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当前共找到 37637 篇文献，本页显示第 1821 - 1840 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1821 | 2026-03-02 |
HIV-1 activates oxidative phosphorylation in infected CD4 T cells in a human tonsil explant model
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1172938
PMID:37325659
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研究论文 | 本研究利用人扁桃体离体模型，通过单细胞RNA测序分析了HIV-1感染对不同细胞类型转录组的影响，发现感染CD4+ T细胞中氧化磷酸化基因上调，而暴露于病毒的巨噬细胞中NLRP3炎症小体通路基因表达增加 | 首次在人类扁桃体离体模型中，利用单细胞RNA测序技术揭示了HIV-1感染诱导的CD4+ T细胞中氧化磷酸化基因上调及巨噬细胞中NLRP3炎症小体通路激活的转录组变化 | 研究基于离体模型，可能无法完全模拟体内复杂环境；样本来源有限，仅使用健康捐赠者的扁桃体组织 | 探究HIV-1感染在淋巴组织不同细胞类型中诱导的转录组变化及其在慢性炎症机制中的作用 | 人类扁桃体离体组织中的CD4+ T细胞和巨噬细胞 | 单细胞转录组学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自健康捐赠者的人扁桃体离体组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1822 | 2026-03-02 |
Endocardium-to-coronary artery differentiation during heart development and regeneration involves sequential roles of Bmp2 and Cxcl12/Cxcr4
2022-11-21, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.10.007
PMID:36347256
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研究论文 | 本研究通过小鼠遗传学和单细胞RNA测序，揭示了心内膜细胞在心脏发育和再生中分化为冠状动脉的分子机制，特别是Bmp2和Cxcl12/Cxcr4信号通路的顺序作用 | 利用时间特异性谱系追踪和新的CXCR4活性报告小鼠系，精确评估了CXCL12/CXCR4信号在动脉形态发生而非血管生成中的特异性作用，并识别了Bmp2表达过渡群体在中期妊娠中的关键角色 | 研究主要基于小鼠模型，可能不完全适用于人类心脏再生，且未详细探讨成年心脏中的再生潜力 | 探究心内膜细胞分化为冠状动脉的分子机制，以促进心脏损伤后的血管再生 | 小鼠心脏发育过程中的心内膜细胞和冠状动脉内皮细胞 | 发育生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1823 | 2026-03-02 |
Interactions in CSF1-Driven Tenosynovial Giant Cell Tumors
2022-11-14, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-22-1898
PMID:36007098
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探究了腱鞘巨细胞瘤中的细胞相互作用 | 首次在单细胞水平识别TGCT中的两种复发性肿瘤细胞群，并发现其与正常滑膜细胞高度相似，同时揭示了肿瘤细胞不表达CSF1R，为治疗靶点提供了新见解 | 样本量较小（仅3个TGCT和2个GCTB样本），可能限制结果的普适性 | 探究腱鞘巨细胞瘤中的细胞相互作用及潜在治疗靶点 | 腱鞘巨细胞瘤和骨巨细胞瘤样本中的细胞 | 单细胞组学 | 腱鞘巨细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 长读长RNA测序, 免疫荧光, 免疫组化 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 18,788个单细胞，来自3个TGCT和2个GCTB样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1824 | 2026-03-02 |
Tempo: an unsupervised Bayesian algorithm for circadian phase inference in single-cell transcriptomics
2022-11-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-34185-w
PMID:36323668
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Tempo的无监督贝叶斯算法，用于从单细胞转录组数据中推断昼夜节律相位 | Tempo结合了昼夜节钟的领域知识，并量化了相位估计的不确定性，相比现有方法提供了更准确的相位估计和校准良好的不确定性量化 | 未在摘要中明确提及具体限制 | 开发一种计算方法来准确推断单细胞转录组数据中的昼夜节律相位，并量化估计不确定性 | 单细胞转录组数据，特别是与昼夜节律相关的数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 贝叶斯变分推断 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1825 | 2026-03-02 |
SARS-CoV-2 infection of human pluripotent stem cell-derived liver organoids reveals potential mechanisms of liver pathology
2022-Oct-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105146
PMID:36128218
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研究论文 | 本研究利用人诱导多能干细胞衍生的肝脏类器官模拟SARS-CoV-2感染，揭示了病毒感染导致的肝脏病理机制 | 首次使用人诱导多能干细胞衍生的肝脏类器官模型研究SARS-CoV-2感染对肝脏的影响，并结合单细胞测序技术揭示了感染细胞与未感染旁观者细胞的转录组变化 | 研究基于体外类器官模型，可能无法完全模拟体内复杂的肝脏微环境 | 探究SARS-CoV-2感染导致肝脏病理的潜在分子机制 | 人诱导多能干细胞衍生的肝脏类器官 | 单细胞组学 | COVID-19 | 单细胞测序 | 类器官模型 | 转录组数据 | 未明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1826 | 2026-03-02 |
Erythroblastic islands foster granulopoiesis in parallel to terminal erythropoiesis
2022-10-06, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2022015724
PMID:35862735
|
研究论文 | 本研究通过多光谱成像流式细胞术、体外岛重构和单细胞RNA测序，揭示了小鼠骨髓中红系母细胞岛（EBI）不仅是红系终末分化的场所，还支持粒系终末分化，并展示了其巨噬细胞亚群的异质性 | 首次证明红系母细胞岛（EBI）同时作为红系和粒系终末分化的双重微环境，并揭示了巨噬细胞亚群在病理生理状态下的动态调控机制 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需进一步验证；单细胞测序样本量有限，可能未完全覆盖所有细胞亚群 | 探究骨髓中红系母细胞岛（EBI）的精确组成及其在造血微环境中的功能 | 成年小鼠骨髓中的红系母细胞岛组分细胞，包括巨噬细胞、红系前体细胞和中性粒细胞前体细胞 | 数字病理学 | NA | 多光谱成像流式细胞术、体外岛重构、单细胞RNA测序、细胞转录组和表位测序索引 | NA | 图像、单细胞转录组数据 | 成年小鼠骨髓样本，通过梯度沉降富集EBI组分细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1827 | 2026-03-02 |
Transcription and splicing regulation by NLRC5 shape the interferon response in human pancreatic β cells
2022-09-16, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abn5732
PMID:36103539
|
研究论文 | 本研究揭示了转录因子NLRC5在人类胰腺β细胞中调控干扰素反应、HLA I类分子表达及可变剪接的核心作用 | 首次发现NLRC5不仅调控HLA I类分子和抗原呈递相关基因的表达，还介导IFNα对可变剪接的影响，从而参与β细胞新抗原生成 | 研究主要基于体外诱导的多能干细胞来源的胰岛样细胞和EndoC-βH1细胞系，未在完整人体组织中进行验证 | 阐明IFNα在1型糖尿病早期通过NLRC5调控β细胞免疫原性反应的分子机制 | 人类诱导多能干细胞来源的胰岛样细胞、EndoC-βH1细胞系以及人类胰岛细胞 | 单细胞组学 | 1型糖尿病 | RNA测序、单细胞RNA测序、靶向基因/蛋白检测 | NA | RNA测序数据、单细胞RNA测序数据 | 未明确具体样本数量，涉及多能干细胞来源的胰岛样细胞、EndoC-βH1细胞系和人类胰岛细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1828 | 2026-03-02 |
CST6 suppresses osteolytic bone disease in multiple myeloma by blocking osteoclast differentiation
2022-09-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI159527
PMID:35881476
|
研究论文 | 本研究揭示了CST6通过抑制破骨细胞分化和功能，在多发性骨髓瘤中抑制溶骨性骨病的作用机制 | 首次发现CST6表达升高与多发性骨髓瘤患者无溶骨性病变显著相关，并阐明其通过阻断cathepsin K活性和NF-κB/p100、TRAF3的切割来抑制破骨细胞分化的分子机制 | 研究主要基于相关性分析和体外/体内模型，临床转化应用仍需进一步验证 | 探究多发性骨髓瘤中溶骨性骨病缺失的分子基础 | 多发性骨髓瘤患者骨髓CD138+细胞及破骨细胞分化过程 | NA | 多发性骨髓瘤 | PET-CT、基因表达谱分析、酶联免疫吸附试验、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质水平数据、单细胞转录组数据 | 512名新诊断的多发性骨髓瘤患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1829 | 2026-03-02 |
A time-resolved, multi-symbol molecular recorder via sequential genome editing
2022-Aug, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-04922-8
PMID:35794474
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为DNA Typewriter的体内分子记录系统，通过顺序基因组编辑实现时间分辨、多符号的记录 | DNA Typewriter系统克服了现有DNA记忆设备在并发记录符号数量和事件顺序捕获方面的限制，利用CRISPR-Cas9靶点阵列和短插入编辑实现顺序记录 | 作为概念验证研究，系统在体内应用和长期稳定性方面可能仍需进一步验证 | 开发一种能够记录事件顺序和多种符号的体内分子记录系统 | DNA序列作为记录介质，细胞系作为实验模型 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因编辑、prime editing、单细胞RNA-seq | NA | DNA序列数据、单细胞转录组数据 | 3,257个细胞的单克隆谱系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1830 | 2026-03-02 |
Orexin neurons inhibit sleep to promote arousal
2022-07-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-31591-y
PMID:35851580
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研究论文 | 本文通过体内光遗传学、体外光遗传学电路映射和单细胞转录组学，揭示了食欲素神经元通过抑制腹外侧视前核的促睡眠神经元来促进觉醒的间接机制 | 发现食欲素神经元通过间接抑制促睡眠神经元来维持觉醒，这为理解觉醒维持提供了新的电路框架 | NA | 研究食欲素神经元如何通过神经回路机制促进和维持觉醒状态 | 食欲素神经元和腹外侧视前核的促睡眠神经元 | 神经科学 | NA | 体内光遗传学、体外光遗传学电路映射、单细胞转录组学 | NA | 神经活动数据、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 1831 | 2026-03-02 |
Cellular and immunometabolic mechanisms of inflammation in depression: Preliminary findings from single cell RNA sequencing and a tribute to Bruce McEwen
2022-Jul, Neurobiology of stress
IF:4.3Q1
DOI:10.1016/j.ynstr.2022.100462
PMID:35655933
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探索了重度抑郁症患者中炎症与快感缺失症状相关的免疫细胞亚群和转录组特征 | 首次在单细胞水平上揭示了重度抑郁症患者中单核细胞和CD4 T细胞的免疫代谢重编程与炎症及行为症状的关联 | 样本量较小（仅6名患者），且为初步发现，需要更大规模研究验证 | 探究重度抑郁症中炎症的细胞和免疫代谢机制及其与行为症状的关系 | 重度抑郁症门诊患者的外周血单核细胞 | 单细胞转录组学 | 重度抑郁症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6名未用药的重度抑郁症门诊患者（3名高CRP，3名低CRP） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1832 | 2026-03-02 |
Altered patterning of trisomy 21 interneuron progenitors
2022-06-14, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2022.05.001
PMID:35623352
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研究论文 | 本研究通过分析唐氏综合征（21三体）患者的大脑皮层及利用诱导多能干细胞模型，揭示了21三体导致中间神经元前体细胞模式改变及数量减少的机制 | 首次结合成人脑组织立体学分析与21三体诱导多能干细胞模型，发现COUP-TFII+前体细胞减少与WNT信号通路异常在唐氏综合征皮层中间神经元发育缺陷中的关键作用 | 研究主要基于体外干细胞模型，体内验证尚不充分；WNT信号激活仅部分恢复表型，提示存在其他调控机制 | 探究唐氏综合征大脑神经元减少及智力障碍的发育机制 | 唐氏综合征患者大脑皮层组织、21三体人类诱导多能干细胞及其同基因对照 | 发育神经生物学 | 唐氏综合征 | 单细胞RNA测序、立体学分析、干细胞分化 | 人类诱导多能干细胞分化模型 | 基因表达数据、细胞计数数据 | 未明确样本数量，使用成人DS皮层组织及多株iPSC细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1833 | 2026-03-02 |
CellRank for directed single-cell fate mapping
2022-02, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-021-01346-6
PMID:35027767
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研究论文 | 本文介绍了CellRank，一种用于单细胞命运映射的计算方法，适用于方向未知的多样化场景，如再生、重编程和疾病 | 结合轨迹推断的鲁棒性和RNA速度的方向信息，考虑细胞命运决策的渐进性和随机性，以及速度向量的不确定性 | NA | 开发一种能够处理方向未知生物过程的单细胞命运映射工具 | 单细胞RNA测序数据，应用于胰腺发育、细胞重编程和肺损伤后再生等场景 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1834 | 2026-03-02 |
Metabolic modeling of single Th17 cells reveals regulators of autoimmunity
2021-08-05, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.05.045
PMID:34216539
|
研究论文 | 本研究开发了Compass算法，通过单细胞RNA测序和通量平衡分析，揭示了Th17细胞代谢状态与其自身免疫致病性之间的关联，并验证了多胺代谢在调控Th17细胞功能中的关键作用 | 开发了Compass算法，首次将单细胞RNA测序与通量平衡分析结合，实现了单细胞代谢状态的表征，并发现了多胺代谢在Th17细胞致病性中的新调控机制 | 算法基于RNA测序数据推断代谢状态，可能无法完全反映实际的代谢通量变化，且体内验证主要集中于中枢神经系统自身免疫模型 | 研究Th17细胞的代谢状态如何调控其自身免疫致病性 | Th17细胞（T辅助17细胞） | 计算生物学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序，通量平衡分析，代谢测定 | Compass算法（基于通量平衡分析） | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1835 | 2026-03-02 |
Multifunctional barcoding with ClonMapper enables high-resolution study of clonal dynamics during tumor evolution and treatment
2021-07, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-021-00222-8
PMID:34939038
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为ClonMapper的功能化谱系追踪系统，该系统整合了DNA条形码、单细胞RNA测序和克隆分离技术，用于全面表征异质群体中的数千个克隆 | 开发了ClonMapper系统，首次将DNA条形码与单细胞RNA测序及克隆分离相结合，实现了对特定克隆的活细胞操作和基因组、表观组、转录组测量的整合 | NA | 研究肿瘤进化与治疗过程中的克隆动态 | 慢性淋巴细胞白血病细胞系及原代人类慢性淋巴细胞白血病样本 | 数字病理学 | 慢性淋巴细胞白血病 | DNA条形码，单细胞RNA测序，克隆分离 | NA | 单细胞转录组数据 | 数千个克隆 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1836 | 2026-03-02 |
Categorization of lung mesenchymal cells in development and fibrosis
2021-Jun-25, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102551
PMID:34151224
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，系统描绘了小鼠和人类在发育、衰老及纤维化过程中肺间充质细胞的异质性，并鉴定了一个新的细胞亚群 | 首次在胚胎、出生后、成年及衰老纤维化肺中，对小鼠和人类的间充质细胞进行跨物种、跨发育阶段的单细胞转录组比较分析，鉴定了一个新的细胞亚群，并揭示了各亚群在纤维化中均参与基质基因表达 | 未明确提及新细胞亚群的具体功能验证，且分析主要基于转录组数据，缺乏蛋白水平或功能实验的深入验证 | 阐明肺间充质细胞在发育和纤维化疾病中的异质性、亚群分类及其转录特征 | 小鼠和人类在胚胎期、出生后、成年期及衰老纤维化肺组织中的间充质细胞 | 单细胞组学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 涵盖小鼠和人类多个发育阶段（胚胎、出生后、成年、衰老）及纤维化状态的肺组织样本，具体样本数量未明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1837 | 2026-03-02 |
Identification of EMT signaling cross-talk and gene regulatory networks by single-cell RNA sequencing
2021-05-11, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2102050118
PMID:33941680
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了TGF-β1诱导的MCF10A细胞上皮-间质转化过程，揭示了EMT信号通路的交叉调控和基因调控网络 | 利用单细胞RNA测序和伪时间聚类重建，首次在单细胞水平上揭示了EMT过程中信号通路的顺序和并行激活模式，并识别了关键的NOTCH信号通路作为TGF-β诱导EMT的主要驱动因素 | 研究仅基于MCF10A细胞系模型，未在体内或更多细胞类型中验证，且单细胞测序技术本身存在技术噪音和批次效应等局限性 | 探究上皮-间质转化过程中的信号通路交叉调控机制和基因调控网络 | MCF10A细胞系在TGF-β1刺激下经历EMT的过程 | 单细胞组学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 伪时间聚类分析、随机电路扰动方法 | 单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量，但基于MCF10A细胞系进行单细胞测序 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1838 | 2026-03-02 |
Single Molecule-Based fliFISH Validates Radial and Heterogeneous Gene Expression Patterns in Pancreatic Islet β-Cells
2021-05, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db20-0802
PMID:33685924
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研究论文 | 本研究利用fliFISH技术在单个细胞水平上量化小鼠胰岛切片中的转录本，验证了胰岛β细胞中基因表达的径向和异质性模式 | 采用fliFISH技术克服了scRNA-Seq在检测低丰度转录本和空间组织信息方面的局限性，首次在完整胰岛的空间背景下评估转录异质性 | 研究仅聚焦于小鼠胰岛，未涉及人类样本或其他物种；分析的基因数量有限，可能未全面覆盖胰岛β细胞的异质性 | 验证胰岛β细胞中基因表达的异质性模式，并探索其空间组织与细胞成熟状态的关系 | 小鼠胰岛β细胞 | 数字病理学 | NA | fliFISH（基于波动定位成像的荧光原位杂交） | NA | 图像 | 未明确指定样本数量，但涉及单个胰岛的多个细胞 | NA | 单细胞RNA测序（作为比较技术提及），但主要使用fliFISH | NA | NA |
| 1839 | 2026-03-02 |
SCDC: bulk gene expression deconvolution by multiple single-cell RNA sequencing references
2021-01-18, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbz166
PMID:31925417
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研究论文 | 本文提出了一种名为SCDC的批量基因表达去卷积方法，该方法利用多个单细胞RNA测序参考数据集中的细胞类型特异性基因表达谱，通过集成方法整合不同实验室和时间产生的数据，以解决批次效应问题，并在模拟和实验混合细胞系中验证了其优于现有方法的准确性 | SCDC采用集成方法整合多个scRNA-seq参考数据集，隐式处理批次效应混淆问题，提高了细胞类型分解的准确性 | NA | 开发一种基于多个单细胞RNA测序参考数据集的批量RNA测序去卷积方法，以更准确地分解细胞类型比例 | 批量RNA测序数据，包括模拟生成的伪批量样本和实验混合细胞系，以及人类胰岛和小鼠乳腺组织数据集 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | 集成方法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1840 | 2026-03-02 |
A `one-two punch' therapy strategy to target chemoresistance in estrogen receptor positive breast cancer
2021-Jan, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2020.100946
PMID:33221681
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研究论文 | 本研究探讨了通过HDAC抑制剂靶向化疗诱导的癌症干细胞样细胞，以克服雌激素受体阳性乳腺癌的化疗耐药性 | 提出“一打二击”治疗策略，利用HDAC抑制剂阻断化疗诱导的癌症干细胞样细胞富集，并揭示IIa类和IIb类HDAC在逆转化疗耐药状态中的关键作用 | 研究主要基于体外实验和患者样本分析，缺乏大规模临床试验验证，且对HDAC抑制剂的具体作用机制仍需进一步探索 | 开发针对雌激素受体阳性乳腺癌化疗耐药性的新型治疗策略 | 雌激素受体阳性转移性乳腺癌肿瘤细胞及患者来源的癌症细胞 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |