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当前共找到 41844 篇文献,本页显示第 1901 - 1920 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1901 2026-06-26
Imaging-Based Spatial Transcriptomics: Data Interpretation Methods and Biomedical Applications
2026-Jun-08, Biology
综述 综述了基于成像的空间转录组学在数据解析方法和生物医学应用方面的进展 系统性地从数据解析和应用角度审视了不同成像平台,强调计算生物学问题的共性和挑战 仅关注成像类空间转录组技术,未涵盖基于测序的方法的综合比较 综述成像类空间转录组学的数据解析框架和生物医学应用 成像类空间转录组学数据及分析流程 计算生物学, 空间转录组学 NA 成像空间转录组学, 单分子荧光原位杂交, 多重成像, 原位测序 NA 图像, 转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
1902 2026-06-26
Integrated Single-Cell RNA-Seq and Machine Learning to Construct an EMT Infiltration Scoring Model for Prostate Cancer
2026-Jun-02, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 整合单细胞RNA测序与机器学习构建前列腺癌上皮-间充质转化浸润评分模型 首次在单细胞水平系统描绘前列腺癌中上皮-间充质转化的细胞异质性,并基于关键基因构建浸润评分模型,结合分子对接预测靶向治疗药物 未提及明显局限性 构建上皮-间充质转化浸润评分模型,用于前列腺癌预后预测和治疗指导 前列腺癌患者的单细胞转录组数据和批量转录组数据 机器学习 前列腺癌 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 LASSO, AUCell 基因表达数据 未明确提及样本量 未明确提及 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 未明确提及 NA
1903 2026-06-26
A Multiresolution Breast Cancer CIBERSORTx Resource Validated for Accuracy, Interpretive Limits, and Biological and Clinical Coherence in Tumor Microenvironment Deconvolution
2026-Jun-02, Methods and protocols IF:2.3Q3
研究论文 基于单细胞RNA测序数据开发了乳腺癌特异性多分辨率CIBERSORTx签名矩阵,并系统评估了其在肿瘤微环境反卷积中的准确性、解释性限制及生物学和临床一致性 首次构建乳腺癌特异性多分辨率CIBERSORTx签名矩阵,涵盖主要、次要和亚群级别,并系统评估了不同分辨率下的性能特征 细分辨率子集表现出非经典模式,可能反映谱系内权衡或依赖上下文的转录状态;反卷积性能在细分辨率下下降,且谱系级反卷积虽减少溢出但持续降低准确性 开发和验证用于乳腺癌肿瘤微环境反卷积的多分辨率CIBERSORTx资源,并阐明其性能特征和局限性 乳腺癌肿瘤微环境中的各类免疫和基质细胞群体 机器学习 乳腺癌 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 CIBERSORTx 基因表达数据 TCGA-BRCA和I-SPY2队列中的批量RNA测序样本 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
1904 2026-06-26
Transcriptional Heterogeneity of Oligodendrocytes: Molecular Basis of Diversity Across Development, Brain Regions, and Neurological Diseases
2026-Jun-02, Neurology international IF:3.2Q2
综述 综合阐述了少突胶质细胞在发育、脑区和疾病状态下的转录异质性,重点分析了疾病相关少突胶质细胞的分子特征及调控网络 系统整合了单细胞RNA测序揭示的少突胶质细胞异质性,首次归纳了疾病相关少突胶质细胞的转录调控网络(STAT/IRF、YY1/NF-κB、SOX9/SOX10) 未提供定量比较不同研究间细胞亚群分类标准差异,且空间转录组与单细胞数据的整合方法尚待验证 揭示少突胶质细胞在发育、脑区和疾病中的异质性机制,为靶向髓鞘修复治疗提供理论基础 小鼠体感皮层、海马CA1区、十个CNS区域;人类多发性硬化、阿尔茨海默病和脊髓损伤样本 数字病理学 多发性硬化、阿尔茨海默病、脊髓损伤 单细胞RNA测序、单细胞核RNA测序、空间转录组学 NA 转录组数据 涵盖小鼠十种脑区及人类神经系统疾病多组样本 10x Genomics 单细胞RNA测序、空间转录组学 10x Chromium、10x Visium 10x Chromium 单细胞3'测序、10x Visium 空间基因表达分析
1905 2026-06-26
LMO7 Suppresses Tumor-Associated Macrophage Phagocytosis of Tumor Cells Through Degradation of LRP1
2026-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究揭示了LMO7通过促进LRP1的泛素化降解来抑制肿瘤相关巨噬细胞对肿瘤细胞的吞噬作用 首次发现LMO7在肿瘤相关巨噬细胞中通过泛素-蛋白酶体系统降解吞噬受体LRP1,从而抑制巨噬细胞吞噬功能,并证明联合靶向LMO7和SIRPα具有协同抗肿瘤效果 未提及具体局限性 探究LMO7在肿瘤相关巨噬细胞吞噬功能中的作用及其分子机制 肿瘤相关巨噬细胞 机器学习 肿瘤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
1906 2026-06-26
IgA-Producing B Cells Exert Regulatory Function through Granzyme B in Kidney Allograft Tolerance
2026-Jun-01, Kidney360 IF:3.2Q1
研究论文 该论文研究了肾脏移植耐受中产生IgA的B细胞通过颗粒酶B发挥调节功能 首次发现耐受性肾移植患者中IgA+ B细胞高表达颗粒酶B并发挥调节功能,揭示了IgA与颗粒酶B表达Breg之间的强关联 未在标题和摘要中明确提及局限性 探讨IgA与颗粒酶B表达B细胞在肾移植耐受中的关联及调节机制 健康志愿者和肾移植患者,包括稳定功能、抗体介导排斥和耐受患者 数字病理学 肾脏移植相关疾病 单细胞RNA测序、多参数光谱流式细胞术、ELISA、Western blot NA 基因表达数据、流式细胞术数据、血清免疫球蛋白数据 45名健康志愿者和31名肾移植患者 NA 单细胞RNA-seq NA 各平台详细信息未在标题和摘要中提供
1907 2026-06-26
Generation of CCR4/CD7 Bispecific CAR-T Cells Resistant to Fratricide and Exhaustion
2026-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 开发了一种抗自相残杀和耗竭的CCR4/CD7双特异性CAR-T细胞,并进行了体内外验证 通过简单的单步CD7耗竭和携带c-Jun的CAR结构设计,解决了CAR-T细胞治疗T细胞恶性肿瘤中的自相残杀和功能耗竭问题,并发现了一个独特的AQP3+ CD4+ T细胞亚群 未提及临床试验结果,仅基于体外和体内模型 开发抗自相残杀和耗竭的CCR4/CD7双特异性CAR-T细胞,用于T细胞恶性肿瘤治疗 恶性T细胞系及CD7耗竭的T细胞 计算机视觉 T细胞恶性肿瘤 慢病毒转导, scRNA-seq NA 单细胞RNA测序数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序平台
1908 2026-06-26
Monocyte-derived IL-1β predicts and promotes HBsAg decline in chronic hepatitis B patients under nucleoside analogue therapy
2026-Jun-01, Hepatology communications IF:5.6Q1
研究论文 本研究揭示单核细胞来源的IL-1β可预测并促进核苷类似物治疗的慢性乙型肝炎患者的HBsAg下降 首次通过单细胞RNA测序揭示CD14+CD16-经典单核细胞中IL-1β高表达与HBsAg下降相关,并证实IL-1β可作为预测标志物和潜在治疗靶点 未提及具体限制,但可能包括验证队列规模有限、机制研究需进一步体内验证 探索慢性乙型肝炎患者接受核苷类似物治疗后HBsAg下降的免疫相关因素 核苷类似物治疗的慢性乙型肝炎患者的PBMC及血清 数字病理学 慢性乙型肝炎 单细胞RNA测序、转录组分析、功能检测 单细胞转录组数据、血清IL-1β水平 探索队列:scRNA-seq样本数不详;验证队列:多中心独立队列;回顾性队列:长期随访队列 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
1909 2026-06-26
Beta-Glucan modulates monocyte plasticity and differentiation capacity to mitigate DSS-induced colitis
2026-Jun-01, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本研究揭示β-葡聚糖通过训练免疫调节单核细胞可塑性和分化能力,减轻DSS诱导的小鼠结肠炎 首次证明β-葡聚糖诱导的训练免疫可通过重编程骨髓造血祖细胞和外周单核细胞,促进修复性Cx3cr1巨噬细胞扩增,从而减轻结肠炎症状,且这种保护效应可通过细胞转移传递 研究仅限于小鼠模型,未涉及人类样本或临床验证;DSS诱导模型不能完全模拟人类IBD复杂性 探究训练免疫在IBD发病机制中的作用及其作为治疗策略的潜力 β-葡聚糖训练的小鼠骨髓造血祖细胞和外周单核细胞 机器学习 炎症性肠病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确说明 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序平台
1910 2026-06-26
ScSpTITH: a rank-correlation framework for robust quantification of multi-dimensional tumor heterogeneity
2026-Jun-01, Human genetics IF:3.8Q2
研究论文 提出了一种名为ScSpTITH的秩相关计算框架,用于稳健量化单细胞和空间转录组数据中的肿瘤异质性 基于Spearman秩相关的策略,对单细胞RNA测序中高达70-95%的dropout伪影具有内在鲁棒性,能够在多维度(空间区域、细胞群体、治疗条件)上量化肿瘤异质性 依赖高度可变基因选择步骤,可能忽略部分低表达但重要的生物学特征 开发一个统一且稳健的计算框架,用于解剖单细胞和空间转录组研究中的多维度肿瘤异质性 肿瘤组织和发育过程中的细胞群体 机器学习 肿瘤 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA 基因表达数据 多个癌症和发育数据集的公共数据 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
1911 2026-06-26
Temporal single-cell transcriptional dynamics of murine pancreatic islet remodeling during hyperglycaemia progression
2026-Jun-01, Molecular metabolism IF:7.0Q1
研究论文 通过纵向单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序,构建了小鼠胰岛在高血糖进展过程中的高分辨率转录组图谱,揭示了胰岛细胞的动态重塑机制 首次在单细胞分辨率下纵向解析了高脂饮食诱导胰岛素抵抗过程中小鼠胰岛内分泌和非内分泌细胞的全面转录组动态变化,发现了CCL27a趋化因子信号在β细胞与M1巨噬细胞相互作用中的新角色 未提及具体限制 探究肥胖诱导胰岛素抵抗过程中胰腺胰岛的细胞重塑和转录组动态变化 高脂饮食喂养8、16、24周的C57BL/6小鼠胰岛细胞 单细胞组学 2型糖尿病 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 NA 单细胞转录组数据,单细胞染色质可及性数据 高脂饮食组和常规饮食对照组小鼠,每个时间点多个样本 10x Genomics 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞测序平台
1912 2026-06-26
scTACL: a multitask topology-aware contrastive learning approach for single-cell transcriptomics analysis
2026-Jun-01, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 开发了一种名为scTACL的拓扑感知对比学习方法,用于单细胞转录组学分析,以提升数据填补、聚类、批次效应校正和细胞-细胞相互作用等任务的表现 首次将拓扑感知对比学习与ZINB分布结合,无需空间位置信息即可有效区分上皮和间充质区域,并通过细胞间通讯分析识别到关键信号通路 NA 开发新型计算方法以应对单细胞RNA测序数据中的噪声和缺失事件,提高下游分析准确性 单细胞RNA测序数据及空间转录组数据中的细胞群体 机器学习 肺癌, 肝癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学 对比学习 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
1913 2026-06-26
Synergistic Interaction Between MALAT1/miR-30b-5p/BAFF Axis and Inflammatory Cytokines Underlies Rituximab-Refractory NMOSD
2026-06, CNS neuroscience & therapeutics IF:4.8Q1
研究论文 该研究探索了MALAT1/miR-30b-5p/BAFF轴在单核细胞中的激活如何导致NMOSD疾病发作和利妥昔单抗难治性复发 首次揭示MALAT1/miR-30b-5p/BAFF轴在利妥昔单抗难治性NMOSD中的作用机制,并发现单核细胞特异性MALAT1上调与血清BAFF升高相关 样本量较小,特别是单细胞RNA测序样本仅6例,且研究主要基于体外细胞实验,未在动物模型中验证 探索利妥昔单抗难治性NMOSD的免疫失调机制,特别是MALAT1/miR-30b-5p/BAFF轴的作用 NMOSD患者(包括初发、利妥昔单抗缓解和利妥昔单抗难治性复发患者)的外周血单核细胞和血清,以及THP-1细胞 机器学习 视神经脊髓炎谱系疾病 qPCR, ELISA, Western Blot, 双荧光素酶报告基因检测, 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据, 蛋白质表达数据 PBMCs初发10例,血清初发23例,利妥昔单抗治疗缓解26例,利妥昔单抗难治性复发13例,健康对照15例;单细胞RNA测序6例 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1914 2026-06-26
scMagnifier: Resolving fine-grained cell subtypes via GRN-informed perturbations and consensus clustering
2026-Jun, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 提出scMagnifier框架,通过基因调控网络引导的扰动与共识聚类,解析单细胞RNA测序数据中的精细细胞亚型 创新性地结合基因调控网络(GRN)引导的计算机扰动与共识聚类,通过扰动效应传播放大微弱转录差异,并引入扰动感知可视化(rpcUMAP)用于亚型分离与最优聚类数选择 文中未明确提及局限性 提高单细胞RNA测序数据中精细细胞亚型的分辨率和准确性 卵巢癌细胞亚型及其空间组织结构 机器学习 卵巢癌 单细胞RNA测序 共识聚类模型 单细胞转录组数据、空间转录组数据 未提及具体样本量 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
1915 2026-06-26
Skin eQTL-Cerebrospinal Fluid Metabolites-Keloid Axis: An Integrative Multi-Omics Mediation Mendelian Randomization Study
2026-Jun, Chemical biology & drug design IF:3.2Q3
研究论文 整合皮肤eQTL、脑脊液代谢物与瘢痕疙瘩GWAS数据,通过孟德尔随机化框架鉴定因果中介通路,并利用体外实验验证基因与代谢物的功能角色 首次通过多组学中介孟德尔随机化分析,将皮肤基因表达、脑脊液代谢物与瘢痕疙瘩风险联系起来,发现PARP14和ALDH2为上游调控基因,并揭示SOPC和鞘磷脂通过纤维细胞增殖促进疾病发展的新机制 未明确说明研究局限性 揭示遗传变异、分子表型与瘢痕疙瘩易感性之间的机制联系,鉴定因果中介通路 皮肤基因表达(GTEx v8)、338个脑脊液代谢物、两个欧洲人群瘢痕疙瘩GWAS数据集 机器学习 皮肤瘢痕疙瘩 孟德尔随机化、bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、体外细胞实验 NA 基因表达数据、代谢物数据、GWAS统计摘要 GTEx v8皮肤eQTL数据(样本量未明确)、两个独立欧洲瘢痕疙瘩GWAS数据集(样本量未明确) NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
1916 2026-06-26
Anti-PD-1 Nanobody-Armored MSLN CAR-T Therapy for Malignant Mesothelioma: Preclinical and Clinical Studies
2026-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 开发了抗PD-1纳米抗体装甲的MSLN CAR-T细胞(NAC-T),并在恶性间皮瘤的临床前和临床研究中验证了其疗效 首次将抗PD-1纳米抗体与MSLN CAR-T细胞结合,并在人临床试验中验证安全性和有效性 样本量较小(11名患者),且未提供长期随访数据或随机对照比较 评估NAC-T细胞治疗恶性间皮瘤的安全性和抗肿瘤活性 恶性间皮瘤患者 NA 恶性间皮瘤 CAR-T细胞技术,单细胞测序 NA 单细胞测序数据 11名恶性间皮瘤患者 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1917 2026-06-26
Arginase-1 Expressing Macrophages Interact with Myofibroblasts to Regulate Insulin-Like Growth Factor-1-Dependent Tubule Repair
2026-Jun-01, Kidney360 IF:3.2Q1
研究论文 本文揭示了精氨酸酶-1表达巨噬细胞与肌成纤维细胞相互作用,通过调节胰岛素样生长因子-1依赖的肾小管修复机制 首次发现Arg1表达巨噬细胞通过诱导肌成纤维细胞和内皮细胞表达IGF1,而非自身产生,来促进肾小管上皮细胞增殖 未明确巨噬细胞与肌成纤维细胞间具体的信号分子机制 探究Arg1表达巨噬细胞促进肾小管修复的分子机制 小鼠缺血再灌注损伤模型中的肾脏细胞,包括巨噬细胞、肌成纤维细胞、内皮细胞和肾小管上皮细胞 机器学习 NA 单细胞RNA测序,定量PCR NA 基因表达数据 小鼠肾脏样本(野生型和Arg1mko小鼠)及人类肾脏活检样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'转录组测序
1918 2026-06-26
1 Hz Low-Frequency Repetitive Transcranial Magnetic Stimulation Ameliorates Epilepsy by Suppressing Interferon-γ Signaling-Dependent Microglial Synaptic Phagocytosis in Mice
2026-06, CNS neuroscience & therapeutics IF:4.8Q1
研究论文 研究1 Hz低频重复经颅磁刺激通过抑制干扰素-γ信号依赖的小胶质细胞突触吞噬作用改善小鼠癫痫 首次揭示1 Hz LF-rTMS通过激活IFN-γ/STAT2信号通路并下调CADM1/2/3表达,抑制小胶质细胞突触吞噬,从而减轻癫痫发作和认知障碍的新机制 基于小鼠模型,临床相关性仅通过人脑组织snRNA-seq初步验证,缺少人体临床试验证据 探究低频重复经颅磁刺激对颞叶癫痫中活化小胶质细胞的影响及其分子机制和临床潜力 红藻氨酸诱导的颞叶癫痫小鼠模型和人类海马硬化组织样本 机器学习 癫痫 单细胞核RNA测序 NA 基因表达数据 红藻氨酸诱导的颞叶癫痫小鼠及人类海马硬化组织样本 NA 单细胞核RNA测序 NA NA
1919 2026-06-26
Integrative Drug-Target Causal Analysis, Single-Cell Sequencing and In-Vivo Validation for Dissecting Molecular Mechanisms Underlying Focal Epilepsy
2026-06, CNS neuroscience & therapeutics IF:4.8Q1
研究论文 结合单细胞测序与孟德尔随机化分析,鉴定局灶性癫痫的潜在药物靶点 首次整合单细胞表达数据、eQTL遗传数据和孟德尔随机化方法,系统解析局灶性癫痫的分子机制,并利用分子对接和动物模型进行验证 研究主要基于欧洲人群的遗传数据,可能限制结果的普适性;未进行多组织或不同亚型的进一步分析 识别并验证局灶性癫痫的新药物靶点 局灶性癫痫患者及颞叶癫痫动物模型 自然语言处理 局灶性癫痫 单细胞RNA测序、孟德尔随机化分析、共定位分析、分子对接 NA 基因表达数据、遗传变异数据 FinnGen和UK Biobank队列数据,包含局灶性癫痫病例和对照 NA 单细胞RNA测序 NA 来自GSE190452数据集的单细胞表达数据
1920 2026-06-26
Inflammatory Neovascularization and Vascular Remodeling Associated With Carotid Plaque Destabilization
2026-06, CNS neuroscience & therapeutics IF:4.8Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析颈动脉斑块不同区域中促进病理性新生血管和血管重塑的特定细胞亚群 首次系统分析颈动脉斑块动脉粥样硬化核心区和近端邻近区中血管新生和重塑的细胞异质性 NA 阐明颈动脉斑块不同区域中介导病理性新生血管和血管重塑的特定细胞亚群 颈动脉斑块的动脉粥样硬化核心区与近端邻近区 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序平台
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