单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 44757 篇文献，本页显示第 1881 - 1900 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1881 | 2026-09-29 |
Eczema-like Granular Parakeratosis Exhibits Inflammatory Keratinocyte Remodeling and Aberrant Epidermal Differentiation
2026-Sep-21, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27188418
PMID:42794844
|
研究论文 | 通过对三名颗粒状角化不全患者皮损及三名健康对照皮肤进行单细胞RNA测序，结合免疫荧光验证和HaCaT细胞实验，揭示颗粒状角化不全是一种暴露相关的炎症性表皮分化障碍 | 首次对颗粒状角化不全进行单细胞RNA测序分析，发现炎症性角质形成细胞扩增，并揭示苯扎氯铵暴露可通过诱导IL-1相关炎症激活参与疾病发生 | 样本量较小（单细胞测序3例患者和3例对照，验证队列4例患者和3例对照），需更大规模研究验证；HaCaT细胞系不能完全代表原代角质形成细胞 | 探究颗粒状角化不全的发病机制，明确其是否为单纯的角化异常，并探索环境暴露因素在疾病中的作用 | 颗粒状角化不全患者的皮损皮肤组织、健康对照皮肤组织以及HaCaT细胞系 | 单细胞组学、皮肤病学 | 颗粒状角化不全、湿疹 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、bulk RNA测序、CCK-8 | NA | 单细胞转录组数据、图像、文本 | 单细胞RNA测序：3例颗粒状角化不全患者和3例健康对照；免疫荧光验证：4例患者和3例健康对照；HaCaT细胞实验 | NA | 单细胞RNA测序、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1882 | 2026-09-29 |
Cell-Surface Signatures and Targets of Modulated Vascular Smooth Muscle Cells in Atherosclerosis: From State Identification to Precision Intervention
2026-Sep-20, Journal of cardiovascular development and disease
IF:2.4Q2
DOI:10.3390/jcdd13090472
PMID:42783079
|
综述 | 本文综述了如何将血管平滑肌细胞（VSMC）状态发现转化为细胞表面标志物和表面可及的干预接口，并提出了状态匹配的精准干预框架 | 提出状态匹配框架，将致病状态选择性清除、可塑或可逆状态调节或重编程、基质支持性斑块稳定状态保留，并系统区分状态/谱系标志物、表面识别与分选标志物、功能性表面接口、因果支持的候选靶点和干预支持的表面靶点 | 人类蛋白质水平和表面验证不足、状态特异性有限、空间可及性未知以及缺乏直接治疗测试 | 探讨如何将VSMC状态发现转化为细胞表面标志物和表面可及的干预接口，以实现从状态识别到精准干预的转化 | 动脉粥样硬化斑块中VSMC来源的异质性细胞群体及其细胞表面标志物和干预靶点 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 谱系追踪、单细胞转录组学、空间 profiling、多模态表面蛋白测量 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 1883 | 2026-09-29 |
Echinacoside Alleviates Cisplatin-Induced Acute Kidney Injury by Regulating Bap1 to Inhibit Ferroptosis
2026-Sep-20, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines14092127
PMID:42792866
|
研究论文 | 本研究探讨了松果菊苷（ECH）通过调控Bap1抑制铁死亡，从而减轻顺铂诱导的急性肾损伤的作用及其分子机制 | 首次揭示ECH通过下调Bap1蛋白表达、恢复Slc7a11/GPX4轴来抑制铁死亡，从而发挥肾脏保护作用，并发现ECH-Bap1-铁死亡调控关系可作为顺铂肾毒性的候选治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型和HK-2细胞系，缺乏临床人体试验验证；分子对接仅预测了ECH与Bap1的潜在相互作用，未提供直接结合的结构生物学证据；Bap1调控铁死亡的具体分子通路尚需进一步阐明 | 探索松果菊苷（ECH）对顺铂诱导的急性肾损伤的肾脏保护作用及其潜在的分子机制 | 8周龄雄性C57BL/6顺铂-AKI小鼠模型和HK-2肾小管上皮细胞 | 机器学习 | 急性肾损伤 | 单细胞转录组测序、4D-DIA蛋白质组学、Western blotting、分子对接模拟 | NA | 图像、文本 | 8周龄雄性C57BL/6小鼠模型及HK-2肾小管上皮细胞 | NA | 单细胞RNA-seq、4D-DIA蛋白质组学 | NA | NA |
| 1884 | 2026-09-29 |
Multi-Omics Analysis Identifies TTYH3 and MPG as Candidate Osteoporosis-Associated Biomarkers in Osteoblasts and Characterizes Spatial Heterogeneity of SPP1 in the Osteoporotic Bone Microenvironment
2026-Sep-20, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines14092126
PMID:42792867
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、批量RNA测序和空间转录组数据，结合多种机器学习方法，鉴定出TTYH3和MPG为骨质疏松相关的成骨细胞候选生物标志物，并揭示了SPP1在骨质疏松骨微环境中的空间异质性 | 首次整合scRNA-seq、bulk RNA-seq和空间转录组学数据，结合三种机器学习方法、人工神经网络加权分析和WGCNA来优先筛选骨质疏松相关基因，并发现TTYH3和MPG作为新的候选生物标志物，同时通过CellChat分析揭示了SPP1在骨质疏松骨微环境中的空间异质性表达模式 | 研究主要基于生物信息学分析和有限的实验验证（免疫组化染色和qRT-PCR），缺乏深入的体内功能实验和机制研究，候选基因TTYH3和MPG在骨质疏松发病中的具体分子机制尚未阐明 | 鉴定与骨质疏松稳健相关的成骨细胞特异性基因，并阐明其潜在的致病机制 | 成骨细胞、骨质疏松患者骨组织样本、MC3T3-E1细胞系、人股骨头组织样本 | 数字病理学、机器学习 | 骨质疏松 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、空间转录组学、免疫组化染色、qRT-PCR | 人工神经网络（ANN）、机器学习方法、WGCNA | 基因表达数据、图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 1885 | 2026-09-29 |
Next-Generation Biomarkers and Artificial Intelligence in Colorectal Cancer: From Multi-Omic Data Integration to Clinical Application
2026-Sep-20, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers18183052
PMID:42795017
|
综述 | 本文综述了结直肠癌中新一代生物标志物与人工智能的应用，涵盖多组学数据整合、液体活检、计算病理学、影像组学及临床实施 | 系统整合了多组学、人工智能、液体活检、影像组学和病理组学在结直肠癌中的最新证据，提出从多组学数据整合到临床应用的转化框架 | 跨机构数据协调困难、模型在不同人群中的泛化能力有限、算法偏见以及缺乏适合临床AI的监管框架 | 总结结直肠癌中新一代生物标志物和人工智能应用的最新证据，并探讨其临床转化路径 | 结直肠癌患者及相关多组学、影像和病理数据 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 多组学整合、液体活检、ctDNA监测、影像组学、病理组学、空间转录组学、单细胞技术 | 机器学习、深度学习 | 图像、文本、基因组数据、转录组数据、蛋白质组数据、代谢组数据、微生物组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1886 | 2026-09-29 |
Multi-Omics Integration Identifies Epithelial-Stromal-Immune Co-Regulators Bridging Ulcerative Colitis and Colorectal Cancer
2026-Sep-19, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines14092120
PMID:42792859
|
研究论文 | 该研究通过整合溃疡性结肠炎（UC）微阵列队列与TCGA-COAD数据集，结合WGCNA与定向差异表达分析筛选共享候选基因，并利用多种机器学习方法、孟德尔随机化、免疫解卷积及Visium空间转录组学鉴定连接UC与结直肠癌的上皮-基质-免疫共调控模块 | 首次通过多组学整合策略系统性地识别了桥接溃疡性结肠炎与结直肠癌的共享候选基因，发现了一个由四个基因构成的空间结构化上皮-基质-免疫模块，并采用空间转录组学揭示了该模块在炎症黏膜中的三区室空间结构 | 四个基因的收敛仅出现在特定拟合中而非可重复选择器（1000次重采样中仅0.3%同时恢复），孟德尔随机化分析对部分基因呈无效估计或无法检验，预后模型区分度弱且外部验证不显著，空间转录组每组仅两个切片导致UC与对照的模块评分差异无法分辨，整体发现属假设生成性质，尚不足以用于预后或分层 | 探究桥接溃疡性结肠炎慢性黏膜炎症与结直肠恶性转化之间的转录中间体，明确两疾病共享基因是否驱动转化过程 | 溃疡性结肠炎患者样本、TCGA-COAD结直肠癌数据集、独立UC验证队列及结肠组织切片 | 机器学习, 空间转录组学 | 结直肠癌, 溃疡性结肠炎 | 微阵列分析, RNA-seq, 空间转录组学, 孟德尔随机化, 免疫解卷积 | LASSO, 随机森林, SVM-RFE, LASSO-Cox | 基因表达数据, 空间转录组图像 | UC微阵列队列共227例，TCGA-COAD 524例，独立UC验证队列GSE92415共183例，外部预后验证队列GSE39582共573例，Visium空间转录组来自4个结肠切片（每组2个） | 10x Genomics | 空间转录组学, 微阵列, bulk RNA-seq | 10x Visium | NA |
| 1887 | 2026-09-29 |
HLA-II Expression Marks Activated and Clonally Expanded CD8+ T Cells and Improves Tumor-Reactivity Prediction Across Human Cancers
2026-Sep-19, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27188338
PMID:42794764
|
研究论文 | 该研究整合31个单细胞免疫数据集的scRNA-seq和scTCR-seq数据，揭示HLA-II表达标记活化和克隆扩增的CD8+ T细胞状态，并提升跨癌种肿瘤反应性预测性能 | 首次系统性地将HLA-II表达与CD8+ T细胞的克隆扩增和肿瘤反应性关联，并证明HLA-II相关转录特征可显著提升深度学习模型对肿瘤反应性TCR的预测性能 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 表征与克隆扩增和肿瘤反应性相关的CD8+ T细胞状态，并评估HLA-II表达对肿瘤反应性预测的贡献 | 肿瘤浸润性CD8+ T细胞、TCR克隆型、胰腺导管腺癌样本 | 数字病理学, 机器学习 | 肺癌, 胰腺癌, 多种癌症 | 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序 | DNN | 图像, 文本 | 31个单细胞免疫数据集，6个胰腺导管腺癌样本，3个留出样本中2225个功能注释的CD8+ T细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序 | NA | NA |
| 1888 | 2026-09-29 |
The Compatibility of Astragali Radix and Angelicae Sinensis Radix Attenuates Atherosclerosis by Suppressing Vascular Endothelial PANoptosis via the p38 MAPK/p53 Pathway: A Multi-Omics and Experimental Study
2026-Sep-19, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27188330
PMID:42794757
|
研究论文 | 该研究结合多组学与实验验证，探讨黄芪-当归配伍通过抑制p38 MAPK/p53通路介导的血管内皮PANoptosis改善动脉粥样硬化 | 首次从PANoptosis（涵盖凋亡、焦亡和坏死性凋亡）角度阐明黄芪-当归配伍抗动脉粥样硬化的机制，并整合UPLC-MS/MS、转录组学、单细胞测序、网络药理学、分子对接和分子动力学模拟等多种方法 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究黄芪-当归配伍抗动脉粥样硬化的具体分子机制，特别是从PANoptosis角度阐明其作用靶点和信号通路 | ApoE缺陷雄性小鼠（体内实验）和POVPC刺激的主动脉血管内皮细胞（体外实验），以及黄芪-当归配伍的活性成分 | 机器学习, 数字病理学 | 心血管疾病 | UPLC-MS/MS, 转录组学, 单细胞测序, 网络药理学, 分子对接, 分子动力学模拟 | NA | 图像, 文本 | 体内实验使用雄性ApoE缺陷小鼠，分为模型组、黄芪-当归低中高剂量组、阿托伐他汀组和对照组（年龄匹配的野生型C57BL/6J小鼠）；体外实验使用POVPC刺激的主动脉血管内皮细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组学 | NA | NA |
| 1889 | 2026-09-29 |
Microenvironment-derived acetylated amino acids promote glioblastoma treatment resistance
2026-Sep-18, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-10976328/v1
PMID:42780293
|
研究论文 | 该研究揭示了胶质母细胞瘤中肿瘤相关巨噬细胞通过分泌乙酰化氨基酸促进肿瘤细胞DNA修复和治疗抵抗的机制 | 首次发现肿瘤相关巨噬细胞通过分泌乙酰化氨基酸促进胶质母细胞瘤细胞的DNA修复和治疗抵抗，揭示了微环境来源的乙酰化氨基酸在肿瘤治疗抵抗中的新作用 | 摘要中未明确提及研究的具体限制 | 探究肿瘤微环境中非恶性细胞类型在加速肿瘤细胞DNA修复中的作用机制 | 胶质母细胞瘤（GBM）患者组织、临床前模型及肿瘤相关巨噬细胞 | 空间转录组学、代谢组学、肿瘤生物学 | 胶质母细胞瘤 | 空间转录组学、免疫荧光、代谢组学 | NA | 图像、文本、代谢数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1890 | 2026-09-29 |
Single-Cell Transcriptomic Profiling of Peripheral Blood in a Patient with Progressive Thyroid Eye Disease Following Total Thyroidectomy
2026-Sep-18, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17091143
PMID:42793037
|
研究论文 | 本文对一名全甲状腺切除术后四年仍进展为重度糖皮质激素难治性甲状腺眼病（TED）的47岁女性患者外周血单个核细胞（PBMC）进行单细胞RNA测序，并与年龄性别匹配的健康对照进行比较，揭示其外周血免疫景观向应激相关炎症状态转变的特征 | 首次对全甲状腺切除术后仍进展的TED患者外周血进行单细胞转录组分析，提出了“组织引流”效应的假说，即最具致病性的淋巴细胞沿趋化因子梯度离开血流迁移至炎症眼眶组织，并发现AP-1/应激轴及细胞应激通路可作为候选治疗靶点 | 本研究为单病例观察，结果仅为初步发现，需要在更大队列中验证，还需在蛋白质水平以及体外/体内功能研究中进一步证实 | 探究全甲状腺切除术后甲状腺眼病仍持续进展的潜在免疫机制，特别是外周血免疫细胞状态的变化 | 一名47岁女性重度糖皮质激素难治性TED患者（全甲状腺切除术后四年）的外周血单个核细胞，以及一名年龄性别匹配的健康对照 | 单细胞转录组学 | 甲状腺眼病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 2例外周血样本（1例TED患者和1例健康对照） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1891 | 2026-09-29 |
DVT-primed neutrophils reshape the brain microenvironment to promote brain metastasis
2026-Sep-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.09.15.751589
PMID:42780036
|
研究论文 | 本研究揭示深静脉血栓（DVT）通过重编程循环中性粒细胞促进三阴性乳腺癌脑转移的机制 | 首次将DVT确定为转移性乳腺癌患者脑转移的独立风险因素，并阐明DVT通过诱导中性粒细胞向迁移和炎症表型重编程、增强CXCR2表达和NET形成来促进脑转移的机制 | 研究主要基于小鼠同基因TNBC模型，人体临床验证有限，具体分子机制和治疗靶点仍需进一步探索 | 探究DVT对三阴性乳腺癌脑转移的影响及其潜在机制 | 转移性乳腺癌患者临床队列及两种同基因三阴性乳腺癌小鼠模型 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | 大型临床队列（转移性乳腺癌患者）及两种同基因TNBC小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 对外周血CD45+细胞进行单细胞RNA测序 |
| 1892 | 2026-09-29 |
Integrative Proteome-Wide Mendelian Randomization and Multi-Omics Analysis Identify ADM and CFH as Candidate Genes for Osteoarthritis
2026-Sep-17, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines14092096
PMID:42792836
|
研究论文 | 该研究通过整合蛋白质组范围孟德尔随机化和多组学分析，识别出ADM和CFH作为骨关节炎的候选基因 | 首次结合两阶段蛋白质组范围孟德尔随机化、基于汇总数据的孟德尔随机化、贝叶斯共定位分析、转录组学、单细胞RNA测序和药物重定位分析，系统性地将ADM和CFH优先确定为骨关节炎候选基因 | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 识别骨关节炎的关键候选基因，以促进机制探索和治疗开发 | 骨关节炎患者及骨关节炎体外模型 | 机器学习 | 骨关节炎 | cis-pQTL孟德尔随机化, cis-eQTL SMR分析, 贝叶斯共定位分析, PheWAS, 转录组学, 单细胞RNA测序, 分子对接 | NA | 图像, 文本 | 三个大规模cis-pQTL数据集和两个骨关节炎GWAS汇总统计数据 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 1893 | 2026-09-29 |
From Glycan Biology to Drug Candidates: An Integrated Sialylation Niche Index and AI-Guided Therapeutic Framework for Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2026-Sep-17, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines14092102
PMID:42792842
|
研究论文 | 该研究整合了唾液酸化相关基因表达数据、机器学习预后建模、分子分型以及AI引导的药物筛选，构建了头颈部鳞状细胞癌的唾液酸化生态位指数并探索了潜在治疗化合物 | 首次提出唾液酸化生态位指数（SNI）作为头颈部鳞状细胞癌的预后框架，通过117种机器学习算法组合进行特征选择和模型拟合，并结合单细胞RNA测序、空间转录组学和AI引导的249455种化合物筛选，揭示了唾液酸化作为独立于PD-1/PD-L1轴的免疫抑制途径 | SNI的跨平台迁移需要重新校准；候选化合物仅来自AI预测，尚需实验验证；独立测试队列中C-index仅为0.58-0.62，外部验证性能有限 | 构建头颈部鳞状细胞癌的唾液酸化预后模型并进行分子分型，同时利用AI引导筛选靶向唾液酸化途径的潜在治疗药物 | 头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）患者及其转录组数据 | 机器学习 | 头颈部鳞状细胞癌 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 机器学习算法组合（117种组合，包括生存分析模型）, SHAP分析 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 化合物数据 | TCGA-HNSC 501例，GSE42743 74例（含总生存数据），三个独立测试队列：E-MTAB-8588 83例、GSE65858 270例、GSE41613 97例；单细胞RNA测序168742个细胞；249455种化合物 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 转录组测序 | NA | NA |
| 1894 | 2026-09-29 |
Integrated Transcriptomic Analysis Identifies a Candidate INHBA/Activin A-Associated Macrophage-MuSC Communication Axis in Human Skeletal Muscle Ageing
2026-Sep-17, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27188283
PMID:42794710
|
研究论文 | 该研究整合批量RNA测序、单细胞RNA测序及独立老年队列分析，刻画人类骨骼肌衰老过程中免疫细胞与肌肉干细胞状态的变化，并识别出INHBA/Activin A相关的巨噬细胞-MuSC通讯轴 | 首次整合批量转录组与单细胞转录组数据，在人类骨骼肌衰老中识别出炎症性巨噬细胞通过INHBA/Activin A信号与早期预激活MuSC状态之间的候选通讯轴，并通过独立队列和体外实验加以验证 | 研究主要基于转录组关联分析和体外功能验证，缺乏体内因果实验证据；INHBA/Activin A通讯轴仅为候选信号，尚未在人类衰老肌肉中直接证实其功能作用 | 阐明人类骨骼肌衰老过程中年龄相关免疫变化与肌肉干细胞状态改变之间的关系，并识别潜在的巨噬细胞-MuSC信号交互 | 人类骨骼肌组织及原代人类肌肉干细胞 | 机器学习 | 老年疾病 | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | 配体-靶标建模 | 文本, 图像 | 批量RNA测序样本、单细胞RNA测序样本及一个独立老年成人队列，具体样本量未在摘要中说明 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1895 | 2026-09-29 |
Oncohistone inhibition reshapes tumor-microenvironment communication in Diffuse Midline Glioma (DMG)
2026-Sep-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.17.731637
PMID:42779592
|
研究论文 | 本文通过构建可诱导和可逆的H3K27M细胞和小鼠模型，研究oncohistone在已形成肿瘤中对肿瘤微环境通讯的调控作用及治疗潜力 | 首次建立可诱导和可逆的H3.3K27M和H3.1K27M细胞及小鼠模型，揭示H3K27M在已形成肿瘤中重塑肿瘤微环境、促进肿瘤-神经元耦合和免疫抑制的新机制 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究H3K27M oncohistone在已形成的弥漫性中线胶质瘤中对肿瘤微环境调控及治疗应答的作用 | 患者来源和小鼠来源的弥漫性中线胶质瘤细胞及小鼠模型 | 数字病理学 | 弥漫性中线胶质瘤 | 染色质可及性分析、单细胞RNA测序 | NA | 图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1896 | 2026-09-29 |
Single-Cell RNA Sequencing of Uterine Tissue from a 70-Day-Old Female Rabbit: Cellular Composition and Fibroblast-Associated Networks
2026-Sep-16, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17091131
PMID:42793025
|
研究论文 | 本研究对一只70日龄雌性康大V系兔的子宫体组织进行单细胞RNA测序，初步表征了细胞组成、转录特征及预测的细胞间通讯网络。 | 首次对兔子宫体组织进行单细胞水平的细胞组成和转录特征表征，结合CellChat和高维加权基因共表达网络分析预测成纤维细胞相关通讯网络及共表达模块。 | 仅基于单个样本，样本量有限，缺乏独立动物验证和功能实验验证，所有发现均为初步性和假设生成性质。 | 提供兔子宫组织在细胞水平上的初步参考，揭示细胞群体组成、转录特征及预测的细胞间通讯网络。 | 一只70日龄雌性康大V系兔的子宫体组织 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1只70日龄雌性康大V系兔的子宫体组织，经质控后保留9251个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1897 | 2026-09-29 |
Sex Steroid Hormone Signaling Tunes Metabolic and Neuronal Programs in Human Cortical Development
2026-Sep-15, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-10908944/v1
PMID:42780285
|
研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序分析了人类皮层发育过程中雄激素和雌激素受体的表达，并利用iNeurons和皮层类器官研究性激素对代谢和神经元程序的影响 | 首次在人类皮层发育中系统研究雄激素和雌激素受体介导的转录调控，发现性激素作为选择性、细胞状态依赖的调节因子而非广泛重编程基因组 | 转录调控变异对ASD的影响可能较小，性激素效应较为有限 | 探究性激素（雌激素和雄激素）在人类皮层发育中的转录调控作用及其与ASD性别差异的关联 | 人类原代皮层组织、发育阶段匹配的类器官模型、iNeurons | 单细胞生物学、神经发育生物学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1898 | 2026-09-29 |
Dynamic CD4+ T Cell Genetics Identifies Candidate Therapeutic Targets for Allergic Rhinitis: Mendelian Randomization with Exploratory Single-Cell Contextualization
2026-Sep-15, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines14092077
PMID:42792818
|
研究论文 | 该研究整合动态CD4+ T细胞eQTL数据与过敏性鼻炎GWAS数据，通过孟德尔随机化、共定位和单细胞RNA测序分析，优先筛选过敏性鼻炎的候选治疗靶点 | 首次将动态CD4+ T细胞激活状态eQTL数据与过敏性鼻炎GWAS整合进行孟德尔随机化分析，并结合单细胞RNA测序和TCR分析进行探索性验证，同时采用结构导向筛选优先考虑未经证实的结合剂候选物 | 患者层面重新分析未发现通过多重检验校正的基因对，代谢物筛选信号未与疾病位点共定位，研究结果具有假设生成性质，需要进一步验证 | 识别过敏性鼻炎的候选治疗靶点 | 过敏性鼻炎患者及动态CD4+ T细胞 | 机器学习 | 过敏性鼻炎 | eQTL分析, GWAS, 孟德尔随机化, 共定位分析, SMR/HEIDI, 代谢物筛选, 单细胞RNA-seq, TCR分析, 分子对接, 分子动力学模拟 | NA | 基因表达数据, 遗传变异数据, 单细胞转录组数据, 文本 | 50,654个基因-谱系对；GSE200107数据集；4 vs. 3患者层面样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1899 | 2026-09-29 |
Identification of Novel Transcriptional Alleles in Primary Prostate Cancer Cells and Cancer Stem Cells by Bulk RNA-Seq and Single-Cell RNA-Seq Analyses
2026-Sep-15, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom16091341
PMID:42793173
|
研究论文 | 该研究通过bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq分析原代人前列腺癌细胞及其配对良性上皮细胞，鉴定癌症相关转录等位基因，揭示前列腺癌和癌症干细胞中的转录等位基因异质性 | 首次系统性地描绘了前列腺癌和癌症干细胞中RNA衍生的转录等位基因图谱，发现了223个癌症相关转录等位基因基因，并鉴定了ATF6和KDM3A为潜在功能候选基因，同时揭示了CSC与非CSC群体在转录等位基因数量和分布上的差异 | 研究主要基于转录等位基因的计算预测，缺乏功能性验证实验来确认这些等位基因的生物学功能；样本量有限，仅涉及三名独立患者；单细胞RNA-seq检测转录等位基因的灵敏度可能受限 | 表征前列腺癌和癌症干细胞中的癌症相关转录等位基因，探索转录等位基因异质性与前列腺癌发展的关系 | 原代人前列腺癌细胞及同一患者非癌区域的配对良性上皮细胞，包括CSC和非CSC细胞群体，2D培养和3D球体培养条件 | digital pathology | prostate cancer | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | RNA-seq数据/文本 | 3名独立患者的前列腺癌和配对良性上皮细胞样本，包含2D培养和3D球体培养的CSC和非CSC群体 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1900 | 2026-09-29 |
REDD1 Silencing Aggravates Aortic Dissection and Promotes VSMC Apoptosis with Autophagy-Related Changes
2026-Sep-14, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines14092061
PMID:42792802
|
研究论文 | 本研究探讨了REDD1在主动脉夹层（AD）中对血管平滑肌细胞（VSMC）凋亡和自噬的调控作用，发现REDD1具有保护性代偿作用，其缺失会加重AD | 首次揭示了REDD1在主动脉夹层中通过维持线粒体膜电位和抑制VSMC凋亡发挥保护性代偿作用，并提出靶向REDD1可能成为AD的潜在治疗策略 | 研究主要基于动物模型和细胞实验，缺乏大规模临床样本验证；自噬相关标志物的静态变化未能完全阐明自噬通量的动态变化 | 探究REDD1在主动脉夹层发病机制中对血管平滑肌细胞凋亡和自噬的调控作用及其分子机制 | 人主动脉夹层组织、C57BL/6J小鼠、培养的血管平滑肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、Western blotting、免疫荧光、流式细胞术、JC-1染色、组织病理学染色 | NA | 图像、文本、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |