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当前共找到 43167 篇文献，本页显示第 1761 - 1780 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1761 | 2026-08-21 |
Gut microbial Nordihydroguaiaretic acid suppresses macrophage pyroptosis to regulate epithelial homeostasis and inflammation
2025-12, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2025.2518338
PMID:40596758
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研究论文 | 本研究探讨了肠道微生物产生的去甲二氢愈创木酸通过抑制巨噬细胞焦亡来调节上皮稳态和炎症的机制 | 首次揭示衰老相关的菌群失调导致NDGA减少，进而通过GSDMD/NR4A1/NLRP3轴调控巨噬细胞焦亡，加重结肠炎 | 未明确NDGA对巨噬细胞焦亡的具体分子机制，且研究主要在动物模型中进行，临床验证有限 | 探究衰老相关的肠道菌群失调及其代谢物在加重炎症性肠病中的作用和机制 | 小鼠模型（野生型和IL-10缺陷）、IBD患者和老年人粪便样本 | 微生物组学 | 炎症性肠病 | 16S rDNA测序、代谢组学、单细胞RNA测序 | NA | 微生物序列数据、代谢物数据、单细胞转录组数据 | 小鼠（具体数量未提供）、IBD患者和老年人（具体数量未提供） | NA | 16S rDNA测序、代谢组学、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1762 | 2026-08-21 |
Non-cell-autonomous control of mouse gastruloid development by the ultra-conserved lncRNA T-UCstem1
2025-Dec, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-025-00558-2
PMID:41174250
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研究论文 | 本研究探讨了超保守长链非编码RNA T-UCstem1在小鼠胃类器官发育和前后轴延伸中的作用，揭示了其通过非细胞自主方式调控DKK1依赖的WNT信号通路。 | 首次发现超保守lncRNA T-UCstem1在小鼠胃类器官发育中的新功能，并阐明其通过非细胞自主方式调控WNT通路，为研究lncRNA在早期发育中的作用提供了新模型。 | 研究依赖于胃类器官模型，可能无法完全反映体内胚胎发育的复杂性；机制研究局限于WNT通路，其他潜在机制未深入探索。 | 阐明超保守lncRNA T-UCstem1在哺乳动物体轴形成中的作用及其分子机制。 | 小鼠胃类器官以及T-UCstem1敲低后的胃类器官细胞。 | 发育生物学、转录组学 | 不适用 | 形态学分析、免疫荧光成像、批量RNA测序、单细胞RNA测序 | 不适用 | 图像（形态学和免疫荧光）、转录组数据（批量RNA-seq和单细胞RNA-seq） | 包含多个胃类器官样本，具体数量未明确，涉及对照和T-UCstem1敲低组。 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | 10x Chromium、Illumina测序平台 | 10x Chromium用于单细胞RNA-seq，Illumina平台用于批量RNA-seq，具体配置未详述 |
| 1763 | 2026-08-21 |
Stereo cell: A new approach to the next generation of clinical precision medicine
2025-12, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70537
PMID:41316703
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评论 | 本文提出“立体细胞生物医学”作为下一代精准医学的新方法，强调从基因组数据转向单细胞的多维时空复杂性。 | 提出“立体细胞生物医学”这一新兴学科，整合立体单细胞多组学、空间转录组学和单细胞表面组学，强调分子时空位置和蛋白质相互作用的重要性。 | 摘要未明确提及局限性，但作为评论文章，可能缺乏实验验证。 | 探讨立体细胞生物医学作为下一代精准医学的新方法，促进精准医学发展。 | 单细胞、组织中的细胞间相互作用以及细胞器界面和细胞表面的蛋白质。 | 生物信息学 | 不适用的 | 立体单细胞多组学（Stereo Cell-seq）、空间转录组学（Stereo-seq）、单细胞表面组学（sc-surfaceome） | 不适用的 | 单细胞数据、空间转录组数据、表面组数据 | 不适用的 | 不适用的 | 单细胞多组学、空间转录组学、单细胞表面组学 | 不适用的 | 不适用的 |
| 1764 | 2026-08-21 |
Evolution and Co-occurrence of PI3K Pathway Gene Mutations in Endometrial Carcinoma Molecular Subtypes at the Single-Cell Level
2025-Nov-14, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-1237
PMID:40833784
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序技术，探讨子宫内膜样癌分子亚型中PI3K通路基因突变（PTEN、PIK3CA、PIK3R1）的进化起源及共现模式，发现不同亚型具有不同的进化方式和克隆多样性 | 首次在单细胞水平上分析子宫内膜癌不同分子亚型中PI3K通路基因共现突变的进化模式，区分了线性进化与趋同进化，并揭示了亚型间克隆异质性的显著差异 | 探索性研究，样本量小（n=11），结果需进一步验证，且未分析信号输出及PI3K抑制剂反应 | 确定子宫内膜癌分子亚型中共现PTEN、PIK3CA和/或PIK3R1体细胞突变是否通过趋同或线性进化产生，以解释PI3K通路抑制剂疗效有限的原因 | 11例冷冻子宫内膜样癌样本（NSMP n=5，MMRd n=3，POLE n=3）及非恶性对照样本 | 基因组学, 单细胞测序 | 子宫内膜癌 | 单细胞DNA测序 | NA | 单细胞DNA测序数据 | 11例肿瘤样本，共50,009个单细胞 | NA | 单细胞DNA测序 | NA | NA |
| 1765 | 2026-08-21 |
Advances in artificial intelligence for spatial transcriptomics in cancer: Special focus on Yin Yang 1 (YY1) and Raf kinase inhibitor protein (RKIP)
2025-11, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2025.189456
PMID:40992707
|
综述 | 本文综述了人工智能在癌症空间转录组学中的进展，特别关注YY1和RKIP在癌症研究中的应用。 | 聚焦于YY1和RKIP，展示了机器学习和人工智能在空间转录组学中的具体应用案例，并讨论了监督和无监督学习方法的最新进展。 | 未提及具体的局限性。 | 探讨人工智能和机器学习在癌症空间转录组数据分析中的应用，以及个性化医疗的潜在途径。 | 癌症基因表达数据，特别是涉及YY1和RKIP的研究。 | 机器学习 | 癌症 | 空间转录组学 | 支持向量机（SVM）、随机森林（RF）、PCA、t-SNE、UMAP | 基因表达数据 | 未指定 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1766 | 2026-08-21 |
Single-cell landscape of the tumour immune microenvironment in human gynaecologic malignancies
2025-11, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70538
PMID:41275425
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研究论文 | 通过整合公共单细胞RNA测序数据，系统分析了人类妇科恶性肿瘤（输卵管卵巢癌、子宫内膜癌和宫颈癌）的肿瘤免疫微环境，揭示了免疫细胞亚群的组成和功能。 | 首次对三种常见妇科恶性肿瘤的免疫微环境进行系统性单细胞水平分析，识别出与临床结局相关的特定巨噬细胞亚群和T细胞状态，并确认了CXCL9/10/11介导的T细胞招募机制。 | 本研究基于公共数据，可能受数据来源异质性的影响；未涉及功能验证实验，且样本类型和数量有限。 | 系统表征妇科恶性肿瘤的肿瘤免疫微环境，以发现免疫治疗靶点并改善临床预后。 | 来自111个肿瘤和非恶性组织样本的272,389个CD45+免疫细胞。 | 单细胞组学 | 妇科恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 111个组织样本，272,389个CD45+免疫细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1767 | 2026-08-21 |
Myocardial reprogramming by HMGN1 underlies heart defects in trisomy 21
2025-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09593-9
PMID:41125893
|
研究论文 | 本研究通过人类多能干细胞和小鼠模型，识别HMGN1作为21三体综合征（唐氏综合征）中先天性心脏缺陷的关键贡献者，并揭示其在房室管心肌细胞重编程中的作用 | 首次将HMGN1确定为21号染色体上剂量敏感的心脏发育调节因子，利用CRISPR激活单细胞RNA测序筛选和单细胞转录组学揭示三体21诱导的心肌细胞状态转变，并通过等基因系统提供了解析非整倍体致病机制的范例 | 摘要未明确说明研究的局限性 | 识别唐氏综合征相关先天性心脏缺陷的剂量敏感基因，并阐明其致病机制 | 人类多能干细胞、小鼠模型及房室管心肌细胞 | 转录组学、表观遗传学、心血管发育生物学 | 唐氏综合征相关先天性心脏缺陷 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、CRISPR激活单细胞RNA液滴测序（CROP-seq） | 人类多能干细胞模型、小鼠模型（非深度学习模型） | 单细胞转录组数据 | 未明确提供样本数量，涉及人类多能干细胞和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序、CRISPR激活筛选 | NA | NA |
| 1768 | 2026-08-21 |
Glutamine synthetase loss in β-catenin-mutant hepatocellular carcinoma promotes tumor burden through macrophage metabolic reprogramming
2025-Oct-23, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001591
PMID:41129335
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研究论文 | 本研究探讨了β-catenin突变肝细胞癌中谷氨酰胺合成酶缺失如何通过巨噬细胞代谢重编程促进肿瘤负担 | 首次揭示了β-catenin突变肝细胞癌对肿瘤细胞中谷氨酰胺合成酶的独特代谢依赖性，并发现其缺失后代谢需求转移至巨噬细胞，改变巨噬细胞代谢和功能，导致免疫监视受损和肿瘤负担增加 | 研究主要基于小鼠模型和TCGA数据，需要进一步在人类样本中验证，且未完全阐明所有下游分子机制 | 探究β-catenin突变肝细胞癌中谷氨酰胺合成酶缺失对肿瘤进展的影响及其代谢机制 | β-catenin突变肝细胞癌肿瘤细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞空间转录组学、条件性基因敲除、TCGA数据分析 | NA | 转录组数据、空间转录组数据、图像 | TCGA中CTNNB1突变HCC患者样本及小鼠模型样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
| 1769 | 2026-08-21 |
Elucidating cellular origins and TME dynamic evolution in NSCLC through multi-omics technologies
2025-10, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2025.189425
PMID:40840819
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综述 | 本文通过多组学技术解析非小细胞肺癌的细胞起源和肿瘤微环境动态演变，并探讨其临床转化潜力 | 整合单细胞和空间转录组学揭示肺腺癌的AT2细胞起源及SOX2/WNT/YAP通路驱动的谱系可塑性，并识别微环境中免疫亚群和成纤维细胞亚型作为治疗靶点，提出AI驱动的TME建模新策略 | 未详细讨论多组学技术整合中的技术异质性、样本量有限及临床验证不足等局限 | 阐述多组学技术在揭示NSCLC肿瘤异质性和微环境动态中的作用，以指导个性化治疗和克服耐药 | 非小细胞肺癌，包括其细胞起源、肿瘤微环境成分（免疫细胞、成纤维细胞）及关键信号通路 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、空间表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1770 | 2026-08-21 |
Spatial heterogeneity in glioblastoma: Decoding the role of perfusion
2025-09, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2025.189383
PMID:40614878
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综述 | 本文综述了胶质母细胞瘤中由灌注差异驱动的空间异质性，及其对免疫调节、治疗抵抗和肿瘤进展的影响，并讨论了针对灌注诱导异质性的新兴治疗策略 | 强调灌注差异作为空间异质性的关键决定因素，并系统探讨其对肿瘤微环境、免疫监视和间充质亚型转化的影响，提出靶向灌注诱导异质性的治疗策略 | 基于现有文献的综述，可能缺乏原始实验数据支持，具体机制尚未完全阐明 | 解析胶质母细胞瘤中空间异质性的分子机制，特别是灌注在免疫调节和治疗抵抗中的作用，以促进个性化治疗策略开发 | 胶质母细胞瘤肿瘤及其微环境（包括癌细胞、免疫细胞和基质细胞） | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 第三代基因组学、高分辨率代谢组学、单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1771 | 2026-08-21 |
Single-cell transcriptomic analysis identifies systemic immunosuppressive myeloid cells and local monocytes/macrophages as key regulators in polytrauma-induced immune dysregulation
2025-Jul-07, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-025-00444-x
PMID:40623986
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析，识别多发性创伤诱导的免疫失调中系统性免疫抑制性髓系细胞和局部单核细胞/巨噬细胞的关键作用 | 同时分析全身（外周血）和局部（损伤部位软组织和骨髓）的免疫细胞，识别出创伤相关的免疫抑制性髓系细胞群和CD1d及Spp1单核细胞/巨噬细胞亚群，以及Anxa1-Fpr2和Spp1-Cd44信号轴 | 研究基于大鼠模型，其与人类情况的差异可能影响临床转化；且仅分析了特定时间点，未涉及动态变化 | 理解多发性创伤导致的免疫失调及其相关骨愈合障碍的细胞和分子机制 | 大鼠多发性创伤模型中的血液、骨髓和局部缺损软组织免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 多发性创伤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞基因表达数据 | 大鼠多发性创伤模型，具体样本量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1772 | 2026-08-21 |
Large-scale dependency and drug screens to characterize the therapeutic vulnerabilities of multiple myeloma with 1q
2025-07-03, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024025102
PMID:40073369
|
研究论文 | 本研究通过大规模依赖性筛选和药物筛选，系统表征了伴有1q染色体异常的复发骨髓瘤的治疗脆弱性，并发现对MCL1和PI3K抑制剂敏感性增强 | 首次通过大规模依赖性筛选和药物筛选，结合单细胞RNA测序和同基因克隆模型，系统揭示了1q+骨髓瘤对MCL1和PI3K抑制剂的增强敏感性及协同作用机制 | 研究主要基于体外细胞系和患者样本，缺乏体内验证；1q+亚克隆的比较可能受样本异质性影响 | 系统表征伴有1q染色体异常的复发骨髓瘤的治疗脆弱性，以开发针对性治疗策略 | 伴有1q染色体异常的多发性骨髓瘤细胞系和患者样本 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 大规模依赖性筛选、药物筛选、单细胞RNA测序 | NA | 基因依赖性数据、药物反应数据、单细胞转录组数据 | 未提供具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1773 | 2026-08-21 |
IFN-γ promotes the progression of iMCD by activating inflammatory monocytes
2025-07-03, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024027689
PMID:40163892
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示IFN-γ通过激活炎症性单核细胞促进特发性多中心Castleman病（iMCD）的进展 | 首次在iMCD中阐明IFN-II信号通路在驱动外周炎症风暴中的关键作用，并发现血清IFN-γ水平与疾病严重程度及治疗耐药性正相关，为预后评估和治疗靶点提供新见解 | 样本量相对较小，且未包含功能验证实验，需进一步验证IFN-γ通路抑制剂的临床潜力 | 深入理解iMCD患者的免疫景观，以建立早期预后分层并发现新的治疗靶点 | 15名iMCD患者和4名健康对照的外周血单核细胞（PBMCs），以及部分淋巴结和骨髓样本 | 单细胞转录组学 | 特发性多中心Castleman病 | 单细胞RNA测序，CellChat分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 15名iMCD患者和4名健康对照的PBMCs，以及淋巴结和骨髓样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1774 | 2026-08-21 |
Single-cell transcriptional profiling reveals cellular senescence and inflammatory persistence as key features of type 1 diabetes partial remission
2025-07, Diabetes, obesity & metabolism
DOI:10.1111/dom.16384
PMID:40183401
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术，研究1型糖尿病部分缓解期外周血单核细胞的转录特征，揭示细胞衰老和炎症持续是部分缓解期关键特征 | 首次通过单细胞转录组分析揭示1型糖尿病部分缓解期中单核细胞衰老和炎症持续存在的新特征，识别出IL1B+单核细胞扩增和HDAC9+群体减少等新的免疫失调标志 | 摘要未提及研究局限性 | 探究1型糖尿病部分缓解期外周血单核细胞的免疫机制，寻找潜在治疗靶点 | 健康对照、新诊断T1D患者和部分缓解期患者的单核细胞 | 单细胞转录组学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未具体说明样本数量，涉及健康对照、新诊断T1D和部分缓解期患者的外周血单核细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1775 | 2026-08-21 |
A visual-omics foundation model to bridge histopathology with spatial transcriptomics
2025-Jul, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02707-1
PMID:40442373
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研究论文 | 开发了OmiCLIP视觉组学基础模型，将组织学图像与空间转录组数据整合，并构建了Loki平台提供多种功能 | 首次将H&E图像与转录组数据通过视觉-组学基础模型进行整合，采用将转录组数据转换为句子形式的方法，并构建了大规模配对数据集 | 未提及 | 弥合组织病理学与空间转录组学之间的鸿沟，实现图像与转录组数据的联合分析 | 来自32个器官的220万对组织图像和转录组数据 | 计算机视觉, 自然语言处理, 机器学习 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 基础模型（如OmiCLIP） | 图像, 文本（基因符号序列） | 220万对组织图像和转录组数据，覆盖32个器官 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 使用10x Visium数据生成组织斑块 |
| 1776 | 2026-08-21 |
Mobilizing antigen-presenting mast cells in anti-PD-1-refractory triple-negative breast cancer: a phase 2 trial
2025-Jul, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-025-03776-7
PMID:40563015
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研究论文 | 该研究通过单细胞转录组分析揭示了肥大细胞异质性对抗PD-1治疗三阴性乳腺癌疗效的影响，并启动了一项针对抗PD-1难治性转移性三阴性乳腺癌的2期临床试验，结果显示色甘酸钠联合抗PD-1治疗的客观缓解率达到50%。 | 首次发现抗原呈递肥大细胞（apMCs）在三阴性乳腺癌中对抗PD-1治疗反应的关键作用，并利用色甘酸钠这一常用抗过敏药物增强apMC介导的T细胞免疫，从而克服抗PD-1耐药，提供了逆转转化的精准免疫肿瘤学框架。 | 主要局限包括2期临床试验样本量较小，且仅针对女性患者，以及尚未进行头对头比较或更长时间随访。 | 探索三阴性乳腺癌抗PD-1耐药的机制并评估新策略的临床疗效和安全性。 | 三阴性乳腺癌患者，包括44名初治患者和484名验证队列，以及2期临床试验中的抗PD-1难治性转移性三阴性乳腺癌女性患者。 | 基因组学, 肿瘤学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据、临床数据 | 44名初治患者和484名验证患者，以及2期临床试验中抗PD-1难治性转移性三阴性乳腺癌女性患者（具体数量未提供） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 1777 | 2026-08-21 |
Microglial mechanisms drive amyloid-β clearance in immunized patients with Alzheimer's disease
2025-May, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-025-03574-1
PMID:40050704
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研究论文 | 利用空间转录组学研究了主动和被动Aβ免疫治疗对阿尔茨海默病患者大脑中Aβ清除的影响，揭示了小胶质细胞在免疫介导的Aβ清除中的转录机制 | 首次使用高分辨率空间转录组学结合单细胞RNA测序，在免疫治疗患者的大脑中鉴定了与Aβ清除相关的小胶质细胞状态，并发现了TREM2和APOE的上调与抗体反应和Aβ清除的正相关性 | 研究样本量可能有限，且未提供具体样本数量；主要关注转录层面的变化，未涉及蛋白质水平或功能性验证 | 阐明免疫治疗后阿尔茨海默病大脑中Aβ清除的分子机制，特别是小胶质细胞的作用 | 阿尔茨海默病患者（接受主动或被动Aβ免疫治疗）与非免疫患者及健康对照者的大脑样本 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | 10x Visium,10x Chromium | 未提供具体配置，但可能包括10x Visium用于空间转录组学和10x Chromium用于单细胞RNA测序 |
| 1778 | 2026-08-21 |
RUNX2 promotes fibrosis via an alveolar-to-pathological fibroblast transition
2025-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08542-2
PMID:39910313
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研究论文 | 本研究利用两种小鼠肺纤维化模型，揭示RUNX2通过促进肺泡成纤维细胞向病理成纤维细胞转变来驱动肺纤维化，并表明靶向RUNX2是潜在的治疗策略 | 首次鉴定RUNX2作为肺纤维化中调控病理成纤维细胞生成的关键转录因子，并揭示LEPR阳性细胞中的SCUBE2肺泡成纤维细胞是病理成纤维细胞的主要来源 | 研究主要基于小鼠模型，人类肺纤维化中的相关机制尚需进一步验证 | 识别促进病理成纤维细胞生成的关键调控因子，为肺纤维化的治疗提供潜在靶点 | 小鼠肺纤维化模型中的成纤维细胞及其亚群，包括LEPR阳性细胞、SCUBE2肺泡成纤维细胞和CTHRC1POSTN病理成纤维细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞ATAC测序（scATAC-seq），基因敲除（遗传消融和条件性敲除） | NA | 单细胞基因表达和染色质开放性数据，以及小鼠组织样本 | 两种小鼠肺纤维化模型，具体样本数量未在摘要中明确 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞ATAC测序（scATAC-seq） | NA | NA |
| 1779 | 2026-08-21 |
B-cell signatures characterize the immune landscape and predict LUAD prognosis via the integration of scRNA-seq and bulk RNA-seq
2025-02-14, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-89213-8
PMID:39953119
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，识别B细胞相关特征基因并构建肺腺癌预后风险模型 | 首次通过整合scRNA-seq和bulk RNA-seq数据，系统性地分析了B细胞在肺腺癌免疫微环境中的作用，并构建了基于B细胞相关基因的预后风险模型 | 研究主要基于公共数据库的分析，缺乏实验验证，且样本量有限 | 阐明B细胞在肺腺癌中的作用，并构建基于B细胞相关基因的预后风险模型 | 肺腺癌患者 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | LASSO回归 | 基因表达数据 | 多个GEO数据集和TCGA-LUAD数据集，具体样本数未提供 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 1780 | 2026-08-21 |
The covariance environment defines cellular niches for spatial inference
2025-Feb, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-024-02193-4
PMID:38565973
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研究论文 | 本文介绍了协方差环境（COVET）表示法，利用细胞邻域内的基因-基因协变结构，并基于此开发了环境变分推断（ENVI）模型，用于空间推断和基因表达插补 | 提出COVET表示法和基于最优传输的距离度量，以及ENVI条件变分自编码器，实现空间与单细胞数据的联合嵌入和双向信息迁移 | 未提及 | 开发一种能够表征细胞邻域特征并赋予单细胞数据空间背景的方法 | 空间转录组数据和单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | 条件变分自编码器（CVAE） | 空间转录组数据、单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | NA |