单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27967 篇文献，本页显示第 18561 - 18580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 18561 | 2024-08-08 |
Integrated analysis of multi-omics data reveals T cell exhaustion in sepsis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1110070
PMID:37077915
|
研究论文 | 本研究通过综合分析多组学数据，揭示了脓毒症中T细胞耗竭的现象 | 本研究采用了基因集富集分析（GSEA）和Limma方法来识别与脓毒症相关的重要通路，并利用TIMER资源评估免疫细胞丰度，以及使用甲基化和单细胞转录组数据来识别关键通路基因 | NA | 探索脓毒症相关的高级生物标志物，以识别与疾病相关的重要通路并评估其临床意义 | 脓毒症患者的多组学数据 | 生物信息学 | 脓毒症 | 基因集富集分析（GSEA），Limma，TIMER，甲基化测序，单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据，甲基化数据，单细胞转录组数据 | 脓毒症患者与健康对照组 |
| 18562 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome profiling reveals distinct expression patterns among genes in the mouse incisor dental pulp
2023, The International journal of developmental biology
DOI:10.1387/ijdb.220173db
PMID:37078362
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了小鼠门牙牙髓中基因的表达模式 | 揭示了SOX转录因子在间充质干细胞分化过程中的调控作用 | NA | 探讨SOX转录因子在小鼠门牙牙髓细胞分化中的表达模式 | 小鼠门牙牙髓中的基因表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个间充质干细胞样本 |
| 18563 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing analysis of human chondrocytes reveals cell-cell communication alterations mediated by interactive signaling pathways in osteoarthritis
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1099287
PMID:37082621
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术分析了骨关节炎患者关节软骨组织中的细胞间通讯变化，揭示了特定信号通路在骨关节炎发病机制中的作用 | 首次通过单细胞转录组测序技术揭示了骨关节炎中软骨细胞亚型间的细胞间通讯变化，并验证了特定信号通路在其中的作用 | 研究仅基于公共数据库中的数据，未进行体内外实验验证 | 探索骨关节炎发病机制中细胞间通讯的变化 | 骨关节炎患者的关节软骨组织 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞转录组测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 来自骨关节炎患者的关节软骨组织样本 |
| 18564 | 2024-08-08 |
Expression of OLR1 gene on tumor-associated macrophages of head and neck squamous cell carcinoma, and its correlation with clinical outcome
2023, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2023.2203073
PMID:37089448
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析了头颈鳞状细胞癌中肿瘤相关巨噬细胞上的OLR1基因表达，并探讨了其与临床预后的关系 | 首次揭示了OLR1基因在肿瘤相关巨噬细胞上的特异性表达与头颈鳞状细胞癌不良预后的显著关联 | 研究主要基于TCGA数据库的数据，可能需要进一步的实验验证 | 探讨OLR1基因在头颈鳞状细胞癌中的表达及其对临床预后的影响 | 头颈鳞状细胞癌患者的肿瘤相关巨噬细胞和OLR1基因表达 | NA | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 498个头颈鳞状细胞癌患者肿瘤样本 |
| 18565 | 2024-08-08 |
A novel molecular signature for predicting prognosis and immunotherapy response in osteosarcoma based on tumor-infiltrating cell marker genes
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1150588
PMID:37090691
|
研究论文 | 本研究基于肿瘤浸润细胞标记基因开发了一种新的分子特征，用于预测骨肉瘤的预后和免疫治疗反应 | 首次基于肿瘤浸润淋巴细胞（TILs）标记基因开发了一个预后模型，用于骨肉瘤的预后预测和免疫治疗反应 | NA | 开发一种新的分子特征，用于预测骨肉瘤的预后和免疫治疗反应 | 骨肉瘤的预后和免疫治疗反应 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序（ScRNA-seq），WGCNA，LASSO回归分析，SVM算法 | 风险模型 | RNA转录组数据 | 11个细胞簇和2044个TILs标记基因 |
| 18566 | 2024-08-08 |
Single-cell immune profiling reveals immune responses in oral lichen planus
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1182732
PMID:37090715
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和免疫组库测序技术，揭示了口腔扁平苔藓（OLP）黏膜免疫微环境的特征 | 首次通过单细胞免疫图谱分析，揭示了OLP中组织驻留记忆CD8+ T细胞的活化状态及其他免疫细胞的克隆扩增和基因配对偏好 | NA | 探究口腔扁平苔藓（OLP）的免疫反应机制 | 口腔扁平苔藓（OLP）的黏膜免疫微环境 | 数字病理学 | 口腔疾病 | 单细胞RNA测序，免疫组库测序 | NA | 转录组 | 四个OLP活检样本及其配对的外周血单个核细胞（PBMCs），两个健康组织和三个健康PBMCs样本 |
| 18567 | 2024-08-08 |
ProgClust: A progressive clustering method to identify cell populations
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1183099
PMID:37091787
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研究论文 | 提出了一种名为ProgClust的方法，用于分解细胞群并检测稀有细胞，通过聚类树表示单细胞数据，并设计了一种渐进搜索方法来选择细胞群特异性基因和聚类细胞 | ProgClust能够自动确定聚类数量，并有效地识别常见和稀有细胞，同时在真实未标记数据中揭示潜在的细胞亚群 | NA | 开发一种新的方法来识别单细胞RNA测序数据中的不同细胞类型 | 单细胞RNA测序数据中的细胞群和稀有细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 聚类树 | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 18568 | 2024-08-08 |
Molecular characterization of colorectal mucinous adenocarcinoma and adenocarcinoma, not otherwise specified, identified by multiomic data analysis
2023, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2023.1150362
PMID:37091868
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研究论文 | 本文利用多组学数据分析了结直肠黏液腺癌和非特定类型腺癌的分子特征 | 发现了非特定类型腺癌具有免疫活跃但暴露于缺氧微环境，而黏液腺癌细胞能保护DNA免受损伤，微环境不利于白细胞穿透内皮迁移 | NA | 探究非特定类型腺癌和黏液腺癌的分子特征及其在肿瘤微环境中的差异 | 结直肠黏液腺癌、非特定类型腺癌及正常结肠组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 多组学数据分析 | NA | 蛋白质组学、转录组学、单细胞转录组学、空间转录组学数据 | NA |
| 18569 | 2024-08-08 |
Deciphering cell-cell interactions and communication in the tumor microenvironment and unraveling intratumoral genetic heterogeneity via single-cell genomic sequencing
2022 Jul-Dec, Bioengineered
IF:4.2Q2
DOI:10.1080/21655979.2023.2185434
PMID:37105769
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）的发展、检测原理、流程及其在肿瘤研究中的应用，并探讨了其潜在的临床应用 | scRNA-seq技术提供了比传统RNA测序方法更深入的分子机制理解，揭示了肿瘤演化过程中体细胞突变和功能的变化，以及免疫细胞的浸润和激活 | NA | 理解单细胞基因表达模式，追踪异质细胞中的基因表达或突变，评估癌细胞的克隆起源，并确定不同癌细胞亚群的选择性进化 | 肿瘤微环境中的细胞间相互作用和通信，以及肿瘤内遗传异质性 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 18570 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals new subtypes of lens superficial tissue in humans
2023-Nov, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13477
PMID:37057399
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序揭示了人眼透镜表层组织的新亚型 | 识别了特定表达C8orf4和ADAMTSL4的透镜上皮细胞亚型，以及与上皮细胞邻近的新类型纤维细胞 | 未明确人透镜干/祖细胞在上皮细胞中的分类及其分子特征 | 探讨人眼透镜上皮细胞的亚型及其分化的分子特征 | 人眼透镜表层组织中18,596个细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 18,596个细胞 |
| 18571 | 2024-08-05 |
VT3D: a visualization toolbox for 3D transcriptomic data
2023-09, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2023.04.001
PMID:37054878
|
研究论文 | 本文介绍了VT3D，一个用于3D转录组数据可视化的工具箱 | VT3D允许用户探索3D转录组数据，并支持基因表达映射到任意感兴趣的2D平面 | 目前缺乏广泛可用的数据可视化工具，限制了该技术的潜在影响和应用 | 研究目的是开发一个可视化工具，以促进3D转录组数据的探索和理解 | 研究对象包括多种基于测序和成像的技术生成的数据集 | 数字病理学 | NA | 转录组测序 | NA | 3D转录组数据 | 多个数据集，包括Stereo-seq, 空间转录组学和Slide-seq等技术生成的数据 |
| 18572 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic analysis identifies a highly replicating Cd168+ skeletal stem/progenitor cell population in mouse long bones
2023-09, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2023.04.004
PMID:37075860
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析了小鼠长骨中的骨骼干细胞/祖细胞（SSPCs）的异质性，并发现了一种具有高度复制能力的Cd168+ SSPC群体 | 本研究首次鉴定出一种新的Cd168 SSPC群体，具有高度复制能力和成骨软骨生成潜力，并能在骨折愈合过程中贡献于新形成的骨骼组织 | NA | 阐明小鼠长骨中SSPC群体的异质性及其各自的再生能力 | 小鼠长骨中的骨骼干细胞/祖细胞（SSPCs） | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 小鼠后肢芽、新生长骨和骨折长骨的单细胞RNA测序数据 |
| 18573 | 2024-08-08 |
Immunosuppressive tumor microenvironment contributes to tumor progression in diffuse large B-cell lymphoma upon anti-CD19 chimeric antigen receptor T therapy
2023-Aug, Frontiers of medicine
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11684-022-0972-8
PMID:37060525
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研究论文 | 研究抗CD19嵌合抗原受体T细胞疗法在复发或难治性弥漫大B细胞淋巴瘤患者中的效果及肿瘤微环境的影响 | 首次揭示了M2亚型巨噬细胞在CAR-T细胞疗法失败和疾病进展中的作用，并提出了针对肿瘤微环境和免疫细胞代谢重编程的治疗策略 | 研究样本量较小，需要进一步的大规模临床试验验证 | 探讨CAR-T细胞疗法失败的原因及肿瘤微环境的影响 | 复发或难治性弥漫大B细胞淋巴瘤患者 | NA | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | CAR-T细胞 | RNA | 22名可评估的弥漫大B细胞淋巴瘤患者 |
| 18574 | 2024-08-05 |
TMEM59 ablation leads to loss of olfactory sensory neurons and impairs olfactory functions via interaction with inflammation
2023-07, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2023.04.005
PMID:37061103
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研究论文 | 本研究识别了TMEM59作为维持和再生嗅觉上皮的关键调节因子 | TMEM59缺失导致嗅觉功能受损和嗅觉神经元的丧失，揭示其与炎症的相互作用 | 本研究可能未探讨TMEM59与其他因素的相互作用 | 研究TMEM59在嗅觉上皮维持与再生中的作用 | TMEM59及其在嗅觉上皮中的功能与机制 | 数字病理学 | 嗅觉障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | TMEM59-KO动物和正常对照 |
| 18575 | 2024-08-08 |
Understanding and targeting erythroid progenitor cells for effective cancer therapy
2023-07-01, Current opinion in hematology
IF:3.1Q2
DOI:10.1097/MOH.0000000000000762
PMID:37052294
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综述 | 本文综述了红细胞祖细胞（EPCs）在癌症中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 近年来研究发现EPCs在癌症中具有促进肿瘤生长的作用，并能转化为免疫抑制性髓系细胞，限制T细胞功能和免疫治疗 | NA | 总结EPCs的生物学特性，探讨其促进肿瘤活动的机制，并展望未来针对这些细胞的治疗策略 | 红细胞祖细胞（EPCs）及其在癌症治疗中的应用 | NA | 癌症 | 单细胞转录组和谱系追踪分析 | NA | 转录组 | NA |
| 18576 | 2024-08-05 |
Anaplastic transformation in thyroid cancer revealed by single-cell transcriptomics
2023-06-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI169653
PMID:37053016
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研究论文 | 本文研究了由单细胞转录组学揭示的甲状腺癌中去分化转化的过程 | 通过单细胞转录组学揭示了去分化甲状腺癌细胞的不同亚型和转化模型，识别出重要的转化关键阶段 | 目前对肿瘤内部复杂的转化过程仍缺乏全面理解 | 阐明甲状腺癌中去分化转化的细胞谱系和命运转变 | 不同亚型甲状腺癌患者的单细胞转录组和基因变化数据 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 不同亚型甲状腺癌患者的细胞数据 |
| 18577 | 2024-08-05 |
Fibroblast and Immune Cell Cross-Talk in Cardiac Fibrosis
2023-06, Current cardiology reports
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s11886-023-01877-8
PMID:37074566
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综述 | 本文全面概述了在心脏疾病中免疫细胞与成纤维细胞之间的相互作用 | 识别了在心肌梗死中可能的促炎成纤维细胞，并探讨了成纤维细胞如何影响炎症细胞行为 | 没有提到具体的实验数据支持或临床试验结果 | 探究心脏损伤背景下炎症与修复反应之间复杂的相互作用 | 关注心脏疾病中的成纤维细胞和炎症细胞 | 心血管疾病 | 心脏纤维化 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 18578 | 2024-08-05 |
Unraveling the heterogeneity of cholangiocarcinoma and identifying biomarkers and therapeutic strategies with single-cell sequencing technology
2023-Jun, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2023.114697
PMID:37060660
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综述 | 本文旨在利用单细胞测序技术评估胆管癌的异质性，以识别潜在的生物标志物和治疗靶点 | 通过单细胞测序技术深入分析胆管癌的肿瘤细胞基因组和表观基因组，提供了癌症进展机制的新见解 | 目前尚未解决的准确诊断方法限制了研究的广泛应用 | 寻找胆管癌的早期诊断生物标志物和改进治疗策略 | 胆管癌细胞及其异质性 | 数字病理学 | 胆管癌 | 单细胞测序 | NA | 肿瘤组织 | NA |
| 18579 | 2024-08-08 |
Wnt3a-Loaded Extracellular Vesicles Promote Alveolar Epithelial Regeneration after Lung Injury
2023-06, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202206606
PMID:37072558
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研究论文 | 本研究开发了一种通过将Wnt3a固定在细胞外囊泡(EVs)表面来远程传递Wnt3a的策略，以促进肺损伤后的肺泡上皮再生 | 本研究创新性地利用细胞外囊泡作为载体，有效解决了Wnt蛋白亲水性差的问题，并成功验证了其在肺泡上皮细胞再生中的生物活性 | NA | 探索慢性阻塞性肺疾病(COPD)治疗的新方法 | Wnt3a细胞外囊泡在肺损伤后肺泡上皮再生中的作用 | NA | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 18580 | 2024-08-08 |
Clustering ensemble in scRNA-seq data analysis: Methods, applications and challenges
2023-06, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2023.106939
PMID:37075602
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序数据分析中聚类集成方法的应用、挑战及未来方向 | 聚类集成方法能提高单细胞转录组数据分析的准确性和可靠性 | 不同聚类方法产生的结果存在差异，不稳定的分区会影响分析的准确性 | 总结聚类集成方法在单细胞转录组数据分析中的应用和挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 聚类集成 | 转录组数据 | NA |