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当前共找到 43167 篇文献，本页显示第 1501 - 1520 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1501 | 2026-08-25 |
Protocol for fast scRNA-seq raw data processing using scKB and non-arbitrary quality control with COPILOT
2022-12-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101729
PMID:36181683
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研究论文 | 描述了一种利用scKB和COPILOT对单细胞RNA测序原始数据进行快速且非任意质量控制的分析协议 | 提出scKB作为kallisto和bustools的封装脚本，加速比对和转录本计数矩阵生成，比Cell Ranger更快；COPILOT通过比较低质量和高质量细胞分布实现非任意的背景噪声去除 | 未明确提及局限性 | 简化scRNA-seq数据处理流程，为新手用户提供易于入门的协议 | 单细胞RNA测序原始数据 | 生物信息学 | 不适用 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 不适用 | 单细胞转录组数据 | 不适用 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 1502 | 2026-08-25 |
Comprehensive multi-omics single-cell data integration reveals greater heterogeneity in the human immune system
2022-Oct-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105123
PMID:36185375
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研究论文 | 开发了一种名为SuPERR的新型多组学单细胞数据分析工作流程，用于整合转录组、蛋白质组和细胞受体库数据，以更准确地识别人类免疫系统中的异质细胞类型 | SuPERR通过整合细胞表面蛋白和免疫球蛋白转录计数信息，提高了聚类分辨率和准确性，能发现隐藏的细胞亚群，并有效去除双细胞和防止细胞类型错误分类 | 未提及 | 改进多组学单细胞数据集中多样细胞类型的识别和细胞类型分类的准确性 | 人类免疫系统中的多种免疫细胞类型 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组学、蛋白质组学、细胞受体库测序 | NA | 单细胞多组学数据（转录组、蛋白质组、细胞受体库） | 未提及 | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 1503 | 2026-08-25 |
Decoding the transcriptome of calcified atherosclerotic plaque at single-cell resolution
2022-10-12, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-04056-7
PMID:36224302
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序和系统生物学方法，解析钙化动脉粥样硬化斑块中血管平滑肌细胞和内皮细胞的转录组，揭示解剖位置差异及细胞转分化的潜在驱动因子 | 首次在单细胞分辨率下对钙化动脉粥样硬化核心和邻近组织进行转录组比较，识别出新的细胞转分化候选驱动基因 | 仅基于有限样本的观察性研究，未进行功能验证 | 阐明动脉粥样硬化斑块中不同解剖区域的细胞转录特征，探索疾病进展的潜在机制 | 接受颈动脉内膜切除术患者的钙化动脉粥样硬化核心斑块和近端邻近颈动脉组织 | 单细胞转录组学 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 多个患者（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1504 | 2026-08-25 |
Single-cell analysis of immune cell transcriptome during HIV-1 infection and therapy
2022-09-29, BMC immunology
IF:2.9Q3
DOI:10.1186/s12865-022-00523-2
PMID:36175869
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序分析HIV-1感染及抗逆转录病毒治疗期间的免疫细胞转录组变化，揭示治疗未完全恢复的细胞功能障碍及潜在治疗靶点 | 首次在单细胞水平上高分辨率描绘慢性HIV-1感染及ART治疗后免疫细胞转录组的持续性扰动，并鉴定表达HIV-1转录本的T细胞中的关键调控因子 | 摘要中未提及研究局限性，可能包括样本量有限或仅针对外周血细胞 | 理解HIV-1感染和ART期间免疫细胞景观的动态变化，以定义细胞功能障碍及其在治疗中的印记 | 慢性未治疗HIV-1个体、接受ART的HIV-1感染个体、HIV-1阴性个体，以及健康供者CD4+ T细胞的早期HIV-1感染原代细胞模型 | 单细胞转录组学 | HIV-1感染 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 慢性未治疗HIV-1个体、ART治疗HIV-1个体、HIV-1阴性个体（具体数量未提供）及健康供者CD4+ T细胞（用于原代感染模型） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1505 | 2026-08-25 |
Multi-context genetic modeling of transcriptional regulation resolves novel disease loci
2022-09-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-33212-0
PMID:36171194
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CONTENT的计算方法，利用跨环境的基因表达相关性结构，提高转录组关联研究（TWAS）的效力，并正确调整多重检验，从而发现新的疾病位点。 | CONTENT方法首次利用多环境表达研究中的个体内相关性，进行跨环境的错误发现率校正，并生成环境特异性和共享的基因表达成分，显著提高了遗传预测基因的数量和位点-表型关联的发现率。 | 本文未明确讨论CONTENT方法的局限性，但可能包括对单细胞数据噪声的敏感性或计算资源需求。 | 开发一种高效的计算方法，以改进TWAS分析，利用多环境表达数据的相关性结构，提高复杂性状相关基因和位点的发现能力。 | 研究对象为多组织bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据集，以及22个复杂性状的关联分析。 | 机器学习 | 复杂性状疾病 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 使用了多组织bulk和单细胞RNA-seq数据集，具体样本数未在摘要中提及。 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1506 | 2026-08-25 |
Skeletal Stem/Progenitor Cells in Periosteum and Skeletal Muscle Share a Common Molecular Response to Bone Injury
2022-08, Journal of bone and mineral research : the official journal of the American Society for Bone and Mineral Research
IF:5.1Q1
DOI:10.1002/jbmr.4616
PMID:35652423
|
研究论文 | 本研究揭示了骨膜和骨骼肌中的骨骼干/祖细胞（SSPCs）在骨损伤后共享一种共同的分子响应，由BMP信号介导，促进骨折修复中的软骨内成骨 | 首次通过单细胞RNA测序揭示骨膜细胞在稳态和骨折响应中的细胞异质性，并发现骨膜和骨骼肌SSPCs在骨折后共同经历从干/祖状态向纤维形成状态的转变，且该过程由BMP信号调控 | 摘要中未提及研究的局限性 | 探究骨膜和骨骼肌中的骨骼干/祖细胞在骨损伤后的分子响应及其在骨折修复中的作用机制 | 骨膜和骨骼肌中的骨骼干/祖细胞（SSPCs）以及骨髓基质细胞 | 单细胞转录组学 | 骨折 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未提及具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1507 | 2026-08-25 |
IDEAS: individual level differential expression analysis for single-cell RNA-seq data
2022-01-24, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-022-02605-1
PMID:35073995
|
研究论文 | 提出一种针对单细胞RNA测序数据的个体水平差异表达分析方法IDEAS，用于比较两组个体间的基因表达差异 | 首提个体水平差异表达分析方法，通过汇总每个个体的基因表达分布来比较组间差异，适用于多个体单细胞RNA测序数据 | 未提及具体局限性 | 开发一种统计方法，以识别两组个体之间差异表达的基因 | 自闭症患者与对照组、轻症与重症COVID-19患者的单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 自闭症、COVID-19 | 单细胞RNA测序 | 统计模型 | 基因表达数据 | 未提及具体样本量 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | NA |
| 1508 | 2026-08-24 |
Endothelial cell diversity: the many facets of the crystal
2024-08, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.16660
PMID:36266750
|
综述 | 本文综述了内皮细胞在不同器官和病理条件下的分子异质性，探讨其多样性及其功能意义 | 利用单细胞RNA测序、谱系追踪和交叉遗传学等先进技术，全面揭示了内皮细胞在时间和空间上的分子与功能异质性，突破了传统对内皮细胞仅具有交换功能的认知 | 未提及具体局限性 | 阐明内皮细胞在不同器官和血管床中的分子异质性及其在生理和病理条件下的作用 | 内皮细胞 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序、谱系追踪、交叉遗传学 | NA | 基因表达数据、表观基因组数据、蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1509 | 2026-08-24 |
Single-cell RNA transcriptome analysis of CNS immune cells reveals CXCL16/CXCR6 as maintenance factors for tissue-resident T cells that drive synapse elimination
2022-Sep-24, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-022-01111-0
PMID:36153630
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析小鼠西尼罗病毒恢复期前脑中的免疫细胞，揭示CXCL16/CXCR6信号通路在维持组织驻留T细胞和驱动突触消除中的作用 | 首次鉴定CXCL16/CXCR6趋化因子信号通路作为小胶质细胞和CD8+ T细胞之间的相互作用连接，调控病毒恢复后中枢神经系统中组织驻留记忆T细胞的维持和突触消除 | 研究仅在小鼠模型中开展，临床转化需进一步验证；未完全阐明CXCL16/CXCR6调控T细胞功能的分子机制 | 探究中枢神经系统免疫细胞间的相互作用，特别是T细胞与小胶质细胞之间的信号通路，以理解病毒感染后认知功能障碍的机制 | 小鼠西尼罗病毒恢复期的前脑免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 西尼罗病毒感染的神经系统后遗症 | 单细胞RNA测序 | 聚类分析、差异基因分析 | 单细胞转录组数据 | 小鼠前脑免疫细胞（未提供具体数量） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1510 | 2026-08-23 |
Single-cell RNA sequencing reveals dysregulation of innate immune signaling in early-life respiratory syncytial virus infection with subsequent low-level cadmium exposure
2026-Dec, Toxicology reports
DOI:10.1016/j.toxrep.2026.102325
PMID:42620461
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探讨了早期呼吸道合胞病毒感染联合低剂量镉暴露对小鼠肺部免疫信号失调的影响。 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了eRSV与低剂量镉共暴露下肺泡巨噬细胞中mTORC1信号激活及半乳糖凝集素-9信号增强的机制。 | 未明确提及，推测可能包括样本量限制或机制验证不足。 | 鉴定eRSV联合低剂量镉暴露下的响应细胞群体和新的分子靶点。 | 小鼠肺组织样本 | 单细胞转录组学 | 呼吸道合胞病毒感染 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 单细胞基因表达数据 | 未明确提及具体数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1511 | 2026-08-23 |
Lung Cancer Patients Display Increased Expression of Bovine Meat and Milk Factor (BMMF) Proteins in Peritumor Alveolar Macrophages
2026-Oct-15, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.70574
PMID:42226376
|
研究论文 | 本研究通过免疫组化、共免疫荧光、质谱和单细胞RNA测序等技术，发现肺癌患者肿瘤周围肺泡巨噬细胞中牛类肉奶因子（BMMF）蛋白表达增加，且与吸烟无关，提示BMMF可能是肺癌的独立生物标志物和潜在驱动因素 | 首次在肺癌患者肿瘤周围巨噬细胞中检测到BMMF蛋白表达，揭示了其与吸烟状态无关的特性，并通过单细胞RNA测序发现BMMF巨噬细胞具有促癌的M2样表型，为肺癌的预防和治疗提供了新靶点 | 研究样本量较小（肺癌患者35例，对照组19例），且未明确BMMF与肺癌因果关系的直接证据，需进一步验证其作为早期检测标志物的临床应用价值 | 探究BMMF蛋白在肺癌中的表达情况及其作为吸烟无关生物标志物和潜在驱动因素的作用 | 肺癌患者和良性错构瘤患者的肿瘤及肿瘤周围组织中的肺泡巨噬细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 免疫组织化学, 共免疫荧光显微镜, 免疫检测/质谱, 基因组/转录组学筛查, 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本, 图像 | 肺癌患者35例，癌症无关个体19例（组织邻近良性错构瘤） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 1512 | 2026-08-23 |
Disruption of progesterone synthesis by PBDEs: Potent inhibition of human and rat placental 3β-hydroxysteroid dehydrogenase by the metabolite 4-Bromodiphenyl ether
2026-Oct, Toxicology and applied pharmacology
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.taap.2026.117989
PMID:42571812
|
研究论文 | 本研究探讨了多溴联苯醚及其代谢物BDE3对人胎盘3β-羟基类固醇脱氢酶的抑制作用及其机制 | 首次揭示了BDE3作为人胎盘3β-HSD1和鼠胎盘3β-HSD4的强效混合/竞争性抑制剂，并通过分子对接、网络毒理学和单细胞RNA测序综合分析其作用和影响 | 研究主要基于体外酶学分析和计算预测，缺乏体内实验验证 | 评估PBDEs及其代谢物对胎盘孕酮合成关键酶3β-HSD的抑制作用及潜在不良妊娠结局的风险 | 人胎盘3β-HSD1和鼠胎盘3β-HSD4酶 | 计算生物学 | 先兆子痫 | 酶活性分析, 分子对接, 分子动力学模拟, 单细胞RNA测序 | NA | 酶动力学数据, 分子结构数据, 单细胞基因表达数据 | 8种PBDE同系物和结构类似物BDP | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1513 | 2026-08-23 |
Bisphenol a exposure induces low back pain associated with intervertebral disc degeneration via BIRC3-mediated nucleus pulposus cell senescence
2026-Oct, Toxicology and applied pharmacology
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.taap.2026.117938
PMID:42413735
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研究论文 | 本研究通过流行病学分析、机器学习、单细胞RNA测序及体外实验，评估双酚A暴露与下背痛的相关性，并揭示其通过BIRC3介导的髓核细胞衰老促进椎间盘退变的分子机制 | 首次将BPA暴露与下背痛联系起来，并阐明BPA通过BIRC3/p53通路诱导髓核细胞衰老的机制，提出BIRC3作为潜在治疗靶点 | 研究未明确提及局限性，可能包括样本来源单一、体外实验的局限性等 | 评估BPA暴露与下背痛的相关性，并探讨其通过加速椎间盘退变发挥作用的分子机制 | 双酚A暴露、下背痛、椎间盘退变、髓核细胞 | 机器学习 | 椎间盘退变、下背痛 | 单细胞RNA测序 | 机器学习框架 | 流行病学数据、单细胞转录组数据、体外实验数据 | 1163名受试者（流行病学分析） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1514 | 2026-08-23 |
Systemic acquired resistance: an emerging role for jasmonates in local signal biogenesis, translocation and distal signal decoding
2026-Sep, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.71405
PMID:42402696
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综述 | 本文综述了系统性获得性抗性中茉莉酸在局部信号产生、转运和远端信号解码中的新兴作用 | 揭示了茉莉酸、钙、活性氧和电信号作为早期启动因子和长距离信号传播因子的集体重要性，并强调了它们在植物间通讯中的作用 | 未提及具体局限性 | 总结并强调茉莉酸在系统性获得性抗性中的关键作用及其与其它信号分子的协作 | 植物 | 植物免疫学 | 植物病害 | 单细胞转录组学、共聚焦成像、电信号检测 | NA | 图像、转录组数据 | 不适用（综述文章） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1515 | 2026-08-23 |
Patient-Derived Organoid and Single-Cell Multiomics Reveal Evolution Driven by CEACAM6/KRT19-Mediated Heterogeneity
2026-Aug-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202600610R
PMID:42622615
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研究论文 | 通过患者来源的结直肠癌类器官和单细胞多组学分析，揭示CEACAM6/KRT19介导的肿瘤异质性驱动的化疗耐药演化机制 | 首次在中国人群中建立包含17例患者来源结直肠癌类器官的生物库，并结合单细胞转录组学与多组学框架，鉴定出CEACAM6和KRT19作为死亡率与瘤内异质性的双重调控因子 | 研究样本量有限，且未明确提及跨人群验证或临床干预实验 | 探索结直肠癌化疗耐药的分子机制，并基于瘤内异质性量化提出精准治疗策略 | 来自中国人群的17例治疗初治结直肠癌手术标本及其患者来源类器官，以及TCGA-COAD队列的378例样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组学 | 机器学习共识算法 | 基因表达数据 | 17例患者来源类器官和378例TCGA-COAD样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1516 | 2026-08-23 |
Unveiling the Immune Mechanisms of Hypertension With Single-Cell Transcriptome-Wide Mendelian Randomization
2026-Aug-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202600899R
PMID:42622622
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研究论文 | 利用单细胞转录组范围的孟德尔随机化揭示高血压的免疫机制 | 整合单细胞eQTL与孟德尔随机化和共定位分析，提供细胞类型特异性因果证据，并构建分层框架优先排序治疗靶点，评估药物可用性和脱靶效应 | 未提及 | 揭示高血压的免疫学病因并识别潜在的治疗靶点 | 14种免疫细胞亚群中的基因表达与高血压及其并发症 | 自然语言处理 | 高血压 | eQTL分析、孟德尔随机化、共定位分析、单细胞转录组 | NA | 基因表达数据、遗传变异数据 | OneK1K（14种免疫细胞亚群）、FinnGen和UK Biobank（高血压及并发症） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1517 | 2026-08-23 |
LC-MS-Guided Identification of Bioactive Constituents in Qingfei Jiedu Huatan Formula Reveals Ginsenoside Rb1 as an Endothelial Barrier-Protective Compound Targeting PAI-1 in Pneumonia
2026-Aug-22, Phytochemical analysis : PCA
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/pca.70087
PMID:42630101
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研究论文 | 本研究通过LC-MS和单细胞RNA测序等技术，鉴定清肺解毒化痰方中的活性成分人参皂苷Rb1，其通过靶向PAI-1保护肺炎中的内皮屏障功能 | 整合LC-MS血清药物化学与单细胞RNA测序，首次揭示人参皂苷Rb1通过靶向PAI-1恢复VE-钙黏蛋白介导的内皮连接完整性，为中药复方作用机制提供新视角 | 未在人类临床样本中验证，且PAI-1作为靶点的体内机制仍需更深入的研究 | 探究清肺解毒化痰方对重症肺炎肺血管内皮屏障功能障碍的保护作用及机制 | 肺炎小鼠模型、LPS诱导的HUVEC内皮屏障损伤模型 | 数字病理学 | 肺炎 | LC-MS, 单细胞RNA测序 | NA | 图像、文本 | 小鼠模型及HUVEC细胞模型，具体样本数未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 1518 | 2026-08-23 |
Application and Single-Cell Regulation Mechanism of Engineered EVs Combined With 4D-Printed Hydrogel for Infected Burn Repair
2026-Aug-21, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.77141
PMID:42627293
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研究论文 | 本研究开发了FGF2修饰的细胞外囊泡结合4D打印水凝胶系统，用于感染性烧伤修复，并通过单细胞RNA测序揭示了其调控皮肤再生的机制 | 首次将FGF2修饰的细胞外囊泡与4D打印水凝胶结合，用于感染性烧伤修复，并利用单细胞RNA测序揭示了其通过激活PI3K-Akt信号通路和促进KGF阳性成纤维细胞与KGFR阳性角质形成细胞间通讯的调控机制 | 未提及 | 开发一种新型的感染性烧伤修复方法，通过重建烧伤组织微环境和恢复细胞间通讯来促进皮肤再生 | 人脂肪间充质干细胞来源的细胞外囊泡、成纤维细胞、角质形成细胞以及烧伤小鼠模型 | 数字病理学、单细胞测序 | 烧伤 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 单细胞转录组数据、图像数据 | 未提及具体数量 | 未提及 | 单细胞RNA-seq | 未提及 | 未提及 |
| 1519 | 2026-08-23 |
Macrophage PABPC4-SPP1 Axis Orchestrates Immunosuppression in Colorectal Cancer
2026-Aug-21, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.77361
PMID:42627331
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研究论文 | 发现巨噬细胞中PABPC4-SPP1轴促进结直肠癌免疫抑制，靶向该轴具治疗潜力 | 首次揭示PABPC4-SPP1轴在巨噬细胞中的功能，即通过直接结合SPP1 mRNA 3'UTR稳定其表达，促进免疫抑制和肿瘤进展，为癌症治疗提供新靶点 | 尚需进一步阐明PABPC4-SPP1轴在其他癌症中的普适性，以及临床转化中靶向该轴的可行性和安全性 | 阐明PABPC4在巨噬细胞中的功能及其在肿瘤免疫抑制中的作用机制 | 结直肠癌、黑色素瘤和卵巢癌小鼠模型及人结直肠癌组织 | 癌症免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组测序 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 多种癌症小鼠模型及人类结直肠癌组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 1520 | 2026-08-23 |
Correction to "Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Heterogeneity in Differentiation Trajectory and Tumor Microenvironment Leading to More Aggressive Phenotypes of Papillary Thyroid Cancer in Children and Young Adult Patients"
2026-Aug-21, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.77252
PMID:42627634
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