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当前共找到 43167 篇文献,本页显示第 1881 - 1900 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1881 2026-08-20
Multi-omics Integration of Single-cell and Spatial Transcriptomics with Tissue and Urine Proteomics Identifies TRIM28 as a Translationally Relevant Candidate Regulator in Acute Kidney Injury
2026-Jun-10, Inflammation IF:4.5Q2
研究论文 构建跨尺度多组学图谱,整合单细胞、空间转录组及组织和尿液蛋白质组,识别出TRIM28作为急性肾损伤的候选调节因子,并提名HY-N10592作为潜在化合物工具 首次整合人类单细胞、空间转录组与小鼠肾组织蛋白质组及临床尿液蛋白质组的跨尺度多组学方法,通过随机森林排序候选因子并结合结构虚拟筛选和CETSA验证药物靶点结合 未进行体内药效学评估,HY-N10592的治疗潜力需进一步动物模型验证;尿液蛋白检测的临床样本量及特异性未详述 整合多组学数据以识别连接肾损伤机制和尿液可检测信号的候选调节因子,并探索治疗靶向性 急性肾损伤患者样本、小鼠肾缺血再灌注损伤模型、HK-2细胞缺氧/复氧模型 数字病理学 急性肾损伤 单细胞转录组学、空间转录组学、蛋白质组学、随机森林模型、结构虚拟筛选、分子对接、分子动力学模拟、CETSA 随机森林模型 单细胞转录组数据、空间转录组数据、蛋白质组数据、尿液蛋白质组数据 人类样本数未明确,涉及小鼠RIRI模型及HK-2细胞模型 NA 单细胞RNA-seq、空间转录组学、蛋白质组学 NA NA
1882 2026-08-20
Integration of bulk and single-cell RNA-seq data identifies a cellular senescence-related prognostic signature in liver hepatocellular carcinoma
2026-Jun-10, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 整合bulk和单细胞RNA-seq数据,识别肝细胞癌中与细胞衰老相关的预后特征 首次整合bulk和单细胞RNA-seq数据构建基于细胞衰老相关基因的预后模型,并识别EEF1E1作为关键基因具有致癌潜能 未提及具体局限性 构建细胞衰老相关基因的预后特征,并探究其在肝细胞癌中的功能作用 肝细胞癌患者样本及细胞系 基因组学 肝细胞癌 bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA 基因表达数据 TCGA、ICGC、TISCH数据集中的肝细胞癌样本 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
1883 2026-08-20
RANBP1 promotes oral cancer progression through activating YAP1 and NDUFB3 derived from the database of single-cell sequencing
2026-Jun-10, Cancer cell international IF:5.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞测序数据库和功能实验揭示RANBP1通过激活YAP1和NDUFB3促进口腔癌进展的机制 首次利用单细胞转录组数据库识别RANBP1作为口腔癌恶性上皮细胞中的差异表达基因,并阐明其通过YAP1-NDUFB3轴调控氧化磷酸化和肿瘤侵袭性的新机制 研究中未涉及RANBP1在其他头颈癌类型中的验证,且未探讨肿瘤微环境中其他细胞类型(如免疫细胞、成纤维细胞)对RANBP1作用的影响 探索口腔鳞状细胞癌进展的分子机制,特别是通过单细胞测序识别关键基因并验证其功能 口腔鳞状细胞癌组织样本、细胞系、斑马鱼异种移植模型和NOD/SCID小鼠异种移植模型 数字病理学 口腔癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 10例口腔鳞状细胞癌患者的活检样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
1884 2026-08-20
Multi-omic analysis reveals Wharton's jelly mesenchymal stem cells shift the pro-inflammatory phenotype of fibroblast subpopulation to induce skin rejuvenation
2026-Jun-10, Cell & bioscience
研究论文 本研究通过多组学分析揭示华通胶间充质干细胞通过改变成纤维细胞亚群的促炎表型来诱导皮肤年轻化 首次通过整合bulk RNA-seq、微阵列和单细胞转录组学等多组学方法,全面阐明WJMSCs改善皮肤衰老的机制,并发现其下调促炎成纤维细胞中富集的昼夜节律相关基因Dbp 摘要中未提及明确的局限性 探究WJMSCs对皮肤衰老的作用机制及其对成纤维细胞亚群的影响 人类皮肤成纤维细胞(HDFs)和裸鼠皮肤组织 数字病理学、机器学习 皮肤衰老 bulk RNA-seq、微阵列、单细胞转录组学 NA 基因表达数据、组织学图像、细胞学数据 体外HDFs和裸鼠模型,具体样本数未在摘要中提供 NA bulk RNA-seq、单细胞转录组学 NA NA
1885 2026-08-20
SGMHA: semantic graph reconstruction with multi-head attention for gene regulatory network inference
2026-Jun-09, BMC genomics IF:3.5Q2
研究论文 提出SGMHA,一种基于语义图重建和多头注意力机制的两阶段框架,用于从单细胞RNA测序数据中推断基因调控网络,并在乳腺癌转移研究中验证了其有效性 创新性地将表示学习与链接预测解耦,采用自监督图掩码自编码器(GraphMAE)重建随机掩码的表达值以缓解数据稀疏性,再结合多头注意力微调模块整合预训练表示和原始数据以推断有向调控链接 摘要中未提及明确局限性 提高从稀疏单细胞RNA测序数据中推断基因调控网络的准确性和鲁棒性,并支持复杂疾病中的生物标志物发现 基因调控网络,从单细胞RNA测序数据推断 机器学习 乳腺癌 单细胞RNA测序 图掩码自编码器(GraphMAE)和多头注意力(MHA) 基因表达数据 七个单细胞RNA测序数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1886 2026-08-20
CMS4 epithelial-intrinsic glycosyltransferase GALNT5 promotes tumor aggressiveness and correlates with poor survival in colorectal cancer
2026-Jun-08, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,发现结直肠癌CMS4亚型肿瘤上皮细胞特有糖基转移酶GALNT5,其高表达与肿瘤侵袭性和不良生存相关 利用单细胞转录组学区分CMS4肿瘤上皮细胞与基质细胞,首次定义CMS4上皮内在糖基化程序,并鉴定GALNT5作为预后标志物和治疗候选靶点 未提及具体局限性 明确CMS4肿瘤上皮细胞内在的糖基转移酶表达谱,并评估GALNT5作为预后标志物的潜力 结直肠癌CMS4亚型肿瘤上皮细胞、CMS1-3上皮细胞、正常上皮、基质/免疫细胞、CRC细胞系及431例手术切除的结直肠癌标本 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序、免疫组织化学 NA 单细胞转录组数据、组织微阵列图像 431例结直肠癌手术切除标本 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 单细胞3'转录组测序
1887 2026-08-20
The exploration to identify key molecules in the interaction between endothelial cells and mono-macrophages in atherosclerosis based on the single cell transcriptome
2026-Jun-05, BMC cardiovascular disorders IF:2.0Q3
研究论文 本研究基于单细胞转录组数据,探索动脉粥样硬化中内皮细胞与单核-巨噬细胞相互作用的关键分子 通过单细胞RNA测序分析,识别出与动脉粥样硬化相关的细胞亚群和信号通路,特别是MK(Midkine)通路及MDK-NCL配体-受体对,并通过体外共培养实验初步验证其表达变化 未提及明确的局限性 识别动脉粥样硬化中内皮细胞与单核-巨噬细胞相互作用的关键分子和信号通路,为冠状动脉疾病的防治提供候选靶点 钙化动脉粥样硬化核心斑块和患者匹配的近端邻近颈动脉组织中的内皮细胞和单核-巨噬细胞群体 单细胞转录组学 冠状动脉疾病、动脉粥样硬化 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 公开数据集,具体样本数量未在标题和摘要中提及 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1888 2026-08-20
Linking childhood interstitial lung disease to IARS-related disorder: clinical and preliminary functional studies in four new cases
2026-Jun-03, Human genomics IF:3.8Q2
研究论文 本研究通过四个新病例的临床和初步功能研究,将儿童间质性肺病与IARS相关疾病联系起来,并确定IARS为chILD/PAP的新型致病基因 首次将IARS双等位基因突变与儿童间质性肺病及肺泡蛋白沉积症建立明确关联,并利用单细胞RNA测序揭示单核细胞/巨噬细胞谱系的潜在功能缺陷 研究样本量小(仅四例),且功能研究为初步探索,缺乏更深入的机制验证 阐明IARS双等位基因突变在儿童间质性肺病和肺泡蛋白沉积症中的致病作用及潜在免疫相关机制 四名表现为进行性chILD/PAP并伴有肺外表现的儿科患者 基因组学、单细胞测序 儿童间质性肺病、肺泡蛋白沉积症、IARS相关疾病 全外显子组测序、AlphaFold蛋白结构预测、PAS和ORO染色、western blotting、透射电子显微镜、单细胞RNA测序 AlphaFold 基因组测序数据、蛋白结构数据、染色图像、蛋白质表达数据、电子显微镜图像、单细胞转录组数据 4例儿科患者 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序用于外周血单核细胞分析
1889 2026-08-20
Impaired early type I interferon responses to influenza virus infection in aged mice are associated with subsequent increased pulmonary inflammation
2026-Jun, GeroScience IF:5.3Q1
研究论文 本研究通过年轻和老年小鼠感染流感病毒模型,发现老年小鼠早期I型干扰素反应受损,导致病毒载量增加和后期肺部炎症加剧 首次利用单细胞RNA测序揭示老年小鼠在流感感染后期多种免疫细胞中持续存在炎症相关基因高表达,并关联早期I型干扰素反应受损 研究仅基于小鼠模型,未涉及人类样本;未探讨老年小鼠早期I型干扰素反应受损的分子机制 探究衰老对流感病毒感染早期固有免疫反应的影响及其与后期肺部炎症的关系 年轻(12周龄)和老年(70周龄)C57BL/6J小鼠,感染流感病毒PR8后的肺组织 免疫学 流感 qRT-PCR, 单细胞RNA测序 小鼠模型 基因表达数据, 组织病理图像 两组小鼠(年轻和老年),每组若干只(具体未在摘要中说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
1890 2026-08-20
Spatial blueprint of colorectal cancer identifies Hypoxic CAF program that orchestrates Go-or-Grow decisions and predicts outcomes
2026-Jun, Investigational new drugs IF:3.0Q2
研究论文 本研究整合单细胞转录组和空间转录组数据,绘制结直肠癌的空间蓝图,识别出缺氧CAF程序,该程序调控肿瘤细胞的“生长或迁移”决策并预测患者预后 首次揭示结直肠癌中由缺氧CAF调控的“生长或迁移”空间开关机制,并鉴定HMGA2作为关键转录调控因子,为空间指导的结直肠癌干预提供新靶点 未在摘要中明确说明,但可能包含样本量有限、验证依赖特定队列及体外模型等局限 解析结直肠癌肿瘤微环境的空间组织及其功能影响,揭示驱动肿瘤进展的关键机制 结直肠癌患者肿瘤组织中的细胞(412,208个单细胞和76,627个空间点)及原代CAF培养物 数字病理学 结直肠癌 单细胞转录组测序,空间转录组测序,SCENIC网络推断,细胞间通讯分析,Seahorse代谢分析 NA 单细胞转录组数据,空间转录组数据,临床生存数据,代谢数据 32例患者的38个组织切片,包含412,208个单细胞和76,627个空间点 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA测序,空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium, Illumina NovaSeq 未在摘要中明确但常用配置为10x Chromium Single Cell 3'和10x Visium FFPE
1891 2026-08-20
Clinical outcomes and spatial transcriptomic profiles of CD19/20 CAR-T therapy in relapsed or refractory B-cell non-Hodgkin's lymphoma
2026-May-17, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究评估了CD19/20双特异性CAR-T细胞治疗复发或难治性B细胞非霍奇金淋巴瘤的临床疗效,并结合空间转录组学分析揭示治疗反应相关的肿瘤内源性和微环境因素 首次将空间分辨的单细胞转录组学应用于CD19/20双特异性CAR-T细胞治疗,以识别与临床反应相关的肿瘤内源性和微环境特征 空间转录组分析仅基于少数患者(5例)的预处理活检样本,可能限制了结果的普遍性 评估CD19/20双特异性CAR-T细胞治疗复发或难治性B-NHL的疗效和安全性,并利用空间转录组学探索治疗反应的预测因素 复发或难治性B细胞非霍奇金淋巴瘤患者,包括弥漫大B细胞淋巴瘤等亚型 数字病理学, 机器学习 B细胞非霍奇金淋巴瘤 CAR-T细胞治疗, 空间单细胞转录组学 NA 空间转录组数据, 临床数据 32名患者接受治疗,其中31名可评估疗效;5名患者进行了空间转录组分析 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium空间转录组学平台
1892 2026-08-20
DeSpotX: Identifiability-Based Decontamination for Spatial Transcriptomics
2026-May-14, bioRxiv : the preprint server for biology
research paper 该研究提出了DeSpotX,一种利用锚定基因和空间信息进行可识别性去污的深度生成模型,用于处理空间转录组数据中的转录本污染问题 通过引入锚定基因使去污分解具有可识别性,并利用空间信息进行局部污染估计,同时采用学习到的扩散先验防止过度校正 文中未明确提及限制,但根据内容推测可能涉及对细胞簇注释准确性的一定依赖 解决空间转录组数据中转录本污染导致的分解不明确问题,提高下游生物分析的准确性 空间转录组数据中的基因表达,包括模拟和真实组织样本 生物信息学 不适用 空间转录组测序 深度生成模型 基因表达计数数据 五个人类数据集和四个空间转录组平台,具体样本数量未给出 NA 空间转录组学 NA NA
1893 2026-08-20
Epitranscriptomic and immunometabolic mechanisms of traditional Chinese medicine in metabolic-associated cognitive impairment: a narrative review
2026-04-06, Metabolic brain disease IF:3.2Q2
综述 本文综述了代谢相关认知障碍的病理机制,以及中药通过表观转录组学和免疫代谢途径发挥治疗作用的研究进展 从表观转录组学和免疫代谢角度系统总结中药治疗代谢相关认知障碍的机制,并探讨网络药理学、多组学和空间转录组学等新技术在中药机理研究中的应用 主要基于现有文献综述,缺乏原始实验数据验证,且中药成分复杂,具体作用机制仍需进一步研究 总结代谢相关认知障碍的病理机制和中药通过表观转录组学及免疫代谢途径的治疗作用,并讨论未来研究方向 代谢相关认知障碍及其相关代谢紊乱(如肥胖、2型糖尿病、代谢相关脂肪性肝病) 数字病理学 代谢相关认知障碍 NA NA 文献数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
1894 2026-08-20
Single-cell transcriptomics reveals targeted modulation of inflammatory repertoire by SOCE blockers
2026-Apr, Human immunology IF:3.1Q3
研究论文 本研究利用多重单细胞RNA测序技术,探究SOCE阻断剂BTP2和CM4620对植物血凝素驱动的正常人类外周血单个核细胞T细胞激活模型的影响,发现阻断SOCE可抑制CD8效应T细胞和NK细胞的细胞毒性转录程序,同时保留CD4调节性T细胞的免疫调节特征 首次在单细胞水平上揭示SOCE阻断对特定免疫细胞亚型的差异化影响,即在抑制促炎和细胞毒性程序的同时保留调节性T细胞的耐受相关通路,为靶向免疫调节提供了新见解 研究仅基于体外PHA驱动的T细胞激活模型,未进行体内验证或与传统免疫抑制剂的头对头比较,且未探讨SOCE阻断对其他免疫细胞类型或长期效应的影响 探究SOCE阻断在特定激活背景下对免疫细胞类型特异性转录后果的影响,评估其作为靶向免疫调节策略的潜力 正常人类外周血单个核细胞,包括CD8效应T细胞、自然杀伤细胞和CD4调节性T细胞 单细胞转录组学 免疫介导性疾病 单细胞RNA测序 不适用 单细胞转录组数据 正常人类PBMC样本(具体数量未在标题和摘要中提供) 不适用 单细胞RNA测序 不适用 不适用
1895 2026-08-20
[Comprehensive Analysis of Spatial and Temporal Tumor Heterogeneity of Immune Checkpoint Molecules in GastricCancer]
2026-Apr, Gan to kagaku ryoho. Cancer & chemotherapy
PMID:42178627
综述 本文综述了胃癌中免疫检查点分子的空间和时间肿瘤异质性,探讨其临床意义及对免疫相关生物标志物解读的影响 从空间和时间两个维度系统总结胃癌免疫检查点分子的异质性,并结合单细胞和空间转录组学的最新进展,提出对免疫治疗决策的潜在影响 基于现有文献的综述,可能缺乏原始实验数据支持,且对异质性机制的深入探讨有限 总结胃癌中免疫检查点分子的空间和时间异质性,并讨论其临床意义和生物标志物解读的注意事项 胃癌中的免疫检查点分子及其空间和时间表达模式 数字病理学 胃癌 单细胞分析、空间转录组学 NA 文献综述,无具体数据类型 NA NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
1896 2026-08-20
Oncogenic function and transcriptional dynamics of MYCN in liver tumorigenesis
2026-Feb-24, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究揭示了MYCN在肝肿瘤发生中的致癌作用及其动态转录调控机制,并开发了基于机器学习的MYCN生态位评分以预测肝癌复发风险 首次阐明MYCN与AKT协同驱动肝肿瘤发生,利用时间分辨空间转录组学揭示MYCN富集的肿瘤微环境特征,并开发了临床可用的MYCN生态位评分 未明确提及,但可能包括基于小鼠模型的发现需在人类中进一步验证,以及机器学习评分的预测性能需更大规模前瞻性研究确认 探究MYCN在肝细胞癌发生中的功能及其转录动态调控,并开发临床预测工具 小鼠模型中的肝肿瘤组织及人类肝细胞癌患者样本 数字病理学, 机器学习 肝细胞癌 转录组学, 空间转录组学, 水动力尾静脉注射转座子系统 机器学习模型 转录组数据, 空间转录组图像 小鼠模型及多个人类肝细胞癌队列,具体数量未在摘要中提及 NA 空间转录组学, 批量RNA测序 NA NA
1897 2026-08-20
Single cell transcriptional perturbome in pluripotent stem cell models
2026-Feb, Molecular systems biology IF:8.5Q1
研究论文 开发了iPS2-seq平台,用于在人类诱导多能干细胞衍生物中进行可诱导、克隆感知的单细胞功能基因组学筛查,揭示了SMAD2在心脏祖细胞特化中的作用 iPS2-seq平台结合了诱导性和克隆感知特性,能够区分真实扰动效应与遗传和表观遗传变异,支持汇集和阵列格式,整合微流控或分池单细胞RNA测序,并扩展到染色质和蛋白质的多组学分析,还配套了catcheR分析流程 未明确提及局限性 在iPS2-seq平台中实现基于iPSC模型的高通量功能基因组学筛查,并用于剖析复杂多细胞模型中的基因功能 人类诱导多能干细胞衍生物,包括单层心肌细胞和类器官 功能基因组学 先天性心脏病 RNA-seq NA 单细胞转录组数据 未明确提及样本数量 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 微流控或分池单细胞RNA测序
1898 2026-08-20
An insulin receptor activity surge in follicle cells drives vitellogenesis by upregulating CrebA
2026-02, EMBO reports IF:6.5Q1
研究论文 本研究揭示了果蝇卵泡细胞中胰岛素受体活性在卵黄生成阶段激增,通过上调CrebA促进卵黄和卵黄膜蛋白的转录,从而提升分泌能力 使用基于相分离的报告系统观察到胰岛素受体活性的激增,并通过单细胞RNA-seq发现饮食敏感的卵泡细胞亚群,揭示CrebA在胰岛素信号调控分泌能力中的关键作用,且该调控轴在人类颗粒细胞中保守 摘要中未提及研究的局限性 探究胰岛素信号在果蝇卵泡细胞中调控卵黄生成和卵泡发生的机制 果蝇卵泡细胞及人类颗粒细胞 数字病理学 不适用 单细胞RNA测序 不适用 基因表达数据 果蝇卵泡细胞和人类颗粒细胞(具体数量未提及) 不适用 单细胞RNA测序 不适用 不适用
1899 2026-08-20
Antitumor Effects of PD-1 Blockade Combined with Mild Hyperthermia in a Murine Osteosarcoma Model
2026-Feb-01, Biomedicines IF:3.9Q1
研究论文 本研究探讨了PD-1阻断联合轻度热疗在小鼠骨肉瘤模型中的抗肿瘤效应及其对肿瘤免疫微环境的影响 首次在骨肉瘤模型中评估轻度热疗与PD-1阻断联合治疗的抗肿瘤效果,并利用单细胞RNA测序揭示免疫相关转录特征的变化 研究仅限于小鼠模型,未进行人体临床试验验证 评估轻度热疗联合PD-1阻断对骨肉瘤的抗肿瘤疗效及免疫微环境重塑作用 小鼠LM8骨肉瘤细胞及LM8荷瘤小鼠 数字病理学 骨肉瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠模型及细胞系实验 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1900 2026-08-20
Phylogenomic tree of Cercozoa based on single-cell transcriptomes from 100 uncultured cells
2026-01-30, BMC biology IF:4.4Q1
研究论文 基于100个未培养细胞的单细胞转录组数据构建了Cercozoa的系统发育树,增加了超过300%的分类群采样,并发现了多个新谱系。 利用单细胞转录组学方法对未培养的Cercozoa多样性进行了广泛采样,发现了五个新的和两个仅从环境序列已知的谱系,极大扩展了Rhizaria的多样性认识。 该研究未能恢复所有已建立的进化枝,如Imbricatea类,可能受限于数据覆盖或分析方法。 通过单细胞转录组学方法全面采样未培养的Cercozoa多样性,构建更全面的多基因系统发育树,以增进对其基本生物学和多样性的理解。 100个未培养的Cercozoa单细胞。 系统发育学 NA 单细胞转录组学 NA 转录组数据,图像数据 100个未培养的细胞 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'试剂盒
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