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当前共找到 43167 篇文献,本页显示第 1641 - 1660 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1641 2026-08-23
Targeting RPE Senescence Via Suppressing IL-6/IL-6R Signaling for Treating Retinal Degenerative Diseases
2025-09-02, Investigative ophthalmology & visual science IF:5.0Q1
研究论文 本研究探讨了IL-6/IL-6R信号轴在视网膜色素上皮细胞衰老中的作用,并评估了抑制该通路对治疗视网膜退行性疾病的疗效。 首次揭示IL-6/IL-6R/STAT3信号轴形成衰老诱导环路,并证明托珠单抗可阻断该通路,扩大其临床应用指征。 研究主要基于小鼠模型,人体有效性需进一步验证。 探究IL-6/IL-6R轴是否在RPE细胞中建立衰老诱导环路,并评估其抑制对挽救衰老RPE细胞和退行性视网膜的治疗效果。 小鼠视网膜色素上皮细胞及视网膜组织。 分子生物学,眼科学 视网膜退行性疾病 单细胞RNA测序,AAV介导基因敲除,免疫荧光染色 小鼠模型 基因表达数据,图像数据 未明确提及,使用NaIO₃诱导的视网膜变性小鼠模型 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'转录组测序
1642 2026-08-23
Autophagy Regulates Müller Glial Cell Inflammatory Activation
2025-08-01, Investigative ophthalmology & visual science IF:5.0Q1
研究论文 该研究探讨了自噬在视网膜Müller胶质细胞炎症激活中的调节作用,通过基因敲除和单细胞测序等方法揭示了自噬限制细胞激活和炎症的机制。 首次发现自噬通过调节Müller细胞的激活状态来维持眼内免疫特权,并揭示了自噬缺乏导致所有Müller细胞变为胶质化状态的新机制。 研究主要基于小鼠模型,可能不完全适用于人类;此外,未深入探讨自噬调节Müller细胞激活的上游信号通路。 探究自噬在视网膜Müller胶质细胞炎症激活中的作用及其对眼内免疫特权的维持机制。 小鼠视网膜Müller胶质细胞 分子生物学 眼科炎症性疾病 单细胞RNA测序、基因敲除、小干扰RNA敲低、免疫荧光共聚焦显微镜、流式细胞术 NA 基因表达数据、图像数据 使用对照组和Atg5基因敲除的小鼠视网膜Müller细胞 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium 单细胞RNA测序平台
1643 2026-08-23
DGAT: A Dual-Graph Attention Network for Inferring Spatial Protein Landscapes from Transcriptomics
2025-Jul-09, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 提出了一种名为DGAT的双图注意力网络,用于从转录组数据推断空间蛋白质表达谱 首次通过构建整合转录组、蛋白质组和空间信息的异构图,并利用图注意力网络从仅含转录组的空间数据中推断蛋白质表达 未在摘要中明确提及局限性 弥合空间转录组学缺乏蛋白质测量的关键空白,实现从转录组数据中获得蛋白质层面的见解,增强癌症、免疫学和精准医学中的功能解读 扁桃体、乳腺癌、胶质母细胞瘤和恶性间皮瘤的空间转录组数据集及相应的空间CITE-seq数据集 机器学习和空间组学 乳腺癌、胶质母细胞瘤、恶性间皮瘤 空间CITE-seq 图注意力网络 空间转录组数据、蛋白质表达数据、空间信息 多个公共和内部数据集 未明确提及 空间转录组学、空间CITE-seq 未明确提及 未明确提及
1644 2026-08-23
Boosting data interpretation with GIBOOST to enhance visualization of complex high-dimensional data
2025-Jul-02, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 提出GIBOOST框架,通过贝叶斯方法和优化自编码器整合多个降维方法,提升高维单细胞数据可视化和解释能力 首次利用贝叶斯框架和GI优化自编码器系统整合多个降维方法的输出,自动选择最优组合,显著提高聚类敏感性和生物学相关性 主要依赖降维方法输出,可能对极大数据集计算开销较大,且需要已知生物学过程进行验证 开发一种AI驱动框架,增强复杂高维单细胞数据的可视化和可解释性,保留全局与局部结构 单细胞RNA-seq数据集,包括上皮-间质转化、CiPSC重编程、精子发生和胎盘发育等动态生物学过程 机器学习 NA 单细胞RNA测序 自编码器、贝叶斯模型 基因表达数据 包含约400,000个细胞,28种细胞类型,来自七个胎盘区域的数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1645 2026-08-23
Histone deacetylases facilitate Th17-cell differentiation and pathogenicity in autoimmune uveitis via CDK6/ID2 axis
2025-06, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序和实验模型,揭示了组蛋白去乙酰化酶通过CDK6/ID2轴促进自身免疫性葡萄膜炎中Th17细胞分化和致病性的机制 首次发现HDACs通过CDK6/ID2正反馈环路调控Th17细胞致病性,并提出HDAC抑制剂Belinostat作为潜在治疗策略 未明确说明研究的局限性 探究自身免疫性葡萄膜炎中组蛋白去乙酰化酶对Th17细胞分化和致病性的作用机制,并评估HDAC抑制剂的治疗潜力 自身免疫性葡萄膜炎患者的外周血单个核细胞和小鼠实验性自身免疫性葡萄膜炎模型 免疫学 自身免疫性葡萄膜炎 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术、siRNA、特异性抑制剂、过继转移实验 NA 单细胞转录组数据、流式细胞术数据 未明确说明患者和动物样本的具体数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1646 2026-08-23
High KYNU Expression Is Associated with Poor Prognosis, KEAP1/STK11 Mutations, and Immunosuppressive Metabolism in Patient-Derived but Not Murine Lung Adenocarcinomas
2025-May-16, Cancers IF:4.5Q1
研究论文 本研究通过荟萃分析发现KYNU基因在肺腺癌中双峰表达与预后相关,并揭示其与KEAP1/ST11突变和免疫抑制代谢的关联。 首次系统揭示KYNU作为肺腺癌预后生物标志物,其表达模式在患者来源肿瘤与小鼠模型中存在显著差异,并提出基于模型的聚类方法优于中位数二分化方法。 物种特异性表达模式给临床前建模带来挑战,且需进一步验证其跨癌种的治疗潜力。 旨在发现双峰表达基因与患者预后的关联,揭示潜在致癌基因型,并为肺腺癌提供新的治疗见解。 肺腺癌患者的数据集及小鼠模型,以及其他癌症类型的预后数据。 癌症基因组学、转录组学、代谢组学 肺腺癌 荟萃分析、批量转录组学、单细胞转录组学、代谢组学 基于模型的聚类分析 基因表达数据、代谢数据、单细胞数据 多个肺腺癌数据集(未指定具体数量) NA NA NA NA
1647 2026-08-23
Subcellular level spatial transcriptomics with PHOTON
2025-May-14, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 提出PHOTON方法,结合高分辨率成像与高通量测序,实现亚细胞分辨率下的空间转录组分析 首次在亚细胞水平实现空间转录组分析,能够原位捕获特定细胞类型及亚细胞区室(如核仁、线粒体、应激颗粒)的转录组信息 未提及 开发一种在亚细胞水平分析空间转录组的方法,以理解RNA的亚细胞定位与功能关系 卵巢颗粒细胞、核仁、线粒体、应激颗粒 空间转录组学 NA 空间转录组测序 NA 基因表达数据 未提及 NA 空间转录组学 NA NA
1648 2026-08-23
Clofarabine Enhances the Transduction Efficiency of Recombinant AAV2 in the Retina
2025-05-01, Investigative ophthalmology & visual science IF:5.0Q1
研究论文 本研究探讨了核苷酸还原酶抑制剂克罗拉滨增强重组腺相关病毒血清型2在小鼠视网膜中的转导效率及其机制 首次发现克罗拉滨能通过细胞周期同步化和转录重编程,安全增强rAAV2在视网膜中的转导效率 研究主要基于小鼠模型和细胞系,临床适用性及长期安全性需进一步验证 评估克罗拉滨增强rAAV2转导效率的潜力,并阐明其分子机制,以优化眼部基因治疗 ARPE-19细胞和小鼠视网膜 基因治疗与分子生物学 眼部疾病(基因治疗相关) RNA-seq, 单细胞RNA-seq 细胞系和小鼠模型 转录组数据 未明确样本数量,涉及ARPE-19细胞和小鼠视网膜 NA RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
1649 2026-08-23
Recent Advances in Stem Cells of Corneal Epithelia
2025-05-01, Investigative ophthalmology & visual science IF:5.0Q1
review 综述角膜上皮干细胞的最新研究进展,包括其定位、群体维持和异质性 结合谱系追踪、活体成像和单细胞RNA测序等新技术,揭示了角膜上皮干细胞意想不到的特性 当前研究存在局限性,且角膜上皮干细胞领域内急需解决的关键问题尚未明确 阐明角膜上皮干细胞的基本特性,并探讨其在再生医学中治疗角膜疾病的潜力 角膜上皮干细胞 再生医学 角膜疾病 单细胞RNA测序 NA NA NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1650 2026-08-23
Single-Cell RNA Sequencing Revealed Functional Conjunctival Keratinocytes Loss via TGF-β-Wnt/β-Catenin Signaling in Sjögren's Syndrome Related Dry Eye
2025-04-01, Investigative ophthalmology & visual science IF:5.0Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序技术揭示了干燥综合征相关干眼病中结膜功能性角质形成细胞通过TGF-β-Wnt/β-catenin信号通路丢失的机制 首次通过单细胞RNA测序技术全面解析干燥综合征结膜中实质细胞与免疫细胞的相互作用,发现TGF-β-Wnt/β-catenin轴下调功能性角质形成细胞的形成,并伴随促血管生成和促纤维化巨噬细胞及促炎T细胞的浸润 研究基于小鼠模型,未在人类样本中验证;样本量较小,可能限制了结果的普适性 探究结膜在干燥综合征相关干眼病病理生理中的作用,特别是功能性结膜上皮的改变 干燥综合征小鼠模型的结膜组织及细胞 单细胞转录组学 干燥综合征相关干眼病 单细胞RNA测序、T细胞受体测序、Western blot、免疫荧光、多重免疫组化、流式细胞术 Not applicable (未使用特定模型,而是基于小鼠模型和测序技术) 单细胞转录组数据、TCR测序数据、图像和流式细胞术数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Genomics单细胞RNA测序和TCR测序
1651 2026-08-23
The molecular structure of SHISA5 protein and its novel role in primary biliary cholangitis: From single-cell RNA sequencing to biomarkers
2025-Mar, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术分析原发性胆汁性胆管炎患者和健康对照的肝脏组织样本,发现SHISA5蛋白在PBC中高表达,并预测其结构及功能,揭示其在PBC病理过程中的新作用 首次从单细胞RNA测序角度揭示SHISA5蛋白在原发性胆汁性胆管炎中的表达特征,并预测其独特跨膜结构域及其在细胞信号和细胞间相互作用中的潜在新功能 未提及具体限制,但可能包括样本量有限、单细胞测序的覆盖深度或功能验证不足等未在摘要中说明的局限 探究SHISA5蛋白在原发性胆汁性胆管炎中的表达特征、结构及其潜在生物学功能,以评估其作为生物标志物的可能性 原发性胆汁性胆管炎患者和健康对照的肝脏组织样本中的细胞,特别是肝细胞和胆管细胞 生物信息学 原发性胆汁性胆管炎 单细胞RNA测序, 生物信息学结构预测 NA 基因表达数据, 蛋白质结构数据 未提供具体数量,涉及PBC患者和健康对照的肝脏组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1652 2026-08-23
Spatial transcriptome and single-cell RNA sequencing reveal the molecular basis of cotton fiber initiation development
2025-03, The Plant journal : for cell and molecular biology
研究论文 结合空间转录组和单细胞RNA测序,构建了棉花胚珠在-1、0和1 DPA阶段的空间转录图谱,揭示了纤维起始发育的分子机制 首次构建棉花胚珠在不同发育阶段的空间转录组图谱,并整合单细胞RNA测序数据,发现关键基因SVB和SVBL在纤维起始中的功能冗余 未明确提及研究局限性 解析棉花纤维起始发育的分子基础,为提升皮棉产量提供见解 棉花胚珠(-1、0和1 DPA)及纤维细胞 单细胞转录组学、空间转录组学 NA 空间转录组测序、单细胞RNA测序 NA 基因表达数据(空间转录组和单细胞转录组) 棉花胚珠样本,具体数量未明确 NA 空间转录组学, 单细胞RNA测序 NA NA
1653 2026-08-23
Analysis of the Relationship Between NLRP3 and Alzheimer's Disease in Oligodendrocytes based on Bioinformatics and In Vitro Experiments
2025, Current Alzheimer research IF:1.8Q4
研究论文 基于生物信息学分析和体外实验,研究少突胶质细胞中NLRP3与阿尔茨海默病的关系 结合生物信息学分析和体外实验,首次在少突胶质细胞中验证NLRP3的高表达及其与AD的关联,并构建基于五个关键基因的诊断模型 研究基于公共数据集和体外实验,缺乏体内验证和临床样本验证 探讨少突胶质细胞中NLRP3与阿尔茨海默病的潜在关联,并构建诊断模型 少突胶质细胞中的NLRP3及相关基因 生物信息学、机器学习 阿尔茨海默病 基因表达谱分析、机器学习算法(LASSO、随机森林、SVM)、单细胞转录组学、RT-qPCR、免疫荧光、Western blot LASSO回归、随机森林、支持向量机 基因表达数据、单细胞转录组数据、实验数据 未明确样本数量,涉及多个公共数据集 NA bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq NA NA
1654 2026-08-23
Single-cell and spatial transcriptomics identify COL6A3 as a prognostic biomarker in undifferentiated pleomorphic sarcoma
2024-11-15, Molecular cancer IF:27.7Q1
研究论文 通过单细胞和空间转录组学分析,确定COL6A3作为未分化多形性肉瘤的预后生物标志物 首次结合单细胞和空间转录组学方法,在未分化多形性肉瘤及其亚型中识别出COL6A3作为预后生物标志物,并优于现有肉瘤预后基因面板 样本量相对较小,仅包含5个活检标本和1个切除标本,可能限制结果的广泛适用性 通过单细胞和空间转录组学表征未分化多形性肉瘤及其相关肿瘤,并寻找预后生物标志物 未分化多形性肉瘤(包括非典型纤维黄瘤和皮肤多形性肉瘤)的活检和切除标本 数字病理学 软组织肉瘤 单细胞转录组学、空间转录组学 NA 转录组数据 5个活检标本和1个切除标本 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
1655 2026-08-23
Hunger signalling in the olfactory bulb primes exploration, food-seeking and peripheral metabolism
2024-Nov, Molecular metabolism IF:7.0Q1
研究论文 本研究探讨了嗅球中饥饿素受体(GHSR)如何影响嗅觉功能、觅食行为及外周代谢。 首次通过条件性基因敲除小鼠模型,证明嗅球GHSR在饥饿状态下对嗅觉功能、探索行为和代谢调节的关键作用,并结合单细胞和空间转录组数据鉴定GHSR+神经元类型。 研究主要基于小鼠模型,未涉及人类;未深入探究GHSR下游信号通路的具体分子机制。 阐明嗅球中GHSR在调节嗅觉功能、觅食行为及代谢过程中的作用机制。 小鼠(嗅球GHSR缺失小鼠及对照) 神经科学 NA 行为学分析、scRNA-seq、空间转录组学 条件性基因敲除小鼠模型 基因表达数据、行为数据、代谢数据 未明确,涉及小鼠模型和多组学数据集 未明确(可能包含10x Genomics) 单细胞RNA测序、空间转录组学 未明确 未明确
1656 2026-08-23
STIE: Single-cell level deconvolution, convolution, and clustering in in situ capturing-based spatial transcriptomics
2024-08-30, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 提出STIE算法,基于原位捕获空间转录组数据,通过整合组织学图像核形态实现单细胞水平的解卷积、卷积和聚类 首次实现原位捕获空间转录组数据在单细胞水平的全切片尺度分析,通过期望最大化算法对齐转录组与组织学图像,并恢复约70%间隙区域的缺失细胞 未在摘要中明确提及局限性 实现原位捕获空间转录组数据的单细胞水平分析,提高细胞类型特异基因表达推断的准确性,并揭示单细胞水平的空间生物学见解 原位捕获空间转录组数据及其匹配的组织学图像 生物信息学 NA 空间转录组学 期望最大化算法 空间转录组数据和组织学图像 NA NA 空间转录组学 NA NA
1657 2026-08-23
Partitioning and aggregating cross-tissue and tissue-specific genetic effects to identify gene-trait associations
2024-07-09, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 提出了MTWAS统计框架,用于划分和聚合跨组织及组织特异性遗传效应,以识别基因-性状关联。 引入非参数插补策略增强不可及组织,采用扩展贝叶斯信息准则逐步分类eQTL为跨组织和组织特异性,提高预测准确性。 文中未明确提及限制。 改进TWAS方法,充分利用GWAS信息,识别基因-性状关联。 基因表达和遗传变异数据,涉及GTEx、DICE和OneK1K数据集。 机器学习 NA NA 统计模型(非参数插补、贝叶斯信息准则) 基因表达和基因型数据 47个GTEx组织、DICE和OneK1K数据集;84项UK Biobank GWAS研究 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
1658 2026-08-23
Development of Novel Models of Aggressive Variants of Castration-resistant Prostate Cancer
2024-06, European urology oncology IF:8.3Q1
研究论文 本研究开发了针对侵袭性变异型去势抵抗性前列腺癌的新型临床前模型,包括患者来源的异种移植模型、类器官等,并进行分子特征分析以支持药物评估 首次建立涵盖罕见分子表型如微卫星不稳定性高和神经内分泌前列腺癌的PDX、PDXO和PDO模型,并利用单细胞RNA测序验证其保留了肿瘤内异质性 样本量有限,且模型可能无法完全复制患者肿瘤的微环境复杂性 开发代表侵袭性前列腺癌变异的临床前模型,并建立新的药物评估策略 转移性去势抵抗性前列腺癌患者来源的肿瘤组织 数字病理学 前列腺癌 全外显子组测序、RNA测序、单细胞RNA测序 患者来源异种移植模型、患者来源异种移植类器官、患者来源类器官 基因组、转录组、单细胞转录组数据及组织图像 51例转移性前列腺癌患者,建立了5个神经内分泌前列腺癌、7个DNA损伤反应、1个微卫星不稳定性高的异种移植模型,16个异种移植类器官和6个患者来源类器官 NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序、全外显子组测序 NA NA
1659 2026-08-23
Stem-cell states converge in multistage cutaneous squamous cell carcinoma development
2024-05-31, Science (New York, N.Y.)
研究论文 本研究通过构建基因表达网络并整合谱系追踪和单细胞RNA测序,揭示了多阶段皮肤鳞状细胞癌发展过程中干细胞状态的汇聚现象 首次将基因表达网络与谱系追踪及单细胞RNA测序相结合,识别出癌前肿瘤细胞中表达谱系可塑性和耐药性标志物的汇聚细胞状态,并发现两种细胞状态(多谱系可塑性和增殖)呈相互排斥关系 信息未提供 探究干细胞状态在皮肤鳞状细胞癌多阶段发展中的汇聚及其在治疗中的潜在靶点 小鼠正常和肿瘤组织样本中的干细胞状态 机器学习和单细胞测序 皮肤鳞状细胞癌 单细胞RNA测序、基因表达网络分析、谱系追踪 基因表达网络模型 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 数百个小鼠组织样本(包括正常和肿瘤) 未提供 单细胞RNA测序 未提供 未提供
1660 2026-08-23
The HIF-1α/PLOD2 axis integrates extracellular matrix organization and cell metabolism leading to aberrant musculoskeletal repair
2024-Mar-12, Bone research IF:14.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析,揭示了HIF-1α/PLOD2轴在整合细胞外基质组织和细胞代谢中的作用,从而驱动异常肌肉骨骼修复,并提出了治疗异位骨化的潜在策略 首次通过单细胞和空间转录组学结合小鼠模型,明确HIF-1α/PLOD2/LOX通路在间充质祖细胞中介导异位骨化的代谢和基质重塑机制,并鉴定出新的PLOD2抑制剂 研究主要基于小鼠模型,需进一步验证在人类中的适用性;PLOD2抑制剂的具体临床转化效果和安全性尚未评估 阐明HIF-1α通路在间充质祖细胞中如何通过调控细胞外基质组织和代谢来促进异位骨化,并探索潜在治疗靶点 小鼠间充质祖细胞和损伤诱导的异位骨化模型 数字病理学 异位骨化 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 基因表达数据, 空间转录组数据 小鼠模型(具体样本数未在摘要中提及) 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞3'测序和10x Visium空间转录组学(具体配置未详细说明)
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