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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1581 | 2026-03-04 |
Chimeric brain models to study human glial-neuronal and macroglial-microglial interactions
2026-Jan-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116794
PMID:41499239
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研究论文 | 本研究通过将人源多能干细胞衍生的神经前体细胞和巨噬细胞前体细胞共移植到新生小鼠大脑中,构建了包含人类小胶质细胞、大胶质细胞和神经元的嵌合大脑模型,用于研究人类胶质细胞-神经元以及胶质细胞间的相互作用 | 开发了一种新型共移植嵌合大脑模型,首次在体内同时整合了人类神经元、大胶质细胞和小胶质细胞,并利用单细胞RNA测序和细胞间通讯分析揭示了人类神经细胞间特异的信号通路 | 模型基于小鼠宿主环境,可能无法完全模拟人类大脑的完整微环境;研究主要关注发育早期阶段,成年期相互作用的长期效应尚不明确 | 研究人类胶质细胞与神经元之间以及不同类型胶质细胞之间的相互作用机制 | 人类多能干细胞衍生的神经前体细胞和巨噬细胞前体细胞,移植到新生小鼠大脑中形成的嵌合组织 | 神经科学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序,超分辨率成像,3D重建,细胞间通讯分析 | 嵌合大脑模型 | 单细胞转录组数据,成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1582 | 2026-03-04 |
Molecular and Chromatin Accessibility Programs Underlying Epithelial Injury and Impaired Regeneration in Neonatal Necrotizing Enterocolitis
2026-Jan-20, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2026.101730
PMID:41571092
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研究论文 | 本研究通过整合多组学方法,揭示了新生儿坏死性小肠结肠炎中上皮损伤和再生受损的分子与染色质可及性机制 | 首次在实验性NEC模型中构建了包含转录组、染色质可及性和空间信息的综合多组学图谱,并鉴定出Ezh2作为LGR5+肠道干细胞身份和再生的关键调控因子 | 研究主要基于小鼠模型,其发现需要在人类样本中得到进一步验证 | 阐明新生儿坏死性小肠结肠炎中上皮再生缺陷的分子机制,并寻找潜在的治疗靶点 | 新生小鼠的小肠组织 | 数字病理学 | 坏死性小肠结肠炎 | bulk RNA测序, 单核RNA测序, 单核ATAC测序, 空间转录组学 | NA | 测序数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1583 | 2026-03-04 |
LncRNA ZFAS1 Promotes Alveolar Bone Resorption by Enhancing Osteoclastogenesis in Periodontitis
2026-01, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.70134
PMID:41549697
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研究论文 | 本研究探讨了长链非编码RNA ZFAS1在牙周炎微环境中骨重塑失调的机制作用 | 揭示了lncRNA ZFAS1作为炎症性骨丢失的关键驱动因子,通过促进破骨细胞生成和抑制成骨细胞生成发挥双重调控作用 | 研究主要基于体外细胞模型(RAW264.7和MC3T3-E1细胞),体内验证和临床转化潜力需进一步探索 | 阐明牙周炎中骨吸收的分子机制,特别是lncRNA ZFAS1在病理骨丢失中的作用 | 牙周组织(健康与患病)、RAW264.7破骨前体细胞、MC3T3-E1成骨前体细胞 | 分子生物学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、qPCR、组织学、免疫组织化学 | NA | RNA测序数据、基因表达数据、组织图像 | 未明确具体样本数量,涉及健康与患病牙周组织样本及细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1584 | 2026-03-04 |
The Ly6ghigh Neutrophil Subset Dictates Breast Cancer Lung Metastasis via CD8+ T Cell Death
2026, Cancer communications (London, England)
DOI:10.34133/cancomm.0003
PMID:41625479
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研究论文 | 本研究揭示了Ly6g高表达中性粒细胞亚群通过NETs中的cathelicidin诱导CD8+ T细胞凋亡,从而促进乳腺癌肺转移的机制 | 首次鉴定出Ly6g高表达中性粒细胞亚群在乳腺癌肺转移中的关键作用,并阐明其通过NETs释放cathelicidin直接结合CD8+ T细胞线粒体蛋白Ant1触发凋亡的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床样本验证尚不充分;机制研究集中在cathelicidin-Ant1轴,可能存在其他调控途径 | 解析乳腺癌肺转移微环境中中性粒细胞与CD8+ T细胞的相互作用机制及其在免疫逃逸中的作用 | 小鼠乳腺癌肺转移模型中的肺组织、中性粒细胞亚群、CD8+ T细胞 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、多重免疫荧光、蛋白质结合实验 | NA | 单细胞转录组数据、流式数据、免疫荧光图像、蛋白质互作数据 | 小鼠乳腺癌肺转移模型肺组织(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1585 | 2026-03-04 |
Deciphering precursor cell dynamics in esophageal preneoplasia via genetic barcoding and single-cell transcriptomics
2025-Dec-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2509534122
PMID:41337486
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研究论文 | 本文通过结合遗传条形码和单细胞转录组学技术,追踪食管癌前病变细胞的谱系,揭示了高可塑性前体细胞的动态变化及其在肿瘤发生中的作用 | 首次将遗传条形码与单细胞RNA测序结合,用于追踪食管癌前病变细胞的谱系,并识别出具有高可塑性的独特前体细胞群体 | 未明确提及样本量或具体技术平台细节,可能限制结果的普遍性 | 阐明食管癌前病变细胞的起源和轨迹,以理解早期肿瘤发生机制 | 食管癌前病变细胞 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,遗传条形码,空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 1586 | 2026-03-04 |
Single-cell analysis identifies PI3+S100A7+keratinocytes in early cervical squamous cell carcinoma with HPV infection
2025-Oct-20, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003795
PMID:40947786
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,在早期宫颈鳞状细胞癌中鉴定出与HPV感染相关的PI3+S100A7+角质形成细胞,并揭示了其与肿瘤微环境中巨噬细胞和癌症相关成纤维细胞的相互作用 | 首次在早期HPV阳性宫颈鳞状细胞癌中鉴定出PI3+S100A7+角质形成细胞亚群,并系统揭示了该细胞亚群与巨噬细胞之间的空间邻近性和信号通路互作,以及不同HPV亚型(如HPV16与HPV66)驱动的独特肿瘤促进机制 | 样本量较小(仅4例患者),且研究聚焦于早期肿瘤,未涵盖晚期或转移性病例 | 探究HPV感染在早期宫颈鳞状细胞癌发生发展中的作用机制,特别是肿瘤微环境中细胞异质性和细胞间互作 | 早期宫颈鳞状细胞癌患者的肿瘤组织及配对癌旁组织 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序,病毒序列比对,轨迹分析,免疫荧光染色,CIBERSORTx分析 | NA | 单细胞转录组数据,临床预后数据,免疫荧光图像数据 | 4例早期宫颈鳞状细胞癌患者的肿瘤及配对癌旁组织 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics平台(具体配置未在摘要中说明,推断为10x Chromium单细胞3'基因表达解决方案) |
| 1587 | 2026-03-04 |
KIAA0319 Plays a Critical Role in Cortical Neuronal Maturation and Synaptic Development Through a Dyslexia-Associated Gene Network
2025-Oct-18, Biological psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1016/j.biopsych.2025.10.014
PMID:41115623
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研究论文 | 本研究通过CRISPR-Cas9技术敲除KIAA0319基因,利用人类皮质类器官模型探究其在神经发育中的作用,揭示了该基因通过调控阅读障碍相关基因网络影响皮质神经元成熟和突触发育 | 首次在人类皮质类器官模型中系统研究KIAA0319基因敲除对神经发育的影响,并发现其通过调控一个包含多个阅读障碍相关基因的广泛网络发挥作用 | 研究基于体外类器官模型,可能无法完全模拟体内大脑发育的复杂性;样本规模相对有限 | 探究KIAA0319基因在神经发育中的分子功能及其与阅读障碍的关联机制 | KIAA0319敲除的人类胚胎干细胞及其分化的人类皮质类器官 | 神经科学 | 阅读障碍 | CRISPR-Cas9基因编辑、单细胞RNA测序、钙成像、免疫染色、EdU检测 | 人类皮质类器官模型 | 单细胞转录组数据、图像数据、功能成像数据 | 未明确说明具体样本数量,使用基因敲除和对照类器官 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1588 | 2026-03-04 |
Single-cell nanodroplet processing proteomics pipeline for analysis of human-derived microglia
2025-Oct-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.02.680067
PMID:41256374
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研究论文 | 本文介绍了一种用于分析人源性小胶质细胞的单细胞纳米液滴处理蛋白质组学流程 | 开发了一种基于FACS辅助分离、冷冻保存和纳米液滴处理的单细胞质谱蛋白质组学工作流程,首次实现了对死后人脑皮层来源小胶质细胞的单细胞蛋白质组分析,平均每个细胞可鉴定1039种蛋白质 | 作为原理验证性研究,数据规模有限,仅部分重现了先前已知的小胶质细胞亚型 | 探索脑小胶质细胞在细胞水平的异质性,为阿尔茨海默病等神经系统疾病寻找功能和分析相关的蛋白质靶点 | 人脑皮层来源的小胶质细胞 | 蛋白质组学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞质谱蛋白质组学、FACS、纳米液滴处理 | NA | 蛋白质组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞蛋白质组学 | NA | 基于纳米液滴处理的单细胞质谱蛋白质组学平台 |
| 1589 | 2026-03-04 |
Tumor-expressed GPNMB orchestrates Siglec-9+ TAM polarization and EMT to promote metastasis in triple-negative breast cancer
2025-Sep-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2503081122
PMID:40892920
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研究论文 | 本文探讨了肿瘤表达的GPNMB如何通过调控Siglec-9+ TAM极化和EMT来促进三阴性乳腺癌的转移 | 揭示了GPNMB通过诱导单核细胞中次级GPNMB表达,形成前馈放大环路,促进免疫抑制性TAM极化,并首次阐明了GPNMB不同唾液酸化修饰(α2,3 vs α2,6)导致Siglec-9差异识别的机制 | 研究主要基于体外共培养和体内小鼠模型,人类临床样本验证相对有限,且Siglec-9在人体中的功能需进一步验证 | 阐明GPNMB在三阴性乳腺癌转移中的分子机制,并探索其作为治疗靶点的潜力 | 三阴性乳腺癌细胞、单核细胞、肿瘤相关巨噬细胞(TAMs) | 肿瘤免疫学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、批量RNA测序(bulk RNA-seq)、去卷积分析、体外共培养、体内小鼠模型 | NA | RNA测序数据、基因表达数据 | 基于公开可用的TNBC scRNA-seq数据集和TNBC队列 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1590 | 2026-03-04 |
Epigenomic subtypes of late-onset Alzheimer's disease reveal distinct microglial signatures
2025-Aug-04, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-7232080/v1
PMID:40799738
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研究论文 | 本研究通过分析晚期阿尔茨海默病(LOAD)的死后脑组织DNA甲基化数据,识别出两种不同的表观基因组亚型,并揭示了它们与特定小胶质细胞签名和功能机制的关联 | 首次在LOAD中基于全基因组DNA甲基化数据识别出两种一致的表观基因组亚型,并整合单细胞RNA-seq数据揭示了亚型特异性小胶质细胞炎症状态 | 研究基于死后脑组织样本,可能无法完全反映疾病早期或活体状态;样本量相对有限(N=831),且为回顾性分析 | 识别LOAD的表观基因组亚型,并探索其与小胶质细胞签名、功能机制及临床病理特征的关系 | 晚期阿尔茨海默病患者的死后脑组织样本 | 表观基因组学 | 阿尔茨海默病 | 全基因组DNA甲基化分析、bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq | 无监督聚类方法 | DNA甲基化数据、RNA-seq数据 | 831个死后脑组织样本(来自三个独立队列) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1591 | 2026-03-04 |
Gene regulatory networks and essential transcription factors for de novo-originated genes
2025-Aug, Nature ecology & evolution
IF:13.9Q1
DOI:10.1038/s41559-025-02747-y
PMID:40659874
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研究论文 | 本研究通过计算方法和单细胞RNA测序数据,识别了调控de novo基因表达的关键转录因子,并利用果蝇遗传工具验证了这些转录因子的作用 | 首次揭示了de novo基因的调控程序,识别了关键转录因子如achintya和vismay,并探讨了转录因子复制与de novo基因表达调控的关联 | 研究主要基于果蝇模型,结果在其他物种中的普适性有待验证,且调控机制的实验验证可能有限 | 探究de novo起源基因的调控网络和关键转录因子 | 果蝇中的de novo基因及其调控转录因子 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1592 | 2026-03-04 |
SpaceBF: Spatial coexpression analysis using Bayesian Fused approaches in spatial omics datasets
2025-Jun-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.29.646124
PMID:40236135
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研究论文 | 本文提出了一种名为SpaceBF的贝叶斯融合建模框架,用于在空间组学数据中分析分子间的空间共表达模式 | 开发了首个基于贝叶斯融合方法的框架,能够同时估计局部(位置特异性)和全局(组织范围)的分子共表达,相比现有主要依赖地理空间指标(如双变量莫兰指数和李氏指数)的方法具有更高的特异性和统计效力 | 未明确说明方法对计算资源的需求或可扩展性限制,也未讨论在超大规模数据集上的应用性能 | 开发稳健的统计方法来检测空间组学数据中分子对之间的空间变化共表达模式 | 空间转录组学和空间蛋白质组学数据中的分子(基因、肽段、脂质、N-聚糖)共表达关系 | 空间组学 | 癌症(多种类型) | 空间转录组学、质谱成像 | 贝叶斯融合模型 | 空间组学数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 1593 | 2026-03-04 |
Combining Machine Learning and Multiplexed, In Situ Profiling to Engineer Cell Type and Behavioral Specificity
2025-Jun-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.20.660790
PMID:40667316
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研究论文 | 本研究开发了一个结合机器学习与多重原位分析的端到端平台ESCargoT,用于加速脊髓背角增强子发现,以实现神经回路的精确控制 | 整合机器学习指导的增强子优先排序、模块化AAV组装和多重原位筛选,实现空间解析的多重增强子分析 | 未明确提及样本量或实验重复次数,可能限制统计稳健性 | 加速脊髓背角增强子发现,以开发细胞靶向工具和基因疗法 | 小鼠脊髓背角神经元亚型(如兴奋性神经元、Exc-LMO3和Exc-SKOR2神经元)以及少突胶质细胞和运动神经元 | 机器学习 | 疼痛和瘙痒相关疾病 | 机器学习模型、交叉物种染色质可及性数据、多重原位分析、Golden-Gate组装 | 机器学习模型 | 染色质可及性数据、空间分析数据 | NA | NA | 多重原位分析、空间平行报告基因检测 | NA | ESCargoT平台结合机器学习指导的增强子优先排序、模块化AAV组装和多重原位筛选 |
| 1594 | 2026-03-04 |
A statistical framework for inferring genetic requirements from embryo-scale single-cell sequencing experiments
2025-Jun-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.03.646654
PMID:40236139
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研究论文 | 本文介绍了一个统计框架和两个软件工具(Hooke和Platt),用于从胚胎尺度的单细胞测序实验中推断遗传需求,并应用于斑马鱼胚胎的单细胞图谱分析 | 开发了Hooke和Platt软件工具,利用单细胞数据集中的丰富统计模式来表征实验扰动的直接分子和细胞后果,并通过细胞类型协变分析揭示发育中的基因依赖关系 | NA | 推断遗传、化学或环境扰动对基因和细胞类型的直接影响,并构建谱系依赖图谱 | 斑马鱼胚胎的单细胞测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 统计框架 | 单细胞测序数据 | 数千个斑马鱼胚胎的百万级细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1595 | 2026-03-04 |
Multiomics identifies tumor-intrinsic SREBP1 driving immune exclusion in hepatocellular carcinoma
2025-Jun-15, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011537
PMID:40518290
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了肝细胞癌中肿瘤内在的SREBP1通过促进巨噬细胞M2样重编程驱动免疫排斥的机制 | 首次通过大规模多组学分析结合单细胞RNA测序和空间脂质组学,系统性识别了肝细胞癌中与免疫排斥相关的32条致癌通路,并确定SREBP1为核心调控因子 | 研究主要基于体外三维共培养模型,缺乏体内实验验证;样本量虽大但单细胞RNA测序样本相对较少(31个) | 识别肝细胞癌中导致免疫检查点抑制剂耐药的新治疗靶点 | 肝细胞癌患者样本(包括肿瘤组织)和体外培养的HepG2肝癌细胞系 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | RNA测序, 蛋白质组学, 单细胞RNA测序, 成像质谱流式细胞术, 空间脂质组学, CRISPR基因敲除 | 三维共培养模型 | RNA测序数据, 蛋白质组数据, 单细胞RNA测序数据, 质谱成像数据 | 900多个人类样本(RNA测序和蛋白质组学)和31个肿瘤单细胞RNA测序样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间脂质组学 | NA | NA |
| 1596 | 2026-03-04 |
Single cell immunophenotyping identifies CD8+ GZMK+ IFNG+ T cells as a key immune population in cutaneous Lyme disease
2025-Jun-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.09.658661
PMID:40661371
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和适应性免疫受体测序,首次全面解析了莱姆病皮肤红斑移行(EM)病变中的T细胞免疫应答 | 首次在莱姆病皮肤病变中鉴定出CD8+ GZMK+ IFNG+ T细胞的关键免疫亚群,并发现其克隆扩增和干扰素调控基因的显著差异表达 | 研究样本量虽已扩大但仍有限,且主要聚焦于皮肤局部免疫应答,未涉及系统性免疫反应或长期随访 | 解析莱姆病皮肤病变(红斑移行)中的T细胞免疫表型及其在病原体防御中的作用 | 莱姆病患者的红斑移行(EM)皮肤病变组织与自体未受累皮肤组织 | 数字病理学 | 莱姆病 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq),适应性免疫受体测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 扩大后的样本集(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1597 | 2026-03-04 |
GUIDING CLUSTERING AND ANNOTATION IN SINGLE-CELL RNA SEQUENCING USING THE AVERAGE OVERLAP METRIC
2025-May-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.06.652497
PMID:40654835
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研究论文 | 本文提出使用平均重叠度量来指导单细胞RNA测序中的聚类和注释,以提高细胞类型识别的准确性和生物学意义 | 引入平均重叠度量来比较差异表达基因的排名列表,从而更精确地评估单细胞聚类结果,特别是在高度相似的细胞群体中 | 方法主要基于转录组相似性,可能未考虑其他生物学因素,且在未知细胞身份的数据集中验证有限 | 开发一种新方法来改进单细胞RNA测序数据中细胞聚类的比较和注释,以更准确地识别细胞类型和亚群 | 单细胞RNA测序数据,包括已知T细胞群体和未分选小鼠胸腺细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类算法 | 转录组数据 | 包括已知T细胞群体和未分选小鼠胸腺细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1598 | 2026-03-04 |
Loss of Kmt2c / d promotes gastric cancer initiation and confers vulnerability to mTORC1 inhibition and anti-PD1 immunotherapy
2025-Apr-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.27.645747
PMID:40236091
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研究论文 | 本研究通过基因工程小鼠模型揭示了Kmt2c/d功能缺失在胃癌发生中的作用,并发现其对mTORC1抑制剂和抗PD1免疫疗法敏感 | 首次证明Kmt2c/d缺失与Pten缺失协同驱动侵袭性胃癌快速发生,并发现Kmt2c/d缺失通过调控核糖体蛋白转录和MHC-I表达,创造了mTORC1抑制剂与免疫疗法的联合治疗机会 | 研究基于小鼠模型,其结论在人类胃癌中的直接适用性需要进一步验证 | 探究Kmt2c/d基因在胃癌发生中的功能及其对治疗策略的影响 | 基因工程小鼠模型中的胃上皮细胞及由此产生的胃腺癌 | 癌症生物学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序,组织学染色,基因敲除 | 基因工程小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据,组织学图像 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1599 | 2026-03-04 |
Epigenomic subtypes of late-onset Alzheimer's disease reveal distinct microglial signatures
2025-Mar-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.15.643144
PMID:40166175
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研究论文 | 本研究通过分析三个独立尸检脑队列的全基因组DNA甲基化数据,识别了晚发性阿尔茨海默病的两种表观基因组亚型,并揭示了它们与特定小胶质细胞状态的关联 | 首次在晚发性阿尔茨海默病中基于全基因组DNA甲基化模式识别出两种可重复的表观基因组亚型,并揭示了它们与特定小胶质细胞炎症状态的关联 | 研究基于尸检脑组织样本,可能无法完全反映疾病早期或活体状态;样本量相对有限(n=831),且为回顾性设计 | 识别晚发性阿尔茨海默病的表观基因组亚型,并探索其细胞类型特异性和功能影响 | 晚发性阿尔茨海默病患者的尸检脑组织样本 | 表观基因组学 | 阿尔茨海默病 | 全基因组DNA甲基化分析、单细胞RNA测序、转录组分析 | 无监督聚类方法 | DNA甲基化数据、转录组数据 | 831例尸检脑组织样本(来自三个独立队列) | NA | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序 | NA | NA |
| 1600 | 2026-03-04 |
Seq-Scope: repurposing Illumina sequencing flow cells for high-resolution spatial transcriptomics
2025-03, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01065-0
PMID:39482362
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研究论文 | 本研究开发了一种名为Seq-Scope的高分辨率空间转录组学技术,通过改造Illumina测序流动池实现低成本、高效率的空间转录组分析 | 将Illumina测序平台重新用于高分辨率空间转录组分析,实现了亚微米级分辨率、高捕获效率和低成本,克服了现有商业技术分辨率低、流程复杂、成本高的限制 | 需要研究人员具备分子生物学、组织学和基本Unix技能,且组织处理、文库制备和计算流程仍需3天完成 | 开发一种高分辨率、低成本的空间转录组学技术 | 新鲜冷冻组织切片 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据、组织图像数据 | 可在7 mm × 7 mm或更大区域内分析多个组织切片 | Illumina | 空间转录组学 | Illumina NovaSeq 6000 | Illumina NovaSeq 6000测序流动池 |