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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1681 | 2026-10-01 |
Meis2 transcription factor regulates craniofacial osteogenesis via IGF signaling and cell adhesion
2026-Dec, Bone
IF:3.5Q2
DOI:10.1016/j.bone.2026.118075
PMID:42674164
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研究论文 | 该研究结合空间转录组学与单细胞参考图谱,解析Meis2缺陷胚胎颅面成骨过程中间充质细胞的空间格局,揭示IGF2信号轴与细胞黏附在成骨分化中的作用 | 首次在Meis2缺陷胚胎早期成骨阶段,利用空间转录组学整合单细胞参考图谱,识别出独特的软骨-骨祖细胞微环境,并揭示IGF2信号轴在突变间充质区室中的富集及其与细胞黏附失调的机制关联 | 研究主要基于小鼠胚胎模型和体外功能实验,IGF2信号通路与细胞黏附之间的直接分子机制尚未完全阐明,且未验证人类颅面发育中的保守性 | 阐明Meis2转录因子调控颅面成骨的细胞空间背景及下游效应通路,特别是IGF信号和细胞黏附的作用 | Meis2缺陷小鼠胚胎的颅神经嵴细胞来源间充质 | 空间转录组学 | 颅面发育异常 | 空间转录组学, 单细胞转录组学, 免疫荧光, 体外分化实验 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1682 | 2026-10-01 |
From cell culture to cellular biology in animal-parasitic nematodes: Biotechnological advances
2026-Dec, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.109007
PMID:42586327
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综述 | 本文综述了动物寄生线虫细胞生物学研究从细胞培养到单细胞与空间转录组学等生物技术进展,并提出了将细胞身份与发育动态、解剖背景及功能验证相联系的优先研究方向 | 系统梳理了从早期线虫细胞分离培养到单细胞/单核转录组学、空间转录组学、类器官与共培养系统及功能遗传学平台的技术演进,并提出将细胞身份与发育动态、解剖背景、培养鉴定及可实验验证功能相连接的研究框架 | 目前尚无任何单一系统能够实现全生命周期细胞覆盖、空间分辨的组织结构解析、寄生线虫来源细胞或组织的持续培养以及可靠的功能扰动 | 追踪动物寄生线虫细胞生物技术从细胞分离维持到细胞身份界定及其与生物功能整合的发展,并提出未来研究重点 | 动物寄生线虫及其来源细胞、细胞核与组织,并参考秀丽隐杆线虫、植物寄生线虫和寄生吸虫的方法学经验 | 数字病理学 | 寄生虫感染 | 单细胞转录组学, 单核转录组学, 空间转录组学 | NA | 文本, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1683 | 2026-10-01 |
MOTS-c, a mitochondrial-derived peptide, ameliorates lysosomal membrane permeability and improves survival of soft tissue transplantation
2026-Oct, Autophagy
IF:14.6Q1
DOI:10.1080/15548627.2026.2677180
PMID:42153537
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研究论文 | 本研究探讨了线粒体衍生肽MOTS-c通过抑制PLA2G4A磷酸化、经由MAPK1-MAPK3-NFKB信号通路减轻溶酶体膜通透性并减少细胞焦亡,从而改善缺血皮瓣存活的作用及机制 | 首次揭示MOTS-c通过靶向PLA2G4A-LMP轴调控溶酶体膜通透性和内皮细胞焦亡,从而改善缺血皮瓣存活 | 研究主要基于动物模型和细胞实验,缺乏临床转化验证,且MOTS-c的具体受体和上游调控机制尚未完全阐明 | 探究MOTS-c在缺血皮瓣中的保护作用及其通过PLA2G4A-LMP轴发挥作用的分子机制 | 缺血皮瓣模型、人脐静脉内皮细胞(HUVECs) | 机器学习 | 心血管疾病 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 组织透明化, 激光散斑对比成像, 多普勒分析, 蛋白质印迹, ELISA, 免疫荧光, 免疫共沉淀, 质谱, 表面等离子共振 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1684 | 2026-10-01 |
Identification and Experimental Validation of PANoptosis Key Genes for Constructing a PANoptosis Risk Diagnostic Model in Intervertebral Disc Degeneration
2026-Oct, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.70115
PMID:42803180
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研究论文 | 该研究通过单细胞测序、机器学习算法和LASSO回归识别椎间盘退变中PANoptosis关键基因,构建风险诊断模型,并通过qRT-PCR、Western blot、免疫组化及大鼠模型验证其诊断与治疗价值 | 首次识别椎间盘退变中七个PANoptosis关键基因并构建PANoptosis风险诊断模型,同时通过体内实验验证ACSBG1敲低可减轻椎间盘退变,为椎间盘退变的诊断和治疗提供新思路 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 识别与椎间盘退变相关的PANoptosis关键基因,构建风险诊断模型,并验证其诊断和治疗潜力 | 椎间盘退变患者临床组织样本及大鼠椎间盘退变模型 | 机器学习 | 椎间盘退变 | 单细胞测序, qRT-PCR, Western blot, 免疫组化 | LASSO回归, 机器学习算法 | 单细胞测序数据, 基因表达数据, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1685 | 2026-10-01 |
Retraction notice to "Single-cell RNA-seq reveals the immune response of co-infection with Streptococcus pneumoniae after influenza A virus by a lung-on-chip: The molecular structure and mechanism of tight junction protein ZO-1" [Int. J. Biol. Macromol. 306 (2025) 141815]
2026-10, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.153571
PMID:42481340
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1686 | 2026-10-01 |
Enhancer collapse dictates PKHD1 silencing and centrosome-mediated chromosomal instability and metastasis in clear cell renal cell carcinoma
2026-Oct-01, Experimental cell research
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.yexcr.2026.115150
PMID:42586231
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研究论文 | 该研究通过机器学习驱动的筛选与孟德尔随机化分析,鉴定PKHD1为肾透明细胞癌中维持基因组稳定性的关键因子,并揭示其通过增强子表观遗传失活导致中心体介导的染色体不稳定和转移的机制 | 首次发现PKHD1作为中心体CEP97-CP110复合物的维持因子,并揭示其在ccRCC中因远端800-kb增强子表观遗传失活而沉默,建立了三维基因组调控与中心体稳态之间的新联系 | 摘要中未明确提及研究的具体局限性 | 鉴定调控肾脏基因组完整性的关键驱动因子,并阐明其在ccRCC进展中的作用机制 | ccRCC细胞系、临床队列样本、单细胞和空间转录组数据 | 机器学习, 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞转录组测序, 空间转录组测序, 孟德尔随机化分析 | 机器学习 | 图像, 文本 | NA | NA | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | NA |
| 1687 | 2026-10-01 |
Hyperglycemia-Induced Microglial CTSS Disrupts Blood-Retinal Barrier Integrity via PAR2-Dependent Downregulation of Endothelial MFSD2A
2026-Oct, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1002/cns.71187
PMID:42804124
|
研究论文 | 本研究结合糖尿病小鼠视网膜的单细胞RNA测序与体内外模型,揭示高血糖诱导视网膜微胶质细胞CTSS上调,通过PAR2通路抑制内皮MFSD2A表达,增强转胞吞作用,破坏血视网膜屏障完整性,从而促进糖尿病视网膜病变进展。 | 首次揭示高血糖诱导的微胶质细胞CTSS通过PAR2依赖性下调内皮MFSD2A来破坏血视网膜屏障完整性,阐明了固有免疫与血视网膜屏障 breakdown 之间的分子机制,并发现MFSD2A过表达可独立于紧密连接调节降低血管通透性。 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究糖尿病视网膜病变中微胶质细胞与内皮细胞之间的分子机制,特别是CTSS-PAR2-MFSD2A通路在血视网膜屏障破坏中的作用 | 糖尿病小鼠视网膜、人视网膜微血管内皮细胞(HRMECs)、人微胶质细胞(HMC3) | 数字病理学, 机器学习 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序, siRNA敲低, 质粒过表达, 腺相关病毒(AAV)介导的基因敲低, 转胞吞实验, 全息3D断层扫描 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1688 | 2026-10-01 |
GLP-1R agonist semaglutide protects human forebrain organoids from cholesterol-induced neurotoxicity
2026-Oct, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.71888
PMID:42805933
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研究论文 | 本研究利用人诱导多能干细胞来源的前脑类器官建立胆固醇过载模型,整合转录组学、钙成像和生化实验,揭示GLP-1R激动剂司美格鲁肽对胆固醇诱导神经毒性的保护作用及机制 | 首次在人前脑类器官中证明司美格鲁肽可直接缓解胆固醇过载诱导的神经毒性,并通过整合批量/单细胞转录组学、钙成像揭示其细胞内cAMP-PKA和PI3K-AKT-mTOR信号机制及细胞间中期因子信号网络保护作用 | 研究基于体外类器官模型,尚需体内实验和临床试验验证;类器官无法完全模拟人脑复杂微环境;样本量有限;长期安全性及疗效未评估 | 探究GLP-1R激动剂司美格鲁肽能否直接缓解人神经细胞中胆固醇诱导的代谢应激,并阐明其神经保护机制 | 人诱导多能干细胞来源的前脑类器官 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 钙成像, 生化检测 | NA | 转录组数据, 图像, 生化数据 | NA | NA | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1689 | 2026-10-01 |
Integrated Multi-Omics and Single-Cell Analyses Implicate NOX4 as an Icariin-Associated Oxidative Stress Regulatory Node in Gastric Cancer
2026-Oct, Food science & nutrition
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/fsn3.72390
PMID:42807617
|
研究论文 | 本研究整合网络药理学、批量转录组分析和单细胞RNA测序,鉴定淫羊藿苷相关胃癌基因,发现NOX4是潜在的氧化应激调控节点 | 首次整合网络药理学、多队列批量转录组和单细胞RNA测序鉴定淫羊藿苷相关胃癌靶点,发现NOX4阳性内皮细胞亚群并构建相关分子分型和预后模型,结合分子对接和分子动力学模拟探索淫羊藿苷与NOX4的相互作用 | NOX4是否为淫羊藿苷的直接分子靶点尚需进一步实验验证,其治疗相关性仍需更多研究阐明 | 鉴定淫羊藿苷在胃癌中潜在的分子靶点,探索其抗胃癌活性的分子机制 | 胃癌患者转录组数据和AGS胃癌细胞系 | 机器学习 | 胃癌 | 批量RNA-seq,单细胞RNA-seq,网络药理学,分子对接,分子动力学模拟 | LASSO-Cox | 转录组数据,单细胞转录组数据,图像 | 单细胞RNA测序数据包含142,053个细胞(GSE183904),批量转录组数据来自TCGA-STAD及GSE15497、GSE84437、GSE84433、GSE26253多个队列 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 1690 | 2026-10-01 |
Reference-Based Cell Type Deconvolution Using Self-Supervised Contrastive Learning in Spatial Transcriptomics with Ctdecon
2026-Sep-30, Molecular omics
IF:3.0Q3
DOI:10.1093/molecular-omics/aaiag023
PMID:42813985
|
研究论文 | 本文提出ctdecon,一个基于自监督对比学习的神经网络模块,利用scRNA-seq参考数据对空间转录组数据中的细胞类型进行解卷积,获取每个空间位点中细胞类型的比例 | 不同于仅依赖基因表达的现有方法,ctdecon整合了细胞类型的空间相关性来提升解卷积性能,同时最小化重建误差并保持生物学合理性,确保对技术噪声的泛化能力,还能直接提供具有空间分辨率的细胞类型图谱 | 摘要中未提及 | 解决单个空间位点内多种细胞类型信号严重混合的问题,获取每个空间位点中合理的细胞类型比例 | 空间转录组数据中的空间位点及scRNA-seq参考细胞类型 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 自监督对比学习, 神经网络 | 基因表达数据, 空间转录组数据 | NA | NA | scRNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1691 | 2026-10-01 |
Single-cell transcriptomics identifies neural fate disruption and glial reprogramming caused by RARS2 deficiency
2026-Sep-29, Journal of medical genetics
IF:3.5Q2
DOI:10.1136/jmg-2025-111413
PMID:42532830
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研究论文 | 该研究利用rars2缺陷斑马鱼模型和单细胞RNA测序,揭示了RARS2缺陷导致神经命运破坏和胶质重编程的机制 | 首次在单细胞水平系统解析RARS2缺陷对神经谱系发育的影响,揭示了神经发生转录网络抑制和胶质/细胞外基质程序激活的协同重编程机制 | 研究基于斑马鱼模型,其结论向人类PCH6患者的转化仍需进一步验证;仅检测了48小时受精后的单一时间点 | 探究RARS2缺陷如何破坏神经谱系发育及其分子机制 | rars2缺陷斑马鱼胚胎(48小时受精后) | 单细胞转录组学 | 脑桥小脑发育不全6型 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、CRISPR/Cas9基因编辑、免疫荧光、原位杂交、行为学实验、超微结构分析 | NA | 单细胞转录组数据、图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1692 | 2026-10-01 |
Spatially resolved single cell atlas deciphers SAA1 inflammatory epithelial cells
2026-Sep-29, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-026-00464-1
PMID:42805970
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学与单细胞RNA测序整合分析人类牙龈组织,并结合宏基因组分析,揭示了SAA1+炎症上皮细胞在牙周炎中的作用机制 | 首次在人类牙龈组织中鉴定出位于结合上皮的SAA1+Epi亚群,并阐明其通过TLR2-PITX2轴被牙龈卟啉单胞菌脂多糖激活,进而通过TGFβ和CXCL6调控结缔组织炎症和NK细胞招募的机制 | 摘要未提及研究局限性 | 探究慢性炎症性疾病中上皮完整性的破坏机制,特别是上皮异质性和微生物-上皮-结缔组织串扰 | 人类牙龈组织及匹配的龈下菌斑 | 空间转录组学, 单细胞转录组学, 微生物组学 | 牙周炎 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 宏基因组分析 | NA | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 宏基因组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 宏基因组测序 | NA | NA |
| 1693 | 2026-10-01 |
Spatial transcriptomic analysis of neurons at the glioma infiltration front: A case study
2026-Sep-29, Brain pathology (Zurich, Switzerland)
DOI:10.1111/bpa.70154
PMID:42808225
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研究论文 | 通过空间转录组学分析胶质瘤浸润前沿的神经元,揭示了神经元中局部IGFBP5表达及TGFβ相关信号通路 | 采用空间转录组学技术聚焦胶质瘤浸润前沿的神经元,发现IGFBP5和TGFβ信号在肿瘤浸润区域的空间特异性表达模式 | 仅为案例研究,样本量有限,结论的普遍性有待更大规模研究验证 | 探究胶质瘤浸润前沿神经元的空间转录组特征及其与肿瘤微环境的相互作用 | 胶质瘤浸润组织中的神经元 | 空间转录组学 | 胶质瘤 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1694 | 2026-10-01 |
High ZFP36 Family Expression in Exhausted T Cells Is Associated With Impaired Antitumor Effector Function
2026-Sep-29, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.70546
PMID:42808336
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研究论文 | 该研究对一名PD-1阻断治疗后快速复发的患者的肿瘤浸润淋巴细胞进行单细胞RNA测序,发现耗竭CD8 T细胞中ZFP36家族RNA结合蛋白表达升高,并通过实验证明其通过转录后调控抑制细胞因子产生,从而损害抗肿瘤效应功能 | 首次在PD-1阻断治疗快速复发患者的TIL中通过scRNA-seq发现ZFP36家族在耗竭CD8 T细胞中高表达,并揭示了ZFP36家族通过结合AU富集元件加速Tnf、Il2和Ifng mRNA降解从而抑制细胞因子产生的机制,同时发现缺氧可加剧这一过程 | 研究主要基于单个患者的scRNA-seq数据,样本量有限;ZFP36家族在EL4 T细胞中的功能验证为体外实验,缺乏体内模型的进一步验证;公共bulk转录组数据的预后相关性分析仅为关联性研究,未进行深入的机制验证 | 探究与免疫检查点抑制剂疗效降低相关的T细胞状态及其分子机制,揭示ZFP36家族在耗竭T细胞中损害抗肿瘤效应功能的作用 | 一名PD-1阻断治疗后快速复发患者的肿瘤浸润淋巴细胞、EL4 T细胞系、公共bulk肿瘤转录组数据集中的ICI治疗患者 | digital pathology | lung cancer | scRNA-seq, bulk RNA-seq | NA | 文本, 图像 | 一名PD-1阻断治疗后快速复发患者的肿瘤浸润淋巴细胞样本,以及公共bulk肿瘤转录组数据集中的ICI治疗患者样本 | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1695 | 2026-10-01 |
A Brain-Targeted Nanozyme System for Alleviating Poststroke Neuroinflammation via Synergistic Antioxidant and Anti-inflammatory Mechanisms
2026-Sep-29, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.6c13505
PMID:42809356
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研究论文 | 该研究开发了一种脑靶向纳米酶系统TLNP@Pt/Fe3O4,通过T7肽修饰的脂质纳米颗粒包裹Pt/Fe3O4纳米酶,实现协同抗氧化和抗炎作用以缓解缺血性卒中后的神经炎症 | 将Pt/Fe3O4纳米酶封装于T7肽修饰的脂质纳米颗粒中,构建脑靶向纳米酶系统,整合靶向递送、多酶催化(SOD/CAT/POD样活性)和多靶点调控于一体,通过PI3K/AKT信号通路协同调节氧化还原稳态和炎症微环境 | 摘要未明确提及研究局限性 | 开发一种脑靶向纳米酶系统,用于缓解缺血性卒中后的神经炎症和氧化应激损伤 | 缺血性卒中(IS)、tMCAO小鼠模型、小胶质细胞、神经元 | 机器学习, 数字病理学 | 心血管疾病 | scRNA-Seq | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1696 | 2026-10-01 |
Integrated network toxicology and multiomics analyses reveal the mechanisms underlying trimethyltin chloride-induced epilepsy and the ameliorative effects of astaxanthin via NFKB1 and IL6
2026-Sep-29, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2026.120870
PMID:42810259
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研究论文 | 本研究采用网络毒理学与多组学分析方法,揭示了三甲基氯化锡诱导癫痫的分子机制及虾青素通过NFKB1和IL6发挥改善作用 | 整合了NHANES人群队列分析、网络毒理学、机器学习、单细胞RNA测序、孟德尔随机化、虚拟基因敲除、分子对接、分子动力学模拟及体内动物实验等多维度分析框架,系统鉴定了TMT诱导癫痫的核心靶点及AST的干预机制 | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 系统识别和验证三甲基氯化锡诱导癫痫的核心靶点及候选治疗化合物,并阐明虾青素的靶向干预机制 | 三甲基氯化锡诱导的癫痫及相关核心基因NFKB1和IL6,以及天然海洋产物虾青素 | 机器学习 | 癫痫 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 分子对接, 分子动力学模拟 | NA | 文本, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1697 | 2026-10-01 |
Integrative multi-omics analysis identifies programmed cell death-related biomarkers and their environmentally relevant toxicological interactions in abdominal aortic aneurysm
2026-Sep-29, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2026.120853
PMID:42810262
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研究论文 | 该研究通过整合多组学分析(包括批量转录组、单细胞RNA测序和独立测序的临床样本),系统表征了腹主动脉瘤中程序性细胞死亡(PCD)的失调,鉴定了核心PCD基因并构建了基于人工神经网络的风险模型,同时揭示了与环境化合物的相互作用。 | 首次整合多组学数据系统分析腹主动脉瘤中程序性细胞死亡的失调,结合机器学习鉴定核心基因并构建ANN风险模型,同时通过化学-基因相互作用分析将环境毒物与PCD核心基因联系起来,并实验验证LEP作为潜在生物标志物。 | 摘要中未明确提及研究的局限性。 | 系统表征腹主动脉瘤中程序性细胞死亡的失调,识别可靠的生物标志物,并探索其与环境相关毒理学因素的相互作用。 | 腹主动脉瘤(AAA)患者样本,包括批量转录组数据集、单细胞RNA测序队列、独立测序的临床样本以及UK Biobank人群数据。 | 机器学习 | 心血管疾病 | 批量RNA-seq,单细胞RNA测序 | 人工神经网络(ANN) | 转录组数据,单细胞RNA测序数据,临床数据 | 多个队列,包括批量转录组数据集、单细胞RNA测序队列和独立测序的临床样本,具体样本量未在摘要中明确说明 | NA | bulk RNA-seq,single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1698 | 2026-10-01 |
Spatial evolution of a cachexia-promoting microenvironment in pancreatic cancer
2026-Sep-29, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2026.09.012
PMID:42810340
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研究论文 | 该研究通过整合单细胞RNA测序、Xenium空间转录组学、多重免疫组化、bulk转录组学和功能研究,在人类和小鼠胰腺癌样本中定义了一个由SEMA4A肿瘤细胞、AQP9巨噬细胞和LOXL2癌症相关成纤维细胞组成的恶病质相关微环境生态位,并揭示了其空间演化机制 | 首次定义了胰腺癌恶病质相关的微环境生态位,包括SEMA4A肿瘤细胞、AQP9巨噬细胞和LOXL2癌症相关成纤维细胞三种细胞类型,并阐明了SEMA4A-BMP2-AQP9巨噬细胞-CXCL8-LOXL2成纤维细胞-外泌体N-糖基化LOXL2-FOSL1/SEMA4A的正反馈信号环路,同时通过空间分析揭示了该生态位随恶病质严重程度的渐进性富集及其与术后恶病质发生的关联 | 摘要中未明确提及研究局限性,但整合多种技术的研究可能受样本量限制,且机制研究主要在动物模型中进行,人类样本验证的广度可能有限 | 揭示胰腺癌肿瘤进展与系统性消耗(恶病质)之间的细胞环路和微环境空间演化机制 | 人类非恶病质、前恶病质和恶病质胰腺癌样本,以及小鼠胰腺癌模型 | 空间转录组学, 单细胞组学, 肿瘤微环境 | 胰腺癌, 癌症恶病质 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫组化, bulk转录组学, 功能研究 | NA | 图像, 文本 | 人类非恶病质、前恶病质和恶病质胰腺癌样本(具体数量未提及),以及小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Xenium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台和10x Xenium空间转录组学平台 |
| 1699 | 2026-10-01 |
PRISM-GEP: Viewing Single-Cell Expression through the Lens of Topic Modeling
2026-Sep-29, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag728
PMID:42811202
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研究论文 | 本文提出PRISM-GEP方法,利用潜在狄利克雷分配(LDA)从单细胞RNA-seq数据中发现重叠的基因表达程序(GEPs),并在多个数据集上验证其性能 | 使用基于基因共表达估计的先验替代LDA默认的平坦先验,无需参考数据集或通路数据库,能够发现重叠的基因表达程序,且在每个程序内对基因进行排序以恢复发育级联 | 未在摘要中明确提及 | 从单细胞RNA-seq数据中恢复共调控的基因模块(基因表达程序),并解决现有方法将每个基因分配到单一程序而破坏重叠结构的问题 | 15个人类和小鼠单细胞RNA-seq数据集 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq | 潜在狄利克雷分配(LDA) | 基因表达数据 | 15个人类和小鼠数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1700 | 2026-10-01 |
TLR7 agonist plus anti-PD-L1 enhances HBsAg decline and reinvigorates HBV-specific CD8+ T cells: OCEANcure05 RCT study
2026-Sep-29, Clinical and molecular hepatology
IF:14.0Q1
DOI:10.3350/cmh.2026.0476
PMID:42811768
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研究论文 | 该研究评估了核苷(酸)类似物联合TLR7激动剂TQ-A3334±抗PD-L1抗体TQ-B2450在病毒抑制的慢性乙型肝炎患者中的安全性、疗效及免疫学特征 | 首次在慢性乙型肝炎患者中联合应用TLR7激动剂与抗PD-L1抗体,并通过单细胞RNA测序揭示联合治疗可增强HBV特异性CD8+ T细胞应答并拓宽HBV肽段识别谱 | 样本量小(仅24例),随访时间短(24周),HBsAg下降幅度有限,未设置安慰剂对照 | 评估核苷(酸)类似物联合TLR7激动剂TQ-A3334±抗PD-L1抗体TQ-B2450在病毒抑制的慢性乙型肝炎患者中的安全性、疗效及免疫学特征 | 24例接受核苷(酸)类似物治疗且HBsAg在250-5000 IU/mL之间的慢性乙型肝炎患者 | 机器学习 | 慢性乙型肝炎 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 文本, 图像 | 24例慢性乙型肝炎患者 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |