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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1501 | 2026-10-04 |
eNAMPT Is a Novel DAMP and Therapeutic Target in Human and Murine Pulmonary Fibrosis
2025-10, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2024-0342OC
PMID:40126452
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研究论文 | 本研究探讨了eNAMPT作为人类和小鼠肺纤维化中的新型DAMP和治疗靶点,使用eNAMPT中和抗体ALT-100在IPF患者样本和博来霉素诱导的小鼠肺纤维化模型中进行验证 | 首次将eNAMPT确定为人类和小鼠肺纤维化中的新型DAMP和治疗靶点,并证明eNAMPT中和抗体ALT-100可逆转博来霉素诱导的肺泡2型上皮扩张及内皮细胞和上皮细胞向间充质/肌成纤维细胞的转变 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 研究eNAMPT作为人类和临床前IPF可成药靶点的潜力,评估eNAMPT中和抗体ALT-100的治疗效果 | IPF患者的血液、外周血单个核细胞和肺组织,以及C57Bl6小鼠博来霉素诱导的肺纤维化模型 | 数字病理学 | 肺纤维化 | bulk RNA-seq, single-cell RNA sequencing | NA | 文本, 图像 | IPF患者和C57Bl6小鼠的血液、PBMCs和肺组织样本 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1502 | 2026-10-04 |
Integrative single-cell RNA-seq and ATAC-seq identifies transcriptional and epigenetic blueprint guiding osteoclastogenic trajectory
2025-09-28, Journal of bone and mineral research : the official journal of the American Society for Bone and Mineral Research
IF:5.1Q1
DOI:10.1093/jbmr/zjaf084
PMID:40577680
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研究论文 | 该研究整合单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、批量RNA测序和ChIP测序,揭示了破骨细胞分化轨迹的转录和表观遗传蓝图 | 首次在单细胞分辨率下整合多组学数据全面定义破骨细胞生成的调控景观,发现IRF8作为破骨细胞生成的负调控主控因子,维持单核细胞身份并限制破骨细胞生成位点的染色质可及性 | 研究主要基于小鼠模型,需要在人类样本中进一步验证;IRF8作为治疗靶点的转化应用潜力尚需进一步研究 | 全面定义破骨细胞生成的调控景观,揭示塑造破骨细胞生成潜能的转录和表观遗传机制 | 野生型和IRF8条件性敲除小鼠的造血干细胞和祖细胞、常见单核细胞祖细胞及成熟单核细胞 | 机器学习 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、批量RNA测序、ChIP测序 | NA | 文本、图像 | 野生型和IRF8条件性敲除小鼠的骨髓细胞 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 1503 | 2026-10-04 |
Pro-inflammatory immune microenvironment and Thrombospondin-1-positive monocytes as drivers of osteoclastogenesis in postmenopausal osteoporosis
2025-08-24, Journal of bone and mineral research : the official journal of the American Society for Bone and Mineral Research
IF:5.1Q1
DOI:10.1093/jbmr/zjaf083
PMID:40515615
|
研究论文 | 通过对绝经后骨质疏松症患者骨髓细胞进行单细胞RNA测序,揭示炎症性免疫微环境及THBS1阳性单核细胞在破骨细胞生成中的驱动作用 | 首次对绝经后骨质疏松症患者骨髓微环境进行详细的单细胞转录组表征,鉴定出3个具有破骨细胞生成潜能的单核细胞亚群(THBS1+CCL20+、THBS1+LRP1+、THBS1+C1QA+),并发现靶向THBS1可显著减少小鼠模型中的骨丢失 | 样本量较小(10例患者和10例对照),需要在更大队列中验证;主要基于单细胞转录组数据,功能验证仍有限 | 表征绝经后骨质疏松症骨髓细胞的异质性,鉴定关键的破骨细胞生成通路及潜在治疗靶点 | 绝经后骨质疏松症患者的骨髓细胞及PMOP小鼠模型 | 单细胞转录组学 | 绝经后骨质疏松症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、组织学图像 | 10例PMOP患者和10例对照,共93 867个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1504 | 2026-10-04 |
Protocol for single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics of bladder Ewing sarcoma
2025-03-21, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.103687
PMID:40067823
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研究方案 | 本文介绍了膀胱尤文肉瘤组织单细胞RNA测序和空间转录组测序的实验方案,包括样本采集、单细胞分离和测序步骤 | 首次针对膀胱尤文肉瘤提供单细胞RNA测序和空间转录组测序的完整实验方案 | 文中未明确说明该方案的局限性 | 提供从膀胱尤文肉瘤组织获取高质量单细胞和空间转录组数据的实验方案 | 膀胱尤文肉瘤组织 | 单细胞组学、空间转录组学 | 膀胱尤文肉瘤 | 单细胞RNA测序、空间转录组测序 | NA | 图像、文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium、10x Visium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒、10x Visium空间转录组 |
| 1505 | 2026-10-04 |
Protocol for isolating the single bacteriocyte from whiteflies for single-cell RNA-seq analysis
2025-03-21, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.103691
PMID:40073021
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研究方法 | 本文提出了一种从烟粉虱中分离单个含菌细胞用于单细胞RNA-seq分析的实验方案 | 针对含菌细胞在单个烟粉虱中数量极少、难以获得足够样本进行转录组测序的难题,提供了便捷高效的单个含菌细胞分离与单细胞测序方案,并具有推广至其他昆虫细胞的潜力 | 摘要未提及该方案的局限性 | 建立从烟粉虱中分离单个含菌细胞并进行单细胞RNA-seq分析的实验流程 | 烟粉虱的含菌细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1506 | 2026-10-04 |
Protocol for interpretable and context-specific single-cell-informed deconvolution of bulk RNA-seq data
2025-03-21, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.103670
PMID:40042970
|
研究方法 | 本文提出了一种利用PLIER算法从批量RNA测序数据中提取单细胞相关信息的可解释性方案,包括从文献中提取单细胞特征、训练基于单细胞特征的PLIER模型(称为CLIER)并应用于新数据集 | 使用通路水平信息提取器(PLIER)算法训练基于单细胞特征的CLIER模型,使批量RNA-seq数据的解卷积结果在特定单细胞生物学背景下具有可解释性 | 单细胞测序成本高且数据输出复杂,限制了其临床应用;本方案依赖于从文献中提取的单细胞特征 | 从批量RNA-seq数据中提取单细胞相关信息,实现可解释且上下文特异的解卷积 | 批量RNA-seq数据 | 机器学习 | NA | 批量RNA-seq | PLIER | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1507 | 2026-10-04 |
Spatial-Temporal Diversity of Extrachromosomal DNA Shapes Urothelial Carcinoma Evolution and Tumor Immune Microenvironment
2025-03-11, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-24-1532
PMID:40062518
|
研究论文 | 该研究通过全基因组测序和单细胞RNA测序分析尿路上皮癌中染色体外DNA的时空多样性及其对肿瘤演化和免疫微环境的影响 | 揭示了ecDNA通过结构重排驱动尿路上皮癌克隆演化,促进多灶性和瘤内异质性,并发现ecDNA+恶性细胞通过下调MHC I类分子逃逸T细胞免疫,同时证明尿液沉渣DNA测序可高特异性检测ecDNA | 未明确说明 | 探究ecDNA在尿路上皮癌中的时空多样性及其对肿瘤演化和免疫微环境的作用 | 595例尿路上皮癌患者的全基因组测序数据及肿瘤多区域采样和单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 尿路上皮癌 | 全基因组测序, 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 文本 | 595例尿路上皮癌患者 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1508 | 2026-10-04 |
A single-cell transcriptomic atlas of developing inhibitory neurons reveals expanding and contracting modes of diversification
2025-Feb-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.19.636192
PMID:40027755
|
研究论文 | 该研究通过开发计算流程富集稀有细胞类型,构建了小鼠SST+抑制性神经元发育单细胞转录组图谱,揭示了三种多样化模式 | 开发了跨数据集富集和整合稀有细胞类型的计算流程;构建了包含超过51,000个SST+神经元的Dev-SST-Atlas资源;发现了SST+神经元多样化的三种不同模式——不变、扩张和收缩;揭示了瞬时LRP类型在人胎儿皮层中保守存在 | 数据仅来自小鼠模型,人类数据有限;依赖已有scRNA-seq数据集可能引入批次效应;计算流程的通用性有待在其他细胞类型中验证 | 探究大脑皮层抑制性神经元多样性在发育过程中如何产生 | 小鼠大脑皮层中表达生长抑素(SST+)的抑制性神经元,包括Martinotti细胞、非Martinotti细胞和长距离投射神经元 | 单细胞转录组学,神经科学,发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据(文本/计数矩阵) | 超过51,000个小鼠SST+神经元,涵盖多个发育阶段 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞转录组学 | NA | NA |
| 1509 | 2026-10-04 |
Peripheral nervous system lymphatic vessels: A simple delivery route to promote nerve regeneration
2024-07, Experimental neurology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.expneurol.2024.114783
PMID:38688418
|
研究论文 | 该研究证实了周围神经系统中淋巴管(pLVs)的存在,并揭示了其在神经损伤后促进神经再生的递送途径 | 首次明确周围神经系统中淋巴管的三维结构特征,并通过单细胞测序鉴定出两种特定的淋巴管内皮细胞表型(Rnd1 LECs和Ccl21 LECs),同时动态展示了经淋巴管向周围神经递送的能力 | 未明确说明 | 阐明周围神经系统淋巴管的结构和功能特征,并探索其作为向周围神经递送的替代途径以促进神经再生 | 大鼠、PROX1-EGFP转基因小鼠和人类的周围神经淋巴管 | 神经科学 | 周围神经损伤 | 单细胞测序 | NA | 图像,文本 | 大鼠、PROX1-EGFP转基因小鼠和人类样本(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1510 | 2024-08-07 |
A New Immunological Index for the Elderly: High Proportion of Multiple TCR T Cells Based on scRNA-Seq
2024-05-07, Aging and disease
IF:7.0Q1
DOI:10.14336/AD.2023.0509-1
PMID:38722790
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1511 | 2026-10-04 |
Single-cell transcriptomics reveals the intra-tumoral heterogeneity and SQSTM1/P62 and Wnt/β-catenin mediated epithelial to mesenchymal transition and stemness of triple-negative breast cancer
2024-05-01, Experimental cell research
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.yexcr.2024.114032
PMID:38583856
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术解析三阴性乳腺癌的瘤内异质性,揭示SQSTM1/P62与Wnt/β-catenin介导的上皮-间质转化和干细胞特性 | 首次通过单细胞转录组学揭示TNBC中MSC亚群的EMT标志物和转录因子上调,并发现SQSTM1/P62与Wnt/β-catenin信号通路在TNBC进展中的协同作用,提出联合抑制SQSTM1/P62和Wnt/β-catenin的治疗策略 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 解析三阴性乳腺癌的瘤内异质性,探究SQSTM1/P62和Wnt/β-catenin在EMT和干细胞特性中的作用,开发潜在治疗策略 | 三阴性乳腺癌患者和正常患者来源的样本及间充质干细胞 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1512 | 2026-10-03 |
Comprehensive analysis of the single-cell and transcriptomics uncovers the pathogenic network and potential biomarkers related to hypoxia, metabolic reprogramming and atherosclerosis in obstructive sleep apnoea
2026-Dec, Artificial cells, nanomedicine, and biotechnology
DOI:10.1080/21691401.2026.2730116
PMID:42821729
|
研究论文 | 该研究通过综合分析批量RNA-seq和单细胞RNA-seq数据集,识别阻塞性睡眠呼吸暂停的关键生物标志物,并揭示与缺氧、代谢重编程和动脉粥样硬化相关的致病网络 | 结合WGCNA与多种机器学习方法(随机森林、SVM-RFE、LASSO)识别出四个枢纽基因(C17ORF91、HBEGF、PGBD2、ZNF616)作为候选生物标志物,并通过单细胞RNA-seq揭示cMonocytes在OSA进展中的核心作用及其在缺氧、代谢功能障碍和动脉粥样硬化风险中的最高评分 | 研究结果为假设生成性,枢纽基因的诊断性能为探索性(AUC > 0.7),列线图仅在发现队列中显示良好的内部性能,需要独立外部验证和功能验证 | 识别阻塞性睡眠呼吸暂停的关键生物标志物,并探索与缺氧、代谢重编程和动脉粥样硬化相关的致病网络 | 阻塞性睡眠呼吸暂停患者与对照组的RNA-seq和单细胞RNA-seq数据 | 机器学习 | 阻塞性睡眠呼吸暂停 | RNA-seq,单细胞RNA-seq | 随机森林,SVM-RFE,LASSO | 文本 | RNA-seq数据集GSE75097包含6例对照和42例OSA;单细胞RNA-seq数据集GSE214865包含11例对照和11例OSA | NA | bulk RNA-seq,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1513 | 2026-10-03 |
PD-L1 antibody-induced cardiac dysfunction is regulated by CCR5-positive macrophages
2026-Nov-10, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2026.179333
PMID:42762914
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研究论文 | 该研究通过小鼠模型揭示PD-L1抗体通过CCL5/CCR5轴诱导CCR5阳性巨噬细胞浸润和增殖,导致心脏功能障碍,而CCR5拮抗剂maraviroc可保护心脏而不影响抗肿瘤疗效 | 首次阐明CCL5/CCR5轴是PD-L1抗体诱导早期心脏毒性的核心机制,并证明maraviroc通过免疫调节、代谢重编程和凋亡控制等多效性保护作用预防免疫治疗相关心脏并发症 | 研究仅基于小鼠模型,尚未在人体临床试验中验证maraviroc对PD-L1抗体相关心脏毒性的保护效果 | 系统研究PD-L1抑制的早期心脏毒性效应及其机制,并探索CCR5阻断作为预防免疫治疗相关心脏并发症的策略 | PD-L1抗体治疗的小鼠模型及黑色素瘤荷瘤小鼠 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 空间转录组学, 流式细胞术, 免疫荧光 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1514 | 2026-10-03 |
Targeting the Snail1-ATGL-ferroptosis-EMT axis via AKT-GSK3β signaling: Low-dose colchicine attenuates idiopathic pulmonary fibrosis
2026-Nov-10, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2026.179372
PMID:42785459
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研究论文 | 该研究揭示了低剂量秋水仙碱通过AKT-GSK3β-Snail1信号轴恢复ATGL表达,从而抑制铁死亡驱动的EMT,减轻特发性肺纤维化的新机制 | 首次发现ATGL是调节铁死亡易感性和EMT的上皮检查点,揭示了Snail1通过招募HDAC1/HDAC2抑制ATGL转录的非经典EMT调控机制,并阐明了低剂量秋水仙碱通过AKT-GSK3β-Snail1轴恢复ATGL表达的抗纤维化新机制 | 研究主要基于公共转录组和单细胞RNA测序数据集分析以及博来霉素诱导的小鼠模型和细胞模型,缺乏临床试验数据验证 | 阐明低剂量秋水仙碱对特发性肺纤维化中铁死亡驱动的EMT的影响及其机制,重点研究Snail1-ATGL轴作为调节氧化还原平衡和铁死亡易感性的新通路 | 特发性肺纤维化患者的肺组织及肺泡上皮细胞、博来霉素诱导的肺纤维化小鼠模型、TGF-β刺激的小鼠肺上皮细胞(MLE-12)和人支气管上皮细胞(BEAS-2B) | 机器学习 | 肺纤维化 | 转录组测序,单细胞RNA测序,染色质免疫沉淀,蛋白质相互作用实验 | NA | 文本,图像 | 公共转录组和单细胞RNA测序数据集、博来霉素诱导的小鼠模型、TGF-β刺激的MLE-12和BEAS-2B细胞模型 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1515 | 2026-10-03 |
Comprehensive Multi-Omic Profiling of Desmoplastic Small Round Cell Tumors Identifies Targetable Pathways with Therapeutic Opportunities
2026-Oct-02, Molecular cancer research : MCR
IF:4.1Q2
DOI:10.1158/1541-7786.MCR-25-1134
PMID:42312950
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研究论文 | 本研究通过对五名患者的九份肿瘤活检样本进行多组学分析,全面揭示了促结缔组织增生性小圆细胞肿瘤的可靶向通路及治疗机会 | 首次对促结缔组织增生性小圆细胞肿瘤进行综合性多组学分析,整合了批量与单细胞RNA测序、蛋白质分析、免疫组化、免疫分析及功能性同源重组缺陷检测,发现了缺乏基因组HRD瘢痕特征但具有功能性HRD的肿瘤亚群,并揭示了治疗依赖性的表达和活性变化 | 样本量较小(仅五名患者的九份活检样本),可能限制了研究结果的普遍性;研究为观察性分析,未进行临床试验验证靶向治疗的实际疗效 | 对促结缔组织增生性小圆细胞肿瘤进行深入的多组学表征,识别可靶向的分子特征和患者特异性弱点,为生物标志物指导的治疗策略奠定基础 | 促结缔组织增生性小圆细胞肿瘤患者来源的肿瘤活检样本 | 数字病理学 | 促结缔组织增生性小圆细胞肿瘤 | 批量RNA测序、单细胞RNA测序、蛋白质分析、免疫组化、免疫分析、功能性同源重组缺陷检测 | NA | 转录组数据、蛋白质数据、图像 | 五名患者的九份患者来源肿瘤活检样本 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 1516 | 2026-10-03 |
Macrophage-Induced Senescent Cancer-Associated Fibroblasts Promote SASP-Mediated Chemoresistance in Colorectal Cancer
2026-Oct-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-4870
PMID:42418705
|
研究论文 | 该研究基于单细胞RNA测序数据构建机器学习预测模型识别衰老癌症相关成纤维细胞(sCAF),揭示巨噬细胞来源的IL1B通过IL1B-IL1R1轴诱导CAF衰老,进而通过SASP介导结直肠癌化疗耐药 | 开发了基于机器学习的细胞衰老预测模型用于准确识别sCAF,首次揭示巨噬细胞来源的IL1B通过IL1B-IL1R1相互作用触发CAF衰老,阐明sCAF通过SASP(IL6和CXCL12)介导结直肠癌化疗耐药的新机制 | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 开发机器学习预测模型识别衰老CAF,探究sCAF在结直肠癌化疗耐药中的作用及其诱导机制 | 结直肠癌肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞(CAF)、巨噬细胞及患者来源类器官 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,多重免疫组化 | 机器学习预测模型 | 单细胞RNA测序数据,图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 1517 | 2026-10-03 |
Multiomics Dissection Reveals Natural Killer Cell-CD8+ T-cell Cooperation in Shaping an Immunostimulatory Tumor Microenvironment
2026-Oct-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-4957
PMID:42545372
|
研究论文 | 该研究通过整合空间转录组学、单细胞RNA测序和高维流式细胞术,揭示了在低T细胞浸润肿瘤中自然杀伤细胞与CD8+ T细胞之间的时空协同作用,以及疫苗接种如何重塑肿瘤微环境 | 首次揭示了IRF8+KLRG1+自然杀伤细胞与抗原致敏CXCR3+细胞毒性T淋巴细胞之间的协同程序,发现了CCR5-CCL5和CXCR3-CXCL9信号通路在协调先天性和适应性免疫区室通讯中的作用 | 摘要中未明确说明研究的具体局限性 | 揭示自然杀伤细胞与CD8+ T细胞在塑造免疫刺激性肿瘤微环境中的协同作用机制 | 低T细胞浸润肿瘤中的免疫细胞(自然杀伤细胞、细胞毒性T淋巴细胞、髓系细胞、树突状细胞等) | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学,单细胞RNA测序,高维流式细胞术 | NA | 图像,文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 1518 | 2026-10-03 |
Spatial Transcriptomic Profiling Reveals a Fibroblast-Associated Extracellular Matrix Niche in KRAS G12C-Mutant Lung Adenocarcinoma Primary Tumors From Patients With Metastasis
2026-Oct-02, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.70764
PMID:42823844
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研究论文 | 该研究利用10x Visium空间转录组技术对4例KRAS G12C突变肺腺癌原发肿瘤(2例无转移、2例有转移)进行空间转录组分析,发现与转移相关的成纤维细胞相关细胞外基质生态位 | 首次在KRAS G12C突变肺腺癌原发肿瘤中利用空间转录组揭示与转移状态相关的成纤维细胞相关细胞外基质重塑生态位,并鉴定出由COL1A1、COL1A2、COL3A1、SPARC、POSTN和VCAN组成的基因模块 | 样本量极小(仅4例患者),属于探索性初步研究,TCGA验证和体外功能实验仅提供初步支持,需要在更大规模的空间转录组队列和机制模型中进行验证 | 探究KRAS G12C突变肺腺癌原发肿瘤中伴随转移发生的空间转录组程序 | 4例KRAS G12C突变肺腺癌患者的原发肿瘤组织,其中2例无转移、2例有转移 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据、图像 | 4例KRAS G12C突变肺腺癌原发肿瘤样本,共14,351个空间斑点 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组,结合已发表的NSCLC单细胞图谱进行RCTD解卷积分析 |
| 1519 | 2026-10-03 |
Unraveling the tapestry: Lessons from multi-omics and spatial biology in hepatocellular cancer
2026-Oct-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001716
PMID:41678777
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综述 | 本文综述了空间组学技术(空间转录组学、蛋白质组学、基因组学、表观基因组学、代谢组学)在肝细胞癌研究中的应用,重点阐述了这些技术如何揭示肿瘤微环境的空间组织及其对预后、免疫逃逸和治疗反应的影响 | 强调了空间分辨分析能够揭示传统bulk或单细胞分子分析无法发现的新型癌细胞与基质细胞及实质细胞群体之间的通讯轴,以及空间映射的配体-受体网络所定义的协调信号回路 | 作为一篇综述,本文未提供原始实验数据,且未对现有空间组学技术在肝细胞癌中的具体技术局限性和标准化问题进行深入讨论 | 总结空间组学技术在肝细胞癌研究中的最新进展,探讨空间生物学如何改变对肝癌生物学的理解并推动空间信息指导的精准肿瘤学发展 | 肝细胞癌及其肿瘤微环境 | 空间生物学 | 肝癌 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 空间基因组学, 空间表观基因组学, 空间代谢组学 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 空间基因组学, 空间表观基因组学, 空间代谢组学 | NA | NA |
| 1520 | 2026-10-03 |
Mechanotransduction unifies healthy nondiabetic wound healing over time by promoting a Cd14+/C1qa+ fibroblast subpopulation
2026-Oct, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2026.02.027
PMID:41997300
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序表征了糖尿病小鼠伤口愈合过程中成纤维细胞的异质性,发现机械转导通过促进Cd14+/C1qa+成纤维细胞亚群来统一健康非糖尿病伤口愈合 | 首次在遗传诱导和病理生理性糖尿病小鼠模型中全面表征伤口愈合各阶段成纤维细胞异质性,发现Cd14+/C1qa+血管生成成纤维细胞在非糖尿病伤口愈合中特异性表达,并揭示机械转导通路(FAK和MAPK)在糖尿病中被选择性耗竭 | 研究仅基于小鼠模型,尚未在人类糖尿病伤口中验证;样本量有限;单细胞RNA测序时间点仅涵盖术后第0、2、7和30天 | 表征糖尿病小鼠伤口愈合过程中成纤维细胞异质性,探究机械转导在伤口愈合中的作用机制 | C57BL/6非糖尿病野生型小鼠、高脂饮食诱导的病理生理性糖尿病小鼠、瘦素受体缺陷的遗传诱导糖尿病小鼠的全层切除伤口组织 | 单细胞转录组学 | 糖尿病伤口愈合 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 三种小鼠模型(非糖尿病野生型、高脂饮食诱导糖尿病、瘦素受体缺陷糖尿病)在术后第0、2、7、30天的伤口组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |