单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27585 篇文献，本页显示第 19301 - 19320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 19301 | 2024-08-08 |
Comparison of the Single-Cell Immune Landscape of Testudines from Different Habitats
2022-12-12, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11244023
PMID:36552787
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术比较了来自不同栖息地的龟类外周免疫细胞的组成、功能和分化轨迹 | 首次在龟类外周血液中识别出两种嗜碱性粒细胞亚型（GATA2-high-basophils和GATA2-low-basophils），并鉴定了特定类型的免疫细胞 | NA | 探究龟类对不同生态位免疫适应的机制 | 不同栖息地的龟类外周免疫细胞 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 多种龟类物种 |
| 19302 | 2024-08-08 |
Activation of OSM-STAT3 Epigenetically Regulates Tumor-Promoting Transcriptional Programs in Cervical Cancer
2022-Dec-10, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14246090
PMID:36551576
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研究论文 | 本文研究了OSM-STAT3信号通路在宫颈癌中的表观遗传调控机制 | 首次揭示了OSM-STAT3轴通过表观遗传调控宫颈癌进展相关基因的机制 | NA | 探讨OSM-STAT3信号通路在宫颈癌中的表观遗传调控作用 | 宫颈癌 | 数字病理学 | 宫颈癌 | scRNA-seq, bulk RNA-seq, ATAC-seq | NA | RNA, 染色质 | 三个独立的宫颈癌队列 |
| 19303 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing for the Detection of Clonotypic V(D)J Rearrangements in Multiple Myeloma
2022-Dec-10, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms232415691
PMID:36555330
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研究论文 | 本文探讨了通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）检测多发性骨髓瘤（MM）中克隆型V(D)J重排序列的可行性 | scRNA-seq分析在识别克隆性生产重排方面比标准方法更有效，避免了高突变区域中共识引物错配的限制 | NA | 验证单细胞RNA测序在检测多发性骨髓瘤中克隆型V(D)J重排序列的准确性和有效性 | 多发性骨髓瘤患者的骨髓样本中的CD138细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 19个含有浆细胞紊乱的骨髓抽吸样本 |
| 19304 | 2024-08-08 |
Comparative Analysis of mRNA and miRNA Expression between Dermal Papilla Cells and Hair Matrix Cells of Hair Follicles in Yak
2022-12-09, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11243985
PMID:36552749
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研究论文 | 本研究比较了牦牛毛囊中真皮乳头细胞和毛母质细胞的mRNA和miRNA表达差异，以分析这两种细胞在毛囊发育中的分子相互作用基础 | 本研究结合了10×基因组单细胞转录组数据，鉴定了39个牦牛真皮乳头细胞的标记基因，并筛选出123个相对特异性表达的miRNAs，其中包括与毛囊发育相关的miR-143、miR-214、miR-125b、miR-31和miR-200 | NA | 探讨牦牛毛囊中真皮乳头细胞和毛母质细胞在毛囊发育中的分子机制 | 牦牛毛囊中的真皮乳头细胞和毛母质细胞 | NA | NA | 10×基因组单细胞转录组 | NA | mRNA和miRNA | NA |
| 19305 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing of the Testis of Ciona intestinalis Reveals the Dynamic Transcriptional Profile of Spermatogenesis in Protochordates
2022-12-08, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11243978
PMID:36552742
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研究论文 | 本研究首次对Ciona intestinalis的睾丸进行单细胞RNA测序，揭示了原索动物精子发生过程中的动态转录谱 | 首次在原索动物中进行单细胞RNA测序，揭示了精子发生过程中的基因表达和转录调控动态 | 研究仅限于Ciona intestinalis，且部分特定基因的功能需要进一步验证 | 探究原索动物精子发生的基因调控机制 | Ciona intestinalis的睾丸中的6832个生殖细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 6832个生殖细胞 |
| 19306 | 2024-08-08 |
Baicalein Relieves Ferroptosis-Mediated Phagocytosis Inhibition of Macrophages in Ovarian Endometriosis
2022-Dec-07, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb44120422
PMID:36547083
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研究论文 | 本文研究了铁过载在卵巢子宫内膜异位症中对巨噬细胞的影响，并探讨了黄芩素在缓解铁死亡介导的巨噬细胞吞噬功能抑制中的作用 | 首次揭示了铁死亡在卵巢子宫内膜异位症中通过影响巨噬细胞的吞噬功能和促进血管生成细胞因子的产生，从而促进疾病发展的机制 | NA | 探讨铁过载在卵巢子宫内膜异位症中对巨噬细胞的影响及黄芩素的潜在治疗作用 | 卵巢子宫内膜异位症中的巨噬细胞及黄芩素的作用 | NA | 妇科疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及卵巢子宫内膜异位症患者的巨噬细胞和THP-1细胞 |
| 19307 | 2024-08-08 |
Diversity of Circulating NKT Cells in Defense against Carbapenem-Resistant Klebsiella Pneumoniae Infection
2022-Dec-07, Journal of personalized medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jpm12122025
PMID:36556247
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了在碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌（CRKP）感染过程中，外周血中NK和NKT细胞的免疫反应 | 首次详细描述了NKT细胞亚群在CRKP感染过程中的免疫作用机制 | 研究样本量较小，仅涉及3名患者 | 探讨NKT细胞在防御碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌感染中的作用 | 外周血中的NK和NKT细胞 | NA | 肺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 血液样本 | 3名CRKP感染患者 |
| 19308 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing of Malignant Ascites Reveals Transcriptomic Remodeling of the Tumor Microenvironment during the Progression of Epithelial Ovarian Cancer
2022-12-02, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes13122276
PMID:36553542
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析了五名上皮性卵巢癌患者的恶性腹水样本，揭示了肿瘤微环境在疾病进展中的转录组重塑 | 研究首次详细描述了恶性腹水中肿瘤微环境在卵巢癌进展中的动态变化，包括癌细胞状态的转变和相关生物通路的激活 | 研究样本量较小，仅基于五个患者的样本，可能影响结果的普遍性 | 探索上皮性卵巢癌患者恶性腹水中肿瘤微环境在肿瘤进展和复发中的调控机制 | 上皮性卵巢癌患者的恶性腹水样本 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞测序 | 无监督深度嵌入单细胞聚类算法 | 转录组数据 | 4680个单细胞，来自五个上皮性卵巢癌患者（三个诊断样本和两个复发样本） |
| 19309 | 2024-08-08 |
scDSSC: Deep Sparse Subspace Clustering for scRNA-seq Data
2022-12, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1010772
PMID:36534702
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研究论文 | 本文提出了一种结合噪声降低和维度降低的深度稀疏子空间聚类方法scDSSC，用于单细胞RNA测序数据，该方法通过显式建模scRNA-seq数据生成，同时学习特征表示和聚类 | scDSSC方法在多种scRNA-seq数据集上显著提高了聚类性能，并增强了聚类和下游分析的可解释性 | NA | 旨在改进单细胞RNA测序数据的聚类分析 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 深度稀疏子空间聚类 | 单细胞RNA测序数据 | 数千至数万个细胞 |
| 19310 | 2024-08-08 |
Impact of CD4 T cells on intratumoral CD8 T-cell exhaustion and responsiveness to PD-1 blockade therapy in mouse brain tumors
2022-12, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2022-005293
PMID:36543376
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研究论文 | 本文研究了CD4 T细胞对小鼠脑肿瘤中肿瘤内CD8 T细胞耗竭和PD-1阻断疗法反应性的影响 | 首次描述了功能失调的CD4 T细胞与终末期CD8 T细胞耗竭的关联，并展示了CD40激动剂与PD-1阻断疗法的协同作用 | NA | 探究CD4 T细胞对CD8 T细胞耗竭和PD-1阻断疗法反应性的影响 | 小鼠脑肿瘤模型中的CD4和CD8 T细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 雌性C57/BL6小鼠的肿瘤浸润淋巴细胞 |
| 19311 | 2024-08-08 |
Modeling resistance of colorectal peritoneal metastases to immune checkpoint blockade in humanized mice
2022-12, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2022-005345
PMID:36543378
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研究论文 | 本文通过将患者来源的器官样移植到人源化小鼠的盲肠中，创建了一个新的MSI-H CRC肿瘤自发多器官转移模型，并分析了免疫检查点阻断治疗的效果及其与肿瘤免疫环境的关系。 | 结合器官样和人源化小鼠技术，提供了一个新的自发多器官转移模型，并提供了B细胞在抗CTLA-4治疗后产生部位依赖性抗肿瘤免疫中的关键作用的实证。 | NA | 研究免疫检查点阻断治疗在MSI-H CRC肿瘤中的效果及其机制。 | MSI-H CRC肿瘤的自发多器官转移及其对免疫检查点阻断治疗的反应。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 免疫组织化学、流式细胞术和单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 患者来源的器官样移植到人源化小鼠的盲肠中 |
| 19312 | 2024-08-08 |
Characterizing Macrophages Diversity in COVID-19 Patients Using Deep Learning
2022-12-01, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes13122264
PMID:36553530
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研究论文 | 本研究利用深度学习技术分析了COVID-19患者的单细胞RNA测序数据，以识别与疾病严重程度相关的分子状态 | 本研究首次使用图卷积神经网络模型来预测COVID-19感染的严重程度，并展示了高预测准确率 | NA | 旨在通过计算方法识别与COVID-19感染严重程度相关的分子状态，以理解关键免疫反应的差异 | COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液样本中的单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | 图卷积神经网络 | 基因表达数据 | 12个支气管肺泡灌洗液样本，包含63,734个细胞，每个细胞有23,916个基因 |
| 19313 | 2024-08-08 |
The Sum of Two Halves May Be Different from the Whole-Effects of Splitting Sequencing Samples Across Lanes
2022-12-01, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes13122265
PMID:36553532
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研究论文 | 本文探讨了将样本分批进行高通量测序（HTS）时，跨测序道分割样本对结果的影响 | 系统性地分析了测序设计中被忽略的变异来源，并展示了这种分割对批量和单细胞测序数据分析的定性和定量影响 | 文章未详细说明解决这些问题的具体方法或技术 | 研究测序设计中的变异来源及其对结果稳健性和可重复性的影响 | 批量mRNA测序、批量ChIP测序和单细胞测序数据 | 高通量测序 | NA | 高通量测序（HTS） | NA | 序列数据 | 未具体说明样本数量 |
| 19314 | 2024-08-08 |
Colon-Targeted eNAMPT-Specific Peptide Systems for Treatment of DSS-Induced Acute and Chronic Colitis in Mouse
2022-Nov-30, Antioxidants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antiox11122376
PMID:36552583
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序数据分析，揭示了NAMPT和CYBB在结肠炎患者和鼠模型中的表达上调，并开发了一种新型重组TK肽rCT-NAMPT，该肽能够靶向结肠并抑制NAMPT与CYBB或TLR4的相互作用，有效减轻DSS诱导的急性和慢性结肠炎。 | 开发了一种新型重组TK肽rCT-NAMPT，该肽具有结肠靶向性并能抑制NAMPT与CYBB或TLR4的相互作用，为结肠炎治疗提供了新的候选药物。 | NA | 研究NAMPT在炎症巨噬细胞中的作用及其在结肠炎治疗中的潜在应用。 | NAMPT和CYBB在结肠炎中的表达及新型重组TK肽rCT-NAMPT的开发与应用。 | NA | 结肠炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 19315 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing Identifies Master Regulators Affected by Panobinostat in Neuroblastoma Cells
2022-11-29, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes13122240
PMID:36553506
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研究论文 | 本文通过单细胞测序技术研究了泛HDAC抑制剂panobinostat在神经母细胞瘤细胞中的作用，并识别了受其影响的转录调控因子。 | 利用单细胞测序技术在神经母细胞瘤细胞中研究panobinostat的作用，具有前所未有的分辨率。 | NA | 探究panobinostat在神经母细胞瘤细胞中的分子机制和基因调控网络。 | 神经母细胞瘤细胞和panobinostat的作用。 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 19316 | 2024-08-08 |
A Dual-Channel Microfluidic Chip for Single Tobacco Protoplast Isolation and Dynamic Capture
2022-Nov-29, Micromachines
IF:3.0Q2
DOI:10.3390/mi13122109
PMID:36557407
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研究论文 | 本研究设计了一种基于PDMS的双通道微流控芯片，用于单个烟草原生质体的分离和动态捕获 | 本研究提供了一种新的高吞吐量单原生质体研究策略，并为单细胞捕获机制奠定了理论基础 | NA | 研究单个原生质体的分离和捕获，以满足基因功能验证、亚细胞定位和单细胞测序的需求 | 烟草原生质体和聚苯乙烯微球 | 微流控技术 | NA | 微流控芯片 | NA | NA | 单个烟草原生质体的捕获效率为83.33%，入口流速为0.75 μL/min |
| 19317 | 2024-08-08 |
Advances in Single-Cell Sequencing Technology and Its Application in Poultry Science
2022-11-25, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes13122211
PMID:36553479
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review | 本文综述了单细胞测序技术及其在禽类科学中的应用 | 单细胞测序技术在禽类科学中的应用潜力 | 单细胞测序技术在禽类科学中的应用报道较少 | 探讨单细胞测序技术在禽类科学中的应用及其创新 | 单细胞测序技术及其在禽类科学中的应用 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 基因、表型和细胞生物学机制 | 单个细胞 |
| 19318 | 2024-08-08 |
Microglia-specific transcriptional repression of interferon-regulated genes after prolonged stress in mice
2022-Nov, Neurobiology of stress
IF:4.3Q1
DOI:10.1016/j.ynstr.2022.100495
PMID:36532375
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研究论文 | 研究探讨了小鼠在长期轻度压力下，小胶质细胞特异性的表观基因组变化及其对干扰素调节基因的转录抑制作用 | 首次揭示了小胶质细胞在长期压力下对干扰素调节基因的转录抑制，且这一现象与干扰素的产生无关，而是可能与Activating Transcription Factor 3 (ATF3)的增加有关 | NA | 探究长期压力下小胶质细胞的表观基因组变化及其对神经炎症的影响 | 小胶质细胞 | 神经科学 | NA | RNA-seq, ATAC-seq | NA | 基因表达数据 | 12周暴露于轻度压力的小鼠 |
| 19319 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic, transcriptomic, and metabolomic characterization of human atherosclerosis
2022-Nov, Annals of translational medicine
DOI:10.21037/atm-22-4852
PMID:36544681
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学、转录组学和代谢组学分析，深入探讨了人类动脉粥样硬化的细胞间相互作用和关键基因 | 本研究首次综合分析了单细胞测序数据、主动脉转录组和代谢组数据，揭示了动脉粥样硬化的关键基因和信号通路 | NA | 深入理解动脉粥样硬化斑块形成的细胞间连接和关键中心基因 | 人类动脉粥样硬化的细胞类型、亚型分化轨迹、相互作用网络和重要转录因子 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据、代谢组数据 | 涉及多种细胞类型，包括T细胞、单核细胞、平滑肌细胞、内皮细胞、B细胞、成纤维细胞、浆细胞、肥大细胞、树突状细胞和自然杀伤细胞 |
| 19320 | 2024-08-08 |
Intermittent protein restriction protects islet β cells and improves glucose homeostasis in diabetic mice
2022-04-15, Science bulletin
IF:18.8Q1
DOI:10.1016/j.scib.2021.12.024
PMID:36546138
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研究论文 | 本研究探讨了间歇性蛋白质限制（IPR）在糖尿病控制中的有效性 | IPR不仅显著降低了糖尿病小鼠的高血糖，还改善了胰岛β细胞的数量、增殖和功能，并减少了肝脏中的葡萄糖产生 | NA | 探索间歇性蛋白质限制在糖尿病治疗中的效果 | 糖尿病小鼠模型 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了链脲佐菌素处理和瘦素受体缺陷的db/db小鼠模型 |