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当前共找到 43167 篇文献,本页显示第 1781 - 1800 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1781 2026-08-21
Single-cell spatial transcriptomics reveals distinct patterns of dysregulation in non-neuronal and neuronal cells induced by the Trem2R47H Alzheimer's risk gene mutation
2025-02, Molecular psychiatry IF:9.6Q1
研究论文 本研究利用MERFISH空间转录组学技术,分析了Trem2R47H阿尔茨海默病风险基因突变对非神经元和神经元细胞中基因表达失调模式的影响 首次在单细胞和空间分辨率下,结合5xFAD小鼠模型,系统研究Trem2R47H突变对不同脑区神经元和胶质细胞转录组的独立影响,并揭示了神经元中Bdnf和Ntrk2的一致上调 摘要中未明确提及研究的局限性 探究Trem2R47H突变在不同遗传背景下对特定细胞类型(包括神经元和非神经元细胞)的空间转录组失调的影响 野生型、Trem2、5xFAD和Trem2;5xFAD基因型小鼠的19个脑组织切片 空间转录组学 阿尔茨海默病 MERFISH空间转录组学 NA 图像和空间基因表达数据 19个小鼠脑组织切片,涵盖野生型、Trem2、5xFAD和Trem2;5xFAD四种基因型 NA 空间转录组学 MERFISH MERFISH空间转录组学技术,用于亚细胞水平的空间基因表达分析
1782 2026-08-21
Spatial transcriptomic clocks reveal cell proximity effects in brain ageing
2025-02, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本研究构建了一个包含420万个细胞、跨越成年寿命20个不同年龄及两种年轻化干预的空间分辨单细胞转录组脑图谱,并开发了空间老化时钟来识别衰老、年轻化和疾病的时空及细胞类型特异性转录指纹。 首次利用空间转录组学构建脑衰老时钟,揭示T细胞和神经干细胞对邻近细胞的促衰老和促年轻化邻近效应,并识别潜在介导因子。 摘要未提及研究的局限性。 研究脑衰老过程中细胞邻近效应及其对组织衰退的影响,并开发工具评估干预措施的效果。 成年小鼠大脑,覆盖不同年龄及两种年轻化干预(运动和部分重编程)下的细胞。 空间转录组学 神经退行性疾病 空间转录组学、单细胞转录组学、机器学习(空间老化时钟)、深度学习 机器学习模型(空间老化时钟)、深度学习模型 空间转录组数据 420万个细胞,来自20个不同的年龄点及两种干预条件下的样本 NA 空间转录组学 NA NA
1783 2026-08-21
Microglia depletion reduces human neuronal APOE4-related pathologies in a chimeric Alzheimer's disease model
2025-01-02, Cell stem cell IF:19.8Q1
研究论文 本研究通过嵌合体模型,利用小胶质细胞耗竭技术,探究了小胶质细胞在神经元APOE4相关阿尔茨海默病病理中的作用 首次在嵌合体模型中结合小胶质细胞耗竭与人类iPSC来源神经元移植,揭示了神经元APOE4和小胶质细胞在AD病理形成中的协同作用,并通过单细胞RNA测序鉴定了APOE4相关的小胶质细胞亚型 研究限于小鼠模型,可能不完全反映人类AD的复杂性;未详细探讨小胶质细胞耗竭对其他细胞类型或长期效应的影响 阐明小胶质细胞对神经元APOE4相关AD病理的影响及其分子机制 携带APOE4、APOE3或APOE敲除的人类iPSC来源神经元,以及人类APOE3或APOE4敲入小鼠的小胶质细胞 神经科学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序 小鼠嵌合体模型 基因表达数据(单细胞转录组) 嵌合小鼠模型(具体数量未在摘要中提供) NA 单细胞RNA测序 NA NA
1784 2026-08-21
Single Cell Profiling in the Sox10Dom Hirschsprung Mouse Implicates Hox Genes in Enteric Neuron Trajectory Allocation
2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析Sox10Dom Hirschsprung小鼠模型,揭示了Hox基因在肠神经元轨迹分配中的作用。 首次将Hox基因(特别是Hoxa6)表达变化与肠神经元轨迹改变相关联。 未提供具体局限性信息。 探究Sox10缺陷如何改变早期肠神经系统发育中的神经元比例。 Sox10+/+和Sox10Dom/+小鼠胚胎的肠神经嵴衍生祖细胞、发育中的神经元和肠胶质细胞。 单细胞测序 Hirschsprung病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、免疫组织化学、杂交链式反应(HCR) NA 单细胞转录组数据 未提供具体样本数量 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1785 2026-08-21
CREB Drives Acinar to Ductal Cells Reprogramming and Promotes Pancreatic Cancer Progression in Preclinical Models of Alcoholic Pancreatitis
2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究探讨了CREB在实验性酒精性慢性胰腺炎小鼠模型中驱动腺泡细胞向导管细胞重编程并促进胰腺癌进展的机制 首次揭示了CREB与致癌性KrasG12D/+在慢性炎症条件下协同促进胰腺癌进展的分子机制,并通过腺泡细胞特异性敲除CREB验证其作为治疗靶点的潜力 研究主要基于小鼠模型,其结论在人类胰腺癌中的适用性需进一步验证 阐明慢性酒精性胰腺炎背景下CREB与KrasG12D/+在促进胰腺癌进展中的相互作用及机制 多种小鼠模型,包括Ptf1aCreERTM/+、KC(LSL-KrasG12D/+)和KCC-/-(Crebfl/fl)模型 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序、蛋白质印迹、磷酸激酶阵列、定量聚合酶链反应、谱系追踪 基因工程小鼠模型 测序数据、蛋白质表达数据、基因表达数据 涉及多种基因型小鼠,样本量未在摘要中明确说明 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序用于分析ACP诱导的KC小鼠
1786 2026-08-21
Brca1 haploinsufficiency promotes early tumor onset and epigenetic alterations in a mouse model of hereditary breast cancer
2024-Dec, Nature genetics IF:31.7Q1
研究论文 利用新的基因工程小鼠模型,揭示Brca1单倍剂量不足通过表观遗传改变促进遗传性乳腺癌早期发生。 首次证明Brca1杂合状态下的早期肿瘤发生不能完全由经典'二次打击'假说解释,并发现表观遗传预编程在肿瘤加速中的关键作用。 研究基于小鼠模型,其结果在人类中的适用性有待进一步验证。 阐明Brca1单倍剂量不足促进乳腺癌早期发生的机制。 Brca1杂合小鼠的乳腺上皮细胞及肿瘤细胞。 机器学习, 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序, ATAC测序 NA 基因组数据, 表观基因组数据 小鼠模型,涉及多个个体,具体数量未提供。 10x Genomics 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序和ATAC测序
1787 2026-08-21
A human embryonic limb cell atlas resolved in space and time
2024-11, Nature IF:50.5Q1
研究论文 利用单细胞和空间转录组学技术在空间和时间上详细描绘了人类胚胎肢体发育过程,揭示了细胞多样化和新的细胞群体,并绘制了胎儿后肢的空间转录图谱 首次对人类胚胎肢体发育进行跨空间和时间的单细胞与空间转录组综合分析,发现了多个新的细胞群体和两波肌肉发育过程,并利用新开发的VisiumStitcher工具拼接多个空间转录组样本 未提及具体局限性 深入表征人类胚胎肢体发育的细胞和分子机制,以填补模式生物之外的人类研究空白 人类胚胎肢体(包括上肢和下肢)及小鼠胚胎肢体 转录组学 先天性肢体畸形 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 单细胞转录组数据、空间转录组数据 未明确提及具体样本数量,但包括多个人类胚胎肢体样本和小鼠胚胎肢体样本 10x Genomics 单细胞RNA测序、空间转录组学 10x Chromium、10x Visium 10x Chromium单细胞转录组和10x Visium空间转录组,使用VisiumStitcher拼接多个空间样本
1788 2026-08-21
Proinflammatory immune cells disrupt angiogenesis and promote germinal matrix hemorrhage in prenatal human brain
2024-Nov, Nature neuroscience IF:21.2Q1
研究论文 该研究揭示了产前人类大脑中促炎免疫细胞破坏血管生成并促进生发基质出血的机制 首次发现小胶质细胞与新生血管的年龄依赖性相互作用,并证明在早产儿生发基质出血中,激活的中性粒细胞和单核细胞通过产生促炎因子破坏血管完整性 研究主要基于小鼠模型和早产儿样本,可能无法完全代表人类胎儿发育的复杂情况,且具体分子机制尚需进一步验证 探究生发基质出血的病因,特别是免疫细胞在血管生成和血管脆弱性中的作用 产前小鼠和人类大脑的生发基质,以及CD45免疫细胞 神经科学 生发基质出血 单细胞转录组学,流式细胞术 NA 基因表达数据 包含正常早产儿和生发基质出血早产儿的CD45细胞样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium NA
1789 2026-08-21
MultiSC: a deep learning pipeline for analyzing multiomics single-cell data
2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 MultiSC是一个用于分析多组学单细胞数据的深度学习流程,通过整合基因表达、染色质可及性和转录因子蛋白表达,实现细胞聚类和基因调控网络预测 提出了一种新颖的多模态约束自编码器(单细胞层次约束自编码器)用于聚类过程中的多组学数据整合 未提及 填补多组学单细胞数据分析工具缺乏的空白,提供综合性的分析流程 多组学单细胞数据(以NEAT-seq为例) 机器学习 NA 单细胞测序 自编码器、矩阵分解模型、多元线性回归模型 基因表达、染色质可及性、蛋白质表达数据 NA NA 单细胞多组学 NA NA
1790 2026-08-21
Knocking Out CD70 Rescues CD70-Specific NanoCAR T Cells from Antigen-Induced Exhaustion
2024-09-03, Cancer immunology research IF:8.1Q1
研究论文 该研究通过敲除CD70基因,挽救了CD70特异性纳米CAR T细胞免受抗原诱导的耗竭,显著增强了其在弥漫性大B细胞淋巴瘤PDX模型中的功能 首次发现CD70特异性纳米CAR T细胞的耗竭是由CD70与CAR的顺式相互作用引起的,而非自相残杀;通过CRISPR/Cas9敲除CD70可防止抗原诱导的耗竭,提高治疗效果 研究主要在体外类器官和PDX模型中进行,可能需要进一步的临床试验验证;未深入探讨CD70敲除对T细胞其他功能的影响 优化CD70特异性纳米CAR T细胞的功能,并克服其抗原诱导的耗竭问题 CD70特异性纳米CAR T细胞,恶性横纹肌样肿瘤类器官,弥漫性大B细胞淋巴瘤PDX模型 免疫治疗 弥漫性大B细胞淋巴瘤 CRISPR/Cas9基因敲除,单细胞转录组学 纳米CAR(VHH-based CAR) 单细胞转录组数据 体外共培养(类器官)和体内PDX模型,具体样本量未提及 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 单细胞转录组测序
1791 2026-08-21
Single-cell genomic profiling to study regeneration
2024-08, Current opinion in genetics & development IF:3.7Q2
综述 本文综述了近年来单细胞转录组等单细胞分析技术在多种动物模型再生研究中的应用,并总结了关于再生机制的关键概念。 系统梳理了不同物种和细胞类型中再生的细胞和分子机制,强调了再生与发育的差异及再生特异性细胞类型和基因调控网络。 未提及具体局限性,可能受限于综述范围和涵盖的研究深度。 总结单细胞基因组分析在再生研究中的最新进展,并提炼核心概念。 多种动物模型,包括涡虫等无脊椎动物及不同细胞类型和器官。 单细胞基因组学 NA 单细胞转录组学、单细胞分析技术 NA 单细胞基因表达数据 NA NA 单细胞转录组学 NA NA
1792 2026-08-21
Characterisation of HBV and co-infection with HDV and HIV through spatial transcriptomics
2024-Aug, eGastroenterology
研究论文 通过空间转录组学技术研究了慢性乙肝患者合并丁型肝炎病毒或人类免疫缺陷病毒共感染时的肝内转录组景观、细胞组成和生物学通路 首次应用空间转录组学方法对HBV与HDV或HIV共感染的肝活检样本进行表征,揭示了空间离散的转录组特征和共感染特异性的生物学通路 样本量小(仅3名患者),属于概念验证研究,结果需在更大队列中验证 评估空间转录组学在表征HBV及其与HDV或HIV共感染的肝内转录组、细胞组成和生物学通路中的价值 慢性乙肝合并HDV或HIV共感染的三名未接受治疗患者的肝活检样本 空间转录组学 慢性乙型肝炎、丁型肝炎病毒共感染、人类免疫缺陷病毒共感染 空间转录组学(NanoString GeoMx数字空间分析) 加权基因共表达网络分析(WGCNA) 空间转录组数据 3例肝活检样本 NanoString 空间转录组学 GeoMx Human Whole Transcriptome Atlas NanoString GeoMx数字空间分析平台,使用FFPE组织,检测HBsAg和CD45表达
1793 2026-08-21
Single-cell transcriptional analysis of irradiated skin reveals changes in fibroblast subpopulations and variability in caveolin expression
2024-Jun-26, Radiation oncology (London, England)
研究论文 该研究通过单细胞转录组学分析受辐射与未受辐射的人类皮肤样本,揭示成纤维细胞亚群的变化及窖蛋白表达的变异性,为辐射诱导纤维化的机制提供了新见解。 首次在单细胞水平上识别出辐射皮肤中成纤维细胞的五个不同转录簇,并发现仅一个簇特异性表达Cav2,提示Cav1和Cav2可能对抗性调节纤维化反应。 研究样本量较小(仅六名患者),且主要基于观察性分析,未进行功能验证实验来确认Cav2在纤维化中的直接作用。 通过组织学与单细胞转录组分析,识别辐射诱导纤维化发展中的新型特征,以指导未来治疗策略的制定。 六名接受肿瘤切除术后乳房重建的女性患者的成对辐射与对侧非辐射皮肤样本。 单细胞转录组学 辐射诱导纤维化 单细胞RNA测序、组织学评估、免疫组化、生物力学测试 Seurat聚类、SingleR分类器 单细胞转录组数据、组织图像、力学数据 12个皮肤样本(来自6名患者,每位患者配对的辐射与非辐射样本) 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x单细胞平台(具体配置未在摘要中提供)
1794 2026-08-21
PIK3CA inhibition in models of proliferative glomerulonephritis and lupus nephritis
2024-06-06, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本研究通过基因工程小鼠模型、单细胞RNA测序和空间转录组学揭示PIK3CA在增殖性肾小球肾炎和狼疮性肾炎中的关键作用,并展示PI3Kα抑制剂alpelisib的治疗效果 首次发现体细胞PIK3CA功能获得性突变在足细胞中的作用,并证明PI3Kα抑制剂alpelisib不仅靶向足细胞,还影响淋巴细胞功能,这在狼疮性肾炎中尤为重要 研究主要基于小鼠模型,人类验证仅限于来自活动性狼疮性肾炎患者的淋巴细胞,可能无法完全反映人类疾病的复杂性 探究PIK3CA通路在增殖性肾小球肾炎和狼疮性肾炎发病机制中的作用,并评估PI3Kα抑制剂alpelisib的治疗潜力 增殖性肾小球肾炎和狼疮性肾炎的小鼠模型及人类淋巴细胞 数字病理学 肾小球肾炎 单细胞RNA测序, 空间转录组学 基因工程小鼠模型 基因表达数据, 组织切片 多个基因工程小鼠模型及人类淋巴细胞样本(具体数量未在摘要中说明) 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium FFPE
1795 2026-08-21
RIPK1 protects naive and regulatory T cells from TNFR1-induced apoptosis
2024-06, Cell death and differentiation IF:13.7Q1
research paper 本研究揭示了RIPK1作为支架蛋白在维持外周T细胞稳态中的关键作用,并通过条件敲除小鼠模型证明其缺失导致T细胞通过TNF和caspase-8介导的凋亡而死亡 首次证明不同外周T细胞亚群对RIPK1的需求存在差异,并明确了RIPK1缺失导致T细胞凋亡的具体信号通路 研究主要在动物模型中进行,未涉及人类样本验证 探究RIPK1在不同外周T细胞亚群存活中的具体作用及其介导的细胞死亡途径 小鼠外周T细胞亚群,包括naive CD4、naive CD8和FoxP3调节性T细胞 免疫学 自身免疫性疾病 条件性基因敲除、单细胞RNA测序 基因敲除小鼠模型 转录组数据(单细胞RNA测序数据) 未明确提及,涉及多种小鼠模型 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
1796 2026-08-21
ALKBH5-mediated m6A modification of IL-11 drives macrophage-to-myofibroblast transition and pathological cardiac fibrosis in mice
2024-03-05, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学等揭示了ALKBH5介导的IL-11 mRNA m6A去甲基化促进巨噬细胞向肌成纤维细胞转变及高血压性心脏纤维化的机制 首次发现ALKBH5通过m6A去甲基化稳定IL-11 mRNA,驱动巨噬细胞向肌成纤维细胞转变,并验证靶向递送siRNA可缓解心脏纤维化 研究基于小鼠模型,结果需在人类中验证;未详细探讨其他RNA修饰或细胞类型的作用 阐明心脏巨噬细胞在纤维化中转变的调控机制,并探索治疗靶点 小鼠心脏巨噬细胞、循环单核细胞、Ang II诱导的高血压心脏纤维化模型 单细胞转录组学 心脏纤维化 单细胞RNA测序、谱系追踪、连体共生、RNA免疫沉淀测序 NA 单细胞转录组数据、RNA测序数据 小鼠模型,具体样本数未在摘要中说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1797 2026-08-21
5 signature genes revealed by single-cell profiling identified unique immune subtypes affecting the prognosis of ovarian cancer
2024-03, European review for medical and pharmacological sciences
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序识别出5个预后相关基因,并据此将卵巢癌患者划分为不同免疫亚型,以评估其预后及对免疫治疗和化疗的反应 利用单细胞RNA测序数据识别出5个预后关键基因(IGFBP7、JCHAIN、CCDC80、VSIG4、MS4A1),并通过无监督共识聚类将患者分为不同预后亚型,为卵巢癌的免疫治疗和化疗反应预测提供了新的生物标志物和分型方法 研究主要基于公共数据库(TIGER、TCGA、TIMER等),缺乏外部独立验证;且为回顾性分析,需进一步前瞻性临床研究验证其应用价值 识别卵巢癌中预测预后的基因特征并建立预后亚型,以指导免疫治疗和化疗的临床决策 卵巢癌患者 基因组学 卵巢癌 单细胞RNA测序 无监督共识聚类 基因表达数据 TCGA-OV患者样本(具体数量未在摘要中提及) NA 单细胞RNA测序 NA NA
1798 2026-08-21
Quantifying the clusterness and trajectoriness of single-cell RNA-seq data
2024-02, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 提出多个评分来量化单细胞RNA-seq数据的“聚类性”和“轨迹性”,以指导分析选择 首次提出基于多种数学方法(如距离分布、持续同调、向量幅度、Ripley's K和连通度)的评分体系,客观评估数据更偏向聚类还是轨迹 评分在模拟和真实数据上验证,但未详细讨论对复杂或噪声数据的鲁棒性 开发量化单细胞RNA-seq数据聚类性和轨迹性的评分方法,帮助研究者选择更合适的分析策略 模拟数据集和真实单细胞RNA-seq数据集 机器学习 NA 单细胞RNA-seq NA 基因表达数据 未明确具体样本数量,包括模拟数据和真实单细胞RNA-seq数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1799 2026-08-21
A novel batch-effect correction method for scRNA-seq data based on Adversarial Information Factorization
2024-02, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 提出一种基于对抗信息分解的scRNA-seq数据批次效应校正方法,无需细胞类型先验或特定标准化策略,适用于多种下游分析。 提出Adversarial Information Factorization方法,不依赖细胞类型先验知识或特定标准化策略,在低信噪比、批次特异性细胞类型、多批次不均衡等场景中表现优于现有方法,且能最好地保留细胞类型间相对基因表达,提升差异表达分析结果。 摘要未提及明显的局限性。 开发一种鲁棒的批次效应校正方法,以消除scRNA-seq数据中的批次效应,支持聚合下游分析。 scRNA-seq数据集,包括模拟场景和白血病队列。 机器学习 白血病 scRNA-seq 对抗网络(Adversarial Network) 基因表达数据(单细胞RNA测序数据) 未明确提及具体样本数量,提及多个模拟场景和一个白血病队列。 NA scRNA-seq NA NA
1800 2026-08-21
Interleukin 13 Promotes Maturation and Proliferation in Metaplastic Gastroids
2024, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究建立Meta1胃类器官模型,探究IL-13对化生性SPEM细胞成熟和增殖的促进作用及其分子机制 首次建立可靠的Meta1胃类器官模型,并揭示IL-13通过STAT6信号通路促进SPEM细胞成熟与增殖 未提及具体局限性 阐明IL-13在SPEM细胞成熟和增殖中的分子效应,并建立体外模型 Mist1-Kras转基因小鼠的化生胃类器官、IL-13-tdTomato报告小鼠的ILC2细胞、人类化生胃类器官 分子生物学 胃化生 单细胞RNA测序、细胞分选、三维共培养、空气-液体界面培养、STAT6抑制 类器官模型 基因表达数据、细胞图像 小鼠类器官及人类化生胃类器官,具体数量未提及 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 单细胞RNA测序平台,具体配置未提及
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