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当前共找到 43167 篇文献,本页显示第 1901 - 1920 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1901 2026-08-20
Substantial unannotated noncoding transcripts in tumors may transcriptionally regulate cancer-related genes
2026-01-28, BMC biology IF:4.4Q1
研究论文 本研究通过泛癌分析识别肿瘤中的未注释非编码转录本,并探讨它们通过DNA结合域调控癌症相关基因表达的可能性 首次系统性地在肿瘤中鉴定大量未注释非编码转录本,并预测其DNA结合域及结合位点,通过CRISPR/Cas9实验验证其转录调控功能,揭示了其癌症和物种特异性 研究主要基于细胞系和组织样本,可能未能完全反映体内复杂环境;预测的DNA结合域和结合位点需要更多实验验证 探究肿瘤中未注释非编码转录本是否以及如何调控癌症相关基因的转录 四种肿瘤的细胞系和组织样本中的未注释基因和转录本,特别是三个特定UNTs(MSTRG.2513.6、MSTRG.4401.1、MSTRG.34636.7) 基因组学 多种癌症 RNA-seq, scRNA-seq, CRISPR/Cas9 NA 基因表达数据, 基因序列 涵盖四种肿瘤的细胞系和组织样本,具体数量未在摘要中提供 NA RNA-seq, scRNA-seq NA NA
1902 2026-08-20
Hepatic adaptation to chronic metabolic stress primes tumorigenesis
2026-Jan-22, Cell IF:45.5Q1
研究论文 本研究通过跨物种纵向单细胞多组学分析,揭示了慢性代谢应激下肝细胞的功能适应如何启动肿瘤发生 首次整合跨物种纵向单细胞多组学和空间转录组学,识别并实验验证了驱动肝细胞功能失衡和肿瘤发生启动的主调控因子 未明确提及研究的局限性 探究慢性代谢应激对肝细胞功能的影响及其与肿瘤发生的关联 非转化肝细胞及人类组织样本 单细胞多组学、空间转录组学 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎(MASH) 单细胞多组学、空间转录组学 NA 单细胞多组学数据、空间转录组数据 跨物种样本,具体数量未提及 NA 单细胞多组学、空间转录组学 NA NA
1903 2026-08-20
Repurposing Resmetirom suppresses MASH-associated hepatocellular carcinoma, with mechanistic implications of MDK/LRP1-mediated metabolic reprogramming and immunosuppression
2026-Jan-12, Hepatology (Baltimore, Md.)
研究论文 本研究探索了已批准药物Resmetirom在代谢功能障碍相关脂肪性肝炎相关肝细胞癌中的治疗潜力,并揭示了其通过MDK/LRP1轴调节代谢重编程和免疫抑制的机制 首次将临床批准的Thrb激动剂Resmetirom重新用于MASH相关HCC治疗,并揭示了MDK/LRP1轴在MASH相关肝癌发生中的新机制,包括MDK诱导M2巨噬细胞极化和T细胞耗竭的作用 研究主要基于小鼠模型和体外实验,尚需进一步临床验证;MDK/LRP1轴的调控机制可能不完全覆盖人类疾病的复杂性 探究Resmetirom对MASH相关HCC的治疗潜力及其分子机制,以提供新的治疗策略 小鼠MASH-HCC模型、人类HCC样本、肝星状细胞、发育异常肝细胞、巨噬细胞 机器学习 肝细胞癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 多个人类HCC样本和小鼠模型 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium NA
1904 2026-08-20
Macrophages in tumors with downregulated MHC-I expression: emerging therapeutic opportunities and translational challenges
2026-Jan-06, Clinical and experimental immunology IF:3.4Q3
综述 本文综述了肿瘤细胞MHC-I表达下调与肿瘤相关巨噬细胞之间的双向调控机制,并探讨了针对不同MHC-I下调机制的治疗机会和转化挑战 通过单细胞转录组学揭示TAMs的异质性,并提出根据MHC-I下调的可逆性分别评估其免疫治疗意义 未提供具体实验数据,主要基于现有研究假设,缺乏对不可逆MHC-I下调机制的深入验证 概述肿瘤细胞MHC-I与TAMs双向调控的机制,并评估其对免疫治疗的潜在影响 肿瘤相关巨噬细胞和肿瘤细胞MHC-I表达 数字病理学 癌症 单细胞转录组学 NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1905 2026-08-20
Integrative Analysis Reveals Genes Causal Relation with Ovarian Cancer and aging
2026, Current topics in medicinal chemistry IF:2.9Q3
研究论文 通过整合单细胞RNA测序、GWAS和eQTL数据,利用孟德尔随机化分析识别与卵巢癌和衰老因果关联的单核细胞亚型关键基因 采用SMR和HEIDI测试结合单细胞功能分析,首次系统性地识别了与卵巢癌和衰老因果相关的单核细胞亚型基因,并揭示了其与NK和T细胞相互作用的潜在机制 研究主要基于计算分析,缺乏实验验证;GWAS数据仅来自欧洲人群,可能限制结果的普适性;部分基因表达模式存在矛盾,需要进一步探究 识别并验证与卵巢癌和衰老相关的单核细胞亚型中的关键基因,探索其因果关系及生物学作用 单核细胞亚型(经典单核细胞、中间单核细胞、髓样树突状细胞)中的基因 生物信息学 卵巢癌 单细胞RNA测序、GWAS、eQTL分析、孟德尔随机化 NA 基因表达数据、遗传变异数据 123,280个细胞;14,049例样本和40,941例对照 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1906 2026-08-20
Single-cell RNA sequencing reveals beneficial mechanisms of Exendin-4 in autoimmune uveitis
2026-01, Biochemical pharmacology IF:5.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了艾塞那肽-4在自身免疫性葡萄膜炎中的有益机制,包括缓解症状和调节免疫细胞平衡。 首次探讨了艾塞那肽-4在自身免疫性葡萄膜炎中的作用,并通过单细胞测序揭示了其通过抑制PIM1-AKT-FOXO1通路恢复Teff/Treg细胞平衡的新机制。 研究未明确提及局限性。 探究艾塞那肽-4对自身免疫性葡萄膜炎的治疗作用及其免疫调节机制。 自身免疫性葡萄膜炎小鼠模型(实验性自身免疫性葡萄膜炎)和Vogt-Koyanagi-Harada病患者的样本。 数字病理学 自身免疫性葡萄膜炎 单细胞RNA测序 不适用 单细胞转录组数据 小鼠模型和人类VKH病患者的样本(具体数量未说明) 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
1907 2026-08-20
Revealing Inhibition of Gastric Cancer Occurrence and Metastasis by GPX3 Through Single-Cell Transcriptomics and Organoid Multimodal Technologies
2026-01, Molecular carcinogenesis IF:3.0Q2
研究论文 通过单细胞转录组学和类器官多模态技术,揭示了GPX3抑制胃癌发生和转移的作用 利用单细胞转录组学分析筛选出与上皮-间质转化相关的基因GPX3,并通过类器官模型和裸鼠转移模型等多种手段验证其在胃癌生长和转移中的抑制作用 未提及明确的局限性 阐明胃癌转移的驱动因素,并验证GPX3在胃癌生长和转移中的抑制作用 胃癌原发肿瘤样本、癌旁正常组织样本、胃癌转移样本及胃癌细胞系 单细胞转录组学 胃癌 单细胞转录组学、类器官培养、异种移植模型 NA 单细胞转录组数据、细胞实验数据、动物模型数据 3例原发胃癌样本、1例癌旁非肿瘤样本、6例胃癌转移样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1908 2026-08-20
A single-cell multiomics roadmap of zebrafish spermatogenesis reveals regulatory principles of male germline formation
2026-Jan, Molecular systems biology IF:8.5Q1
研究论文 本文提供了一个斑马鱼精子发生的单细胞多组学图谱,结合scRNA-seq和scATAC-seq以及WGBS分析,揭示了雄性生殖细胞形成的调控原理 首次构建了斑马鱼精子发生的单细胞多组学资源,结合转录组、染色质可及性和DNA甲基化分析,并发现了逃避染色质压缩的位点,提出跨代遗传调控状态的潜在机制 未提及明显的局限性 研究斑马鱼精子发生的调控机制,提供脊椎动物生殖细胞发育和表观遗传的参考资源 斑马鱼(Danio rerio)睾丸中的生殖细胞群体 单细胞多组学、生殖生物学 不适用 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单细胞染色质可及性测序(scATAC-seq)、全基因组亚硫酸盐测序(WGBS) 不适用 单细胞转录组数据、染色质可及性数据、DNA甲基化数据 斑马鱼睾丸生殖细胞群体(具体数量未在摘要中提供) NA 单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq、全基因组亚硫酸盐测序 NA NA
1909 2026-08-20
Single-cell transcriptomic landscape of metabolic reprogramming in kidney allograft rejection
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序构建健康和移植肾样本的代谢重编程转录组图谱,揭示慢性排斥反应中不同细胞类型的代谢特征 首次构建了肾脏移植排斥反应中细胞类型特异性的代谢重编程单细胞图谱,并结合代谢特征对慢性排斥进行分层 未明确提及局限性,但可能受限于样本量和单细胞测序的固有噪声 生成健康和移植人肾脏样本中细胞类型特异性的代谢状态转录组图谱,以理解排斥反应中的代谢改变 人类肾脏样本(包括健康和移植肾组织) 单细胞转录组学 肾移植排斥反应 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 33个肾脏样本,共82,661个细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1910 2026-08-20
Spatial architecture of atherosclerotic plaques: coordinating immune responses through mechanotransduction and vesicular trafficking
2026, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
综述 这篇综述提出了机械-囊泡双轴(MVDA)模型,整合机械传导和囊泡运输两个调控轴,解释动脉粥样硬化斑块免疫微环境的组织结构及其向易损斑块表型的转变,并评估其在精准诊断和治疗中的应用潜力。 首次将机械传导和囊泡运输这两个调控轴显式整合为一个可测试的框架(MVDA模型),用于斑块空间生物学研究,并定义了双向耦合共享信号节点。 MVDA模型的囊泡反向耦合主张仍属前瞻性,尚需遗传学验证;同时面临实时机械信号定量、标准化囊泡追踪和小鼠到人类转化差距等方法论挑战。 阐明机械-囊泡双轴如何塑造斑块免疫微环境并驱动稳定斑块向易损斑块表型转变,评估该框架在精准诊断和治疗中的转化潜力。 动脉粥样硬化斑块中的内皮细胞、巨噬细胞、血管平滑肌细胞,以及细胞外囊泡。 空间生物学 动脉粥样硬化 单细胞RNA测序、空间转录组学、高分辨率力学生物学 MVDA模型 单细胞转录组数据、空间转录组数据、机械生物学数据 不适用(综述文章,未涉及具体样本) NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
1911 2026-08-20
Integrative multi-omics identifies PANX2 as a ferroptosis suppressor and potential therapeutic target in clear cell renal cell carcinoma
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 整合多组学数据识别出PANX2为透明细胞肾细胞癌的铁死亡抑制因子,并作为潜在治疗靶点 首次在ccRCC中鉴定并功能验证PANX2作为铁死亡抑制因子,并揭示其通过PANX2-Akt/mTOR-SLC7A11信号轴调控氧化还原稳态的作用机制 尚未在临床样本中进行验证;需要进一步的机制和转化验证 鉴定具有预后价值的铁死亡相关生物标志物,并明确其在ccRCC进展中的功能作用 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)细胞系及小鼠肾癌模型 多组学、生物信息学 透明细胞肾细胞癌 单细胞RNA测序、批量RNA测序、空间转录组学、机器学习、RNA干扰、RNA-seq、脂质过氧化检测、铁探针、氧化还原实验、蛋白质印迹、荧光素酶报告基因实验、异种移植 风险模型、诺模图、机器学习特征选择 基因表达数据、影像数据、实验数据 多个独立队列及实验模型(具体数量未提供) NA 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq、空间转录组学 NA NA
1912 2026-08-20
Inhibition of fatty acid-binding protein 4 alleviates psoriasis-like skin inflammation by modulating macrophage polarization
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究探讨了脂肪酸结合蛋白4(FABP4)在银屑病皮肤炎症中的作用,发现其通过调节巨噬细胞极化,抑制FABP4可缓解银屑病样皮肤炎症,并提示靶向FABP4可能是潜在的治疗策略 首次揭示FABP4通过调控PPARG表达影响巨噬细胞极化在银屑病皮肤炎症中的关键作用,并整合单细胞RNA测序、药理学抑制和遗传调控等多种手段进行验证 未明确FABP4抑制的长期安全性及在人类银屑病中的临床应用效果,且研究主要基于小鼠模型和体外实验,需进一步的人体研究验证 阐明FABP4在银屑病皮肤炎症中的免疫调节机制,并评估其作为治疗靶点的潜力 人银屑病皮肤样本、小鼠银屑病模型(imiquimod诱导)、巨噬细胞 免疫学、皮肤病学 银屑病 单细胞RNA测序、药理学抑制、遗传调控、转录因子调控子分析 NA 单细胞转录组数据、组织样本、实验数据 人银屑病皮肤样本和小鼠模型(具体数量未在摘要中提及) NA 单细胞RNA测序 NA NA
1913 2026-08-20
Oncolytic HSV1716 attenuates tumor-killing activity of infected primary NK cells
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究探讨了溶瘤病毒HSV1716与原发性人类自然杀伤细胞的相互作用,发现病毒感染NK细胞后导致其肿瘤杀伤能力下降 首次揭示溶瘤病毒HSV1716可感染原发性人类NK细胞,并通过单细胞测序分析其功能表型变化,导致细胞毒性能力降低 研究仅限于体外实验,未在体内模型中验证,且未明确病毒感染导致NK细胞功能抑制的分子机制 探究溶瘤病毒HSV1716与原发性人类NK细胞的相互作用及其对NK细胞功能的影响 原发性人类自然杀伤细胞和HSV1716感染的肿瘤细胞 免疫学、肿瘤学 癌症 单细胞测序、共培养实验、病毒拷贝数检测 NA 单细胞基因表达数据、共培养实验数据 原发性人类NK细胞样本(具体数量未在标题和摘要中说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
1914 2026-08-20
A single-cell transcriptomic atlas of the periventricular proliferative zone in the late gestation fetal brain in the pigtail macaque
2026, Frontiers in neuroscience IF:3.2Q2
研究论文 构建了猪尾猕猴晚期妊娠胎儿脑室周围增殖区的单细胞转录组图谱 首次构建了猪尾猕猴晚期妊娠胎儿脑室周围增殖区的单细胞转录组图谱,为灵长类神经发育关键窗口期的祖细胞、神经元、胶质、血管和免疫细胞状态提供了独特参考 未明确提及局限性 构建猪尾猕猴晚期妊娠胎儿脑室周围增殖区的单细胞RNA测序图谱,研究神经发育轨迹 猪尾猕猴晚期妊娠胎儿脑室周围增殖区细胞 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序 Seurat聚类流程,scVelo和CellRank2轨迹分析 单细胞转录组数据 一个侧脑室壁样本 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Genomics测序,SoupX去除环境RNA,空液滴去除,双细胞排除,Seurat流程
1915 2026-08-20
Spatial transcriptomic analysis identifies a necroptosis-prone thyroid follicular cell state in Hashimoto's thyroiditis
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过空间转录组学和多水平功能验证,本研究在桥本甲状腺炎中识别出一种易发生坏死性凋亡的甲状腺滤泡细胞状态,并揭示了RIPK3-MLKL主导的坏死性凋亡程序及其与炎症微环境的关联 首次在空间转录组层面描绘了桥本甲状腺炎中坏死性凋亡相关的细胞和分子程序,识别出TNF信号通路高富集的TFC亚群(Cluster 2)作为坏死性凋亡易感状态和炎症信号核心接收者,并发现RIPK3-MLKL主导而非RIPK1依赖的坏死性凋亡模式 研究未在原代甲状腺细胞、类器官和体内模型中验证RIPK3-MLKL轴靶向治疗的假说,坏死性凋亡的特异性标记物和机制仍需进一步验证 阐明桥本甲状腺炎中甲状腺滤泡细胞坏死性凋亡的细胞异质性、空间分布及其炎症微环境调控机制 桥本甲状腺炎患者的甲状腺组织、血清样本,以及Nthy-ori 3-1甲状腺细胞系 空间转录组学 桥本甲状腺炎 空间转录组学、透射电子显微镜、免疫组化、免疫印迹、假时间轨迹分析 NA 空间转录组数据、图像、蛋白质表达数据 临床队列的甲状腺组织和血清样本,具体数量未在摘要中说明 NA 空间转录组学 NA NA
1916 2026-08-20
The spatial revolution in immuno-oncology: artificial intelligence decoding NK cell niches to predict therapeutic response
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 本文综述了人工智能辅助空间转录组学分析在预测自然杀伤细胞免疫治疗反应中的应用,并探讨其在优化CAR-NK细胞工程、联合治疗策略和个体化给药方案中的潜力 强调从反应预测转向治疗优化的范式转变,并展望了4D动态监测和可解释人工智能在精准NK细胞免疫治疗中的应用 当前证据存在模型可解释性、数据异质性、因果推断和临床验证等方面的局限性 探讨人工智能辅助的空间和多组学数据分析如何为NK细胞治疗反应的生物标志物发现和验证做出贡献,以及其在优化NK细胞免疫治疗策略中的应用 自然杀伤细胞及其在肿瘤微环境中的空间分布、功能状态和细胞相互作用 人工智能、空间转录组学、免疫肿瘤学 肿瘤(包括实体瘤和血液恶性肿瘤) 空间转录组学、人工智能、多组学分析 NA 空间转录组数据、多组学数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
1917 2026-08-20
Single-cell analysis of the synovium and infrapatellar fat pad identifies key pathogenic genes and drug targets in osteoarthritis
2026, International journal of clinical and experimental pathology IF:1.1Q4
研究论文 通过多组学分析和实验验证,从滑膜和髌下脂肪垫中鉴定骨关节炎的关键致病细胞群、因果基因、诊断生物标志物和潜在药物靶点,并评估候选药物靶点与小分子化合物的结合亲和力 结合单细胞RNA测序、孟德尔随机化、分子对接等多种方法,筛选出新的诊断生物标志物和药物靶点,并发现lumacaftor和naldemedine具有多靶点结合活性,具有旧药新用的潜力 研究基于公开数据集和体外模型,缺乏体内实验验证;分子对接结果需进一步实验确认 从滑膜和髌下脂肪垫中识别骨关节炎的关键致病细胞群、因果基因、诊断生物标志物和潜在药物靶点,为骨关节炎的早期诊断和治疗提供新策略 滑膜和髌下脂肪垫组织中的细胞,以及IL-1α诱导的C28/i2软骨细胞 生物信息学, 基因组学 骨关节炎 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 分子对接 NA 基因表达数据, 基因组变异数据 GSE216651数据集包含滑膜和髌下脂肪垫组织的单细胞RNA测序数据;OA-GWAS和eQTLGen数据;体外模型为IL-1α诱导的C28/i2软骨细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1918 2026-08-20
Single-cell transcriptomic analysis of cutaneous squamous cell carcinoma identifies an NR1H3-associated angiogenic macrophage state
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析皮肤鳞状细胞癌,识别出与NR1H3相关的促血管生成巨噬细胞状态。 首次在皮肤鳞状细胞癌中描绘了整合的细胞景观,通过单细胞转录组分析识别出与NR1H3相关的促血管生成巨噬细胞状态,并揭示了其与不良预后的关联。 基于转录组推断拷贝数变异和转录因子活性,缺乏功能验证;样本量较小,可能限制结果的普适性。 阐述皮肤鳞状细胞癌微环境中细胞异质性、分化轨迹、转录调控和细胞间通讯,以理解肿瘤进展机制。 皮肤鳞状细胞癌患者的肿瘤组织、癌旁正常皮肤和外周血样本。 单细胞转录组学 皮肤鳞状细胞癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 80,736个单细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1919 2026-08-20
CycleMix: Gaussian mixture modeling of the cell cycle
2026, Bioinformatics advances IF:2.4Q2
研究论文 本文提出CycleMix算法,基于高斯混合模型对细胞周期进行灵活分配,超越了现有方法在单细胞RNA测序数据上的性能 CycleMix算法能够将细胞分配到任意数量的细胞周期状态,并能识别不处于分裂期的细胞,相比Seurat和Cyclone在现代化液滴数据集上具有更高的准确性 未在文中明确指出,但可能依赖于提供的标记基因,并且在标记基因不足时性能可能受限 改进单细胞RNA测序(scRNAseq)和空间转录组学数据中细胞周期状态的分类方法,以更准确地评估组织中的增殖情况 六个不同的液滴为基础的scRNAseq数据集中的细胞 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序(scRNAseq) 高斯混合模型 基因表达数据 六个不同的液滴为基础的scRNAseq数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1920 2026-08-20
Precision Drug Delivery Strategies for Treatment-Resistant Depression: Opportunities and Challenges of FUS-BBBO and Spatial Molecular Profiling
2026, Drug design, development and therapy
综述 本文综述了治疗抵抗性抑郁症(TRD)从药物递送角度出发的失败原因,探讨了聚焦超声介导的血脑屏障开放(FUS-BBBO)作为靶向药物递送方法的应用前景,结合空间分子谱分析技术,提出了一套闭环精准治疗框架,以优化靶点选择和药物匹配。 提出将FUS-BBBO与空间转录组学和单核多组学整合,以解决治疗抵抗性抑郁症的靶点异质性问题,并设计了一个三步骤转化框架(患者分层、靶点约束和货物匹配),以及一个闭环精准治疗框架。 FUS-BBBO在TRD中的应用仍处于理论阶段,缺乏疾病特异性验证,且存在多次开放血脑屏障的长期安全性、技术标准化、可量化的颅内药代动力学、生物命中验证和机制丰富的试验设计等临床开发障碍。 探讨治疗抵抗性抑郁症的药物递送挑战,并评估FUS-BBBO结合空间分子谱分析作为精准药物递送策略的转化潜力。 治疗抵抗性抑郁症(TRD)患者,重点关注内侧前额叶皮层(mPFC)、前扣带皮层(ACC)、海马和杏仁核等脑区。 神经科学 抑郁症 聚焦超声介导的血脑屏障开放(FUS-BBBO)、空间转录组学、单核多组学 NA 影像、空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
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