单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 38047 篇文献,本页显示第 1501 - 1520 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1501 2026-03-16
Elucidating the mechanistic association of xylene inducing non-small cell lung cancer through network toxicology and molecular docking analysis
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究结合网络毒理学和分子对接分析,探讨二甲苯暴露与非小细胞肺癌(NSCLC)发生之间的潜在分子机制 首次整合网络毒理学、分子对接与单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据,系统揭示二甲苯异构体通过影响核心靶点基因(IL1A、H3C13、ITGAM、CCR5、COMT)及相关信号通路(如PI3K-Akt)促进NSCLC发展的分子机制 研究主要基于生物信息学分析和体外分子对接模拟,缺乏体内实验或临床样本验证,且二甲苯暴露剂量与基因表达变化的定量关系尚未明确 阐明环境二甲苯暴露与非小细胞肺癌(NSCLC)发生之间的分子关联机制 二甲苯异构体(邻二甲苯、间二甲苯、对二甲苯)及其潜在作用靶点基因与信号通路 计算毒理学 肺癌 网络毒理学分析、分子对接模拟、单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据分析 分子对接模型、蛋白-配体相互作用模型 基因表达数据、蛋白质结构数据、化合物-靶点相互作用数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1502 2026-03-16
From genes to diagnosis: The impact of UNC5B and DOK5 in intracranial aneurysm detection and pathogenesis
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究通过整合机器学习、免疫浸润分析和单基因测序,探讨UNC5B和DOK5基因在颅内动脉瘤检测和发病机制中的作用 首次结合机器学习算法(LASSO、随机森林、SVM-RFE)识别UNC5B和DOK5作为颅内动脉瘤的潜在诊断生物标志物,并通过免疫细胞浸润和单细胞测序分析揭示其与M1巨噬细胞和成纤维细胞的关联 研究基于微阵列数据,样本来源和数量未明确说明,可能影响结果的普遍性;外部验证数据集的具体细节未详细描述 识别颅内动脉瘤的诊断和治疗相关基因,并阐明其发病机制 颅内动脉瘤患者和健康对照的基因表达数据 机器学习 颅内动脉瘤 单基因测序、微阵列分析 LASSO、随机森林、SVM-RFE 基因表达数据 NA NA 单基因测序 NA NA
1503 2026-03-16
Single-Cell RNA Sequencing Study on Two Synovial Derived Tumors in the Temporomandibular Joint
2025-Dec, Oral diseases IF:2.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,探讨了颞下颌关节滑膜软骨瘤病和弥漫性腱鞘巨细胞肿瘤的细胞组成、分化轨迹及细胞间通讯 首次在颞下颌关节滑膜来源肿瘤中应用单细胞RNA测序技术,揭示了滑膜成纤维样细胞作为共同起源,并通过COMP/TGFβ/SMAD信号通路促进软骨分化的新机制 样本量较小,仅针对颞下颌关节特定肿瘤,可能限制了结果的普适性 研究颞下颌关节滑膜软骨瘤病和弥漫性腱鞘巨细胞肿瘤的细胞组成与分化轨迹 颞下颌关节滑膜软骨瘤病和弥漫性腱鞘巨细胞肿瘤的组织样本 单细胞测序 滑膜来源肿瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 未明确指定样本数量,但涉及两种颞下颌关节肿瘤的组织样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1504 2026-03-16
Early-life gut microbiome maturity regulates blood-brain barrier and cognitive development
2025-Dec, Gut microbes IF:12.2Q1
研究论文 本研究探讨了早期肠道微生物组的成熟度如何通过影响血脑屏障完整性和大脑转录程序来调节认知发育 首次通过将无菌孕鼠定植人类足月或早产婴儿肠道微生物,建立了微生物组成熟度与血脑屏障完整性及认知功能发育的直接因果关系 研究基于小鼠模型,人类相关性需进一步验证;微生物组影响的具体分子机制尚未完全阐明 探究早期肠道微生物组成熟度对血脑屏障发育和认知功能的影响机制 无菌孕鼠及其后代(定植人类足月或早产婴儿肠道微生物) 微生物组学与神经发育 神经发育障碍 单细胞RNA测序、宏基因组学、代谢组学 动物模型(小鼠) 基因表达数据、微生物组数据、代谢物数据 无菌孕鼠及其后代(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA测序、宏基因组学、代谢组学 NA NA
1505 2026-03-16
Distinct stromal cell populations define the B-cell acute lymphoblastic leukemia microenvironment
2025-Nov, Leukemia IF:12.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析,揭示了B细胞急性淋巴细胞白血病(B-ALL)骨髓微环境中两种不同的间充质基质细胞群及其功能 首次在B-ALL患者中鉴定出早期间充质祖细胞和成脂祖细胞两种不同的基质细胞群,并发现成脂祖细胞通过IL-7和VCAM1信号支持白血病细胞 研究样本主要来自儿科患者,可能无法完全代表成人B-ALL的微环境特征 解析B-ALL骨髓微环境的细胞异质性及其在白血病进展中的作用 儿科B-ALL患者的骨髓抽吸物和骨活检样本 数字病理学 白血病 单细胞RNA测序, 空间转录组学分析 NA RNA测序数据, 空间转录组数据 儿科B-ALL患者的骨髓抽吸物和骨活检样本 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
1506 2026-03-16
Psychological stress and social support are associated with opposing single-cell pro-inflammatory gene regulatory mechanisms in adults
2025-Oct-15, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和染色质可及性分析,探讨了心理压力和社会支持对成年人外周血单个核细胞中促炎基因调控机制的影响 首次在单细胞水平上揭示了心理压力和社会支持如何通过不同的转录因子调控机制影响免疫基因表达,特别是干扰素信号通路 研究样本仅限于165名非裔美国成年人,年龄范围较窄(50-89岁),可能限制了结果的普适性 探究心理压力和社会支持如何通过分子机制调节免疫系统的炎症反应 165名自我报告的非裔美国成年人(年龄50-89岁)的外周血单个核细胞 单细胞组学 炎症相关疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq),单细胞染色质可及性测序(scATAC-seq) NA 单细胞转录组数据,单细胞表观基因组数据 165名成年人 NA 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq NA NA
1507 2026-03-16
Loss of BAP1 defines a unique subtype of TP53-mutated de novo AML and confers sensitivity to BCL-xL inhibitors
2025-Sep-18, Blood IF:21.0Q1
研究论文 本文发现BAP1缺失与TP53突变在急性髓系白血病中共存,定义了独特的亚型,并揭示了其对BCL-xL抑制剂的敏感性 首次揭示BAP1缺失与TP53突变在AML中的协同作用,定义了新的白血病亚型,并发现其依赖BCL2L1表达,对BCL-xL抑制剂敏感 研究主要基于小鼠模型和有限的患者样本,人类疾病异质性可能未被完全捕捉 探究与TP53缺陷协同促进红细胞白血病转化的遗传改变 TP53突变的急性髓系白血病患者及小鼠模型 NA 急性髓系白血病 单细胞RNA测序, 染色质免疫沉淀测序 NA 基因表达数据, 表观遗传数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
1508 2026-03-16
CD81+ senescent-like fibroblasts exaggerate inflammation and activate neutrophils via C3/C3aR1 axis in periodontitis
2025-Aug-13, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本研究探讨了细胞衰老在牙周炎发病机制中的作用,发现CD81+衰老样成纤维细胞通过C3/C3aR1轴加剧炎症并激活中性粒细胞 首次鉴定出CD81在衰老牙龈成纤维细胞中高表达,并揭示了其通过C3/C3aR1轴招募中性粒细胞、维持炎症的新机制 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本,临床转化潜力仍需进一步验证 探究细胞衰老在牙周炎发病机制中的作用及具体分子机制 人类牙周炎样本、小鼠牙周炎模型、牙龈成纤维细胞 单细胞组学 牙周炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 人类牙周炎样本及小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1509 2026-03-16
Defining the Ovarian Cancer Precancerous Landscape through Modeling Fallopian Tube Epithelium Reprogramming Driven by Extracellular Vesicles
2025-Aug-01, Cancer research communications IF:2.0Q3
研究论文 本研究通过微流体组织培养平台结合空间转录组学和蛋白质组学分析,探索卵巢癌来源的小细胞外囊泡如何驱动输卵管上皮细胞重编程,揭示卵巢癌前病变的分子机制 开发了一个结合空间转录组学和蛋白质组学读出的微流体组织培养平台,首次同时捕获组织对细胞外囊泡的短期转录组变化和长期分泌囊泡蛋白质组变化,为研究细胞外囊泡-组织相互作用提供了新工具 研究基于体外模型,可能无法完全模拟体内复杂微环境;样本规模有限,需要进一步验证 探索卵巢癌来源的细胞外囊泡如何驱动输卵管上皮细胞重编程,以理解卵巢癌前病变的分子机制 人输卵管上皮细胞(hFTE)及其对卵巢癌来源小细胞外囊泡(sEV)的响应 数字病理学 卵巢癌 空间转录组学,蛋白质组学,微流体组织培养 微流体组织培养平台 转录组数据,蛋白质组数据 未明确指定具体样本数量,但涉及人输卵管上皮细胞培养 NA 空间转录组学,蛋白质组学 NA NA
1510 2026-03-16
Investigating pulmonary neutrophil responses to inflammation in mice via flow cytometry
2025-Mar-14, Journal of leukocyte biology IF:3.6Q2
研究论文 本文介绍了一种通过流式细胞术评估小鼠肺部中性粒细胞表型的详细实验方案 提供了一种针对真菌细胞壁颗粒zymosan诱导的肺部无菌炎症模型,结合细胞表面和细胞内标记的全面染色技术,适用于下游单细胞测序等应用 NA 探索肺部中性粒细胞在生理和病理条件下的复杂功能 小鼠肺部组织及气腔中的中性粒细胞 数字病理学 肺部炎症 流式细胞术 NA 细胞表型数据 NA NA NA NA NA
1511 2026-03-16
PLXNB1 and other signaling drives a pathologic astrocyte state contributing to cognitive decline in Alzheimer's Disease
2025-Feb-25, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文通过单核转录组学数据分析,揭示了阿尔茨海默病中Ast10星形胶质细胞亚群在认知衰退中的关键作用及其信号驱动机制 首次通过大规模单核转录组学元分析(869个大脑样本)识别出Ast10星形胶质细胞亚群,并利用空间转录组学验证其与配体的共定位,结合遗传学实验证实PLXNB1等信号通路的调控作用 研究主要基于转录组数据,功能机制验证仍需进一步实验;样本虽多样但可能存在批次效应;动物模型与人类疾病的直接对应性有限 探究阿尔茨海默病中病理性星形胶质细胞状态的信号驱动机制及其对认知衰退的贡献 阿尔茨海默病患者及衰老相关的大脑组织样本(人类和小鼠模型),重点关注星形胶质细胞和小胶质细胞亚群 数字病理学 阿尔茨海默病 单核转录组测序(snRNAseq),空间转录组学,遗传学敲除实验 NA 转录组数据,空间基因表达数据 869个大脑样本(来自多样化捐赠者),涵盖人类和小鼠iPSC衍生细胞 NA 单核RNA-seq,空间转录组学 NA NA
1512 2026-03-16
mTOR signaling regulates multiple metabolic pathways in human lung fibroblasts after TGF-β and in pulmonary fibrosis
2025-Feb-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
研究论文 本研究探讨了mTOR和ATF4在TGF-β诱导的人肺成纤维细胞代谢重编程中的作用 首次系统揭示了mTOR和ATF4在调控肺成纤维细胞氨基酸稳态、糖酵解和TCA循环代谢途径中的关键作用,并通过单细胞RNA-seq数据验证了这些通路在IPF患者病理成纤维细胞中的激活 研究主要基于体外细胞模型,体内验证不足;代谢组学分析可能未覆盖所有相关代谢物 阐明mTOR信号通路在肺纤维化中调控成纤维细胞代谢重编程的分子机制 人肺成纤维细胞和IPF患者肺组织样本 分子生物学与代谢研究 肺纤维化 RNA测序、代谢组学分析、单细胞RNA-seq数据分析 NA 转录组数据、代谢组数据、单细胞RNA-seq数据 未明确样本数量,但使用了人肺成纤维细胞和公开的单细胞RNA-seq数据集 NA RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 代谢组学 NA NA
1513 2026-03-16
Amniotic fluid cell-free transcriptome: a glimpse into fetal development and placental cellular dynamics during normal pregnancy
2020-02-12, BMC medical genomics IF:2.1Q3
研究论文 本研究通过分析羊水细胞游离转录组,探讨正常妊娠期间胎儿发育和胎盘细胞动态变化 首次报道单细胞基因组特征可在羊水中追踪并显示妊娠期间复杂的表达模式,同时揭示了选择性剪接在组织身份获取、器官发育和免疫过程中的作用 样本量相对有限(共98例),且仅关注正常妊娠,未纳入病理妊娠病例进行对比 建立正常妊娠羊水基因表达和剪接模式,为产科生物标志物发现提供基础 正常妊娠女性的羊水样本(孕中期30例,足月68例) 转录组学 NA 人类转录组芯片(Human Transcriptome Arrays)和单细胞RNA-seq NA 转录组数据 98例羊水样本(孕中期30例,足月68例) NA 单细胞RNA-seq NA NA
1514 2026-03-16
Single-cell transcriptomics identifies CD44 as a marker and regulator of endothelial to haematopoietic transition
2020-Jan-29, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析和抗体筛选,鉴定出CD44作为内皮向造血转变(EHT)的标志物,并揭示了其在造血干细胞和祖细胞(HSPCs)发育中的调控作用 首次识别CD44为EHT过程的特异性标记物,并证明其与透明质酸的相互作用是HSPC发育的关键调控因素 研究主要基于小鼠主动脉-性腺-中肾(AGM)区域,人类或其他物种中的适用性尚未验证 阐明内皮向造血转变(EHT)的中间步骤及调控机制 小鼠主动脉-性腺-中肾(AGM)区域的内皮细胞和造血干细胞/祖细胞(HSPCs) 单细胞组学 NA 单细胞转录组分析,抗体筛选 NA 单细胞RNA-seq数据 未明确指定样本数量,但涉及AGM区域的细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1515 2026-03-15
Tanreqing injection regulates Sema7a/Plxnc1 signaling pathway mediated neutrophil extracellular trap formation to alleviate lipopolysaccharide-induced acute lung injury
2026-May-23, Journal of ethnopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究探讨了痰热清注射液通过调节Sema7a/Plxnc1信号通路介导的中性粒细胞胞外诱捕网形成,以减轻脂多糖诱导的急性肺损伤 首次揭示了痰热清注射液通过抑制Sema7a/Plxnc1信号通路来减少中性粒细胞胞外诱捕网形成,从而缓解急性肺损伤的分子机制 研究主要基于大鼠模型和体外实验,其结论在人体中的适用性尚需进一步临床验证 评估痰热清注射液对急性肺损伤的治疗效果并阐明其分子机制 脂多糖诱导的急性肺损伤大鼠模型 药理学与分子生物学 急性肺损伤 超高效液相色谱-四极杆-电喷雾质谱、代谢组学、RNA测序、单细胞测序、分子对接 NA 代谢组学数据、转录组数据、单细胞数据 NA NA 单细胞测序、RNA测序 NA NA
1516 2026-03-15
The co-action mechanism of agreement prescription "homotherapy for heteropathy" against esophageal, head and neck cancer, and lung cancer: network pharmacology, bioinformatics analysis, and experimental validation
2026-May-23, Journal of ethnopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究通过网络药理学、生物信息学分析和实验验证,探讨了协定处方“异病同治”治疗食管癌、头颈癌和肺癌的共同靶点与分子机制 首次整合网络药理学、生物信息学(包括单细胞转录组学)和体内外实验,系统揭示了“异病同治”协定处方在多种癌症中的共同作用靶点(如CCR7、VEGFA)和PI3K-AKT通路机制 研究主要基于数据库分析和实验模型,未涉及临床患者数据,且具体处方成分未明确列出,可能影响结果的普适性 探索中医“异病同治”协定处方治疗食管癌、头颈癌和肺癌的共同分子靶点与作用机制 协定处方的活性成分、癌症相关基因、PI3K-AKT信号通路、以及食管癌、头颈癌和肺癌的细胞与动物模型 生物信息学 肺癌 网络药理学、生物信息学分析、分子对接、单细胞转录组学、体内外实验 NA 基因表达数据、蛋白质相互作用数据、转录组数据 未明确样本数量,但使用了TCGA/UALCAN数据库的泛癌数据及实验模型 NA 单细胞转录组学 NA NA
1517 2026-03-15
From Single-Cell Clusters to Causality: ITCH Engagement for CKD Uncovered by Integrative Analysis of MR and MAGMA
2026-Mar-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过整合人类肾脏单细胞RNA测序数据与遗传关联及因果推断框架,识别并验证了ITCH作为慢性肾脏病(CKD)的潜在易感基因 采用供体感知的伪批量策略缓解单细胞数据中的假重复问题,并整合转录组差异表达、孟德尔随机化(MR)和MAGMA基因水平关联分析等多层证据,首次将ITCH确立为CKD的高置信度候选基因 研究主要基于已有数据集和计算模拟,实验验证仅在动物模型中进行,尚未在人体中进行功能验证;药物预测部分为假设生成性质,需后续实验测试 识别慢性肾脏病(CKD)的潜在分子靶点 人类肾脏组织、实验性肾损伤模型 生物信息学 慢性肾脏病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、孟德尔随机化(MR)、MAGMA基因关联分析、免疫组织化学、分子对接、分子动力学模拟 NA 单细胞转录组数据、GWAS汇总统计数据、图像数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1518 2026-03-15
[Spatial omics in pulmonary fibrosis: advancing mechanistic insights and therapeutic strategies]
2026-Mar-25, Zhejiang da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Zhejiang University. Medical sciences
综述 本文综述了空间组学技术在肺纤维化研究中的应用进展,强调其在揭示疾病机制和指导治疗策略方面的潜力 整合空间代谢组学、转录组学和蛋白质组学技术,为肺纤维化提供前所未有的组织架构背景下的高通量可视化分析 NA 推进肺纤维化的机制理解和治疗策略开发 肺纤维化,特别是特发性肺纤维化(IPF) 数字病理学 肺纤维化 空间代谢组学,空间转录组学,空间蛋白质组学 NA 空间组学数据 NA NA 空间代谢组学,空间转录组学,空间蛋白质组学 NA NA
1519 2026-03-15
Identification of a putative progenitor-like chondrocyte subpopulation in osteoarthritic human cartilage
2026-Mar-14, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,在骨关节炎患者的软骨组织中鉴定出一个具有祖细胞样特征的软骨细胞亚群 在骨关节炎软骨中首次鉴定出三个新的软骨细胞亚群,包括一个具有祖细胞样特征的亚群,并描绘了其转录组特征和分化轨迹 研究样本量较小,且缺乏功能验证和空间定位验证 解析骨关节炎软骨细胞的异质性,并鉴定具有再生潜能的祖细胞样软骨细胞 骨关节炎患者的膝关节软骨细胞 单细胞组学 骨关节炎 单细胞RNA测序 无监督聚类,伪时间轨迹分析 单细胞转录组数据 6名终末期骨关节炎患者的约14,000个细胞 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 基于液滴的单细胞RNA测序
1520 2026-03-15
Integrated transcriptomics and single-cell analysis identify ITGAX⁺ macrophages as key immunosuppressive factors in the prostate cancer tumor microenvironment
2026-Mar-13, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过整合转录组学和单细胞分析,识别出ITGAX⁺巨噬细胞作为前列腺癌肿瘤微环境中的关键免疫抑制因子 首次将ITGAX确定为前列腺癌预后基因,并通过单细胞RNA测序揭示其在巨噬细胞亚群中的富集及其与免疫抑制微环境的关联 研究主要基于TCGA等公共数据集,缺乏实验验证;样本量相对有限,且未涉及不同种族或亚型的比较分析 识别前列腺癌肿瘤微环境中新的生物标志物,以更好地理解疾病进展并为未来诊断或治疗策略提供信息 前列腺癌患者的肿瘤和正常前列腺组织样本 数字病理学 前列腺癌 转录组学分析、单细胞RNA测序 ESTIMATE算法、免疫去卷积算法、Cox回归、PPI网络分析、GSEA功能预测 转录组数据、临床数据、生存数据、单细胞RNA测序数据 551个样本(499个肿瘤样本和52个正常前列腺样本) NA 单细胞RNA-seq NA NA
回到顶部