单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 24273 篇文献，本页显示第 1801 - 1820 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1801 | 2024-11-23 |
Mouse enteric neurons control intestinal plasmacytoid dendritic cell function via serotonin-HTR7 signaling
2024-Oct-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53545-2
PMID:39455564
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研究论文 | 研究了肠道血清素能神经元通过血清素-HTR7信号通路调控肠道浆细胞样树突状细胞功能 | 揭示了肠道血清素能神经元与肠道免疫稳态之间的紧密相互作用，增强了黏膜防御 | NA | 探讨肠道血清素能神经元在免疫反应调控中的作用 | 肠道血清素能神经元、肠道浆细胞样树突状细胞、IgA B细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 1802 | 2024-11-23 |
The spatial impact of a Western diet in enriching Galectin-1-regulated Rho, ECM, and SASP signaling in a novel MASH-HCC mouse model
2024-Oct-14, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00660-3
PMID:39402682
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研究论文 | 研究西方饮食对Galectin-1调控的Rho、ECM和SASP信号在新型MASH-HCC小鼠模型中的空间影响 | 开发了一种新型MASH-HCC小鼠模型，并使用空间转录组学和多重免疫组化技术研究了西方饮食对Galectin-1信号的影响 | NA | 探讨西方饮食对Galectin-1信号在MASH向HCC进展中的影响 | MASH-HCC小鼠模型中的Galectin-1信号 | NA | 肝细胞癌 | 空间转录组学、多重免疫组化 | NA | 转录组数据、免疫组化数据 | 小鼠样本 |
| 1803 | 2024-11-23 |
Transcriptomic mapping of the 5-HT receptor landscape
2024-Oct-11, Patterns (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.patter.2024.101048
PMID:39569210
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和多重荧光原位杂交技术，对成年小鼠大脑中的5-HT受体进行了全面的转录组分析 | 首次在单细胞水平上揭示了5-HT受体的多样性分布和共转录现象 | NA | 研究5-HT受体在小鼠大脑中的转录模式和空间分布 | 5-HT受体及其在小鼠大脑中的表达 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、多重荧光原位杂交（MERFISH） | NA | 转录组数据 | 约400万细胞（scRNA-seq）和约1000万细胞（MERFISH） |
| 1804 | 2024-11-23 |
An Anterior Second Heart Field Enhancer Regulates the Gene Regulatory Network of the Cardiac Outflow Tract
2023-11-21, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 研究通过CRISPR-Cas9基因编辑技术删除心脏增强子，探讨其在心脏流出道基因调控网络中的作用 | 揭示了前第二心场增强子在连接GATA6与NKX2-5依赖的旋转和隔膜基因程序中的关键作用 | NA | 探讨心脏流出道发育异常的基因调控网络 | 心脏流出道、前第二心场增强子、GATA6、NKX2-5 | NA | 心血管疾病 | CRISPR-Cas9基因编辑、RNA测序、单细胞RNA测序、染色质免疫沉淀测序、转座酶可及染色质测序 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 小鼠模型、人类诱导多能干细胞衍生的心肌细胞 |
| 1805 | 2024-11-23 |
Single-Cell Integration of BMD GWAS Results Prioritize Candidate Genes Influencing Age-Related Bone Loss
2023-Oct, JBMR plus
IF:3.4Q2
DOI:10.1002/jbm4.10795
PMID:37808401
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研究论文 | 研究利用单细胞RNA测序数据整合骨密度全基因组关联研究结果，优先筛选影响年龄相关骨丢失的候选基因 | 通过单细胞RNA测序数据，揭示了候选基因在特定细胞类型中的表达特征，为骨密度维持提供了新的治疗靶点 | 主要基于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 研究年龄相关骨丢失的遗传机制，并筛选潜在的治疗靶点 | 骨密度相关基因及其在不同细胞类型中的表达 | 基因组学 | 骨骼疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 老年小鼠的骨髓和骨组织样本 |
| 1806 | 2024-11-23 |
Immunophenotypic correlates of sustained MRD negativity in patients with multiple myeloma
2023-09-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-40966-8
PMID:37660077
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研究论文 | 本研究探讨了多发性骨髓瘤患者在接受连续来那度胺维持治疗期间，免疫微环境在维持疾病缓解中的作用 | 利用单细胞RNA测序、T细胞受体β测序和CyTOF质谱流式细胞术，全面分析了23名新诊断的多发性骨髓瘤患者在接受来那度胺治疗前后的免疫景观变化 | 样本量较小，仅包括23名患者 | 旨在发现与长期治疗反应相关的免疫表型特征 | 新诊断的多发性骨髓瘤患者在接受来那度胺维持治疗期间的免疫微环境 | NA | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序、T细胞受体β测序、CyTOF质谱流式细胞术 | NA | RNA序列、T细胞受体序列、质谱流式细胞术数据 | 23名患者 |
| 1807 | 2024-11-23 |
Mammary duct luminal epithelium controls adipocyte thermogenic programme
2023-Aug, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06361-5
PMID:37495690
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研究论文 | 研究报告了乳腺导管上皮细胞在脂肪微环境中调节冷暴露诱导的小鼠皮下白色脂肪组织中脂肪细胞UCP1表达的作用 | 首次揭示了乳腺导管上皮细胞通过分泌因子'mammokines'调控脂肪细胞UCP1表达，并发现这些因子在性别特异性脂肪生成中的作用 | 研究主要集中在小鼠模型上，结果的普遍性和在人类中的适用性需要进一步验证 | 探讨乳腺导管上皮细胞在脂肪细胞UCP1表达调控中的作用及其在性别特异性脂肪生成中的意义 | 小鼠皮下白色脂肪组织中的乳腺导管上皮细胞和脂肪细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠皮下白色脂肪组织样本 |
| 1808 | 2024-11-23 |
SPICEMIX enables integrative single-cell spatial modeling of cell identity
2023-01, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-022-01256-z
PMID:36624346
|
研究论文 | 介绍了一种名为SPICEMIX的计算方法，用于整合单细胞空间转录组数据，以揭示细胞身份 | SPICEMIX基于概率潜变量建模，能够显著改进细胞类型及其空间模式的推断，优于现有方法 | NA | 开发一种能够利用空间转录组数据独特性质揭示细胞身份的计算方法 | 空间转录组数据中的细胞类型及其空间模式 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | 概率潜变量模型 | 基因表达数据 | 人类和小鼠脑区的空间转录组数据，通过seqFISH+、STARmap和Visium技术获取 |
| 1809 | 2024-11-23 |
RNase H-dependent PCR-enabled T-cell receptor sequencing for highly specific and efficient targeted sequencing of T-cell receptor mRNA for single-cell and repertoire analysis
2019-08, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-019-0195-x
PMID:31341290
|
研究论文 | 介绍了一种基于RNase H依赖的PCR技术进行T细胞受体测序的方法，用于单细胞和T细胞受体库分析 | 该方法通过RNase H依赖的PCR技术实现了T细胞受体的特异性扩增和双索引条码的添加，简化了工作流程，并提高了单细胞T细胞受体配对信息的成功率 | 与基于液滴的方法相比，该方法的通量较低，适用于分析小规模的排序细胞群体 | 开发一种高效且特异性的T细胞受体测序方法，用于单细胞和T细胞受体库分析 | T细胞受体（TCR）的α/β克隆型和T细胞受体库 | 基因测序 | NA | RNase H依赖的PCR（rhPCR） | NA | RNA | 单细胞或批量RNA样本，单细胞分析可处理384孔板中的细胞 |
| 1810 | 2024-11-22 |
Microglia phagocytosis of PNNs mediates PV-positive interneuron dysfunction and associated gamma oscillations in neuroinflammation-induced cognitive impairment in mice
2025-Jan-01, Neuropharmacology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.neuropharm.2024.110205
PMID:39489286
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研究论文 | 研究探讨了神经炎症通过小胶质细胞吞噬PNNs导致PV阳性中间神经元功能障碍和相关γ振荡，从而引发小鼠认知障碍的机制 | 首次揭示了小胶质细胞吞噬PNNs在神经炎症诱导的认知障碍中的关键作用，并提出ApoE可能介导这一过程 | 研究主要集中在小鼠模型上，结果的普适性有待进一步验证 | 探讨神经炎症导致认知障碍的具体机制 | 小鼠的认知功能、神经振荡、小胶质细胞基因表达 | 神经科学 | 认知障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | C57BL/6J小鼠和CX3CR1-CreERT2小鼠 |
| 1811 | 2024-11-22 |
Optimizing CAR-T cell Culture: Differential effects of IL-2, IL-12, and IL-21 on CAR-T cells
2024-Dec, Cytokine
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.cyto.2024.156758
PMID:39299100
|
研究论文 | 研究不同细胞因子（IL-2、IL-12和IL-21）对CAR-T细胞培养的影响 | 首次通过单细胞RNA测序分析不同细胞因子对CAR-T细胞生物过程的影响 | 研究仅限于体外实验，未涉及临床应用 | 优化CAR-T细胞培养条件，寻找最有效的细胞因子 | CAR-T细胞在不同细胞因子处理下的生物学过程 | 生物技术 | 血液恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多种CAR-T细胞组在不同处理下的样本 |
| 1812 | 2024-11-22 |
Exploring the Unknown: How Can We Improve Single-cell RNAseq Cell Type Annotations in Non-model Organisms?
2024-Nov-21, Integrative and comparative biology
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/icb/icae112
PMID:39013613
|
研究论文 | 本文探讨了如何改进非模式生物中单细胞RNA测序（scRNAseq）细胞类型注释的方法 | 提出了利用细胞谱系进化背景进行注释、使用机器学习进行无参考注释以及利用未注释基因作为潜在细胞标记的新方法 | 未具体讨论这些方法在实际应用中的效果和局限性 | 改进非模式生物中单细胞RNA测序的细胞类型注释，以发现新的细胞类型并提高注释的准确性 | 非模式生物中的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | 机器学习 | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量 |
| 1813 | 2024-11-22 |
A cell atlas foundation model for scalable search of similar human cells
2024-Nov-20, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08411-y
PMID:39566551
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研究论文 | 开发了一种名为SCimilarity的度量学习框架，用于学习统一的、可解释的细胞表示，以便快速查询数千万个细胞档案 | 提出了SCimilarity框架，能够跨研究快速查询转录相似的细胞状态 | NA | 开发一种能够跨人体快速查询相似细胞状态的工具 | 人类细胞的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 间质性肺病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 度量学习框架 | 单细胞RNA测序数据 | 2340万细胞，来自412项研究 |
| 1814 | 2024-11-22 |
CD38 ligation in sepsis promotes nicotinamide phosphoribosyltransferase-mediated IL-6 production in kidney stromal cells
2024-Nov-20, Nephrology, dialysis, transplantation : official publication of the European Dialysis and Transplant Association - European Renal Association
DOI:10.1093/ndt/gfae269
PMID:39568061
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研究论文 | 研究探讨了CD38在脓毒症中的作用及其对肾脏基质细胞IL-6产生的影响 | 首次揭示了CD38结合通过烟酰胺磷酸核糖基转移酶信号通路促进肾脏基质细胞中IL-6的产生 | 研究主要基于小鼠模型，需要在人体中进一步验证 | 阐明CD38结合在脓毒症中的作用，并寻找新的治疗靶点 | 小鼠和人类的脓毒症模型 | NA | 脓毒症 | 单细胞和单核RNA测序（scRNA-seq和snRNA-seq） | NA | RNA | 小鼠和人类脓毒症组织的样本 |
| 1815 | 2024-11-22 |
Serinc5 Regulates Sequential Chondrocyte Differentiation by Inhibiting Sox9 Function in Pre-Hypertrophic Chondrocytes
2024-Nov-20, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.31490
PMID:39568258
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研究论文 | 研究探讨了Serinc5在调节软骨细胞分化中的作用 | 首次揭示了Serinc5通过抑制Sox9功能在过渡期软骨细胞中调节软骨细胞分化的机制 | NA | 探究过渡期软骨细胞的分子基础及其在骨生长中的作用 | 软骨细胞的分化过程 | NA | NA | scRNA-seq, ChIP-seq, ATAC-seq | NA | 基因表达数据 | 荧光标记的生长板软骨细胞 |
| 1816 | 2024-11-22 |
Single-cell transcriptional analysis of murine norovirus infection in a human intestinal cell line
2024-Nov-19, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01617-24
PMID:39475272
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组分析探讨了在小鼠诺如病毒感染的人类肠细胞系中的复制机制和宿主反应 | 建立了表达小鼠诺如病毒受体的人类肠细胞系，并首次在单细胞水平上分析了病毒感染过程中的转录组变化 | 研究仅限于特定的人类肠细胞系和小鼠诺如病毒，可能不适用于其他病毒或细胞类型 | 探讨小鼠诺如病毒在人类肠细胞系中的复制机制和宿主反应 | 小鼠诺如病毒感染的人类肠细胞系 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个时间点的单细胞样本 |
| 1817 | 2024-11-22 |
Fibroblastic reticular cells generate protective intratumoral T cell environments in lung cancer
2024-Nov-19, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.10.042
PMID:39566495
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研究论文 | 研究揭示了成纤维网状细胞在肺癌肿瘤微环境中生成保护性肿瘤内T细胞环境的作用 | 首次展示了CCL19表达的成纤维网状细胞在人类非小细胞肺癌中生成互联的T细胞环境，并揭示了这些细胞在调节肿瘤内T细胞活性和分化中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型和单细胞转录组学分析，可能无法完全反映人类肺癌的复杂性 | 探讨成纤维网状细胞在肺癌肿瘤微环境中生成保护性T细胞环境的作用及其机制 | 成纤维网状细胞、T细胞、肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型和人类非小细胞肺癌样本 |
| 1818 | 2024-11-22 |
A single-cell transcriptomic census of mammalian olfactory epithelium aging
2024-Nov-18, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.07.020
PMID:39173624
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析年轻和老年小鼠嗅上皮细胞，识别出与衰老相关的差异表达基因 | 首次在单细胞分辨率下揭示了嗅上皮衰老的细胞和分子机制 | NA | 研究嗅上皮衰老的细胞和分子机制 | 年轻和老年小鼠的嗅上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 年轻和老年小鼠的嗅上皮细胞，涉及21种细胞类型 |
| 1819 | 2024-11-22 |
Integrated single-cell analysis reveals heterogeneity and therapeutic insights in osteosarcoma
2024-Nov-18, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01523-x
PMID:39556142
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术揭示了骨肉瘤的细胞异质性和转录动力学，并提供了个性化治疗策略的基础 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了骨肉瘤中11种不同的肿瘤细胞亚群及其与疾病进展和转移相关的独特转录特征 | NA | 深入了解骨肉瘤的分子机制，以改进治疗策略 | 骨肉瘤肿瘤细胞的异质性和转录动力学 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 1820 | 2024-11-22 |
Multi-omics analysis reveals the role of the autophagy-related gene AGT in chemotherapy resistance in colorectal cancer and the therapeutic potential of its inhibitors
2024-Nov-18, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01545-5
PMID:39557714
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研究论文 | 通过多组学分析探讨自噬相关基因AGT在结直肠癌化疗耐药中的作用及其抑制剂的治疗潜力 | 首次通过多组学分析揭示了自噬相关基因AGT在结直肠癌化疗耐药中的作用，并评估了其抑制剂的治疗潜力 | 研究主要基于数据库分析和模拟实验，缺乏体内实验验证 | 探讨自噬相关基因AGT在结直肠癌化疗耐药中的作用及其抑制剂的治疗潜力 | 自噬相关基因AGT在结直肠癌中的表达模式、功能及其与化疗耐药的关系 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 多组学分析、空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、药物敏感性数据、免疫浸润数据 | CRC组织和正常组织的基因表达数据来自GTEx和TCGA数据库，单细胞RNA测序数据来自TISCH数据库 |