体-受体相互作用作为两种疾病间潜在的免疫-血管通讯机制 | 本研究为探索性分析,样本量有限,ITGB2-ICAM1相互作用仅为计算预测结果,需要进一步的实验验证来确认其生物学意义 | 旨在描绘糖尿病视网膜病变与帕金森病之间的分子和细胞联系,特别关注两者趋同的神经免疫和血管通路 | 增殖性糖尿病视网膜病变(PDR)的视网膜纤维血管膜组织和帕金森病(PD)的脑组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | CellChat | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1936 | 2026-09-29 |
Aerobic Exercise Alleviates Oligodendrocyte Injury and Ferroptosis-Related Features in MPTP-Induced Parkinsonian Mice with Improved Neuropathological Phenotypes
2026-Aug-24, Brain sciences
IF:2.7Q3
DOI:10.3390/brainsci16090904
PMID:42793329
|
研究论文 | 本研究结合单核RNA测序和空间转录组学,探究有氧运动对MPTP诱导的帕金森病小鼠黑质致密部少突胶质细胞损伤及铁死亡相关特征的缓解作用 | 首次结合单核RNA测序和空间转录组学揭示MPTP诱导帕金森病小鼠黑质致密部少突胶质细胞丰度降低及铁死亡通路富集,并发现有氧运动可部分恢复少突胶质细胞标志基因Plp1及抗氧化分子Nrf2和Gpx4的表达 | 研究主要基于MPTP诱导的小鼠模型,尚未在人类帕金森病患者中验证;代谢组学分析为探索性非靶向研究,需要进一步验证 | 探究帕金森病中少突胶质细胞相关的调控机制,以及有氧运动对少突胶质细胞损伤和铁死亡相关特征的干预效果 | MPTP诱导的帕金森病小鼠模型黑质致密部 | 数字病理学, 机器学习 | 帕金森病 | 单核RNA测序, 空间转录组学, 非靶向代谢组学 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学, 非靶向代谢组学 | NA | NA |
| 1937 | 2026-09-29 |
Single-cell spatial mapping of human kidney development implicates the microenvironment in guiding cell fate decisions
2026-Aug, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-026-02665-0
PMID:42533102
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术,分析了超过70万个细胞,绘制了人类肾脏发育的时空图谱,揭示了微环境在指导细胞命运决定中的作用。 | 揭示了肾脏发育过程中细胞命运的可塑性,即早期模式化建立的细胞命运可以在后期被修正;通过全基因组、空间感知的细胞间相互作用分析,将局部配体信号与细胞命运决定联系起来。 | 未明确提及 | 研究人类肾脏发育过程中细胞间相互作用如何协调器官形成,并绘制其空间组织图谱。 | 人类肾脏发育过程中的细胞 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据 | 超过700,000个细胞 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 1938 | 2026-09-29 |
[Research Progress on the Application of Single-Cell Sequencing Technology in Diffuse Large B-Cell Lymphoma --Review]
2026-Aug, Zhongguo shi yan xue ye xue za zhi
|
综述 | 本文系统综述了单细胞测序技术在弥漫性大B细胞淋巴瘤研究中的前沿进展 | 从单细胞层面系统解析DLBCL的细胞异质性、肿瘤微环境细胞互作及动态变化,并展望多组学和空间转录组技术的临床应用前景 | 未涉及具体实验数据或原始研究结果,属于文献综述,缺乏对现有研究局限性的深入批判性分析 | 阐述单细胞测序技术在DLBCL发病机制、肿瘤微环境、预后评估及新型治疗靶点研究中的应用进展 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL) | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1939 | 2026-09-29 |
CODAvision: best practices and a user-friendly interface for rapid, customizable segmentation of medical images
2026-Jul-07, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-026-01404-3
PMID:42414617
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研究方法 | 该论文介绍了CODAvision工具,这是一个用户友好的图形界面,用于快速、可定制的医学图像语义分割,并提供了最佳实践指南 | CODAvision通过提供图形用户界面简化了参数配置、模型训练和性能评估,自动生成定量结果和综合报告,使没有编码经验的研究人员也能使用深度学习进行医学图像分割 | 需要用户对编程和解剖学有基本了解 | 简化医学图像的语义分割过程,使没有广泛编码专业知识的研究人员能够训练高度可定制的深度学习模型 | 医学图像,包括组织学、磁共振成像和计算机断层扫描等 | 数字病理学 | NA | 深度学习语义分割 | 卷积神经网络 | 图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1940 | 2026-09-29 |
Single-cell RNA sequencing in thyroid cancer: a methodological review and thyroid specific dissociation protocol
2026-Jun-26, Thyroid research
IF:1.9Q3
DOI:10.1186/s13044-026-00306-6
PMID:42363265
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综述 | 该综述系统评估了甲状腺癌中已发表的单细胞RNA测序研究的方法学,并提出了一种优化的甲状腺组织解离方案,用于生成高质量的单细胞悬液 | 提出了用免疫磁珠去除步骤替代传统红细胞裂解缓冲液的优化甲状腺组织解离方案,提高了细胞回收率和活力,并系统评价了现有甲状腺癌scRNA-seq研究的方法学缺陷 | 优化方案仍需正式的验证研究,且需要在更广泛的样本类型中进行基准测试 | 评估甲状腺癌中已发表的scRNA-seq研究的方法学,并开发适用于珍贵患者来源甲状腺样本的优化组织解离方案 | 甲状腺癌原发肿瘤样本,包括乳头状甲状腺癌、低分化甲状腺癌和未分化甲状腺癌 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | 22项研究,涉及作者收集的原发肿瘤标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基于液滴的单细胞RNA测序平台 |