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当前共找到 35765 篇文献,本页显示第 1621 - 1640 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1621 2026-01-08
Endothelial-to-mesenchymal transition primes vascular endothelial cells toward an osteochondrogenic fate
2025-Dec-29, Vascular pharmacology IF:3.5Q2
研究论文 本文研究了内皮-间质转化(EndMT)如何使血管内皮细胞向成骨和软骨生成命运转变,从而在动脉粥样硬化中促进血管功能障碍和钙化 首次在体外和体内定义了EndMT衍生细胞向成骨和软骨生成命运转变的启动状态,揭示了EndMT通过生成成骨和软骨样细胞在动脉粥样硬化中的作用 研究主要基于HUVECs和鼠模型,可能不完全反映人体内复杂环境,且EndMT诱导条件为特定因子组合,存在局限性 探究EndMT在血管功能障碍中的作用,特别是EndMT衍生细胞的分化潜能和功能特性 人脐静脉内皮细胞(HUVECs)和动脉粥样硬化模型小鼠中的内皮谱系追踪细胞 细胞生物学 动脉粥样硬化 流式细胞术、单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞RNA测序数据、流式细胞术数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1622 2026-01-08
Chronic alcohol consumption drives inflammaging and transposon derepression in hematopoietic stem and progenitor cells
2025-Dec-26, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA-seq和ATAC-seq技术,探讨了慢性酒精摄入如何驱动造血干细胞和祖细胞(HSPCs)的炎症衰老和转座子去抑制 揭示了慢性酒精暴露在人类和小鼠HSPCs中诱导年龄依赖性的炎症反应、DNA损伤和转座子表观遗传再激活,并识别出两个表观基因组不同的LT-HSC亚群 研究主要基于动物模型和异种移植实验,人类样本的直接验证有限,且未探讨酒精戒断后功能恢复的具体分子机制 探究慢性酒精摄入对造血干细胞和祖细胞(HSPCs)的影响,特别是炎症反应和表观遗传调控 人类和小鼠的造血干细胞和祖细胞(HSPCs),包括长期造血干细胞(LT-HSCs) 单细胞组学 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA 单细胞转录组数据, 单细胞染色质可及性数据 人类和小鼠HSPCs样本,具体数量未明确 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA NA
1623 2026-01-08
Integration analysis of single-cell and spatial transcriptomics identifies prognostic genes associated with neddylation in colorectal cancer
2025-Dec-24, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞和空间转录组学数据,识别与结直肠癌中neddylation相关的预后基因,并构建了一个三基因预后模型 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,系统分析neddylation相关基因在结直肠癌中的预后价值,并构建了包含PSMD12、PSMB2和FBXL5的新型三基因预后模型 研究依赖于公共数据集,缺乏独立的前瞻性队列验证;空间转录组样本量有限,可能影响结果的普适性 识别结直肠癌中与neddylation相关的预后基因,以改进治疗策略 结直肠癌患者样本,包括单细胞RNA测序、空间转录组和批量RNA测序数据 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序,空间转录组测序,批量RNA测序 回归分析,风险模型,列线图模型 转录组数据,单细胞数据,空间转录组数据 TCGA-CRC数据集(训练/内部验证,7:3分割),GSE28722(外部验证),GSE132257(scRNA-seq),GSE226997(ST) NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学,批量RNA-seq NA NA
1624 2026-01-08
Identification and experimental validation of biomarkers for acute myeloid leukemia based on single-cell RNA sequencing data
2025-Dec-23, Molecular and cellular probes IF:2.3Q4
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序、孟德尔随机化和基因调控网络分析,识别并实验验证了急性髓系白血病的生物标志物 结合单细胞RNA测序与孟德尔随机化方法识别AML生物标志物,并通过体外实验验证其功能 研究主要基于体外实验,缺乏体内或临床验证数据 识别和验证急性髓系白血病的可靠生物标志物 急性髓系白血病相关细胞和基因 数字病理学 白血病 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 基因调控网络分析, GSEA富集分析, 细胞转染, 细胞增殖实验, 流式细胞术 NA 单细胞RNA测序数据 22,742个细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1625 2026-01-08
PTEN deficiency linked to chromosome 10q loss leads to aggressive NF2 mutant meningioma biology
2025-Dec-22, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过分析人类脑膜瘤的RNA测序数据,并结合小鼠模型,揭示了PTEN缺失与YAP1激活共同驱动侵袭性NF2突变脑膜瘤的生物学机制 首次在免疫活性小鼠模型中证实PTEN缺失会显著加速YAP1驱动的肿瘤发生,并通过跨物种整合验证了该模型能准确复现侵袭性NF2突变脑膜瘤的转录程序 NA 表征侵袭性NF2突变脑膜瘤的生物学特征并探究其驱动机制 人类脑膜瘤组织样本及基因工程小鼠模型 数字病理学 脑膜瘤 RNA测序 基因工程小鼠模型 RNA测序数据 NA NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
1626 2026-01-08
A Multi-omic Atlas of Human Choroid Plexus in Alzheimer's Disease
2025-Dec-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过整合单核RNA测序、空间转录组学、单核ATAC测序和蛋白质组学数据,构建了阿尔茨海默病患者脉络丛的多组学图谱,揭示了其在疾病中的细胞状态转变和功能障碍 首次构建了阿尔茨海默病脉络丛的多组学综合图谱,识别了17种细胞状态和三大表型轴,并发现了疾病相关的多细胞信号枢纽 样本来源仅限于ROSMAP队列,且未明确探讨这些发现与临床症状进展的直接因果关系 阐明脉络丛在阿尔茨海默病病理生理学中的作用和功能障碍机制 来自69名ROSMAP参与者的脉络丛组织样本,涵盖正常认知、轻度认知障碍和阿尔茨海默病痴呆 数字病理学 阿尔茨海默病 单核RNA测序, 空间转录组学, 单核ATAC测序, 蛋白质组学 NA 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 表观基因组数据, 蛋白质组数据 69名ROSMAP参与者的脉络丛样本 NA 单核RNA-seq, 空间转录组学, 单核ATAC-seq, 蛋白质组学 NA NA
1627 2026-01-08
Exosomal heterogeneity and functional zonation in cancer drug resistance
2025-Dec-17, Drug discovery today IF:6.5Q1
综述 本文综述了肿瘤微环境中外泌体异质性及其在功能分区中的作用,特别是在癌症耐药性中的机制 探讨了肿瘤功能分区(如缺氧、血管周围区域)中外泌体亚型的特异性分子货物及其在耐药性中的空间通信网络,并介绍了新兴技术如单细胞测序和空间生物学平台的应用 NA 阐明外泌体异质性在肿瘤功能分区中的角色及其对癌症耐药性的影响 肿瘤微环境中的外泌体及其分子货物(核酸、蛋白质、脂质、代谢物) 空间生物学 癌症 单细胞测序、微芯片3D肿瘤培养、先进光谱方法、空间生物学平台 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq、空间转录组学 NA NA
1628 2026-01-08
Formononetin suppresses osteosarcoma by targeting MYO1B and remodeling the tumor immune microenvironment
2025-Dec, APL bioengineering IF:6.6Q1
研究论文 本研究通过患者来源异种移植模型和单细胞多组学测序,揭示了芒柄花素通过靶向MYO1B和重塑肿瘤免疫微环境来抑制骨肉瘤的分子机制 首次在单细胞水平上全面解析了芒柄花素抗骨肉瘤的作用机制,并鉴定出MYO1B为其关键作用靶点 研究主要基于PDX模型和体外实验,缺乏大规模临床样本验证 探索低毒性抗骨肉瘤新疗法的作用机制 骨肉瘤细胞及肿瘤微环境中的免疫细胞 单细胞多组学 骨肉瘤 单细胞多组学测序 PDX模型 单细胞转录组数据 未明确说明 NA 单细胞多组学测序 NA NA
1629 2026-01-08
Single-cell transcriptome analysis elucidates the microenvironmental interactions between colorectal cancer and sarcopenia
2025-Nov-28, Medicine IF:1.3Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞转录组数据,揭示了结直肠癌与肌肉减少症之间共享细胞类型的跨组织功能异质性及其微环境相互作用机制 首次结合CRC肿瘤组织和SP肌肉组织的单细胞转录组数据,系统解析跨组织微环境异质性,识别共享核心细胞类型及其功能分化,并发现潜在的全域调控因子 样本量相对有限(16个CRC组织和17个SP组织),且主要基于转录组数据,缺乏蛋白质水平验证 阐明结直肠癌与肌肉减少症之间的微环境相互作用机制及其对预后的影响 结直肠癌肿瘤组织和肌肉减少症肌肉组织 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单核RNA测序(snRNA-seq) Harmony(批次效应校正)、CellChat(细胞通讯建模) 单细胞转录组数据 16个CRC肿瘤组织和17个SP肌肉组织 NA 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq NA NA
1630 2026-01-08
Identification of ferroptosis-related therapeutic targets and causal risk factors in aortic dissection via multi-omics integration
2025-Nov-28, Medicine IF:1.3Q2
研究论文 本研究通过多组学整合分析,识别了主动脉夹层中与铁死亡相关的关键基因、调控网络及潜在的因果风险因素 首次结合单细胞RNA测序与孟德尔随机化分析,系统探索了铁死亡相关基因在主动脉夹层中的细胞特异性表达模式,并揭示了肠道微生物和血清代谢物与疾病的潜在因果关系 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,缺乏实验验证;孟德尔随机化分析结果可能受混杂因素影响 阐明铁死亡在主动脉夹层发病机制中的作用,并寻找潜在的治疗靶点 主动脉夹层患者与对照组的基因表达数据、单细胞转录组数据、肠道微生物组和血清代谢组数据 生物信息学与多组学整合分析 心血管疾病 RNA-seq, 单细胞RNA测序, 全基因组关联研究, 孟德尔随机化 LASSO回归, 受试者工作特征分析 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 基因组关联数据, 微生物组数据, 代谢组数据 基于公共数据库(GEO)的样本,具体数量未明确说明;涉及211种肠道微生物分类群和1400种血清代谢物的GWAS汇总数据 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
1631 2026-01-08
The Dynamic UPR Rheostat Orchestrates Single-Cell Plasticity in Glioblastoma
2025-Nov-27, Journal of molecular neuroscience : MN IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过重新分析公开的单细胞RNA测序数据,揭示了胶质母细胞瘤中未折叠蛋白反应三臂(IRE1/XBP1、ATF6、PERK)作为一个分级调控系统在单细胞分辨率上的动态协调机制 引入了臂特异性指标(如Rheostat Index和平衡度)来量化UPR各臂的活动及其协调性,并首次在单细胞水平上描绘了UPR三臂沿谱系轨迹的动态优势切换模式 转录组分析仅能推断臂特异性协调,功能验证需要扰动研究和蛋白质水平读数 探究胶质母细胞瘤中未折叠蛋白反应三臂是否作为单细胞分辨率的分级控制系统运作 胶质母细胞瘤细胞 单细胞组学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 发现队列871个细胞,验证队列11,877个细胞 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium, SMART-seq 10x Chromium单细胞基因表达解决方案,SMART-seq全长单细胞RNA测序技术
1632 2026-01-08
Mesothelin-expressing triple-negative breast cancer: a highly invasive and immunosuppressive subtype
2025-Nov-25, Breast cancer research and treatment IF:3.0Q2
研究论文 本研究探讨了间皮素(MSLN)在三阴性乳腺癌(TNBC)中的表达及其与肿瘤侵袭性和免疫抑制微环境的关系 首次通过泛癌分析揭示MSLN在TNBC中的重要性,结合空间转录组学和单细胞数据识别MSLN高表达的肿瘤亚群及其特征 研究样本量有限,且主要基于局部队列,缺乏大规模多中心验证 探究MSLN在TNBC中的临床病理特征及其对治疗反应的影响 三阴性乳腺癌患者及其肿瘤组织 数字病理学 乳腺癌 空间转录组学,单细胞RNA测序 NA 转录组数据,单细胞数据 局部队列及公共单细胞数据,具体样本数未明确 NA 空间转录组学,单细胞RNA-seq NA NA
1633 2026-01-08
Effect of the mitophagy inducer urolithin A on age-related immune decline: a randomized, placebo-controlled trial
2025-Nov, Nature aging IF:17.0Q1
研究论文 本研究通过一项随机、双盲、安慰剂对照试验,评估了线粒体自噬诱导剂尿石素A对健康中年成年人免疫系统的影响 首次在人体临床试验中证明尿石素A能够调节免疫细胞组成和功能,特别是扩增幼稚样CD8 T细胞并增强其脂肪酸氧化能力 样本量较小(50名参与者),干预时间较短(仅4周),且研究对象为健康中年成年人,结果可能不适用于其他人群 探究尿石素A是否能够改善与年龄相关的免疫衰退 健康中年成年人的外周血免疫细胞 NA 老年性疾病 流式细胞术,单细胞RNA测序 NA 临床数据,单细胞转录组数据 50名健康中年成年人 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1634 2026-01-08
An Investigation of the Causal Link Between Palmoylation Genes and Epilepsy Utilising Multi-omics Mendelian Randomisation Analysis and Validation Through Single-Cell Evidence
2025-Oct-16, Journal of molecular neuroscience : MN IF:2.8Q2
研究论文 本研究利用多组学孟德尔随机化分析和单细胞证据验证,探讨了棕榈酰化基因(ZDHHC家族)与癫痫之间的因果关系 结合多水平基因组数据和单细胞转录组学,首次在细胞类型特异性水平上验证了特定棕榈酰化基因对癫痫的保护性因果作用 研究主要基于公开的eQTL和GWAS数据,可能受数据来源和样本异质性限制,且单细胞验证数据来自特定数据集(GSE302285) 探究棕榈酰化修饰基因与癫痫发病风险的因果关系,为癫痫病理机制研究和靶向治疗提供新见解 棕榈酰蛋白修饰基因(ZDHHC家族),特别是ZDHHC3和ZDHHC20,以及它们与癫痫风险的关联 生物信息学 癫痫 孟德尔随机化分析,表达数量性状位点分析,单细胞转录组测序 逆方差加权,加权中位数,MR-Egger,基于汇总数据的孟德尔随机化 基因组关联研究数据,表达数量性状位点数据,单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1635 2026-01-08
Single-cell RNA profiling identifies immune cell population shifts in diabetes associated mucosal inflammation
2025-Oct, Mucosal immunology IF:7.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了糖尿病如何通过增加γ T细胞、减少调节性T细胞和增强中性粒细胞极化来加剧牙周炎的机制 首次在糖尿病牙周组织中应用单细胞RNA测序技术,识别出γ T细胞作为糖尿病增强牙周炎的关键驱动因素,并验证了其作为治疗靶点的潜力 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本,可能需要更大规模的人类队列验证,且机制细节如γ T细胞的具体激活途径尚未完全阐明 探究糖尿病与牙周炎协同作用的免疫机制,并识别潜在的治疗靶点 糖尿病牙周组织中的免疫细胞,包括γ T细胞、调节性T细胞和中性粒细胞 数字病理学 牙周病 单细胞RNA测序,流式细胞术 NA 单细胞RNA测序数据,流式细胞术数据 糖尿病小鼠和人类糖尿病牙周标本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1636 2026-01-08
ASPEN: Robust detection of allelic dynamics in single cell RNA-seq
2025-Sep-03, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一种名为ASPEN的统计方法,用于在F1杂交单细胞转录组数据中建模等位基因均值和方差,以检测等位基因动态变化 ASPEN采用敏感映射流程和自适应收缩技术,能区分单细胞中的等位基因失衡和方差,相比现有方法在稀疏液滴单细胞数据中表现出更高的敏感性和更低的假发现率 NA 开发一种统计方法来检测单细胞RNA-seq数据中的等位基因动态变化,以解析复杂调控现象 F1杂交单细胞转录组数据,具体应用于小鼠脑类器官和T细胞 自然语言处理 NA 单细胞RNA-seq 统计模型 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1637 2026-01-08
Oxidative Stress Links Thyroid Autoimmunity to Cancer: Peroxiredoxin 2 Protection via Genomic and Single-Cell Insights
2025-Sep, Cancer biotherapy & radiopharmaceuticals
研究论文 本研究通过整合多组学方法,揭示了桥本甲状腺炎与甲状腺癌之间的共享遗传因素,并确定了过氧化物还原酶2(PRDX2)的关键保护作用 首次通过孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序和机器学习分类模型的整合方法,系统性地识别了连接自身免疫性甲状腺疾病与甲状腺癌的因果基因及其表达模式 研究主要基于欧洲人群(FinnGen)的遗传数据,结论在其他人群中的普适性有待验证;单细胞测序样本量相对有限 探究桥本甲状腺炎与甲状腺癌之间的共享遗传机制和分子联系 桥本甲状腺炎和甲状腺癌(包括乳头状癌和未分化癌)患者及正常甲状腺组织 单细胞组学 甲状腺癌 单细胞RNA测序, 全基因组关联研究, 孟德尔随机化分析 机器学习分类模型 基因组数据, 单细胞转录组数据 76,243个甲状腺细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1638 2026-01-08
Gene Regulatory Network Inference from Pseudotime-Ordered scRNA-seq Data via Time-Lagged Divergence Measures
2025-Sep, Bioinformatics research and applications : ... international symposium, ISBRA ... proceedings. ISBRA (Conference)
研究论文 提出了一种名为PseudoGRN的新型整合框架,用于从时间序列单细胞RNA测序数据推断细胞类型特异性基因调控网络 整合了多种伪时间推断方法、时滞散度度量、非冗余惩罚网络推断和偏相关分析,能够从稀疏时间分辨率数据重建有向基因调控网络 NA 从时间序列单细胞RNA测序数据推断基因调控网络 单细胞RNA测序数据 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 整合框架(包含伪时间推断、时滞散度度量、惩罚网络推断、偏相关分析) 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1639 2026-01-08
Systematic analysis of cellular cross-talk reveals a role for SEMA6D-TREM2 regulating microglial function in Alzheimer's disease
2025-07-30, Science translational medicine IF:15.8Q1
研究论文 通过单细胞转录组和空间转录组分析,揭示了SEMA6D-TREM2介导的神经元-小胶质细胞通讯在阿尔茨海默病中的作用机制 首次系统重建了AD中的细胞间通讯网络,发现了SEMA6D-TREM2这一新的神经元-小胶质细胞信号通路,并证实其调控小胶质细胞活化和Aβ清除功能 样本量相对有限(67例),主要基于转录组数据推断功能,体内功能验证仍需进一步深入 探究阿尔茨海默病中细胞间通讯网络的失调机制及其对疾病进展的影响 人脑组织样本(来自Knight ADRC和DIAN队列)、人诱导多能干细胞衍生的小胶质细胞 数字病理学 阿尔茨海默病 单核RNA测序、空间转录组学、组织免疫染色、基因敲除技术 细胞通讯网络分析 单细胞转录组数据、空间转录组数据、图像数据 67例临床和神经病理学特征明确的对照和AD脑组织捐赠者 NA 单核RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
1640 2026-01-08
Nanocoding: Lipid Nanoparticle Barcoding for Multiplexed Single-Cell RNA Sequencing
2025-Jun-24, ACS nano IF:15.8Q1
研究论文 本文介绍了一种名为nanocoding的新技术,利用脂质纳米颗粒(LNPs)进行高密度条形码标记,用于多重单细胞RNA测序 采用脂质纳米颗粒作为条形码载体,通过多种可控的细胞摄取方式,将条形码负载量提高10-100倍,并能在细胞裂解时提供保护和高效释放 NA 开发一种高效、稳定的样本多重标记技术,以降低单细胞RNA测序的成本并减少批次效应 培养细胞系、组织消化物中的异质性细胞(如脾脏和肥胖啮齿动物脂肪组织) 单细胞测序技术 肥胖相关疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA测序数据 涉及培养细胞系、脾脏消化物(6重条形码样本)和肥胖啮齿动物脂肪组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
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