单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 24273 篇文献，本页显示第 1501 - 1520 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1501 | 2024-12-01 |
Granzyme K+CD8+ T cells interact with fibroblasts to promote neutrophilic inflammation in nasal polyps
2024-Nov-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54685-1
PMID:39614076
|
研究论文 | 研究了鼻息肉中GZMK+CD8+ T细胞与成纤维细胞的相互作用，揭示了其促进中性粒细胞炎症的机制 | 首次发现GZMK+CD8+ T细胞通过表达CXCR4与CXCL12分泌的成纤维细胞相互作用，诱导后者产生中性粒细胞趋化因子，从而促进中性粒细胞炎症 | 研究仅限于鼻息肉和相关炎症疾病，未探讨其他疾病中的潜在作用 | 探讨鼻息肉中中性粒细胞炎症的机制 | GZMK+CD8+ T细胞与成纤维细胞的相互作用 | 免疫学 | 鼻窦炎 | 单细胞分析、空间转录组学、T细胞受体测序 | NA | 细胞 | 未明确提及具体样本数量 |
| 1502 | 2024-12-01 |
Integrative mapping of human CD8+ T cells in inflammation and cancer
2024-Nov-29, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02530-0
PMID:39614111
|
研究论文 | 介绍了一种基于深度学习的模型scAtlasVAE，用于整合大规模单细胞RNA测序数据和跨图谱比较，构建了广泛的人类CD8+ T细胞图谱 | 提出了scAtlasVAE模型，能够整合大规模单细胞RNA测序数据，并成功建立了不同细胞亚型之间的联系，揭示了其表型和功能转变 | NA | 全面理解人类CD8+ T细胞在炎症和癌症中的克隆景观和动态变化 | 人类CD8+ T细胞在炎症和癌症中的表型多样性 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | VAE | RNA测序数据 | 1,151,678个细胞，来自68项研究的961个样本，涵盖42种疾病条件 |
| 1503 | 2024-12-01 |
Human CD8+ T cell map with single-cell transcriptome and TCR information
2024-Nov-29, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02529-7
PMID:39614112
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1504 | 2024-12-01 |
Single-cell multiomics reveals simvastatin inhibits pan-cancer epithelial-mesenchymal transition via the MEK/ERK pathway in XBP1+ mast cells
2024-Nov-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-80858-5
PMID:39604504
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研究论文 | 研究通过单细胞多组学分析，揭示辛伐他汀通过MEK/ERK通路抑制泛癌种上皮-间质转化（EMT）在XBP1+肥大细胞中的作用 | 首次揭示辛伐他汀通过抑制XBP1+肥大细胞中的MEK/ERK信号通路，逆转泛癌种中的EMT过程 | 研究主要基于体外实验验证，缺乏体内实验数据支持 | 探讨肥大细胞在肿瘤微环境中的作用及其在系统治疗中的潜在靶点 | 肥大细胞及其在泛癌种转移中的作用 | 数字病理学 | 泛癌种 | 单细胞测序 | WGCNA和12种机器学习算法 | 单细胞数据 | 泛癌种转移的单细胞测序数据 |
| 1505 | 2024-12-01 |
Elevated serum and urinary secreted protein acidic and rich in cysteine levels are novel biomarkers of kidney fibrosis severity
2024-Nov-28, Archives of medical research
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.arcmed.2024.103125
PMID:39612526
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研究论文 | 研究探讨了血清和尿液中SPARC水平作为肾纤维化严重程度的新型生物标志物的诊断价值 | 首次发现血清和尿液中SPARC水平与肾纤维化严重程度相关，并验证了其在非侵入性诊断中的潜力 | 研究样本量有限，且仅限于慢性肾病患者，未来需在更大样本和不同疾病阶段进行验证 | 探索SPARC在血清和尿液中作为肾纤维化生物标志物的诊断价值 | 慢性肾病患者的肾纤维化程度 | NA | 慢性肾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 674名慢性肾病患者 |
| 1506 | 2024-12-01 |
BOP1: A pivotal prognostic biomarker in clear cell renal cell carcinoma uncovered through integrated bulk and single-cell sequencing
2024-Nov-28, Asian journal of surgery
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.asjsur.2024.10.159
PMID:39613603
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1507 | 2024-12-01 |
Advancing toward a unified eosinophil signature from transcriptional profiling
2024-Nov-27, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiae188
PMID:39213186
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研究论文 | 本文总结了先前在血液和组织中对小鼠和人类嗜酸性粒细胞进行的转录组研究，并讨论了各种方法的优缺点 | 本文提出了一个统一的嗜酸性粒细胞转录特征，并讨论了未来研究的机会和知识空白 | 本文主要总结了现有研究，未提供新的实验数据 | 旨在推进嗜酸性粒细胞生物学研究，并促进跨研究比较 | 小鼠和人类的嗜酸性粒细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、微阵列 | NA | 转录组数据 | 涉及小鼠和人类样本，具体数量未提及 |
| 1508 | 2024-12-01 |
Recruitment of homodimeric proneural factors by conserved CAT-CAT E-boxes drives major epigenetic reconfiguration in cortical neurogenesis
2024-Nov-27, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae950
PMID:39494521
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研究论文 | 研究探讨了在皮质神经发生过程中，同源二聚体前神经因子通过保守的CAT-CAT E-box驱动主要表观遗传重构的机制 | 首次全面分析了NEUROG2和NEUROD2在神经发生中间阶段的染色质重塑机制，并揭示了CAT-CAT E-box在DNA去甲基化和进化约束中的重要作用 | 研究主要基于小鼠皮质数据，未来需在其他物种和不同神经发育阶段进行验证 | 探讨前神经因子在皮质神经发生中的表观遗传调控机制 | NEUROG2和NEUROD2前神经因子及其在神经发生中的作用 | 表观遗传学 | 神经精神疾病 | 染色质免疫沉淀测序（ChIP-seq）、单细胞RNA测序（RNA-seq）、ATAC-seq、DNA甲基化测序 | NA | 基因组数据 | 小鼠皮质发育过程中的多个时间点样本 |
| 1509 | 2024-12-01 |
Functional profiling of murine glioma models highlights targetable immune evasion phenotypes
2024-Nov-27, Acta neuropathologica
IF:9.3Q1
DOI:10.1007/s00401-024-02831-w
PMID:39592459
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研究论文 | 研究通过功能基因筛选和单细胞转录组学分析，揭示了小鼠胶质瘤模型中的免疫逃逸机制 | 通过CRISPR基因编辑和机器学习方法，识别了三种关键的癌症内在逃逸机制，并发现了与人类胶质母细胞瘤相似的依赖性 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步验证在人类患者中的适用性 | 探讨小鼠胶质瘤模型中的免疫逃逸机制，并寻找潜在的治疗靶点 | 小鼠胶质瘤模型GL261和CT2A，以及人类胶质母细胞瘤 | 数字病理学 | 脑癌 | CRISPR基因编辑、单细胞转录组学、机器学习 | 机器学习 | 基因数据、转录组数据 | 两个小鼠胶质瘤模型（GL261和CT2A），多种免疫细胞（细胞毒性T细胞、自然杀伤细胞、巨噬细胞） |
| 1510 | 2024-12-01 |
Sele-targeted siRNA liposome nanoparticles inhibit pathological scars formation via blocking the cross-talk between monocyte and endothelial cells: a preclinical study based on a novel mice scar model
2024-Nov-27, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-024-03003-4
PMID:39593088
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研究论文 | 研究开发了一种新型小鼠瘢痕模型，并通过RNA测序和单细胞测序分析，揭示了机械张力和慢性炎症在病理性瘢痕形成中的关键作用，同时开发了靶向E-选择素（Sele）的siRNA脂质体纳米颗粒（LNPs），有效抑制了瘢痕形成 | 首次开发了一种新型小鼠瘢痕模型（Retroflex Scar Model, RSM），并利用该模型揭示了机械张力和慢性炎症在病理性瘢痕形成中的关键作用，同时开发了靶向E-选择素的siRNA脂质体纳米颗粒（LNPs），为预防病理性瘢痕提供了新的治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证其有效性和安全性 | 探讨病理性瘢痕形成机制，并开发新的治疗策略 | 小鼠瘢痕模型、E-选择素（Sele）、siRNA脂质体纳米颗粒（LNPs） | NA | 创伤和烧伤并发症 | RNA测序、单细胞测序、Western blotting、免疫荧光、共免疫沉淀 | NA | RNA、蛋白质 | 小鼠模型、人类病理性瘢痕（Keloid）样本 |
| 1511 | 2024-12-01 |
Single-cell transcriptome analysis reveals CD34 as a marker of human sinoatrial node pacemaker cardiomyocytes
2024-Nov-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54337-4
PMID:39604360
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析揭示了CD34作为人类窦房结起搏心肌细胞的标志物 | 首次报道了CD34作为窦房结起搏细胞的细胞表面标志物，并展示了其在干细胞分化培养中对窦房结细胞的富集作用 | NA | 揭示人类窦房结的细胞和分子组成，特别是寻找窦房结起搏细胞的细胞表面标志物 | 人类窦房结起搏心肌细胞及其标志物 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞/单核RNA测序 | NA | 转录组数据 | 胎儿和人类多能干细胞衍生的窦房结细胞 |
| 1512 | 2024-12-01 |
SLC2A3 promotes head and neck squamous cancer developing through negatively regulating CD8+ T cell in tumor microenvironment
2024-11-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-79417-9
PMID:39604419
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研究论文 | 研究探讨了SLC2A3在头颈部鳞状细胞癌（HNSC）中的作用及其对肿瘤微环境中CD8+ T细胞的影响 | 首次揭示了SLC2A3在HNSC中的预后意义及其通过抑制CD8+ T细胞促进肿瘤发展的机制 | 研究主要基于TCGA数据库和单细胞RNA测序数据，缺乏体内实验验证 | 探讨SLC2A3在头颈部鳞状细胞癌中的预后意义及其对肿瘤微环境中免疫细胞的影响 | SLC2A3基因、CD8+ T细胞、头颈部鳞状细胞癌患者 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序、磁激活细胞分选、流式细胞术、基因集富集分析、Western blot | NA | 基因表达数据、单细胞数据 | 504名头颈部鳞状细胞癌患者 |
| 1513 | 2024-12-01 |
Single-cell RNA sequencing reveals multiple immune cell subpopulations promote the formation of abnormal bone microenvironment in osteoporosis
2024-11-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-80993-z
PMID:39604551
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序揭示了多种免疫细胞亚群在骨质疏松症中异常骨微环境形成中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了骨质疏松症中多种免疫细胞亚群及其在异常骨微环境形成中的作用 | 研究仅限于单细胞RNA测序数据分析，缺乏体内实验验证 | 识别促进骨质疏松症发展的免疫细胞亚群，为新疗法的开发提供基础 | 骨质疏松症中的免疫细胞亚群及其在异常骨微环境形成中的作用 | 数字病理学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个样本 |
| 1514 | 2024-12-01 |
Proximal tubule cell maturation rate and function are controlled by PPARα signaling in kidney organoids
2024-Nov-27, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-07069-6
PMID:39604738
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研究论文 | 研究了PPARα信号在肾脏类器官中近端小管细胞成熟率和功能中的作用 | 揭示了PPARα信号在近端小管细胞成熟中的关键作用，并提出了一种促进近端小管细胞成熟的方法 | NA | 探索肾脏类器官中近端小管细胞的成熟机制，并开发促进其成熟的方法 | 人多能干细胞衍生的肾脏类器官中的近端小管细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 时间序列的肾脏类器官样本 |
| 1515 | 2024-12-01 |
Zinc Ions Facilitate Metabolic Bioenergetic Recovery Post Spinal Cord Injury by Activating Microglial Mitophagy through the STAT3-FOXO3a-SOD2 Pathway
2024-Nov-27, Free radical biology & medicine
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研究论文 | 研究锌离子通过STAT3-FOXO3a-SOD2通路激活小胶质细胞自噬，促进脊髓损伤后的代谢和生物能量恢复 | 揭示了锌离子通过STAT3-FOXO3a-SOD2轴调控线粒体基因表达，改善小胶质细胞代谢功能，为脊髓损伤治疗提供了新的靶点 | NA | 探讨锌离子在脊髓损伤后通过激活小胶质细胞自噬促进代谢恢复的机制 | 脊髓损伤后的小胶质细胞代谢功能 | NA | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 1516 | 2024-12-01 |
Defective ribosome assembly impairs leukemia progression in a murine model of acute myeloid leukemia
2024-Nov-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114864
PMID:39412990
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研究论文 | 研究探讨了核糖体组装在急性髓系白血病（AML）中的作用及其对白血病进展的影响 | 揭示了核糖体组装缺陷可以延长AML小鼠模型的生存期，并展示了其在p53缺陷型AML中的抗白血病效果 | NA | 探讨核糖体组装在白血病细胞功能中的作用，并评估其作为AML治疗靶点的潜力 | 急性髓系白血病（AML）患者数据和鼠类模型 | NA | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序和蛋白质组分析 | NA | RNA和蛋白质数据 | 包含AML患者数据和鼠类模型 |
| 1517 | 2024-12-01 |
Interleukin-1β modulates lymphoid differentiation of Flt3-positive multipotent progenitors after transplantation
2024-Nov-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114890
PMID:39425929
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研究论文 | 研究探讨了IL-1β在移植后调节Flt3阳性多能祖细胞淋巴分化中的作用 | 首次揭示了IL-1β在促进B淋巴生成中的未被认识的功能，并强调了IL-1β在调节MPP细胞命运动态中的潜在作用 | NA | 研究IL-1β在移植后调节多能祖细胞淋巴分化中的机制 | Flt3阳性多能祖细胞（MPPs）及其淋巴分化 | NA | NA | 单细胞RNA测序（RNA-seq） | NA | RNA | 小鼠多能祖细胞（MPPs） |
| 1518 | 2024-12-01 |
Spatial, transcriptomic, and epigenomic analyses link dorsal horn neurons to chronic pain genetic predisposition
2024-Nov-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114876
PMID:39453813
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研究论文 | 本文通过多物种方法研究了背角神经元在慢性疼痛遗传易感性中的作用 | 首次将背角神经元的转录组和表观基因组与慢性疼痛的遗传变异联系起来 | NA | 探讨慢性疼痛的遗传变异是否影响背角神经元的调控基因组 | 背角神经元及其在慢性疼痛中的作用 | 数字病理学 | 慢性疼痛 | 单核RNA测序 (snRNA-seq)、空间转录组学、单核开放染色质图谱 | NA | 转录组数据、表观基因组数据 | 包括猕猴、人类和小鼠的数据集 |
| 1519 | 2024-12-01 |
scRNA-seq revealed transcriptional signatures of human umbilical cord primitive stem cells and their germ lineage origin regulated by imprinted genes
2024-11-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-79810-4
PMID:39587190
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示了人类脐带原始干细胞及其生殖系起源的转录特征，这些特征受印记基因调控 | 首次通过单细胞RNA测序技术展示了从脐带血中纯化的人类VSELs的分子特征，并发现其与小鼠骨髓来源的VSELs具有相似的转录特征 | 研究仅限于脐带血中的VSELs，未涉及其他组织来源的VSELs | 探讨人类脐带原始干细胞及其生殖系起源的转录特征及其受印记基因调控的机制 | 人类脐带血中的VSELs及其转录特征 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 脐带血中的VSELs样本 |
| 1520 | 2024-12-01 |
Spatial transcriptomics reveals substantial heterogeneity in triple-negative breast cancer with potential clinical implications
2024-Nov-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54145-w
PMID:39592577
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研究论文 | 研究使用空间转录组学技术分析了三阴性乳腺癌的肿瘤组织结构和细胞组成 | 首次结合组织形态学和空间转录组学对三阴性乳腺癌的肿瘤微环境进行深入分析，并识别出与疾病预后和免疫治疗反应相关的基因特征 | NA | 探讨三阴性乳腺癌的空间异质性及其临床意义 | NA | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 92名患者 |