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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1701 | 2026-03-02 |
Predicting Macrophage Spatial Localization from Single-Cell Transcriptomes to Uncover Disease Mechanisms
2026-Feb-28, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202410924
PMID:41762738
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研究论文 | 本研究开发了一种名为MERLIN的算法,用于从单细胞RNA测序数据中重建细胞在器官中的空间定位信息,以揭示疾病机制 | 开发了MERLIN算法,首次能够从单细胞转录组数据中准确预测具有区室化解剖结构器官(如肾脏和大脑)中特定免疫细胞(如巨噬细胞)的空间位置,准确率超过75%,并成功应用于疾病模型分析 | 该算法仅适用于具有明确解剖分区的器官;对于淋巴细胞等移动性较强的细胞,其空间位置无法准确预测;算法性能依赖于训练数据的质量和分区定义 | 开发一种从单细胞RNA测序数据中重建细胞空间位置信息的计算方法,以增强对疾病机制的理解 | 肾脏和大脑中的免疫细胞,特别是驻留巨噬细胞和小胶质细胞 | 机器学习 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | 改进的多层感知机 | 单细胞转录组数据 | 来自三个肾脏分区的多个独立免疫细胞scRNA-seq数据集(包括小鼠和人类肾脏数据集),以及新月体肾小球肾炎、内毒素诱导和缺血/再灌注诱导的急性肾损伤模型和糖尿病肾病治疗模型的已发表数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1702 | 2026-03-02 |
Role of CTGF-LRP1 in impaired healing of cesarean section incisions
2026-Feb-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69747-9
PMID:41764198
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析剖宫产切口愈合不良的微环境,揭示了LRP1缺陷在成纤维细胞中的作用及其对细胞外基质合成的抑制机制 | 首次在剖宫产切口愈合不良(niche)组织中,通过单细胞RNA测序识别出成纤维细胞亚群中LRP1的缺陷,并阐明其通过抑制CTGF激活ERK和WNT信号通路,从而损害细胞功能 | 研究样本量相对有限(共135,793个细胞),且主要基于体外实验和动物模型,临床转化需进一步验证 | 探究剖宫产切口愈合不良(niche)的发病机制,并寻找潜在的治疗靶点 | 剖宫产切口相邻子宫肌层组织、愈合良好的瘢痕组织以及niche组织中的细胞 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 135,793个单个细胞(来自48,587个相邻组织细胞、47,653个对照组细胞和39,553个niche组织细胞),以及60个组织样本(30个非愈合组 vs 30个愈合组) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1703 | 2026-03-02 |
RETN exacerbates sepsis by GBP5/NLRP3 signaling pathway-mediated pyroptosis of macrophage
2026-Feb-28, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-026-00387-1
PMID:41764353
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研究论文 | 本研究揭示了RETN通过GBP5/NLRP3信号通路调控巨噬细胞焦亡,从而加剧脓毒症的机制 | 首次证明RETN/GBP5/NLRP3信号轴在脓毒症中调控巨噬细胞焦亡的作用,为脓毒症治疗提供了新靶点 | 研究主要基于体外实验和动物模型,临床转化需进一步验证 | 探索脓毒症的致病机制并寻找潜在治疗靶点 | 巨噬细胞和脓毒症动物模型 | 生物信息学与分子生物学 | 脓毒症 | 单细胞测序、RNA-Seq、生物信息学分析 | NA | 基因表达数据 | 脓毒症患者和动物模型样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1704 | 2026-03-02 |
Sinusoidal cell-derived biomarker scores predict diagnosis and prognosis in chronic liver disease
2026-Feb-28, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-026-04733-y
PMID:41764477
|
研究论文 | 本研究开发了基于肝窦细胞特异性特征的生物标志物评分,用于慢性肝病的诊断和预后预测 | 首次整合肝窦内皮细胞毛细血管化、肝星状细胞活化和巨噬细胞极化的单细胞特征,创建了反映细胞去分化的肝窦评分系统 | 评分系统基于回顾性数据推导,需要前瞻性验证和临床实施 | 开发肝窦细胞特异性生物标志物,用于慢性肝病的诊断和预后评估 | 慢性肝病患者(包括内部队列和三个独立验证队列) | 数字病理学 | 慢性肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 内部队列108例患者,三个独立验证队列总计1008例患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1705 | 2026-03-02 |
Atherosclerotic Fibrous Plaques in Women Present ECM Remodeling Linked to TGF-β
2026-Feb-27, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.327624
PMID:41641539
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研究论文 | 本研究揭示了女性与男性在晚期动脉粥样硬化纤维斑块中具有不同的临床和分子特征,特别是女性纤维斑块以平滑肌细胞驱动的细胞外基质重塑和TGF-β反应为特征 | 首次系统性地结合组织学、临床特征及多组学数据(蛋白质、bulk RNA、单细胞RNA、DNA甲基化),揭示了性别差异在动脉粥样硬化纤维斑块分子机制中的作用,并利用空间转录组学定位了基因表达模式,实验验证了TGF-β/SMAD3通路在女性偏向性机制中的关键作用 | 研究样本来源于颈动脉内膜切除术患者,可能无法完全代表其他血管床的斑块特性;研究为观察性设计,因果关系需进一步实验验证 | 探究男性和女性在组织学确定的纤维斑块中的分子驱动因素差异,以理解斑块侵蚀的分子机制并为动脉粥样硬化治疗提供潜在靶点 | 人类晚期动脉粥样硬化斑块(来自颈动脉内膜切除术患者) | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, DNA甲基化测序, 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | RNA-seq数据, 甲基化数据, 蛋白质数据, 空间转录组数据 | 1889个动脉粥样硬化斑块(1309例男性,580例女性) | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1706 | 2026-03-02 |
A beneficial environment promotes immune resilience through epigenetic regulation
2026-Feb-27, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ady7317
PMID:41758935
|
研究论文 | 本研究探讨了农场粉尘暴露如何通过表观遗传重编程增强免疫韧性,从而减轻过敏性肺部炎症 | 首次揭示了有益环境暴露通过PPARγ信号通路维持的组蛋白去乙酰化酶活性,对单核细胞来源的巨噬细胞进行表观遗传重编程的机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验,人类样本验证有限;长期效应和临床转化潜力需进一步研究 | 探究有益环境暴露对免疫系统的影响机制,寻找哮喘预防新策略 | 小鼠过敏性炎症模型、骨髓来源巨噬细胞、人类细胞 | 免疫学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序、ATAC-seq、RNA测序 | NA | 基因表达数据、表观遗传数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq、ATAC-seq | NA | NA |
| 1707 | 2026-02-28 |
Correction: CiCLoDS: Joint cell clustering and gene selection for single-cell spatial transcriptomics
2026-Feb-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-42146-2
PMID:41748707
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1708 | 2026-03-02 |
BST2 promotes esophageal squamous cell carcinoma progression by mediating the cell-cell interaction between cancer cells and cancer-associated fibroblasts
2026-Feb-26, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2026.01.012
PMID:41763536
|
研究论文 | 本研究探讨了BST2在食管鳞状细胞癌中通过介导癌细胞与癌症相关成纤维细胞之间的细胞间相互作用促进癌症进展的机制 | 首次建立了通过直接共培养骨髓间充质干细胞与食管鳞癌细胞生成CAF样细胞的方法,并利用此方法结合单细胞RNA测序数据揭示了BST2在癌细胞与CAFs相互作用中的关键作用 | 研究主要基于体外共培养模型和公共数据库分析,缺乏体内实验验证BST2在肿瘤微环境中的具体作用机制 | 探究BST2在食管鳞状细胞癌进展中的作用及其介导癌细胞与癌症相关成纤维细胞相互作用的机制 | 食管鳞状细胞癌细胞、骨髓来源的间充质干细胞、癌症相关成纤维细胞 | 肿瘤生物学 | 食管鳞状细胞癌 | cDNA微阵列分析、单细胞RNA测序、免疫组织化学 | 共培养模型 | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、临床病理数据 | 未明确说明具体样本数量,但使用了公共单细胞RNA测序数据库和患者组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1709 | 2026-03-02 |
Functional validation gaps in single-cell RNA sequencing-defined neuronal subtypes
2026-Feb-26, Neuroscience
IF:2.9Q2
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1710 | 2026-03-02 |
Tertiary lymphoid structures correlate with reduced recurrence risk and enhanced antitumor immunity in esophageal squamous cell carcinoma with pathologic non-complete response to neoadjuvant chemoimmunotherapy
2026-Feb-25, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-026-00748-6
PMID:41736069
|
研究论文 | 本研究探讨了三级淋巴结构(TLS)在食管鳞状细胞癌(ESCC)新辅助化疗免疫治疗后非病理完全缓解(non-pCR)患者中的预后价值和免疫特征 | 首次在non-pCR ESCC患者中系统评估TLS与术后复发风险及抗肿瘤免疫的关系,并利用单细胞测序和多色免疫组化揭示TLS内免疫细胞的空间定位和相互作用模式 | 研究为回顾性分析,样本量有限,且未涉及TLS形成的机制或干预策略 | 评估TLS在non-pCR ESCC中的预后意义和免疫调控作用 | 接受新辅助化疗免疫治疗的局部晚期食管鳞状细胞癌患者 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞测序、批量RNA测序、多色免疫组化 | NA | 单细胞数据、批量RNA测序数据、免疫组化图像 | 未明确指定样本数量,但涉及临床病理特征、复发事件和生存结果分析 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1711 | 2026-03-02 |
Evaluation of statistical differential analysis methods for identification of senescent cells using single-cell transcriptomics
2026-Feb-23, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2025.101264
PMID:41576958
|
研究论文 | 本研究系统评估了Seurat包中10种差异基因表达分析方法在单细胞RNA测序数据中识别衰老细胞的性能 | 首次系统评估Seurat包中多种DGE方法在scRNA-seq数据中识别衰老细胞的性能,并推荐DESeq2为最佳方法 | 仅评估了Seurat包中的方法,未涵盖所有可用的DGE工具;基于模拟和真实数据集,但可能未覆盖所有生物学场景 | 评估单细胞转录组学中差异基因表达分析方法的性能,以优化衰老细胞的识别 | 单细胞RNA测序数据中的衰老细胞 | 生物信息学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | 多种统计方法(Wilcox、DESeq2等) | 单细胞转录组数据 | 模拟和真实scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1712 | 2026-03-02 |
DMC-BrainMap is an open-source, end-to-end tool for multi-feature brain mapping in different species
2026-Feb-23, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2026.101302
PMID:41666930
|
研究论文 | 介绍了一个名为DMC-BrainMap的开源端到端工具,用于处理和分析不同物种的脑解剖数据 | 开发了一个用户友好的开源napari插件,无需编程即可完成从图像预处理到数据分析可视化的全流程脑图谱绘制 | NA | 为神经科学研究提供标准化的脑解剖数据处理和分析工具 | 小鼠、大鼠和斑马鱼等模式生物的脑组织数据 | 数字病理学 | NA | 组织学成像、空间转录组学 | NA | 图像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1713 | 2026-03-02 |
Predictive modeling of molecular activity underlying physical cell-cell interactions
2026-Feb-23, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2026.101301
PMID:41672069
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Gloss的预测建模框架,用于系统性地将基因和通路活性与LIPSTIC测量的细胞间相互作用强度联系起来 | Gloss是一种创新的预测建模框架,优于基于相关性和标准回归方法,同时保持可解释性,适用于分析LIPSTIC+scRNA-seq数据 | NA | 系统性地链接基因和通路活性与细胞间物理相互作用强度,以优先驱动细胞通讯的基因和通路 | 小鼠肿瘤中的髓系-T细胞相互作用以及病毒感染期间不同T细胞亚群之间的相互作用 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | group lasso | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1714 | 2026-03-02 |
An integrative spatial multi-omic workflow for unified analysis of tumor tissue
2026-Feb-23, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2026.101306
PMID:41687601
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研究论文 | 本研究提出了一种名为SMINT的空间多组学整合工作流,用于统一分析IDH突变型弥漫性胶质瘤组织,结合空间转录组学和空间代谢组学数据 | 开发了一个创新的空间多组学整合工作流,能够将空间转录组学和空间代谢组学数据在共同坐标框架下进行细胞分割和配准,并识别出肿瘤浸润边缘的独特细胞邻域 | 仅使用细胞核分割策略时仅包含40%的细胞转录本,且未考虑多核细胞的分割场景 | 开发并验证一个整合空间多组学数据的工作流,以深入理解IDH突变型胶质瘤的肿瘤微环境 | IDH突变型弥漫性胶质瘤组织 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 空间转录组学, 空间代谢组学 | NA | 空间多组学数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间代谢组学 | NA | NA |
| 1715 | 2026-03-02 |
Poly-l-lactic acid electrospun membrane with specific morphology promotes bone regeneration through macrophage reprogramming
2026-Feb-19, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04182-y
PMID:41715106
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研究论文 | 本研究探讨了具有特定形态的聚左旋乳酸电纺膜通过巨噬细胞重编程促进骨再生的分子机制 | 通过单细胞RNA测序揭示了PLLA电纺膜通过调控巨噬细胞亚型转化(特别是M2极化)来促进骨再生的新机制,为骨免疫调节视角下的仿生材料设计提供了新见解 | 研究主要基于大鼠颅骨缺损模型,结果在人类或其他动物模型中的适用性有待验证;单细胞测序仅针对特定组别,可能未全面覆盖所有免疫微环境变化 | 探究不同形态PLLA电纺膜对骨再生的影响及其免疫调节机制 | 聚左旋乳酸电纺膜(不同排列方式和尺寸)、大鼠颅骨缺损模型、巨噬细胞和骨髓间充质干细胞 | 生物材料与组织工程 | 骨缺损 | 单细胞RNA测序、电纺技术、细胞共培养 | NA | 单细胞RNA测序数据、组织学数据 | 大鼠颅骨缺损模型(具体数量未明确),涉及多个材料组别 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1716 | 2026-03-02 |
The Proximity of PD-1-CD103+ Tissue-Resident CD8+ T Cells to Tumor Cells Is Correlated with Improved Clinical Outcomes in Patients with Cholangiocarcinoma
2026-Feb-19, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers18040680
PMID:41749934
|
研究论文 | 本研究探讨了胆管癌中CD8+组织驻留记忆T细胞的激活表型及其与肿瘤细胞的空间分布如何影响抗肿瘤免疫监视并预测临床结局 | 结合多重免疫组化和单细胞RNA测序,首次量化了PD-1-CD103+ CD8+ T细胞与肿瘤细胞的空间邻近性,并将其确定为改善临床结局的独立预测因子 | NA | 阐明胆管癌免疫微环境中CD8+ T细胞的激活状态和空间定位对预后的影响 | 胆管癌患者的肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 胆管癌 | 多重免疫组化, 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1717 | 2026-03-02 |
Signatures of Pancreatic Ductal Adenocarcinoma Uncovered by Integrative Multi-Omics Analysis
2026-Feb-19, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers18040687
PMID:41749940
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学分析揭示了胰腺导管腺癌的分子特征 | 成功将分子特征归因于不同的细胞类型群体,并识别出与肿瘤发生活性和免疫抑制相关的分子特征 | 未明确说明样本选择或数据整合的具体限制 | 更好地表征胰腺导管腺癌的分子特征以改善临床结果 | 胰腺导管腺癌肿瘤组织及配对正常邻近组织 | 数字病理学 | 胰腺导管腺癌 | 转录组学、蛋白质组学、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据 | 140个肿瘤组织、67个配对正常邻近组织、73个肿瘤组织的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1718 | 2026-03-02 |
AZD4635 Targets cAMP/CREB Axis to Salvage PARPi-Induced Immune Evasion and Enhance Antitumor Efficacy in Ovarian Cancer
2026-Feb-19, Pharmaceutics
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/pharmaceutics18020257
PMID:41754998
|
研究论文 | 本研究探讨了PARP抑制剂与A2A受体拮抗剂联合治疗卵巢癌的机制,通过靶向cAMP/CREB轴克服免疫逃逸并增强抗肿瘤效果 | 首次揭示PARPi耐药卵巢癌细胞中腺苷受体上调导致免疫抑制,并提出联合A2ARa靶向cAMP/CREB轴的新型治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,临床转化效果需进一步验证 | 探索PARPi与A2ARa联合治疗在卵巢癌中的抗肿瘤机制及免疫微环境调控 | 卵巢癌细胞和小鼠肿瘤模型 | 癌症免疫治疗 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量,涉及小鼠模型和体外细胞实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1719 | 2026-03-02 |
Upregulated ZBP1 Is Associated with B-Cell Dysregulation in Systemic Lupus Erythematosus
2026-Feb-17, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines14020451
PMID:41751350
|
研究论文 | 本研究通过整合转录组学分析,揭示了ZBP1在系统性红斑狼疮(SLE)患者B细胞中上调,并与B细胞活化、疾病活动度相关,提示其可能通过调控细胞周期通路参与SLE发病机制 | 首次系统性地将先天免疫感受器ZBP1与SLE中的B细胞功能失调联系起来,并通过单细胞转录组学揭示了其在多个B细胞亚群中的表达模式,同时结合功能实验验证了其对B细胞活化、浆细胞分化和抗体产生的调控作用 | 研究主要基于公共数据集和体外实验,直接因果关系尚未完全确立,缺乏体内模型验证和更深入的机制研究 | 探究ZBP1在系统性红斑狼疮(SLE)B细胞失调中的作用及其与疾病活动的关联 | 系统性红斑狼疮(SLE)患者的B细胞(包括初始B细胞、记忆B细胞、年龄相关B细胞和浆细胞) | 生物信息学与免疫学 | 系统性红斑狼疮 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 基因敲低实验 | NA | 转录组数据(批量RNA-seq和单细胞RNA-seq) | 基于多个公共数据集(GSE61635, GSE235658, GSE136035, GSE163497),具体样本数量未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1720 | 2026-03-02 |
Identification and Mechanism Research of Oxidative Stress-Related Biomarkers in Oral Lichen Planus
2026-Feb-13, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines14020420
PMID:41751319
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析识别了与口腔扁平苔藓相关的氧化应激生物标志物,并探索了其潜在机制 | 首次整合多个数据集和单细胞RNA测序技术,系统性地识别了TGFB1、KLF4、TNF、NQO1和MMP9作为口腔扁平苔藓的氧化应激相关生物标志物,并预测了潜在的治疗化合物和RNA修饰位点 | 研究主要基于公共数据集和生物信息学预测,实验验证仅限于qRT-PCR,缺乏更深入的体内外功能验证 | 识别和表征口腔扁平苔藓中与氧化应激相关的分子标志物及其作用机制 | 口腔扁平苔藓组织样本及相关基因表达数据 | 生物信息学 | 口腔扁平苔藓 | 单细胞RNA测序,定量实时PCR,分子对接模拟,RNA修饰分析 | NA | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | 来自GSE38616和GSE211630数据集的数据,涉及467个氧化应激相关基因 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |