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当前共找到 37637 篇文献，本页显示第 1561 - 1580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1561 | 2026-03-05 |
Protocol for flow cytometry-assisted single-nucleus RNA sequencing of human and mouse adipose tissue with sample multiplexing
2024-03-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.102893
PMID:38416649
|
研究论文 | 本文介绍了一种用于人和小鼠脂肪组织的流式细胞术辅助单核RNA测序协议，支持样本多重分析 | 开发了一种整合流式细胞术进行质量控制、计数和精确核池化的新工作流程，以直接加载到10x Chromium控制器，有效消除批次混淆、减少低质量核、环境RNA污染和试剂浪费 | NA | 优化脂肪组织的单细胞RNA测序方法，克服脂肪细胞大小、脆弱性和商业试剂盒成本限制 | 人和小鼠的脂肪组织 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium控制器 |
| 1562 | 2026-03-05 |
Niche-DE: niche-differential gene expression analysis in spatial transcriptomics data identifies context-dependent cell-cell interactions
2024-01-12, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-03159-6
PMID:38217002
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研究论文 | 本文提出了一种名为niche-DE的新统计方法，用于分析空间转录组数据中的细胞类型特异性生态位相关基因，并开发了niche-LR方法来揭示配体-受体信号机制 | 首次专注于识别由细胞间相互作用驱动的局部基因表达变化，而非全局基因表达变异，适用于不同分辨率的空间转录组数据 | 未在摘要中明确提及具体局限性 | 开发统计方法以分析空间转录组数据中的细胞类型特异性生态位相关基因和配体-受体信号机制 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | niche-DE, niche-LR | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1563 | 2026-03-05 |
Central lung gene expression associates with myofibroblast features in idiopathic pulmonary fibrosis
2023-02, BMJ open respiratory research
IF:3.6Q1
DOI:10.1136/bmjresp-2022-001391
PMID:36725082
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研究论文 | 本研究通过RNA测序分析特发性肺纤维化（IPF）中央与周边肺组织的基因表达差异，揭示了中央肺区肌成纤维细胞特征与疾病进展的关联 | 首次系统比较IPF中央与周边肺组织的转录组差异，并识别出85个中央IPF相关基因（CAG），这些基因在肌成纤维细胞中高度表达且与疾病信号通路相关 | 研究样本量有限，且依赖于计算细胞去卷积方法而非直接单细胞实验验证 | 探究中央肺组织在特发性肺纤维化发病机制中的作用 | 特发性肺纤维化患者的中央与周边肺组织活检样本，以及非IPF肺组织对照 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | RNA测序（RNA-seq），单细胞RNA测序分析 | 计算细胞去卷积分析，网络分析 | 基因表达数据，组织活检数据 | 未明确具体样本数量，但包括配对IPF中央与周边肺组织及非IPF对照 | NA | RNA-seq，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1564 | 2026-03-05 |
SARS-CoV-2 infection of the pancreas promotes thrombofibrosis and is associated with new-onset diabetes
2021-08-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.151551
PMID:34241597
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研究论文 | 本文研究了SARS-CoV-2感染胰腺与血栓纤维化及新发糖尿病之间的关联 | 首次通过单细胞RNA测序和免疫定位技术，在非人灵长类动物和人类中证实SARS-CoV-2可直接感染胰腺细胞，并揭示其与血栓纤维化及新发糖尿病的潜在机制 | 样本量较小（8只非人灵长类动物和5名COVID-19患者），且为观察性研究，因果关系需进一步验证 | 探究SARS-CoV-2感染是否直接导致胰腺功能障碍及新发糖尿病 | 非人灵长类动物和人类胰腺组织 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序，免疫定位 | NA | RNA测序数据，组织图像 | 8只非人灵长类动物和5名COVID-19患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1565 | 2026-03-05 |
Building and Regenerating the Lung Cell by Cell
2019-01-01, Physiological reviews
IF:29.9Q1
DOI:10.1152/physrev.00001.2018
PMID:30427276
|
综述 | 本文综述了哺乳动物肺的细胞多样性和发育机制，探讨了单细胞RNA测序和高分辨率成像在揭示肺细胞异质性和基因表达中的作用 | 整合了最新的单细胞RNA测序数据和高分辨率成像技术，以揭示肺细胞类型的显著异质性和发育过程中的细胞选择性基因表达 | NA | 理解肺的细胞和分子机制，以揭示急性及慢性肺疾病的发病机制 | 哺乳动物肺的细胞类型和发育过程 | 数字病理学 | 肺疾病 | 单细胞RNA测序，高分辨率成像 | NA | RNA测序数据，图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1566 | 2026-03-04 |
GPR56 Outperforms CD319 as a Discriminative Marker for CD4 + Cytotoxic T Lymphocytes and Is Elevated in Primary Sjögren's Syndrome
2026-Apr, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.70073
PMID:41324175
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研究论文 | 本研究探讨了GPR56作为CD4+细胞毒性T淋巴细胞（CTLs）的新型表面标记物，并评估其在原发性干燥综合征（pSS）中的表达和功能相关性 | 首次将GPR56识别为CD4 CTLs的功能性表面标记物，并证明其在pSS患者中表达升高且与疾病严重程度相关 | 研究样本可能有限，且机制研究尚需进一步深入验证 | 鉴定CD4 CTLs的表面标记物，并探索其在自身免疫性疾病中的作用 | CD4+细胞毒性T淋巴细胞和原发性干燥综合征患者 | 免疫学 | 原发性干燥综合征 | 单细胞RNA测序和流式细胞术 | NA | 基因表达数据和细胞表型数据 | 未明确指定样本数量，但涉及pSS患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1567 | 2026-03-04 |
Islet amyloid disrupts MHC class II antigen presentation and delays autoimmune diabetes in NOD mice
2026-Apr, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-025-06622-0
PMID:41423547
|
研究论文 | 本研究探讨了胰岛淀粉样蛋白通过下调胰岛巨噬细胞中的MHC II类抗原呈递基因，从而延缓NOD小鼠自身免疫性糖尿病发病的机制 | 首次揭示了胰岛淀粉样蛋白在早期形成阶段通过减少抗原呈递来干扰β细胞自身免疫的新作用，挑战了其仅促炎的既定观点 | 研究主要基于小鼠模型，人类中的直接相关性尚需进一步验证；且机制细节如具体信号通路未完全阐明 | 理解胰岛淀粉样蛋白对胰岛巨噬细胞及β细胞自身免疫的影响，以阐明其在1型糖尿病发病中的作用 | 表达人胰岛淀粉样多肽（hIAPP）的NOD小鼠、胰岛巨噬细胞、树突状细胞及自身反应性T细胞 | 单细胞组学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 未明确指定样本数量，但涉及转基因与野生型NOD小鼠的比较组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1568 | 2026-03-04 |
Phosphodiesterase ENPP2, which is co-upregulated in obese and pregnant mice, is essential for islet beta cell compensation during obesity
2026-Apr, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-025-06639-5
PMID:41454014
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，识别出在肥胖和妊娠小鼠胰岛β细胞中共同上调的磷酸二酯酶ENPP2，并证实其在肥胖期间β细胞代偿中的关键作用 | 首次利用单细胞RNA-seq技术比较肥胖和妊娠小鼠胰岛细胞的转录组，发现ENPP2作为共同上调基因，并揭示其通过LPA-Akt/mTOR信号通路促进β细胞增殖的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限，且ENPP2在糖尿病模型中表达下降，其治疗潜力需进一步临床验证 | 识别能适度增强肥胖期间β细胞代偿能力的关键分子 | 饮食诱导的肥胖小鼠、妊娠小鼠、Min6β细胞系、Enpp2基因敲除小鼠及β细胞过表达ENPP2的转基因小鼠 | 单细胞转录组学 | 糖尿病 | 单细胞RNA-seq, 定量PCR, 免疫荧光 | NA | RNA表达数据, 蛋白质表达数据 | 小鼠模型及人类参与者（具体数量未在摘要中明确） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1569 | 2026-03-04 |
RUNX1 is expressed in a subpopulation of dermal fibroblasts and is associated with disease severity of systemic sclerosis
2026-Mar, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.10.033
PMID:41381303
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研究论文 | 本研究探讨了RUNX1在系统性硬化症（SSc）皮肤纤维化中的作用，通过基因表达、DNA甲基化和单细胞RNA-seq数据分析，发现RUNX1表达与疾病严重程度相关，并通过实验验证其功能 | 首次证明RUNX1在SSc皮肤纤维化发病机制中的潜在作用，并揭示其在特定成纤维细胞亚群中的表达与疾病严重程度相关 | 研究主要基于体外细胞培养和数据分析，缺乏体内实验验证，且样本来源和数量可能限制结论的普适性 | 探究RUNX1在系统性硬化症皮肤纤维化进展中的角色 | 系统性硬化症患者的皮肤样本和成纤维细胞 | 数字病理学 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA-seq, DNA甲基化分析, siRNA, 药物抑制, CRISPR敲除 | NA | 基因表达数据, DNA甲基化数据, 单细胞RNA-seq数据 | 多个队列的SSc患者皮肤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1570 | 2026-03-04 |
Spatially Resolved Lipid Composition of the Human Brain Cortical Layers
2026-Mar, Neuroscience bulletin
IF:5.9Q1
DOI:10.1007/s12264-025-01486-1
PMID:40880037
|
研究论文 | 本研究通过激光捕获显微切割结合质谱和质谱成像技术，分析了人类大脑皮层两个区域的脂质组组成，揭示了脂质分布与皮层层次结构之间的复杂关系 | 首次结合激光捕获显微切割、质谱和空间转录组学数据，系统解析了人类大脑皮层各层次脂质组成的空间分布模式及其与细胞类型的关联 | 研究仅关注了人类大脑皮层的两个区域和三个层次（L1、L3、L5），样本覆盖范围有限，且未深入探讨脂质功能机制 | 阐明人类大脑皮层脂质组组成的空间分布及其与皮层层次结构的关系 | 人类大脑皮层组织样本 | 空间组学 | NA | 激光捕获显微切割、质谱、质谱成像、空间转录组学 | NA | 质谱数据、成像数据、转录组数据 | 涉及人类大脑皮层两个区域的离散层次（L1、L3、L5）组织样本，检测了312种脂质 | NA | 质谱成像、空间转录组学 | NA | NA |
| 1571 | 2026-03-04 |
Single-Cell Sequencing Reveals Thalidomide-Induced Teratogenicity in Zebrafish via Endoplasmic Reticulum Stress and Dysregulated Angiogenic Signaling
2026 Mar-Apr 01, The Journal of craniofacial surgery
IF:1.0Q3
DOI:10.1097/SCS.0000000000011570
PMID:40549513
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了沙利度胺通过内质网应激和血管生成信号失调诱导斑马鱼畸形的分子机制 | 首次在单细胞水平构建了沙利度胺暴露下斑马鱼胚胎的转录组图谱，并鉴定了与氧化应激和抗血管生成相关的关键基因 | 研究仅基于转录组数据，缺乏蛋白质水平验证；样本时间点有限（仅1、2、5天） | 探究沙利度胺致畸性的分子机制，特别是氧化应激和抗血管生成相关基因的作用 | 斑马鱼胚胎 | 单细胞测序 | 先天性畸形 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、RT-qPCR | NA | 单细胞转录组数据 | 69,115个细胞（来自沙利度胺暴露组和野生型对照组） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1572 | 2026-03-04 |
Single-Cell Nanodroplet Processing Proteomics Pipeline for Analysis of Human-Derived Microglia
2026-Feb-25, Proteomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1002/pmic.70112
PMID:41742681
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于FACS辅助分离、冷冻保存和纳米液滴处理的单细胞质谱蛋白质组学工作流程，用于分析人脑皮层来源的小胶质细胞 | 开发了一种无标记的单细胞蛋白质组学方法，首次应用于人源小胶质细胞，平均每个细胞可鉴定1039种蛋白质，并揭示了线粒体蛋白驱动小胶质细胞异质性 | 该研究为原理验证性实验，样本量有限，仅基于单个人类供体，且蛋白质组学数据仅部分重现先前的小胶质细胞亚型 | 探索小胶质细胞在细胞水平的异质性，并识别与阿尔茨海默病等神经系统疾病相关的功能性和分析性蛋白质靶点 | 人脑皮层来源的小胶质细胞 | 蛋白质组学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞质谱蛋白质组学 | NA | 蛋白质组学数据 | 单个人类供体的小胶质细胞 | NA | 单细胞蛋白质组学 | NA | 基于FACS辅助分离、冷冻保存和纳米液滴处理的单细胞质谱蛋白质组学工作流程 |
| 1573 | 2026-03-04 |
mosna reveals different types of cellular interactions predictive of response to immunotherapies and survival in cancer
2026-Feb-25, Molecular & cellular proteomics : MCP
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.mcpro.2026.101536
PMID:41759628
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研究论文 | 本文介绍了一个名为mosna的Python软件包，用于整合临床或生物学数据，分析空间组学数据，以揭示细胞相互作用模式或组织结构，并预测免疫疗法反应和癌症生存率 | 开发了mosna这一通用Python包，能整合多种空间组学技术与临床数据，提供从描述性统计到机器学习模型训练的全流程分析，支持二进制条件和生存数据分析 | 未明确说明样本量限制或算法在特定数据集上的性能边界，可能依赖于手动注释的数据集进行验证 | 开发一个可访问的分析工具，用于整合空间组学数据与临床信息，以预测免疫疗法反应和癌症生存结果 | 空间组学数据，包括亚细胞分辨率转录组学（如MERFISH、seqFISH、Xenium）和蛋白质组学（如CODEX、MIBI-TOF、低重免疫荧光），以及基于点的空间转录组学（如10x Visium、Slide-seq、Stereo-seq） | 数字病理学 | 癌症 | 空间组学技术，包括空间转录组学和空间蛋白质组学 | 机器学习模型 | 空间组学数据（图像和文本数据） | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台 |
| 1574 | 2026-03-04 |
CD14 plays a critical role in pain and inflammation across multiple models of post-traumatic osteoarthritis
2026-Feb-24, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.70100
PMID:41735778
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研究论文 | 本研究通过基因敲除和抗体阻断方法，在多模型小鼠中验证CD14在创伤后骨关节炎疼痛和炎症中的关键作用 | 首次在多模型系统中系统验证CD14在骨关节炎疼痛和炎症中的核心作用，并采用单细胞转录组和空间蛋白质组学揭示其作用机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探究CD14在创伤后骨关节炎疼痛和炎症中的作用机制 | 人类骨关节炎滑液样本、多种创伤后骨关节炎小鼠模型 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞转录组学、空间蛋白质组学、流式细胞术 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据、行为学数据 | 人类滑液样本及多种小鼠模型（包括不同性别和肥胖因素） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 1575 | 2026-03-04 |
Large-scale sequencing study of de novo regulatory Tandem Repeats (TRs) identifies new ASD (Autism Spectrum Disorders) candidate genes integrating gene expression mapping, brain scRNA-seq and organoid models
2026-Feb-13, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-8374597/v1
PMID:41727608
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研究论文 | 本研究通过对新生串联重复序列进行整合分析，结合基因表达图谱、大脑单细胞RNA测序和类器官模型，识别出新的自闭症谱系障碍候选基因 | 整合了新生串联重复序列分析、多组学功能注释、大脑单细胞RNA测序和皮质类器官表达数据，以揭示传统外显子组或全基因组分析中通常遗漏的非编码区域复杂遗传变异 | 研究主要基于特定队列（西班牙队列和SSC队列），样本来源和规模可能限制结果的普适性；依赖生物信息学流程的准确性，可能存在检测偏差 | 揭示自闭症谱系障碍的缺失遗传性，识别新的风险基因，特别是在非编码区域 | 自闭症谱系障碍患者及其家庭（包括西班牙队列200个ASD三重奏和SSC的1637个ASD单纯型四重家庭），以及人类大脑组织和皮质类器官 | 基因组学 | 自闭症谱系障碍 | 目标测序、单细胞RNA测序、生物信息学分析 | NA | 基因组测序数据、单细胞RNA测序数据、类器官表达数据 | 200个ASD三重奏（西班牙队列）和1637个ASD单纯型四重家庭（SSC），以及人类大脑单细胞RNA测序数据和皮质类器官数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1576 | 2026-03-04 |
WAS Protein Deficiency Disrupts Memory B Cell Formation During Acute LCMV Infection
2026-Feb-11, Journal of clinical immunology
IF:7.2Q1
DOI:10.1007/s10875-026-01984-5
PMID:41670926
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研究论文 | 本研究通过使用WAS蛋白敲除小鼠模型，探究了在急性LCMV感染中WAS蛋白缺乏对记忆B细胞分化的影响及其机制 | 首次结合单细胞RNA测序技术，揭示了WAS蛋白在急性病毒感染期间差异表达于记忆B细胞亚群，并调控其命运 | 研究仅基于小鼠模型，可能无法完全反映人类WAS患者的复杂免疫反应 | 探究WAS蛋白缺乏如何影响记忆B细胞在急性病毒感染中的形成机制 | WAS蛋白敲除小鼠在急性LCMV感染后的记忆B细胞 | 免疫学 | Wiskott-Aldrich综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1577 | 2026-03-04 |
fastdemux: Robust SNP-based demultiplexing of single-cell population genomics data
2026-Feb-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.10.705082
PMID:41726916
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研究论文 | 本文介绍了fastdemux，一种基于SNP的高效单细胞基因组学数据解复用框架，通过DLDA模型显著提升计算效率并保持准确的供体分配 | 提出基于对角线性判别分析（DLDA）的快速解复用框架，在计算速度和内存使用上相比现有方法有数量级提升，同时支持双联体和多联体检测，并适用于scATAC-seq数据 | 未明确提及具体样本量限制或跨平台验证的广泛性 | 开发一种高效且可扩展的单细胞基因组学数据解复用方法，以降低大规模研究中的成本和批次效应 | 单细胞RNA-seq和scATAC-seq数据中的供体解复用 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq, scATAC-seq | DLDA（对角线性判别分析） | 基因组学数据（SNP变异信息） | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 1578 | 2026-03-04 |
SCALPEL: A pipeline for processing large-scale spatial transcriptomics data
2026-Feb-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.09.698732
PMID:41648271
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研究论文 | 本文介绍了一个名为SCALPEL的用于处理大规模空间转录组学数据的分析流程 | 该流程针对大型图谱级数据集设计，集成了优化的3D分割、改进的过滤标准、基于转录组的双联体检测、增强的细胞类型标签转移、空间域检测、组织切片配准至标准脑图谱以及全基因组表达插补等多项先进功能 | NA | 开发一个能够高效、准确处理大规模空间转录组学数据的标准化分析流程 | 空间转录组学数据，特别是来自小鼠全脑的大规模数据集 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组学数据，scRNA-seq数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1579 | 2026-03-04 |
Inactivation of Hes1 in Skeletal Undifferentiated Cells Increases Bone Volume
2026-Feb-04, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqag015
PMID:41685823
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研究论文 | 本研究探讨了在瘦素受体阳性（LepR+）细胞中失活Hes1基因对骨量的影响 | 首次在LepR+细胞中特异性失活Hes1基因，揭示了其通过抑制RANKL表达减少骨吸收从而增加骨量的机制 | 研究仅在小鼠模型中进行，未在人类细胞中验证；骨量增加仅限于股骨，未影响椎骨和皮质骨；性别差异仅在成骨细胞数量变化中观察到 | 探究Notch信号通路靶基因Hes1在LepR+细胞中对骨代谢的调控作用 | LepR-Cre;Hes1Δ/Δ基因工程小鼠及其对照小鼠的骨骼组织 | 骨生物学 | 骨代谢疾病 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | 5月龄LepR-Cre;Hes1Δ/Δ小鼠和对照小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1580 | 2026-03-04 |
Club cell RhoA activation amplifies allergic airway inflammation by regulating epithelial integrity and C1qα+ interstitial macrophages
2026-Feb-01, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2026.01.016
PMID:41633491
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研究论文 | 本研究探讨了Club细胞中RhoA激活在过敏性气道炎症中的作用，通过基因敲除小鼠模型和多组学技术揭示了其通过影响上皮屏障功能和巨噬细胞动态来放大炎症的机制 | 首次在Club细胞中特异性研究RhoA的功能，并发现其通过调节上皮完整性和C1qα+间质巨噬细胞来放大过敏性气道炎症 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性尚需进一步验证 | 确定Club细胞中RhoA在过敏性气道炎症中的功能 | Club细胞特异性RhoA敲除小鼠模型及气液界面培养的上皮细胞 | 免疫学与呼吸疾病研究 | 过敏性气道炎症 | 多维流式细胞术、bulk RNA测序、单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、流式细胞数据、单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量，但涉及基因敲除小鼠模型和多组学分析 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |