单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 30059 篇文献，本页显示第 15781 - 15800 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 15781 | 2024-08-07 |
Resistance to PRMT5-targeted therapy in mantle cell lymphoma
2024-01-09, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2023010554
PMID:37782774
|
研究论文 | 研究探讨了蛋白精氨酸甲基转移酶5（PRMT5）靶向治疗在套细胞淋巴瘤（MCL）中的耐药性问题 | 发现使用temsirolimus靶向阻断mTORC1可以克服PRMT5抑制剂的耐药性，并在耐药的MCL细胞系中显示出治疗协同作用 | 研究主要基于患者来源的异种移植（PDX）模型和细胞系，可能需要进一步的临床验证 | 探讨PRMT5靶向治疗在MCL中的耐药机制并寻找克服耐药性的策略 | 套细胞淋巴瘤（MCL）及其对PRMT5抑制剂的耐药性 | NA | 淋巴瘤 | RNA测序 | NA | RNA | 敏感细胞系4个，初级耐药细胞系4个，耐药PDX模型若干 |
| 15782 | 2024-08-04 |
Comprehensive molecular and cellular characterization of endoplasmic reticulum stress-related key genes in renal ischemia/reperfusion injury
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1340997
PMID:38495888
|
研究论文 | 本研究全面表征了与内质网应激相关的三种关键基因在肾脏缺血/再灌注损伤中的作用 | 该研究首次确定了与内质网应激相关的三种关键基因，并探讨了它们在肾脏移植后愈后预后的价值 | 研究的限制在于使用了已有的数据集，可能无法完全捕捉肾脏缺血/再灌注损伤的所有机制 | 研究旨在揭示肾脏缺血/再灌注损伤的潜在机制，以发现有效的肾脏保护靶点 | 研究对象为在肾脏缺血/再灌注损伤中涉及的关键基因及其相关途径 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 从GEO数据库收集了495个肾脏样本进行研究 |
| 15783 | 2024-08-05 |
Apolipoprotein L genes are novel mediators of inflammation in beta cells
2024-Jan, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-023-06033-z
PMID:37924378
|
研究论文 | 本文研究了载脂蛋白L基因在炎症引起的β细胞损伤中的新作用 | 发现APOL基因在β细胞中的表达受到炎症的显著上调，揭示了它们在胰腺炎症中的新调节作用 | 研究主要集中在单一细胞模型，可能无法全面反映复杂的体内环境 | 探讨载脂蛋白L基因在β细胞炎症损伤中的作用机制 | 主要研究人类胰腺β细胞以及与糖尿病相关的细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 使用了原代人胰岛细胞和EndoC-βH1细胞 |
| 15784 | 2024-08-07 |
Multi-omics and tumor immune microenvironment characterization of a prognostic model based on aging-related genes in melanoma
2024, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
DOI:10.62347/UZGP9704
PMID:38590405
|
研究论文 | 本文通过分析与衰老相关的基因，构建了一个针对黑色素瘤的预后模型，并探讨了其与肿瘤免疫微环境的关系 | 首次基于衰老相关基因构建黑色素瘤预后模型，并展示了其在预测患者死亡率方面的高准确性 | NA | 构建一个基于衰老相关基因的黑色素瘤预后模型，并探讨其在免疫治疗中的潜在应用 | 黑色素瘤及其免疫微环境 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组分析 | 预后模型 | 转录组数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 15785 | 2024-08-05 |
Human monoclonal antibodies against Staphylococcus aureus A protein identified by high-throughput single-cell sequencing of phase I clinical volunteers' B cells
2023-12, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2023.109843
PMID:37981106
|
研究论文 | 本研究通过高通量单细胞测序识别出对抗金黄色葡萄球菌A蛋白的人源单克隆抗体 | 发现了一种特异性针对金黄色葡萄球菌A蛋白的高表达的人单克隆抗体IgG-6 | 本研究仅在I期临床试验中进行，样本量相对较小，长期效果尚未验证 | 研究人源单克隆抗体作为对付金黄色葡萄球菌感染的新策略 | 从64名志愿者的外周血淋巴细胞中分离的抗原特异性记忆B细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | NA | 64名临床志愿者的外周血淋巴细胞 |
| 15786 | 2024-08-07 |
Ruxolitinib attenuates acute rejection and can serve as an immune induction therapy in heart transplantation
2023-12, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2023.109851
PMID:38008145
|
研究论文 | 研究探讨了IL2RA拮抗剂在心脏移植患者中的效果，并发现鲁索利替尼可能是一种新的免疫诱导治疗药物 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了IL2RA拮抗剂治疗后免疫细胞的动态变化，并发现鲁索利替尼可作为新的免疫诱导治疗药物，不影响调节性T细胞的激活 | 研究主要基于小鼠模型，需要在人体中进一步验证 | 阐明IL2RA拮抗剂的效果并寻找优于IL2RA拮抗剂的治疗目标 | 心脏移植患者及IL2RA拮抗剂治疗后的免疫细胞 | NA | 心脏移植 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 十九种细胞类型 |
| 15787 | 2024-08-07 |
Single-cell dissection, hdWGCNA and deep learning reveal the role of oxidatively stressed plasma cells in ulcerative colitis
2023-11-25, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2023237
PMID:37814814
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和高级加权基因共表达网络分析，揭示了氧化应激浆细胞在溃疡性结肠炎中的作用，并利用深度学习模型进行诊断 | 首次通过单细胞水平分析和多种机器学习方法，识别出氧化应激浆细胞在溃疡性结肠炎中的关键作用，并开发了用于诊断的深度学习模型 | NA | 阐明溃疡性结肠炎在单细胞水平的发病机制及其临床意义 | 溃疡性结肠炎中的氧化应激浆细胞 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序 | 卷积神经网络 | 转录组数据 | NA |
| 15788 | 2024-08-07 |
scAce: an adaptive embedding and clustering method for single-cell gene expression data
2023-09-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad546
PMID:37672035
|
research paper | 本文提出了一种名为scAce的自适应嵌入和聚类方法，用于单细胞基因表达数据的分析 | scAce方法通过构建变分自编码器同时学习细胞嵌入和聚类分配，并开发了一种自适应聚类合并方法，无需预先估计聚类数量 | NA | 旨在改进单细胞RNA测序数据的聚类分析，区分细胞类型并发现新的细胞类型 | 单细胞基因表达数据 | machine learning | NA | scRNA-seq | variational autoencoder | gene expression data | NA |
| 15789 | 2024-08-07 |
NMFClustering: Accessible NMF-based clustering utilizing GPU acceleration
2023-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.16.545370
PMID:37398372
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于非负矩阵分解（NMF）的聚类方法，通过GPU加速提高了计算效率 | 实现了基于NMF的聚类方法在GPU计算节点上的运行，使用Cupy库和消息传递接口（MPI），显著减少了计算时间 | NA | 旨在解决非负矩阵分解在处理大规模基因表达数据时的计算密集问题 | 基因表达数据，特别是单细胞RNA测序（scRNA-seq）计数矩阵 | 生物信息学 | NA | 非负矩阵分解（NMF） | NA | 基因表达数据 | 涉及数万个基因的高维数据集 |
| 15790 | 2024-08-04 |
Cellular states are coupled to genomic and viral heterogeneity in HPV-related oropharyngeal carcinoma
2023-04, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-023-01357-3
PMID:37012457
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序分析HPV阳性和阴性口咽肿瘤，揭示肿瘤内外的细胞多样性。 | 首次揭示了口咽癌细胞状态与基因组和病毒异质性的关系 | 研究中未明确涉及样本的具体数量和来源 | 探索HPV相关的口咽癌细胞的多样性及其对预后影响 | HPV阳性和阴性口咽肿瘤 | 数字病理学 | 其他癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 15791 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing explores the evolution of the ecosystem from leukoplakia to head and neck squamous cell carcinoma
2024-04-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-58978-9
PMID:38582791
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探索从白斑病到头颈鳞状细胞癌的生态系统演变过程 | 发现了在白斑病向头颈鳞状细胞癌进展过程中，与预后相关的多个细胞亚群及其不同的命运走向 | NA | 揭示白斑病向头颈鳞状细胞癌进展的分子机制，并为新治疗策略的开发提供理论基础 | 白斑病和头颈鳞状细胞癌的细胞生态系统 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自基因表达综合数据库和UCSC Xena数据库的样本信息 |
| 15792 | 2024-08-07 |
IRF1 governs the expression of SMARCC1 via the GCN5-SETD2 axis and actively engages in the advancement of osteoarthritis
2024-Mar, Journal of orthopaedic translation
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.jot.2024.01.002
PMID:38586591
|
研究论文 | 本研究分析了IRF1-GCN5-SETD2-SMARCC1轴在骨关节炎（OA）发展中的作用 | 发现IRF1通过GCN5和SETD2调控SMARCC1的表达，进而影响H3K27ac和H3K4me3修饰，促进M1巨噬细胞的极化，推动骨关节炎的进展 | NA | 分析IRF1-GCN5-SETD2-SMARCC1轴在骨关节炎发展中的功能 | IRF1、SMARCC1、GCN5、SETD2以及它们在骨关节炎中的作用 | NA | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 13名骨关节炎患者和7名无骨关节炎的骨折患者 |
| 15793 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics reveals altered lipid metabolism and inflammation-related gene expression of sebaceous glands in psoriasis and atopic dermatitis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1334844
PMID:38433843
|
研究论文 | 本研究揭示了皮脂腺在银屑病和特应性皮炎中的脂质代谢和炎症相关基因表达的变化 | 首次深入探讨了皮脂腺在银屑病和特应性皮炎中的作用，揭示其与炎症微环境的相互影响 | 未能探讨其他炎症性皮肤疾病对皮脂腺的影响 | 研究皮脂腺在银屑病和特应性皮炎中的作用 | 银屑病和特应性皮炎患者的人类皮肤样本 | 数字病理学 | 银屑病, 特应性皮炎 | 空间转录组学 | NA | 人类皮肤样本 | 涉及银屑病和特应性皮炎患者的皮肤样本 |
| 15794 | 2024-08-07 |
Unveiling macrophage diversity in myocardial ischemia-reperfusion injury: identification of a distinct lipid-associated macrophage subset
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1335333
PMID:38449872
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，在心肌缺血-再灌注损伤中鉴定出一种新型脂质相关巨噬细胞亚型，并探讨了其在心肌重塑中的潜在作用 | 首次在心肌缺血-再灌注损伤中发现并鉴定了一种新型脂质相关巨噬细胞亚型，该亚型具有高表达的Spp1和Trem2等基因 | NA | 旨在识别心肌缺血-再灌注损伤中的巨噬细胞亚型，并探索其对心脏修复和损伤的双重作用 | 心肌缺血-再灌注损伤中的巨噬细胞亚型 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 使用小鼠和人类的心脏样本进行研究 |
| 15795 | 2024-08-07 |
Integrative analysis identifies oxidative stress biomarkers in non-alcoholic fatty liver disease via machine learning and weighted gene co-expression network analysis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1335112
PMID:38476236
|
研究论文 | 本研究通过机器学习和加权基因共表达网络分析，识别非酒精性脂肪肝病中的氧化应激生物标志物 | 本研究发现了两个与非酒精性脂肪肝病中氧化应激密切相关的关键基因，CDKN1B和TFAM，这些基因可能作为新的诊断和治疗靶点 | NA | 识别非酒精性脂肪肝病中的氧化应激生物标志物，为临床管理提供新的视角 | 非酒精性脂肪肝病中的氧化应激相关基因 | 机器学习 | 非酒精性脂肪肝病 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA） | LASSO回归, SVM-RFE, 随机森林 | 基因表达数据 | 涉及31个交集基因和NASH小鼠模型中的肝脏组织 |
| 15796 | 2024-08-07 |
CD81 and CD82 expressing tumor-infiltrating lymphocytes in the NSCLC tumor microenvironment play a crucial role in T-cell activation and cytokine production
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1336246
PMID:38515751
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了非小细胞肺癌肿瘤微环境中表达CD81和CD82的肿瘤浸润淋巴细胞在T细胞激活和细胞因子产生中的重要作用 | 发现四跨膜蛋白家族成员CD81和CD82在激活的T细胞中表达，并与激活和耗竭标记物有强相关性，体外实验证实IL-2刺激的T细胞中CD81和CD82表达增加 | NA | 阐明非小细胞肺癌肿瘤微环境中与T细胞激活相关的分子特征 | 非小细胞肺癌患者的肿瘤组织样本中的T细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 19名非小细胞肺癌患者 |
| 15797 | 2024-08-07 |
SAP-expressing T peripheral helper cells identify systemic lupus erythematosus patients with lupus nephritis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1327437
PMID:38550577
|
研究论文 | 本文研究了SAP表达的T外周辅助细胞在系统性红斑狼疮（SLE）患者中的作用，特别是与狼疮性肾炎（LN）的关系。 | 首次探讨了SAP表达的T外周辅助细胞在狼疮性肾炎发病机制中的作用，并利用单细胞RNA测序数据验证了其在肾浸润T细胞中的表达。 | NA | 探讨SAP表达的T外周辅助细胞在狼疮性肾炎发病机制中的作用。 | 系统性红斑狼疮患者的外周血单个核细胞（PBMC）和肾浸润T细胞。 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序（scRNA seq） | NA | 细胞表面标记和细胞内SAP的表达数据 | 30名SLE患者（包括10名LN患者）和对照组 |
| 15798 | 2024-08-07 |
Identification of potential biomarkers for idiopathic pulmonary arterial hypertension using single-cell and bulk RNA sequencing analysis
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1328234
PMID:38586587
|
研究论文 | 本研究利用单细胞和批量RNA测序分析，探索特发性肺动脉高压（IPAH）中的细胞异质性和分子病理，并识别潜在的生物标志物 | 本研究结合单细胞和批量RNA测序数据，首次识别出12个候选生物标志物，并通过RT-qPCR验证了其中5个基因在肺动脉内皮细胞中的表达差异 | NA | 揭示IPAH的潜在诊断标志物和治疗靶点 | 特发性肺动脉高压（IPAH）的细胞异质性和分子病理 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、批量RNA测序 | NA | RNA | 涉及三个IPAH数据集和两个额外的PAH数据集 |
| 15799 | 2024-08-07 |
Identification of antigen-presentation related B cells as a key player in Crohn's disease using single-cell dissecting, hdWGCNA, and deep learning
2023-Dec, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-023-01145-7
PMID:37550553
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，结合高维加权基因共表达网络分析和深度学习方法，识别出与克罗恩病发病机制相关的抗原呈递相关B细胞亚群 | 首次揭示了抗原呈递相关B细胞在克罗恩病发病机制中的潜在促进作用，并开发了一种基于基因-免疫卷积神经网络的深度学习模型，有效区分疾病与正常黏膜 | NA | 探究克罗恩病的发病机制及其临床意义 | 克罗恩病中的B细胞亚群及其在疾病中的作用 | 机器学习 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | 卷积神经网络 | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量 |
| 15800 | 2024-08-07 |
COX5A as a potential biomarker for disease activity and organ damage in lupus
2023-Dec, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-023-01215-w
PMID:37891386
|
研究论文 | 本研究通过综合分析RNA-seq数据和单细胞RNA测序数据，探讨了系统性红斑狼疮（SLE）中的关键通路和驱动基因，并评估了COX5A作为SLE疾病活动和器官损伤的潜在生物标志物的价值 | 本研究首次发现氧化磷酸化（OXPHOS）是SLE中最显著改变的代谢途径，并识别了与OXPHOS相关的酶COX5A，其表达与SLE的疾病活动、器官损伤和皮质类固醇治疗相关 | NA | 旨在深入了解SLE的免疫学途径和预后生物标志物 | SLE的免疫细胞类型、关键通路和驱动基因，以及COX5A作为生物标志物的潜在价值 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据, 单细胞RNA测序数据 | 64例SLE患者和62例健康对照 |