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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1841 | 2026-03-02 |
A distinct GM-CSF+ T helper cell subset requires T-bet to adopt a TH1 phenotype and promote neuroinflammation
2020-Oct-23, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.aba9953
PMID:33097590
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和高维单细胞质谱流式技术,识别了一种独特的GM-CSF+ T辅助细胞亚群(TGM),并探讨其在神经炎症中的作用 | 首次系统性地识别并表征了GM-CSF+ TGM细胞亚群,揭示了其缺乏经典T细胞谱系标志,但能在IL-12刺激下向TH1表型转化并促进神经炎症 | 研究主要基于小鼠模型和健康人血液样本,在人类自身免疫疾病中的直接验证尚需进一步研究 | 探究GM-CSF+ T辅助细胞的身份、特性及其在自身免疫神经炎症中的致病机制 | 健康人血液中的抗原经验性CD45RA- CD4+ T细胞,以及实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)小鼠模型中的外周和中枢神经系统细胞 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序,高维单细胞质谱流式 | NA | 单细胞转录组数据,质谱流式数据 | 健康人血液样本及EAE小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1842 | 2026-03-02 |
Cortical Foxp2 Supports Behavioral Flexibility and Developmental Dopamine D1 Receptor Expression
2020-03-14, Cerebral cortex (New York, N.Y. : 1991)
DOI:10.1093/cercor/bhz209
PMID:31711176
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研究论文 | 本研究通过分析皮层特异性Foxp2条件性敲除小鼠,揭示了Foxp2在行为灵活性及皮层多巴胺D1受体表达发育中的作用 | 首次在皮层特异性Foxp2敲除模型中系统评估行为灵活性缺陷,并结合单细胞转录组学揭示D1R表达细胞类型的组成和基因表达变化,包括非细胞自主性改变 | 研究主要基于小鼠模型,人类FOXP2相关疾病的直接转化应用需进一步验证;行为测试可能未覆盖所有相关神经发育表型 | 探究Foxp2在皮层发育中的分子和行为功能,及其与神经发育障碍的相关性 | 皮层特异性Foxp2条件性敲除小鼠 | 神经科学 | 神经发育障碍 | 单细胞转录组学 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、行为数据 | 未明确样本数量的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1843 | 2026-03-02 |
SAME-clustering: Single-cell Aggregated Clustering via Mixture Model Ensemble
2020-01-10, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkz959
PMID:31777938
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研究论文 | 本文提出了一种名为SAME-clustering的集成聚类方法,通过混合模型整合多种单细胞RNA测序数据的聚类结果,以提高聚类准确性 | SAME-clustering采用混合模型集成策略,从多种聚类方法中选择最大多样性的子集,生成改进的集成聚类解决方案,这在单细胞RNA测序数据分析中是一种创新方法 | 论文未明确讨论该方法在极端大规模数据集或高度噪声数据下的性能限制,也未涉及计算效率的详细评估 | 开发一种集成聚类方法,以解决单细胞RNA测序数据聚类中不同方法结果不一致的问题,提高聚类结果的准确性和鲁棒性 | 单细胞RNA测序数据,涉及从49到32,695个单细胞,涵盖3到15个不同的细胞类型或簇 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 混合模型 | 单细胞RNA测序数据 | 15个数据集,单细胞数量从49到32,695个 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1844 | 2026-03-02 |
Fast, sensitive and accurate integration of single-cell data with Harmony
2019-12, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-019-0619-0
PMID:31740819
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Harmony的算法,用于高效、敏感且准确地整合单细胞RNA-seq数据,以解决不同数据集间的技术和生物差异问题 | Harmony算法能够将细胞投影到共享嵌入空间中,使细胞按细胞类型而非数据集特定条件分组,同时考虑多个实验和生物因素,在计算资源需求较低的情况下实现高性能整合 | NA | 开发一种算法以整合多样化的单细胞RNA-seq数据集,实现跨技术和条件的细胞类型转录特征分析 | 单细胞RNA-seq数据集,包括外周血单个核细胞、胰岛细胞、小鼠胚胎发育数据以及空间转录组学数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq | Harmony算法 | 单细胞RNA-seq数据 | 约10^6个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1845 | 2026-03-02 |
Single-Cell Profiling of Cutaneous T-Cell Lymphoma Reveals Underlying Heterogeneity Associated with Disease Progression
2019-05-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-18-3309
PMID:30718356
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和机器学习方法,揭示了皮肤T细胞淋巴瘤(特别是Sézary综合征)的转录组异质性,并开发了预测疾病阶段的基因特征模型 | 首次在Sézary综合征中应用单细胞RNA测序结合Monocle包的机器学习逆向图嵌入方法,定义了不同的转录组状态,并识别了FOXP3+恶性T细胞在克隆进化中的关键作用 | 研究样本量有限,且主要聚焦于Sézary综合征,可能无法完全代表所有CTCL亚型 | 探究皮肤T细胞淋巴瘤(CTCL)的疾病进展机制,并开发预测疾病阶段的分类模型 | 皮肤T细胞淋巴瘤(CTCL)患者,特别是Sézary综合征的恶性T细胞 | 单细胞组学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序,机器学习逆向图嵌入 | 增强树分类模型 | 单细胞RNA测序数据 | 未明确指定样本数量,但涉及CTCL患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1846 | 2026-03-02 |
Single-cell RNA-seq analysis identifies markers of resistance to targeted BRAF inhibitors in melanoma cell populations
2018-09, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.234062.117
PMID:30061114
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SAKE的单细胞RNA-seq分析方法,用于识别黑色素瘤细胞对BRAF抑制剂耐药性的标记物 | 开发了SAKE方法,提供分析流程各步骤的定量统计指标,并在大型复杂细胞群体中优于其他方法 | 未明确说明方法在小型或简单群体中的性能比较,可能受限于特定平台数据 | 识别黑色素瘤细胞对靶向BRAF抑制剂的耐药性标记物 | 人类黑色素瘤细胞 | 单细胞分析 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA-seq | SAKE算法 | 单细胞RNA-seq数据 | 未明确指定样本数量,涉及多个细胞群体 | Fluidigm, 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | Fluidigm C1, 10x Genomics平台 | Fluidigm C1和10x Genomics单细胞RNA-seq平台 |
| 1847 | 2026-03-02 |
Distinct Mesenchymal Lineages and Niches Promote Epithelial Self-Renewal and Myofibrogenesis in the Lung
2017-Sep-07, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2017.07.034
PMID:28886382
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和信号谱系报告系统,绘制了肺间充质细胞的空间和转录图谱,揭示了不同间充质谱系在肺泡上皮细胞自我更新和损伤后肌成纤维细胞生成中的独特功能 | 首次系统性地绘制了肺间充质细胞的空间和转录图谱,并明确了Wnt响应性间充质肺泡生态位细胞和Axin2+肌源性祖细胞在稳态维持与损伤修复中的不同功能 | NA | 阐明肺间充质细胞的空间分布、转录特征及其在肺泡上皮细胞自我更新和损伤修复中的调控功能 | 小鼠肺组织中的间充质细胞谱系 | 单细胞组学 | 肺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1848 | 2026-03-01 |
Single-cell transcriptomics and metabolomics demonstrate that Taohe Chengqi decoction alleviates sepsis-associated acute lung injury by modulating immunometabolism
2026-May-10, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2026.121283
PMID:41619860
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和代谢组学分析,探讨了桃核承气汤通过调节免疫代谢缓解脓毒症相关急性肺损伤的机制 | 整合单细胞转录组学和非靶向代谢组学,首次揭示了桃核承气汤通过抑制糖酵解改善肺泡-毛细血管屏障和免疫微环境的机制 | 研究基于一批桃核承气汤样本,需进一步验证多批次样本的一致性和可重复性 | 探索桃核承气汤治疗脓毒症相关急性肺损伤的潜在免疫代谢机制 | LPS诱导的SA-ALI小鼠模型 | 数字病理学 | 脓毒症相关急性肺损伤 | 单细胞转录组学, 非靶向代谢组学, Western blotting, RT-PCR, ELISA, 流式细胞术 | NA | 转录组数据, 代谢组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 代谢组学 | NA | NA |
| 1849 | 2026-03-01 |
Supplementation with Lycium barbarum glycopeptide (LbGP) rescues the quality of aged oocytes
2026-May-10, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2026.121318
PMID:41651042
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研究论文 | 本研究探讨了枸杞糖肽(LbGP)对老年小鼠卵巢功能和卵母细胞质量的恢复作用及其机制 | 首次全面揭示了LbGP通过激活PPAR信号通路恢复老年卵母细胞线粒体功能,并通过单细胞RNA测序系统重塑卵巢微环境 | 研究仅基于小鼠模型,其结论在人类中的适用性有待进一步验证 | 研究LbGP对生殖衰老的对抗作用及改善卵母细胞质量的机制 | 老年雌性小鼠的卵巢组织和卵母细胞 | 生殖医学 | 生殖衰老 | 组织学分析、体外受精(IVF)、早期胚胎培养、活细胞成像、蛋白质组学分析、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 图像、文本(测序数据) | 老年雌性小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1850 | 2026-03-01 |
Inhibition of the p38/JNK MAPK pathway mediated by circadian rhythm genes: Study of the mechanism of Linggan Wuwei Jiangxin decoction in the treatment of COPD
2026-May-10, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2026.121349
PMID:41672117
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研究论文 | 本研究探讨了苓甘五味姜辛汤通过调节昼夜节律基因抑制p38/JNK MAPK通路治疗慢性阻塞性肺疾病的机制 | 首次整合代谢组学、转录组学、单细胞RNA测序及机器学习算法,揭示了苓甘五味姜辛汤通过昼夜节律基因Bmal1和Per2调控p38/JNK MAPK通路的新机制 | 研究主要基于大鼠模型和细胞实验,尚未在人体临床试验中验证,且机制探索可能未涵盖所有潜在通路 | 阐明苓甘五味姜辛汤预防和治疗慢性阻塞性肺疾病的作用机制 | 慢性阻塞性肺疾病大鼠模型及BEAS-2B细胞系 | 生物信息学 | 慢性阻塞性肺疾病 | UPLC-MS/MS, 代谢组学, 转录组学, 单细胞RNA测序, WGCNA, 机器学习算法, 分子对接, 分子动力学模拟 | 机器学习算法(未指定具体模型), WGCNA | 组学数据, 图像, 文本 | 慢性阻塞性肺疾病大鼠模型及BEAS-2B细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 代谢组学, 转录组学 | NA | NA |
| 1851 | 2026-03-01 |
Clusterin Drives Fiber Endocytosis by Mesothelial Cells to Resolve Liver Fibrosis
2026-Mar, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2025.08.022
PMID:41369634
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研究论文 | 本研究揭示了簇集蛋白(CLU)通过其受体LRP2驱动间皮细胞纤维内吞以缓解肝纤维化的新机制,并设计了一种模拟CLU的肽段CLUtide,展示了其治疗潜力 | 首次发现CLU通过LRP2受体特异性作用于肝脏间皮细胞(而非肝星状细胞),诱导其增殖、迁移并内吞纤维,从而缓解肝纤维化,并设计了具有治疗潜力的模拟肽CLUtide | 研究主要在动物模型中进行,CLUtide在人体中的安全性和有效性仍需进一步验证 | 探究CLU在肝纤维化中的作用机制及治疗潜力 | 肝纤维化患者及小鼠模型、CLU敲除小鼠、间皮细胞特异性LRP2敲除小鼠 | NA | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、基因敲除、肽段设计 | NA | 基因表达数据、图像数据 | 患者及小鼠样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1852 | 2026-03-01 |
Endothelin-1/endothelin B receptor signalling mediates Prx1+ skeletal stem cells senescence: A driver of osteoporotic bone loss
2026-Mar, Journal of orthopaedic translation
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.jot.2026.101048
PMID:41757294
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研究论文 | 本研究揭示了内皮素-1/内皮素B受体信号轴通过诱导Prx1+骨骼干细胞衰老,从而驱动骨质疏松性骨丢失的机制 | 首次将血管内皮素-1信号与骨骼干细胞衰老及骨质疏松联系起来,并确定了ETBR是关键的介导受体,为骨质疏松治疗提供了新的靶点 | 研究主要基于小鼠模型,其在人类中的直接相关性仍需进一步验证;长期ETBR抑制的安全性和副作用有待评估 | 探究内皮素-1信号是否驱动骨骼干细胞衰老及其在骨质疏松发生中的作用机制 | 骨骼干细胞、间充质干细胞、衰老和卵巢切除小鼠模型、转基因小鼠模型 | 干细胞生物学与骨代谢研究 | 骨质疏松 | 单细胞RNA测序、转录组分析、基因敲除、药理学抑制 | 小鼠疾病模型(衰老、OVX)、转基因小鼠模型(TET-1, Prx1-Cre;ETBR fl/fl) | 单细胞RNA测序数据、转录组数据、表型数据 | 涉及人类单细胞RNA测序数据集及多种小鼠模型,具体样本数量未在摘要中明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1853 | 2026-03-01 |
Dual Role of PSMB9 Linking Immune Activation and Tumor Adaptation in Hepatocellular Carcinoma With Therapeutic and Prognostic Implications
2026-Mar, Anticancer research
IF:1.6Q4
DOI:10.21873/anticanres.18036
PMID:41760269
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研究论文 | 本研究探讨了PSMB9在肝细胞癌(HCC)中连接免疫激活与肿瘤适应的双重作用,及其治疗和预后意义 | 识别PSMB9作为HCC中免疫热表型的关键生物标志物,揭示其既促进免疫激活又预测不良生存的矛盾表型 | 未明确PSMB9促进肿瘤适应的具体分子机制,且研究基于回顾性队列,需前瞻性验证 | 探索HCC中免疫激活的分子决定因素及其预后和治疗意义 | 肝细胞癌(HCC)患者样本和HepG2细胞系 | 生物信息学与癌症研究 | 肝细胞癌 | 单样本基因集富集分析(ssGSEA)、差异表达基因筛选、bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、体外功能实验 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA-seq数据 | TCGA-LIHC队列、HCC TACE治疗队列、多个免疫治疗和靶向治疗队列 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1854 | 2026-03-01 |
Endometrial Epithelial Lactate Deficiency Drives CD8+ T-Cells Dysregulation in Unexplained Recurrent Implantation Failure
2026-Feb-27, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202524090
PMID:41758694
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现,不明原因反复种植失败患者的子宫内膜中细胞毒性CD8+ T细胞增殖和激活增加,同时腺上皮糖酵解异常和乳酸生成减少,这破坏了胚胎植入所需的免疫平衡 | 首次将子宫内膜腺上皮的乳酸生成缺陷与CD8+ T细胞功能失调联系起来,揭示了不明原因反复种植失败的新机制 | 研究样本量有限,且小鼠模型可能无法完全模拟人类子宫内膜的复杂生理环境 | 探究不明原因反复种植失败的分子机制,特别是子宫内膜免疫微环境与代谢异常的关系 | 不明原因反复种植失败患者的子宫内膜组织、小鼠模型以及体外培养的CD8+ T细胞 | 单细胞组学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1855 | 2026-03-01 |
Regulatory-like FOXP3+Helios+ CD4+ T conventional cells correlate with T cell activation after Orca-T immunotherapy
2026-Feb-27, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025031545
PMID:41758930
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研究论文 | 本研究通过单细胞mRNA测序和流式细胞术分析,比较了Orca-T免疫疗法与未处理外周血干细胞移植后患者的免疫激活差异,并鉴定了一个新的调节样T细胞亚群 | 首次在Orca-T治疗后患者中鉴定出CD4+CD25-FOXP3+Helios+ Tcon细胞亚群,并发现其与长期免疫激活相关 | 研究样本量相对较小(51例患者),且仅关注了HLA匹配患者,可能限制了结果的普适性 | 探究Orca-T免疫疗法与未处理外周血干细胞移植在免疫激活方面的差异,以理解其对感染、移植物抗宿主病和复发的影响 | 接受Orca-T或未处理外周血干细胞移植的HLA匹配白血病患者 | 免疫学 | 白血病 | 单细胞mRNA测序(scRNA-seq),流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | 51例HLA匹配患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1856 | 2026-03-01 |
Integrated Single-Cell Profiling Reveals Dichotomous NK Cell Populations Associated with Immunosuppression in Solid Tumors
2026-Feb-27, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-1229
PMID:41758966
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了实体瘤中NK细胞的双重表型和功能景观,由IFNG或TGFB1表达驱动的内在信号程序塑造 | 首次系统性地在癌症中剖析NK细胞,发现了一个以前未被认识的NK细胞调控轴,该轴由对立的IFNG或TGFB1表达程序驱动,并关联不同的转录因子回路 | NA | 理解NK细胞异质性如何影响免疫反应和临床结果 | 实体瘤中的自然杀伤(NK)细胞 | 数字病理学 | 实体瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1857 | 2026-03-01 |
Exosomal S100A9 promotes lung metastasis of adenoid cystic carcinoma via activating cancer-associated fibroblasts
2026-Feb-27, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-026-02991-6
PMID:41760596
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研究论文 | 本研究揭示了腺样囊性癌(ACC)来源的外泌体S100A9通过激活癌症相关成纤维细胞(CAFs)促进肺转移的分子机制 | 首次发现外泌体S100A9在ACC肺转移中的关键作用,并阐明其通过IL-17信号轴激活CAFs的分子机制 | 研究主要基于细胞和动物模型,临床样本验证有限;未探讨其他潜在信号通路是否参与 | 探究ACC肺转移的分子机制及潜在治疗靶点 | 腺样囊性癌细胞、外泌体、癌症相关成纤维细胞、肿瘤微环境 | 肿瘤生物学 | 腺样囊性癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1858 | 2026-03-01 |
STING activation induces polarized cytokine secretion of IFN-β and IL-17A promoting photoreceptor death and choroidal disruption in age-related macular degeneration
2026-Feb-27, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08491-w
PMID:41760600
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研究论文 | 本研究揭示了STING通路在年龄相关性黄斑变性(AMD)中通过调控IFN-β和IL-17A的极化分泌,促进光感受器死亡和脉络膜破坏的机制 | 首次发现STING通路在AMD中具有双相、阶段依赖性功能,从健康组织的细胞保护转变为早期AMD的致病性炎症驱动因子,并作为同时控制多种AMD病理的主调控因子 | 研究主要基于动物模型和体外细胞实验,人类样本验证相对有限,且未详细探讨STING抑制剂在临床转化中的潜在副作用 | 探究STING通路在年龄相关性黄斑变性(AMD)发病机制中的作用,并评估其作为治疗靶点的潜力 | 人类眼睛组织、AMD患者来源的iPSC-RPE细胞、人类视网膜类器官、Cryba1条件性敲除小鼠模型、Il17a敲入小鼠模型 | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | 免疫组织化学分析、单细胞转录组学、AAV2介导的基因过表达、药理学抑制和遗传学方法 | NA | 图像、文本(基因表达数据) | 人类眼睛组织样本、AMD患者来源的iPSC-RPE细胞、多种基因工程小鼠模型 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 1859 | 2026-03-01 |
Single-cell RNA sequencing of adenoid cystic carcinoma of the breast reveals cellular heterogeneity and tumor microenvironment features
2026-Feb-27, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-026-02329-2
PMID:41761191
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1860 | 2026-03-01 |
TGF-β regulated Tim-3 sustains macrophage phagocytic function and confers protection in Plasmodium yoelii NSM-infected mice
2026-Feb-27, Parasites & vectors
IF:3.0Q1
DOI:10.1186/s13071-026-07287-3
PMID:41761269
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研究论文 | 本研究揭示了在疟疾感染中,TGF-β调控的Tim-3通过维持巨噬细胞的吞噬功能发挥保护作用 | 发现了TGF-β-Tim-3轴在疟疾感染中维持巨噬细胞功能的新保护机制,并明确了Tim-3在巨噬细胞上的非T细胞调控作用 | 研究主要基于小鼠模型,其在人体中的适用性尚需验证 | 探究Tim-3在疟疾感染期间调控巨噬细胞功能的作用及机制 | 约氏疟原虫NSM感染的小鼠模型、脾脏巨噬细胞、体外共培养系统 | 免疫学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、功能测定 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |