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当前共找到 43167 篇文献,本页显示第 1541 - 1560 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1541 2026-08-23
Integrating machine learning and multi-omics analysis to identify and validate key genes associated with periodontitis
2026-Aug-19, Acta odontologica Scandinavica IF:1.4Q3
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序、孟德尔随机化及机器学习方法,识别并验证了与牙周炎相关的关键基因作为潜在诊断生物标志物 首次结合单细胞RNA测序、孟德尔随机化和多种机器学习算法组合,识别出四种新的牙周炎亚型,并验证了IGFBP4、IL1B和LAPTM5作为诊断生物标志物的潜力 样本量有限(仅13例III/IV期牙周炎患者和健康对照),并且实验验证仅限于RT-qPCR,缺乏更大规模的临床验证 通过多组学分析识别牙周炎的诊断生物标志物,以促进早期检测和干预 牙周炎患者和健康对照的牙龈组织 机器学习 牙周炎 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, RT-qPCR 随机森林, 套索回归, 岭回归, 弹性网络, 支持向量机, 梯度提升机, XGBoost, 朴素贝叶斯 基因表达数据(单细胞和批量RNA-seq), 遗传变异数据 13例III/IV期牙周炎患者和健康对照的牙龈组织 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA 使用了GEO数据集GSE164241(单细胞)、GSE10334、GSE16134、GSE23586、GSE106090(批量)
1542 2026-08-23
Fzd7 Restrains Pink1-Dependent Mitophagy in Suture Stem Cells to Maintain Cranial Suture Patency
2026-Aug-19, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究结合单细胞RNA测序和Visium HD空间转录组学,揭示了Fzd7通过调控Pink1依赖性线粒体自噬维持颅缝间充质干细胞(SuSC)功能及颅缝通畅性的机制 首次将单细胞RNA-seq与2µm Visium HD空间转录组学结合,在Fgfr2小鼠模型中解析了SuSC的时空变化,并发现了Fzd7-Pink1线粒体自噬轴在颅缝通畅性维持中的新作用 研究基于小鼠模型,可能不完全代表人类颅缝早闭的复杂性,且未深入探讨Fzd7下游其他信号通路 阐明SuSC功能障碍在颅缝早闭中的作用,特别是Fzd7和Pink1介导的线粒体自噬在维持颅缝通畅中的机制 Fgfr2小鼠模型中的Prrx1阳性颅缝间充质干细胞(SuSC) 分子生物学 颅缝早闭 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 基因表达数据, 空间转录组数据 未明确说明样本数量 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium HD 2µm Visium HD空间转录组学
1543 2026-08-23
Integrated multi-omics strategy for screening novel protective antigens against Brucella melitensis and analysis of their immunogenicity
2026-Aug-19, Brazilian journal of microbiology : [publication of the Brazilian Society for Microbiology] IF:2.1Q3
research paper 本研究利用多组学整合策略筛选布鲁氏菌新保护性抗原,并分析其免疫原性,为开发安全有效的亚单位疫苗提供基础 通过整合单细胞转录组测序、全基因组扫描和泛基因组分析,筛选出在强毒株中保守且仅存在于强毒株中的膜/分泌蛋白作为候选抗原,其中BMEI1943展现出强Th1型免疫原性 摘要未提供明确的局限性信息 筛选针对羊种布鲁氏菌的新型保护性抗原,并评估其免疫原性,以开发更安全的亚单位疫苗 布鲁氏菌羊种M16、544 A、M5、104 M菌株,以及C57BL/6J小鼠 微生物学、免疫学 布鲁氏菌病 单细胞转录组测序、第二代测序、泛基因组分析、原核表达系统、间接ELISA、流式细胞术 NA 单细胞转录组数据、基因组序列数据、免疫学实验数据 45,231个细胞(12种免疫细胞亚群),4株布鲁氏菌,若干小鼠 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Genomics Chromium 10x Genomics单细胞转录组测序平台
1544 2026-08-23
NOX2 deficiency exacerbates lupus nephritis through activation of NLRP3 inflammasome in neutrophils
2026-Aug-19, Journal of biomedical science IF:9.0Q1
研究论文 本研究探讨NOX2缺陷如何通过中性粒细胞中NLRP3炎症小体的激活加剧狼疮性肾炎,并评估IL-1受体拮抗剂的治疗潜力 首次揭示NOX2衍生ROS作为NLRP3炎症小体负调控因子在狼疮性肾炎中的作用,并提出IL-1β阻断作为针对ROS产生受损患者的精准治疗策略 未提供明确的局限性声明 阐明NOX2衍生ROS在狼疮性肾炎发病机制中的作用,并识别潜在治疗靶点 NOX2缺陷(Ncf1-/-)小鼠和野生型对照小鼠 免疫学 狼疮性肾炎 单细胞RNA测序、流式细胞术、转录组分析 NA 基因表达数据 小鼠模型(具体数量未提及) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序
1545 2026-08-23
Macrophage Lipid Homeostasis Drives IVDD via a Senescence-Dependent Impairment of Efferocytosis
2026-Aug-19, Cell proliferation IF:5.9Q2
研究论文 本研究探讨巨噬细胞脂质稳态通过衰老依赖性胞葬功能受损推动椎间盘退变的机制 首次将巨噬细胞脂质代谢与衰老及胞葬功能联系起来,揭示脂质过载通过p53/p21衰老通路导致椎间盘退变,并发现瑞舒伐他汀可通过恢复脂质稳态改善退变 研究主要基于动物模型和体外实验,临床样本量可能有限,具体机制仍需进一步验证 阐明巨噬细胞脂质处理紊乱如何通过衰老和胞葬功能障碍促进椎间盘退变,并评估瑞舒伐他汀的治疗潜力 椎间盘退变相关的巨噬细胞、骨髓来源巨噬细胞、大鼠针刺模型及临床椎间盘样本 数字病理学 椎间盘退变 单细胞RNA测序、批量转录组学、孟德尔随机化、机器学习建模、磁共振成像 机器学习模型 图像、转录组数据、单细胞数据 临床样本及大鼠模型(未提供具体样本量) NA 单细胞RNA测序 NA NA
1546 2026-08-23
POSTN⁺ CAF-SPP1⁺ macrophage crosstalk is associated with immune exclusion and poor prognosis in lung adenocarcinoma
2026-Aug-19, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 该研究通过整合多种测序和功能实验,揭示了肺腺癌中POSTN⁺癌症相关成纤维细胞与SPP1⁺巨噬细胞的相互作用与免疫排斥及不良预后相关 首次在肺腺癌中通过多组学整合分析揭示了POSTN⁺ CAF与SPP1⁺巨噬细胞的空间共定位及其与免疫排斥的关联,并鉴定出SPP1-CD44信号轴和CAF来源的C3反馈环路 研究主要基于体外实验和公共数据集,缺乏体内验证;免疫治疗反应的探索性分析样本量有限,需进一步验证 阐明肺腺癌中肿瘤微环境的基质-免疫细胞相互作用机制,特别是成纤维细胞与巨噬细胞的串扰及其对免疫排斥和预后的影响 肺腺癌肿瘤微环境中的POSTN⁺癌症相关成纤维细胞和SPP1⁺巨噬细胞 数字病理学, 机器学习 肺腺癌 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫荧光, 体外功能实验 NA 基因表达数据, 空间转录组数据, 免疫荧光图像, 体外实验数据 未明确说明样本数量,但涉及肺腺癌组织样本及公共数据集 NA 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
1547 2026-08-23
The miRNA-virus axis in RNA virus infections: Mechanisms, therapeutic targeting, and systems biology approaches
2026-Aug-17, Microbial pathogenesis IF:3.3Q2
综述 本文全面综述了RNA病毒感染中的miRNA-病毒轴,涵盖其机制、治疗靶向和系统生物学方法 提出超越传统抗病毒-促病毒二分法的miRNA功能分类,并建立将miRNA功能分类与靶向抗病毒干预相连接的治疗决策框架 讨论递送效率、组织特异性和脱靶效应等关键挑战,但未提供具体实验验证 重新解读miRNA-病毒轴作为动态调控网络,并为下一代抗病毒疗法提供转化框架 RNA病毒感染中的宿主miRNA及其与病毒的相互作用 系统生物学 病毒感染相关疾病 多组学整合、单细胞和空间转录组学、网络分析、人工智能 NA 文献数据 NA NA 单细胞和空间转录组学 NA NA
1548 2026-08-23
Accurate prediction in reconstructed spatial transcriptomes does not ensure valid biological discovery
2026-Aug-10, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文引入TIDEST框架,用于对重建的空间转录组进行统计有效的推断,通过校准重建表达和调整潜在空间变异,控制假发现并改善生物学解释 提出TIDEST框架,首次在重建空间转录组中系统处理预测误差和潜在空间变异的统计推断问题,确保差异表达分析的统计有效性 未明确提及,但可能依赖于模拟和特定组织数据集的验证,实际应用的广泛性有待进一步探索 开发统计有效的推断方法,以确保重建空间转录组中生物学发现的可靠性 重建的空间转录组数据,涉及小鼠和人类大脑、胶质母细胞瘤和乳腺癌样本 计算生物学、空间转录组学 胶质母细胞瘤、乳腺癌 空间转录组学、单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 未提供具体数量,但包括多种组织和疾病样本 NA 空间转录组学、单细胞RNA-seq NA NA
1549 2026-08-23
Decoding Leukocyte Dynamics: Functional Biomarkers and Precision Diagnostics in Parasitic Infections
2026-Aug-10, Acta parasitologica IF:1.2Q2
综述 本文综述了白细胞功能动态在寄生虫感染诊断和预后中的应用,提出“精准寄生虫学”框架。 整合白细胞功能动态(转录、代谢、空间特征)与人工智能驱动的流式细胞术和空间转录组学,提出超越病原体中心方法的“精准寄生虫学”概念。 未提及具体限制。 探讨白细胞功能动态如何革新寄生虫病的诊断精度、预后分层和治疗开发。 白细胞(粒细胞、单核细胞、嗜酸性粒细胞、B细胞等)在寄生虫感染中的作用。 机器学习 寄生虫感染(疟疾、利什曼病、血吸虫病、恰加斯病) 单细胞多组学、空间转录组学、人工智能流式细胞术、基于CRISPR的功能基因组学 NA 基因表达数据、细胞影像、临床数据 NA NA 单细胞多组学, 空间转录组学 NA NA
1550 2026-08-23
Transforming subcellular spatial transcriptomics: deep learning models for cell segmentation
2026-Aug-10, Nucleic acids research IF:16.6Q1
综述 本文综述了深度学习模型在亚细胞空间转录组学中细胞分割的应用,重点讨论了全卷积神经网络、基于Transformer的模型和基础模型的架构创新、性能特征和实际局限性 系统比较了不同深度学习架构在细胞分割中的泛化能力和再训练需求,并预测了未来方法的发展趋势 基于Transformer和基础模型的采用受限于大数据需求和高计算成本 探讨如何利用深度学习实现更准确的转录本到细胞的映射,以推动亚细胞空间转录组学的定量分析 亚细胞空间转录组学中的细胞分割算法和深度学习模型 计算生物学 NA 空间转录组学 全卷积神经网络、Transformer模型、基础模型 亚细胞空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
1551 2026-08-23
Rapid discovery of monoclonal antibodies via high-throughput single BCR affinity sequencing
2026-Aug-10, Nucleic acids research IF:16.6Q1
research paper 提出一种高通量单细胞测序平台AAB-seq,可同时获取数千对配对BCR序列的抗体-抗原相对亲和力 通过双标记抗原和DNA条形码抗轻链抗体计算AAB评分,无需从头合成抗体基因,直接克隆并实现亲和力引导的抗体筛选 摘要中未提及明显局限 加速单克隆抗体发现,提供大规模序列-亲和力数据集以支持机器学习驱动的治疗性抗体设计 小鼠来源的抗体,针对卵清蛋白和SARS-COV-2 RBD的特异性抗体 单细胞测序、抗体发现、机器学习 传染病(COVID-19) 单细胞BCR测序 NA 序列数据(BCR序列)和亲和力数据 数千个配对的B细胞受体序列 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1552 2026-08-23
Nuclear localized p70S6K maintain cancer stem-like properties by modulating RPA3 activity in osteosarcoma
2026-Aug-07, Cellular signalling IF:4.4Q2
研究论文 本研究揭示了核定位p70S6K通过与RPA3相互作用调节其单链DNA结合活性,促进骨肉瘤细胞获得癌症干细胞特性,并提出了核p70S6K-RPA3通路作为骨肉瘤治疗的新靶点 首次发现核定位p70S6K在癌症干细胞维持中的新功能,并阐明其通过调控RPA3活性的机制;通过单细胞转录组学分析识别RPA3在骨肉瘤CSCs亚群中的高表达 摘要未提及具体局限性,可能包括样本量有限或机制研究主要基于体外实验 探究核定位p70S6K在骨肉瘤癌症干细胞特性维持中的作用及潜在治疗价值 骨肉瘤细胞及其癌症干细胞亚群 数字病理学 骨肉瘤 单细胞转录组学 NA 单细胞转录组数据,图像(细胞) 未提供具体样本数量,涉及骨肉瘤细胞系和CSCs亚群 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1553 2026-08-23
Targeting cancer-intrinsic protein neddylation bypasses the loss of JAK/STAT signaling and overcomes acquired resistance to immunotherapy
2026-Aug-06, Research square
研究论文 本研究通过患者来源的JAK2缺陷黑色素瘤细胞系建立共培养系统,发现靶向蛋白类泛素化修饰可绕过JAK/STAT信号缺失,恢复对PD1阻断的敏感性,克服免疫治疗获得性耐药 首次揭示蛋白类泛素化修饰缺失可通过稳定染色质结合的cGAS增强癌细胞内在炎症信号,进而招募促炎固有免疫细胞,克服免疫治疗耐药 摘要未提及具体局限性 探索克服癌症免疫治疗获得性耐药的新靶点和方法 JAK2缺陷黑色素瘤细胞系、MHC-I和/或JAK/STAT缺陷小鼠肿瘤、黑色素瘤患者肿瘤样本 癌症免疫治疗 黑色素瘤 全基因组遗传筛选、单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据、基因筛选数据 一个患者来源的JAK2缺陷黑色素瘤细胞系、多种小鼠肿瘤模型、患者肿瘤样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 用于单细胞RNA测序的10x Chromium系统
1554 2026-08-23
Tumor Treating Fields (TTFields) sensitize anti-PD1-resistant lung tumors to PD1 blockade and remodel myeloid and lymphoid states
2026-Aug-06, Research square
研究论文 研究肿瘤治疗电场(TTFields)对耐抗PD1肺癌的增敏作用,并揭示其通过重塑免疫微环境克服免疫检查点阻断耐药性的机制 首次证明TTFields能够使抗PD1耐药的肺癌对PD1阻断治疗重新敏感,并通过单细胞RNA测序揭示其对髓系和淋巴系免疫状态的协同重塑作用 基于小鼠模型,临床转化仍需进一步验证 探究TTFields是否以及如何克服免疫检查点阻断耐药性,增强抗PD1治疗对肺癌的疗效 抗PD1耐药的344SQR小鼠肺腺癌细胞及其同基因肿瘤模型 免疫肿瘤学 肺癌 单细胞RNA测序、T细胞受体克隆型分析 小鼠肿瘤模型 基因表达数据、T细胞受体序列数据、肿瘤生长和转移数据 小鼠肿瘤样本(具体数量未提供) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
1555 2026-08-23
Multi-Omics Analysis for Pathogenesis and Candidate Therapeutic Target in Thoracic Aortic Aneurysms
2026-08-04, Journal of the American Heart Association IF:5.0Q1
研究论文 本研究通过整合孟德尔随机化、多组学分析和体外实验,确定LTBP4为胸主动脉瘤的候选治疗靶点,并揭示其在TGF-β信号通路中的作用机制 创新性地将孟德尔随机化与多组学分析及体外实验相结合,从循环蛋白质组、转录组和单细胞水平全面解析胸主动脉瘤的发病机制,并识别出新的治疗靶点LTBP4 未提供明确的局限性信息 识别胸主动脉瘤的药物治疗靶点并理解其致病机制 胸主动脉瘤患者及主动脉组织样本 基因组学 胸主动脉瘤 蛋白质组学、转录组学、单细胞测序、孟德尔随机化、Western blot、免疫荧光染色 NA 蛋白质定量数据、转录组数据、单细胞测序数据、主动脉组织图像 大规模蛋白质pQTL研究涉及35,559名冰岛人;结果数据来自FinnGen研究和UK Biobank数据库;血浆转录组和单细胞测序样本数未明确;体外实验使用主动脉组织 NA 蛋白质组学、转录组学、单细胞测序 NA NA
1556 2026-08-23
Cellular Retinoic Acid-Binding Protein 2 Promotes Ischemia-Induced Cardiac Fibroblast Activation and Fibrosis Through Suppression of MRE11-RAD50-NBS1-Mediated DNA Repair
2026-08-04, Journal of the American Heart Association IF:5.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和动物模型,发现CRABP2通过抑制MRE11-MRN介导的DNA修复促进心脏成纤维细胞活化和纤维化,并鉴定CRABP2-MRE11-MRN轴作为潜在治疗靶点 首次揭示CRABP2通过直接结合MRE11抑制DNA修复通路来驱动促纤维化成纤维细胞活化,并验证了CRABP2-MRE11-MRN轴作为治疗靶点的潜力 本研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本验证有限,且未探讨CRABP2在其他心脏病类型中的作用 探究缺血性心力衰竭中DNA损伤反应与促纤维化重塑之间的上游调控机制,特别是CRABP2在心脏成纤维细胞活化中的作用 人类缺血性心肌病心脏组织中的成纤维细胞亚群,以及异丙肾上腺素诱导的小鼠心脏纤维化模型中的心肌成纤维细胞 心血管生物学 缺血性心力衰竭 单细胞RNA测序, RNA测序, 免疫沉淀-质谱, 彗星实验 NA 基因表达数据, 蛋白质互作数据, 影像数据 人类缺血性心肌病样本(具体数量未提供),小鼠模型(具体数量未提供) NA 单细胞RNA测序 NA NA
1557 2026-08-23
Progressive deterioration of adaptive immune repertoires in Down syndrome linked to interferon hyperactivity and lymphoid tissue disorganization
2026-Aug-04, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过多模式分析,揭示了唐氏综合征中适应性免疫库随年龄的进行性恶化,并与干扰素过度活跃和淋巴组织紊乱相关 首次整合质谱流式、转录组、蛋白质组、BCR/TCR测序及空间转录组学,全面描绘唐氏综合征适应性免疫随发育和衰老的动态变化,并指出干扰素信号作为治疗靶点 未提供明确的局限性说明,可能样本数量和临床干预效果验证不足 阐明三体21号染色体如何导致适应性免疫失调及其随年龄变化的机制,并探索潜在治疗干预点 唐氏综合征患者的B细胞、T细胞、免疫球蛋白库、TCR库及扁桃体组织 免疫组学, 空间转录组学 唐氏综合征 质谱流式, BCR测序, TCR测序, 空间转录组学, 转录组学, 蛋白质组学 NA 单细胞蛋白质表达数据, 免疫受体序列数据, 空间基因表达数据 涵盖不同年龄段唐氏综合征患者及对照的样本 10x Genomics, Illumina 空间转录组学, BCR/TCR测序 10x Visium, Illumina NovaSeq NA
1558 2026-08-23
Ascl1 Represses Müller Glial and Promotes Rod Photoreceptor Fate Through Repressing Notch Signaling in Late Retinal Progenitor Cells
2026-08-03, Investigative ophthalmology & visual science IF:5.0Q1
研究论文 本研究通过小鼠视网膜晚期祖细胞模型,揭示了Ascl1通过抑制Notch信号通路促进视杆光感受器命运并抑制Müller胶质细胞命运,阐明了其调控视网膜发育的分子机制。 首次利用整合RNA-seq、scRNA-seq、ATAC-seq和ChIP-seq分析,阐明Ascl1在晚期视网膜祖细胞中通过结合并开放基因组区域,抑制Notch信号通路并激活神经发生基因,从而促进视杆光感受器命运的决定机制。 研究主要基于小鼠模型,且对Ascl1介导的成人Müller胶质细胞重编程效率与特异性的影响未直接验证。 探究Ascl1在晚期视网膜祖细胞中调控视网膜命运决定的功能及分子机制。 小鼠视网膜晚期祖细胞(RPCs) 分子生物学 NA RNA-seq, scRNA-seq, ATAC-seq, ChIP-seq, 免疫荧光染色, 体内电穿孔 转录因子过表达模型 转录组和表观基因组数据 未明确样本数量(可能涉及多个小鼠视网膜样本) NA RNA-seq, scRNA-seq, ATAC-seq, ChIP-seq NA NA
1559 2026-08-23
SLC25A12 mitigates mitochondrial dysfunction in myoblast senescence, and alleviates cuproptosis-related changes under copper stress
2026-Aug-03, Biology direct IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过多组学整合分析识别SLC25A12为肌肉减少症的核心线粒体相关生物标志物,并验证其在成肌细胞衰老和铜应激下的保护作用 首次将SLC25A12与肌肉减少症和铜死亡联系起来,并结合单细胞RNA测序和Geneformer模型进行计算机模拟扰动分析 主要基于体外细胞模型和小鼠验证,缺乏人体临床试验证据 识别肌肉减少症的线粒体相关生物标志物并评估其潜在治疗靶点 人转录组数据集、自然衰老小鼠、C2C12成肌细胞、肌肉卫星细胞 机器学习 骨骼肌衰老 转录组测序、单细胞RNA测序 Geneformer 转录组数据、单细胞转录组数据、细胞图像 人类队列(具体数量未提及)和24月龄自然衰老小鼠,以及C2C12细胞系 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1560 2026-08-23
Single-cell and spatial transcriptomics analysis of osteoarthritis: pathway regulation, cell interaction networks, and therapeutic translation
2026-Aug-03, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
综述 本综述综合评述了单细胞RNA测序和空间转录组学在骨关节炎研究中的应用,重点探讨了通路调控、细胞互作网络及治疗转化 首次系统整合scRNA-seq和ST技术,揭示骨关节炎中细胞状态特异性疾病驱动因子及跨组织通讯枢纽,如滑膜-软骨轴和神经-免疫-血管三联体,并提出新型ECM-线粒体-力学轴 尽管技术先进,但整合分析仍面临计算方法和数据解释的挑战,且单细胞和空间数据在临床转化上的应用尚处于早期阶段 阐明单细胞和空间转录组学如何重新定义骨关节炎的病理机制,并推动新治疗靶点和生物标志物的发现 骨关节炎相关的滑膜、软骨、软骨下骨和髌下脂肪垫中的细胞群体 数字病理学 骨关节炎 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 单细胞转录组和空间转录组数据 不适用(综述文章,未涉及具体样本) NA 单细胞RNA-seq、空间转录组学 NA NA
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