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当前共找到 44757 篇文献,本页显示第 1561 - 1580 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1561 2026-10-03
YAP1 induces hepatocellular carcinoma via DNA demethylation rather than by canonical driver gene mutations
2026-09-17, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究通过小鼠嵌合模型和多种测序技术,揭示了YAP1-TEAD激活通过TET1介导的DNA去甲基化驱动肝细胞癌发生,而非依赖经典驱动基因突变 首次提出并验证了YAP1-TEAD-TET1轴通过DNA去甲基化激活多个 oncogenes 驱动经典驱动基因突变阴性肝细胞癌的新机制 主要基于小鼠模型,人类样本验证仅限于FALD患者肝细胞,缺乏更广泛的人类HCC队列验证 探究经典驱动基因突变阴性癌症的发病机制,验证YAP1激活通过表观遗传改变驱动肿瘤发生的假说 小鼠肝细胞癌嵌合模型、FALD患者肝细胞 表观遗传学、肿瘤基因组学 肝癌 全外显子组测序、亚硫酸氢盐测序、单细胞空间转录组学 NA 图像、文本、测序数据 NA NA 单细胞空间转录组学、bulk RNA-seq、全外显子组测序、亚硫酸氢盐测序 NA NA
1562 2026-10-03
Unicellular and Multicellular Modes of Selection Impose Distinct Constraints on Cellular Phenotype Evolution
2026-Sep-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文使用几何模型研究选择通过细胞表型单独或联合作用时,如何限制共享基因组在多个功能需求下演化并维持分化表型的能力 通过几何模型明确区分单细胞和多细胞模式下的选择压力,揭示表型组织方式对分化演化的不同约束 基于几何模型的简化假设,可能未完全反映真实生物系统的复杂性 探究选择通过细胞表型单独或联合作用时,如何约束共享基因组演化并维持分化表型 共享基因组、细胞表型、功能需求 机器学习 NA NA 几何模型 NA NA NA NA NA NA
1563 2026-10-03
Uncovering pan-cancer signatures of chemoresistance
2026-Sep-16, Genome medicine IF:10.4Q1
研究论文 该研究整合单细胞RNA测序、空间转录组学、调控网络建模等多组学数据,揭示了一种跨癌种保守的增殖性化疗耐药肿瘤状态,并确定MYC-SRM轴为可成药靶点 首次将化疗耐药重新定义为增殖性、MYC驱动的状态,而非传统认为的静息或EMT样表型;发现SRM(亚精胺合成酶)作为MYC的新型靶基因和耐药保守效应因子,促进多胺生物合成以维持染色质稳定性和代谢韧性 未在摘要中明确说明 揭示跨癌种化疗耐药的保守分子程序,定义耐药肿瘤状态并寻找可干预的治疗靶点 多种癌症类型的耐药肿瘤细胞、细胞系、患者来源类器官和小鼠模型 数字病理学 泛癌种 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 调控网络建模, 转录因子结合数据分析, 药物扰动实验 NA 图像, 文本 NA NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
1564 2026-10-03
TGF-β serves as a critical signaling determinant of liver progenitor cell activation and function
2026-09-15, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本文通过空间转录组学和单细胞测序揭示了TGF-β在肝祖细胞静息状态维持与激活调控中的关键作用,并阐明其与HGF、EGF等信号的协同调控机制 首次阐明TGF-β在肝祖细胞中具有双重角色:既抑制LPC增殖(通过阻断G1到S期转换),又是HGF依赖的肝细胞基因程序诱导所必需的,揭示了TGF-β作为LPC激活和谱系特化的情境依赖性决定因子 摘要中未明确提及研究局限性 探究肝祖细胞在生理条件下如何维持静息状态以及在大量肝坏死相关急性肝衰竭后如何被激活的调控机制 肝祖细胞(LPCs)、急性肝衰竭患者样本、斑马鱼模型、小鼠损伤模型 空间转录组学, 单细胞测序 急性肝衰竭 空间转录组学, 单细胞测序, 免疫染色 NA 转录组数据, 图像 NA NA 空间转录组学, 单细胞RNA测序 NA NA
1565 2026-10-03
Selective vulnerability and resilience of thalamic neuronal populations in Frontotemporal Dementia
2026-Sep-11, Research square
研究论文 通过对来自三个独立队列的92名个体共331,065个细胞核进行单核RNA测序,构建了人类前内侧丘脑的整合图谱,揭示了GRN相关额颞叶痴呆中选择性丘脑神经元易损性和韧性的细胞框架 首次构建了涵盖GRN相关FTD、散发性FTD伴TDP-43蛋白病、阿尔茨海默病和正常衰老的人类前内侧丘脑大规模单核RNA测序整合图谱,鉴定出FTD中两群选择性耗竭的抑制性神经元和易损的RNF220+兴奋性神经元,并发现RNF220-兴奋性神经元具有内在韧性及其与GRN表达和细胞骨架维持程序的关联 摘要中未明确说明研究局限性 揭示GRN突变相关额颞叶痴呆中选择性丘脑易损性的细胞基础,并鉴定与神经退行性变抵抗相关的内在分子程序 GRN相关FTD患者、散发性FTD伴TDP-43蛋白病患者、阿尔茨海默病患者及神经正常衰老个体的前内侧丘脑组织 数字病理学 额颞叶痴呆 单核RNA测序,空间转录组学 NA 图像,文本 92名个体的331,065个细胞核,来自三个独立队列 10x Genomics 单细胞RNA测序,空间转录组学 10x Chromium,10x Visium NA
1566 2026-10-03
NNMT-associated metabolic-thromboinflammatory-immune co-activation in heterogeneous CTC clusters: a hypothesis-generating computational framework"
2026-Sep-10, BMC cancer IF:3.4Q2
研究论文 本文构建了一个假设生成的计算框架,整合机制证据、泛癌计算分析和单细胞转录组分析,评估NNMT与CTC簇相关的代谢-血栓炎症-免疫共激活状态的关联 首次系统性地将NNMT与CTC簇中血小板/凝血、中性粒细胞/NET和免疫耗竭程序进行整合分析,构建了三轴共激活的计算框架,并提出了“解聚-暴露-清除”策略 本研究为假设生成性框架,未产生新的实验、动物或临床干预数据,伪时间分析不能建立时间因果关系 系统评估NNMT与CTC相关状态中血小板/凝血、中性粒细胞/NET及免疫耗竭程序的协调关系,并探索CTC异质性相关的代谢-血栓炎症-免疫共激活特征 异质性循环肿瘤细胞簇、血小板、中性粒细胞、基质细胞和免疫细胞 机器学习, 数字病理学 肺癌, 前列腺癌, 泛癌 bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq 监督机器学习模型 文本, 图像 483,590个细胞,来自8个公开可用的多癌种单细胞RNA-seq队列,以及TCGA泛癌bulk RNA-seq数据 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
1567 2026-10-03
Spatial Proteomics and Epigenomics Reveal Cell Morphology and Epigenetic Gene Regulation in Human Hippocampus
2026-Sep-07, Research square
研究论文 本文通过空间蛋白质组学和空间表观基因组学技术,构建了人类海马体的空间三组学(蛋白质组、转录组和表观基因组)分类图谱,揭示了细胞形态和表观遗传基因调控 首次构建人类海马体的空间三组学分类图谱;设计了25种蛋白质靶标的新面板并进行多重成像,生成了首个单细胞分辨率(330纳米)的大规模海马体空间蛋白质组图谱;应用了最先进的空间ATAC-seq技术来识别开放染色质区域和顺式调控元件 摘要中未明确提及研究局限性 解决单细胞和空间转录组学中的两个关键挑战:原位可视化细胞形态和表观遗传基因调控;构建人类海马体的综合空间图谱 人类海马体组织,包括齿状回和安蒙角(CA)区域 空间组学 神经系统疾病 空间蛋白质组学,空间转录组学,空间ATAC-seq NA 图像,文本 来自16个个体的超过160万个单细胞 NA 空间蛋白质组学,空间转录组学,空间ATAC-seq NA NA
1568 2026-10-03
SIRT1/PGC-1α axis and CPT1A-mediated metabolic reprogramming reshape macrophage polarization to ameliorate intervertebral disc degeneration
2026-Sep-05, Pharmacological research IF:9.1Q1
研究论文 该研究结合单细胞RNA测序、bulk RNA测序和同位素示踪,揭示SIRT1/PGC-1α轴与CPT1A介导的代谢重编程通过调控巨噬细胞极化改善椎间盘退变 首次阐明SIRT1/PGC-1α/CPT1A轴通过增强氧化磷酸化和脂肪酸氧化、抑制糖酵解来促进M2极化,并证实SRT1720或C75可缓解椎间盘退变 研究主要基于大鼠穿刺诱导模型,尚需进一步验证于人类椎间盘退变样本及临床转化 阐明SIRT1/PGC-1α轴和CPT1A介导的代谢重编程如何调控椎间盘退变中的巨噬细胞极化 穿刺诱导的椎间盘退变大鼠模型及巨噬细胞 机器学习 椎间盘退变 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 同位素示踪 NA 文本, 图像 NA NA 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 NA NA
1569 2026-10-03
[Hepatocellular carcinoma-derived lactate-mediated histone H3K18 lactylation modifies S100A2 transcription to promote proliferation, migration, invasion and epithelial-mesenchymal transition of hepatocellular carcinoma cells]
2026 Sept 20, Nan fang yi ke da xue xue bao = Journal of Southern Medical University
研究论文 本文研究肝细胞癌来源的乳酸介导的组蛋白H3K18乳酰化修饰通过调控S100A2转录,促进肝细胞癌细胞的增殖、迁移、侵袭和上皮-间质转化 揭示了肝细胞癌来源的乳酸通过增强H3K18la修饰激活S100A2转录,进而正向调控Wnt/β-catenin通路,最终促进肝细胞癌恶性进展的新机制,并首次发现S100A2与KRT6A蛋白的直接相互作用 摘要中未明确说明研究局限性 探讨组蛋白H3赖氨酸18乳酰化(H3K18la)调控S100钙结合蛋白A2(S100A2)转录在肝细胞癌发生发展中的作用及其分子机制 肝细胞癌细胞系和正常肝细胞系、肝细胞癌单细胞转录组测序数据、TCGA数据库 数字病理学 肝癌 单细胞转录组测序、ChIP-qPCR、Western blotting、Co-IP、分子对接 NA 图像、文本 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1570 2026-10-03
Single-cell landscape of human liver sinusoidal γδ T cells in the context of latent human cytomegalovirus infection
2026-08-29, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 该研究通过单细胞RNA测序结合抗体衍生标签技术,分析了健康捐赠者(有或无潜伏性人类巨细胞病毒感染)的肝脏正弦γδ T细胞的异质性 首次在潜伏性HCMV感染背景下,揭示了肝脏正弦γδ T细胞的详细异质性,并鉴定出一种新型肝脏驻留CD56CD161细胞群体,具有独特的TCR库和IL-15诱导的NK样细胞毒性 研究仅基于健康捐赠者样本,可能无法完全反映疾病状态下的γδ T细胞变化 阐明肝脏正弦γδ T细胞在潜伏性人类巨细胞病毒感染背景下的异质性和功能 人类肝脏正弦γδ T细胞 单细胞组学 人类巨细胞病毒感染 单细胞RNA测序, 抗体衍生标签 NA 单细胞转录组数据, 抗体衍生标签数据 健康捐赠者的肝脏正弦γδ T细胞样本,具体数量未指定 NA 单细胞RNA测序, 抗体衍生标签 NA NA
1571 2026-10-03
Dual blockade of PD-1 and NKG2A prevents NK cell senescence and reprograms the immunosuppressive microenvironment in pancreatic cancer
2026-Jul-28, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 该研究发现PD-1和NKG2A双重阻断可防止NK细胞衰老并重塑胰腺癌的免疫抑制微环境 首次揭示ICB诱导的IFN-γ信号通过H2-T23/NKG2A轴激活p38 MAPK和STAT1/3通路诱导NK细胞衰老,并证明PD-1和NKG2A双重阻断可恢复NK细胞功能,通过NK细胞依赖性CCL5促进CD8 T细胞招募,激活先天和适应性免疫 未明确说明 探究ICB在PDAC中疗效有限的机制,并寻找克服免疫治疗耐药的新策略 胰腺导管腺癌(PDAC)肿瘤细胞和NK细胞 肿瘤免疫学 胰腺癌 单细胞测序 NA 单细胞测序数据 九种癌症类型的单细胞测序数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1572 2026-10-03
CCR7-PERK-CREB3L1 signaling mediates tumor-associated macrophages-derived SPP1 promotion of oral squamous cell carcinoma
2026-07-20, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本文研究了CCR7在肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)中的免疫调节作用及其通过PERK-CREB3L1信号通路调控SPP1表达,进而促进口腔鳞状细胞癌(OSCC)进展的机制 首次揭示了TAMs中CCR7通过PERK-CREB3L1信号轴调控SPP1表达从而促进OSCC恶性表型的新机制,并证明靶向CCR7-CREB3L1轴可能成为OSCC的潜在治疗策略 摘要中未明确提及研究局限性 探究CCR7在肿瘤相关巨噬细胞中的免疫功能及其对口腔鳞状细胞癌进展的贡献 CCR7缺陷(Ccr7)OSCC小鼠模型、肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)、口腔鳞状细胞癌细胞 肿瘤免疫学 口腔鳞状细胞癌 单细胞RNA测序 NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1573 2026-10-03
Developmental and transcriptional programs that define the initiation of the forelimb
2026-07-15, Development (Cambridge, England)
研究论文 该研究通过多种高通量测序技术定义了小鼠胚胎前肢起始的四个阶段,并鉴定了前肢早期特征基因 首次定义了前肢起始的四个不同阶段,并发现了一组富含TBX5结合位点的早期转录靶基因,可能参与神经投射和细胞粘附 研究主要基于小鼠胚胎,结果是否适用于其他脊椎动物尚需验证 探究脊椎动物前肢起始的分子机制和早期转录程序 小鼠胚胎的前肢发育过程 发育生物学 NA RNA-seq, scRNA-seq, ChIP-seq, Ribo-ITP NA 测序数据 NA NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, ChIP-seq, Ribo-ITP NA NA
1574 2026-10-03
Antigen-specific type 1 regulatory T cell responses shape immunity and disease tolerance in human malaria
2026-07-15, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
评论 本文评论了Nideffer等人在《临床研究杂志》上发表的研究,该研究揭示了儿童恶性疟原虫感染期间人类1型调节性T细胞的表型特征和功能作用 提出Tr1细胞可通过CD127下调和CXCR6表达的组合进行更准确的鉴定,而非依赖其他表面标志物,并利用单细胞转录组学建立了更严格的标志物验证框架 作为评论文章,未提供原始实验数据,所讨论的研究仅限于儿童恶性疟原虫感染场景,结论的普适性有待进一步验证 深入理解人类1型调节性T细胞的表型定义及其在人类疾病中的作用,特别是在儿童疟疾感染中的免疫功能 儿童恶性疟原虫感染患者中的疟疾特异性CD4+ T细胞及1型调节性T细胞 免疫学 疟疾 单细胞转录组学 NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1575 2026-10-03
Gut microbe-derived short-chain fatty acids regulate alphavirus arthritis and macrophage activation in mice
2026-07-15, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本文利用小鼠模型研究肠道微生物来源的短链脂肪酸如何调控甲病毒诱导的关节炎和巨噬细胞活化 揭示了肠道微生物代谢物短链脂肪酸通过TLR4/MyD88信号通路和免疫细胞调控甲病毒关节炎的新机制 研究仅基于小鼠模型,尚未在人类中验证;具体微生物种类和SCFA类型的作用机制需进一步探索 探究肠道共生菌、代谢物和宿主免疫机制在促进肌肉骨骼炎症中的作用 小鼠模型、基孔肯雅病毒和Mayaro病毒感染的关节炎模型 免疫学、微生物组学 关节炎、病毒感染 单细胞RNA测序、抗生素处理、微生物定植 小鼠模型 基因表达数据、临床评分数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
1576 2026-10-03
Spatial transcriptomic profiling reveals molecular signatures of endocapillary hypercellularity in IgA nephropathy
2026-Jul-06, BMC nephrology IF:2.2Q2
研究论文 该研究利用GeoMx DSP空间转录组平台分析东亚IgA肾病患者肾活检标本,比较正常、E0和E1组之间的基因表达谱差异 首次利用空间转录组技术揭示IgA肾病中毛细血管内皮细胞增生(E1病变)的分子特征,发现淀粉样前体蛋白、CD47和整合素αV等基因的新下调现象 样本仅来自东亚人群,样本量相对有限,未进行独立队列验证 探究IgA肾病中毛细血管内皮细胞增生(E0和E1)的分子基础 东亚IgA肾病患者的肾活检标本 空间转录组学 IgA肾病 空间转录组学 NA 空间转录组数据 未明确说明具体样本数量 NanoString 空间转录组学 GeoMx DSP GeoMx数字空间分析平台
1577 2026-10-03
O-GlcNAc transferase governs spermatogenic mitotic-to-meiotic transition and progression by coordinating transcription and alternative splicing programs
2026-Jul-03, Cellular & molecular biology letters IF:9.2Q1
研究论文 本研究通过构建生殖细胞特异性Ogt敲除小鼠模型,结合IP-MS、bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq,揭示OGT介导的O-GlcNAc修饰通过协调转录和可变剪接程序调控精子发生的减数分裂转变与进程 首次系统揭示OGT及O-GlcNAc修饰在哺乳动物精子发生中的功能机制,发现OGT可O-GlcNAc修饰转录因子(如HCFC1)和剪接调控因子(如SRSF1和SF3B3),并证明其通过协调转录和可变剪接程序调控有丝分裂-减数分裂转变 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类中验证;IP-MS鉴定的O-GlcNAc底物可能不全面;具体位点及修饰动态变化未深入解析 阐明OGT在精子发生和雄性生育中的功能机制 小鼠睾丸生殖细胞(精原细胞和早期精母细胞) 机器学习 NA 免疫共沉淀-质谱(IP-MS)、bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq NA 文本、图像 幼年小鼠睾丸样本及Ogt条件性敲除小鼠模型 10x Genomics, Illumina single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq 10x Chromium, Illumina NovaSeq NA
1578 2026-10-03
Intragraft clonal expansion of cytotoxic CD8+ and CD4+ T cells in antibody-mediated kidney transplant rejection
2026-07, Kidney international IF:14.8Q1
研究论文 该研究通过分析肾移植活检的多组学数据,揭示了抗体介导排斥反应(AMR)中存在克隆扩增的细胞毒性CD4+和CD8+ T细胞 首次在抗体介导排斥反应中证明了克隆扩增的细胞毒性CD4+和CD8+ T细胞的存在,挑战了AMR与T细胞介导排斥反应(TCMR)之间的传统二分法 AMR活检样本量较小(仅4例),需要更大规模的验证研究来确认这些发现 探索抗体介导排斥反应中T细胞的参与及其克隆性 肾移植活检样本(包括AMR/MVI、无排斥反应和TCMR病例) 数字病理学 肾脏疾病 批量转录组学、单细胞RNA/TCR测序、多重免疫染色、空间蛋白质组学 无监督聚类 转录组数据、单细胞测序数据、图像数据 192例批量转录组学、16例单细胞RNA/TCR测序、18例和75例多重免疫染色 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, single-cell TCR-seq, 空间转录组学 NA NA
1579 2026-10-03
R4ST: a reference-guided graph-generative model for robust reconstruction of spatial transcriptomic profiles
2026-07-01, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 提出R4ST框架,利用scRNA-seq作为参考,通过图归纳和直推式双学习通道重建空间转录组中缺失的基因表达 采用双学习通道(图归纳与直推式建模)捕获互补的空间拓扑信息,实现从少量测得基因准确恢复大规模基因表达谱 摘要中未明确提及 解决空间转录组技术中空间粒度与转录组覆盖度之间的权衡导致的表达谱稀疏和不完整问题 空间转录组数据和scRNA-seq参考数据 空间转录组学 NA 空间转录组测序, 单细胞RNA测序 图生成模型, 图归纳学习, 直推式学习 基因表达谱, 空间拓扑数据 NA NA 空间转录组学, 单细胞RNA-seq NA NA
1580 2026-10-03
Mapping the evolutionary landscape of intestinal organoids: from self-organization biology to precision medicine
2026-06-24, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1
综述 该文章通过文献计量学分析,系统梳理了1986年至2025年肠道类器官研究的全球发展格局与演化轨迹 首次对肠道类器官领域进行全面的文献计量学分析,揭示了从干细胞分化与培养优化到疾病建模、再到器官芯片、力生物学和单细胞测序的范式转变 仅基于Web of Science核心合集数据,可能存在文献覆盖偏倚,且文献计量分析无法深入评估具体研究的技术细节与生物学机制 绘制肠道类器官研究的演化 landscape,识别研究热点与趋势,为未来研究方向提供导航 1986年至2025年间发表的肠道类器官相关文献 机器学习 结直肠癌 文献计量学分析 NA 文本 来自Web of Science核心合集的肠道类器官相关文献 NA NA NA 使用VOSviewer和bibliometrix工具进行文献计量分析
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