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当前共找到 44757 篇文献,本页显示第 1721 - 1740 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1721 2026-10-01
Arhgap25 Promotes Metabolic Dysfunction-Associated Steatotic Liver Disease (MASLD) by Driving Kupffer Cell Polarization via Activation of the AKT/mTOR Signaling Pathway
2026-Sep-07, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
研究论文 该研究通过整合bulk和单细胞RNA测序,鉴定出Arhgap25是高脂饮食诱导的MASLD中Kupffer细胞的关键调控基因,并通过AAV过表达小鼠模型和体外共培养体系验证其通过激活AKT/mTOR信号通路促进Kupffer细胞M1极化,加剧代谢功能障碍 首次发现Arhgap25在MASLD中作为Kupffer细胞极化的关键调控因子,揭示了Arhgap25通过激活AKT/mTOR信号通路驱动Kupffer细胞向M1表型极化,进而促进肝脏免疫-代谢网络紊乱的新机制 研究主要基于小鼠模型和体外共培养体系,缺乏人体样本验证;AAV过表达模型可能存在非特异性效应;未探讨Arhgap25的具体上游调控机制 探究MASLD中肝脏免疫失调与代谢紊乱之间的调控节点,鉴定高脂饮食诱导的核心调控基因并阐明其功能机制 高脂饮食喂养小鼠的肝脏组织、Kupffer细胞、肝细胞 机器学习 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA 转录组数据 NA NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
1722 2026-10-01
CNP-miR146a Promotes NRF2-Related Ferroptosis-Protective Myeloid Programs and Immune-Vascular Regeneration in Diabetic Wounds
2026-Sep-04, Pharmaceutics IF:4.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析CNP-miR146a治疗糖尿病伤口后第7天的细胞和转录组反应,发现其与NRF2相关的铁死亡保护性髓系程序及免疫血管再生相关 首次在糖尿病伤口中揭示CNP-miR146a治疗与NRF2相关铁死亡保护性髓系程序、促再生髓系状态及免疫血管通讯网络的关联 研究结果主要基于转录组关联分析,需要进一步功能验证实验证实所发现的机制 探究CNP-miR146a治疗糖尿病伤口修复是否与铁死亡保护性程序和免疫血管通讯相关 糖尿病切除伤口组织 数字病理学 糖尿病 单细胞RNA测序 NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1723 2026-10-01
Molecular and Cellular Hallmarks of Age-Related Vestibular Hair Cell Degeneration
2026-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 通过对年轻和老年小鼠前庭毛细胞进行单细胞RNA测序,结合成像与电生理记录,揭示年龄相关前庭毛细胞退化的分子和细胞特征 首次系统描绘老年前庭毛细胞的单细胞转录组衰老特征,发现毛束退化和机械转导功能下降先于毛细胞丢失,并比较前庭与耳蜗毛细胞的异同 研究基于小鼠模型,尚未在人类样本中验证;单细胞转录组可能丢失空间信息;未明确具体驱动基因或干预靶点 探究年龄相关前庭功能障碍的分子机制,聚焦于机械敏感毛细胞的衰老过程 年轻与老年小鼠的前庭毛细胞 机器学习 老年性疾病 单细胞RNA测序、成像、电生理记录 NA 转录组数据、图像数据、电生理数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1724 2026-10-01
Machine learning-driven decoding of maternal immune signatures in repeated pregnancy loss
2026-Sep, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 本文通过对复发性流产患者和早孕期对照的蜕膜组织进行单细胞RNA测序,结合机器学习模型解码母体免疫特征,揭示母体T细胞在复发性流产中的免疫失调作用 首次将基于基因型的来源分析、监督机器学习模型和基于Transformer的基础模型(scGPT)相结合,采用分层方法解码复发性流产的母体免疫特征,并通过计算药物重定位和网络中心性分析鉴定出CXCR4和JUN作为可成药分子候选靶点 摘要中未明确提及研究局限性 解析复发性流产中母胎免疫耐受破坏的免疫机制,鉴定与母体T细胞免疫失调相关的可成药分子靶点 复发性流产患者的蜕膜组织和早孕期对照的蜕膜组织 机器学习 复发性流产 单细胞RNA测序 监督机器学习模型, Transformer基础模型(scGPT) 单细胞转录组数据 NA NA single-cell RNA-seq NA NA
1725 2026-10-01
ST-ConMa: a multimodal foundation framework for spatial transcriptomics via image-gene contrastive and matching learning
2026-Sep-01, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 提出了一种基于图像-基因对比与匹配学习的空间转录组学多模态基础模型ST-ConMa 采用对比学习和匹配学习在大规模斑点级组织图像与基因表达谱上预训练,通过配备交叉注意力的多模态编码器和匹配目标联合学习图像-基因融合表示,而非分别生成模态特异性嵌入 摘要中未明确提及 构建具有广泛空间转录组学知识的多模态基础模型,提升跨平台和跨任务的泛化能力 斑点级组织图像与对应的基因表达谱 数字病理学 NA 空间转录组学 多模态编码器(含交叉注意力) 图像、基因表达谱 NA NA 空间转录组学 NA NA
1726 2026-10-01
Data-driven identification of cell subtypes for single-cell transcriptomic data with Subtypist
2026-Sep-01, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 提出了一种名为Subtypist的全数据驱动多尺度迭代算法,用于从单细胞RNA测序数据中识别细胞亚型,无需外部先验参考 提出了一种不依赖外部参考标签的全数据驱动多尺度迭代算法,能够发现新的细胞亚型,并在多种疾病场景中揭示了新的生物学意义细胞亚型及其细胞间通讯机制 未明确提及 开发一种无需参考即可从单细胞转录组数据中识别细胞亚型的方法,以准确理解疾病发生发展机制 单细胞RNA测序数据,包括模拟和真实数据集,以及肝细胞癌、食管鳞状细胞癌和心肌梗死三种疾病场景 机器学习 肝细胞癌, 食管鳞状细胞癌, 心肌梗死 单细胞RNA测序 多尺度迭代算法 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1727 2026-10-01
ProST: an image prompt-guided multimodal representation learning framework for spatial domain identification
2026-Aug-31, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 提出ProST,一种图像提示引导的多模态表示学习框架,用于空间转录组数据的空间域识别 利用组织学图像中的形态学感知信息作为图像提示,同时减少无关视觉噪声的影响,生成稳健且空间连贯的嵌入表示,并优化了组织学图像特征提取以更好地利用形态学信息 摘要中未明确提及 有效利用组织学图像中的形态学信息,实现空间转录组数据的空间域识别,恢复具有连贯生物学结构的空间区域 空间转录组数据及其对应的组织学图像 数字病理学 NA 空间转录组学 多模态表示学习框架 图像, 文本 NA NA 空间转录组学 NA NA
1728 2026-10-01
Integration of GWAS and single-cell analysis for psoriasis identifies disease-associated cell subtypes and therapeutic targets
2026-Aug-27, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 该研究通过整合大规模全基因组 meta 分析和单细胞转录组数据,揭示了银屑病的遗传和分子结构 发现了 17 个之前未报道的银屑病易感位点,并优先排序了 50 个潜在治疗靶点基因及其细胞亚型特异性活动模式 研究主要基于欧洲血统个体,可能不适用于其他人群;未涉及功能验证实验 阐明银屑病的遗传和分子机制,识别疾病相关细胞亚型和治疗靶点 欧洲血统个体的基因组和单细胞转录组数据 机器学习 银屑病 GWAS,单细胞转录组测序 NA 基因组数据,单细胞转录组数据 1,131,685 个欧洲血统个体 NA bulk RNA-seq,single-cell RNA-seq NA NA
1729 2026-10-01
Low-Strength Type I Interferon Signaling Promotes CAR T-cell Treatment Efficacy
2026-Aug-04, Cancer immunology research IF:8.1Q1
研究论文 通过单细胞转录组分析r/r DLBCL患者的CAR T细胞输注产品,发现低强度I型干扰素信号可增强CAR T细胞疗效,并开发了一种体外制造策略 首次发现低强度IFN-I信号作为CAR T细胞效力的增强剂,且独立于共刺激信号;开发了利用IFN-I增强CAR T细胞体外制造的新策略,兼容现有CAR结构和制造流程 样本量较小(仅8例患者),需要更大规模的临床研究验证;未明确IFN-I的最佳强度和持续时间 揭示CAR T细胞治疗疗效的决定因素,并开发提高CD19靶向CAR T细胞治疗 efficacy 的策略 复发/难治性弥漫大B细胞淋巴瘤患者的CAR T细胞输注产品,以及体外培养的CD28和4-1BB共刺激的第二代CAR T细胞 单细胞转录组学 弥漫大B细胞淋巴瘤、B细胞淋巴瘤、白血病 单细胞转录组测序 NA 单细胞转录组数据 8例r/r DLBCL患者的输注产品 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1730 2026-10-01
Tfh dysfunction underlies poor responses to HBV vaccination
2026-Aug-04, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 该研究通过对101名接受乙肝疫苗接种的健康成年人进行纵向追踪,并对其中10名参与者的疫苗引流淋巴结进行单细胞RNA测序和配对抗原受体测序,揭示了Tfh细胞功能障碍是乙肝疫苗应答不良的分子机制 首次在人类疫苗引流淋巴结中结合单细胞RNA测序与配对抗原受体测序,纵向解析乙肝疫苗接种后GC动态,发现GNG4+Tfh亚群在高低应答者中的转录网络差异,提出GNG4+Tfh功能障碍是疫苗应答不良的关键机制 淋巴结活检样本量较小(仅10例),可能限制统计效力;研究仅聚焦HBV疫苗,结论是否可推广至其他疫苗尚需验证;未对GNG4+Tfh进行功能实验验证 识别导致疫苗应答差异的分子和细胞事件,阐明GC动态与下游抗体产出之间的机制联系 101名接受乙肝疫苗初次免疫或加强免疫的健康成年人,以及其中10名参与者的疫苗引流淋巴结活检样本 免疫学 乙型肝炎 单细胞RNA测序, 配对抗原受体测序 NA 单细胞转录组数据, 抗原受体序列数据 101名健康成年人(初次免疫n=59,加强免疫n=42),其中10名参与者提供淋巴结核心针活检样本(高应答者n=6,低应答者n=4) NA 单细胞RNA测序, 单细胞免疫组库测序 NA NA
1731 2026-10-01
Early Developmental Neuronal Activity Impacts Oligodendrocyte Differentiation Through AMPA Receptors
2026-08, Glia IF:5.4Q1
研究论文 本研究探讨了早期发育阶段神经元活动通过AMPA受体影响少突胶质细胞分化的机制 首次揭示早期发育阶段谷氨酸能神经元活动通过AMPA受体调控少突胶质细胞分化,与成熟大脑中的作用相反 研究主要基于小鼠模型,结论是否适用于人类尚需验证 探究早期大脑发育过程中谷氨酸能神经元活动如何调控少突胶质细胞成熟 小鼠的嗅觉系统、体感皮层和胼胝体中的少突胶质细胞 神经科学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据、图像 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1732 2026-10-01
Integrative multi-omics analysis identifies stellate cell-derived complement component 7 as a predictor of fibrosis and liver-related events in MASLD
2026-Jul-22, JHEP reports : innovation in hepatology IF:9.5Q1
研究论文 通过整合多组学分析,鉴定补体成分C7为MASLD中纤维化和肝脏相关事件的预测生物标志物 首次通过整合多组学方法鉴定出星状细胞来源的补体成分C7作为MASLD纤维化和肝脏相关事件的预测生物标志物,并在多个队列中验证其优于现有指标 摘要中未明确提及研究局限性 识别具有机制基础的生物标志物,用于MASLD的临床风险分层 MASLD患者,包括活检确诊的日本队列、基于VCTE的队列和UK Biobank队列 多组学分析 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 整合多组学分析,肝脏转录组学,血浆蛋白质组学,空间转录组学,单核RNA测序,原位杂交,体外实验 NA 转录组数据,蛋白质组数据,空间转录组数据,图像 活检确诊的日本队列430例,VCTE队列120例,UK Biobank队列4486例 NA bulk RNA-seq, 空间转录组学, 单核RNA测序 NA NA
1733 2026-10-01
scWeave: A deep learning model that bidirectionally translates between gene expression and chromatin structure at single-cell resolution
2026-Jul-18, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 该文章开发了scWeave模型,用于在单细胞分辨率下双向翻译基因表达和染色质结构 scWeave是首个在单细胞分辨率下双向翻译基因表达和染色质结构的深度学习模型,使用双自动编码器和翻译模块,在多个数据集上优于基线方法 模型性能可能受限于训练数据的质量和数量,且 human 数据有限,泛化能力需进一步验证 更好地描述3D染色质结构与基因表达之间的关系,并 enable 从单模态测量中进行跨模态推断 小鼠胚胎发育、小鼠皮层、小鼠嗅觉上皮和人类骨髓的单细胞数据 机器学习 NA scRNA-seq, scHi-C 自动编码器 基因表达数据, 染色质结构数据 六个公开可用的共检测数据集,包括小鼠和人类细胞 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞Hi-C NA NA
1734 2026-10-01
Integration of bulk RNA-seq and scRNA-seq reveals cell subsets and gene signatures associated with Glaesserella parasuis infection
2026-Jul-07, BMC genomics IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过整合bulk RNA-seq和scRNA-seq数据,分析了Glaesserella parasuis感染猪肺泡巨噬细胞的异质性,揭示了与感染严重程度相关的巨噬细胞亚群和基因特征 首次在单细胞分辨率下对GPS感染中巨噬细胞异质性进行多组学解析,发现了四个转录上不同的巨噬细胞亚群,并揭示了决定临床结局的保护性和致病性细胞程序 研究仅基于猪肺泡巨噬细胞,未涉及其他免疫细胞类型或组织;样本来自特定感染模型,可能无法完全反映自然感染情况 探究Glaesserella parasuis感染中巨噬细胞异质性及其与疾病严重程度的关系,揭示导致不同临床结局的分子机制 猪肺泡巨噬细胞 机器学习 细菌感染 bulk RNA-seq, scRNA-seq NA 文本 超过98,000个猪肺泡巨噬细胞,来自对照、轻度和重度感染组 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
1735 2026-10-01
scVAEAT: An Integrative Attention-Augmented Variational Autoencoder for Predicting Single-Cell Perturbation Responses
2026-Jul-07, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
研究论文 该文章提出了scVAEAT,一种整合变分自编码器与注意力增强最优传输的深度学习框架,用于从单细胞RNA测序数据预测单细胞扰动响应 引入两个关键创新:(1) 注意力增强编码模块,通过结合全局和局部注意力机制捕获多尺度特征表示;(2) 基于注意力的最优传输策略,无需配对数据即可对齐未扰动和扰动细胞状态 摘要中未明确提及研究的局限性 从标准单细胞RNA测序数据预测单细胞对遗传或环境扰动的响应,以解析疾病机制和推进精准医学 人类外周血单核细胞(PBMC)和肠道上皮细胞 机器学习 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 变分自编码器(VAE)、注意力机制、最优传输 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA NA
1736 2026-10-01
LncPTEC mediated homocysteine accumulation elevates oxidative stress via UBQLN1-dependent MTHFD1 ubiquitination in DKD
2026-Jul-07, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 该研究揭示了lncPTEC通过UBQLN1依赖的MTHFD1泛素化介导同型半胱氨酸积累,进而加剧糖尿病肾病中的氧化应激 首次发现并鉴定了一个与DKD相关的长非编码RNA lncPTEC,并阐明了其通过SP1转录上调、与MTHFD1相互作用并通过UBQLN1促进MTHFD1泛素化降解,导致同型半胱氨酸积累和线粒体氧化应激的新机制 未明确说明 探究同型半胱氨酸积累在糖尿病肾病线粒体氧化应激中的具体机制,并寻找潜在的诊断生物标志物和治疗靶点 糖尿病肾病患者的肾组织样本、近端肾小管上皮细胞、DKD动物模型 机器学习 糖尿病肾病 单细胞RNA测序 NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1737 2026-10-01
CD13 identifies S100A4+ immunosuppressive monocytes and predicts temozolomide benefit in glioblastoma
2026-Jul-07, Biology direct IF:5.7Q1
研究论文 该研究通过流式细胞术和生物信息学分析,鉴定出CD13可作为胶质母细胞瘤中S100A4高表达免疫抑制性单核细胞的表面标记物,并预测替莫唑胺的治疗获益 首次发现CD13(由ANPEP编码)是胶质母细胞瘤中与S100A4最显著相关的表面标记物,揭示了CD13-TGFβ-S100A4免疫抑制轴,并发现CD13高表达可预测替莫唑胺的生存获益 摘要中未明确提及研究局限性 鉴定胶质母细胞瘤中内在表达S100A4的特定免疫亚群及其对应的细胞表面靶点 健康人骨髓和外周血中的免疫亚群、胶质母细胞瘤患者及TCGA GBM数据集 数字病理学 胶质母细胞瘤 流式细胞术, 单细胞RNA测序, 网络分析, 相关性分析 NA 图像, 文本 健康人骨髓和外周血样本(具体数量未提及)、TCGA GBM数据集、Human Protein Atlas、Immgen、GEO及单细胞RNA-seq数据集 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA GEPIA 3 平台用于药物反应分析
1738 2026-10-01
Upregulation of macrophage UPP1 promotes lung adenocarcinoma metastasis through an mtROS-cGAS-NLRP3 inflammasome axis
2026-Jul-06, Cell death discovery IF:6.1Q1
研究论文 本研究揭示了巨噬细胞中UPP1通过mtROS-cGAS-NLRP3炎症小体轴促进肺腺癌转移的免疫代谢机制 首次发现UPP1是巨噬细胞富集的代谢调控因子,阐明了UPP1通过破坏核苷酸稳态导致线粒体ROS积累和mtDNA泄漏,进而激活cGAS-STING通路并优先招募NLRP3炎症小体而非经典抗病毒反应的巨噬细胞特异性免疫代谢回路 摘要中未明确说明研究的具体局限性 探究肿瘤相关巨噬细胞中UPP1在肺腺癌进展和转移中的代谢调控机制及临床意义 肺腺癌(LUAD)肿瘤相关巨噬细胞、LUAD细胞系及临床队列样本 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 NA 图像, 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1739 2026-10-01
Single-cell transcriptomics-guided dynamic hydrogel delivery of artemisia argyi-derived EVs relieves ER stress and promotes diabetic wound regeneration
2026-Jul-06, Journal of nanobiotechnology IF:10.6Q1
研究论文 该研究通过单细胞转录组学和多组学分析发现糖尿病创面促炎巨噬细胞中内质网应激信号显著富集,并开发了一种负载艾叶来源细胞外囊泡的可注射动态水凝胶(GPOK-2@EVs),用于局部免疫调节治疗以促进糖尿病创面再生 首次将单细胞转录组学与多组学分析相结合揭示糖尿病创面促炎巨噬细胞中内质网应激相关信号的富集机制,并创新性地开发了基于苯硼酸修饰明胶与氧化魔芋葡甘聚糖双重动态交联的负载艾叶来源EVs的可注射自愈合水凝胶,实现pH/ROS响应性持续释放EVs以靶向内质网应激和炎症微环境 摘要中未明确提及研究局限性 开发一种基于单细胞转录组学指导的负载艾叶来源细胞外囊泡的动态水凝胶,通过靶向内质网应激和炎症微环境促进糖尿病创面再生 糖尿病创面中的促炎巨噬细胞、内皮细胞及糖尿病小鼠创面模型 数字病理学 糖尿病创面 单细胞转录组学、多组学分析 NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1740 2026-10-01
Conserved minimal CD8 cytotoxic immune-state unit in an IL18R1-associated immune program in hepatocellular carcinoma
2026-Jul-06, Cancer immunology, immunotherapy : CII
研究论文 该研究通过整合五个独立肝细胞癌队列的单细胞RNA测序数据,识别出一个保守的、以CCL5为中心的CD8细胞毒性免疫状态单元,并与IL18R1相关 首次定义了肝细胞癌中IL18R1相关免疫状态的最小可重复的人类对应单元,并利用空间转录组学验证了该细胞毒性状态在肿瘤相关CD8 T细胞中的定位 在TCGA-LIHC中,复合CCL5中心细胞毒性核心评分与总生存期的关联在调整临床协变量后减弱,且研究主要基于公共数据集,需要进一步前瞻性验证 识别肝细胞癌中与IL18R1相关的保守、可重复的最小免疫状态组件,并评估其临床相关性 肝细胞癌患者及小鼠肝脏肿瘤模型 数字病理学 肝癌 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序 NA 图像,文本 五个独立肝细胞癌队列的公共单细胞RNA测序数据集,一个小鼠肝脏肿瘤Xenium空间转录组数据集,以及TCGA-LIHC批量RNA测序数据 10x Genomics 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序 10x Chromium,10x Xenium NA
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