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当前共找到 44757 篇文献，本页显示第 1821 - 1840 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1821 | 2026-10-01 |
ERG mediates the differentiation of hepatic progenitor cells towards immunosuppressive PDGFRα+ cancer-associated fibroblasts during hepatocarcinogenesis
2025-01-18, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-07270-9
PMID:39827226
|
研究论文 | 该研究利用单细胞测序技术在大鼠原发性肝癌模型中鉴定了一群炎症相关CAFs（PDGFRα+ CAFs），并揭示肝祖细胞通过TLR4-MAPK-ERG信号轴异常分化为PDGFRα+ CAFs，进而招募巨噬细胞并诱导其向免疫抑制表型极化，促进肝癌发生发展 | 首次揭示肝祖细胞（HPCs）可通过TLR4受体激活MAPK信号通路及下游转录因子ERG，异常分化为免疫抑制性PDGFRα+ CAFs；阐明了PDGFRα+ CAFs在肿瘤微环境中的双重生物学功能（分泌CCL3/CXCL12招募巨噬细胞并分泌TGFβ诱导其免疫抑制极化）；发现下调HPCs中ERG表达可显著减少PDGFRα+ CAFs数量及肿瘤相关巨噬细胞浸润，从而抑制肝癌发生 | 研究基于大鼠原发性肝癌模型，其结论在人类HCC中的适用性仍需进一步验证；未在摘要中明确说明单细胞测序的具体样本量及人类临床样本的验证情况 | 阐明肝细胞癌中癌症相关成纤维细胞（CAFs）的起源及其在免疫抑制微环境建立中的作用机制，为HCC免疫治疗策略提供新思路 | 大鼠原发性肝癌模型中的肝祖细胞（HPCs）、PDGFRα+ CAFs、肿瘤相关巨噬细胞及肝细胞癌微环境 | 单细胞组学 | 肝癌 | 单细胞测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1822 | 2026-10-01 |
Integrated bulk RNA and single-cell analysis with experimental validation reveal oxidative stress-related diagnostic biomarkers for osteoporosis
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0322326
PMID:40299834
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研究论文 | 本研究结合批量RNA测序和单细胞RNA测序分析，并通过体外实验验证，揭示了CHRM2作为氧化应激相关基因在骨质疏松症中的诊断生物标志物潜力及其对成骨分化的负调控作用 | 首次将批量RNA测序与单细胞RNA测序相结合，发现CHRM2是骨质疏松症中与氧化应激相关的关键基因，并通过体外实验验证了CHRM2敲低通过COL4A2相互作用促进成骨分化并抑制细胞增殖 | 研究主要基于生物信息学分析和体外细胞实验，缺乏体内动物模型验证和临床大样本验证 | 探索CHRM2在成骨分化中的作用，并评估其作为骨质疏松症诊断生物标志物的潜力 | 骨质疏松症患者与健康对照者的单细胞RNA测序数据，以及体外培养的成骨细胞 | 机器学习 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 文本, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1823 | 2026-10-01 |
STmiR: A Novel XGBoost-based framework for spatially resolved miRNA activity prediction in cancer transcriptomics
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0322082
PMID:40924781
|
研究论文 | 该文章提出了STmiR，一个基于XGBoost的框架，用于在癌症转录组学中预测空间分辨的miRNA活性 | 首次提出基于XGBoost的框架STmiR，整合bulk RNA-seq数据与空间转录组数据，实现空间分辨的miRNA活性预测，并揭示肿瘤微环境中的miRNA调控网络 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 解决当前空间转录组技术无法探索miRNA在肿瘤微环境中空间动态的问题，实现空间分辨的miRNA活性预测 | 四种主要癌症类型（乳腺癌、肺癌、卵巢癌、前列腺癌）以及九种癌症的10X Visium空间转录组数据集 | 机器学习, 空间转录组学 | 乳腺癌, 肺癌, 卵巢癌, 前列腺癌 | bulk RNA-seq, 空间转录组学 | XGBoost | 转录组数据, 空间转录组数据 | TCGA和CCLE的bulk RNA-seq数据，四种癌症类型的空间转录组数据，九种癌症的10X Visium空间转录组数据集，以及一个独立的验证空间转录组数据集 | 10x Genomics | 空间转录组学, bulk RNA-seq | 10x Visium | 10X Visium空间转录组数据集 |
| 1824 | 2026-10-01 |
An improved nuclei isolation protocol from leaf tissue for single-cell transcriptomics
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0302118
PMID:40929130
|
研究方法论文 | 本文介绍了一种从玉米叶片组织中分离细胞核的改进方法，通过利用叶绿体自发荧光在FACS步骤中有效去除叶绿体污染，从而提高单核RNA测序中reads比对到基因组和转录组的效率 | 利用叶绿体自发荧光在FACS分选步骤中有效去除叶绿体污染，解决了叶片组织因叶绿体含量高而干扰单核RNA测序质量的问题 | 仅针对玉米叶片组织进行了验证，未在其他高叶绿体含量的植物组织中测试 | 开发一种从叶片组织中分离细胞核的改进方案，减少叶绿体污染，提高单细胞转录组测序的数据质量 | 玉米（Zea mays）叶片组织 | 单细胞转录组学 | NA | 单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单核RNA测序 | NA | NA |
| 1825 | 2026-10-01 |
Role of endothelial cell markers in prognosis of hepatocellular carcinoma: Integrating bioinformatics analysis and experimental validation
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0331580
PMID:40956822
|
研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序识别肝细胞癌内皮细胞特异性标志物，并结合生物信息学分析和实验验证构建了预后多基因特征 | 在单细胞水平上识别了肝细胞癌内皮细胞特异性标志物，并构建了预后多基因特征 | 样本量较小，仅使用了12个肝细胞癌样本的单细胞转录组数据 | 识别内皮细胞特异性标志物并开发肝细胞癌的预后多基因特征 | 肝细胞癌患者样本 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学，Western blotting | Lasso-Cox回归 | 单细胞转录组数据，图像 | 12个肝细胞癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1826 | 2026-10-01 |
CD44 as a novel therapeutic target in pulmonary arterial hypertension: Insights from multi-omics integration and molecular docking
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0332817
PMID:40971695
|
研究论文 | 该研究通过多组学整合和分子对接，探讨CD44在肺动脉高压炎症过程中的作用，并发现CD44与孕酮的潜在相互作用 | 首次发现CD44在肺动脉平滑肌细胞中高表达，并揭示其与孕酮的潜在相互作用，为肺动脉高压治疗提供新靶点 | 未进行实验验证CD44与孕酮的相互作用及CD44靶向治疗的有效性 | 研究CD44在肺动脉高压炎症过程中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 特发性肺动脉高压患者的RNA-seq数据和肺动脉细胞 | 多组学整合 | 肺动脉高压 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 分子对接 | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1827 | 2026-10-01 |
Exploratory trajectory inference reveals convergent lineages for CD8 T cells in chronic LCMV infection
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0332406
PMID:40971956
|
研究论文 | 该文章提出探索性轨迹推断方法，通过模拟轨迹推断和无监督聚类分析解析慢性LCMV感染中CD8 T细胞的汇聚分化轨迹 | 提出探索性轨迹推断方法，结合模拟轨迹推断和无监督聚类分析，解决了复杂分化拓扑（如汇聚轨迹）难以解析的问题 | 该研究仅基于慢性LCMV感染中CD8 T细胞的scRNA-seq数据，方法的普适性需要更多不同生物学系统的验证 | 从单细胞RNA测序数据中重建动态过程的状态序列，解析复杂的分化拓扑结构，特别是汇聚分化轨迹 | 慢性LCMV感染过程中的CD8 T细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1828 | 2026-10-01 |
Understanding and mitigating the impact of ambient mRNA contamination in single-cell RNA-sequencing analysis
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0332440
PMID:40991648
|
研究论文 | 本研究探讨了液滴单细胞RNA测序中环境mRNA污染对差异基因表达和通路富集分析的影响，并评估了两种校正方法的效果 | 使用登革热患者外周血单核细胞和人类胎儿肝脏组织两个独立数据集，系统评估环境mRNA污染对下游分析的影响并比较两种校正策略 | 仅评估了CellBender和SoupX两种校正工具，未涉及其他潜在校正方法，且样本类型限于PBMC和胎儿肝脏组织 | 理解和减轻环境mRNA污染对单细胞RNA测序分析的影响 | 登革热患者的外周血单核细胞和人类胎儿肝脏组织 | 单细胞转录组学 | 登革热 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 10个登革热患者外周血单核细胞样本和42个人类胎儿肝脏组织单细胞RNA测序样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1829 | 2026-10-01 |
Bone-marrow macrophage-derived GPNMB protein binds to orphan receptor GPR39 and plays a critical role in cardiac repair
2024-Nov, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-024-00555-4
PMID:39455836
|
研究论文 | 本文揭示了骨髓来源巨噬细胞分泌的GPNMB蛋白通过结合孤儿受体GPR39促进心肌梗死后心脏修复的作用机制 | 首次发现GPNMB是心肌梗死后心脏修复的关键因子，并鉴定出GPR39为其功能性受体，揭示了骨髓巨噬细胞-心肌细胞/成纤维细胞跨器官通讯的新机制 | 未明确GPNMB-GPR39信号通路的下游具体分子机制，缺乏临床试验验证，病毒递送GPNMB的长期安全性未知 | 探究GPNMB在心肌梗死后心脏损伤与修复中的作用及其分子机制 | 人类和小鼠衰竭心脏组织、骨髓来源巨噬细胞、心肌细胞、成纤维细胞 | 心血管疾病研究、单细胞转录组学 | 心肌梗死、心力衰竭、心血管疾病 | 谱系追踪、骨髓移植、单细胞转录组测序、基因功能缺失模型、病毒递送 | NA | 单细胞转录组数据、图像、文本 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1830 | 2026-10-01 |
Effector MoSDT1 enhances Magnaporthe oryzae virulence and plays a dual role in regulating rice defense
2024-10-01, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiae364
PMID:39046202
|
研究论文 | 本研究通过构建MoSDT1过表达菌株和敲除菌株，研究该C2H2锌指效应蛋白对稻瘟病菌致病性及水稻防御的双重调控作用 | 首次系统阐明MoSDT1作为C2H2锌指效应蛋白在稻瘟病菌致病性和水稻防御中的双重调控机制，并通过多组学手段揭示其通过调控水稻信号蛋白磷酸化和泛素化发挥作用的分子机制 | 研究主要基于实验室条件下的功能验证，尚未在田间自然感染条件下验证MoSDT1的实际应用价值，且具体调控的下游靶标基因网络有待进一步解析 | 探究MoSDT1在稻瘟病菌致病性和水稻防御中的调控作用及其分子机制 | 稻瘟病菌（Magnaporthe oryzae）和水稻（Oryza sativa） | 机器学习 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA测序, ChIP-seq | NA | 文本, 图像 | MoSDT1过表达菌株1个和敲除菌株2个 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, ChIP-seq | NA | NA |
| 1831 | 2026-10-01 |
DEPDC1 as a metabolic target regulates glycolysis in renal cell carcinoma through AKT/mTOR/HIF1α pathway
2024-07-27, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06913-1
PMID:39068164
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序等多组学分析，发现DEPDC1通过AKT/mTOR/HIF1α通路调控肾细胞癌的糖酵解，并可作为克服TKI耐药的代谢靶点 | 首次发现DEPDC1通过AKT/mTOR/HIF1α通路调控肾细胞癌糖酵解，并揭示其作为TKI联合靶向代谢治疗新靶点的潜力 | 样本量相对有限（14例scRNA-seq和98例临床组织样本），DEPDC1调控糖酵解的具体分子机制尚未完全阐明，缺乏体内动物实验验证 | 探索肾细胞癌中糖酵解在不良预后和TKI耐药中的作用，寻找TKI联合靶向代谢治疗的新靶点 | 肾细胞癌患者（包括TKI耐药患者）的临床组织样本和肾细胞癌细胞系 | digital pathology | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 非靶向代谢组学测序 | NA | 文本, 图像 | 14例肾细胞癌患者（含3例TKI耐药穿刺活检样本）进行scRNA-seq，98例肾细胞癌患者临床组织样本，TCGA-KIRC数据库 | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1832 | 2026-10-01 |
PPAR-γ/NF-kB/AQP3 axis in M2 macrophage orchestrates lung adenocarcinoma progression by upregulating IL-6
2024-07-26, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06919-9
PMID:39060229
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序揭示AQP3在肺腺癌肿瘤微环境中主要富集于M2巨噬细胞亚群，并通过PPAR-γ/NF-κB轴调控M2巨噬细胞极化，进而通过IL-6影响肿瘤生长、迁移和糖代谢 | 首次阐明AQP3通过PPAR-γ/NF-κB轴调控M2巨噬细胞极化，并通过IL-6/IL-6R信号通路影响肺腺癌细胞的增殖、迁移和糖代谢，揭示了AQP3在肺腺癌肿瘤微环境中的新功能机制 | 样本量较小，仅纳入五例肺腺癌患者进行单细胞RNA测序分析，可能无法完全代表肺腺癌患者的整体异质性 | 探究AQP3在肺腺癌肿瘤微环境中的功能及其潜在机制 | 肺腺癌患者肿瘤组织、M2巨噬细胞、肺腺癌细胞 | 数字病理学、机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像、文本 | 5例肺腺癌患者的单细胞RNA测序样本，以及混合皮下移植瘤小鼠模型和Aqp3基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1833 | 2026-10-01 |
Lysyl oxidase-like 1 predicts the prognosis of patients with primary glioblastoma and promotes tumor invasion via EMT pathway
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.17579
PMID:38978755
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研究论文 | 本研究探讨了赖氨酰氧化酶家族基因在胶质母细胞瘤中的遗传改变和预后价值，并构建了基于Loxl1的列线图和预后风险评分模型，同时验证了Loxl1通过EMT通路促进肿瘤侵袭的作用 | 构建了基于Loxl1的列线图和预后风险评分模型（PRSM），并通过单细胞RNA测序和体外实验揭示了Loxl1通过EMT通路促进胶质母细胞瘤侵袭的新机制 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究赖氨酰氧化酶家族基因在胶质母细胞瘤中的遗传改变、预后价值及生物学功能，并构建个体化预后评估模型 | 原发性胶质母细胞瘤患者及其肿瘤样本 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序, CCK-8实验, 蛋白质印迹, 伤口愈合实验, Transwell侵袭实验 | 列线图, 预后风险评分模型（PRSM）, Cox比例风险模型 | 基因表达数据, 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1834 | 2026-10-01 |
Impact of Memory T Cells on SARS-COV-2 Vaccine Response in Hematopoietic Stem Cell Transplant
2023-Oct-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.26.564259
PMID:37961434
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研究论文 | 本研究评估了42名造血干细胞移植受者和5名健康对照者对SARS-CoV-2 mRNA疫苗的体液和适应性免疫反应，并通过单细胞RNA测序结合TCR和BCR测序探索了无反应机制 | 在造血干细胞移植受者中揭示了记忆T细胞群缺陷与T细胞反应缺失之间的关联，并发现部分缺陷可在疫苗接种前检测到 | 样本量较小（42名HSCT受者和5名健康对照），未明确说明随访时间长度 | 评估SARS-CoV-2 mRNA疫苗在造血干细胞移植受者中的免疫应答效果，并探索缺乏应答的机制 | 42名造血干细胞移植受者和5名健康对照者 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序，TCR测序，BCR测序 | NA | 文本，血清抗体滴度数据，单细胞转录组数据 | 42名造血干细胞移植受者和5名健康对照者的外周血单核细胞和血清样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq，单细胞免疫组库测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞5'转录组与TCR/BCR联合测序 |
| 1835 | 2026-10-01 |
High-throughput identification of Toxoplasma gondii effector proteins that target host cell transcription
2023-10-11, Cell host & microbe
IF:20.6Q1
DOI:10.1016/j.chom.2023.09.003
PMID:37827122
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研究论文 | 该研究结合混合CRISPR敲除筛选与宿主-微生物双单细胞RNA测序（dual perturb-seq），鉴定了弓形虫靶向宿主细胞转录的效应蛋白 | 开发了dual perturb-seq方法，将pooled CRISPR敲除筛选与双宿主-微生物单细胞RNA测序结合，能够从转录组数据直接推断效应蛋白功能，并发现了TgGRA59和TgSOS1等新型效应蛋白 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 鉴定细胞内病原体弓形虫重编程宿主细胞转录的分子介导因子，揭示感染和免疫逃逸机制 | 弓形虫（Toxoplasma gondii）及被感染的宿主细胞 | 机器学习 | NA | CRISPR敲除筛选, 单细胞RNA测序 | NA | 文本, 转录组数据 | NA | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1836 | 2026-10-01 |
Tumor Niche Network-Defined Subtypes Predict Immunotherapy Response of Esophageal Squamous Cell Cancer
2023-Feb-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.02.15.528539
PMID:36824935
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研究论文 | 该研究通过整合69例食管鳞状细胞癌患者的肿瘤微环境单细胞转录组数据集，基于细胞网络转录特征对ESCC进行亚型划分，以预测免疫检查点阻断治疗的响应 | 利用肿瘤微环境中T细胞、髓系细胞和成纤维细胞的细胞网络转录特征定义ESCC亚型，并通过液体活检单细胞转录组学验证，实现对ICB应答者和非应答者的分类 | 样本量相对有限（69例患者），需要更大规模队列进一步验证亚型分类的普适性和临床适用性 | 基于肿瘤微环境转录网络对食管鳞状细胞癌患者进行亚型划分，预测免疫检查点阻断治疗响应 | 69例人食管鳞状细胞癌（ESCC）患者的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 69例人食管鳞状细胞癌患者的肿瘤微环境单细胞转录组数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1837 | 2026-10-01 |
A tensor decomposition-based integrated analysis applicable to multiple gene expression profiles without sample matching
2022-12-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-25524-4
PMID:36481877
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研究论文 | 本文提出了一种基于张量分解的无监督特征提取策略，用于整合多个独立研究中的基因表达谱，无需样本匹配或标签 | 首次提出利用张量分解实现无需样本匹配和标签的多个基因表达谱整合分析，并能显著减少scRNA-seq所需计算内存 | 未明确说明 | 解决多个独立研究中基因表达谱因缺乏样本匹配和共同标签而难以整合的问题 | 阿尔茨海默病相关的基因表达谱，包括单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 张量分解 | 基因表达谱数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1838 | 2026-10-01 |
A Poisson reduced-rank regression model for association mapping in sequencing data
2022-Dec-08, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-022-05054-6
PMID:36482321
|
研究论文 | 开发了一种基于泊松似然的降秩回归模型，用于识别单细胞RNA测序数据中高维基因表达与细胞特异性协变量之间的低维线性关联 | 提出使用泊松似然来建模单细胞RNA测序计数的独特结构，并采用降秩回归方法捕捉基因表达的低维表示，同时考虑了基因之间的相关性结构，避免了传统方法中假设基因独立和逐基因回归的计算成本问题 | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 解决传统关联映射方法中假设结果变量独立、计算成本高以及忽略基因表达相关结构的问题，同时克服基于高斯假设的传统模型在处理计数型scRNA-seq数据时的挑战 | 单细胞RNA测序数据、空间基因表达数据、批量RNA测序数据中的基因表达与细胞及样本特异性协变量之间的关联 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | 降秩回归模型, 泊松回归模型 | 计数数据, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1839 | 2026-10-01 |
DestVI identifies continuums of cell types in spatial transcriptomics data
2022-09, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01272-8
PMID:35449415
|
研究论文 | 本文提出了一种名为DestVI的方法，利用变分推断对空间转录组数据进行解卷积，以识别细胞类型的连续变异 | 首次实现了在空间转录组数据中识别同一细胞类型内部的转录组连续变异，而不仅限于离散细胞类型的比例评估 | 未明确提及 | 解决空间转录组技术分辨率不足的问题，通过联合单细胞RNA测序分析，识别细胞类型内部的连续转录组变化 | 感染淋巴结和小鼠肿瘤模型的空间转录组数据 | 空间转录组学 | 感染性疾病, 癌症 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | 变分推断 | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 未明确提及 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1840 | 2026-10-01 |
A single cell atlas of human cornea that defines its development, limbal progenitor cells and their interactions with the immune cells
2021-07, The ocular surface
DOI:10.1016/j.jtos.2021.03.010
PMID:33865984
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研究论文 | 该研究对人类角膜及邻近结膜从胚胎、胎儿到成人阶段进行单细胞分析，构建了全面的角膜单细胞图谱 | 首次构建了从发育到成年的角膜和结膜所有细胞类型的综合单细胞图谱，发现了新的角膜缘祖细胞表面标志物GPHA2，揭示了免疫细胞与角膜缘祖细胞的相互作用，并发现圆锥角膜中胶原酶激活和角膜缘基底上层细胞减少两个关键变化 | 未明确提及 | 生成从发育到成年的角膜和邻近结膜所有细胞类型的综合单细胞图谱，定义可改善角膜缘祖细胞体外扩增、干细胞分化方法及眼表疾病治疗的基因/通路 | 4个成人角膜及邻近结膜、17个胚胎和胎儿角膜（10至21孕周）、圆锥角膜、培养的角膜缘上皮细胞 | 数字病理学 | 圆锥角膜 | scRNA-seq, scATAC-seq, RNA-seq, RNA干扰, 免疫荧光, 集落形成效率实验, 克隆实验 | Seurat基于图的聚类, UMAP, 拟时序分析 | 单细胞转录组数据, 单细胞ATAC数据, 图像 | 21,343个成人细胞（来自4个成人角膜及邻近结膜）和89,897个胚胎/胎儿细胞（来自17个样本），共约111,240个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 10x Chromium | 10x Genomics平台用于scRNA-seq和/或scATAC-seq |