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当前共找到 35765 篇文献，本页显示第 1861 - 1880 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1861 | 2026-01-03 |
Multi-omics analysis reveals shared diagnostic and therapeutic targets in endometriosis and recurrent implantation failure
2025-Dec-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-28877-8
PMID:41462508
|
研究论文 | 本研究通过多组学数据分析，揭示了子宫内膜异位症和反复种植失败在影响子宫内膜容受性方面的共享分子机制 | 首次利用多组学数据结合加权基因共表达网络分析，识别出子宫内膜异位症和反复种植失败共有的15个枢纽基因，并验证了其高诊断准确性 | 研究依赖于公共数据库的数据，可能受限于样本异质性和批次效应，且需要进一步的体内外实验验证 | 阐明影响子宫内膜容受性在子宫内膜异位症和反复种植失败中的共享分子机制 | 子宫内膜异位症和反复种植失败相关的基因表达数据 | 生物信息学 | 子宫内膜异位症 | 多组学数据分析，加权基因共表达网络分析，单细胞测序，免疫荧光 | 加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 1862 | 2026-01-03 |
Centromere Protein I, a Cell Cycle Checkpoint Gene, Accelerates Tumor Progression via the Hippo Pathway and Mediates Immune Escape in Hepatocellular Carcinoma
2025-Dec-28, Journal of clinical and translational hepatology
IF:3.1Q2
DOI:10.14218/JCTH.2025.00127
PMID:41473255
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研究论文 | 本研究探讨了细胞周期检查点相关基因在肝细胞癌中的预后意义，并揭示了CENPI通过Hippo通路促进肿瘤进展及免疫逃逸的机制 | 首次将CENPI鉴定为肝细胞癌的关键枢纽基因，阐明其通过抑制YAP磷酸化增强核转位驱动恶性进展，并揭示其通过破坏肿瘤抗原呈递和趋化因子介导的CD8+ T细胞趋化作用促进免疫逃逸的新机制 | 研究主要基于公共数据库和体外实验，临床样本验证和体内机制深度探索有待加强，免疫逃逸机制的具体信号通路细节需进一步阐明 | 探索细胞周期检查点相关基因在肝细胞癌中的预后价值及其促进肿瘤进展的分子机制 | 肝细胞癌患者数据集、HCC细胞系、动物模型及患者来源的HCC组织标本 | 肿瘤生物学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、免疫组织化学、体外功能实验、动物实验 | 预后模型（Kaplan-Meier、nomogram、决策曲线分析、ROC分析） | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、临床病理数据 | 来自TCGA和ICGC的HCC数据集、GSE149614单细胞RNA测序数据、患者来源的HCC标本及细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1863 | 2026-01-03 |
PDK4 Regulates Inflammatory Injury in Acute-on-chronic Liver Failure by Phosphorylating STAT1-mediated M1 Polarization of Macrophages
2025-Dec-28, Journal of clinical and translational hepatology
IF:3.1Q2
DOI:10.14218/JCTH.2025.00343
PMID:41473257
|
研究论文 | 本研究探讨了丙酮酸脱氢酶激酶4（PDK4）在慢加急性肝衰竭（ACLF）中通过磷酸化STAT1介导巨噬细胞M1极化来调节炎症损伤的作用机制 | 首次揭示了PDK4在ACLF中作为关键促炎调节因子，通过激活STAT1信号通路促进巨噬细胞M1极化的新机制 | 研究主要基于体外实验和动物模型，临床验证尚不充分，且PDK4抑制剂的具体临床应用潜力需进一步评估 | 探究PDK4在ACLF中的作用机制，以寻找调节巨噬细胞功能、缓解ACLF进展的治疗靶点 | 健康与ACLF肝组织、ACLF患者外周血单个核细胞、LO2肝细胞、ACLF小鼠模型 | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞RNA测序、转录组学分析、体外实验、体内验证 | NA | RNA测序数据、转录组数据 | 来自数据库的单细胞RNA测序数据、ACLF患者外周血单个核细胞转录组数据（GSE168048）、体外细胞实验、ACLF小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1864 | 2026-01-03 |
Single-cell analysis identifies inflammatory and tissue remodeling tumor-associated macrophages distinct from M1/M2 paradigm
2025-Dec-26, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiaf176
PMID:41347255
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研究论文 | 本文通过整合分析公开的单细胞RNA测序数据，识别了乳腺癌中七种与M1/M2范式不同的肿瘤相关巨噬细胞亚群，揭示了其功能异质性 | 首次在单细胞水平上系统识别了乳腺癌中七种转录特征不同的肿瘤相关巨噬细胞亚群，这些亚群不遵循传统的M1/M2极化分类，并发现了与组织修复和干扰素反应相关的独特功能特征 | 研究主要基于公开数据集进行生物信息学分析，实验验证部分仅在小规模墨西哥患者队列中进行初步验证，样本代表性可能有限 | 深入表征乳腺癌中肿瘤相关巨噬细胞的异质性，探索其功能亚群与患者预后的关系 | 乳腺癌患者及健康个体的血液、肿瘤和非肿瘤乳腺组织中的单细胞RNA测序数据 | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 生物信息学整合分析 | 单细胞转录组数据 | 来自公共数据库的多个乳腺癌患者和健康个体样本，具体数量未明确说明，但包含血液、肿瘤及非肿瘤组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1865 | 2026-01-03 |
Endoplasmic reticulum stress exacerbates ischemia-reperfusion-induced pulmonary endothelial barrier dysfunction by activating TXNDC5
2025-Dec-26, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.12.039
PMID:41456650
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研究论文 | 本研究探讨了内质网应激通过激活TXNDC5加剧肺缺血再灌注损伤中肺内皮屏障功能障碍的机制 | 首次揭示了内质网应激通过ATF6-TXNDC5轴调控肺内皮屏障功能，并构建了基于TXNDC5的LIRI早期预警模型 | 研究主要基于动物和细胞模型，临床验证样本量有限，需进一步多中心验证 | 探究TXNDC5在肺缺血再灌注损伤诱导的肺内皮屏障破坏中的作用及其机制与治疗潜力 | 大鼠肺缺血再灌注损伤模型、人脐静脉内皮细胞、LIRI患者血浆样本 | 基础医学研究 | 肺缺血再灌注损伤 | 单细胞RNA测序、ChIP-seq、血浆蛋白质组学、AAV-shRNA敲低 | NA | 基因表达数据、蛋白质组数据、临床数据 | 动物模型、细胞模型及LIRI患者血浆样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序、蛋白质组学 | NA | NA |
| 1866 | 2026-01-03 |
Copper-linked metabolic stress as a potential contributor to gastric epithelial transformation and metastasis
2025-Dec-26, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000046590
PMID:41465895
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA-seq数据和孟德尔随机化分析，探讨了铜相关代谢应激在胃上皮细胞转化和转移中的潜在作用 | 首次在单细胞水平识别了胃上皮从正常到恶性的过渡表型，并结合遗传学证据（孟德尔随机化）系统性地将循环铜水平与胃肿瘤风险联系起来 | 研究结果虽支持铜的因果作用假说，但并非确证；需要正交组织验证、铜处理/铜死亡通路的功能扰动实验以及扩展的遗传分析（如多变量/共定位分析）来进一步证实 | 阐明胃上皮从正常到恶性转化及转移过程中的分子事件，特别关注铜相关代谢应激的作用 | 胃组织（来自公共数据库）、循环铜水平（遗传代理变量）、良性胃肿瘤和胃癌（GWAS数据） | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA-seq, 孟德尔随机化 | 基于典型相关分析的批次校正, 伪时间推断（Monocle; 自然样条模型）, 通路活性评分（GSVA/GSEA） | 基因表达数据（单细胞RNA-seq）, 遗传关联数据（GWAS） | 两个公共单细胞RNA-seq数据集（来源：GEO数据库），以及来自FinnGen和GWAS Catalog的汇总统计数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1867 | 2026-01-03 |
TLR2, CCR1, IRF8, and CCL4 as biomarkers for atherosclerosis progression and therapy response: A multi-omics study
2025-Dec-26, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000046647
PMID:41465914
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析识别出TLR2、CCR1、IRF8和CCL4作为动脉粥样硬化进展和治疗反应的新型生物标志物 | 结合WGCNA、机器学习、单细胞RNA-seq和分子对接，首次系统鉴定出与免疫通路相关的四个关键生物标志物，并构建了用于风险预测的列线图模型 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，缺乏前瞻性临床队列验证，且分子对接结果需实验验证 | 寻找动脉粥样硬化的新型诊断标志物和靶向治疗策略 | 动脉粥样硬化相关基因表达数据和单细胞数据 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA-seq，分子对接 | LASSO，随机森林，人工神经网络 | 基因表达数据，单细胞数据 | 基于GSE28829和GSE159677数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1868 | 2026-01-03 |
Single-cell atlas of COVID-19 based on multiple sample integration
2025-Dec-26, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000046038
PMID:41465968
|
研究论文 | 本研究通过整合多个样本的单细胞RNA测序数据，构建了COVID-19的单细胞图谱，并开发了预测重症患者预后的逻辑回归模型 | 整合了来自COVID-19患者、流感患者和健康对照的八个数据集，构建了包含434,703个细胞的综合单细胞图谱，并识别了与疾病严重程度和预后相关的关键基因和通路变化 | 模型在训练集和测试集中的AUC约为70.6%，预测性能有提升空间，且样本来源和数据集间的异质性可能影响结果的普适性 | 理解COVID-19的免疫景观并预测重症患者的预后 | COVID-19患者、流感患者和健康对照的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | 逻辑回归模型 | 单细胞RNA测序数据 | 434,703个细胞，来自233个样本，涵盖8个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1869 | 2026-01-03 |
Exploring the potential mechanisms of OSBPL3 in metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease by integrating bulk and single-cell RNA sequencing data
2025-Dec-26, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000046273
PMID:41466006
|
研究论文 | 本研究通过整合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据，探索了OSBPL3在代谢功能障碍相关脂肪性肝病（MASLD）中的潜在免疫机制 | 首次结合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据系统研究OSBPL3在MASLD中的免疫机制，并通过细胞通讯和拟时序分析揭示了巨噬细胞和单核细胞的关键作用 | 研究基于公共数据库的回顾性数据，缺乏实验验证；样本来源和数量可能受限 | 阐明OSBPL3在MASLD发病中的免疫学机制，为靶向治疗提供见解 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病（MASLD）患者样本数据 | 生物信息学 | 脂肪肝 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | GSEA, 细胞通讯分析, 拟时序分析 | 基因表达数据 | 来自GSE57425和GSE129516等公共数据集的样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1870 | 2026-01-03 |
Cell Surface Ion-Seq: Potassium Ion Monitoring in the Colorectal Cancer Cellular Microenvironment Based on Split G‑quadruplex Probe
2025-Dec-24, ACS central science
IF:12.7Q1
DOI:10.1021/acscentsci.5c01472
PMID:41473793
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于分裂G-四链体探针的细胞表面离子测序方法，用于在单细胞分辨率下监测结直肠癌微环境中的钾离子动态 | 首次将分裂G-四链体探针与单细胞测序技术结合，实现了对亚纳米级钾离子的单细胞水平监测，突破了传统抗体检测的技术限制 | 技术目前仅针对钾离子进行验证，在其他离子监测中的应用潜力尚需进一步探索，且临床样本的广泛适用性有待更多研究证实 | 开发一种新型单细胞离子监测技术，以研究结直肠癌微环境中钾离子稳态与细胞表型的关系 | 结直肠癌细胞及其微环境中的钾离子 | 单细胞分析 | 结直肠癌 | 分裂G-四链体探针技术，单细胞离子测序 | NA | DNA测序数据 | 临床样本（具体数量未说明） | NA | 单细胞离子测序 | NA | 基于分裂G-四链体探针的细胞表面生物传感器 |
| 1871 | 2026-01-03 |
A single-cell transcriptomic atlas of peripheral blood immune cells spanning progressive canine leishmaniosis
2025-Dec-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.18.695149
PMID:41446132
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了犬利什曼病外周血免疫细胞的转录组图谱，揭示了疾病进展中的免疫细胞组成和基因表达变化 | 首次创建了犬利什曼病外周血免疫细胞的单细胞转录组图谱，追踪了疾病进展中免疫细胞表型和转录状态的动态变化 | 研究基于自然感染犬只，可能受个体差异影响；未涉及组织特异性免疫反应 | 阐明犬利什曼病免疫病理机制及疾病阶段转换的免疫基础 | 对照犬和自然感染犬利什曼病的外周血免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 犬利什曼病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 对照犬和自然感染犬的外周血样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1872 | 2026-01-03 |
VEGF/ERK activation and PI3K inhibition together drive a vein-to-artery transition in an in vitro model of human angiogenesis
2025-Dec-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.17.694993
PMID:41446158
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研究论文 | 本研究开发了一种人类多能干细胞分化协议，模拟静脉到动脉的内皮细胞转换过程 | 首次建立人类模型来研究静脉到动脉的转换，并揭示了VEGF激活与PI3K抑制联合足以在48小时内诱导静脉内皮细胞获得动脉特性 | 基于体外模型，可能无法完全模拟体内复杂的生理环境 | 研究血管发育中的静脉到动脉转换机制，以改善血管再生疗法 | 人类多能干细胞分化的内皮细胞 | 细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1873 | 2026-01-03 |
Machine Learning Models for Cancer Research: A Narrative Review of Bulk RNA-Seq Applications
2025-Dec-16, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262412081
PMID:41465507
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综述 | 本文是一篇关于机器学习模型在癌症研究中应用的叙述性综述，重点介绍了基于Bulk RNA-Seq数据的完整工作流程 | 提供了从数据预处理到模型验证的完整工作流程，并讨论了Bulk RNA-Seq反卷积作为单细胞RNA-Seq分析肿瘤细胞组成的成本效益替代方案 | 作为一篇叙述性综述，未涉及原始实验数据或新模型的开发，主要基于现有文献进行总结 | 为开发具有转化潜力的可重复诊断和预后模型提供实用指南 | 癌症研究中的机器学习模型，特别是基于Bulk RNA-Seq数据的应用 | 机器学习 | 癌症 | Bulk RNA-seq | NA | RNA-Seq数据 | NA | NA | bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1874 | 2026-01-03 |
Pair-rule-like transcription patterns during neural tube closure in a proto-vertebrate
2025-Dec-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.205064
PMID:41217384
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研究论文 | 本研究在尾索动物海鞘中，揭示了Lmx1、Cdkn1b和Msx基因构成的转录调控网络如何通过类似体节成对规则的表达模式，协调神经管闭合过程中的细胞增殖与融合 | 首次在脊椎动物近缘原索动物中发现神经管闭合过程存在类似体节发育的“成对规则样”转录模式，并解析了Lmx1/Cdkn1b转录开关调控上皮重塑的新机制 | 研究聚焦于海鞘这一模型，其在脊椎动物中的保守性仍需进一步验证；功能实验主要依赖过表达，缺乏条件性敲除等更精细的调控手段 | 探究神经管闭合过程中协调形态发生与细胞行为的转录调控程序 | 海鞘（Ciona）胚胎的神经管闭合过程 | 发育生物学 | NA | 高分辨率HCR原位杂交、单细胞RNA测序、基因过表达实验 | NA | 基因表达空间数据、单细胞转录组数据 | 未明确说明具体胚胎数量，但涉及单细胞RNA-seq数据集分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1875 | 2026-01-03 |
FastCCC: a permutation-free framework for scalable, robust, and reference-based cell-cell communication analysis in single cell transcriptomics studies
2025-Dec-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-66272-z
PMID:41390348
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研究论文 | 本文介绍了FastCCC，一种无需排列的框架，用于在单细胞转录组学研究中实现可扩展、稳健且基于参考的细胞间通讯分析 | FastCCC采用基于快速傅里叶变换的卷积来解析计算p值，无需排列，引入模块化代数操作框架以捕获广泛的CCC模式，并能利用图谱级单细胞参考来增强用户收集数据集的CCC分析 | NA | 开发一个可扩展、稳健且基于参考的细胞间通讯分析框架，以识别关键CCC并揭示生物学见解 | 单细胞转录组学数据中的细胞间通讯 | 单细胞转录组学 | COVID-19 | 单细胞RNA-seq | 快速傅里叶变换卷积 | 单细胞转录组数据 | 约1600万个细胞，涵盖19种不同组织类型和超过450种独特细胞类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1876 | 2026-01-03 |
BGN Secreted by Cancer-Associated Fibroblasts Promotes Esophageal Squamous Cell Carcinoma Progression via Activation of TLR4-Mediated Erk and NF-κB Signaling Pathways
2025-Dec-13, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262412024
PMID:41465449
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研究论文 | 本研究揭示了癌症相关成纤维细胞分泌的BGN通过激活TLR4介导的Erk和NF-κB信号通路促进食管鳞状细胞癌进展 | 首次在食管鳞状细胞癌中系统阐明了CAF分泌的BGN通过TLR4信号通路促进肿瘤进展及调控肿瘤微环境细胞行为的机制 | 研究主要基于体外共培养模型和临床样本分析，缺乏体内动物模型的直接验证 | 探究癌症相关成纤维细胞在食管鳞状细胞癌进展中的具体作用机制 | 食管鳞状细胞癌细胞系、间充质干细胞、临床食管鳞状细胞癌组织样本 | 肿瘤生物学 | 食管鳞状细胞癌 | cDNA微阵列分析、单细胞RNA测序、免疫组织化学 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、临床病理数据 | 66例食管鳞状细胞癌组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1877 | 2026-01-03 |
Discovering Candidate Anti-Aging Perturbations Using a Foundation Model for Gene Expression
2025-Dec-12, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262411977
PMID:41465404
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研究论文 | 本研究利用scGPT基础模型分析人类单细胞RNA-seq数据，以识别影响衰老预测的基因扰动，并发现潜在的抗衰老候选基因 | 通过微调scGPT大型转录组模型来预测年龄组，并系统性地进行基因扰动分析以分类促衰老或抗衰老候选基因 | 研究依赖于计算模拟的基因扰动，未进行实验验证，且模型可能受限于训练数据的多样性和复杂性 | 识别影响衰老过程的基因扰动，并探索潜在的抗衰老干预靶点 | 人类单细胞RNA-seq数据，特别是来自多组织AgeAnno数据集的数据 | 自然语言处理 | 老年疾病 | 单细胞RNA-seq | scGPT | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1878 | 2026-01-03 |
DOCK10 Regulates Insulin Hypersecretion in Insulinoma and Serves as a Diagnostic and Therapeutic Target
2025-Dec-11, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101705
PMID:41389876
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研究论文 | 本研究揭示了DOCK10在胰岛素瘤中调控胰岛素过度分泌的作用，并探讨其作为诊断标志物和治疗靶点的潜力 | 首次发现DOCK10在胰岛素瘤胰岛素分泌成分中特异性过表达，并揭示了DOCK10-Cdc42轴在调控胰岛素分泌中的新机制 | 研究基于胰岛素瘤样本和模型，结果在更广泛胰腺神经内分泌肿瘤中的适用性需进一步验证 | 识别胰岛素瘤中胰岛素过度分泌的分子机制，以开发改进的诊断工具和治疗策略 | 人类胰岛素瘤手术标本、匹配的类器官、MIN6细胞和小鼠异种移植模型 | 分子生物学 | 胰岛素瘤 | bulk RNA测序、单细胞RNA测序、定量PCR、免疫组化 | NA | 转录组数据、基因表达数据、组织图像 | 人类胰岛素瘤手术标本及匹配类器官组成的生物库 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1879 | 2026-01-03 |
The circadian clock regulates scavenging of fluid-borne substrates by brain border-associated macrophages
2025-Dec-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.08.693074
PMID:41427288
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了脑边界相关巨噬细胞（BAMs）在昼夜周期中的节律性，并发现其在休息阶段通过上调内吞基因增强对细胞外液源性物质（如淀粉样蛋白β）的清除功能 | 首次发现脑边界相关巨噬细胞具有昼夜节律性，并阐明其通过时钟基因调控内吞受体CD206介导的清除功能，这为理解昼夜节律紊乱如何加剧淀粉样病变提供了新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类相关性尚需验证；且未全面探讨其他脑免疫细胞在昼夜节律中的角色 | 探究昼夜节律如何调控脑免疫系统功能，特别是脑边界相关巨噬细胞在清除淀粉样蛋白β中的作用 | 小鼠脑免疫细胞，重点关注脑边界相关巨噬细胞（BAMs） | 单细胞组学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 未明确指定样本数量，但涉及昼夜周期多个时间点的脑免疫细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1880 | 2026-01-03 |
Single-Cell and Bulk RNA Sequencing Reveal SPINK1 and TIMP1 as Epithelial Cell Marker Genes Linked to Colorectal Cancer Survival and Tumor Immune Microenvironment Profiles
2025-Dec-11, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262411964
PMID:41465391
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研究论文 | 本研究通过单细胞和bulk RNA测序，鉴定出SPINK1和TIMP1作为与结直肠癌生存及肿瘤免疫微环境相关的上皮细胞标志基因 | 整合单细胞RNA测序与bulk RNA测序数据，识别出两个新的上皮细胞标志基因（SPINK1和TIMP1）作为结直肠癌的独立生存预测因子，并揭示了其与特定免疫细胞浸润模式的关联 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，需要前瞻性临床队列进一步验证；单细胞数据样本量（23,176个细胞）相对有限 | 识别与结直肠癌生存相关的上皮细胞标志基因，并评估其预后价值及与肿瘤免疫微环境的关系 | 结直肠癌患者 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | LASSO回归, Cox比例风险模型 | 基因表达数据 | 单细胞数据：23,176个细胞；TCGA-COAD队列：375例；验证队列GSE39582：585例；GSE17536：177例 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |