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当前共找到 35765 篇文献，本页显示第 1801 - 1820 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1801 | 2026-01-04 |
SEEK-VEC: Robust Latent Structure Discovery via Ensemble Topic Modeling
2025-Dec-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.12.693799
PMID:41427368
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研究论文 | 本文提出了一种名为SEEK-VEC的集成框架，用于通过主题建模发现计数数据中的潜在结构 | SEEK-VEC通过集成多个候选主题模型，利用谱集成程序自动强化信号并减轻噪声，生成数据的共识低维嵌入，从而在信号弱时优于现有方法 | NA | 开发一个鲁棒的集成框架，用于在计数数据中检测潜在结构，以克服标准主题建模方法的限制 | 计数数据，包括自报告的心理病理症状数据、食物偏好问卷和单细胞转录组学数据 | 机器学习 | NA | 主题建模 | 集成主题模型 | 计数数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1802 | 2026-01-04 |
Spatiotemporal Atlas of Heart Development Reveals Blood-Flow-Dependent Cellular, Structural, Metabolic, and Spatial Remodeling
2025-Dec-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.09.693024
PMID:41427371
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研究论文 | 本研究通过扰动鸡胚胎心脏血流，结合单细胞和空间转录组学，构建了血流依赖的心脏发育时空图谱，揭示了血流力学如何重塑心脏组织的细胞、结构和代谢特征 | 首次在胚胎心脏发育中系统整合血流力学扰动与高分辨率空间转录组学，揭示了血流依赖的跨尺度（分子、细胞、结构）重塑机制，并识别了LOX表达心肌细胞等新的血流敏感细胞状态 | 研究基于鸡胚胎模型，其结论在哺乳动物或人类中的普适性需进一步验证；空间转录组分辨率虽高但仍存在技术限制 | 探究血流力学如何调控胚胎心脏的细胞程序、组织结构和代谢适应，阐明血流依赖的发育重塑机制 | 鸡胚胎心脏组织 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 空间转录组数据，单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 1803 | 2026-01-04 |
Riemannian Metric Learning for Alignment of Spatial Multiomics
2025-Dec-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.09.693237
PMID:41427348
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研究论文 | 本文提出了一种名为Manifold Gromov-Wasserstein (MGW)的度量学习框架，用于对齐空间多组学数据中的异构模态 | MGW框架利用神经场推断模态特定的黎曼度量，并通过Gromov-Wasserstein最优传输对齐这些度量，实现了无需超参数的成本计算，并具有理论不变性 | 未在摘要中明确提及 | 开发一种能够对齐空间多组学数据中不同模态的方法 | 空间多组学数据，包括转录组、表观基因组、蛋白质组和代谢组等 | 机器学习 | 结直肠癌、肾癌 | 空间转录组学、空间代谢组学 | 神经场 | 空间多模态数据 | 数千个细胞 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | NA |
| 1804 | 2026-01-04 |
Analysis of clinical, single cell, and spatial data from the Human Tumor Atlas Network (HTAN) with massively distributed cloud-based queries
2025-Nov-17, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-7769205/v1
PMID:41333415
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研究论文 | 本文介绍了人类肿瘤图谱网络（HTAN）开发的基于云的基础设施，用于整合和分析大规模、多模态的癌症数据 | 引入了两个关键创新：基于来源的HTAN ID表简化了队列构建和跨检测整合；以及将BigQuery的地理空间功能创新性地应用于空间生物学，实现了肿瘤微环境的邻域和相关性分析 | 未明确提及具体的技术或应用限制 | 开发一个基于云的基础设施，以降低整合和分析大规模、多模态癌症数据的技术和计算障碍 | 人类肿瘤图谱网络（HTAN）生成的多模态癌症数据，包括单细胞转录组学、蛋白质组学、多重成像数据以及临床数据 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞转录组学、蛋白质组学、多重成像 | NA | 单细胞数据、空间数据、临床数据、图像数据 | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | Google BigQuery | 基于Google BigQuery的云基础设施，托管于系统生物学研究所癌症云网关（ISB-CGC） | |
| 1805 | 2026-01-04 |
The acute myeloid leukemia microenvironment impairs neutrophil maturation and function through NF-κB signaling
2025-Oct-02, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024028199
PMID:40663784
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研究论文 | 本文通过小鼠模型和单细胞转录组学，揭示了急性髓系白血病（AML）微环境通过NF-κB信号通路损害中性粒细胞成熟和功能，导致免疫抑制和感染易感性 | 首次使用非照射中性粒细胞报告小鼠模型，结合单细胞转录组学和体外细胞因子筛选，系统阐明了AML微环境如何通过NF-κB信号通路影响中性粒细胞成熟和功能，并发现其免疫抑制能力 | 研究主要基于小鼠模型，虽然患者数据支持类似生物学现象，但人类AML的异质性可能未被完全覆盖，且机制细节如特定细胞因子作用需进一步验证 | 探究AML微环境对健康中性粒细胞成熟和功能的影响，以解释患者中性粒细胞减少和感染易感性的机制 | AML暴露的中性粒细胞（来自小鼠模型和患者样本） | 血液肿瘤学 | 急性髓系白血病 | 单细胞转录组学，体外细胞因子筛选，染色质重塑分析，基序发现 | NA | 转录组数据，染色质数据 | 小鼠模型和患者样本（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1806 | 2026-01-04 |
Single-Cell and Spatial Transcriptomics Reveal a Tumor-Associated Macrophage Subpopulation that Mediates Prostate Cancer Progression and Metastasis
2025-Jul-02, Molecular cancer research : MCR
IF:4.1Q2
DOI:10.1158/1541-7786.MCR-24-0791
PMID:40105746
|
研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和多重免疫荧光数据，揭示了前列腺癌中肿瘤相关巨噬细胞（TAM）的异质性，并识别出一个与转移相关的SPP1+/TREM2+ TAM亚群 | 首次整合单细胞和空间转录组学数据，识别出SPP1+/TREM2+ TAM亚群在前列腺癌转移中的关键作用，并验证其作为治疗靶点的潜力 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本，需要更大规模临床验证；SPP1阻断策略的长期疗效和安全性未充分评估 | 探究前列腺癌中肿瘤相关巨噬细胞的异质性及其在肿瘤进展和转移中的作用机制 | 人类前列腺癌患者样本、小鼠前列腺癌模型（RM1模型） | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、免疫荧光图像 | 人类患者样本和小鼠模型样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1807 | 2026-01-04 |
Pseudoassembly of k-mers
2025-May-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.11.653354
PMID:40463286
|
研究论文 | 本文介绍了一种通过彩色de Bruijn图识别基因组序列变异的方法，并实现了名为klue的程序 | 提出了一种基于k-mer伪组装的方法，用于识别单细胞RNA-seq数据中的细胞类型特异性变异 | NA | 开发一种识别基因组序列变异的新方法 | 小鼠黑色素瘤模型中的单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA-seq | 彩色de Bruijn图 | 基因组序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1808 | 2026-01-04 |
Microglia depletion reduces human neuronal APOE4-related pathologies in a chimeric Alzheimer's disease model
2025-Jan-02, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2024.10.005
PMID:39500314
|
研究论文 | 本研究通过在小鼠海马中移植人类iPSC来源的神经元，并利用小胶质细胞耗竭技术，探讨了小胶质细胞对神经元APOE4相关阿尔茨海默病病理的影响 | 首次在嵌合模型中结合神经元APOE基因型和小胶质细胞耗竭，揭示了APOE4与小胶质细胞协同促进Aβ和tau病理形成的机制 | 研究基于嵌合小鼠模型，可能不完全反映人类AD的复杂环境；样本量未明确说明 | 探究小胶质细胞在神经元APOE4相关阿尔茨海默病病理形成中的作用 | 人类iPSC来源的神经元（APOE4、APOE3和APOE-KO基因型）移植到人类APOE3或APOE4敲入小鼠海马中 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 嵌合小鼠模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1809 | 2026-01-04 |
Histopathologic Analysis of Human Kidney Spatial Transcriptomics Data: Toward Precision Pathology
2025-Jan, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2024.06.011
PMID:39097165
|
研究论文 | 本研究通过形态学方法分析人类肾脏空间转录组学数据，旨在推进精准病理学的发展 | 首次将基于形态学的分析方法应用于人类肾脏空间转录组学数据，以病理学为基础识别聚类，并成功投影到其他样本中 | 仅基于单一人类肾脏样本进行建模，未涉及大规模验证或多种疾病状态的比较 | 探索基于形态学的空间转录组学数据分析方法，以提升对慢性肾脏病病变机制的理解 | 人类肾脏组织样本，包括健康与疾病状态 | 数字病理学 | 慢性肾脏病 | 空间转录组学 | NA | 图像与空间转录组学数据 | 单个人类肾脏样本，并扩展到肾切除或针吸活检样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1810 | 2026-01-04 |
Spatial Transcriptomics: Integrating Morphology and Molecular Mechanisms of Kidney Diseases
2025-Jan, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2024.06.012
PMID:39097166
|
综述 | 本文综述了空间转录组学技术在肾脏疾病研究中的应用，整合形态学与分子生物学以提升对组织生物学和疾病机制的理解 | 整合了空间转录组学技术与肾脏疾病研究，强调了高分辨率空间技术在生命科学中的革命性潜力 | NA | 探讨空间转录组学技术在肾脏疾病研究中的科学和潜在医学价值 | 肾脏疾病 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1811 | 2026-01-04 |
Differential TGF-β1/SMAD4 Signaling Regulates PMN-MDSC Differentiation and Reshapes the Immune Microenvironment in Breast Cancer
2025, Breast cancer (Dove Medical Press)
DOI:10.2147/BCTT.S566995
PMID:41476671
|
研究论文 | 本研究探讨了TGF-β1/SMAD4信号通路如何调节多形核髓源性抑制细胞的分化并重塑乳腺癌免疫微环境 | 结合单细胞RNA测序与空间转录组学分析乳腺癌组织中中性粒细胞亚群的异质性，并揭示了TGF-β1在正常与荷瘤小鼠中对PMN-MDSC分化的差异调控作用 | 需要进一步在临床环境中验证TGF-β1通路作为治疗靶点的疗效 | 阐明TGF-β1/SMAD4信号通路调控PMN-MDSC分化及调节乳腺癌免疫微环境的机制 | 乳腺癌组织中的中性粒细胞亚群、4T1小鼠乳腺癌转移模型及脾源性造血干细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, RNA测序, 流式细胞术, Western blotting | NA | 基因表达谱, 图像 | 使用GSE176078数据集及建立的4T1小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1812 | 2026-01-04 |
Inhibitors of KAT2A Alleviate the Progression of AKI by Alleviating Macrophage Ferritinophagy
2025, ImmunoTargets and therapy
IF:6.2Q1
DOI:10.2147/ITT.S568586
PMID:41476772
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫荧光技术，揭示了组蛋白乙酰转移酶KAT2A通过调控NCOA4介导的巨噬细胞铁蛋白自噬和cGAS-STING炎症信号通路，促进急性肾损伤（AKI）的进展，并发现KAT2A抑制剂MB-3可减轻AKI的病理变化 | 首次阐明了KAT2A在AKI中通过调节巨噬细胞铁蛋白自噬和cGAS-STING信号通路的作用机制，并验证了KAT2A抑制剂MB-3的治疗潜力 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系实验，人类样本验证有限，且MB-3的长期疗效和安全性尚未在临床中评估 | 探究KAT2A在急性肾损伤（AKI）进展中的作用机制，并评估其作为治疗靶点的潜力 | 小鼠肾脏组织、RAW264.7巨噬细胞系、人类AKI活检样本 | 单细胞测序与分子病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序、免疫荧光染色、基因敲低与过表达 | NA | 单细胞RNA测序数据、免疫荧光图像 | 未明确样本数量，涉及小鼠模型、细胞系和人类活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1813 | 2026-01-04 |
IL-18 receptor axis in allergic conjunctivitis: a multi-omics study
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1704591
PMID:41476961
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研究论文 | 本研究通过整合多组学策略，揭示了过敏性结膜炎中IL-18受体/IFN-γ轴在NK细胞和T细胞中的作用及其与疾病严重程度的相关性 | 首次通过整合人类GWAS数据、小鼠单细胞RNA测序和体内验证，系统性地将IL-18受体信号轴与过敏性结膜炎的病理机制和严重程度联系起来，超越了传统的Th2中心模型 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限；单细胞测序数据仅来自小鼠模型，未直接应用于人类患者样本 | 识别过敏性结膜炎相关的候选基因并描绘免疫通路，特别关注可能导致疾病异质性的细胞类型特异性机制 | 过敏性结膜炎患者（通过GWAS数据）和卵清蛋白诱导的过敏性结膜炎小鼠模型 | 数字病理学 | 过敏性结膜炎 | GWAS分析（FUSION, MAGMA, UTMOST）、单细胞RNA测序、qRT-PCR、Western blot | NA | 基因组数据、转录组数据、蛋白质数据 | 未明确说明具体样本数量，涉及人类GWAS数据和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1814 | 2026-01-04 |
Machine learning-derived cellular senescence index for predicting prognosis and drug sensitivity in patients with renal cell carcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1727099
PMID:41476960
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析识别肾透明细胞癌中的衰老细胞，并整合多种机器学习算法构建了一个仅含9个基因的衰老相关评分模型，用于预测患者预后和药物敏感性 | 结合十种机器学习算法生成101种组合模型，从中筛选出最优的Lasso-StepCox模型，构建了显著少于典型范围（15-30个基因）的最小化基因特征（仅9个基因），并基于此开发了衰老相关评分模型（SRSM） | 未明确说明样本量大小，且模型验证主要依赖于内部数据，需要进一步的外部验证 | 开发一个可量化的衰老相关评分模型，用于肾透明细胞癌患者的预后分层和治疗靶向 | 肾透明细胞癌（ccRCC）患者 | 机器学习 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | plsRcox, Ridge, Enet, CoxBoost, Lasso, StepCox, RSF, SuperPC, GBM, survivalSVM, Lasso-StepCox | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1815 | 2026-01-04 |
Single-cell analysis reveals shared adaptive responses across different types of podocyte injury
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1698284
PMID:41476974
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了不同肾脏疾病中足细胞损伤的异质性和共享适应性反应 | 首次整合多种肾脏疾病的单细胞数据，系统比较足细胞损伤机制，并识别出跨疾病的共享适应性反应路径 | 样本量相对有限，且主要基于转录组数据，功能验证不足 | 探究不同肾脏疾病中足细胞损伤的分子机制和共享适应性反应 | 人类肾脏组织中的足细胞及其他肾细胞 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 16个样本，共73,684个细胞，来自健康对照和IgA肾病、特发性膜性肾病、急性肾损伤患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1816 | 2026-01-04 |
Comparative single-cell analysis reveals IFN-γ as a driver of respiratory sequelae after acute COVID-19
2024-07-17, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adn0136
PMID:39018367
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研究论文 | 本研究通过比较临床PASC样本与小鼠模型的单细胞RNA测序数据，揭示了干扰素-γ是驱动急性COVID-19后呼吸系统后遗症的关键因素 | 首次在临床样本和动物模型中进行全面的比较单细胞分析，确定了IFN-γ信号轴在呼吸系统PASC中的核心作用，并通过功能实验验证了其致病机制 | 研究主要聚焦于呼吸系统后遗症，可能无法完全代表其他器官系统的PASC机制；动物模型与人类疾病的完全对应性存在局限 | 探究严重急性呼吸综合征冠状病毒2感染后急性后遗症（PASC）的病因和免疫机制 | 临床PASC患者的支气管肺泡灌洗液样本和PASC小鼠模型 | 单细胞组学 | COVID-19后遗症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 临床PASC样本和小鼠模型样本（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1817 | 2026-01-04 |
Ultrasound Neuromodulation of an Anti-Inflammatory Pathway at the Spleen Improves Experimental Pulmonary Hypertension
2024-Jun-21, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.123.323679
PMID:38712557
|
研究论文 | 本研究探讨了通过无创聚焦超声刺激脾脏（sFUS）调节脾神经的抗炎神经免疫通路，以改善实验性肺动脉高压 | 首次将非侵入性聚焦超声神经调控应用于脾脏，通过调节抗炎通路改善肺动脉高压，并揭示了其剂量依赖性和持续效应 | 研究基于大鼠实验模型，尚未在人类中进行验证，且长期安全性和具体机制需进一步探索 | 研究sFUS通过神经免疫通路治疗肺动脉高压的疗效和机制 | 使用Sugen/缺氧和野百合碱模型诱导肺动脉高压的大鼠 | NA | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫组织化学、超声心动图 | NA | 基因表达数据、细胞计数数据、组织学图像、血流动力学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1818 | 2026-01-03 |
Targeting neuronal cuproptosis and neuroinflammation with biomimetic nanoparticle for the therapy of radiotherapy-induced brain injury
2026-May, Biomaterials
IF:12.8Q1
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学识别神经元铜死亡在放疗性脑损伤中的关键作用，并构建了一种仿生纳米颗粒递送系统，用于双重负载铜死亡抑制剂UK5099和神经炎症抑制剂褪黑素，通过鼻-脑递送改善小鼠行为功能、减少脑水肿并提高神经元存活 | 首次揭示神经元铜死亡在放疗性脑损伤中的核心作用，并开发了一种基于巨噬细胞膜伪装的仿生纳米颗粒递送系统，实现双重靶向治疗 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未进行临床试验，且治疗机制的初步揭示可能需要进一步深入验证 | 开发针对放疗性脑损伤的新治疗靶点和有效药物递送平台 | 放疗性脑损伤小鼠模型 | 数字病理学 | 脑损伤 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1819 | 2026-01-03 |
Cationic nanoparticle targets cGAS-STING axis to drive functional orofacial muscle regeneration
2026-May, Biomaterials
IF:12.8Q1
|
研究论文 | 本研究利用阳离子纳米颗粒清除细胞游离DNA，调控损伤后微环境，从而促进口面部肌肉的功能性再生 | 首次提出并验证了通过阳离子纳米颗粒（MSN-PEI）清除cfDNA以调控cGAS-STING轴，从而驱动功能性口面部肌肉再生的新策略 | 研究基于小鼠冷冻诱导的咬肌损伤模型，其临床转化潜力及在人类其他肌肉类型中的适用性尚需进一步验证 | 探究cfDNA清除如何促进口面部肌肉再生，并影响微环境与肌肉卫星细胞之间的相互作用 | 小鼠口面部肌肉（咬肌）损伤模型、肌肉卫星细胞、巨噬细胞 | 再生医学与纳米医学 | 肌肉损伤与纤维化 | 单细胞RNA测序、组织学分析、功能分析、分子分析、转录组学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据、组织学图像、功能测量数据、分子信号数据 | 小鼠模型（具体数量未在摘要中明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1820 | 2026-01-03 |
Pro-osteogenic implants inhibit local excessive B cell maturation via neutrophils-derived CD52 signaling to enhance osseointegration
2026-May, Biomaterials
IF:12.8Q1
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了骨植入物周围免疫细胞的异质性，并强调了B细胞在骨整合中的关键作用，特别是通过中性粒细胞来源的CD52信号通路抑制B细胞成熟以增强骨整合 | 首次系统性地研究了B细胞在骨植入物介导的骨整合中的作用，并发现了中性粒细胞来源的CD52-SiglecG轴作为抑制B细胞成熟的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需进一步验证，且未深入探讨其他免疫细胞类型的潜在影响 | 探究骨植入物周围免疫微环境对骨整合的影响，特别是B细胞在其中的作用机制 | 小鼠胫骨植入模型中的免疫细胞，特别是B细胞和中性粒细胞 | 数字病理学 | 骨科疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |