单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 30478 篇文献，本页显示第 1501 - 1520 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1501 | 2025-07-21 |
Genetics- and age-driven neuroimmune and disc changes underscore herniation susceptibility and pain-associated behaviors in SM/J mice
2025-Apr-25, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ado6847
PMID:40267183
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研究论文 | 该研究通过SM/J小鼠模型探讨了遗传背景和老化对自发性椎间盘突出易感性及疼痛相关行为的影响 | 首次在野生型小鼠中建立了自发性椎间盘突出的病理模型，并揭示了神经免疫和椎间盘变化的分子机制 | 研究仅使用SM/J小鼠这一特定品系，结果可能不适用于其他遗传背景的小鼠或人类 | 探究遗传和年龄因素对椎间盘突出易感性及疼痛行为的分子机制 | SM/J小鼠的腰椎间盘、背根神经节和脊髓组织 | 神经生物学 | 椎间盘疾病 | 转录组学分析、飞行时间细胞计数、单细胞RNA测序 | SM/J小鼠模型 | 基因表达数据、细胞计数数据 | 未明确说明具体数量，但涉及SM/J小鼠的多组织分析 |
| 1502 | 2025-07-21 |
3D spatial transcriptomics reveals the molecular structure of input and output pathways in the mouse olfactory bulb
2025-Apr-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.19.639192
PMID:40060607
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研究论文 | 利用3D空间转录组学技术重建小鼠嗅球的解剖和分子组织，揭示其对称性结构 | 首次提供了嗅球的全面分子图谱，揭示了其分子结构如何由上皮基因表达程序指导 | 研究仅针对小鼠嗅球，未涉及其他物种或脑区 | 理解嗅球的分子和结构对称性及其与感觉输入和皮层输出通路的关系 | 小鼠嗅球的分子和结构组织 | 神经科学 | NA | 3D空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 近一千个分子上不同的肾小球 |
| 1503 | 2025-07-21 |
Accessing genetically defined cell types in the superior colliculus with transgenic mouse lines
2025-Apr-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112194
PMID:40212591
|
研究论文 | 本文通过转基因小鼠品系研究了上丘中具有遗传定义的细胞类型 | 利用单细胞转录组学数据验证了形态学和转录组学神经元类型的相关性，并确定了用于遗传靶向上丘神经元类型的有用品系 | 部分测试小鼠中未观察到Cre或荧光表达与特定转录组神经元类型的对应关系 | 研究上丘中不同神经元亚型的功能 | 转基因小鼠品系中的上丘神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 10个转基因小鼠品系 |
| 1504 | 2025-07-21 |
Altered baseline immunological state and impaired immune response to SARS-CoV-2 mRNA vaccination in lung transplant recipients
2025-Apr-15, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102050
PMID:40187358
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法探讨了肺移植受者在基线状态和接种SARS-CoV-2 mRNA疫苗后的免疫状态，并与健康对照组进行了比较 | 揭示了肺移植受者基线免疫状态与严重COVID-19和败血症相似的免疫特征，并发现这些特征与疫苗反应受损相关 | 研究样本仅限于肺移植受者，可能不适用于其他器官移植患者 | 评估肺移植受者对SARS-CoV-2 mRNA疫苗的免疫反应及其基线免疫状态 | 肺移植受者和健康对照者 | 免疫学 | COVID-19 | 多组学方法，单细胞RNA测序 | NA | 生物标志物数据，单细胞RNA测序数据 | 肺移植受者和健康对照者（具体数量未提及） |
| 1505 | 2025-07-21 |
Comparative analysis of nuclei isolation methods for brain single-nucleus RNA sequencing
2025-Mar-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.25.645306
PMID:40196571
|
研究论文 | 比较分析用于大脑单核RNA测序的核分离方法 | 首次系统比较了三种不同机制的核分离方法对核完整性和后续数据质量的影响 | 研究仅针对大脑组织，未涵盖其他组织类型 | 评估不同核分离方法对单核RNA测序数据质量的影响 | 大脑组织中的细胞核 | 基因组学 | NA | 单核RNA测序(snRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | 三种不同核分离方法处理的脑组织样本 |
| 1506 | 2025-03-22 |
Spatial Transcriptomics Reveals Differential Inflammatory Pathways in Discoid Lupus Erythematosus and Lichen Planus
2025-Mar-18, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.02.148
PMID:40113031
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1507 | 2025-07-21 |
Integrated 'omics analysis reveals human milk oligosaccharide biosynthesis programs in human lactocytes
2025-Mar-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.17.643803
PMID:40166160
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序数据和特定HMO浓度测量，揭示了人类乳腺细胞中母乳寡糖（HMO）的生物合成程序 | 鉴定了已知HMO合成基因在乳腺上皮细胞亚群中的差异表达模式，并提名了几个与HMO浓度变化相关的候选基因，同时发现了可能调控HMO生物合成基因表达的新基因模式和转录因子 | 研究仅基于单细胞RNA测序数据和有限的HMO浓度测量，未进行实验验证 | 揭示人类乳腺细胞中HMO的生物合成途径 | 人类乳腺细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 未明确提及样本数量 |
| 1508 | 2025-07-21 |
SUV39H1 maintains cancer stem cell chromatin state and properties in glioblastoma
2025-Mar-10, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.186344
PMID:40059829
|
research paper | 该研究揭示了SUV39H1在维持胶质母细胞瘤干细胞（GSCs）染色质状态和特性中的关键作用，并探讨了其作为治疗靶点的潜力 | 首次发现SUV39H1通过超级增强子介导的激活在GSCs中高表达，并证明其调控G2/M细胞周期进程、干细胞维持和细胞死亡通路 | 研究主要基于体外和动物模型，临床转化效果需进一步验证 | 探索SUV39H1在胶质母细胞瘤干细胞维持中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 胶质母细胞瘤干细胞（GSCs） | 癌症生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA-seq、全细胞RNA-seq、ATAC-seq | 患者来源的异种移植模型 | 基因表达数据、染色质可及性数据 | 未明确提及具体样本数量，但使用了患者来源的GSCs和异种移植模型 |
| 1509 | 2025-07-21 |
Systematic evaluation of single-cell multimodal data integration for comprehensive human reference atlas
2025-Mar-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.06.637075
PMID:40093094
|
研究论文 | 本文系统评估了单细胞多模态数据整合方法在构建全面人类参考图谱中的应用 | 开发了可解释的机器学习工具scOMM，并系统评估了数据整合策略，发现水平整合和垂直整合对细胞类型识别的不同影响 | 研究主要聚焦于肾脏皮层组织，在其他复杂组织中的适用性有待验证 | 评估单细胞多模态数据整合方法在构建人类参考图谱中的效果 | 肾脏皮层组织的单细胞数据 | 单细胞组学 | NA | scRNA-seq, snRNA-seq, snATAC-seq | scOMM (机器学习工具) | 单细胞多模态组学数据 | 19名捐赠者的119,744个高质量核/细胞 |
| 1510 | 2025-07-21 |
Microglial Responses to Alzheimer's Disease Pathology: Insights From "Omics" Studies
2025-Mar, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.24666
PMID:39760224
|
综述 | 本文综述了关于小胶质细胞对阿尔茨海默病病理反应的'组学'研究方法和发现 | 综合应用多种组学技术揭示小胶质细胞在阿尔茨海默病中的异质性和分子模式变化 | 主要基于小鼠模型研究，人类组织研究数据有限 | 阐明小胶质细胞在阿尔茨海默病发病机制中的作用 | 小胶质细胞在阿尔茨海默病中的反应 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 转录组学、表观基因组学、空间转录组学、蛋白质组学、脂质组学、代谢组学 | NA | 组学数据 | NA |
| 1511 | 2025-07-21 |
An international perspective on the future of systemic sclerosis research
2025-Mar, Nature reviews. Rheumatology
DOI:10.1038/s41584-024-01217-2
PMID:39953141
|
review | 本文探讨了系统性硬化症（SSc）研究的未来国际视角，强调了该疾病的复杂性、当前研究的局限性以及新兴技术带来的机遇 | 综述了单细胞RNA测序、下一代测序、空间生物学等新兴技术在SSc研究中的应用潜力，以及全球合作和标准化协议的重要性 | 疾病分类、临床异质性以及缺乏可靠的生物标志物和动物模型是当前研究的主要挑战 | 推动系统性硬化症的诊断、治疗和护理方面的突破 | 系统性硬化症（SSc）患者 | 医学研究 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序、下一代测序、空间生物学、转录组学、基因组学、蛋白质组学、代谢组学、微生物组分析、人工智能 | NA | 分子生物学数据、临床数据 | NA |
| 1512 | 2025-07-21 |
Transcriptomic responses of lung mesenchymal cells during pneumonia
2025-Feb-25, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.177084
PMID:39998887
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了肺炎期间肺间充质细胞的转录组反应 | 首次全面描述了肺炎期间不同类型肺间充质细胞的转录组变化，揭示了这些细胞的共同反应和特异性反应 | 研究仅基于小鼠模型，结果是否适用于人类尚需验证 | 阐明肺间充质细胞在肺炎期间的免疫活动 | 小鼠肺间充质细胞 | 单细胞转录组学 | 肺炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 来自不同处理组(naive、pneumonic、resolved)的小鼠肺间充质细胞 |
| 1513 | 2025-07-21 |
Multiple Myeloma Insights from Single-Cell Analysis: Clonal Evolution, the Microenvironment, Therapy Evasion, and Clinical Implications
2025-Feb-14, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17040653
PMID:40002248
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综述 | 本文综述了多发性骨髓瘤（MM）的复杂性及异质性，探讨了克隆进化、肿瘤微环境、治疗逃逸机制及其临床意义 | 利用单细胞技术（如单细胞转录组学、基因组学和多组学）深入解析MM的细胞水平异质性，识别罕见细胞群和耐药机制 | 单细胞技术成本高、数据复杂，且临床应用中存在生物信息学标准化和伦理问题 | 增强对MM进展机制的理解，优化个性化治疗策略并改善患者预后 | 多发性骨髓瘤（MM）及其微环境 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞转录组学、单细胞基因组学、多组学 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 1514 | 2025-07-21 |
Suppressing recurrence in Sonic Hedgehog subgroup medulloblastoma using the OLIG2 inhibitor CT-179
2025-Feb-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54861-3
PMID:39904981
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research paper | 研究OLIG2抑制剂CT-179在抑制Sonic Hedgehog亚型髓母细胞瘤复发中的治疗潜力 | 首次证实CT-179通过破坏OLIG2二聚化、磷酸化和DNA结合，改变肿瘤细胞周期动力学，增加分化和凋亡，从而延长生存期并增强放疗效果 | 未明确提及研究样本量是否足够大，以及是否涵盖所有SHH-MB亚型 | 开发针对SHH亚型髓母细胞瘤中OLIG2+肿瘤干细胞的特异性治疗方案 | SHH-MB移植器官样体、PDX和GEM SHH-MB模型 | 肿瘤治疗 | 髓母细胞瘤 | scRNA-seq | PDX和GEM模型 | 转录组数据 | NA |
| 1515 | 2025-07-21 |
BRD4 inhibition rewires cardiac macrophages toward a protective phenotype marked by low MHC class II expression
2025-Feb-01, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
DOI:10.1152/ajpheart.00438.2024
PMID:39716819
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research paper | 研究BRD4抑制如何通过改变心脏巨噬细胞的表型，减少炎症反应并促进心脏修复 | 揭示了BRD4抑制通过调控巨噬细胞的MHC-II表达和NF-κB信号通路，促进心脏修复的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证 | 探索BET抑制剂JQ1改善心脏结构和功能的细胞机制 | 心脏巨噬细胞和单核细胞 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | 小鼠缺血/再灌注损伤模型 | 基因表达数据 | 小鼠心脏组织及培养的巨噬细胞 |
| 1516 | 2025-07-21 |
Variants and vaccines impact nasal immunity over three waves of SARS-CoV-2
2025-Feb, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-024-02052-z
PMID:39833605
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研究论文 | 研究探讨了SARS-CoV-2变体和宿主疫苗接种状态如何影响人类鼻黏膜的细胞反应 | 首次通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析了Delta和Omicron变体感染下鼻黏膜的细胞组成变化，并比较了疫苗接种对细胞反应的影响 | 研究样本可能不足以代表所有人群，且未考虑其他潜在影响因素 | 了解SARS-CoV-2不同变体和疫苗接种状态对鼻黏膜免疫反应的影响 | 接种和未接种疫苗的成年人鼻咽拭子样本 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | 来自Delta和Omicron感染患者的鼻咽拭子样本，并与原始SARS-CoV-2感染数据整合 |
| 1517 | 2025-07-21 |
Robust Cluster Prediction Across Data Types Validates Association of Sex and Therapy Response in GBM
2025-Jan-28, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17030445
PMID:39941811
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研究论文 | 本研究利用稳健的集成机器学习方法，训练了一个基于基因微阵列数据的模型，能够在RNA-seq和潜在的单细胞RNA-seq等多平台上进行预测 | 利用‘遗留数据’训练模型，实现跨平台预测，并发现性别特异性预测特征 | 预测特征仅对女性患者有效，男性患者结果出乎意料 | 验证性别与胶质母细胞瘤治疗反应的关联 | 胶质母细胞瘤患者 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 基因微阵列, RNA-seq, 潜在的单细胞RNA-seq | 集成机器学习 | 基因表达数据 | NA |
| 1518 | 2025-07-21 |
Mechanism of enhancing chemotherapy efficacy in pancreatic ductal adenocarcinoma with paricalcitol and hydroxychloroquine
2025-Jan-21, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101881
PMID:39730001
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研究论文 | 探讨帕立骨化醇和羟氯喹在增强胰腺导管腺癌化疗效果中的分子机制 | 首次揭示了帕立骨化醇和羟氯喹联合使用通过调节自噬和内质网应激相关转录物，增强吉西他滨对胰腺导管腺癌的治疗效果 | 研究主要基于体外和小鼠模型，临床样本量有限 | 阐明帕立骨化醇和羟氯喹联合使用增强胰腺导管腺癌对吉西他滨敏感性的分子机制 | 胰腺导管腺癌(PDAC) | 肿瘤学 | 胰腺癌 | 蛋白质组学、单细胞RNA测序(RNA-seq) | NA | 分子生物学数据、临床数据 | 体外实验、原位小鼠模型、患者来源的异种移植模型(PDX)及临床试验(NCT04524702)中的配对活检样本 |
| 1519 | 2025-07-21 |
Low fucosylation defines the glycocalyx of progenitor cells and melanocytes in the human limbal stem cell niche
2025-01-14, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.11.008
PMID:39706176
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研究论文 | 本研究揭示了人类角膜缘干细胞微环境中前体细胞和黑色素细胞糖萼的低岩藻糖基化特征 | 首次发现角膜缘上皮前体细胞和黑色素细胞表面存在低AAL结合特性，并证实岩藻糖基化调控对干细胞增殖潜能的影响 | 研究主要基于体外实验，需要进一步体内验证 | 探究成人干细胞糖萼的独特组成及其在干细胞自我更新和分化中的作用 | 人类角膜缘、毛囊上皮和睑板腺导管的分层上皮基底细胞 | 干细胞生物学 | 眼科疾病 | 荧光激活细胞分选技术、单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞数据 | 人类角膜缘组织样本 |
| 1520 | 2025-07-21 |
Robust single-nucleus RNA sequencing reveals depot-specific cell population dynamics in adipose tissue remodeling during obesity
2025-Jan-13, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.97981
PMID:39804687
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研究论文 | 本文提出了一种稳健的单核RNA测序技术，用于研究肥胖期间脂肪组织重塑中的细胞群动态 | 开发了一种适用于多种组织类型的核分离技术，显著提高了snRNA-seq数据质量，并首次全面描述了肥胖期间脂肪组织重塑的细胞动态 | 研究主要基于小鼠模型，人类脂肪组织的适用性尚需验证 | 探究肥胖过程中脂肪组织重塑的细胞分子机制 | 小鼠脂肪组织中的各种细胞类型 | 基因组学 | 肥胖 | 单核RNA测序(snRNA-seq), 批量核RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 多种小鼠脂肪组织样本 |