本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1501 | 2025-12-13 |
Single-Cell RNA Sequencing Identifies Accumulation of Fcgr2b + Virtual Memory-Like CD8 T Cells With Cytotoxic and Inflammatory Potential in Aged Mouse White Adipose Tissue
2025-Dec, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70278
PMID:41116748
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了老年小鼠白色脂肪组织中Fcgr2b+虚拟记忆样CD8 T细胞的积累及其在细胞毒性和炎症反应中的潜在作用 | 首次在老年小鼠白色脂肪组织中鉴定出Fcgr2b+CD49d-虚拟记忆样CD8 T细胞的积累,并发现其具有细胞毒性和促炎特性,为理解衰老相关脂肪组织炎症提供了新视角 | 研究主要基于小鼠模型,结果在人类中的适用性尚需验证;样本量相对有限,可能影响统计效力 | 比较衰老与高脂饮食诱导的肥胖状态下脂肪组织炎症的差异,识别独特的调控靶点 | 年轻和老年小鼠的性腺白色脂肪组织(gWAT)基质血管组分(SVF) | 单细胞组学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自年轻小鼠(正常或高脂饮食)和老年小鼠(正常饮食)的性腺白色脂肪组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1502 | 2025-12-13 |
The joint impact of elevated homocysteine and type 2 diabetes on non-healing wounds and all-cause mortality: integrated clinical and multi-omics analyses
2025-Dec-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003715
PMID:41186525
|
研究论文 | 本研究通过整合临床数据和多组学分析,探讨了高同型半胱氨酸血症与2型糖尿病对不愈合伤口及全因死亡率的联合影响及其潜在机制 | 首次系统评估了HHcy与T2D对不愈合伤口的协同作用,并利用多组学数据揭示了Hcy通过MIF-CD74/CXCR4轴重塑糖尿病足溃疡微环境的免疫代谢重编程机制 | 研究基于横断面调查数据,因果关系推断受限;单细胞测序样本量可能有限;结果外推至其他人群需谨慎 | 阐明高同型半胱氨酸血症与2型糖尿病联合作用对伤口愈合及死亡风险的影响机制 | 美国国家健康与营养调查(NHANES)的8406名参与者(1999-2004年),以及糖尿病足溃疡的转录组和单细胞测序数据 | 数字病理学 | 糖尿病足溃疡 | 批量转录组测序, 单细胞RNA测序 | 加权逻辑回归, Cox比例风险模型, 限制性立方样条, 中介分析 | 临床数据, 转录组数据, 单细胞数据 | 8406名NHANES参与者 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1503 | 2025-12-13 |
Single Cell Sequencing Identifies Distinct Cellular Alterations in Impaired Aged and Diabetic Wounds
2025-Dec, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70217
PMID:41189300
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,比较了老年和糖尿病小鼠伤口愈合过程中的细胞差异,揭示了两种条件下独特的分子机制 | 首次在单细胞水平直接比较老年和糖尿病伤口愈合,识别了蛋白酶富集状态和炎症表型等不同分子机制 | 研究仅基于小鼠模型,未涉及人类样本,且样本规模有限,可能影响结果的普适性 | 探究老年和糖尿病伤口愈合受损的细胞和分子基础,以寻找更精确的治疗靶点 | 老年和糖尿病小鼠的伤口组织 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 未明确指定,但涉及年轻、老年和糖尿病小鼠的伤口样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1504 | 2025-12-13 |
Destruction of VISTA by TRIM25 ablation in T cells potentiates cancer immunotherapy
2025-Dec, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-025-01186-5
PMID:41225152
|
研究论文 | 本研究揭示了TRIM25通过稳定VISTA蛋白调控T细胞功能的分子机制,并证明靶向TRIM25-VISTA轴可增强癌症免疫治疗效果 | 首次发现TRIM25是VISTA的正向调控因子,阐明了ERK介导的VISTA磷酸化增强其与TRIM25互作的分子机制,并开发了可破坏该互作的磷酸肽抑制剂 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化效果需进一步验证;磷酸肽的体内稳定性和递送效率有待优化 | 探索VISTA免疫检查点的调控机制并开发增强癌症免疫治疗的新策略 | T细胞中的VISTA蛋白及其调控蛋白TRIM25 | 癌症免疫学 | 癌症 | CRISPR基因敲除筛选、蛋白质组学分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质互作数据、单细胞转录组数据 | 多种小鼠肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1505 | 2025-12-13 |
Decoding the Therapeutic Effects of Acupuncture in Hemorrhagic Stroke Using Single-Cell RNA Sequencing
2025-Dec, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1002/cns.70689
PMID:41363028
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,探索了针灸在出血性中风恢复中的治疗作用及其分子机制 | 首次在单细胞水平上揭示针灸如何通过调节胶质细胞(如小胶质细胞、星形胶质细胞和少突胶质细胞)的基因表达,特别是通过APOE-TREM2信号轴,促进神经保护和炎症消退 | 研究基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类;样本量未在摘要中明确说明;机制细节需进一步验证 | 探究针灸在出血性中风恢复中的治疗机制 | 小鼠模型中的胶质细胞(小胶质细胞、星形胶质细胞、少突胶质细胞) | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1506 | 2025-12-13 |
Removal of unwanted variation in pseudobulk analysis of single-cell RNA sequencing data and the leveraging of pseudoreplicates
2025-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf179
PMID:41368194
|
研究论文 | 本文评估了在单细胞RNA测序数据的伪批量分析中去除不必要变异的策略,并提出了新方法RUVIII PBPS以解决技术重复不足或阴性对照基因缺失的问题 | 引入了RUVIII PBPS新策略,可在缺乏技术重复或阴性对照基因时有效控制伪发现率,扩展了RUV方法在单细胞数据中的应用范围 | 研究主要基于模拟和特定生物信号数据,可能未覆盖所有真实世界复杂场景,且方法性能依赖于数据质量和模型假设 | 评估和优化单细胞RNA测序伪批量数据中去除不必要变异的方法,以提高差异表达分析的准确性 | 单细胞RNA测序数据的伪批量分析,重点关注技术噪声和混杂因素的影响 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | RUV2, RUVIII, RUV4, RUVIII PBPS | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1507 | 2025-12-13 |
Comment on "Bidirectional Mendelian randomization and single-cell sequencing reveal T cell-mediated causal links between COPD and lung adenocarcinoma"
2025-Dec-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003223
PMID:40839102
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1508 | 2025-12-13 |
Spatial mapping of rheumatoid arthritis synovial niches reveals a LYVE1+ macrophage network associated with response to therapy
2025-Dec, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.07.019
PMID:40849271
|
研究论文 | 本研究通过高维成像质谱流式技术,揭示了类风湿关节炎滑膜中LYVE1+巨噬细胞网络在治疗响应中的关键作用 | 首次在空间和动态层面绘制了类风湿关节炎滑膜对治疗响应的蓝图,并识别出LYVE1+巨噬细胞网络作为滑膜稳态的核心组件 | 研究样本量有限,且主要关注早期类风湿关节炎患者,可能无法完全代表所有患者群体 | 旨在解析类风湿关节炎治疗期间滑膜的细胞和分子变化,识别与临床缓解相关的关键细胞网络和通路 | 健康对照、骨关节炎患者及早期类风湿关节炎患者的滑膜组织 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 成像质谱流式技术、全组织RNA测序、免疫荧光、配体-受体分析、单细胞RNA测序、体外共培养实验 | NA | 图像、文本 | 包括健康对照、骨关节炎患者及早期类风湿关节炎患者的滑膜组织样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1509 | 2025-12-13 |
The regulatory role and mechanism of TGFBI on Tregs in the immune microenvironment of clear cell renal cell carcinoma
2025-Dec-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003225
PMID:40865943
|
研究论文 | 本研究阐明了TGFBI通过上调CCL22分泌招募Tregs,从而促进透明细胞肾细胞癌免疫抑制微环境的机制 | 首次在ccRCC中揭示了TGFBI通过CCL22轴调控Tregs介导的免疫抑制的具体机制,并提出了靶向该轴作为增强免疫治疗疗效的新策略 | 研究主要基于细胞系和动物模型,临床样本验证相对有限,且TGFBI-CCL22轴在其他肿瘤类型中的普适性未探讨 | 阐明TGFBI在ccRCC免疫微环境中调控Tregs的机制及其临床意义 | 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)的肿瘤微环境,特别是Tregs和TGFBI蛋白 | 肿瘤免疫学 | 肾细胞癌 | 单细胞测序,Western blotting,流式细胞术,ELISA,CCL22中和抗体实验 | BALB/c小鼠模型,TGFBI敲低(RENCA)和过表达(A498)细胞系 | 基因表达数据,单细胞测序数据,体外实验数据,体内实验数据 | TCGA数据集,单细胞测序数据,细胞系(RENCA, A498),BALB/c小鼠模型,临床样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1510 | 2025-12-13 |
Healthy human enthesis stromal cells mediate immunoregulation via the CD39/CD73 adenosine ectonucleotidase pathway
2025-Dec, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.09.001
PMID:41058388
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和功能分析,揭示了健康人类附着点基质细胞通过CD39/CD73腺苷外核苷酸酶途径介导免疫调节的机制 | 首次在人类附着点组织中识别出基质细胞通过CD39/CD73腺苷途径进行免疫调节,并比较了其与肠道Treg依赖机制的差异 | 研究样本量有限(27,348个细胞),且主要基于体外共培养实验,体内验证不足 | 探究附着点组织的免疫稳态机制及其在脊柱关节病中的作用 | 健康人类附着点组织细胞、肠道组织数据集、活化T细胞 | 单细胞转录组学 | 脊柱关节病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 27,348个附着点细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1511 | 2025-12-13 |
A multi-omics pipeline integrating machine learning and spatial-cellular analysis identifies SASH1 as a prognostic biomarker and therapeutic target in head and neck squamous cell carcinoma
2025-Dec-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003647
PMID:41099090
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据、机器学习算法和空间细胞分析,识别出SASH1作为头颈部鳞状细胞癌的预后生物标志物和治疗靶点 | 整合了多平台转录组学、多种机器学习算法以及单细胞和空间转录组学数据,系统性地识别并验证了SASH1作为HNSCC的新型生物标志物,并揭示了其空间分布特征 | 研究主要基于公共数据库和细胞系数据,缺乏大规模临床样本的独立验证 | 识别和验证头颈部鳞状细胞癌的关键驱动基因,以发现可靠的分子生物标志物用于改善临床管理 | 头颈部鳞状细胞癌 | 机器学习 | 头颈部鳞状细胞癌 | 转录组学分析,单细胞RNA-seq,空间转录组学,Western blot | LASSO, SVM-RFE, XGBoost, Boruta | 转录组数据,单细胞数据,空间转录组数据,蛋白质数据 | 多个GEO数据集(GSE29330, GSE6631, GSE138206)和TCGA-HNSC队列,以及公共单细胞(GSE215403)和空间转录组(GSE252265)数据 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1512 | 2025-12-13 |
Deconstruction of tophi and synovium defines SPP1+ macrophages involved in extracellular matrix remodelling in gout
2025-Dec, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.09.003
PMID:41107120
|
研究论文 | 本研究首次提供了痛风石关节的单细胞转录组图谱,揭示了SPP1+/MMP9+/CHI3L1+巨噬细胞在痛风石形成中的关键作用 | 首次对痛风石关节进行单细胞转录组分析,识别出痛风石特有的SPP1+/MMP9+/CHI3L1+巨噬细胞亚群,并揭示了其具有免疫调节和基质重塑的双重功能 | NA | 探究痛风石形成的免疫-基质细胞相互作用机制 | 痛风患者的滑膜组织和痛风石组织 | 数字病理学 | 痛风 | 单细胞转录组测序, 空间转录组学, 免疫荧光, 流式细胞术, 孟德尔随机化 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 44,221个滑膜组织细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1513 | 2025-12-13 |
High KCNJ14 expression is associated with an immunosuppressive tumor microenvironment and advanced pathological features: An RNA in situ hybridization-based analysis of colorectal carcinoma
2025-Dec, Experimental and molecular pathology
IF:2.8Q2
DOI:10.1016/j.yexmp.2025.105005
PMID:41124752
|
研究论文 | 本研究通过RNA原位杂交技术分析了结直肠癌中KCNJ14的表达,发现其高表达与免疫抑制性肿瘤微环境和晚期病理特征相关 | 首次在结直肠癌中利用RNA原位杂交技术揭示KCNJ14的高表达与免疫抑制性肿瘤微环境及晚期病理特征的关联 | KCNJ14并非独立的预后因素,且与FOXP3细胞浸润、总生存期或无复发生存期无显著关联 | 探究KCNJ14在结直肠癌中的临床意义、空间表达模式及其与肿瘤微环境和病理特征的关系 | 259例结直肠癌病例的组织芯片样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA原位杂交,单细胞RNA测序 | NA | 图像,RNA表达数据 | 259例结直肠癌病例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | RNAscope技术用于RNA原位杂交分析 |
| 1514 | 2025-12-13 |
Integration of genetic, proteomic, and transcriptomic data identifies therapeutic targets and prognostic biomarkers in bladder cancer
2025-Nov-30, Translational andrology and urology
IF:1.9Q3
DOI:10.21037/tau-2025-443
PMID:41368242
|
研究论文 | 本研究通过整合遗传、蛋白质组和转录组数据,识别了膀胱癌的潜在治疗靶点和预后生物标志物 | 整合跨组学定量性状位点、OLINK蛋白质组学和转录组学数据,结合前瞻性队列研究和多组学分析,识别新的治疗靶点和生物标志物 | 研究依赖于现有数据库和队列数据,可能受限于样本代表性和数据完整性,需要进一步实验验证 | 识别膀胱癌的分子靶点和候选药物,以改善早期诊断和精准治疗 | 膀胱癌患者及相关遗传、蛋白质和转录组数据 | 生物信息学 | 膀胱癌 | xQTLs, OLINK蛋白质组学, 转录组学, GWAS, 单细胞RNA测序, 甲基化分析 | Cox回归, 随机生存森林模型 | 遗传数据, 蛋白质数据, 转录组数据, 甲基化数据 | 来自UK Biobank Pharma Proteomics Project, deCODE Genetics和Atherosclerosis Risk in Communities study的数据,具体样本数量未明确说明 | OLINK, NA | 蛋白质组学, 单细胞RNA测序, 甲基化测序 | OLINK平台, NA | OLINK高通量血浆蛋白测量平台,具体配置未详细说明 |
| 1515 | 2025-12-13 |
Migrasome-related long non-coding RNAs orchestrate immune microenvironment and serve as a novel prognostic model in clear cell renal cell carcinoma
2025-Nov-30, Translational andrology and urology
IF:1.9Q3
DOI:10.21037/tau-2025-541
PMID:41368248
|
研究论文 | 本研究通过整合转录组数据和临床参数,识别了与透明细胞肾细胞癌预后相关的迁移体相关长链非编码RNA,并构建了一个包含五个MRLs的预后模型,用于风险分层和指导治疗策略 | 首次系统性地识别了迁移体相关长链非编码RNA在透明细胞肾细胞癌中的预后价值,并构建了一个基于五个MRLs的稳健预后模型,同时结合单细胞RNA测序揭示了肿瘤细胞内在VEGF信号通路在调节迁移体相关分子程序中的作用 | 研究主要基于TCGA数据库的回顾性数据,需要进一步的前瞻性临床验证,且单细胞RNA测序数据的样本量可能有限 | 系统识别与透明细胞肾细胞癌预后相关的迁移体相关长链非编码RNA,并构建一个稳健的预后模型以改善风险分层和指导潜在治疗策略 | 透明细胞肾细胞癌患者 | 生物信息学 | 肾细胞癌 | 转录组分析、LASSO回归、单细胞RNA测序、RT-qPCR | LASSO回归模型 | 转录组数据、临床数据、单细胞RNA测序数据 | TCGA数据库中的透明细胞肾细胞癌患者样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1516 | 2025-12-13 |
MSI2 exerts antitumor effects by regulating T-cell function in kidney renal clear cell carcinoma
2025-Nov-30, Translational andrology and urology
IF:1.9Q3
DOI:10.21037/tau-2025-437
PMID:41368259
|
研究论文 | 本研究探讨了Musashi 2 (MSI2)在肾透明细胞癌中的表达及其与肿瘤微环境的关系,发现MSI2通过调节T细胞功能发挥抗肿瘤作用 | 首次在肾透明细胞癌中发现MSI2下调并具有抗肿瘤功能,揭示了其在T细胞分化中的动态表达模式 | 研究主要基于数据库分析和体外实验,缺乏体内实验验证,且MSI2的具体调控机制仍需进一步探索 | 探索MSI2在肾透明细胞癌中的表达、功能及其与肿瘤微环境的相互作用 | 肾透明细胞癌患者样本、肾细胞系、T细胞 | 生物信息学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序、伪时序分析、Kaplan-Meier分析、富集分析 | NA | mRNA表达数据、蛋白质表达数据、单细胞RNA测序数据 | 基于公共数据库(TIMER2.0、UALCAN)的肾透明细胞癌患者样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1517 | 2025-12-13 |
Multi-omics characterization of metabolic and immune interactions in prostate cancer
2025-Nov-30, Translational andrology and urology
IF:1.9Q3
DOI:10.21037/tau-2025-502
PMID:41368255
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了前列腺癌中代谢重编程与免疫微环境之间的相互作用,并识别了具有预后意义的关键代谢生物标志物ENO1和CKB | 整合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据,首次系统性地揭示了ENO1和CKB在前列腺癌代谢-免疫串扰中的关键作用,并构建了整合这些标志物与临床参数的预后列线图 | 研究主要基于公开数据集,缺乏独立的实验验证队列;单细胞数据来源未明确说明具体平台细节 | 阐明前列腺癌中代谢重编程与免疫微环境相互作用的调控机制,并识别关键的预后代谢生物标志物 | 前列腺癌组织 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 生物信息学分析 | 多组学分析框架, Seurat, Signac, CIBERSORT, GSVA, GSEA, Cox回归模型 | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据, 临床数据 | TCGA-PRAD队列(具体样本数未明确说明)及公开可用的单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 1518 | 2025-12-13 |
Monocyte/macrophage-derived NLRP3 Promotes the Onset and Progression of Ankylosing Spondylitis Via the NOD-like Receptor Pathway
2025-Nov-26, Journal of clinical immunology
IF:7.2Q1
DOI:10.1007/s10875-025-01961-4
PMID:41291215
|
研究论文 | 本研究揭示了单核/巨噬细胞通过NOD样受体信号通路(主要由NLRP3介导)在强直性脊柱炎发病机制中的关键作用,并识别了调控NLRP3的因子及潜在治疗药物 | 首次在AS中识别出经典的单核细胞-巨噬细胞-炎症性巨噬细胞分化轨迹,并明确了单核/巨噬细胞来源的NLRP3通过NOD样受体通路驱动疾病进展,同时发现了多个调控NLRP3表达的因子及潜在靶向治疗化合物 | 研究结论主要基于生物信息学分析和单细胞测序数据验证,仍需进一步的体内外功能实验和临床前模型验证 | 阐明强直性脊柱炎的致病通路并探索潜在治疗策略 | 强直性脊柱炎患者及非AS患者的血液样本、GEO转录组数据集、AS患者和骨折对照患者的骨髓样本 | 生物信息学与免疫学 | 强直性脊柱炎 | 单细胞RNA测序、转录组分析、GSEA通路分析、生物信息学分析 | NA | 血液检测数据、转录组数据、单细胞测序数据 | 未明确具体样本数量,涉及AS患者、非AS患者及骨折对照患者的血液和骨髓样本,并利用了GEO公共数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1519 | 2025-12-13 |
Deciphering the role of angiogenesis in glioblastoma: Integrative insights from transcriptomic profiling, single-cell sequencing and interpretable machine learning approaches
2025-Nov-24, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2025.156305
PMID:41380386
|
研究论文 | 本研究通过整合转录组分析、单细胞测序和可解释机器学习方法,揭示了血管生成相关基因在胶质母细胞瘤中的作用,并建立了一个基于六个枢纽基因的风险分层模型 | 结合多种机器学习算法和SHAP分析提高模型可解释性,首次识别出六个枢纽ARGs并验证其在独立队列中的预后价值,同时揭示了高风险患者肿瘤微环境的免疫抑制和机械特性改变 | 研究主要基于回顾性队列数据,需要进一步实验验证枢纽基因的功能机制和靶向治疗的临床效果 | 系统研究血管生成相关基因在胶质母细胞瘤进展中的功能意义,并开发预后预测模型 | 胶质母细胞瘤患者样本及其血管生成相关基因 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞测序,转录组分析 | Cox回归,LASSO回归,多种机器学习生存预测算法 | 转录组数据,单细胞测序数据 | 多个独立胶质母细胞瘤队列(CGGA-GBM、GSE43378、GSE7696) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1520 | 2025-12-13 |
Study on the anti-liver cirrhosis of Fuzheng Huayu tablet : Targeting macrophage PPARα axis-fatty acid metabolic
2025-Nov-22, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157586
PMID:41380414
|
研究论文 | 本研究通过基础实验评估了扶正化瘀片(FZHY)的抗肝硬化效果,并分析了其作用机制及活性成分 | 首次在基础研究层面评估FZHY的抗肝硬化效果,结合单细胞转录组学、代谢组学等多组学技术及分子生物学实验,揭示了其通过靶向巨噬细胞PPARα轴-脂肪酸代谢通路发挥作用的机制 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化需进一步验证;机制验证虽全面,但人类样本数据缺乏 | 评估扶正化瘀片(FZHY)的抗肝硬化效果并阐明其作用机制及活性成分 | 肝硬化小鼠模型、巨噬细胞(Kupffer细胞、THP1细胞) | NA | 肝硬化 | 单细胞转录组学、代谢组学、16S RNA微生物组分析、流式细胞术、免疫组化、免疫共聚焦显微镜、WB、PCR、油红O染色、LC-MS、分子对接 | NA | 转录组数据、代谢组数据、微生物组数据、图像数据、分子数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 代谢组学, 16S RNA测序 | NA | NA |