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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1481 | 2026-04-30 |
Human CD206+ macrophages associate with diabetes and adipose tissue lymphoid clusters
2022-02-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.146563
PMID:34990410
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研究论文 | 本研究分析了人类脂肪组织中三种巨噬细胞亚型在肥胖和糖尿病中的作用,发现CD206+CD11c-巨噬细胞与糖尿病相关,并在血管化淋巴样簇中聚集 | 首次在人类脂肪组织中定义CD206+巨噬细胞亚型与2型糖尿病的关联,并揭示其独特的基因表达谱和空间分布特征 | 样本量有限且仅来自肥胖参与者,未纳入正常体重或非糖尿病对照组 | 探究人类脂肪组织巨噬细胞亚型在肥胖和糖尿病中的作用及其基因表达特征 | 糖尿病和非糖尿病肥胖参与者的内脏脂肪组织和皮下脂肪组织 | 机器学习和数据分析 | 糖尿病、肥胖 | 单细胞转录组学、流式细胞术、免疫组化 | NA | 基因表达数据、细胞计数数据 | 糖尿病和非糖尿病肥胖参与者的脂肪组织样本 | NA | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | NA |
| 1482 | 2026-04-30 |
External signals regulate continuous transcriptional states in hematopoietic stem cells
2021-12-23, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.66512
PMID:34939923
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和ATAC测序,研究造血干细胞在外部信号刺激下的转录状态变化及其调控机制 | 首次在体内单细胞水平揭示造血干细胞对干扰素、G-CSF和前列腺素等微环境信号的转录反应异质性,发现六种标记基因富集但不排他的HSC状态,并证明染色质状态预先决定了HSC对信号的响应能力 | 未明确说明局限性 | 探究造血干细胞在外部应激信号下调控连续转录状态的分子机制 | 小鼠造血干细胞和LSK祖细胞 | 单细胞组学 | 血液疾病 | scRNA-seq, scATAC-seq | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞染色质可及性数据 | 功能验证的小鼠HSC和LSK祖细胞(具体数量未提供) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序平台 |
| 1483 | 2026-04-30 |
Sequential regulation of hemogenic fate and hematopoietic stem and progenitor cell formation from arterial endothelium by Ezh1/2
2021-07-13, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2021.05.014
PMID:34143974
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研究论文 | 描述了Ezh1/2通过调控动脉内皮的血液命运和造血干细胞与前体细胞形成的顺序机制 | 首次阐明Ezh1在脊椎动物HSPC生产中通过调控血液体细胞承诺的机制作用,揭示Ezh1/2的非冗余顺序功能 | 未提供 | 研究Ezh1/2在造血干细胞和前体细胞形成中的调控机制 | 斑马鱼胚胎 | 数字病理学 | 血液疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 斑马鱼胚胎样本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1484 | 2026-04-30 |
Multilineage murine stem cells generate complex organoids to model distal lung development and disease
2020-11-02, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2019103476
PMID:32985719
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研究论文 | 建立了三维鼠支气管肺泡类器官模型,模拟远端肺发育和疾病 | 首次通过FACS分选的支气管肺泡干细胞与肺驻留间充质细胞共培养,实现了高度分支的三维结构生成,并结合单细胞RNA测序和电镜验证细胞组成,支持巨噬细胞植入和病毒建模 | 未提及体外模型与体内环境的完全对应性及长期培养稳定性 | 建立复杂类器官模型以研究远端肺发育、感染和再生过程 | 小鼠支气管肺泡干细胞和肺驻留间充质细胞 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序、荧光成像、电子显微镜 | 三维类器官模型 | 基因表达数据、图像数据 | FACS分选的支气管肺泡干细胞与肺驻留间充质细胞共培养样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1485 | 2026-04-30 |
Stromal cell diversity associated with immune evasion in human triple-negative breast cancer
2020-10-01, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2019104063
PMID:32790115
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research paper | 通过对五例三阴性乳腺癌进行单细胞RNA测序,揭示了肿瘤基质中成纤维细胞和血管周细胞的异质性及其与免疫逃逸的关联 | 首次描绘了三阴性乳腺癌中两种癌症相关成纤维细胞和两种血管周样细胞亚群,并揭示了它们与细胞毒性T细胞功能障碍和排斥的强相关性 | 未明确说明局限性 | 探究人类三阴性乳腺癌中肿瘤基质的细胞异质性及其与免疫逃逸的关系 | 五例三阴性乳腺癌患者的肿瘤组织样本 | machine learning | lung cancer | NA | NA | 文本和测序数据 | 5例三阴性乳腺癌患者肿瘤组织 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1486 | 2026-04-30 |
A Widespread Neurogenic Potential of Neocortical Astrocytes Is Induced by Injury
2020-10-01, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2020.07.006
PMID:32758425
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研究论文 | 研究发现,当Notch信号被阻断时,大脑皮层星形胶质细胞在损伤后能够产生新的神经元,并揭示了其分子调控机制 | 首次证明Notch信号缺陷的星形胶质细胞在损伤后可转变为神经干细胞样状态并启动神经发生程序,且成功将星形胶质细胞神经发生与反应性胶质增生在单细胞水平上解耦 | 仅在小鼠模型中验证,且神经发生效率较低,仅少数预激活的星形胶质细胞在损伤后启动神经发生程序 | 阐明非神经源性脑区星形胶质细胞在损伤后产生新神经元的分子调控机制 | 小鼠大脑皮层星形胶质细胞 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠大脑皮层细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 1487 | 2026-04-30 |
Endothelial, pericyte and tumor cell expression in glioblastoma identifies fibroblast activation protein (FAP) as an excellent target for immunotherapy
2020, Clinical & translational immunology
IF:4.6Q2
DOI:10.1002/cti2.1191
PMID:33082953
|
研究论文 | 研究确认成纤维细胞活化蛋白(FAP)作为胶质母细胞瘤免疫治疗新靶点,并详细分析其在肿瘤血管内皮细胞、周细胞及肿瘤细胞中的表达情况 | 首次通过多模态分析揭示FAP在胶质母细胞瘤的血管内皮细胞和周细胞上显著表达,而非正常组织血管,提出FAP可作为同时靶向肿瘤细胞及血管网络的理想免疫治疗抗原 | 未提及具体临床试验验证或体内功能研究,且儿童脑肿瘤样本的泛癌表达分析可能局限于已公开转录组数据集 | 验证FAP作为胶质母细胞瘤免疫治疗抗原的可行性,并明确其细胞定位与表达特征 | 人类胶质母细胞瘤组织样本、正常脑组织、胶质瘤神经干细胞(GNS)培养物、健康星形胶质细胞和神经元培养物及多个儿科脑肿瘤样本 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 免疫染色、流式细胞术、单细胞转录组测序(scRNA-seq) | NA | 组织切片、细胞培养物、单细胞测序数据 | 包含多个胶质母细胞瘤患者组织样本及公开转录组数据集,具体数字未明确说明 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'测序试剂盒及Illumina NovaSeq测序平台 |
| 1488 | 2026-04-30 |
Dynamics of genomic clones in breast cancer patient xenografts at single-cell resolution
2015-Feb-19, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/nature13952
PMID:25470049
|
研究论文 | 通过深度基因组和单细胞测序方法,以单细胞分辨率研究乳腺癌患者异种移植模型中基因组克隆的动态变化 | 首次在单细胞分辨率下系统检查了移植和传代对肿瘤基因组克隆结构的影响,并揭示了克隆选择的重复性 | 未明确提及,但可能包括样本量有限(15例)及免疫缺陷小鼠模型的局限性 | 探讨乳腺癌异种移植过程中克隆动态的机制及其对肿瘤生物学研究的意义 | 原发性和转移性乳腺癌患者的肿瘤组织 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 深度基因组测序、单细胞测序 | NA | 基因组测序数据、单细胞测序数据 | 15例乳腺癌病例 | NA | NA | NA | NA |
| 1489 | 2026-04-29 |
Extracellular vesicle-mediated transcellular mitophagy as a modulatory target for moderate hyperoxia-induced alveolar developmental arrest in bronchopulmonary dysplasia
2026-Jun, Free radical biology & medicine
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研究论文 | 揭示中度高氧诱导支气管肺发育不良中成纤维细胞通过细胞外囊泡介导的线粒体自噬传递导致肺泡发育停滞的机制 | 首次阐明成纤维细胞通过富含外线粒体膜蛋白VDAC1的细胞外囊泡抑制肺泡上皮细胞线粒体自噬,从而在BPD中发挥关键作用 | NA | 探究中度高氧下成纤维细胞如何参与肺泡发育停滞的机制,为支气管肺发育不良寻找治疗靶点 | 中度高氧诱导的支气管肺发育不良小鼠模型中的成纤维细胞和II型肺泡上皮细胞 | 数字病理学 | 支气管肺发育不良 | 单细胞RNA测序, 细胞外囊泡分析 | NA | 基因表达数据, 图像 | 中度高氧(60%氧气)暴露的BPD小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1490 | 2026-04-29 |
Advancing single-cell omics and cell-based therapeutics with quantum computing
2026-May, Nature reviews. Molecular cell biology
DOI:10.1038/s41580-025-00918-0
PMID:41478876
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综述 | 探讨量子计算在单细胞组学和基于细胞的治疗中的进展与挑战,通过高分辨率检测与先进计算工具整合,构建细胞行为的精准模型 | 首次系统阐述量子计算如何协同人工智能,解决单细胞分析中捕获细胞动态的计算瓶颈,并提出与基于细胞治疗的整合路径 | 作为路线图文章,未提供实验验证或具体算法实现,主要基于理论探讨和案例研究 | 探索量子计算在单细胞空间转录组学和多组学技术中的应用,推动细胞行为模型的变革 | 单细胞和细胞群体行为模型、基于细胞的治疗策略 | 机器学习 | NA | 单细胞测序、空间转录组学、多组学技术 | NA | 单细胞组学数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、单细胞多组学 | NA | NA |
| 1491 | 2026-04-29 |
Serial Spatial Transcriptomes Reveal Regulatory Transitions in Maize Leaf Development
2026-May, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70515
PMID:41493197
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研究论文 | 优化了使用10× Genomics Visium系统的空间转录组学协议,并开发计算流程重建玉米幼苗中SAM和连续发育叶片的三维基因表达谱,揭示从SAM中未分化干细胞到功能分化叶片结构的动态转变 | 首次优化了基于10× Genomics Visium系统的空间转录组学实验流程与计算分析管线,实现了玉米叶片发育过程中基因表达的三维空间定位与动态追踪,优于缺乏时空背景的单细胞转录组分析 | 目前该方法的应用仍需要进一步的样品制备和数据处理优化,可能对某些植物组织或特定发育阶段存在适用性挑战 | 揭示玉米叶片从茎尖分生组织起源到功能分化过程中的基因表达调控网络与发育转变机制 | 玉米幼苗中的茎尖分生组织(SAM)和连续发育的叶片 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 多个连续发育阶段的玉米幼苗茎尖分生组织和叶片样品 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10× Genomics Visium系统用于空间转录组学实验优化 |
| 1492 | 2026-04-29 |
Mass Spectrometry Imaging Combined With Single-Cell Transcriptional Profiling Reveals the Multidimensional Spatial Distributions and Biosynthetic Pathways of Medicinal Components in Andrographis paniculata
2026-May, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70534
PMID:41504619
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研究论文 | 通过质谱成像与单细胞转录组分析,揭示了穿心莲中药物成分的多维空间分布和生物合成途径 | 首次在药用植物穿心莲中建立质谱成像与单细胞RNA测序联合系统,实现活性成分的精细空间定位和细胞类型特异性表达分析 | 未提及明显局限性 | 探索药用植物中活性成分的精细分布和生物合成途径 | 穿心莲(Andrographis paniculata) | 数字病理学 | NA | 质谱成像(MSI)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、LC-QQQ-MS/MS | NA | 图像、基因表达数据 | 穿心莲叶片和茎组织样本 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、质谱成像(MSI) | NA | NA |
| 1493 | 2026-04-29 |
Dissecting the Cell-Type-Specific Response to an Emerging Tobamovirus in Tomato Reveals Cultivar-Dependent Involvement of Brassinosteroid Signalling
2026-May, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70559
PMID:41562490
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序解析番茄中两种不同遗传背景的品种对新兴烟草花叶病毒的细胞类型特异性反应,揭示了油菜素内酯信号通路的差异参与 | 首次在单细胞水平上揭示不同遗传背景的番茄品种对ToBRFV感染的细胞类型特异性反应,并发现油菜素内酯信号通路在抗性中起品种依赖性作用 | 未提供具体局限性信息 | 探究植物病毒在不同细胞类型中的宿主反应以及遗传背景(包括抗性基因)对感染动态的影响 | 番茄品种'金鹏1号'(JP)和'Rutgers'(RG)以及番茄褐色皱纹果病毒(ToBRFV) | 机器学习 | 植物病毒病 | 单细胞RNA测序 | 拟时间分析 | 基因表达数据 | 两种番茄品种(JP和RG)的叶片样本 | 未明确提及 | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1494 | 2026-04-29 |
Multi-scale spatial testing recovers gene programs missed by existing detection methods
2026-Apr-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.12.711372
PMID:41890107
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研究论文 | 提出FlashS方法,在频域中重新定义基于核的空间检验,以检测任意多尺度表达模式,并扩展到数百万细胞 | 通过频域变换将空间检验从固定尺度模型解放出来,实现多尺度空间可变基因检测,同时保持可扩展性 | 未明确说明局限性,但可能依赖于基因表达数据的空间分辨率 | 开发一种能够检测现有方法遗漏的多尺度空间模式的空间可变基因检测方法 | 空间转录组学数据中的基因表达模式 | 机器学习和数字病理学 | 心血管疾病(与心脏组织相关) | 空间转录组学 | 核方法(频域变换) | 基因表达数据 | 50个基准数据集覆盖9个平台,包括艾伦脑MERFISH图谱(394万个细胞) | NA | 空间转录组学,MERFISH | MERFISH | 艾伦脑MERFISH图谱 |
| 1495 | 2026-04-29 |
Cross-platform transcriptomic data integration identifies an overactive neuro-immune signature in human osteoarthritis synovium
2026-Apr, Osteoarthritis and cartilage
IF:7.2Q1
DOI:10.1016/j.joca.2025.08.013
PMID:40889615
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研究论文 | 通过跨平台转录组数据整合,识别出人类骨关节炎滑膜中过度活跃的神经免疫信号特征 | 首次通过跨平台统计整合多个公开数据集,系统性地表征骨关节炎滑膜的转录表型,并聚焦于与疼痛相关的信号通路 | 研究基于公共数据集,样本量有限(153例受试者),且仅关注终末期骨关节炎,未纳入早期或中度病变 | 表征骨关节炎滑膜的转录表型,重点关注与疼痛相关的神经免疫信号 | 人类非骨关节炎和骨关节炎滑膜组织样本 | 机器学习 | 骨关节炎 | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 153例受试者(质量控后139例) | Illumina | bulk RNA-seq | Illumina NovaSeq | 来自GEO数据库的多个微阵列和RNA测序数据集 |
| 1496 | 2026-04-29 |
Spatial Transcriptomics Reveals Injured Cells, Signature Genes, and Communication Patterns in the Cyst Microenvironment of Polycystic Kidney Disease
2026-Apr-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000894
PMID:41071604
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研究论文 | 利用空间转录组学揭示多囊肾病囊肿微环境中的损伤细胞、标志基因和通讯模式 | 首次通过空间转录组学方法在组织原位解析多囊肾病囊肿微环境中的细胞组成、基因表达和细胞通讯模式,填补了传统单细胞测序缺乏空间信息的空白 | 文章未明确提及局限性 | 研究多囊肾病囊肿微环境的变化如何驱动囊肿形成 | Pkd1缺陷小鼠和野生型小鼠的肾脏组织 | 空间转录组学 | 多囊肾病 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 野生型和Pkd1缺陷小鼠肾脏样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Genomics Visium空间基因表达平台 |
| 1497 | 2026-04-29 |
Hmx2 and Dmrt2 Coordinate the Differentiation of Intercalated Cell Subtypes in Kidney
2026-Apr-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000885
PMID:41051882
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研究论文 | 本研究揭示了Hmx2和Dmrt2在肾脏集合管闰细胞亚型分化中的协调作用 | 首次阐明Hmx2和Dmrt2作为互斥转录因子分别调控B型和A型闰细胞分化,并发现Hmx3在两者缺失时补偿性表达 | Dmrt2敲入未能修复Foxp1缺陷小鼠的闰细胞分化异常,提示可能存在尚未阐明的调控机制 | 探究Dmrt2和Hmx2在肾脏闰细胞亚型分化中的功能 | 小鼠肾脏远端肾单位特异条件性敲除和敲入模型 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | 条件性基因敲除/敲入小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 小鼠及人类肾脏数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序分析小鼠和人类肾脏数据集 |
| 1498 | 2026-04-12 |
Spatial Transcriptomics of the Cyst Microenvironment in an Autosomal Dominant Polycystic Kidney Disease Model
2026-Apr-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000001050
PMID:41920711
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1499 | 2026-04-29 |
A single-cell atlas of the human airways from patients with allergic rhinitis comorbid with asthma
2026-Mar-24, Annals of allergy, asthma & immunology : official publication of the American College of Allergy, Asthma, & Immunology
DOI:10.1016/j.anai.2026.03.013
PMID:41887463
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research paper | 本文通过单细胞RNA测序技术,绘制了过敏性鼻炎合并哮喘患者气道的单细胞图谱,揭示了上下气道细胞组成和转录变化的相似性及炎症反应机制 | 首次对过敏性鼻炎合并哮喘患者多个不同微解剖区域的气道刷取样本进行单细胞RNA分析,发现了病变气道纤毛细胞结构损伤和上皮屏障破坏,并鉴定出GZMA-PARD3通路在体外破坏气道上皮屏障 | 仅纳入有限样本量,且为横断面研究、缺乏纵向随访数据 | 研究过敏性鼻炎合并哮喘患者上下气道细胞种群分布和转录变化,探索慢性炎症条件下细胞图谱的异同 | 过敏性鼻炎合并哮喘患者及健康志愿者的鼻腔和支气管刷取细胞 | machine learning | asthma | single-cell RNA-seq | NA | single-cell transcriptomic data | 若干名过敏性鼻炎合并哮喘患者和健康志愿者的鼻腔及支气管刷取样本 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 测序平台 |
| 1500 | 2026-04-29 |
Regulation of spikelet number during wheat spike development
2026-Mar-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.07.698073
PMID:41835394
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综述 | 本文综述了小麦穗发育过程中调控小穗数目的基因网络与分子机制,重点探讨了顶端分生组织向花序分生组织转变、小穗分生组织形成速率及终端小穗转化时间等关键过程 | 整合了近年空间转录组学、单细胞分析及多组学技术在小麦穗发育研究中的最新应用,系统梳理了促进小穗数增加的突变体(如超数小穗和分枝结构)及其育种应用进展 | 目前将超数小穗突变导入商业品种时面临育性和籽粒重量的权衡问题,且对多基因组合效应的田间验证研究仍有限 | 阐明小麦穗部小穗数目(SNS)的遗传调控网络及其对产量的影响机制 | 小麦穗部发育过程中的花序分生组织(IM)、小穗分生组织(SM)及终端小穗(TS) | 植物遗传学与作物育种 | NA | 空间转录组学, 单细胞转录组学, 多组学分析 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 多组学 | NA | NA |