单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 24273 篇文献，本页显示第 1761 - 1780 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1761 | 2024-11-24 |
A computational approach to assessing the prognostic implications of BRAF and RAS mutations in patients with papillary thyroid carcinoma
2024-Nov, Endocrine
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s12020-024-03911-3
PMID:38886331
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨BRAF和RAS突变在甲状腺乳头状癌中的预后价值 | 揭示了BRAF和RAS突变在甲状腺乳头状癌进展中的重要作用，特别是BRAF V600E突变与侵袭性特征的关联 | NA | 探讨BRAF和RAS突变在甲状腺乳头状癌中的预后意义 | 甲状腺乳头状癌患者中的BRAF和RAS突变 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 甲状腺乳头状癌和正常样本 |
| 1762 | 2024-11-24 |
Transcriptomics of Human Brain Tissue in Parkinson's Disease: a Comparison of Bulk and Single-cell RNA Sequencing
2024-Nov, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-024-04124-5
PMID:38578357
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综述 | 本文综述了利用RNA测序技术研究帕金森病（PD）的文献，特别是比较了批量RNA测序和单细胞RNA测序的结果 | 本文通过整合批量和单细胞RNA测序的结果，展示了这两种技术在揭示神经退行性疾病转录变化方面的互补性 | 本文主要基于文献综述，未提供新的实验数据 | 评估批量和单细胞RNA测序技术在研究帕金森病中的兼容性和互补性 | 帕金森病患者的人脑组织 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1763 | 2024-11-24 |
Advancements in Single-Cell RNA Sequencing Research for Neurological Diseases
2024-Nov, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-024-04126-3
PMID:38564138
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综述 | 本文详细介绍了单细胞RNA测序技术，并总结了其在神经系统疾病研究中的应用 | 单细胞RNA测序技术不仅识别了多种细胞类型和反应状态，还揭示了细胞特异性基因表达变化、基因调控网络、细胞间通讯和细胞运动轨迹等 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在神经系统疾病研究中的应用，揭示疾病的具体机制，并为新的治疗策略提供依据 | 神经系统疾病及其相关细胞 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 1764 | 2024-11-24 |
Targeting METTL3 as a checkpoint to enhance T cells for tumour immunotherapy
2024-Nov, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70089
PMID:39568154
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研究论文 | 本文研究了通过靶向METTL3增强T细胞功能以提高肿瘤免疫疗法的效果 | 首次探讨了m6A在调节T细胞功能和增强抗肿瘤免疫中的作用，并发现靶向METTL3可以增强肿瘤细胞的免疫原性和T细胞功能 | NA | 探索通过靶向METTL3增强T细胞功能以提高肿瘤免疫疗法的效果 | METTL3抑制剂STM2457对肿瘤细胞和T细胞功能的影响 | 肿瘤学 | NA | RNA测序 (RNA-seq)，单细胞RNA测序 (scRNA-seq)，CRISPR Cas9 | NA | RNA | 多种癌细胞系，小鼠黑色素瘤 (B16) 和小鼠结直肠腺癌 (MC38) 模型，人黑色素瘤模型 (A375) 和人T细胞 |
| 1765 | 2024-11-24 |
p53 mutation biases squamocolumnar junction progenitor cells towards dysplasia rather than metaplasia in Barrett's oesophagus
2024-Oct-01, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-332095
PMID:39353725
|
研究论文 | 研究p53突变在Barrett食管向食管腺癌进展中对胃贲门祖细胞命运和功能的影响 | 首次揭示p53突变在慢性损伤条件下抑制祖细胞向化生分化，促进向异型增生转变 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需进一步验证 | 探讨p53突变在Barrett食管向食管腺癌进展中的作用 | Barrett食管中的胃贲门祖细胞 | NA | 食管腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | L2-IL1β小鼠模型中的Cck2r+贲门祖细胞 |
| 1766 | 2024-11-24 |
Targeting IL-33 reprograms the tumor microenvironment and potentiates antitumor response to anti-PD-L1 immunotherapy
2024-09-03, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-009236
PMID:39231544
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研究论文 | 研究探讨了IL-33/ST2信号在PD-L1免疫治疗中的作用，并开发了sST2-Fc融合蛋白和双功能融合蛋白anti-PD-L1-sST2，以增强抗肿瘤效果 | 首次揭示了IL-33/ST2信号在PD-L1免疫治疗中的免疫抑制机制，并开发了新的融合蛋白策略以增强抗肿瘤效果 | 研究主要集中在小鼠模型上，尚未在临床试验中验证其效果 | 探讨IL-33/ST2信号在PD-L1免疫治疗中的作用，并开发新的治疗策略以增强抗肿瘤效果 | IL-33/ST2信号、PD-L1抗体、sST2-Fc融合蛋白、双功能融合蛋白anti-PD-L1-sST2 | NA | 肺癌、结肠癌 | RNA测序、ELISA、WB、免疫荧光 | NA | RNA、蛋白质 | 小鼠肿瘤模型 |
| 1767 | 2024-11-24 |
Bulk and single cells transcriptomes with experimental validation identify USP18 as a novel glioma prognosis and proliferation indicator
2024-May, Experimental and therapeutic medicine
IF:2.4Q3
DOI:10.3892/etm.2024.12517
PMID:38596661
|
研究论文 | 本研究通过批量和单细胞转录组分析，结合实验验证，揭示了USP18作为胶质瘤预后和增殖的新指标 | 首次揭示了USP18在胶质瘤中的上调与不良预后相关，并影响患者对免疫治疗的反应 | 研究仅限于U251和U87MG ATCC细胞系，未涵盖所有胶质瘤细胞类型 | 探讨USP18在胶质瘤中的作用及其对预后和增殖的影响 | 胶质瘤细胞和患者的预后及增殖情况 | 数字病理学 | 脑癌 | 转录组分析 | NA | 转录组数据 | U251和U87MG ATCC细胞系 |
| 1768 | 2024-11-24 |
The neuroendocrine transition in prostate cancer is dynamic and dependent on ASCL1
2024-Apr-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.09.588557
PMID:38645223
|
研究论文 | 研究描述了前列腺癌中神经内分泌转变的动态过程及其依赖于ASCL1的分子机制 | 开发了一个多功能平台，用于识别和研究前列腺癌进展不同阶段神经内分泌谱系转化的分子决定因素 | 研究主要集中在小鼠模型和特定基因的缺失上，可能不完全适用于人类疾病 | 揭示前列腺癌中神经内分泌谱系转化的分子机制及其对治疗结果的影响 | 前列腺癌中的神经内分泌转变及其分子机制 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 多重免疫荧光、空间转录组学、PrismSpot | NA | 基因表达数据 | 小鼠前列腺器官样本 |
| 1769 | 2024-11-24 |
Nature and nurture in fruit fly hearing
2024, Frontiers in neural circuits
IF:3.4Q2
DOI:10.3389/fncir.2024.1503438
PMID:39568979
|
review | 本文综述了果蝇听觉感知中的“先天与后天”现象，特别是歌曲偏好学习的神经机制 | 整合了单细胞转录组和脑连接组等组学数据库，结合传统分子遗传学，使果蝇成为研究听觉感知和行为中“先天与后天”神经基础的杰出模型 | NA | 探讨果蝇歌曲偏好学习的神经机制及其在听觉感知和行为中的作用 | 果蝇的歌曲偏好学习及其神经回路 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1770 | 2024-11-24 |
Single-cell sequencing reveals transcriptional dynamics regulated by ERα in mouse ovaries
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0313867
PMID:39570927
|
研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序揭示ERα在小鼠卵巢中的转录调控动态 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了ERα缺失对卵巢细胞转录组的影响 | 研究仅限于αERKO小鼠模型，可能无法完全代表所有卵巢功能障碍的情况 | 阐明ERα调控卵巢细胞转录动力学的分子机制 | ERα敲除小鼠的卵巢细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 野生型和αERKO小鼠的卵巢细胞 |
| 1771 | 2024-11-24 |
BreCML: identifying breast cancer cell state in scRNA-seq via machine learning
2024, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2024.1482726
PMID:39574916
|
研究论文 | 本文开发了一种基于机器学习的预测工具BreCML，用于准确分类乳腺癌细胞亚群及其相关标记基因 | BreCML在训练数据集上达到了98.92%的准确率，并在测试数据集上展示了卓越的准确性、精确度、召回率和F1分数 | NA | 开发一种能够准确分类乳腺癌细胞亚群及其相关标记基因的机器学习预测工具 | 乳腺癌细胞及其相关标记基因 | 机器学习 | 乳腺癌 | scRNA-seq | XGBoost | 基因数据 | NA |
| 1772 | 2024-11-24 |
Cellular Characterization and Interspecies Evolution of the Tree Shrew Retina across Postnatal Lifespan
2024, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0536
PMID:39574940
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研究论文 | 研究了树鼩视网膜细胞在出生后生命周期中的细胞特征和跨物种进化 | 建立了树鼩视网膜细胞的年龄相关单细胞RNA测序图谱，并进行了跨物种分析 | NA | 探讨树鼩视网膜细胞在不同年龄阶段的细胞组成和基因表达模式 | 树鼩视网膜细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 15只树鼩 |
| 1773 | 2024-11-24 |
Integrated analysis of single-cell, spatial and bulk RNA-sequencing identifies a cell-death signature for predicting the outcomes of head and neck cancer
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1487966
PMID:39575251
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研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和批量RNA测序数据，识别出一种细胞死亡特征，用于预测头颈部癌症的预后 | 本文创新性地整合了单细胞RNA测序、空间转录组学和批量RNA测序数据，构建了一个细胞死亡相关特征风险评分模型（CDRscore），用于预测头颈部癌症的预后 | NA | 研究细胞死亡在头颈部癌症复发和术后预后中的作用，并开发一种预测预后的模型 | 头颈部癌症患者的单细胞RNA测序数据、批量RNA测序数据和空间转录组学数据 | 数字病理学 | 头颈部癌症 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、空间转录组学 | 机器学习模型 | RNA测序数据 | 涉及五种主要亚型的头颈部癌症相关单细胞RNA测序数据，以及来自TCGA数据集的批量RNA测序数据和喉鳞状细胞癌的空间转录组学数据 |
| 1774 | 2024-11-24 |
Differential chromatin accessibility and transcriptional dynamics define breast cancer subtypes and their lineages
2023-Nov-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.31.565031
PMID:37961519
|
研究论文 | 本文研究了乳腺癌亚型及其谱系的染色质可及性和转录动力学的差异 | 首次应用多组学技术结合空间转录组学和多重成像技术，揭示了乳腺癌亚型与其潜在起源细胞之间的基因表达和染色质可及性的特征联系 | 研究样本量相对较小，且仅限于乳腺癌患者 | 探讨乳腺癌亚型及其谱系的起源细胞和转录网络 | 乳腺癌亚型及其谱系的起源细胞和转录网络 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、单核RNA测序、空间转录组学、多重成像 | NA | 基因表达数据、染色质可及性数据 | 61个样本，来自37名乳腺癌患者 |
| 1775 | 2024-11-24 |
FRC transplantation restores lymph node conduit defects in laminin α4-deficient mice
2023-04-24, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.167816
PMID:37092548
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研究论文 | 研究探讨了纤维母细胞网状细胞（FRCs）通过产生层粘连蛋白α4（Lama4）在调节淋巴结（LN）结构和功能中的特定作用 | 首次揭示了Lama4在维持淋巴结导管完整性中的关键作用，并通过FRC移植恢复了Lama4缺陷小鼠的淋巴结导管缺陷 | 研究主要集中在小鼠模型上，尚未在人类中验证这些发现 | 探讨FRCs在免疫调节中的作用及其在淋巴结结构和功能中的具体机制 | 纤维母细胞网状细胞（FRCs）和层粘连蛋白α4（Lama4）在淋巴结（LN）中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用FRC特异性KO小鼠进行研究 |
| 1776 | 2024-11-23 |
Atlas of Metastatic Gastric Cancer Links Ferroptosis to Disease Progression and Immunotherapy Response
2024-Dec, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2024.07.038
PMID:39097198
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组和免疫分析，揭示了胃腺癌转移过程中铁死亡与疾病进展及免疫治疗反应的关系 | 首次大规模分析了胃腺癌转移的单细胞数据，揭示了铁死亡在疾病进展中的作用，并提出了联合CAR-T细胞疗法的新治疗策略 | 研究主要集中在治疗前患者的样本，未来需进一步验证在治疗后患者中的效果 | 深入理解胃腺癌转移的肿瘤和免疫生物学机制，开发创新有效的治疗方法 | 胃腺癌转移的肿瘤细胞及其微环境 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 68对治疗前原发性和转移性肿瘤样本 |
| 1777 | 2024-11-23 |
Mucosal Single-Cell Profiling of Crohn's-Like Disease of the Pouch Reveals Unique Pathogenesis and Therapeutic Targets
2024-Dec, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2024.07.025
PMID:39084267
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研究论文 | 研究了克罗恩样袋病（CDP）的黏膜单细胞分析，揭示了其独特的病理机制和治疗靶点 | 首次通过单细胞RNA测序和质谱流式细胞术分析了CDP的黏膜细胞，揭示了其独特的免疫细胞特征和细胞内信号通路 | 样本量较小，且仅限于特定患者群体 | 探讨克罗恩样袋病（CDP）的病理生理机制，并寻找潜在的治疗靶点 | 克罗恩样袋病（CDP）患者的黏膜细胞 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序、质谱流式细胞术、免疫组化 | NA | 细胞 | 50名接受回肠储袋-肛门吻合术的患者 |
| 1778 | 2024-11-23 |
CVGAE: A Self-Supervised Generative Method for Gene Regulatory Network Inference Using Single-Cell RNA Sequencing Data
2024-Dec, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-024-00633-y
PMID:38778003
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研究论文 | 提出了一种基于单细胞RNA测序数据的自我监督生成方法CVGAE用于基因调控网络推断 | 使用图神经网络进行归纳表示学习，将基因表达数据和观测拓扑结构合并到低维向量空间中，并采用多层GraphSAGE作为编码器和改进的解码器来克服网络稀疏性问题 | NA | 改进基因调控网络推断的准确性和模型泛化能力 | 单细胞RNA测序数据中的基因调控网络 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图神经网络 | 基因表达数据 | 多个包含四个相关真实网络的单细胞数据集 |
| 1779 | 2024-11-23 |
Luteinizing Hormone Receptor Mutation (LHRN316S) Causes Abnormal Follicular Development Revealed by Follicle Single-Cell Analysis and CRISPR/Cas9
2024-Dec, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-024-00646-7
PMID:39150470
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和CRISPR/Cas9技术研究黄体生成素受体突变对卵泡发育的影响 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了黄体生成素受体突变对卵泡发育的影响，并利用CRISPR/Cas9技术构建了LHR小鼠模型 | 研究主要集中在体外实验和小鼠模型，需要进一步的人体研究来验证结果 | 探讨黄体生成素受体突变对卵泡发育的影响及其在女性不孕治疗中的潜在应用 | 卵泡中的卵母细胞、卵丘颗粒细胞和壁颗粒细胞 | NA | 女性不孕 | 单细胞RNA测序、CRISPR/Cas9 | NA | RNA | 14只LHR雌性小鼠和ICR野生型雄性小鼠交配 |
| 1780 | 2024-11-23 |
A Study on the Inflammatory Response of the Brain in Neurosyphilis
2024-Nov-22, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202406971
PMID:39574316
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研究论文 | 研究了神经梅毒中大脑的炎症反应机制 | 通过蛋白质组学和单细胞转录组学的整合分析，确定了Toll样/NF-κB信号通路在Tp引起的中枢神经系统损伤中的关键作用 | NA | 揭示Tp感染引起的神经梅毒中炎症介导的脑损伤机制 | 神经梅毒患者的中枢神经系统和外周血中的炎症细胞 | NA | 神经梅毒 | 蛋白质组学、单细胞转录组学 | NA | 蛋白质组数据、转录组数据 | NA |