单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
19181 2024-08-05
Strategy of Patient-Specific Therapeutics in Cardiovascular Disease Through Single-Cell RNA Sequencing
2023-Jan, Korean circulation journal IF:3.0Q2
综述 本文总结了单细胞RNA测序技术及其在心血管疾病中的应用 探讨了单细胞测序技术在精准医学中的临床应用 未具体提及技术的局限性 研究单细胞RNA测序在心血管疾病中的应用 分析心脏和血管的单细胞转录组 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 转录组 NA
19182 2024-08-05
Transcriptomic Analysis of Human Podocytes In Vitro: Effects of Differentiation and APOL1 Genotype
2023-Jan, Kidney international reports IF:5.7Q1
研究论文 本研究分析了人类足细胞的转录组,以探讨分化和APOL1基因型的影响 该研究首次综合分析了人类尿源性足细胞的转录组特征,揭示APOL1高风险变体对足细胞功能的影响 研究仅使用了有限的细胞系,可能无法全面反映所有足细胞的转录特征 理解APOL1高风险变体对足细胞病理的作用机制 人类尿源性足细胞样上皮细胞(HUPEC)及其转录组 数字病理学 肾小管间质病 转录组分析 NA RNA 4个细胞系(2个APOL1高风险,2个低风险)
19183 2024-08-05
Initiative of clinical single-cell biomedicine in clinical and translational medicine
2023-01, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 临床单细胞生物医学是一个新兴学科,旨在整合单细胞分子和临床表型以揭示新的疾病特异性诊断和疗法 提出了临床单细胞生物医学(cscBioMed)的倡议,促进单细胞生物学和医学的发现与发展 NA 希望通过建立临床单细胞动态监测和早期预测系统来改善人类健康 总括单细胞RNA测序、空间转录组学以及基于单细胞的生物标志物和靶点 数字病理学 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA 基因组数据 NA
19184 2024-08-08
Perspectives on single-nucleus RNA sequencing in different cell types and tissues
2023-Jan, Journal of pathology and translational medicine IF:1.7Q3
综述 本文综述了单核RNA测序(snRNA-seq)在不同细胞类型和组织中的实验和分析步骤,以及其方法和特征。 snRNA-seq作为一种替代或补充方法,适用于难以分离的细胞类型,有助于理解细胞多样性和疾病状态的改变。 snRNA-seq存在一些局限性,如细胞分离的困难,这可能影响其使用和数据解释的准确性。 旨在提供snRNA-seq的全面概述,以增加其应用并改善生物学数据的解释。 研究对象包括不同细胞类型和组织中的单核RNA测序技术。 基因组学 NA 单核RNA测序(snRNA-seq) NA RNA序列数据 NA
19185 2024-08-08
Single-cell and spatial sequencing application in pathology
2023-Jan, Journal of pathology and translational medicine IF:1.7Q3
综述 本文综述了空间转录组测序的当前方法,包括其技术背景、组织准备和分析流程,并探讨了其在病理诊断中的应用潜力 结合单细胞RNA测序(scRNA-seq)与空间测序,提供同时包含组织学和单细胞信息的分子基础 NA 探讨空间转录组测序在病理诊断中的应用及其对疾病理解的提升 空间转录组测序技术及其在病理学中的应用 数字病理学 NA 空间转录组测序 NA 转录组数据 NA
19186 2024-08-08
Catecholamine induces Kupffer cell apoptosis via growth differentiation factor 15 in alcohol-associated liver disease
2023-01, Experimental & molecular medicine
研究论文 本文研究了在酒精相关性肝病中,儿茶酚胺通过生长分化因子15诱导库普弗细胞凋亡的机制 发现了儿茶酚胺/GDF15轴在库普弗细胞凋亡中的新保护机制,并揭示了肠道与肝脏之间的独特神经代谢免疫轴 NA 探讨儿茶酚胺在慢性酒精暴露下对炎症库普弗细胞的调节作用 库普弗细胞在酒精相关性肝病中的凋亡机制 NA 酒精相关性肝病 单细胞RNA测序 NA RNA 慢性乙醇喂养的小鼠及早期酒精相关性肝病患者
19187 2024-08-08
TREM2hi resident macrophages protect the septic heart by maintaining cardiomyocyte homeostasis
2023-01, Nature metabolism IF:18.9Q1
研究论文 本文研究了脓毒症诱导的心肌病(SICM)中,一种名为CD163RETNLA(Mac1)的心脏驻留巨噬细胞亚群通过维持心肌细胞稳态来保护心脏的作用 首次鉴定并描述了Mac1亚群在SICM中的作用,并展示了TREM2 Mac1细胞在清除受损线粒体和预防SICM中的潜在治疗价值 NA 探讨脓毒症诱导的心肌病中免疫细胞亚群的作用,特别是Mac1亚群的功能 心脏驻留巨噬细胞亚群Mac1及其在脓毒症诱导的心肌病中的作用 NA 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA RNA 小鼠模型
19188 2024-08-08
Single-cell transcriptome analysis reveals functional changes in tumour-infiltrating B lymphocytes after chemotherapy in oesophageal squamous cell carcinoma
2023-01, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析,探讨了食管鳞状细胞癌(ESCC)中化疗前后肿瘤浸润B淋巴细胞(TIL-Bs)的功能变化。 首次详细描述了化疗前后TIL-Bs的功能异质性,并发现化疗后TIL-Bs的某些功能如共刺激和CD40信号传导得到增强。 研究样本量有限,且仅限于食管鳞状细胞癌,可能限制了结果的普遍性。 旨在研究食管鳞状细胞癌中化疗前后肿瘤浸润B淋巴细胞的功能异质性。 食管鳞状细胞癌中的肿瘤浸润B淋巴细胞及其在化疗前后的功能变化。 数字病理学 食管癌 单细胞转录组分析 NA 转录组数据 共分析了23个样本,涉及81,246个细胞。
19189 2024-08-08
Integrative multi-omic analysis of radiation-induced skin injury reveals the alteration of fatty acid metabolism in early response of ionizing radiation
2022-Dec, Journal of dermatological science IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过综合多组学分析,探讨了电离辐射诱导的皮肤损伤早期反应中的分子事件及其机制 首次揭示了电离辐射早期反应中皮肤脂肪酸代谢的改变,并详细研究了ACADVL在脂肪酸代谢中的重要作用 NA 研究电离辐射对皮肤组织的早期分子反应及其机制 小鼠、大鼠的皮肤组织以及人类角质形成细胞和皮肤成纤维细胞 代谢组学 辐射损伤 液相色谱-质谱联用(LC-MS)、mRNA测序(mRNA-Seq)、单细胞RNA测序(scRNA-Seq) NA 代谢物、基因表达数据 涉及小鼠、大鼠、猴子以及人类样本
19190 2024-08-08
Single-cell transcriptomics and network pharmacology reveal therapeutic targets of Jianpi Yiqi Bugan Yishen decoction in immune cell subsets of children with myasthenia gravis
2022-Dec, Translational pediatrics IF:1.5Q2
研究论文 本研究通过单细胞转录组学和网络药理学方法,揭示了健脾益气补肝益肾汤在治疗儿童重症肌无力中的作用机制及其活性成分和潜在治疗靶点 本研究首次结合单细胞转录组学和网络药理学方法,探讨了健脾益气补肝益肾汤在儿童重症肌无力治疗中的作用机制和潜在靶点 NA 探索健脾益气补肝益肾汤治疗儿童重症肌无力的作用机制,并评估其活性成分和潜在治疗靶点 儿童重症肌无力的免疫细胞亚群及健脾益气补肝益肾汤的作用机制 数字病理学 神经肌肉疾病 单细胞转录组测序 NA 转录组数据 20只Lewis大鼠
19191 2024-08-08
Correlation between oncogene integrator complex subunit 7 and a poor prognosis in lung adenocarcinoma
2022-Dec, Journal of thoracic disease IF:2.1Q3
research paper 研究整合子复合体亚单位7(INTS7)在肺腺癌(LUAD)中的临床意义及其对细胞行为的影响 首次探讨了INTS7在肺腺癌中的表达与患者预后的关系,并验证了INTS7作为治疗靶点和预后标志物的潜力 研究主要基于公开数据集和细胞实验,未来需要更多临床样本验证 探讨INTS7在肺腺癌中的临床意义及其对细胞行为的影响 肺腺癌组织、细胞系及患者预后 digital pathology lung cancer 单细胞测序 NA RNA 包括33种癌症类型的数据集及肺腺癌细胞系
19192 2024-08-08
Tumor-infiltrating lymphocyte: features and prognosis of lymphocytes infiltration on colorectal cancer
2022-06, Bioengineered IF:4.2Q2
研究论文 本研究旨在探讨结直肠癌中肿瘤浸润淋巴细胞(TILs)的特征及其对预后的影响 首次综合多个队列数据库,详细描述了TILs在结直肠癌中的特征、比例及预后价值 NA 研究TILs在结直肠癌中的特征及其对预后的影响 结直肠癌中的肿瘤浸润淋巴细胞 数字病理学 结直肠癌 scRNA-seq NA 基因表达数据 涉及四个基因表达综合系列(GSE)的结直肠癌队列
19193 2024-08-08
Single-cell transcriptome reveals diversity of Müller cells with different metabolic-mitochondrial signatures in normal and degenerated macula
2022, Frontiers in neuroscience IF:3.2Q2
研究论文 本研究通过整合早期年龄相关性黄斑变性(AMD)患者和健康捐赠者的单细胞转录组数据,揭示了具有不同代谢-线粒体特征的穆勒细胞亚群 本研究首次展示了早期AMD中穆勒细胞亚群的变化主要是亚群丰度的改变,而非新亚群的产生,并通过转录因子富集分析强调了代谢-线粒体状态的关键调节因子 NA 揭示早期年龄相关性黄斑变性中穆勒细胞的新特征及其与视网膜神经胶质化的关联 穆勒细胞在正常和退化黄斑中的多样性及其代谢-线粒体特征 数字病理学 年龄相关性黄斑变性 单细胞转录组 NA 转录组数据 早期AMD患者和健康捐赠者的样本
19194 2024-08-08
Single-cell RNA-Seq identifies factors necessary for the regenerative phenotype of prostate luminal epithelial progenitors
2022, American journal of clinical and experimental urology IF:1.5Q3
PMID:36636696
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,确认了激素完整和去势小鼠前列腺中管腔前体细胞群的身份,并识别了维持前列腺器官样再生表型所需的因素。 首次使用单细胞RNA测序技术确认前列腺管腔前体细胞群的身份,并识别了维持其再生表型所需的关键因素。 研究主要集中在小鼠和人类的前列腺器官样上,未来需进一步验证这些因素在体内环境中的作用。 定义正常的前列腺前体细胞表型,并发现可能导致可药物化靶点的因果网络,以对抗前列腺增生疾病。 前列腺管腔上皮前体细胞及其再生表型。 数字病理学 前列腺癌 单细胞RNA测序 NA RNA序列 包括激素完整和去势的小鼠前列腺及人类前列腺器官样。
19195 2024-08-05
Shared developmental pathways of the placenta and fetal heart
2023-09-26, Placenta IF:3.0Q2
综述 本文回顾了先天性心脏缺陷与胎盘功能障碍之间的临床、结构和分子关系 探讨了胎盘在先天性心脏缺陷发病机制中的特定病因角色 小鼠和大鼠模型在评估心脏与胎盘关系方面存在显著限制 研究先天性心脏缺陷与胎盘功能障碍的关系 先天性心脏缺陷(CHD)和胎盘发育 数字病理学 先天性心脏缺陷 单细胞测序 小鼠和大鼠模型 临床和分子数据 NA
19196 2024-08-08
Selective Clearance of Senescent Chondrocytes in Osteoarthritis by Targeting Excitatory Amino Acid Transporter Protein 1 to Induce Ferroptosis
2023-08, Antioxidants & redox signaling IF:5.9Q1
研究论文 本研究旨在探索衰老软骨细胞对铁死亡(一种铁依赖性的非凋亡细胞死亡形式)的抵抗机制。通过代谢组学和单细胞RNA测序,发现铁死亡代谢的过度激活是衰老软骨细胞的显著代谢特征之一。衰老软骨细胞通过过度表达膜蛋白EAAT1来提高细胞内谷氨酸水平并激活谷胱甘肽系统,从而抵抗铁死亡。使用EAAT1的特异性抑制剂UCPH-101和siRNA-EAAT1可以显著增加衰老软骨细胞对铁死亡的敏感性,并诱导细胞死亡,而对正常细胞无明显影响。通过关节内注射UCPH-101,可以选择性地抑制EAAT1,清除软骨中的衰老软骨细胞,改善软骨稳态,并显著延缓骨关节炎的进展。 本研究揭示了衰老软骨细胞通过过度表达EAAT1来抵抗铁死亡的机制,并发现EAAT1是骨关节炎抗衰老治疗的有效且特异性靶点。 NA 探索衰老软骨细胞对铁死亡的抵抗机制,并寻找骨关节炎的潜在治疗靶点。 衰老软骨细胞及其在骨关节炎中的作用。 NA 骨关节炎 代谢组学,单细胞RNA测序 NA RNA NA
19197 2024-08-05
Loss of CDKN2A Cooperates with WWTR1(TAZ)-CAMTA1 Gene Fusion to Promote Tumor Progression in Epithelioid Hemangioendothelioma
2023-07-05, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1
研究论文 本研究评估了CDKN2A缺失在上皮样血管内皮瘤肿瘤发生中的影响 首次生成了上皮样血管内皮瘤的细胞系,并展示其对TC癌蛋白的依赖性 仅在小鼠模型中进行研究,可能不完全代表人类疾病 探讨CDKN2A缺失如何促进上皮样血管内皮瘤的肿瘤发生 上皮样血管内皮瘤及其相关细胞系 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 肿瘤细胞系 使用小鼠模型建立的上皮样血管内皮瘤肿瘤细胞系
19198 2024-08-08
Single-cell RNA sequencing reveals changes in glioma-associated macrophage polarization and cellular states of malignant gliomas with high AQP4 expression
2023-05, Cancer gene therapy IF:4.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了高表达AQP4的恶性胶质瘤样本中的细胞状态和胶质瘤相关巨噬细胞极化情况 首次揭示了AQP4高表达与恶性胶质瘤中免疫相关基因的过度表达以及肿瘤相关巨噬细胞向M2型极化的关联 NA 探讨AQP4表达水平与恶性胶质瘤细胞状态及肿瘤微环境之间的关系 恶性胶质瘤样本中的细胞状态和胶质瘤相关巨噬细胞极化 数字病理学 脑瘤 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 53059个细胞来自13个恶性胶质瘤样本
19199 2024-08-05
USP48 Stabilizes Gasdermin E to Promote Pyroptosis in Cancer
2023-04-04, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 该研究揭示了USP48通过稳定gasdermin E(GSDME)促进癌症中的细胞焦亡 文章首次确定了USP48作为细胞焦亡的调节因子,并探索了其机制 未对USP48在其他类型癌症中的作用进行广泛验证 揭示在癌症中调节细胞焦亡的机制和途径 主要关注USP48及其与gasdermin E的相互作用 数字病理 癌症 CRISPR-Cas9筛选和单细胞测序 小鼠模型 临床组织样本和细胞数据 NA
19200 2024-08-08
Integrative Single-Cell Analysis Reveals Transcriptional and Epigenetic Regulatory Features of Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2023-03-02, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单细胞转座酶可及染色质测序(scATAC-seq)分析了19例透明细胞肾细胞癌(ccRCC)样本,揭示了ccRCC的转录和表观遗传调控特征 本研究首次综合分析了ccRCC的单细胞转录组和染色质可及性图谱,并鉴定了两种长链非编码RNA(RP11-661C8.2和CTB-164N12.1),这些RNA促进了ccRCC的侵袭和迁移 NA 深入理解透明细胞肾细胞癌的功能状态和调控动态 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)的转录和表观遗传调控特征 数字病理学 肾细胞癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq),单细胞转座酶可及染色质测序(scATAC-seq) NA 基因表达数据,染色质可及性数据 19例透明细胞肾细胞癌样本
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