单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 24273 篇文献，本页显示第 1681 - 1700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1681 | 2024-11-27 |
CD4+ T cells display a spectrum of recall dynamics during re-infection with malaria parasites
2024-Jun-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49879-6
PMID:38944658
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研究论文 | 研究了在再次感染疟原虫时，CD4+ T细胞的回忆反应动态 | 首次详细描述了在再次感染疟原虫时，不同CD4 T细胞亚群的回忆反应多样性，并提供了用于研究基因表达动态和克隆关系的图形用户界面 | 研究仅在老鼠模型中进行，结果可能不完全适用于人类 | 探讨在再次感染疟原虫时，CD4+ T细胞的回忆反应及其多样性 | CD4+ T细胞及其在再次感染疟原虫时的反应 | NA | 疟疾 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、T细胞受体测序（TCR-seq）和空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 老鼠模型中的CD4+ T细胞 |
| 1682 | 2024-11-27 |
Bacterial single-cell RNA sequencing captures biofilm transcriptional heterogeneity and differential responses to immune pressure
2024-Jun-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.28.601229
PMID:38979200
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研究论文 | 开发了一种优化的细菌单细胞RNA测序方法BaSSSh-seq，用于研究生物膜生长和免疫细胞暴露后的转录适应性 | 首次使用BaSSSh-seq方法捕捉生物膜转录异质性和对免疫压力的不同反应 | NA | 研究生物膜内细菌亚群的转录异质性和对免疫压力的适应性 | 细菌生物膜及其对免疫细胞暴露的转录反应 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 1683 | 2024-11-27 |
Rescue Blood Contamination in scRNA-Seq Data by Originator, a Computational Deciphering Tool using Genetic and Contextual Information
2024-Jun-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.04.588144
PMID:38617220
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研究论文 | 本文提出了一种名为Originator的计算框架，用于解析单细胞RNA测序数据中的血液污染问题 | 首次提出了一种计算框架Originator，能够通过遗传和上下文信息解析单细胞的遗传起源并分离血液细胞与组织细胞 | NA | 揭示复杂人体组织中单细胞RNA测序数据中的血液细胞污染问题 | 单细胞RNA测序数据中的血液污染问题 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 计算框架 | 单细胞RNA测序数据 | 多种组织的单细胞RNA测序数据 |
| 1684 | 2024-11-27 |
Dissecting tumor transcriptional heterogeneity from single-cell RNA-seq data by generalized binary covariance decomposition
2024-May-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.15.553436
PMID:37645713
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研究论文 | 本文介绍了一种新的统计方法——广义二元协方差分解（GBCD），用于从单细胞RNA测序数据中解析肿瘤转录异质性 | GBCD方法能够将转录异质性分解为可解释的成分，包括患者特异性、数据集特异性和与疾病亚型相关的共享成分，在强肿瘤间异质性的情况下，比现有方法产生更易解释的结果 | NA | 通过单细胞RNA测序数据识别与癌症进展相关的转录变异模式，并产生新的治疗相关见解 | 胰腺癌腺癌（PDAC）的肿瘤亚型和基因表达程序 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 广义二元协方差分解（GBCD） | 基因表达数据 | 来自三个胰腺癌腺癌（PDAC）研究的样本 |
| 1685 | 2024-11-27 |
To be or not to be - Decoding the Trabecular Meshwork Cell Identity
2024-Apr-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.26.591346
PMID:38746421
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序比较人小梁网细胞培养与组织，探讨细胞身份和可翻译性 | 首次报道了通过单细胞RNA测序比较人小梁网细胞培养与组织的研究方法 | 研究结果从细胞培养到组织研究的翻译仍存在挑战 | 探讨小梁网细胞的身份及其在组织中的可翻译性 | 人小梁网细胞培养与组织 | NA | 青光眼 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 共14个初级人小梁网样本，包括4个青光眼患者样本 |
| 1686 | 2024-11-27 |
Differentiation signals induce APOBEC3A expression via GRHL3 in squamous epithelia and squamous cell carcinoma
2024-Mar-04, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3997426/v1
PMID:38496447
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研究论文 | 研究了APOBEC3A和APOBEC3B在健康和恶性黏膜上皮中的表达及其在鳞状上皮和鳞状细胞癌中的调控机制 | 首次揭示了GRHL3在调节APOBEC3A表达中的作用，并展示了APOBEC3A在鳞状细胞癌中的表达和活性扩展机制 | NA | 探讨APOBEC3A和APOBEC3B在癌症中的表达及其对肿瘤发展和药物抗性的影响 | 健康和恶性黏膜上皮细胞中的APOBEC3A和APOBEC3B表达 | 数字病理学 | 鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序、免疫组化、空间转录组学 | NA | RNA | NA |
| 1687 | 2024-11-27 |
scRNA-Seq Analysis Revealed CAFs Regulating HCC Cells via PTN Signaling
2024, Journal of hepatocellular carcinoma
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JHC.S493675
PMID:39582814
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了癌症相关成纤维细胞（CAFs）通过PTN信号通路调控肝细胞癌（HCC）细胞 | 首次揭示了CAFs通过PTN/SDC2信号通路促进HCC进展的机制 | 研究仅基于单细胞RNA测序数据和有限的临床样本，未来需更多实验验证 | 探讨CAFs在肝细胞癌微环境中的作用机制 | 癌症相关成纤维细胞（CAFs）和肝细胞癌细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个单细胞RNA测序数据集（GSE158723和GSE112271）以及来自HCC患者的临床样本 |
| 1688 | 2024-11-27 |
Single-cell data revealed the function of natural killer cells and macrophage cells in chemotherapy tolerance in acute myeloid leukemia
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.18521
PMID:39583114
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组数据分析，揭示了自然杀伤细胞和巨噬细胞在急性髓系白血病化疗耐药中的功能 | 首次通过单细胞RNA测序数据揭示了自然杀伤细胞和巨噬细胞在急性髓系白血病化疗耐药中的潜在作用 | 研究主要基于单细胞转录组数据，缺乏体内实验验证 | 探讨免疫细胞在急性髓系白血病化疗耐药中的调控机制 | 急性髓系白血病患者的免疫细胞亚群及其标记基因 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 急性髓系白血病患者 |
| 1689 | 2024-11-27 |
MUC1 and CREB3 are Hub Ferroptosis Suppressors for Nucleus Pulposus and Annulus Fibrosus Degeneration by Integrated Bioinformatics and Experimental Verification
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S489052
PMID:39583856
|
研究论文 | 本研究通过整合生物信息学和实验验证，探讨了MUC1和CREB3作为核心铁死亡抑制因子在椎间盘退变中的作用 | 首次揭示了MUC1和CREB3作为椎间盘退变中的铁死亡抑制因子，并构建了药物和竞争性内源RNA网络 | 实验验证和单细胞RNA测序分析的样本量有限，可能影响结果的普适性 | 探索铁死亡相关基因及其在椎间盘退变中的作用 | 椎间盘的髓核和纤维环 | 生物信息学 | 椎间盘退变 | 基因表达分析、GO和KEGG分析、LASSO和SVM-RFE算法、GSEA和GSVA分析、CIBERSORT算法、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 髓核和纤维环的基因表达数据来自Gene Expression Omnibus数据库，实验验证和单细胞RNA测序分析的具体样本量未详细说明 |
| 1690 | 2024-11-27 |
Prognostic features of bladder cancer based on five neddylation-related genes
2024, American journal of clinical and experimental urology
IF:1.5Q3
DOI:10.62347/RWCH7802
PMID:39584004
|
研究论文 | 研究基于五个neddylation相关基因的膀胱癌预后特征 | 首次探讨neddylation在膀胱癌发病和进展中的潜在影响 | NA | 探索neddylation在膀胱癌中的作用及其对发病和进展的影响 | 膀胱癌的预后特征 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 基因表达数据分析 | LASSO回归分析 | 基因表达数据 | 11,361个差异表达基因和1,500个枢纽基因 |
| 1691 | 2024-11-27 |
A Mendelian randomisation approach to explore genetic factors associated with erectile dysfunction based on pooled genomic data
2024, American journal of clinical and experimental urology
IF:1.5Q3
DOI:10.62347/GENV7771
PMID:39584007
|
研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化方法探索与勃起功能障碍相关的遗传因素 | 首次利用孟德尔随机化分析结合全血表达数量性状位点和GWAS数据，筛选出与勃起功能障碍高度相关的基因MDM4 | 研究样本主要来自芬兰数据库，可能存在地域和人群偏倚 | 探索勃起功能障碍的遗传因素，为个性化治疗提供依据 | 勃起功能障碍相关的遗传基因 | 遗传学 | 男性健康 | 孟德尔随机化分析 | NA | 基因组数据 | 共95178个个体，包括1154个病例和94024个对照 |
| 1692 | 2024-11-27 |
Prognostic characteristics and drug sensitivity analysis of hepatocellular carcinoma based on histone modification-related genes: a multi-omics integrated study revealing potential therapeutic targets and individualized treatment strategies
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1489469
PMID:39584133
|
研究论文 | 本研究整合多组学数据，分析了肝细胞癌中与组蛋白修饰相关的基因，并开发了一种基于组蛋白修饰的预后特征，揭示了潜在的治疗靶点和个性化治疗策略 | 首次通过多组学整合分析，定义了110个与组蛋白相关的基因，并开发了一种新的预后特征，为肝细胞癌的个性化治疗提供了新的见解 | 研究主要基于现有数据集，未来需要进一步的临床验证 | 探讨组蛋白修饰在肝细胞癌中的作用，并开发新的预后特征和治疗策略 | 肝细胞癌患者及其组蛋白修饰相关基因 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | 机器学习 | 基因组数据、临床信息 | 多个队列的数据，包括单细胞RNA测序和批量RNA测序 |
| 1693 | 2024-11-27 |
Multi-Omics Exploration of the Role of PTGS2 as a Hub Gene in Ferroptosis Within the Artery of Takayasu Arteritis
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S478413
PMID:39588139
|
研究论文 | 本研究探讨了PTGS2作为Takayasu动脉炎中铁死亡相关枢纽基因的多组学作用 | 首次通过高通量和单细胞转录组学研究Takayasu动脉炎中的铁死亡机制，并识别出PTGS2作为核心基因 | 研究样本量较小，且缺乏动脉样本 | 探索Takayasu动脉炎中铁死亡的机制 | Takayasu动脉炎患者的动脉样本 | 数字病理学 | Takayasu动脉炎 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 8名Takayasu动脉炎患者和8名肾移植供体的样本，以及3个公共颈动脉样本 |
| 1694 | 2024-11-27 |
CXCR6 expression predicts prognosis and immunotherapeutic benefit in muscle-invasive bladder cancer
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1498579
PMID:39588301
|
研究论文 | 研究探讨了CXCR6在肌肉浸润性膀胱癌中的表达及其对预后和免疫治疗效果的预测作用 | 首次系统研究了CXCR6在肌肉浸润性膀胱癌中的表达及其对预后和免疫治疗效果的影响 | NA | 探讨CXCR6在肌肉浸润性膀胱癌中的作用及其对预后和免疫治疗效果的预测价值 | 肌肉浸润性膀胱癌患者 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 391名肌肉浸润性膀胱癌患者的数据，212名来自GEO，131名来自本中心，195名来自IMvigor210队列，以及9名膀胱癌患者的单细胞RNA测序数据 |
| 1695 | 2024-11-27 |
Periodontal ligament tissues support neutrophil differentiation and maturation processes
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1446541
PMID:39588378
|
研究论文 | 研究牙周韧带组织支持中性粒细胞分化和成熟过程 | 首次揭示牙周韧带中中性粒细胞的异质性及其在成熟过程中的不同阶段 | 研究仅基于小鼠牙周韧带中的单细胞RNA测序数据，未涉及人类样本 | 探讨牙周韧带中中性粒细胞的分化和成熟过程 | 牙周韧带中的中性粒细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠牙周韧带中的单细胞RNA测序数据 |
| 1696 | 2024-11-27 |
Ferroptosis-related prognostic model of mantle cell lymphoma
2024, Open medicine (Warsaw, Poland)
DOI:10.1515/med-2024-1090
PMID:39588389
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研究论文 | 本研究建立了一个与铁死亡相关的基因模型，用于评估套细胞淋巴瘤患者的预后 | 首次建立了基于铁死亡相关基因的套细胞淋巴瘤预后模型，并预测了潜在的治疗药物 | NA | 开发一个基于铁死亡相关基因的预后模型，用于评估套细胞淋巴瘤患者的预后 | 套细胞淋巴瘤患者 | NA | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | Cox回归和Least absolute selection and shrinkage Operator回归分析 | 基因表达数据 | 使用了GSE184031和GSE32018数据集中的样本 |
| 1697 | 2024-11-27 |
Causal impact of gut microbiota on five liver diseases: insights from mendelian randomization and single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1362139
PMID:39588518
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研究论文 | 研究肠道微生物群对五种肝脏疾病的因果影响，通过孟德尔随机化和单细胞RNA测序分析 | 首次通过孟德尔随机化分析和单细胞RNA测序揭示了肠道微生物群与五种肝脏疾病之间的因果关系，并发现Prevotella具有保护作用 | 研究依赖于现有的大规模全基因组关联研究数据，可能存在数据偏差 | 探讨肠道微生物群与肝脏疾病之间的因果关系，并评估Prevotella的保护作用 | 肠道微生物群和五种肝脏疾病（酒精性肝病、肝硬化、肝功能衰竭、良性肝肿瘤和原发性肝恶性肿瘤） | NA | 肝脏疾病 | 孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、单细胞RNA测序数据 | 13,266个样本用于全基因组关联研究 |
| 1698 | 2024-11-27 |
Spatial Omics: Navigating Neuroscience Research into the New Era
2024, Advances in neurobiology
DOI:10.1007/978-3-031-69188-1_6
PMID:39589713
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研究论文 | 本文探讨了空间组学技术在神经科学研究中的应用及其对脑组织结构理解的革命性影响 | 本文介绍了空间组学技术，特别是结合转录组学和蛋白质组学的技术，如何通过FISH、ISS和NGS等方法提供详细的空间背景信息，克服了传统技术的分辨率和全面性限制 | 尽管空间组学技术在成本、速度和数据分析方面存在挑战，但其仍在不断发展 | 本文旨在探讨空间组学技术在神经科学研究中的应用，以深入理解脑组织结构和神经退行性疾病 | 本文主要研究对象是人类大脑的神经元和突触，以及这些结构在神经发育和疾病中的作用 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 空间组学技术，包括FISH、ISS和NGS | NA | 基因表达和表观遗传状态数据 | NA |
| 1699 | 2024-11-27 |
A spatial human thymus cell atlas mapped to a continuous tissue axis
2023-Oct-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.25.562925
PMID:37986877
|
研究论文 | 本文通过空间解析分析，建立了一个新的定量形态学框架，用于描述胸腺的皮质-髓质轴，并展示了胸腺细胞和胸腺上皮细胞的高度组织性 | 本文创新性地结合了多模态单细胞、空间转录组学和高分辨率多重成像技术，构建了一个连续组织轴上的空间人类胸腺细胞图谱 | NA | 研究胸腺细胞在出生前和出生后的发育过程及其微解剖学基础 | 胸腺细胞和胸腺上皮细胞的发育轨迹及其组织结构 | NA | NA | 空间转录组学、高分辨率多重成像 | NA | 单细胞数据、空间转录组数据、图像数据 | NA |
| 1700 | 2024-11-27 |
Ras drives malignancy through stem cell crosstalk with the microenvironment
2022-12, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-05475-6
PMID:36450983
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研究论文 | 研究了RAS激活后癌症干细胞与微环境之间的异常信号交流如何驱动恶性进展 | 揭示了癌症干细胞与微环境之间的动态交流如何促进从良性到恶性鳞状细胞癌的转变 | 研究主要基于小鼠模型，可能不完全适用于人类癌症 | 探讨RAS激活后癌症干细胞与微环境之间的信号交流如何驱动恶性进展 | 癌症干细胞与微环境之间的信号交流 | 癌症生物学 | 鳞状细胞癌 | 单细胞转录组学、染色质景观分析、慢病毒报告基因和谱系追踪 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 |